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N ALA C 69 O ILE C 361 ? O ILE C 361 AB5 1 2 O LEU C 170 ? O LEU C 170 N ILE C 159 ? N ILE C 159 AB5 2 3 O LYS C 162 ? O LYS C 162 N GLU C 134 ? N GLU C 134 AB5 3 4 N GLU C 126 ? N GLU C 126 O ILE C 234 ? O ILE C 234 AB6 1 2 O LYS C 201 ? O LYS C 201 N TYR C 192 ? N TYR C 192 AB6 2 3 O ILE C 193 ? O ILE C 193 N TYR C 131 ? N TYR C 131 AB6 3 4 N ARG C 123 ? N ARG C 123 O GLU C 293 ? O GLU C 293 AB7 1 2 N CYS C 336 ? N CYS C 336 O SER C 346 ? O SER C 346 AB8 1 2 N ILE D 103 ? N ILE D 103 O ASP D 299 ? O ASP D 299 AB8 2 3 N LEU D 296 ? N LEU D 296 O ILE D 325 ? O ILE D 325 AB8 3 4 O LEU D 324 ? O LEU D 324 N VAL D 73 ? N VAL D 73 AB8 4 5 N LEU D 74 ? N LEU D 74 O LEU D 355 ? O LEU D 355 AB9 1 2 O VAL D 242 ? O VAL D 242 N VAL D 129 ? N VAL D 129 AB9 2 3 N GLY D 128 ? N GLY D 128 O ILE D 292 ? O ILE D 292 AC1 1 2 N THR D 333 ? N THR D 333 O SER D 342 ? O SER D 342 AC2 1 2 N THR E 101 ? N THR E 101 O VAL E 295 ? O VAL E 295 AC2 2 3 N LEU E 296 ? N LEU E 296 O ILE E 325 ? 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O SER F 342 # _pdbx_entry_details.entry_id 9HB4 _pdbx_entry_details.nonpolymer_details ? _pdbx_entry_details.sequence_details ? _pdbx_entry_details.compound_details ? _pdbx_entry_details.source_details ? _pdbx_entry_details.has_ligand_of_interest Y _pdbx_entry_details.has_protein_modification N # loop_ _pdbx_validate_close_contact.id _pdbx_validate_close_contact.PDB_model_num _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_2 _pdbx_validate_close_contact.dist 1 1 OH B TYR 366 ? ? 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'1, 2, 3' 2 1 RECOMBINANT COMPLEX 'Components that form the hexameric Ring' ;RuvBL1 (Chains A-C), amino acids 125-235, and RuvBL2 (Chain E), amino acids 133-238, are present in this model, although the final PostProcess map lacks sufficient density. These reagions were rigid fitted in the Refine Map (Reference models 2C9O for RuvBL1 and 6H7X for RuvBL2). ; ? ? 1,2 # _em_imaging.entry_id 9HB4 _em_imaging.id 1 _em_imaging.astigmatism ? _em_imaging.electron_beam_tilt_params ? _em_imaging.residual_tilt ? _em_imaging.microscope_model 'TFS KRIOS' _em_imaging.specimen_holder_type ? _em_imaging.specimen_holder_model 'FEI TITAN KRIOS AUTOGRID HOLDER' _em_imaging.details ? _em_imaging.date ? _em_imaging.accelerating_voltage 300 _em_imaging.illumination_mode 'FLOOD BEAM' _em_imaging.mode 'BRIGHT FIELD' _em_imaging.nominal_cs 2.7 _em_imaging.nominal_defocus_min 900 _em_imaging.nominal_defocus_max 2000 _em_imaging.calibrated_defocus_min ? _em_imaging.calibrated_defocus_max ? _em_imaging.tilt_angle_min ? _em_imaging.tilt_angle_max ? _em_imaging.nominal_magnification 130000 _em_imaging.calibrated_magnification ? _em_imaging.electron_source 'FIELD EMISSION GUN' _em_imaging.citation_id ? _em_imaging.temperature ? _em_imaging.detector_distance ? _em_imaging.recording_temperature_minimum ? _em_imaging.recording_temperature_maximum ? _em_imaging.alignment_procedure ? _em_imaging.c2_aperture_diameter ? _em_imaging.specimen_id 1 _em_imaging.cryogen NITROGEN # _em_sample_support.id 1 _em_sample_support.film_material ? _em_sample_support.method ? _em_sample_support.grid_material COPPER _em_sample_support.grid_mesh_size 300 _em_sample_support.grid_type 'Quantifoil R2/1' _em_sample_support.details ? _em_sample_support.specimen_id 1 _em_sample_support.citation_id ? # _em_vitrification.entry_id 9HB4 _em_vitrification.id 1 _em_vitrification.specimen_id 1 _em_vitrification.cryogen_name ETHANE _em_vitrification.humidity 95 _em_vitrification.temp ? _em_vitrification.chamber_temperature 292 _em_vitrification.instrument 'LEICA EM GP' _em_vitrification.method ? _em_vitrification.time_resolved_state ? _em_vitrification.citation_id ? _em_vitrification.details ? # _em_experiment.entry_id 9HB4 _em_experiment.id 1 _em_experiment.reconstruction_method 'SINGLE PARTICLE' _em_experiment.aggregation_state PARTICLE _em_experiment.entity_assembly_id 1 # _em_single_particle_entity.entry_id 9HB4 _em_single_particle_entity.id 1 _em_single_particle_entity.image_processing_id 1 _em_single_particle_entity.point_symmetry C1 # loop_ _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_model_num _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.polymer_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.occupancy_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_ins_code _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_seq_id 1 1 Y 1 A MET 1 ? A MET 1 2 1 Y 1 A LYS 2 ? A LYS 2 3 1 Y 1 A ILE 3 ? A ILE 3 4 1 Y 1 A GLU 4 ? A GLU 4 5 1 Y 1 A GLU 5 ? A GLU 5 6 1 Y 1 A VAL 6 ? A VAL 6 7 1 Y 1 A GLU 142 ? A GLU 142 8 1 Y 1 A THR 143 ? A THR 143 9 1 Y 1 A GLU 144 ? A GLU 144 10 1 Y 1 A ASN 145 ? A ASN 145 11 1 Y 1 A PRO 146 ? A PRO 146 12 1 Y 1 A MET 147 ? A MET 147 13 1 Y 1 A GLY 148 ? A GLY 148 14 1 Y 1 A GLY 149 ? A GLY 149 15 1 Y 1 A TYR 150 ? A TYR 150 16 1 Y 1 A GLY 151 ? A GLY 151 17 1 Y 1 A LYS 152 ? A LYS 152 18 1 Y 1 A THR 153 ? A THR 153 19 1 Y 1 A ILE 154 ? A ILE 154 20 1 Y 1 A SER 155 ? A SER 155 21 1 Y 1 A PRO 250 ? A PRO 250 22 1 Y 1 A GLN 251 ? A GLN 251 23 1 Y 1 A GLY 252 ? A GLY 252 24 1 Y 1 A GLY 253 ? A GLY 253 25 1 Y 1 A GLN 254 ? A GLN 254 26 1 Y 1 A ASP 255 ? A ASP 255 27 1 Y 1 A ILE 256 ? A ILE 256 28 1 Y 1 A LEU 257 ? A LEU 257 29 1 Y 1 A SER 258 ? A SER 258 30 1 Y 1 A MET 259 ? A MET 259 31 1 Y 1 A MET 260 ? A MET 260 32 1 Y 1 A GLY 261 ? A GLY 261 33 1 Y 1 A GLN 262 ? A GLN 262 34 1 Y 1 A LEU 263 ? A LEU 263 35 1 Y 1 A MET 264 ? A MET 264 36 1 Y 1 A LYS 265 ? A LYS 265 37 1 Y 1 A PRO 266 ? A PRO 266 38 1 Y 1 A LYS 267 ? A LYS 267 39 1 Y 1 A LYS 268 ? A LYS 268 40 1 Y 1 A THR 269 ? A THR 269 41 1 Y 1 A GLU 270 ? A GLU 270 42 1 Y 1 A ILE 271 ? A ILE 271 43 1 Y 1 A GLN 451 ? A GLN 451 44 1 Y 1 A ASP 452 ? A ASP 452 45 1 Y 1 A LYS 453 ? A LYS 453 46 1 Y 1 A TYR 454 ? A TYR 454 47 1 Y 1 A MET 455 ? A MET 455 48 1 Y 1 A LYS 456 ? A LYS 456 49 1 Y 1 B MET 1 ? B MET 1 50 1 Y 1 B LYS 2 ? B LYS 2 51 1 Y 1 B ILE 3 ? B ILE 3 52 1 Y 1 B GLU 4 ? B GLU 4 53 1 Y 1 B GLU 142 ? B GLU 142 54 1 Y 1 B THR 143 ? B THR 143 55 1 Y 1 B GLU 144 ? B GLU 144 56 1 Y 1 B ASN 145 ? B ASN 145 57 1 Y 1 B PRO 146 ? B PRO 146 58 1 Y 1 B MET 147 ? B MET 147 59 1 Y 1 B GLY 148 ? B GLY 148 60 1 Y 1 B GLY 149 ? B GLY 149 61 1 Y 1 B TYR 150 ? B TYR 150 62 1 Y 1 B GLY 151 ? B GLY 151 63 1 Y 1 B LYS 152 ? B LYS 152 64 1 Y 1 B THR 153 ? B THR 153 65 1 Y 1 B ILE 154 ? B ILE 154 66 1 Y 1 B SER 155 ? B SER 155 67 1 Y 1 B ARG 249 ? B ARG 249 68 1 Y 1 B PRO 250 ? B PRO 250 69 1 Y 1 B GLN 251 ? B GLN 251 70 1 Y 1 B GLY 252 ? B GLY 252 71 1 Y 1 B GLY 253 ? B GLY 253 72 1 Y 1 B GLN 254 ? B GLN 254 73 1 Y 1 B ASP 255 ? B ASP 255 74 1 Y 1 B ILE 256 ? B ILE 256 75 1 Y 1 B LEU 257 ? B LEU 257 76 1 Y 1 B SER 258 ? B SER 258 77 1 Y 1 B MET 259 ? B MET 259 78 1 Y 1 B MET 260 ? B MET 260 79 1 Y 1 B GLY 261 ? B GLY 261 80 1 Y 1 B GLN 262 ? B GLN 262 81 1 Y 1 B LEU 263 ? B LEU 263 82 1 Y 1 B MET 264 ? B MET 264 83 1 Y 1 B LYS 265 ? B LYS 265 84 1 Y 1 B PRO 266 ? B PRO 266 85 1 Y 1 B LYS 267 ? B LYS 267 86 1 Y 1 B LYS 268 ? B LYS 268 87 1 Y 1 B THR 269 ? B THR 269 88 1 Y 1 B GLU 270 ? B GLU 270 89 1 Y 1 B ILE 271 ? B ILE 271 90 1 Y 1 B GLN 450 ? B GLN 450 91 1 Y 1 B GLN 451 ? B GLN 451 92 1 Y 1 B ASP 452 ? B ASP 452 93 1 Y 1 B LYS 453 ? B LYS 453 94 1 Y 1 B TYR 454 ? B TYR 454 95 1 Y 1 B MET 455 ? B MET 455 96 1 Y 1 B LYS 456 ? B LYS 456 97 1 Y 1 C MET 1 ? C MET 1 98 1 Y 1 C LYS 2 ? C LYS 2 99 1 Y 1 C ILE 3 ? C ILE 3 100 1 Y 1 C GLU 4 ? C GLU 4 101 1 Y 1 C GLU 142 ? C GLU 142 102 1 Y 1 C THR 143 ? C THR 143 103 1 Y 1 C GLU 144 ? C GLU 144 104 1 Y 1 C ASN 145 ? C ASN 145 105 1 Y 1 C PRO 146 ? C PRO 146 106 1 Y 1 C MET 147 ? C MET 147 107 1 Y 1 C GLY 148 ? C GLY 148 108 1 Y 1 C GLY 149 ? C GLY 149 109 1 Y 1 C TYR 150 ? C TYR 150 110 1 Y 1 C GLY 151 ? C GLY 151 111 1 Y 1 C LYS 152 ? C LYS 152 112 1 Y 1 C THR 153 ? C THR 153 113 1 Y 1 C ILE 154 ? C ILE 154 114 1 Y 1 C SER 155 ? C SER 155 115 1 Y 1 C ARG 249 ? C ARG 249 116 1 Y 1 C PRO 250 ? C PRO 250 117 1 Y 1 C GLN 251 ? C GLN 251 118 1 Y 1 C GLY 252 ? C GLY 252 119 1 Y 1 C GLY 253 ? C GLY 253 120 1 Y 1 C GLN 254 ? C GLN 254 121 1 Y 1 C ASP 255 ? C ASP 255 122 1 Y 1 C ILE 256 ? C ILE 256 123 1 Y 1 C LEU 257 ? C LEU 257 124 1 Y 1 C SER 258 ? C SER 258 125 1 Y 1 C MET 259 ? C MET 259 126 1 Y 1 C MET 260 ? C MET 260 127 1 Y 1 C GLY 261 ? C GLY 261 128 1 Y 1 C GLN 262 ? C GLN 262 129 1 Y 1 C LEU 263 ? C LEU 263 130 1 Y 1 C MET 264 ? C MET 264 131 1 Y 1 C LYS 265 ? C LYS 265 132 1 Y 1 C PRO 266 ? C PRO 266 133 1 Y 1 C LYS 267 ? C LYS 267 134 1 Y 1 C LYS 268 ? C LYS 268 135 1 Y 1 C THR 269 ? C THR 269 136 1 Y 1 C GLU 270 ? C GLU 270 137 1 Y 1 C ILE 271 ? C ILE 271 138 1 Y 1 C GLN 450 ? C GLN 450 139 1 Y 1 C GLN 451 ? C GLN 451 140 1 Y 1 C ASP 452 ? C ASP 452 141 1 Y 1 C LYS 453 ? C LYS 453 142 1 Y 1 C TYR 454 ? C TYR 454 143 1 Y 1 C MET 455 ? C MET 455 144 1 Y 1 C LYS 456 ? C LYS 456 145 1 Y 1 D MET 1 ? D MET 1 146 1 Y 1 D ALA 2 ? D ALA 2 147 1 Y 1 D THR 3 ? D THR 3 148 1 Y 1 D VAL 4 ? D VAL 4 149 1 Y 1 D THR 5 ? D THR 5 150 1 Y 1 D ALA 6 ? D ALA 6 151 1 Y 1 D THR 7 ? D THR 7 152 1 Y 1 D THR 8 ? D THR 8 153 1 Y 1 D ARG 14 ? D ARG 14 154 1 Y 1 D ASP 15 ? D ASP 15 155 1 Y 1 D VAL 16 ? D VAL 16 156 1 Y 1 D THR 17 ? D THR 17 157 1 Y 1 D ARG 18 ? D ARG 18 158 1 Y 1 D GLU 136 ? D GLU 136 159 1 Y 1 D ILE 137 ? D ILE 137 160 1 Y 1 D ILE 138 ? D ILE 138 161 1 Y 1 D GLU 139 ? D GLU 139 162 1 Y 1 D GLY 140 ? D GLY 140 163 1 Y 1 D GLU 141 ? D GLU 141 164 1 Y 1 D VAL 142 ? D VAL 142 165 1 Y 1 D VAL 143 ? D VAL 143 166 1 Y 1 D GLU 144 ? D GLU 144 167 1 Y 1 D ILE 145 ? D ILE 145 168 1 Y 1 D GLN 146 ? D GLN 146 169 1 Y 1 D ILE 147 ? D ILE 147 170 1 Y 1 D ASP 148 ? D ASP 148 171 1 Y 1 D ARG 149 ? D ARG 149 172 1 Y 1 D PRO 150 ? D PRO 150 173 1 Y 1 D ALA 151 ? D ALA 151 174 1 Y 1 D THR 152 ? D THR 152 175 1 Y 1 D GLY 153 ? D GLY 153 176 1 Y 1 D THR 154 ? D THR 154 177 1 Y 1 D GLY 155 ? D GLY 155 178 1 Y 1 D SER 156 ? D SER 156 179 1 Y 1 D LYS 157 ? D LYS 157 180 1 Y 1 D VAL 158 ? D VAL 158 181 1 Y 1 D GLY 159 ? D GLY 159 182 1 Y 1 D LYS 160 ? D LYS 160 183 1 Y 1 D LEU 161 ? D LEU 161 184 1 Y 1 D THR 162 ? D THR 162 185 1 Y 1 D LEU 163 ? D LEU 163 186 1 Y 1 D LYS 164 ? D LYS 164 187 1 Y 1 D THR 165 ? D THR 165 188 1 Y 1 D THR 166 ? D THR 166 189 1 Y 1 D GLU 167 ? D GLU 167 190 1 Y 1 D MET 168 ? D MET 168 191 1 Y 1 D GLU 169 ? D GLU 169 192 1 Y 1 D THR 170 ? 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