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EMDB EMD-52580 ? ? # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal _pdbx_audit_revision_history.data_content_type _pdbx_audit_revision_history.major_revision _pdbx_audit_revision_history.minor_revision _pdbx_audit_revision_history.revision_date _pdbx_audit_revision_history.part_number 1 'Structure model' 1 0 2025-09-03 ? 2 'EM metadata' 1 0 2025-09-03 ? 3 FSC 1 0 2025-09-03 ? 4 'Half map' 1 0 2025-09-03 1 5 'Half map' 1 0 2025-09-03 2 6 Image 1 0 2025-09-03 ? 7 'Primary map' 1 0 2025-09-03 ? 8 'Structure model' 1 1 2025-09-24 ? 9 'Structure model' 1 2 2025-11-26 ? # loop_ _pdbx_audit_revision_details.ordinal _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_details.data_content_type _pdbx_audit_revision_details.provider _pdbx_audit_revision_details.type _pdbx_audit_revision_details.description _pdbx_audit_revision_details.details 1 1 'Structure model' repository 'Initial release' ? ? 2 2 'EM metadata' repository 'Initial release' ? ? 3 3 FSC repository 'Initial release' ? ? 4 4 'Half map' repository 'Initial release' ? ? 5 5 'Half map' repository 'Initial release' ? ? 6 6 Image repository 'Initial release' ? ? 7 7 'Primary map' repository 'Initial release' ? ? # loop_ _pdbx_audit_revision_group.ordinal _pdbx_audit_revision_group.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_group.data_content_type _pdbx_audit_revision_group.group 1 8 'Structure model' 'Data collection' 2 8 'Structure model' 'Database references' 3 9 'Structure model' 'Data collection' 4 9 'Structure model' 'Database references' # loop_ _pdbx_audit_revision_category.ordinal _pdbx_audit_revision_category.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_category.data_content_type _pdbx_audit_revision_category.category 1 8 'Structure model' citation 2 8 'Structure model' citation_author 3 8 'Structure model' em_admin 4 9 'Structure model' citation 5 9 'Structure model' em_admin # loop_ _pdbx_audit_revision_item.ordinal _pdbx_audit_revision_item.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_item.data_content_type _pdbx_audit_revision_item.item 1 8 'Structure model' '_citation.country' 2 8 'Structure model' '_citation.journal_abbrev' 3 8 'Structure model' '_citation.journal_id_CSD' 4 8 'Structure model' '_citation.journal_id_ISSN' 5 8 'Structure model' '_citation.pdbx_database_id_DOI' 6 8 'Structure model' '_citation.pdbx_database_id_PubMed' 7 8 'Structure model' '_citation.title' 8 8 'Structure model' '_citation.year' 9 8 'Structure model' '_em_admin.last_update' 10 9 'Structure model' '_citation.journal_volume' 11 9 'Structure model' '_citation.page_first' 12 9 'Structure model' '_citation.page_last' 13 9 'Structure model' '_citation.pdbx_database_id_PubMed' 14 9 'Structure model' '_citation.title' 15 9 'Structure model' '_em_admin.last_update' # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 9I2B _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2025-01-20 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site PDBE _pdbx_database_status.process_site PDBE _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y # _pdbx_database_related.db_name EMDB _pdbx_database_related.details 'SPIN90-Arp2/3 complex at the end of their nucleated actin filaments' _pdbx_database_related.db_id EMD-52580 _pdbx_database_related.content_type 'associated EM volume' # _pdbx_contact_author.id 2 _pdbx_contact_author.email c.moores@bbk.ac.uk _pdbx_contact_author.name_first Carolyn _pdbx_contact_author.name_last Moores _pdbx_contact_author.name_mi A. _pdbx_contact_author.role 'principal investigator/group leader' _pdbx_contact_author.identifier_ORCID 0000-0001-5686-6290 # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Liu, T.' 1 ? 'Moores, C.A.' 2 ? # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country US _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev Nat.Struct.Mol.Biol. _citation.journal_id_ASTM ? _citation.journal_id_CSD ? _citation.journal_id_ISSN 1545-9985 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume 32 _citation.language ? _citation.page_first 2262 _citation.page_last 2271 _citation.title 'Arp2/3-mediated bidirectional actin assembly by SPIN90 dimers.' _citation.year 2025 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1038/s41594-025-01665-8 _citation.pdbx_database_id_PubMed 40954369 _citation.pdbx_database_id_patent ? _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Liu, T.' 1 ? primary 'Cao, L.' 2 ? primary 'Mladenov, M.' 3 ? primary 'Romet-Lemonne, G.' 4 ? primary 'Way, M.' 5 ? primary 'Moores, C.A.' 6 ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer man 'Actin-related protein 2' 44818.711 2 ? ? ? ? 2 polymer man 'Actin-related protein 2/3 complex subunit 2' 34386.043 2 ? ? ? ? 3 polymer man 'Actin-related protein 2/3 complex subunit 3' 20572.666 2 ? ? ? ? 4 polymer man 'Actin-related protein 2/3 complex subunit 4' 19697.047 2 ? ? ? ? 5 polymer man 'Actin-related protein 2/3 complex subunit 5-like protein' 16964.180 2 ? ? ? ? 6 polymer nat 'Actin, cytoplasmic 1' 41782.660 4 ? ? ? ? 7 polymer nat Phalloidin 808.899 4 ? ? ? ? 8 polymer man 'NCK-interacting protein with SH3 domain' 79054.094 2 ? ? ? ? 9 polymer man 'Actin-related protein 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_entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no ;MDSQGRKVVVCDNGTGFVKCGYAGSNFPEHIFPALVGRPIIRSTTKVGNIEIKDLMVGDEASELRSMLEVNYPMENGIVR NWDDMKHLWDYTFGPEKLNIDTRNCKILLTEPPMNPTKNREKIVEVMFETYQFSGVYVAIQAVLTLYAQGLLTGVVVDSG DGVTHICPVYEGFSLPHLTRRLDIAGRDITRYLIKLLLLRGYAFNHSADFETVRMIKEKLCYVGYNIEQEQKLALETTVL VESYTLPDGRIIKVGGERFEAPEALFQPHLINVEGVGVAELLFNTIQAADIDTRSEFYKHIVLSGGSTMYPGLPSRLERE LKQLYLERVLKGDVEKLSKFKIRIEDPPRRKHMVFLGGAVLADIMKDKDNFWMTRQEYQEKGVRVLEKLGVTVR ; ;MDSQGRKVVVCDNGTGFVKCGYAGSNFPEHIFPALVGRPIIRSTTKVGNIEIKDLMVGDEASELRSMLEVNYPMENGIVR NWDDMKHLWDYTFGPEKLNIDTRNCKILLTEPPMNPTKNREKIVEVMFETYQFSGVYVAIQAVLTLYAQGLLTGVVVDSG DGVTHICPVYEGFSLPHLTRRLDIAGRDITRYLIKLLLLRGYAFNHSADFETVRMIKEKLCYVGYNIEQEQKLALETTVL VESYTLPDGRIIKVGGERFEAPEALFQPHLINVEGVGVAELLFNTIQAADIDTRSEFYKHIVLSGGSTMYPGLPSRLERE LKQLYLERVLKGDVEKLSKFKIRIEDPPRRKHMVFLGGAVLADIMKDKDNFWMTRQEYQEKGVRVLEKLGVTVR ; B,L ? 2 'polypeptide(L)' no no ;MILLEVNNRIIEETLALKFENAAAGNKPEAVEVTFADFDGVLYHISNPNGDKTKVMVSISLKFYKELQAHGADELLKRVY GSFLVNPESGYNVSLLYDLENLPASKDSIVHQAGMLKRNCFASVFEKYFQFQEEGKEGENRAVIHYRDDETMYVESKKDR VTVVFSTVFKDDDDVVIGKVFMQEFKEGRRASHTAPQVLFSHREPPLELKDTDAAVGDNIGYITFVLFPRHTNASARDNT INLIHTFRDYLHYHIKCSKAYIHTRMRAKTSDFLKVLNRARPDAEKKEMKTITGKTFSSR ; ;MILLEVNNRIIEETLALKFENAAAGNKPEAVEVTFADFDGVLYHISNPNGDKTKVMVSISLKFYKELQAHGADELLKRVY GSFLVNPESGYNVSLLYDLENLPASKDSIVHQAGMLKRNCFASVFEKYFQFQEEGKEGENRAVIHYRDDETMYVESKKDR VTVVFSTVFKDDDDVVIGKVFMQEFKEGRRASHTAPQVLFSHREPPLELKDTDAAVGDNIGYITFVLFPRHTNASARDNT INLIHTFRDYLHYHIKCSKAYIHTRMRAKTSDFLKVLNRARPDAEKKEMKTITGKTFSSR ; D,N ? 3 'polypeptide(L)' no no ;MPAYHSSLMDPDTKLIGNMALLPIRSQFKGPAPRETKDTDIVDEAIYYFKANVFFKNYEIKNEADRTLIYITLYISECLK KLQKCNSKSQGEKEMYTLGITNFPIPGEPGFPLNAIYAKPANKQEDEVMRAYLQQLRQETGLRLCEKVFDPQNDKPSKWW TCFVKRQFMNKSLSGPGQ ; ;MPAYHSSLMDPDTKLIGNMALLPIRSQFKGPAPRETKDTDIVDEAIYYFKANVFFKNYEIKNEADRTLIYITLYISECLK KLQKCNSKSQGEKEMYTLGITNFPIPGEPGFPLNAIYAKPANKQEDEVMRAYLQQLRQETGLRLCEKVFDPQNDKPSKWW TCFVKRQFMNKSLSGPGQ ; E,O ? 4 'polypeptide(L)' no no ;MTATLRPYLSAVRATLQAALCLENFSSQVVERHNKPEVEVRSSKELLLQPVTISRNEKEKVLIEGSINSVRVSIAVKQAD EIEKILCHKFMRFMMMRAENFFILRRKPVEGYDISFLITNFHTEQMYKHKLVDFVIHFMEEIDKEISEMKLSVNARARIV AEEFLKNF ; ;MTATLRPYLSAVRATLQAALCLENFSSQVVERHNKPEVEVRSSKELLLQPVTISRNEKEKVLIEGSINSVRVSIAVKQAD EIEKILCHKFMRFMMMRAENFFILRRKPVEGYDISFLITNFHTEQMYKHKLVDFVIHFMEEIDKEISEMKLSVNARARIV AEEFLKNF ; F,P ? 5 'polypeptide(L)' no no ;MARNTLSSRFRRVDIDEFDENKFVDEQEEAAAAAAEPGPDPSEVDGLLRQGDMLRAFHAALRNSPVNTKNQAVKERAQGV VLKVLTNFKSSEIEQAVQSLDRNGVDLLMKYIYKGFEKPTENSSAVLLQWHEKALAVGGLGSIIRVLTARKTV ; ;MARNTLSSRFRRVDIDEFDENKFVDEQEEAAAAAAEPGPDPSEVDGLLRQGDMLRAFHAALRNSPVNTKNQAVKERAQGV VLKVLTNFKSSEIEQAVQSLDRNGVDLLMKYIYKGFEKPTENSSAVLLQWHEKALAVGGLGSIIRVLTARKTV ; G,Q ? 6 'polypeptide(L)' no no ;MDDDIAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWD DMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVT 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SVLPVELARDMQTDTQDHQKLCYSALILAMVFSMGEAVPYAHYEHLGTPFAQFLLNIVEDGLPLDTTEQLPDLCVNLLLA LNLHLPAADQNVIMAALSKHANVKIFSEKLLLLLNRGDDPVRIFKHEPQPPHSVLKFLQDVFGSPATAAIFYHTDMMALI DITVRHIADLSPGDKLRMEYLSLMHAIVRTTPYLQHRHRLPDLQAILRRILNEEETSPQCQMDRMIVREMCKEFLVLGEA PS ; H,R ? 9 'polypeptide(L)' no no ;MAYHSFLVEPISCHAWNKDRTQIAICPNNHEVHIYEKSGAKWTKVHELKEHNGQVTGIDWAPESNRIVTCGTDRNAYVWT LKGRTWKPTLVILRINRAARCVRWAPNENKFAVGSGSRVISICYFEQENDWWVCKHIKKPIRSTVLSLDWHPNNVLLAAG SCDFKCRIFSAYIKEVEERPAPTPWGSKMPFGELMFESSSSCGWVHGVCFSASGSRVAWVSHDSTVCLADADKKMAVATL ASETLPLLALTFITDNSLVAAGHDCFPVLFTYDAAAGMLSFGGRLDVPKQSSQRGLTARERFQNLDKKASSEGGTAAGAG LDSLHKNSVSQISVLSGGKAKCSQFCTTGMDGGMSIWDVKSLESALKDLKIK ; ;MAYHSFLVEPISCHAWNKDRTQIAICPNNHEVHIYEKSGAKWTKVHELKEHNGQVTGIDWAPESNRIVTCGTDRNAYVWT LKGRTWKPTLVILRINRAARCVRWAPNENKFAVGSGSRVISICYFEQENDWWVCKHIKKPIRSTVLSLDWHPNNVLLAAG SCDFKCRIFSAYIKEVEERPAPTPWGSKMPFGELMFESSSSCGWVHGVCFSASGSRVAWVSHDSTVCLADADKKMAVATL ASETLPLLALTFITDNSLVAAGHDCFPVLFTYDAAAGMLSFGGRLDVPKQSSQRGLTARERFQNLDKKASSEGGTAAGAG LDSLHKNSVSQISVLSGGKAKCSQFCTTGMDGGMSIWDVKSLESALKDLKIK ; C,M ? 10 'polypeptide(L)' no no ;MAGRLPACVVDCGTGYTKLGYAGNTEPQFIIPSCIAIKESAKVGDQAQRRVMKGVDDLDFFIGDEAIEKPTYATKWPIRH GIVEDWDLMERFMEQVIFKYLRAEPEDHYFLLTEPPLNTPENREYTAEIMFESFNVPGLYIAVQAVLALAASWTSRQVGE RTLTGTVIDSGDGVTHVIPVAEGYVIGSCIKHIPIAGRDITYFIQQLLRDREVGIPPEQSLETAKAVKERYSYVCPDLVK EFNKYDTDGSKWIKQYTGINAISKKEFSIDVGYERFLGPEIFFHPEFANPDFTQPISEVVDEVIQNCPIDVRRPLYKNIV LSGGSTMFRDFGRRLQRDLKRTVDARLKLSEELSGGRLKPKPIDVQVITHHMQRYAVWFGGSMLASTPEFYQVCHTKKDY EEIGPSICRHNPVFGVMS ; ;MAGRLPACVVDCGTGYTKLGYAGNTEPQFIIPSCIAIKESAKVGDQAQRRVMKGVDDLDFFIGDEAIEKPTYATKWPIRH GIVEDWDLMERFMEQVIFKYLRAEPEDHYFLLTEPPLNTPENREYTAEIMFESFNVPGLYIAVQAVLALAASWTSRQVGE RTLTGTVIDSGDGVTHVIPVAEGYVIGSCIKHIPIAGRDITYFIQQLLRDREVGIPPEQSLETAKAVKERYSYVCPDLVK EFNKYDTDGSKWIKQYTGINAISKKEFSIDVGYERFLGPEIFFHPEFANPDFTQPISEVVDEVIQNCPIDVRRPLYKNIV LSGGSTMFRDFGRRLQRDLKRTVDARLKLSEELSGGRLKPKPIDVQVITHHMQRYAVWFGGSMLASTPEFYQVCHTKKDY EEIGPSICRHNPVFGVMS ; A,K ? # loop_ _pdbx_entity_nonpoly.entity_id _pdbx_entity_nonpoly.name _pdbx_entity_nonpoly.comp_id 11 "ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE" ADP 12 'MAGNESIUM ION' MG # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET n 1 2 ASP n 1 3 SER n 1 4 GLN n 1 5 GLY n 1 6 ARG n 1 7 LYS n 1 8 VAL n 1 9 VAL n 1 10 VAL n 1 11 CYS n 1 12 ASP n 1 13 ASN n 1 14 GLY n 1 15 THR n 1 16 GLY n 1 17 PHE n 1 18 VAL n 1 19 LYS n 1 20 CYS n 1 21 GLY n 1 22 TYR n 1 23 ALA n 1 24 GLY n 1 25 SER n 1 26 ASN n 1 27 PHE n 1 28 PRO n 1 29 GLU n 1 30 HIS n 1 31 ILE n 1 32 PHE n 1 33 PRO n 1 34 ALA n 1 35 LEU n 1 36 VAL n 1 37 GLY n 1 38 ARG n 1 39 PRO n 1 40 ILE n 1 41 ILE n 1 42 ARG n 1 43 SER n 1 44 THR n 1 45 THR n 1 46 LYS n 1 47 VAL n 1 48 GLY n 1 49 ASN n 1 50 ILE n 1 51 GLU n 1 52 ILE n 1 53 LYS n 1 54 ASP n 1 55 LEU n 1 56 MET n 1 57 VAL n 1 58 GLY n 1 59 ASP n 1 60 GLU n 1 61 ALA n 1 62 SER n 1 63 GLU n 1 64 LEU n 1 65 ARG n 1 66 SER n 1 67 MET n 1 68 LEU n 1 69 GLU n 1 70 VAL n 1 71 ASN n 1 72 TYR n 1 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'Amanita phalloides' 67723 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ADP non-polymer n "ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE" ? 'C10 H15 N5 O10 P2' 427.201 ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 DTH 'D-peptide linking' . D-THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 EEP 'L-peptide linking' . '(2S,4R)-2-amino-4,5-dihydroxy-4-methylpentanoic acid' ? 'C6 H13 N O4' 163.172 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 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N TYR 80 CD1 106 1 Y 1 N TYR 80 ? CD2 ? N TYR 80 CD2 107 1 Y 1 N TYR 80 ? CE1 ? N TYR 80 CE1 108 1 Y 1 N TYR 80 ? CE2 ? N TYR 80 CE2 109 1 Y 1 N TYR 80 ? CZ ? N TYR 80 CZ 110 1 Y 1 N TYR 80 ? OH ? N TYR 80 OH 111 1 Y 1 O GLU 35 ? CG ? O GLU 35 CG 112 1 Y 1 O GLU 35 ? CD ? O GLU 35 CD 113 1 Y 1 O GLU 35 ? OE1 ? O GLU 35 OE1 114 1 Y 1 O GLU 35 ? OE2 ? O GLU 35 OE2 115 1 Y 1 P ARG 6 ? CG ? P ARG 6 CG 116 1 Y 1 P ARG 6 ? CD ? P ARG 6 CD 117 1 Y 1 P ARG 6 ? NE ? P ARG 6 NE 118 1 Y 1 P ARG 6 ? CZ ? P ARG 6 CZ 119 1 Y 1 P ARG 6 ? NH1 ? P ARG 6 NH1 120 1 Y 1 P ARG 6 ? NH2 ? P ARG 6 NH2 121 1 Y 1 Q ARG 62 ? CG ? Q ARG 62 CG 122 1 Y 1 Q ARG 62 ? CD ? Q ARG 62 CD 123 1 Y 1 Q ARG 62 ? NE ? Q ARG 62 NE 124 1 Y 1 Q ARG 62 ? CZ ? Q ARG 62 CZ 125 1 Y 1 Q ARG 62 ? NH1 ? Q ARG 62 NH1 126 1 Y 1 Q ARG 62 ? NH2 ? Q ARG 62 NH2 127 1 Y 1 S GLN 41 ? CG ? R GLN 41 CG 128 1 Y 1 S GLN 41 ? CD ? R GLN 41 CD 129 1 Y 1 S GLN 41 ? OE1 ? R GLN 41 OE1 130 1 Y 1 S GLN 41 ? NE2 ? R GLN 41 NE2 131 1 Y 1 S GLU 270 ? CG ? 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O N N 3 ? P N N 4 ? Q N N 5 ? R N N 6 ? S N N 6 ? T N N 7 ? U N N 7 ? V N N 8 ? W N N 9 ? X N N 10 ? Y N N 11 ? Z N N 12 ? AA N N 11 ? BA N N 12 ? CA N N 11 ? DA N N 12 ? EA N N 11 ? FA N N 12 ? GA N N 11 ? HA N N 12 ? IA N N 11 ? JA N N 12 ? KA N N 11 ? LA N N 12 ? MA N N 11 ? 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H TRP 1 C ? ? ? 1_555 H EEP 2 N ? ? c TRP 1 c EEP 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.330 ? ? covale2 covale both ? H TRP 1 N ? ? ? 1_555 H ALA 7 C ? ? c TRP 1 c ALA 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.334 ? ? covale3 covale both ? H EEP 2 C ? ? ? 1_555 H ALA 3 N ? ? c EEP 2 c ALA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? ? covale4 covale both ? H ALA 3 C ? ? ? 1_555 H DTH 4 N ? ? c ALA 3 c DTH 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.325 ? ? covale5 covale both ? H DTH 4 C ? ? ? 1_555 H CYS 5 N ? ? c DTH 4 c CYS 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.340 ? ? covale6 covale both ? H CYS 5 C ? ? ? 1_555 H HYP 6 N ? ? c CYS 5 c HYP 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.341 ? ? covale7 covale both ? H HYP 6 C ? ? ? 1_555 H ALA 7 N ? ? c HYP 6 c ALA 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.384 ? ? covale8 covale both ? I TRP 1 C ? ? ? 1_555 I EEP 2 N ? ? d TRP 1 d EEP 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? ? covale9 covale both ? I TRP 1 N ? ? ? 1_555 I ALA 7 C ? ? d TRP 1 d ALA 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.336 ? ? covale10 covale both ? I EEP 2 C ? ? ? 1_555 I ALA 3 N ? ? d EEP 2 d ALA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? ? covale11 covale both ? I ALA 3 C ? ? ? 1_555 I DTH 4 N ? ? d ALA 3 d DTH 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? ? covale12 covale both ? I DTH 4 C ? ? ? 1_555 I CYS 5 N ? ? d DTH 4 d CYS 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.339 ? ? covale13 covale both ? I CYS 5 C ? ? ? 1_555 I HYP 6 N ? ? d CYS 5 d HYP 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.342 ? ? covale14 covale both ? I HYP 6 C ? ? ? 1_555 I ALA 7 N ? ? d HYP 6 d ALA 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.385 ? ? covale15 covale both ? T TRP 1 C ? ? ? 1_555 T EEP 2 N ? ? U TRP 1 U EEP 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.330 ? ? covale16 covale both ? T TRP 1 N ? ? ? 1_555 T ALA 7 C ? ? U TRP 1 U ALA 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.334 ? ? covale17 covale both ? T EEP 2 C ? ? ? 1_555 T ALA 3 N ? ? U EEP 2 U ALA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? ? covale18 covale both ? T ALA 3 C ? ? ? 1_555 T DTH 4 N ? ? U ALA 3 U DTH 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.325 ? ? covale19 covale both ? T DTH 4 C ? ? ? 1_555 T CYS 5 N ? ? U DTH 4 U CYS 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.340 ? ? covale20 covale both ? T CYS 5 C ? ? ? 1_555 T HYP 6 N ? ? U CYS 5 U HYP 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.341 ? ? covale21 covale both ? T HYP 6 C ? ? ? 1_555 T ALA 7 N ? ? U HYP 6 U ALA 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.384 ? ? covale22 covale both ? U TRP 1 C ? ? ? 1_555 U EEP 2 N ? ? V TRP 1 V EEP 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? ? covale23 covale both ? U TRP 1 N ? ? ? 1_555 U ALA 7 C ? ? V TRP 1 V ALA 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.336 ? ? covale24 covale both ? U EEP 2 C ? ? ? 1_555 U ALA 3 N ? ? V EEP 2 V ALA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? ? covale25 covale both ? U ALA 3 C ? ? ? 1_555 U DTH 4 N ? ? V ALA 3 V DTH 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? ? covale26 covale both ? U DTH 4 C ? ? ? 1_555 U CYS 5 N ? ? V DTH 4 V CYS 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.339 ? ? covale27 covale both ? U CYS 5 C ? ? ? 1_555 U HYP 6 N ? ? V CYS 5 V HYP 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.342 ? ? covale28 covale both ? U HYP 6 C ? ? ? 1_555 U ALA 7 N ? ? V HYP 6 V ALA 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.385 ? ? metalc1 metalc ? ? Y ADP . O3B ? ? ? 1_555 Z MG . MG ? ? B ADP 501 B MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.041 ? ? metalc2 metalc ? ? Y ADP . O2A ? ? ? 1_555 Z MG . MG ? ? B ADP 501 B MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.752 ? ? metalc3 metalc ? ? AA ADP . O2B ? ? ? 1_555 BA MG . MG ? ? I ADP 401 I MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.236 ? ? metalc4 metalc ? ? CA ADP . O2B ? ? ? 1_555 DA MG . MG ? ? J ADP 401 J MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.235 ? ? metalc5 metalc ? ? EA ADP . O2B ? ? ? 1_555 FA MG . MG ? ? A ADP 501 A MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.306 ? ? metalc6 metalc ? ? GA ADP . O3B ? ? ? 1_555 HA MG . MG ? ? L ADP 501 L MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? ? metalc7 metalc ? ? GA ADP . O2A ? ? ? 1_555 HA MG . MG ? ? L ADP 501 L MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.752 ? ? metalc8 metalc ? ? IA ADP . O2B ? ? ? 1_555 JA MG . MG ? ? S ADP 401 S MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.236 ? ? metalc9 metalc ? ? KA ADP . O2B ? ? ? 1_555 LA MG . MG ? ? T ADP 401 T MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.235 ? ? metalc10 metalc ? ? MA ADP . O2B ? ? ? 1_555 NA MG . MG ? ? K ADP 501 K MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.306 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference covale ? ? metalc ? ? # loop_ _pdbx_struct_conn_angle.id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.value _pdbx_struct_conn_angle.value_esd 1 O3B ? Y ADP . ? B ADP 501 ? 1_555 MG ? Z MG . ? B MG 502 ? 1_555 O2A ? Y ADP . ? B ADP 501 ? 1_555 65.1 ? 2 O3B ? GA ADP . ? L ADP 501 ? 1_555 MG ? HA MG . ? L MG 502 ? 1_555 O2A ? GA ADP . ? L ADP 501 ? 1_555 65.1 ? # loop_ _pdbx_modification_feature.ordinal _pdbx_modification_feature.label_comp_id _pdbx_modification_feature.label_asym_id _pdbx_modification_feature.label_seq_id _pdbx_modification_feature.label_alt_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_alt_id _pdbx_modification_feature.auth_comp_id _pdbx_modification_feature.auth_asym_id _pdbx_modification_feature.auth_seq_id _pdbx_modification_feature.PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.symmetry _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.modified_residue_symmetry _pdbx_modification_feature.comp_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id _pdbx_modification_feature.ref_pcm_id _pdbx_modification_feature.ref_comp_id _pdbx_modification_feature.type _pdbx_modification_feature.category 1 EEP H 2 ? . . . . EEP c 2 ? 1_555 . . . . . . . LEU 1 EEP Hydroxylation 'Named protein modification' 2 HYP H 6 ? . . . . HYP c 6 ? 1_555 . . . . . . . PRO 1 HYP Hydroxylation 'Named protein modification' 3 EEP I 2 ? . . . . EEP d 2 ? 1_555 . . . . . . . LEU 1 EEP Hydroxylation 'Named protein modification' 4 HYP I 6 ? . . . . HYP d 6 ? 1_555 . . . . . . . PRO 1 HYP Hydroxylation 'Named protein modification' 5 EEP T 2 ? . . . . EEP U 2 ? 1_555 . . . . . . . LEU 1 EEP Hydroxylation 'Named protein modification' 6 HYP T 6 ? . . . . HYP U 6 ? 1_555 . . . . . . . PRO 1 HYP Hydroxylation 'Named protein modification' 7 EEP U 2 ? . . . . EEP V 2 ? 1_555 . . . . . . . LEU 1 EEP Hydroxylation 'Named protein modification' 8 HYP U 6 ? . . . . HYP V 6 ? 1_555 . . . . . . . PRO 1 HYP Hydroxylation 'Named protein modification' 9 TRP H 1 ? ALA H 7 ? TRP c 1 ? 1_555 ALA c 7 ? 1_555 N C . . . None 'Non-standard linkage' 10 TRP I 1 ? ALA I 7 ? TRP d 1 ? 1_555 ALA d 7 ? 1_555 N C . . . None 'Non-standard linkage' 11 TRP T 1 ? ALA T 7 ? TRP U 1 ? 1_555 ALA U 7 ? 1_555 N C . . . None 'Non-standard linkage' 12 TRP U 1 ? ALA U 7 ? TRP V 1 ? 1_555 ALA V 7 ? 1_555 N C . . . None 'Non-standard linkage' # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 GLU 607 J . ? GLU 607 H PRO 608 J ? PRO 608 H 1 -1.77 2 GLU 607 V . ? GLU 607 R PRO 608 V ? PRO 608 R 1 -1.77 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 6 ? AA2 ? 3 ? AA3 ? 3 ? AA4 ? 2 ? AA5 ? 5 ? AA6 ? 2 ? AA7 ? 2 ? AA8 ? 4 ? AA9 ? 4 ? AB1 ? 5 ? AB2 ? 2 ? AB3 ? 2 ? AB4 ? 4 ? AB5 ? 6 ? AB6 ? 3 ? AB7 ? 2 ? AB8 ? 3 ? AB9 ? 5 ? AC1 ? 2 ? AC2 ? 6 ? AC3 ? 3 ? AC4 ? 2 ? AC5 ? 3 ? AC6 ? 5 ? AC7 ? 2 ? AC8 ? 4 ? AC9 ? 3 ? AD1 ? 4 ? AD2 ? 4 ? AD3 ? 3 ? AD4 ? 4 ? AD5 ? 4 ? AD6 ? 6 ? AD7 ? 3 ? AD8 ? 2 ? AD9 ? 3 ? AE1 ? 5 ? AE2 ? 2 ? AE3 ? 6 ? AE4 ? 3 ? AE5 ? 3 ? AE6 ? 2 ? AE7 ? 5 ? AE8 ? 2 ? AE9 ? 2 ? AF1 ? 4 ? AF2 ? 4 ? AF3 ? 5 ? AF4 ? 2 ? AF5 ? 2 ? AF6 ? 4 ? AF7 ? 6 ? AF8 ? 3 ? AF9 ? 2 ? AG1 ? 3 ? AG2 ? 5 ? AG3 ? 2 ? AG4 ? 6 ? AG5 ? 3 ? AG6 ? 2 ? AG7 ? 3 ? AG8 ? 5 ? AG9 ? 2 ? AH1 ? 4 ? AH2 ? 3 ? AH3 ? 4 ? AH4 ? 4 ? AH5 ? 3 ? AH6 ? 4 ? AH7 ? 4 ? AH8 ? 6 ? AH9 ? 3 ? AI1 ? 2 ? AI2 ? 3 ? AI3 ? 5 ? AI4 ? 2 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA1 3 4 ? parallel AA1 4 5 ? parallel AA1 5 6 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA5 3 4 ? parallel AA5 4 5 ? parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA8 3 4 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AA9 2 3 ? anti-parallel AA9 3 4 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB1 2 3 ? anti-parallel AB1 3 4 ? anti-parallel AB1 4 5 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB4 2 3 ? anti-parallel AB4 3 4 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB5 2 3 ? anti-parallel AB5 3 4 ? parallel AB5 4 5 ? parallel AB5 5 6 ? anti-parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB6 2 3 ? anti-parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB8 2 3 ? anti-parallel AB9 1 2 ? anti-parallel AB9 2 3 ? anti-parallel AB9 3 4 ? parallel AB9 4 5 ? parallel AC1 1 2 ? anti-parallel AC2 1 2 ? anti-parallel AC2 2 3 ? anti-parallel AC2 3 4 ? parallel AC2 4 5 ? parallel AC2 5 6 ? anti-parallel AC3 1 2 ? anti-parallel AC3 2 3 ? anti-parallel AC4 1 2 ? anti-parallel AC5 1 2 ? anti-parallel AC5 2 3 ? anti-parallel AC6 1 2 ? anti-parallel AC6 2 3 ? anti-parallel AC6 3 4 ? parallel AC6 4 5 ? parallel AC7 1 2 ? anti-parallel AC8 1 2 ? anti-parallel AC8 2 3 ? anti-parallel AC8 3 4 ? anti-parallel AC9 1 2 ? anti-parallel AC9 2 3 ? anti-parallel AD1 1 2 ? anti-parallel AD1 2 3 ? anti-parallel AD1 3 4 ? anti-parallel AD2 1 2 ? anti-parallel AD2 2 3 ? anti-parallel AD2 3 4 ? anti-parallel AD3 1 2 ? anti-parallel AD3 2 3 ? anti-parallel AD4 1 2 ? anti-parallel AD4 2 3 ? anti-parallel AD4 3 4 ? anti-parallel AD5 1 2 ? anti-parallel AD5 2 3 ? anti-parallel AD5 3 4 ? anti-parallel AD6 1 2 ? anti-parallel AD6 2 3 ? anti-parallel AD6 3 4 ? parallel AD6 4 5 ? parallel AD6 5 6 ? anti-parallel AD7 1 2 ? anti-parallel AD7 2 3 ? anti-parallel AD8 1 2 ? anti-parallel AD9 1 2 ? anti-parallel AD9 2 3 ? anti-parallel AE1 1 2 ? anti-parallel AE1 2 3 ? anti-parallel AE1 3 4 ? parallel AE1 4 5 ? parallel AE2 1 2 ? anti-parallel AE3 1 2 ? anti-parallel AE3 2 3 ? anti-parallel AE3 3 4 ? parallel AE3 4 5 ? parallel AE3 5 6 ? anti-parallel AE4 1 2 ? anti-parallel AE4 2 3 ? anti-parallel AE5 1 2 ? anti-parallel AE5 2 3 ? anti-parallel AE6 1 2 ? anti-parallel AE7 1 2 ? anti-parallel AE7 2 3 ? anti-parallel AE7 3 4 ? parallel AE7 4 5 ? parallel AE8 1 2 ? anti-parallel AE9 1 2 ? anti-parallel AF1 1 2 ? anti-parallel AF1 2 3 ? anti-parallel AF1 3 4 ? anti-parallel AF2 1 2 ? anti-parallel AF2 2 3 ? anti-parallel AF2 3 4 ? anti-parallel AF3 1 2 ? anti-parallel AF3 2 3 ? anti-parallel AF3 3 4 ? anti-parallel AF3 4 5 ? anti-parallel AF4 1 2 ? anti-parallel AF5 1 2 ? anti-parallel AF6 1 2 ? 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CB HB3 sing N N 93 ASN CG OD1 doub N N 94 ASN CG ND2 sing N N 95 ASN ND2 HD21 sing N N 96 ASN ND2 HD22 sing N N 97 ASN OXT HXT sing N N 98 ASP N CA sing N N 99 ASP N H sing N N 100 ASP N H2 sing N N 101 ASP CA C sing N N 102 ASP CA CB sing N N 103 ASP CA HA sing N N 104 ASP C O doub N N 105 ASP C OXT sing N N 106 ASP CB CG sing N N 107 ASP CB HB2 sing N N 108 ASP CB HB3 sing N N 109 ASP CG OD1 doub N N 110 ASP CG OD2 sing N N 111 ASP OD2 HD2 sing N N 112 ASP OXT HXT sing N N 113 CYS N CA sing N N 114 CYS N H sing N N 115 CYS N H2 sing N N 116 CYS CA C sing N N 117 CYS CA CB sing N N 118 CYS CA HA sing N N 119 CYS C O doub N N 120 CYS C OXT sing N N 121 CYS CB SG sing N N 122 CYS CB HB2 sing N N 123 CYS CB HB3 sing N N 124 CYS SG HG sing N N 125 CYS OXT HXT sing N N 126 DTH N CA sing N N 127 DTH N H sing N N 128 DTH N H2 sing N N 129 DTH CA CB sing N N 130 DTH CA C sing N N 131 DTH CA HA sing N N 132 DTH CB CG2 sing N N 133 DTH CB OG1 sing N N 134 DTH CB HB sing N N 135 DTH CG2 HG21 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