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_citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Toyonaga, T.' 1 0000-0002-2632-4375 primary 'Kato, T.' 2 0000-0002-8879-6685 primary 'Kawamoto, A.' 3 0000-0002-7380-0127 primary 'Miyata, T.' 4 0000-0002-5543-7459 primary 'Kawakami, K.' 5 0000-0002-1689-1819 primary 'Fujita, J.' 6 0000-0003-1273-3917 primary 'Hamaguchi, T.' 7 0000-0003-0876-7700 primary 'Namba, K.' 8 0000-0003-2911-5875 primary 'Miyata, M.' 9 0000-0002-7478-7390 # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer nat 'G1-ATPase subunit beta' 88510.383 6 3.6.3.14 ? ? ? 2 polymer nat 'G1-ATPase subunit alpha' 58794.668 6 3.6.3.14 ? ? ? 3 polymer nat 'G1-ATPase subunit gamma' 39810.602 2 ? ? ? ? 4 polymer nat 'Phosphoglycerate kinase' 56680.750 3 2.7.2.3 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;MKNLKITAIKDNLIFVEGEHQFSFLEIIKFSDKVEGVVLKANDRSAIVAILNEDKDLNLTVGSLAEATGELYKIPIYDNY LGSIINVLGESLVKQYERTNVALDKKYVFTEAQPIFTRSAVNEPLVTGITVVDGVLPVGRGQKELIIGDRGTGKTAIALN AMLAQENTDVINIFIAIGKKRDEIVEIYGTFKKHNILHKSIIVSAASDDAVAARYLAPYAGMAIAEFFQQIGKDVLVVMD DLTNHADAYRELSLLAGIAPAREAYPGDIFYVHSSLLERGGKYGPEFGGGSITILPIAQTLAGDISGYIPTNLISITDGQ IYTSAKLFNEGTRPAIDVNLSVSRLGSAAQSKFMAFASSGLKKIYTEYKYLKRLSSFSSKISNRDLETLQKGKAFESLID QAEYEVIDYETSAILFLLLKKGFLNFYTEKTEALKVIIGVIKVFLAKDVLGRKMRAILVEHGIDSIVWNLYLNHMILPLL KYHLLSELQYLATNREFIKKFKDIRNDGRILLAYERKGYERGIAYDYK ; D,E,F,K,L,M ? 3 'polypeptide(L)' no no ;MKRKDVEEKKQNLDFYHNYIDISKIKVLQKLNEEIASLNMLKLQKGESHYLLNRIINKWFPHNSNIYHELHHENDRKELY ILIDPKKLDLFSEALLRKLSQTVKERIRPDKDFVITVGTNVDNIARQLNLNIIDHYDLDLFNQIDDFANRIGELVDVGLN NKIFNYVSLLIAQSSTKNNGGLVQERIVPFNTKNIKVWNESNQDENGMPIVSEENEVEIMSYAKTLRNINFKKHTWLPNI NTFYEQFVKSVFKQELFEFKSISVIEELKIELQLLDEKKKRLEEQKKELILKWNRARKEEATLQSTLLFSAFKVKNQKST RDEILRLSKGKNRNGA ; ;MKRKDVEEKKQNLDFYHNYIDISKIKVLQKLNEEIASLNMLKLQKGESHYLLNRIINKWFPHNSNIYHELHHENDRKELY ILIDPKKLDLFSEALLRKLSQTVKERIRPDKDFVITVGTNVDNIARQLNLNIIDHYDLDLFNQIDDFANRIGELVDVGLN NKIFNYVSLLIAQSSTKNNGGLVQERIVPFNTKNIKVWNESNQDENGMPIVSEENEVEIMSYAKTLRNINFKKHTWLPNI NTFYEQFVKSVFKQELFEFKSISVIEELKIELQLLDEKKKRLEEQKKELILKWNRARKEEATLQSTLLFSAFKVKNQKST RDEILRLSKGKNRNGA ; G,N ? 4 'polypeptide(L)' no no ;MKKTLDQISLKNKKVIIRVDFNVPIVNGIVTSNKRIEAVIPTIKKVVNEGGKAILMSHLGRVKSEEDLKKKSLAPVVEIL VNLLGMPITFVPATNGTELEETINSMKSGEIVMMENTRFEDLNNDAESSNNPDLGMYWASLGDVFINDAFGTVHRKHASN VGISTYIAESGIGYLVEKEIKNLDKALSRPERPIVAILGGAKVSDKIGVLNNLLKYVDKIIIGGAMAYTFLAAQGIGIGK SLVEEDKIDLAREYLKNNLDKFVLPIDYALAKDFEDVKPFYNLENTLEIPNGYMGLDIGPKSIEVFKKYIKDAKTILWNG PLGVTEFKYFKEGTKAIAKAITELKGNVYTVVGGGDSVAIIEELGLDRRFSHVSTGGGATLEFLEGKELPGIQAIQNEGE LGRTKEEIFSILTQNSEEVLHEHTAAFSTSEVEPANEEFPSEYNDSNSQTYFSNEVENDEDFLLNTNDFPTREASFPNEV KTEEIILNENDDEFDIEDEELDSLPNDDIKF ; ;MKKTLDQISLKNKKVIIRVDFNVPIVNGIVTSNKRIEAVIPTIKKVVNEGGKAILMSHLGRVKSEEDLKKKSLAPVVEIL VNLLGMPITFVPATNGTELEETINSMKSGEIVMMENTRFEDLNNDAESSNNPDLGMYWASLGDVFINDAFGTVHRKHASN VGISTYIAESGIGYLVEKEIKNLDKALSRPERPIVAILGGAKVSDKIGVLNNLLKYVDKIIIGGAMAYTFLAAQGIGIGK SLVEEDKIDLAREYLKNNLDKFVLPIDYALAKDFEDVKPFYNLENTLEIPNGYMGLDIGPKSIEVFKKYIKDAKTILWNG PLGVTEFKYFKEGTKAIAKAITELKGNVYTVVGGGDSVAIIEELGLDRRFSHVSTGGGATLEFLEGKELPGIQAIQNEGE LGRTKEEIFSILTQNSEEVLHEHTAAFSTSEVEPANEEFPSEYNDSNSQTYFSNEVENDEDFLLNTNDFPTREASFPNEV KTEEIILNENDDEFDIEDEELDSLPNDDIKF ; O,P,Q ? 5 'polypeptide(L)' no no ;MKKTDKNQTGKEIMKKELLIKTNEQDINLAPKSQSTSKKLSNTWNYEELINQTKEIDVNSKIVKTELEYVEEDSRLRKEK IELIQKNYDNLNAKPLVGVDLYESYSLVLNKSAWNYNEIIQRDTQLTILDMALQVHLFLYEGKIIDIAHIQKIIKTFVLN VFAKIIKGVPIVLNPIIIFDSVRFDKSKILPVAVANPKLMPPLGVQDWDTIVDEDEEIKKIVSTFIKLLENALTVGHEVE FFQDTLLVRNVDGITSLYVSEKAAQVFNNSVIDQIMPEKPKYEALEDPFSNKK ; ;MKKTDKNQTGKEIMKKELLIKTNEQDINLAPKSQSTSKKLSNTWNYEELINQTKEIDVNSKIVKTELEYVEEDSRLRKEK IELIQKNYDNLNAKPLVGVDLYESYSLVLNKSAWNYNEIIQRDTQLTILDMALQVHLFLYEGKIIDIAHIQKIIKTFVLN VFAKIIKGVPIVLNPIIIFDSVRFDKSKILPVAVANPKLMPPLGVQDWDTIVDEDEEIKKIVSTFIKLLENALTVGHEVE FFQDTLLVRNVDGITSLYVSEKAAQVFNNSVIDQIMPEKPKYEALEDPFSNKK ; R,S,T,U,V,W ? 6 'polypeptide(L)' no no ;MTKNIFANKIANQKAYFKRDIKTVHTFLGRVNYIQRASKFNDEKRVFRPLQIELSGTNEIVDIYLEATTYISKKALDEIR QNSYIFLEAKWLPESNFLNNPLFEIQNIVIEN ; ;MTKNIFANKIANQKAYFKRDIKTVHTFLGRVNYIQRASKFNDEKRVFRPLQIELSGTNEIVDIYLEATTYISKKALDEIR QNSYIFLEAKWLPESNFLNNPLFEIQNIVIEN ; X ? 7 'polypeptide(L)' no no '(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)' XXXXXXXXXXXXX Y ? 8 'polypeptide(L)' no no '(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)' XXXXXXXXX Z ? # loop_ _pdbx_entity_nonpoly.entity_id _pdbx_entity_nonpoly.name _pdbx_entity_nonpoly.comp_id 9 "ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE" ATP 10 'MAGNESIUM ION' MG 11 "ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE" ADP 12 'PHOSPHATE ION' PO4 # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET n 1 2 THR n 1 3 THR n 1 4 ASN n 1 5 ASN n 1 6 LEU n 1 7 THR n 1 8 GLU 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M ATP 600 M MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.363 ? ? # _struct_conn_type.id metalc _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _pdbx_struct_conn_angle.id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.value _pdbx_struct_conn_angle.value_esd 1 OG1 ? 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M ATP 600 ? 1_555 76.7 ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 ASP 546 A . ? ASP 546 A ASN 547 A ? ASN 547 A 1 5.05 2 TYR 635 A . ? TYR 635 A PRO 636 A ? PRO 636 A 1 -0.40 3 ASP 546 B . ? ASP 546 B ASN 547 B ? ASN 547 B 1 6.85 4 TYR 635 B . ? TYR 635 B PRO 636 B ? PRO 636 B 1 7.41 5 ASP 546 C . ? ASP 546 C ASN 547 C ? ASN 547 C 1 7.59 6 TYR 635 C . ? 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parallel AD4 4 5 ? parallel AD4 5 6 ? parallel AD4 6 7 ? parallel AD4 7 8 ? anti-parallel AD5 1 2 ? anti-parallel AD6 1 2 ? anti-parallel AD6 2 3 ? anti-parallel AD6 3 4 ? anti-parallel AD6 4 5 ? anti-parallel AD6 5 6 ? anti-parallel AD6 6 7 ? anti-parallel AD6 7 8 ? parallel AD7 1 2 ? anti-parallel AD7 2 3 ? anti-parallel AD7 3 4 ? anti-parallel AD7 4 5 ? anti-parallel AD7 5 6 ? anti-parallel AD7 6 7 ? anti-parallel AD7 7 8 ? anti-parallel AD7 8 9 ? anti-parallel AD7 9 10 ? anti-parallel AD7 10 11 ? anti-parallel AD7 11 12 ? anti-parallel AD7 12 13 ? anti-parallel AD7 13 14 ? anti-parallel AD8 1 2 ? anti-parallel AD9 1 2 ? parallel AD9 2 3 ? parallel AD9 3 4 ? parallel AD9 4 5 ? parallel AD9 5 6 ? parallel AD9 6 7 ? parallel AD9 7 8 ? anti-parallel AE1 1 2 ? anti-parallel AE2 1 2 ? anti-parallel AE2 2 3 ? anti-parallel AE2 3 4 ? anti-parallel AE2 4 5 ? anti-parallel AE2 5 6 ? anti-parallel AE2 6 7 ? anti-parallel AE3 1 2 ? anti-parallel AE4 1 2 ? anti-parallel AE4 2 3 ? parallel AE4 3 4 ? 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