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'Escherichia coli' 562 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 4 oligosaccharide 5 oligosaccharide 6 oligosaccharide 7 oligosaccharide 8 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_descriptor.ordinal _pdbx_entity_branch_descriptor.entity_id _pdbx_entity_branch_descriptor.descriptor _pdbx_entity_branch_descriptor.type _pdbx_entity_branch_descriptor.program _pdbx_entity_branch_descriptor.program_version 1 4 DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1-ROH 'Glycam Condensed Sequence' GMML 1.0 2 4 'WURCS=2.0/1,2,1/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O]/1-1/a4-b1' WURCS PDB2Glycan 1.1.0 3 4 '[][D-1-deoxy-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{}}' LINUCS PDB-CARE ? 4 5 DManpb1-4DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1-ROH 'Glycam Condensed Sequence' GMML 1.0 5 5 'WURCS=2.0/2,3,2/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O][a1122h-1b_1-5]/1-1-2/a4-b1_b4-c1' WURCS PDB2Glycan 1.1.0 6 5 '[][D-1-deoxy-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-Manp]{}}}' LINUCS PDB-CARE ? 7 6 'DManpa1-3DManpa1-6[DManpa1-3]DManpb1-4DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1-ROH' 'Glycam Condensed Sequence' GMML 1.0 8 6 'WURCS=2.0/3,6,5/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O][a1122h-1b_1-5][a1122h-1a_1-5]/1-1-2-3-3-3/a4-b1_b4-c1_c3-d1_c6-e1_e3-f1' WURCS PDB2Glycan 1.1.0 9 6 '[][D-1-deoxy-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-Manp]{[(3+1)][a-D-Manp]{}[(6+1)][a-D-Manp]{[(3+1)][a-D-Manp]{}}}}}' LINUCS PDB-CARE ? 10 7 'DManpa1-3DManpa1-6[DManpa1-3]DManpb1-3DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1-ROH' 'Glycam Condensed Sequence' GMML 1.0 11 7 'WURCS=2.0/3,6,5/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O][a1122h-1b_1-5][a1122h-1a_1-5]/1-1-2-3-3-3/a4-b1_b3-c1_c3-d1_c6-e1_e3-f1' WURCS PDB2Glycan 1.1.0 12 7 '[][D-1-deoxy-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(3+1)][b-D-Manp]{[(3+1)][a-D-Manp]{}[(6+1)][a-D-Manp]{[(3+1)][a-D-Manp]{}}}}}' LINUCS PDB-CARE ? 13 8 DManpb1-3DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1-ROH 'Glycam Condensed Sequence' GMML 1.0 14 8 'WURCS=2.0/2,3,2/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O][a1122h-1b_1-5]/1-1-2/a4-b1_b3-c1' WURCS PDB2Glycan 1.1.0 15 8 '[][D-1-deoxy-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(3+1)][b-D-Manp]{}}}' LINUCS PDB-CARE ? # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order _pdbx_entity_branch_link.details 1 4 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 2 5 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 3 5 3 BMA C1 O1 2 NAG O4 HO4 sing ? 4 6 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 5 6 3 BMA C1 O1 2 NAG O4 HO4 sing ? 6 6 4 MAN C1 O1 3 BMA O6 HO6 sing ? 7 6 5 MAN C1 O1 4 MAN O3 HO3 sing ? 8 6 6 MAN C1 O1 3 BMA O3 HO3 sing ? 9 7 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 10 7 3 BMA C1 O1 2 NAG O3 HO3 sing ? 11 7 4 MAN C1 O1 3 BMA O6 HO6 sing ? 12 7 5 MAN C1 O1 4 MAN O3 HO3 sing ? 13 7 6 MAN C1 O1 3 BMA O3 HO3 sing ? 14 8 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 15 8 3 BMA C1 O1 2 NAG O3 HO3 sing ? # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ABU non-polymer . 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None 'Disulfide bridge' # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 GLY 369 A . ? GLY 53 A PRO 370 A ? PRO 54 A 1 1.06 2 TYR 168 B . ? TYR 143 B PRO 169 B ? PRO 144 B 1 -3.51 3 TYR 168 E . ? TYR 143 E PRO 169 E ? PRO 144 E 1 -1.84 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 6 ? AA2 ? 5 ? AA3 ? 4 ? 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AC6 ? 4 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA1 3 4 ? anti-parallel AA1 4 5 ? anti-parallel AA1 5 6 ? parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA2 3 4 ? anti-parallel AA2 4 5 ? parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA3 3 4 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA4 3 4 ? anti-parallel AA4 4 5 ? anti-parallel AA4 5 6 ? parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA5 3 4 ? anti-parallel AA5 4 5 ? parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA6 3 4 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA7 3 4 ? anti-parallel AA7 4 5 ? anti-parallel AA7 5 6 ? parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA8 3 4 ? anti-parallel AA8 4 5 ? parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AA9 2 3 ? anti-parallel AA9 3 4 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB1 2 3 ? anti-parallel AB1 3 4 ? anti-parallel AB1 4 5 ? parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB2 2 3 ? anti-parallel AB2 3 4 ? anti-parallel AB2 4 5 ? parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB3 2 3 ? anti-parallel AB3 3 4 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB4 2 3 ? anti-parallel AB4 3 4 ? anti-parallel AB4 4 5 ? anti-parallel AB4 5 6 ? parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB5 2 3 ? anti-parallel AB5 3 4 ? anti-parallel AB5 4 5 ? parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB6 2 3 ? anti-parallel AB6 3 4 ? anti-parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB7 2 3 ? anti-parallel AB7 3 4 ? anti-parallel AB8 1 2 ? parallel AB8 2 3 ? anti-parallel AB8 3 4 ? anti-parallel AB8 4 5 ? anti-parallel AB8 5 6 ? anti-parallel AB9 1 2 ? parallel AB9 2 3 ? anti-parallel AB9 3 4 ? anti-parallel AC1 1 2 ? anti-parallel AC1 2 3 ? anti-parallel AC1 3 4 ? anti-parallel AC2 1 2 ? parallel AC2 2 3 ? anti-parallel AC2 3 4 ? anti-parallel AC2 4 5 ? anti-parallel AC2 5 6 ? anti-parallel AC3 1 2 ? parallel AC3 2 3 ? anti-parallel AC3 3 4 ? anti-parallel AC4 1 2 ? anti-parallel AC4 2 3 ? anti-parallel AC4 3 4 ? anti-parallel AC5 1 2 ? parallel AC5 2 3 ? anti-parallel AC5 3 4 ? anti-parallel AC5 4 5 ? anti-parallel AC5 5 6 ? anti-parallel AC6 1 2 ? parallel AC6 2 3 ? anti-parallel AC6 3 4 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 ARG A 401 ? 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ILE B 164 TRP B 168 AA5 1 ASP B 126 ? VAL B 131 ? ASP B 101 VAL B 106 AA5 2 THR B 148 ? ALA B 160 ? THR B 123 ALA B 135 AA5 3 ASP B 81 ? ARG B 93 ? ASP B 56 ARG B 68 AA5 4 VAL B 61 ? SER B 76 ? VAL B 36 SER B 51 AA5 5 VAL B 200 ? THR B 201 ? VAL B 175 THR B 176 AA6 1 THR B 121 ? PHE B 123 ? THR B 96 PHE B 98 AA6 2 GLU B 172 ? SER B 181 ? GLU B 147 SER B 156 AA6 3 GLY B 228 ? ARG B 241 ? GLY B 203 ARG B 216 AA6 4 PHE B 211 ? PHE B 225 ? PHE B 186 PHE B 200 AA7 1 LEU C 106 ? THR C 107 ? LEU C 81 THR C 82 AA7 2 ARG C 139 ? LEU C 143 ? ARG C 114 LEU C 118 AA7 3 THR C 148 ? ALA C 160 ? THR C 123 ALA C 135 AA7 4 ASP C 81 ? ARG C 93 ? ASP C 56 ARG C 68 AA7 5 VAL C 61 ? SER C 76 ? VAL C 36 SER C 51 AA7 6 ILE C 189 ? TRP C 193 ? ILE C 164 TRP C 168 AA8 1 ASP C 126 ? VAL C 131 ? ASP C 101 VAL C 106 AA8 2 THR C 148 ? ALA C 160 ? THR C 123 ALA C 135 AA8 3 ASP C 81 ? ARG C 93 ? ASP C 56 ARG C 68 AA8 4 VAL C 61 ? SER C 76 ? VAL C 36 SER C 51 AA8 5 VAL C 200 ? THR C 201 ? 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ALA P 479 LYS P 486 AB8 4 ILE F 439 ? GLN F 445 ? ILE P 420 GLN P 426 AB8 5 GLU F 452 ? SER F 458 ? GLU P 433 SER P 439 AB8 6 THR F 464 ? TYR F 466 ? THR P 445 TYR P 447 AB9 1 GLY F 29 ? LEU F 30 ? GLY P 10 LEU P 11 AB9 2 THR F 525 ? THR F 528 ? THR P 506 THR P 509 AB9 3 ALA F 498 ? LYS F 505 ? ALA P 479 LYS P 486 AB9 4 TYR F 518 ? TRP F 521 ? TYR P 499 TRP P 502 AC1 1 GLN G 22 ? SER G 26 ? GLN Q 3 SER Q 7 AC1 2 ARG G 425 ? SER G 431 ? ARG Q 406 SER Q 412 AC1 3 THR G 484 ? GLU G 488 ? THR Q 465 GLU Q 469 AC1 4 THR G 475 ? ASP G 479 ? THR Q 456 ASP Q 460 AC2 1 GLY G 29 ? LEU G 30 ? GLY Q 10 LEU Q 11 AC2 2 THR G 525 ? THR G 528 ? THR Q 506 THR Q 509 AC2 3 ALA G 498 ? LYS G 505 ? ALA Q 479 LYS Q 486 AC2 4 ILE G 439 ? GLN G 445 ? ILE Q 420 GLN Q 426 AC2 5 GLU G 452 ? SER G 458 ? GLU Q 433 SER Q 439 AC2 6 THR G 464 ? TYR G 466 ? THR Q 445 TYR Q 447 AC3 1 GLY G 29 ? LEU G 30 ? GLY Q 10 LEU Q 11 AC3 2 THR G 525 ? THR G 528 ? THR Q 506 THR Q 509 AC3 3 ALA G 498 ? LYS G 505 ? 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C C N N 399 PRO O O N N 400 PRO CB C N N 401 PRO CG C N N 402 PRO CD C N N 403 PRO OXT O N N 404 PRO H H N N 405 PRO HA H N N 406 PRO HB2 H N N 407 PRO HB3 H N N 408 PRO HG2 H N N 409 PRO HG3 H N N 410 PRO HD2 H N N 411 PRO HD3 H N N 412 PRO HXT H N N 413 SER N N N N 414 SER CA C N S 415 SER C C N N 416 SER O O N N 417 SER CB C N N 418 SER OG O N N 419 SER OXT O N N 420 SER H H N N 421 SER H2 H N N 422 SER HA H N N 423 SER HB2 H N N 424 SER HB3 H N N 425 SER HG H N N 426 SER HXT H N N 427 THR N N N N 428 THR CA C N S 429 THR C C N N 430 THR O O N N 431 THR CB C N R 432 THR OG1 O N N 433 THR CG2 C N N 434 THR OXT O N N 435 THR H H N N 436 THR H2 H N N 437 THR HA H N N 438 THR HB H N N 439 THR HG1 H N N 440 THR HG21 H N N 441 THR HG22 H N N 442 THR HG23 H N N 443 THR HXT H N N 444 TRP N N N N 445 TRP CA C N S 446 TRP C C N N 447 TRP O O N N 448 TRP CB C N N 449 TRP CG C Y N 450 TRP CD1 C Y N 451 TRP CD2 C Y N 452 TRP NE1 N Y N 453 TRP CE2 C Y N 454 TRP CE3 C Y N 455 TRP CZ2 C Y N 456 TRP 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HXT H N N 514 # loop_ _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_ordinal ABU N CD sing N N 1 ABU N H sing N N 2 ABU N H2 sing N N 3 ABU CD CB sing N N 4 ABU CD HA1 sing N N 5 ABU CD HA2 sing N N 6 ABU CB CG sing N N 7 ABU CB HB1 sing N N 8 ABU CB HB2 sing N N 9 ABU CG C sing N N 10 ABU CG HG1 sing N N 11 ABU CG HG2 sing N N 12 ABU C O doub N N 13 ABU C OXT sing N N 14 ABU OXT HXT sing N N 15 ALA N CA sing N N 16 ALA N H sing N N 17 ALA N H2 sing N N 18 ALA CA C sing N N 19 ALA CA CB sing N N 20 ALA CA HA sing N N 21 ALA C O doub N N 22 ALA C OXT sing N N 23 ALA CB HB1 sing N N 24 ALA CB HB2 sing N N 25 ALA CB HB3 sing N N 26 ALA OXT HXT sing N N 27 ARG N CA sing N N 28 ARG N H sing N N 29 ARG N H2 sing N N 30 ARG CA C sing N N 31 ARG CA CB sing N N 32 ARG CA HA sing N N 33 ARG C O doub N N 34 ARG C OXT sing N N 35 ARG CB CG sing N N 36 ARG CB HB2 sing N N 37 ARG CB HB3 sing N N 38 ARG CG CD sing N N 39 ARG CG HG2 sing N N 40 ARG CG HG3 sing N N 41 ARG CD NE sing N N 42 ARG CD HD2 sing N N 43 ARG CD HD3 sing N N 44 ARG NE CZ sing N N 45 ARG NE HE sing N N 46 ARG CZ NH1 sing N N 47 ARG CZ NH2 doub N N 48 ARG NH1 HH11 sing N N 49 ARG NH1 HH12 sing N N 50 ARG NH2 HH21 sing N N 51 ARG NH2 HH22 sing N N 52 ARG OXT HXT sing N N 53 ASN N CA sing N N 54 ASN N H sing N N 55 ASN N H2 sing N N 56 ASN CA C sing N N 57 ASN CA CB sing N N 58 ASN CA HA sing N N 59 ASN C O doub N N 60 ASN C OXT sing N N 61 ASN CB CG sing N N 62 ASN CB HB2 sing N N 63 ASN CB HB3 sing N N 64 ASN CG OD1 doub N N 65 ASN CG ND2 sing N N 66 ASN ND2 HD21 sing N N 67 ASN ND2 HD22 sing N N 68 ASN OXT HXT sing N N 69 ASP N CA sing N N 70 ASP N H sing N N 71 ASP N H2 sing N N 72 ASP CA C sing N N 73 ASP CA CB sing N N 74 ASP CA HA sing N N 75 ASP C O doub N N 76 ASP C OXT sing N N 77 ASP CB CG sing N N 78 ASP CB HB2 sing N N 79 ASP CB HB3 sing N N 80 ASP CG OD1 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C3 sing N N 125 EPE C2 H21 sing N N 126 EPE C2 H22 sing N N 127 EPE C3 N4 sing N N 128 EPE C3 H31 sing N N 129 EPE C3 H32 sing N N 130 EPE N4 C5 sing N N 131 EPE N4 C7 sing N N 132 EPE C5 C6 sing N N 133 EPE C5 H51 sing N N 134 EPE C5 H52 sing N N 135 EPE C6 H61 sing N N 136 EPE C6 H62 sing N N 137 EPE C7 C8 sing N N 138 EPE C7 H71 sing N N 139 EPE C7 H72 sing N N 140 EPE C8 O8 sing N N 141 EPE C8 H81 sing N N 142 EPE C8 H82 sing N N 143 EPE O8 HO8 sing N N 144 EPE C9 C10 sing N N 145 EPE C9 H91 sing N N 146 EPE C9 H92 sing N N 147 EPE C10 S sing N N 148 EPE C10 H101 sing N N 149 EPE C10 H102 sing N N 150 EPE S O1S doub N N 151 EPE S O2S doub N N 152 EPE S O3S sing N N 153 EPE O3S HOS3 sing N N 154 GLN N CA sing N N 155 GLN N H sing N N 156 GLN N H2 sing N N 157 GLN CA C sing N N 158 GLN CA CB sing N N 159 GLN CA HA sing N N 160 GLN C O doub N N 161 GLN C OXT sing N N 162 GLN CB CG sing N N 163 GLN CB HB2 sing N N 164 GLN CB HB3 sing N N 165 GLN CG CD sing N N 166 GLN CG HG2 sing N N 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HIS CB HB3 sing N N 211 HIS CG ND1 sing Y N 212 HIS CG CD2 doub Y N 213 HIS ND1 CE1 doub Y N 214 HIS ND1 HD1 sing N N 215 HIS CD2 NE2 sing Y N 216 HIS CD2 HD2 sing N N 217 HIS CE1 NE2 sing Y N 218 HIS CE1 HE1 sing N N 219 HIS NE2 HE2 sing N N 220 HIS OXT HXT sing N N 221 ILE N CA sing N N 222 ILE N H sing N N 223 ILE N H2 sing N N 224 ILE CA C sing N N 225 ILE CA CB sing N N 226 ILE CA HA sing N N 227 ILE C O doub N N 228 ILE C OXT sing N N 229 ILE CB CG1 sing N N 230 ILE CB CG2 sing N N 231 ILE CB HB sing N N 232 ILE CG1 CD1 sing N N 233 ILE CG1 HG12 sing N N 234 ILE CG1 HG13 sing N N 235 ILE CG2 HG21 sing N N 236 ILE CG2 HG22 sing N N 237 ILE CG2 HG23 sing N N 238 ILE CD1 HD11 sing N N 239 ILE CD1 HD12 sing N N 240 ILE CD1 HD13 sing N N 241 ILE OXT HXT sing N N 242 LEU N CA sing N N 243 LEU N H sing N N 244 LEU N H2 sing N N 245 LEU CA C sing N N 246 LEU CA CB sing N N 247 LEU CA HA sing N N 248 LEU C O doub N N 249 LEU C OXT sing N N 250 LEU CB CG sing N N 251 LEU CB HB2 sing N N 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