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_refine.pdbx_ls_cross_valid_method NONE _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values 'GeoStd + Monomer Library + CDL v1.2' _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_real_space_R ? _refine.pdbx_density_correlation ? _refine.pdbx_pd_number_of_powder_patterns ? _refine.pdbx_pd_number_of_points ? _refine.pdbx_pd_meas_number_of_points ? _refine.pdbx_pd_proc_ls_prof_R_factor ? _refine.pdbx_pd_proc_ls_prof_wR_factor ? _refine.pdbx_pd_Marquardt_correlation_coeff ? _refine.pdbx_pd_Fsqrd_R_factor ? _refine.pdbx_pd_ls_matrix_band_width ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? 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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.3674 ? 17396 ? f_angle_d ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.0380 ? 2106 ? f_chiral_restr ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.0031 ? 2028 ? f_plane_restr ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 16.0076 ? 2334 ? f_dihedral_angle_d ? ? ? # _struct.entry_id 9GXP _struct.title 'C. thermocellum UvrA in complex with DNA with an abasic site (basal conformation)' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 9GXP _struct_keywords.text 'DNA binding protein, DNA Repair pathway, Nucleotide excision repair pathway, NER' _struct_keywords.pdbx_keywords 'DNA BINDING PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 2 ? D N N 2 ? E N N 3 ? F N N 3 ? G N N 3 ? H N N 3 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP A3DC70_ACET2 A3DC70 ? 1 ;MKKDYIVVKGAREHNLKNIDVKIPRDKFVVITGLSGSGKSSLAFDTIYAEGQRRYVESLSSYARQFLGQMEKPDVDYIDG LSPAIAIDQKTTSRNPRSTVGTVTEIYDYLRLLFARIGTPHCYLCGREISQQTVDQMVDRIMEFEEGTRIQLLAPVVRGR KGEYHKLIEDIKKEGYVRIRVDGEVVDVNDPVNLDKNKKHNIEIVVDRLIVRPGIQKRLTDSIETVLRLSNGILVVDVIG GKEMLLSQNFACTECNVSMEEITPRMFSFNNPYGACPECTGLGSLMRIDPDLVIPDKKLSLAQGAVRASGWNIANDESYA RMYIDALAKHYNFSVDTPVEELPPHILDIILYGTNGEKIKIEYERENEKGTFMASFPGIINSMERRYKETTSEVMKQYYE NFMSNIPCPVCKGARLKKESLAVTIGGKNIYEVCCLSIGEAKEFFANLNLTERQQLIARQILKEINARLGFLVDVGLDYL TLARAAGTLSGGEAQRIRLATQIGSGLMGVIYILDEPSIGLHQRDNDRLLRSLKKLRDLGNTLLVVEHDEDTMYASDYII DLGPGAGSHGGQIVAEGTVEEIKQNPNSVTGEYLSGRKKIEVPKERRKPNGKWLEIIGARENNLKNINVRIPLGVFTCIT GVSGSGKSSLINEILYKRLAAELNRASVKPGEHDLIKGIEYLDKVIDIDQSPIGRTPRSNPATYTGVFDFIREIFANTTE AKTRGYKAGRFSFNVKGGRCEACAGDGINKIEMHFLPDIYVPCEVCKGKRYNRETLEVRYKGKNIAEVLDMTVEEALEFF KNIPRIHKKIETLYDVGLGYIKLGQSSTTLSGGEAQRVKLATELSRKSTGKTMYILDEPTTGLHMADVHRLVGILHRLVE AGNSVVVIEHNLDVIKTADYIIDLGPEGGSGGGLVVAEGTPEEVAKVENSYTGQFLKKVLST ; 1 2 PDB 9GXP 9GXP ? 2 ? 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 9GXP A 21 ? 962 ? 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'expression tag' -13 7 1 9GXP HIS A 8 ? UNP A3DC70 ? ? 'expression tag' -12 8 1 9GXP HIS A 9 ? UNP A3DC70 ? ? 'expression tag' -11 9 1 9GXP HIS A 10 ? UNP A3DC70 ? ? 'expression tag' -10 10 1 9GXP SER A 11 ? UNP A3DC70 ? ? 'expression tag' -9 11 1 9GXP SER A 12 ? UNP A3DC70 ? ? 'expression tag' -8 12 1 9GXP GLY A 13 ? UNP A3DC70 ? ? 'expression tag' -7 13 1 9GXP LEU A 14 ? UNP A3DC70 ? ? 'expression tag' -6 14 1 9GXP VAL A 15 ? UNP A3DC70 ? ? 'expression tag' -5 15 1 9GXP PRO A 16 ? UNP A3DC70 ? ? 'expression tag' -4 16 1 9GXP ARG A 17 ? UNP A3DC70 ? ? 'expression tag' -3 17 1 9GXP GLY A 18 ? UNP A3DC70 ? ? 'expression tag' -2 18 1 9GXP SER A 19 ? UNP A3DC70 ? ? 'expression tag' -1 19 1 9GXP HIS A 20 ? UNP A3DC70 ? ? 'expression tag' 0 20 2 9GXP MET B 1 ? UNP A3DC70 ? ? 'initiating methionine' -19 21 2 9GXP GLY B 2 ? UNP A3DC70 ? ? 'expression tag' -18 22 2 9GXP SER B 3 ? UNP A3DC70 ? ? 'expression tag' -17 23 2 9GXP SER B 4 ? UNP A3DC70 ? ? 'expression tag' -16 24 2 9GXP HIS B 5 ? UNP A3DC70 ? ? 'expression tag' -15 25 2 9GXP HIS B 6 ? UNP A3DC70 ? ? 'expression tag' -14 26 2 9GXP HIS B 7 ? UNP A3DC70 ? ? 'expression tag' -13 27 2 9GXP HIS B 8 ? UNP A3DC70 ? ? 'expression tag' -12 28 2 9GXP HIS B 9 ? UNP A3DC70 ? ? 'expression tag' -11 29 2 9GXP HIS B 10 ? UNP A3DC70 ? ? 'expression tag' -10 30 2 9GXP SER B 11 ? UNP A3DC70 ? ? 'expression tag' -9 31 2 9GXP SER B 12 ? UNP A3DC70 ? ? 'expression tag' -8 32 2 9GXP GLY B 13 ? UNP A3DC70 ? ? 'expression tag' -7 33 2 9GXP LEU B 14 ? UNP A3DC70 ? ? 'expression tag' -6 34 2 9GXP VAL B 15 ? UNP A3DC70 ? ? 'expression tag' -5 35 2 9GXP PRO B 16 ? UNP A3DC70 ? ? 'expression tag' -4 36 2 9GXP ARG B 17 ? UNP A3DC70 ? ? 'expression tag' -3 37 2 9GXP GLY B 18 ? UNP A3DC70 ? ? 'expression tag' -2 38 2 9GXP SER B 19 ? UNP A3DC70 ? ? 'expression tag' -1 39 2 9GXP HIS B 20 ? UNP A3DC70 ? ? 'expression tag' 0 40 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details tetrameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 4 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'not applicable' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 GLY A 58 ? ASP A 65 ? GLY A 38 ASP A 45 1 ? 8 HELX_P HELX_P2 AA2 THR A 66 ? SER A 78 ? THR A 46 SER A 58 1 ? 13 HELX_P HELX_P3 AA3 SER A 80 ? GLY A 88 ? SER A 60 GLY A 68 1 ? 9 HELX_P HELX_P4 AA4 THR A 119 ? THR A 124 ? THR A 99 THR A 104 1 ? 6 HELX_P HELX_P5 AA5 ILE A 126 ? GLY A 138 ? ILE A 106 GLY A 118 1 ? 13 HELX_P HELX_P6 AA6 ASN A 291 ? ALA A 295 ? ASN A 271 ALA A 275 5 ? 5 HELX_P HELX_P7 AA7 ASP A 309 ? ILE A 314 ? ASP A 289 ILE A 294 1 ? 6 HELX_P HELX_P8 AA8 SER A 320 ? GLY A 324 ? SER A 300 GLY A 304 5 ? 5 HELX_P HELX_P9 AA9 SER A 338 ? TYR A 351 ? SER A 318 TYR A 331 1 ? 14 HELX_P HELX_P10 AB1 PRO A 363 ? GLY A 373 ? PRO A 343 GLY A 353 1 ? 11 HELX_P HELX_P11 AB2 GLY A 398 ? GLU A 409 ? GLY A 378 GLU A 389 1 ? 12 HELX_P HELX_P12 AB3 GLU A 413 ? PHE A 422 ? GLU A 393 PHE A 402 1 ? 10 HELX_P HELX_P13 AB4 GLU A 439 ? VAL A 443 ? GLU A 419 VAL A 423 5 ? 5 HELX_P HELX_P14 AB5 ASN A 449 ? CYS A 455 ? ASN A 429 CYS A 435 1 ? 7 HELX_P HELX_P15 AB6 SER A 457 ? ASN A 467 ? 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WATSON-CRICK ? ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference metalc ? ? hydrog ? ? # loop_ _pdbx_struct_conn_angle.id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.value _pdbx_struct_conn_angle.value_esd 1 SG ? 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