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'ribosome, antimicrobial peptide, RNA, ribosomal protein, PrAMP, proline-rich peptide, antibiotics, 50S, Api137' _struct_keywords.pdbx_keywords RIBOSOME # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? 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'REVERSED HOOGSTEEN' ? ? ? hydrog28 hydrog ? ? B G 15 N1 ? ? ? 1_555 B U 525 O2 ? ? A G 15 A U 525 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? ? hydrog29 hydrog ? ? B G 15 O6 ? ? ? 1_555 B U 525 N3 ? ? A G 15 A U 525 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? ? hydrog30 hydrog ? ? B C 16 N3 ? ? ? 1_555 B G 524 N1 ? ? A C 16 A G 524 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog31 hydrog ? ? B C 16 N4 ? ? ? 1_555 B G 524 O6 ? ? A C 16 A G 524 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog32 hydrog ? ? B C 16 O2 ? ? ? 1_555 B G 524 N2 ? ? A C 16 A G 524 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog33 hydrog ? ? B G 17 N1 ? ? ? 1_555 B C 523 N3 ? ? A G 17 A C 523 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog34 hydrog ? ? B G 17 N2 ? ? ? 1_555 B C 523 O2 ? ? A G 17 A C 523 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog35 hydrog ? ? B G 17 O6 ? ? ? 1_555 B C 523 N4 ? ? A G 17 A C 523 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog36 hydrog ? ? B U 18 N3 ? ? ? 1_555 B A 522 N1 ? ? A U 18 A A 522 1_555 ? ? ? ? ? ? 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B G 189 N3 ? ? ? 1_555 B A 207 N6 ? ? A G 189 A A 207 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_11_PAIR ? ? ? hydrog251 hydrog ? ? B A 190 N6 ? ? ? 1_555 B U 206 O2 ? ? A A 190 A U 206 1_555 ? ? ? ? ? ? 'REVERSED HOOGSTEEN' ? ? ? hydrog252 hydrog ? ? B A 190 N7 ? ? ? 1_555 B U 206 N3 ? ? A A 190 A U 206 1_555 ? ? ? ? ? ? 'REVERSED HOOGSTEEN' ? ? ? hydrog253 hydrog ? ? B A 191 N6 ? ? ? 1_555 B A 204 N7 ? ? A A 191 A A 204 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_2_PAIR ? ? ? hydrog254 hydrog ? ? B A 191 N7 ? ? ? 1_555 B A 204 N6 ? ? A A 191 A A 204 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_2_PAIR ? ? ? hydrog255 hydrog ? ? B G 194 N1 ? ? ? 1_555 B C 201 N3 ? ? A G 194 A C 201 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog256 hydrog ? ? B G 194 N2 ? ? ? 1_555 B C 201 O2 ? ? A G 194 A C 201 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog257 hydrog ? ? B G 194 O6 ? ? ? 1_555 B C 201 N4 ? ? A G 194 A C 201 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog258 hydrog ? ? B C 198 N3 ? ? ? 1_555 B G 248 N1 ? ? A C 198 A G 248 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog259 hydrog ? ? B C 198 N4 ? ? ? 1_555 B G 248 O6 ? ? A C 198 A G 248 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog260 hydrog ? ? B C 198 O2 ? ? ? 1_555 B G 248 N2 ? ? A C 198 A G 248 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog261 hydrog ? ? B G 215 N2 ? ? ? 1_555 B A 432 N1 ? ? A G 215 A A 432 1_555 ? ? ? ? ? ? 'G-A MISPAIR' ? ? ? hydrog262 hydrog ? ? B A 216 N6 ? ? ? 1_555 B U 431 O2 ? ? A A 216 A U 431 1_555 ? ? ? ? ? ? 'REVERSED HOOGSTEEN' ? ? ? hydrog263 hydrog ? ? B A 216 N7 ? ? ? 1_555 B U 431 N3 ? ? A A 216 A U 431 1_555 ? ? ? ? ? ? 'REVERSED HOOGSTEEN' ? ? ? hydrog264 hydrog ? ? B A 217 N6 ? ? ? 1_555 B U 431 O2 ? ? A A 217 A U 431 1_555 ? ? ? ? ? ? 'A-U PAIR' ? ? ? hydrog265 hydrog ? ? B A 221 N6 ? ? ? 1_555 B A 265 N3 ? ? A A 221 A A 265 1_555 ? ? ? ? ? ? 'A-A MISPAIR' ? ? ? hydrog266 hydrog ? ? B A 221 N6 ? ? ? 1_555 B U 427 O2 ? ? A A 221 A U 427 1_555 ? ? ? ? ? ? 'REVERSED HOOGSTEEN' ? ? ? hydrog267 hydrog ? ? B A 221 N7 ? ? ? 1_555 B U 427 N3 ? ? 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B A 226 N1 ? ? ? 1_555 B C 229 N4 ? ? A A 226 A C 229 1_555 ? ? ? ? ? ? 'A-C MISPAIR' ? ? ? hydrog277 hydrog ? ? B C 228 N4 ? ? ? 1_555 B C 417 O2 ? ? A C 228 A C 417 1_555 ? ? ? ? ? ? 'C-C MISPAIR' ? ? ? hydrog278 hydrog ? ? B A 233 N6 ? ? ? 1_555 B C 264 O2 ? ? A A 233 A C 264 1_555 ? ? ? ? ? ? 'A-C MISPAIR' ? ? ? hydrog279 hydrog ? ? B A 233 N1 ? ? ? 1_555 B A 429 N6 ? ? A A 233 A A 429 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_1_PAIR ? ? ? hydrog280 hydrog ? ? B A 233 N6 ? ? ? 1_555 B A 429 N1 ? ? A A 233 A A 429 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_1_PAIR ? ? ? hydrog281 hydrog ? ? B U 234 O4 ? ? ? 1_555 B G 263 N2 ? ? A U 234 A G 263 1_555 ? ? ? ? ? ? 'U-G MISPAIR' ? ? ? hydrog282 hydrog ? ? B U 234 N3 ? ? ? 1_555 B A 430 N1 ? ? A U 234 A A 430 1_555 ? ? ? ? ? ? 'REVERSED WATSON-CRICK' ? ? ? hydrog283 hydrog ? ? B U 234 O2 ? ? ? 1_555 B A 430 N6 ? ? A U 234 A A 430 1_555 ? ? ? ? ? ? 'REVERSED WATSON-CRICK' ? ? ? hydrog284 hydrog ? ? B U 235 N3 ? ? ? 1_555 B A 262 N1 ? ? A U 235 A A 262 1_555 ? ? ? ? ? ? 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'REVERSED WATSON-CRICK' ? ? ? hydrog441 hydrog ? ? B C 378 O2 ? ? ? 1_555 B G 396 N1 ? ? A C 378 A G 396 1_555 ? ? ? ? ? ? 'REVERSED WATSON-CRICK' ? ? ? hydrog442 hydrog ? ? B G 379 N2 ? ? ? 1_555 B U 395 O2 ? ? A G 379 A U 395 1_555 ? ? ? ? ? ? 'G-U MISPAIR' ? ? ? hydrog443 hydrog ? ? B G 380 N1 ? ? ? 1_555 B C 394 N3 ? ? A G 380 A C 394 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog444 hydrog ? ? B G 380 N2 ? ? ? 1_555 B C 394 O2 ? ? A G 380 A C 394 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog445 hydrog ? ? B G 380 O6 ? ? ? 1_555 B C 394 N4 ? ? A G 380 A C 394 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog446 hydrog ? ? B G 380 N1 ? ? ? 1_555 B U 395 O2 ? ? A G 380 A U 395 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? ? hydrog447 hydrog ? ? B G 380 O6 ? ? ? 1_555 B U 395 N3 ? ? A G 380 A U 395 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? ? hydrog448 hydrog ? ? B G 381 N1 ? ? ? 1_555 B C 393 N3 ? ? A G 381 A C 393 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog449 hydrog ? ? B G 381 N2 ? ? ? 1_555 B C 393 O2 ? ? 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A A 2837 A U 2881 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog1834 hydrog ? ? B A 2837 N6 ? ? ? 1_555 B U 2881 O4 ? ? A A 2837 A U 2881 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog1835 hydrog ? ? B G 2838 N1 ? ? ? 1_555 B C 2880 N3 ? ? A G 2838 A C 2880 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog1836 hydrog ? ? B G 2838 N2 ? ? ? 1_555 B C 2880 O2 ? ? A G 2838 A C 2880 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog1837 hydrog ? ? B G 2838 O6 ? ? ? 1_555 B C 2880 N4 ? ? A G 2838 A C 2880 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog1838 hydrog ? ? B G 2839 N1 ? ? ? 1_555 B U 2878 O2 ? ? A G 2839 A U 2878 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? ? hydrog1839 hydrog ? ? B G 2839 O6 ? ? ? 1_555 B U 2878 N3 ? ? A G 2839 A U 2878 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? ? hydrog1840 hydrog ? ? B C 2840 N3 ? ? ? 1_555 B G 2877 N1 ? ? A C 2840 A G 2877 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog1841 hydrog ? ? B C 2840 N4 ? ? ? 1_555 B G 2877 O6 ? ? A C 2840 A G 2877 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog1842 hydrog ? ? B C 2840 O2 ? ? ? 1_555 B G 2877 N2 ? ? A C 2840 A G 2877 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog1843 hydrog ? ? B C 2841 N3 ? ? ? 1_555 B G 2876 N1 ? ? A C 2841 A G 2876 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog1844 hydrog ? ? B C 2841 N4 ? ? ? 1_555 B G 2876 O6 ? ? A C 2841 A G 2876 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog1845 hydrog ? ? B C 2841 O2 ? ? ? 1_555 B G 2876 N2 ? ? A C 2841 A G 2876 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog1846 hydrog ? ? B G 2842 N1 ? ? ? 1_555 B C 2875 N3 ? ? A G 2842 A C 2875 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog1847 hydrog ? ? B G 2842 N2 ? ? ? 1_555 B C 2875 O2 ? ? A G 2842 A C 2875 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog1848 hydrog ? ? B G 2842 O6 ? ? ? 1_555 B C 2875 N4 ? ? A G 2842 A C 2875 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog1849 hydrog ? ? B G 2843 N1 ? ? ? 1_555 B C 2874 N3 ? ? A G 2843 A C 2874 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog1850 hydrog ? ? 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MET K 7 VAL K 10 AA6 2 ARG F 18 ? VAL F 24 ? ARG K 18 VAL K 24 AA6 3 ILE F 38 ? THR F 42 ? ILE K 38 THR K 42 AA6 4 VAL F 57 ? ARG F 64 ? VAL K 57 ARG K 64 AA6 5 ALA F 83 ? LEU F 86 ? ALA K 83 LEU K 86 AA6 6 MET F 7 ? VAL F 10 ? MET K 7 VAL K 10 AA7 1 VAL F 69 ? ARG F 70 ? VAL K 69 ARG K 70 AA7 2 VAL F 76 ? PHE F 79 ? VAL K 76 PHE K 79 AA7 3 GLU I 67 ? GLN I 74 ? GLU P 67 GLN P 74 AA7 4 ALA I 57 ? SER I 64 ? ALA P 57 SER P 64 AA7 5 LYS I 36 ? ARG I 50 ? LYS P 36 ARG P 50 AA7 6 THR I 24 ? GLU I 33 ? THR P 24 GLU P 33 AA7 7 VAL I 80 ? SER I 84 ? VAL P 80 SER P 84 AA8 1 VAL G 121 ? ARG G 122 ? VAL L 122 ARG L 123 AA8 2 ILE G 141 ? GLU G 142 ? ILE L 142 GLU L 143 AA9 1 ILE H 33 ? THR H 36 ? ILE N 33 THR N 36 AA9 2 PRO H 109 ? LEU H 115 ? PRO N 109 LEU N 115 AA9 3 THR H 95 ? PHE H 102 ? THR N 95 PHE N 102 AB1 1 GLN K 11 ? SER K 15 ? GLN R 11 SER R 15 AB1 2 TYR K 2 ? GLN K 6 ? TYR R 2 GLN R 6 AB1 3 MET K 40 ? ILE K 41 ? MET R 40 ILE R 41 AB2 1 THR K 19 ? LEU K 22 ? 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OXT O N N 520 VAL H H N N 521 VAL H2 H N N 522 VAL HA H N N 523 VAL HB H N N 524 VAL HG11 H N N 525 VAL HG12 H N N 526 VAL HG13 H N N 527 VAL HG21 H N N 528 VAL HG22 H N N 529 VAL HG23 H N N 530 VAL HXT H N N 531 # loop_ _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_ordinal A OP3 P sing N N 1 A OP3 HOP3 sing N N 2 A P OP1 doub N N 3 A P OP2 sing N N 4 A P "O5'" sing N N 5 A OP2 HOP2 sing N N 6 A "O5'" "C5'" sing N N 7 A "C5'" "C4'" sing N N 8 A "C5'" "H5'" sing N N 9 A "C5'" "H5''" sing N N 10 A "C4'" "O4'" sing N N 11 A "C4'" "C3'" sing N N 12 A "C4'" "H4'" sing N N 13 A "O4'" "C1'" sing N N 14 A "C3'" "O3'" sing N N 15 A "C3'" "C2'" sing N N 16 A "C3'" "H3'" sing N N 17 A "O3'" "HO3'" sing N N 18 A "C2'" "O2'" sing N N 19 A "C2'" "C1'" sing N N 20 A "C2'" "H2'" sing N N 21 A "O2'" "HO2'" sing N N 22 A "C1'" N9 sing N N 23 A "C1'" "H1'" 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