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_refine.ls_restrained_S_obs ? _refine.ls_shift_over_esd_max ? _refine.ls_shift_over_esd_mean ? _refine.ls_structure_factor_coef ? _refine.ls_weighting_details ? _refine.ls_weighting_scheme ? _refine.ls_wR_factor_all ? _refine.ls_wR_factor_obs ? _refine.ls_wR_factor_R_free ? _refine.ls_wR_factor_R_work ? _refine.occupancy_max ? _refine.occupancy_min ? _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.pdbx_R_complete ? _refine.ls_R_factor_gt ? _refine.ls_goodness_of_fit_gt ? _refine.ls_goodness_of_fit_ref ? _refine.ls_shift_over_su_max ? _refine.ls_shift_over_su_max_lt ? _refine.ls_shift_over_su_mean ? _refine.ls_shift_over_su_mean_lt ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F ? _refine.pdbx_ls_sigma_Fsqd ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method NONE _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values 'GeoStd + Monomer Library + CDL v1.2' _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_real_space_R ? _refine.pdbx_density_correlation ? _refine.pdbx_pd_number_of_powder_patterns ? _refine.pdbx_pd_number_of_points ? _refine.pdbx_pd_meas_number_of_points ? _refine.pdbx_pd_proc_ls_prof_R_factor ? _refine.pdbx_pd_proc_ls_prof_wR_factor ? _refine.pdbx_pd_Marquardt_correlation_coeff ? _refine.pdbx_pd_Fsqrd_R_factor ? _refine.pdbx_pd_ls_matrix_band_width ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.pdbx_diffrn_id ? _refine.overall_SU_B ? 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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.4878 ? 14872 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.0366 ? 1723 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.0024 ? 1783 ? f_plane_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 20.4592 ? 3928 ? f_dihedral_angle_d ? ? # _struct.entry_id 9HZG _struct.title 'Ku70/80 bound to WRN-exo' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 9HZG _struct_keywords.text 'WRN, Ku70, Ku80, NHEJ, DNA BINDING PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'DNA BINDING PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? F N N 6 ? G N N 7 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP XRCC6_HUMAN P12956 ? 1 ;MSGWESYYKTEGDEEAEEEQEENLEASGDYKYSGRDSLIFLVDASKAMFESQSEDELTPFDMSIQCIQSVYISKIISSDR DLLAVVFYGTEKDKNSVNFKNIYVLQELDNPGAKRILELDQFKGQQGQKRFQDMMGHGSDYSLSEVLWVCANLFSDVQFK MSHKRIMLFTNEDNPHGNDSAKASRARTKAGDLRDTGIFLDLMHLKKPGGFDISLFYRDIISIAEDEDLRVHFEESSKLE DLLRKVRAKETRKRALSRLKLKLNKDIVISVGIYNLVQKALKPPPIKLYRETNEPVKTKTRTFNTSTGGLLLPSDTKRSQ IYGSRQIILEKEETEELKRFDDPGLMLMGFKPLVLLKKHHYLRPSLFVYPEESLVIGSSTLFSALLIKCLEKEVAALCRY TPRRNIPPYFVALVPQEEELDDQKIQVTPPGFQLVFLPFADDKRKMPFTEKIMATPEQVGKMKAIVEKLRFTYRSDSFEN PVLQQHFRNLEALALDLMEPEQAVDLTLPKVEAMNKRLGSLVDEFKELVYPPDYNPEGKVTKRKHDNEGSGSKRPKVEYS EEELKTHISKGTLGKFTVPMLKEACRAYGLKSGLKKQELLEALTKHFQD ; 1 2 UNP WRN_HUMAN Q14191 ? 2 ;MSEKKLETTAQQRKCPEWMNVQNKRCAVEERKACVRKSVFEDDLPFLEFTGSIVYSYDASDCSFLSEDISMSLSDGDVVG FDMEWPPLYNRGKLGKVALIQLCVSESKCYLFHVSSMSVFPQGLKMLLENKAVKKAGVGIEGDQWKLLRDFDIKLKNFVE LTDVANKKLKCTETWSLNSLVKHLLGKQLLKDKSIRCSNWSKFPLTEDQKLYAATDAYAGFIIYRNLEILDDTVQRFAIN KEEEILLSDMNKQLTSISEEVMDLAKHLPHAFSKLENPRRVSILLKDISENLYSLRRMIIGSTNIETELRPSNNLNLLSF EDSTTGGVQQKQIREHEVLIHVEDETWDPTLDHLAKHDGEDVLGNKVERKEDGFEDGVEDNKLKENMERACLMSLDITEH ELQILEQQSQEEYLSDIAYKSTEHLSPNDNENDTSYVIESDEDLEMEMLKHLSPNDNENDTSYVIESDEDLEMEMLKSLE NLNSGTVEPTHSKCLKMERNLGLPTKEEEEDDENEANEGEEDDDKDFLWPAPNEEQVTCLKMYFGHSSFKPVQWKVIHSV LEERRDNVAVMATGYGKSLCFQYPPVYVGKIGLVISPLISLMEDQVLQLKMSNIPACFLGSAQSENVLTDIKLGKYRIVY VTPEYCSGNMGLLQQLEADIGITLIAVDEAHCISEWGHDFRDSFRKLGSLKTALPMVPIVALTATASSSIREDIVRCLNL RNPQITCTGFDRPNLYLEVRRKTGNILQDLQPFLVKTSSHWEFEGPTIIYCPSRKMTQQVTGELRKLNLSCGTYHAGMSF STRKDIHHRFVRDEIQCVIATIAFGMGINKADIRQVIHYGAPKDMESYYQEIGRAGRDGLQSSCHVLWAPADINLNRHLL TEIRNEKFRLYKLKMMAKMEKYLHSSRCRRQIILSHFEDKQVQKASLGIMGTEKCCDNCRSRLDHCYSMDDSEDTSWDFG PQAFKLLSAVDILGEKFGIGLPILFLRGSNSQRLADQYRRHSLFGTGKDQTESWWKAFSRQLITEGFLVEVSRYNKFMKI CALTKKGRNWLHKANTESQSLILQANEELCPKKLLLPSSKTVSSGTKEHCYNQVPVELSTEKKSNLEKLYSYKPCDKISS GSNISKKSIMVQSPEKAYSSSQPVISAQEQETQIVLYGKLVEARQKHANKMDVPPAILATNKILVDMAKMRPTTVENVKR IDGVSEGKAAMLAPLLEVIKHFCQTNSVQTDLFSSTKPQEEQKTSLVAKNKICTLSQSMAITYSLFQEKKMPLKSIAESR ILPLMTIGMHLSQAVKAGCPLDLERAGLTPEVQKIIADVIRNPPVNSDMSKISLIRMLVPENIDTYLIHMAIEILKHGPD SGLQPSCDVNKRRCFPGSEEICSSSKRSKEEVGINTETSSAERKRRLPVWFAKGSDTSKKLMDKTKRGGLFS ; 1 3 UNP XRCC5_HUMAN P13010 ? 3 ;MVRSGNKAAVVLCMDVGFTMSNSIPGIESPFEQAKKVITMFVQRQVFAENKDEIALVLFGTDGTDNPLSGGDQYQNITVH RHLMLPDFDLLEDIESKIQPGSQQADFLDALIVSMDVIQHETIGKKFEKRHIEIFTDLSSRFSKSQLDIIIHSLKKCDIS LQFFLPFSLGKEDGSGDRGDGPFRLGGHGPSFPLKGITEQQKEGLEIVKMVMISLEGEDGLDEIYSFSESLRKLCVFKKI ERHSIHWPCRLTIGSNLSIRIAAYKSILQERVKKTWTVVDAKTLKKEDIQKETVYCLNDDDETEVLKEDIIQGFRYGSDI VPFSKVDEEQMKYKSEGKCFSVLGFCKSSQVQRRFFMGNQVLKVFAARDDEAAAVALSSLIHALDDLDMVAIVRYAYDKR ANPQVGVAFPHIKHNYECLVYVQLPFMEDLRQYMFSSLKNSKKYAPTEAQLNAVDALIDSMSLAKKDEKTDTLEDLFPTT KIPNPRFQRLFQCLLHRALHPREPLPPIQQHIWNMLNPPAEVTTKSQIPLSKIKTLFPLIEAKKKDQVTAQEIFQDNHED GPTAKKLKTEQGGAHFSVSSLAEGSVTSVGSVNPAENFRVLVKQKKASFEEASNQLINHIEQFLDTNETPYFMKSIDCIR AFREEAIKFSEEQRFNNFLKALQEKVEIKQLNHFWEIVVQDGITLITKEEASGSSVTAEEAKKFLAPKDKPSGDTAAVFE EGGDVDDLLDMI ; 1 4 PDB 9HZG 9HZG ? 4 ? 1 5 PDB 9HZG 9HZG ? 5 ? 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 9HZG A 1 ? 609 ? P12956 1 ? 609 ? 1 609 2 2 9HZG E 1 ? 1432 ? Q14191 1 ? 1432 ? 1 1432 3 3 9HZG B 1 ? 732 ? P13010 1 ? 732 ? 1 732 4 4 9HZG O 1 ? 17 ? 9HZG 3 ? 19 ? 3 19 5 5 9HZG P 1 ? 17 ? 9HZG 17 ? 33 ? 17 33 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details pentameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 5 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'not applicable' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 SER A 45 ? GLU A 50 ? SER A 45 GLU A 50 5 ? 6 HELX_P HELX_P2 AA2 THR A 58 ? SER A 78 ? THR A 58 SER A 78 1 ? 21 HELX_P HELX_P3 AA3 GLY A 112 ? GLN A 121 ? GLY A 112 GLN A 121 1 ? 10 HELX_P HELX_P4 AA4 LYS A 123 ? MET A 135 ? LYS A 123 MET A 135 1 ? 13 HELX_P HELX_P5 AA5 SER A 142 ? SER A 155 ? SER A 142 SER A 155 1 ? 14 HELX_P HELX_P6 AA6 ASP A 179 ? THR A 196 ? ASP A 179 THR A 196 1 ? 18 HELX_P HELX_P7 AA7 LYS A 238 ? THR A 251 ? LYS A 238 THR A 251 1 ? 14 HELX_P HELX_P8 AA8 LEU A 312 ? SER A 314 ? LEU A 312 SER A 314 5 ? 3 HELX_P HELX_P9 AA9 GLU A 330 ? LEU A 337 ? GLU A 330 LEU A 337 1 ? 8 HELX_P HELX_P10 AB1 VAL A 354 ? LEU A 356 ? VAL A 354 LEU A 356 5 ? 3 HELX_P HELX_P11 AB2 GLY A 377 ? GLU A 393 ? GLY A 377 GLU A 393 1 ? 17 HELX_P HELX_P12 AB3 THR A 455 ? LEU A 469 ? THR A 455 LEU A 469 1 ? 15 HELX_P HELX_P13 AB4 ASN A 480 ? ASP A 496 ? ASN A 480 ASP A 496 1 ? 17 HELX_P HELX_P14 AB5 LYS A 510 ? LEU A 518 ? LYS A 510 LEU A 518 1 ? 9 HELX_P HELX_P15 AB6 VAL A 522 ? TYR A 530 ? VAL A 522 TYR A 530 1 ? 9 HELX_P HELX_P16 AB7 SER A 560 ? GLY A 571 ? SER A 560 GLY A 571 1 ? 12 HELX_P HELX_P17 AB8 THR A 577 ? TYR A 588 ? THR A 577 TYR A 588 1 ? 12 HELX_P HELX_P18 AB9 LYS A 595 ? ASP A 609 ? LYS A 595 ASP A 609 1 ? 15 HELX_P HELX_P19 AC1 PRO B 16 ? ARG B 25 ? PRO E 16 ARG E 25 1 ? 10 HELX_P HELX_P20 AC2 CYS B 26 ? VAL B 28 ? CYS E 26 VAL E 28 5 ? 3 HELX_P HELX_P21 AC3 PHE B 40 ? LEU B 44 ? PHE E 40 LEU E 44 5 ? 5 HELX_P HELX_P22 AC4 ASP B 58 ? LEU B 73 ? ASP E 58 LEU E 73 1 ? 16 HELX_P HELX_P23 AC5 PRO B 121 ? ASN B 130 ? PRO E 121 ASN E 130 1 ? 10 HELX_P HELX_P24 AC6 GLY B 139 ? ASP B 152 ? GLY E 139 ASP E 152 1 ? 14 HELX_P HELX_P25 AC7 LEU B 161 ? LYS B 170 ? LEU E 161 LYS E 170 1 ? 10 HELX_P HELX_P26 AC8 SER B 176 ? LYS B 182 ? SER E 176 LYS E 182 1 ? 7 HELX_P HELX_P27 AC9 ASP B 192 ? CYS B 197 ? ASP E 192 CYS E 197 1 ? 6 HELX_P HELX_P28 AD1 THR B 206 ? LEU B 230 ? THR E 206 LEU E 230 1 ? 25 HELX_P HELX_P29 AD2 PHE C 18 ? ASN C 22 ? PHE B 18 ASN B 22 5 ? 5 HELX_P HELX_P30 AD3 SER C 29 ? ALA C 48 ? SER B 29 ALA B 48 1 ? 20 HELX_P HELX_P31 AD4 ASP C 87 ? SER C 96 ? ASP B 87 SER B 96 1 ? 10 HELX_P HELX_P32 AD5 ASP C 106 ? THR C 122 ? ASP B 106 THR B 122 1 ? 17 HELX_P HELX_P33 AD6 GLN C 146 ? ASP C 158 ? GLN B 146 ASP B 158 1 ? 13 HELX_P HELX_P34 AD7 THR C 198 ? GLY C 217 ? THR B 198 GLY B 217 1 ? 20 HELX_P HELX_P35 AD8 GLU C 218 ? ASP C 222 ? GLU B 218 ASP B 222 5 ? 5 HELX_P HELX_P36 AD9 PHE C 227 ? ARG C 232 ? PHE B 227 ARG B 232 1 ? 6 HELX_P HELX_P37 AE1 PHE C 237 ? GLU C 241 ? PHE B 237 GLU B 241 5 ? 5 HELX_P HELX_P38 AE2 LYS C 285 ? GLU C 287 ? LYS B 285 GLU B 287 5 ? 3 HELX_P HELX_P39 AE3 LEU C 306 ? GLU C 308 ? LEU B 306 GLU B 308 5 ? 3 HELX_P HELX_P40 AE4 VAL C 326 ? MET C 331 ? VAL B 326 MET B 331 1 ? 6 HELX_P HELX_P41 AE5 SER C 349 ? VAL C 351 ? SER B 349 VAL B 351 5 ? 3 HELX_P HELX_P42 AE6 GLN C 352 ? PHE C 356 ? GLN B 352 PHE B 356 5 ? 5 HELX_P HELX_P43 AE7 ALA C 374 ? ASP C 388 ? 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