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S MC3 1 C22 111 1 N 1 C MC3 401 ? C23 ? S MC3 1 C23 112 1 N 1 C MC3 401 ? C24 ? S MC3 1 C24 113 1 N 1 C C14 402 ? C08 ? T C14 1 C08 114 1 N 1 C C14 402 ? C09 ? T C14 1 C09 115 1 N 1 C C14 402 ? C10 ? T C14 1 C10 116 1 N 1 C C14 402 ? C11 ? T C14 1 C11 117 1 N 1 C C14 402 ? C12 ? T C14 1 C12 118 1 N 1 C C14 402 ? C13 ? T C14 1 C13 119 1 N 1 C C14 402 ? C14 ? T C14 1 C14 120 1 N 1 C MC3 403 ? C16 ? U MC3 1 C16 121 1 N 1 C MC3 403 ? C17 ? U MC3 1 C17 122 1 N 1 C MC3 403 ? C18 ? U MC3 1 C18 123 1 N 1 C MC3 403 ? C19 ? U MC3 1 C19 124 1 N 1 C MC3 403 ? C20 ? U MC3 1 C20 125 1 N 1 C MC3 403 ? C21 ? U MC3 1 C21 126 1 N 1 C MC3 403 ? C22 ? U MC3 1 C22 127 1 N 1 C MC3 403 ? C23 ? U MC3 1 C23 128 1 N 1 C MC3 403 ? C24 ? U MC3 1 C24 129 1 N 1 C MC3 403 ? C38 ? U MC3 1 C38 130 1 N 1 C MC3 403 ? C39 ? U MC3 1 C39 131 1 N 1 C MC3 403 ? C40 ? U MC3 1 C40 132 1 N 1 C MC3 403 ? C41 ? U MC3 1 C41 133 1 N 1 C MC3 403 ? C42 ? U MC3 1 C42 134 1 N 1 C MC3 403 ? C43 ? U MC3 1 C43 135 1 N 1 C MC3 403 ? C44 ? 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X MC3 1 C42 161 1 N 1 D MC3 403 ? C43 ? X MC3 1 C43 162 1 N 1 D MC3 403 ? C44 ? 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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 1.261 ? 12534 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 23.632 ? 1626 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.165 ? 1422 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.004 ? 1470 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 9IPM _struct.title ;Hemichannel sub-structure of Cx36/GJD2 gap junction intercellular channel (FN conformation) in soybean polar lipid nanodiscs, treated with a 20-fold molar excess of carbenoxolone ; _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 9IPM _struct_keywords.text 'Gap junction, Connexin36, Inhibitor, Carbenoxolone, MEMBRANE PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'MEMBRANE PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 1 ? D N N 1 ? E N N 1 ? F N N 1 ? G N N 2 ? H N N 3 ? I N N 2 ? J N N 2 ? K N N 3 ? L N N 2 ? M N N 2 ? N N N 3 ? O N N 2 ? P N N 2 ? Q N N 3 ? R N N 2 ? S N N 2 ? T N N 3 ? U N N 2 ? V N N 2 ? W N N 3 ? X N N 2 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP CXD2_HUMAN Q9UKL4 ? 1 ;MGEWTILERLLEAAVQQHSTMIGRILLTVVVIFRILIVAIVGETVYDDEQTMFVCNTLQPGCNQACYDRAFPISHIRYWV FQIIMVCTPSLCFITYSVHQSAKQRERR ; 1 2 UNP C562_ECOLX P0ABE7 ? 1 ;ADLEDNMETLNDNLKVIEKADNAAQVKDALTKMRAAALDAQKATPPKLEDKSPDSPEMKDFRHGFDILVGQIDDALKLAN EGKVKEAQAAAEQLKTTRNAYHQKYR ; 23 3 UNP CXD2_HUMAN Q9UKL4 ? 1 ;KLRRQEGISRFYIIQVVFRNALEIGFLVGQYFLYGFSVPGLYECNRYPCIKEVECYVSRPTEKTVFLVFMFAVSGICVVL NLAELNHLGWRKIKLAVRGAQAKRKSIYEIRNKDLPRVSVPNFGRTQSSDSAYV ; 188 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 9IPM E 1 ? 108 G Q9UKL4 1 ? 108 ? 1 101 2 2 9IPM E 109 H 214 I P0ABE7 23 ? 128 ? 101 105 3 3 9IPM E 215 J 348 ? 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Q9UKL4 188 ? 321 ? 105 321 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 2 9IPM TRP E 115 N UNP P0ABE7 MET 29 'engineered mutation' 101 1 2 9IPM ILE E 210 E UNP P0ABE7 HIS 124 'engineered mutation' 105 2 2 9IPM LEU E 214 I UNP P0ABE7 ARG 128 'engineered mutation' 105 3 3 9IPM SER E 349 ? UNP Q9UKL4 ? ? 'expression tag' 322 4 3 9IPM ARG E 350 ? UNP Q9UKL4 ? ? 'expression tag' 323 5 3 9IPM GLY E 351 ? UNP Q9UKL4 ? ? 'expression tag' 324 6 3 9IPM ASP E 352 ? UNP Q9UKL4 ? ? 'expression tag' 325 7 3 9IPM MET E 353 ? UNP Q9UKL4 ? ? 'expression tag' 326 8 3 9IPM LEU E 354 ? UNP Q9UKL4 ? ? 'expression tag' 327 9 3 9IPM GLU E 355 ? UNP Q9UKL4 ? ? 'expression tag' 328 10 3 9IPM VAL E 356 ? UNP Q9UKL4 ? ? 'expression tag' 329 11 3 9IPM LEU E 357 ? UNP Q9UKL4 ? ? 'expression tag' 330 12 3 9IPM PHE E 358 ? UNP Q9UKL4 ? ? 'expression tag' 331 13 3 9IPM GLN E 359 ? UNP Q9UKL4 ? ? 'expression tag' 332 14 5 9IPM TRP A 115 N UNP P0ABE7 MET 29 'engineered mutation' 101 15 5 9IPM ILE A 210 E UNP P0ABE7 HIS 124 'engineered mutation' 105 16 5 9IPM LEU A 214 I UNP P0ABE7 ARG 128 'engineered mutation' 105 17 6 9IPM SER A 349 ? UNP Q9UKL4 ? ? 'expression tag' 322 18 6 9IPM ARG A 350 ? UNP Q9UKL4 ? ? 'expression tag' 323 19 6 9IPM GLY A 351 ? UNP Q9UKL4 ? ? 'expression tag' 324 20 6 9IPM ASP A 352 ? UNP Q9UKL4 ? ? 'expression tag' 325 21 6 9IPM MET A 353 ? UNP Q9UKL4 ? ? 'expression tag' 326 22 6 9IPM LEU A 354 ? UNP Q9UKL4 ? ? 'expression tag' 327 23 6 9IPM GLU A 355 ? UNP Q9UKL4 ? ? 'expression tag' 328 24 6 9IPM VAL A 356 ? UNP Q9UKL4 ? ? 'expression tag' 329 25 6 9IPM LEU A 357 ? UNP Q9UKL4 ? ? 'expression tag' 330 26 6 9IPM PHE A 358 ? UNP Q9UKL4 ? ? 'expression tag' 331 27 6 9IPM GLN A 359 ? UNP Q9UKL4 ? ? 'expression tag' 332 28 8 9IPM TRP B 115 N UNP P0ABE7 MET 29 'engineered mutation' 101 29 8 9IPM ILE B 210 E UNP P0ABE7 HIS 124 'engineered mutation' 105 30 8 9IPM LEU B 214 I UNP P0ABE7 ARG 128 'engineered mutation' 105 31 9 9IPM SER B 349 ? UNP Q9UKL4 ? ? 'expression tag' 322 32 9 9IPM ARG B 350 ? UNP Q9UKL4 ? ? 'expression tag' 323 33 9 9IPM GLY B 351 ? UNP Q9UKL4 ? ? 'expression tag' 324 34 9 9IPM ASP B 352 ? UNP Q9UKL4 ? ? 'expression tag' 325 35 9 9IPM MET B 353 ? UNP Q9UKL4 ? ? 'expression tag' 326 36 9 9IPM LEU B 354 ? UNP Q9UKL4 ? ? 'expression tag' 327 37 9 9IPM GLU B 355 ? UNP Q9UKL4 ? ? 'expression tag' 328 38 9 9IPM VAL B 356 ? UNP Q9UKL4 ? ? 'expression tag' 329 39 9 9IPM LEU B 357 ? UNP Q9UKL4 ? ? 'expression tag' 330 40 9 9IPM PHE B 358 ? UNP Q9UKL4 ? ? 'expression tag' 331 41 9 9IPM GLN B 359 ? UNP Q9UKL4 ? ? 'expression tag' 332 42 11 9IPM TRP F 115 N UNP P0ABE7 MET 29 'engineered mutation' 101 43 11 9IPM ILE F 210 E UNP P0ABE7 HIS 124 'engineered mutation' 105 44 11 9IPM LEU F 214 I UNP P0ABE7 ARG 128 'engineered mutation' 105 45 12 9IPM SER F 349 ? UNP Q9UKL4 ? ? 'expression tag' 322 46 12 9IPM ARG F 350 ? UNP Q9UKL4 ? ? 'expression tag' 323 47 12 9IPM GLY F 351 ? UNP Q9UKL4 ? ? 'expression tag' 324 48 12 9IPM ASP F 352 ? UNP Q9UKL4 ? ? 'expression tag' 325 49 12 9IPM MET F 353 ? UNP Q9UKL4 ? ? 'expression tag' 326 50 12 9IPM LEU F 354 ? UNP Q9UKL4 ? ? 'expression tag' 327 51 12 9IPM GLU F 355 ? UNP Q9UKL4 ? ? 'expression tag' 328 52 12 9IPM VAL F 356 ? UNP Q9UKL4 ? ? 'expression tag' 329 53 12 9IPM LEU F 357 ? UNP Q9UKL4 ? ? 'expression tag' 330 54 12 9IPM PHE F 358 ? UNP Q9UKL4 ? ? 'expression tag' 331 55 12 9IPM GLN F 359 ? UNP Q9UKL4 ? ? 'expression tag' 332 56 14 9IPM TRP C 115 N UNP P0ABE7 MET 29 'engineered mutation' 101 57 14 9IPM ILE C 210 E UNP P0ABE7 HIS 124 'engineered mutation' 105 58 14 9IPM LEU C 214 I UNP P0ABE7 ARG 128 'engineered mutation' 105 59 15 9IPM SER C 349 ? UNP Q9UKL4 ? ? 'expression tag' 322 60 15 9IPM ARG C 350 ? UNP Q9UKL4 ? ? 'expression tag' 323 61 15 9IPM GLY C 351 ? UNP Q9UKL4 ? ? 'expression tag' 324 62 15 9IPM ASP C 352 ? UNP Q9UKL4 ? ? 'expression tag' 325 63 15 9IPM MET C 353 ? UNP Q9UKL4 ? ? 'expression tag' 326 64 15 9IPM LEU C 354 ? UNP Q9UKL4 ? ? 'expression tag' 327 65 15 9IPM GLU C 355 ? UNP Q9UKL4 ? ? 'expression tag' 328 66 15 9IPM VAL C 356 ? UNP Q9UKL4 ? ? 'expression tag' 329 67 15 9IPM LEU C 357 ? UNP Q9UKL4 ? ? 'expression tag' 330 68 15 9IPM PHE C 358 ? UNP Q9UKL4 ? ? 'expression tag' 331 69 15 9IPM GLN C 359 ? UNP Q9UKL4 ? ? 'expression tag' 332 70 17 9IPM TRP D 115 N UNP P0ABE7 MET 29 'engineered mutation' 101 71 17 9IPM ILE D 210 E UNP P0ABE7 HIS 124 'engineered mutation' 105 72 17 9IPM LEU D 214 I UNP P0ABE7 ARG 128 'engineered mutation' 105 73 18 9IPM SER D 349 ? UNP Q9UKL4 ? ? 'expression tag' 322 74 18 9IPM ARG D 350 ? UNP Q9UKL4 ? ? 'expression tag' 323 75 18 9IPM GLY D 351 ? UNP Q9UKL4 ? ? 'expression tag' 324 76 18 9IPM ASP D 352 ? UNP Q9UKL4 ? ? 'expression tag' 325 77 18 9IPM MET D 353 ? UNP Q9UKL4 ? ? 'expression tag' 326 78 18 9IPM LEU D 354 ? UNP Q9UKL4 ? ? 'expression tag' 327 79 18 9IPM GLU D 355 ? UNP Q9UKL4 ? ? 'expression tag' 328 80 18 9IPM VAL D 356 ? UNP Q9UKL4 ? ? 'expression tag' 329 81 18 9IPM LEU D 357 ? UNP Q9UKL4 ? ? 'expression tag' 330 82 18 9IPM PHE D 358 ? UNP Q9UKL4 ? ? 'expression tag' 331 83 18 9IPM GLN D 359 ? UNP Q9UKL4 ? ? 'expression tag' 332 84 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details hexameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 6 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'not applicable' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 SER A 19 ? ASP A 48 ? SER E 19 ASP E 48 1 ? 30 HELX_P HELX_P2 AA2 ASP A 48 ? PHE A 53 ? ASP E 48 PHE E 53 1 ? 6 HELX_P HELX_P3 AA3 GLY A 61 ? PHE A 71 ? GLY E 61 PHE E 71 1 ? 11 HELX_P HELX_P4 AA4 SER A 74 ? SER A 101 ? SER E 74 SER E 101 1 ? 28 HELX_P HELX_P5 AA5 ILE A 222 ? TYR A 248 ? ILE E 195 TYR E 221 1 ? 27 HELX_P HELX_P6 AA6 ARG A 273 ? GLY A 303 ? ARG E 246 GLY E 276 1 ? 31 HELX_P HELX_P7 AA7 THR B 20 ? ASP B 48 ? THR A 20 ASP A 48 1 ? 29 HELX_P HELX_P8 AA8 ASP B 48 ? PHE B 53 ? ASP A 48 PHE A 53 1 ? 6 HELX_P HELX_P9 AA9 GLY B 61 ? PHE B 71 ? GLY A 61 PHE A 71 1 ? 11 HELX_P HELX_P10 AB1 SER B 74 ? SER B 101 ? SER A 74 SER A 101 1 ? 28 HELX_P HELX_P11 AB2 ILE B 222 ? TYR B 248 ? ILE A 195 TYR A 221 1 ? 27 HELX_P HELX_P12 AB3 ARG B 273 ? GLY B 303 ? ARG A 246 GLY A 276 1 ? 31 HELX_P HELX_P13 AB4 THR C 20 ? ASP C 48 ? THR B 20 ASP B 48 1 ? 29 HELX_P HELX_P14 AB5 ASP C 48 ? PHE C 53 ? ASP B 48 PHE B 53 1 ? 6 HELX_P HELX_P15 AB6 GLY C 61 ? PHE C 71 ? GLY B 61 PHE B 71 1 ? 11 HELX_P HELX_P16 AB7 SER C 74 ? SER C 101 ? SER B 74 SER B 101 1 ? 28 HELX_P HELX_P17 AB8 ILE C 222 ? TYR C 248 ? ILE B 195 TYR B 221 1 ? 27 HELX_P HELX_P18 AB9 ARG C 273 ? GLY C 303 ? ARG B 246 GLY B 276 1 ? 31 HELX_P HELX_P19 AC1 THR D 20 ? ASP D 48 ? THR F 20 ASP F 48 1 ? 29 HELX_P HELX_P20 AC2 ASP D 48 ? PHE D 53 ? ASP F 48 PHE F 53 1 ? 6 HELX_P HELX_P21 AC3 GLY D 61 ? PHE D 71 ? GLY F 61 PHE F 71 1 ? 11 HELX_P HELX_P22 AC4 SER D 74 ? SER D 101 ? SER F 74 SER F 101 1 ? 28 HELX_P HELX_P23 AC5 ILE D 222 ? TYR D 248 ? ILE F 195 TYR F 221 1 ? 27 HELX_P HELX_P24 AC6 ARG D 273 ? GLY D 303 ? ARG F 246 GLY F 276 1 ? 31 HELX_P HELX_P25 AC7 THR E 20 ? ASP E 48 ? THR C 20 ASP C 48 1 ? 29 HELX_P HELX_P26 AC8 ASP E 48 ? PHE E 53 ? ASP C 48 PHE C 53 1 ? 6 HELX_P HELX_P27 AC9 GLY E 61 ? PHE E 71 ? GLY C 61 PHE C 71 1 ? 11 HELX_P HELX_P28 AD1 SER E 74 ? SER E 101 ? SER C 74 SER C 101 1 ? 28 HELX_P HELX_P29 AD2 ILE E 222 ? TYR E 248 ? ILE C 195 TYR C 221 1 ? 27 HELX_P HELX_P30 AD3 ARG E 273 ? GLY E 303 ? ARG C 246 GLY C 276 1 ? 31 HELX_P HELX_P31 AD4 THR F 20 ? ASP F 48 ? THR D 20 ASP D 48 1 ? 29 HELX_P HELX_P32 AD5 ASP F 48 ? PHE F 53 ? ASP D 48 PHE D 53 1 ? 6 HELX_P HELX_P33 AD6 GLY F 61 ? PHE F 71 ? GLY D 61 PHE D 71 1 ? 11 HELX_P HELX_P34 AD7 SER F 74 ? SER F 101 ? SER D 74 SER D 101 1 ? 28 HELX_P HELX_P35 AD8 ILE F 222 ? TYR F 248 ? ILE D 195 TYR D 221 1 ? 27 HELX_P HELX_P36 AD9 ARG F 273 ? GLY F 303 ? ARG D 246 GLY D 276 1 ? 31 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? A CYS 55 SG ? ? ? 1_555 A CYS 269 SG ? ? E CYS 55 E CYS 242 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? ? disulf2 disulf ? ? A CYS 62 SG ? ? ? 1_555 A CYS 263 SG ? ? E CYS 62 E CYS 236 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf3 disulf ? ? A CYS 66 SG ? ? ? 1_555 A CYS 258 SG ? ? E CYS 66 E CYS 231 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? ? disulf4 disulf ? ? B CYS 55 SG ? ? ? 1_555 B CYS 269 SG ? ? A CYS 55 A CYS 242 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? ? disulf5 disulf ? ? B CYS 62 SG ? ? ? 1_555 B CYS 263 SG ? ? A CYS 62 A CYS 236 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf6 disulf ? ? B CYS 66 SG ? ? ? 1_555 B CYS 258 SG ? ? A CYS 66 A CYS 231 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? ? disulf7 disulf ? ? C CYS 55 SG ? ? ? 1_555 C CYS 269 SG ? ? B CYS 55 B CYS 242 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? ? disulf8 disulf ? ? C CYS 62 SG ? ? ? 1_555 C CYS 263 SG ? ? B CYS 62 B CYS 236 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf9 disulf ? ? C CYS 66 SG ? ? ? 1_555 C CYS 258 SG ? ? B CYS 66 B CYS 231 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? ? disulf10 disulf ? ? D CYS 55 SG ? ? ? 1_555 D CYS 269 SG ? ? F CYS 55 F CYS 242 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf11 disulf ? ? D CYS 62 SG ? ? ? 1_555 D CYS 263 SG ? ? F CYS 62 F CYS 236 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf12 disulf ? ? D CYS 66 SG ? ? ? 1_555 D CYS 258 SG ? ? F CYS 66 F CYS 231 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? ? disulf13 disulf ? ? E CYS 55 SG ? ? ? 1_555 E CYS 269 SG ? ? C CYS 55 C CYS 242 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf14 disulf ? ? E CYS 62 SG ? ? ? 1_555 E CYS 263 SG ? ? C CYS 62 C CYS 236 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf15 disulf ? ? E CYS 66 SG ? ? ? 1_555 E CYS 258 SG ? ? C CYS 66 C CYS 231 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? ? disulf16 disulf ? ? F CYS 55 SG ? ? ? 1_555 F CYS 269 SG ? ? D CYS 55 D CYS 242 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? ? disulf17 disulf ? ? F CYS 62 SG ? ? ? 1_555 F CYS 263 SG ? ? D CYS 62 D CYS 236 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf18 disulf ? ? F CYS 66 SG ? ? ? 1_555 F CYS 258 SG ? ? D CYS 66 D CYS 231 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? ? # _struct_conn_type.id disulf _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _pdbx_modification_feature.ordinal _pdbx_modification_feature.label_comp_id _pdbx_modification_feature.label_asym_id _pdbx_modification_feature.label_seq_id _pdbx_modification_feature.label_alt_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_alt_id _pdbx_modification_feature.auth_comp_id _pdbx_modification_feature.auth_asym_id _pdbx_modification_feature.auth_seq_id _pdbx_modification_feature.PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.symmetry _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.modified_residue_symmetry _pdbx_modification_feature.comp_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id _pdbx_modification_feature.ref_pcm_id _pdbx_modification_feature.ref_comp_id _pdbx_modification_feature.type _pdbx_modification_feature.category 1 CYS A 55 ? CYS A 269 ? CYS E 55 ? 1_555 CYS E 242 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 2 CYS A 62 ? CYS A 263 ? CYS E 62 ? 1_555 CYS E 236 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 3 CYS A 66 ? CYS A 258 ? CYS E 66 ? 1_555 CYS E 231 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 4 CYS B 55 ? CYS B 269 ? CYS A 55 ? 1_555 CYS A 242 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 5 CYS B 62 ? CYS B 263 ? CYS A 62 ? 1_555 CYS A 236 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 6 CYS B 66 ? CYS B 258 ? CYS A 66 ? 1_555 CYS A 231 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 7 CYS C 55 ? CYS C 269 ? CYS B 55 ? 1_555 CYS B 242 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 8 CYS C 62 ? CYS C 263 ? CYS B 62 ? 1_555 CYS B 236 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 9 CYS C 66 ? CYS C 258 ? CYS B 66 ? 1_555 CYS B 231 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 10 CYS D 55 ? CYS D 269 ? CYS F 55 ? 1_555 CYS F 242 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 11 CYS D 62 ? CYS D 263 ? 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None 'Disulfide bridge' # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 TYR 261 A . ? TYR 234 E PRO 262 A ? PRO 235 E 1 5.07 2 TYR 261 B . ? TYR 234 A PRO 262 B ? PRO 235 A 1 5.10 3 TYR 261 C . ? TYR 234 B PRO 262 C ? PRO 235 B 1 5.11 4 TYR 261 D . ? TYR 234 F PRO 262 D ? PRO 235 F 1 5.02 5 TYR 261 E . ? TYR 234 C PRO 262 E ? PRO 235 C 1 5.01 6 TYR 261 F . ? TYR 234 D PRO 262 F ? PRO 235 D 1 5.10 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 3 ? AA2 ? 3 ? AA3 ? 3 ? AA4 ? 3 ? AA5 ? 3 ? AA6 ? 3 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA6 2 3 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 VAL A 54 ? 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LEU D 228 CYS D 231 # loop_ _pdbx_struct_sheet_hbond.sheet_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_1 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_2 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_seq_id AA1 1 2 N VAL A 54 ? 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N TYR D 229 # _pdbx_entry_details.entry_id 9IPM _pdbx_entry_details.nonpolymer_details ? _pdbx_entry_details.sequence_details ? _pdbx_entry_details.compound_details ? _pdbx_entry_details.source_details ? _pdbx_entry_details.has_ligand_of_interest Y _pdbx_entry_details.has_protein_modification Y # loop_ _pdbx_validate_torsion.id _pdbx_validate_torsion.PDB_model_num _pdbx_validate_torsion.auth_comp_id _pdbx_validate_torsion.auth_asym_id _pdbx_validate_torsion.auth_seq_id _pdbx_validate_torsion.PDB_ins_code _pdbx_validate_torsion.label_alt_id _pdbx_validate_torsion.phi _pdbx_validate_torsion.psi 1 1 LYS E 238 ? ? 54.22 -144.05 2 1 TRP E 277 ? ? 39.88 50.05 3 1 LYS A 238 ? ? 54.18 -144.02 4 1 TRP A 277 ? ? 39.96 50.01 5 1 LYS B 238 ? ? 54.15 -144.05 6 1 TRP B 277 ? ? 39.95 50.01 7 1 LYS F 238 ? ? 54.18 -144.08 8 1 TRP F 277 ? ? 39.95 50.01 9 1 LYS C 238 ? ? 54.24 -144.05 10 1 TRP C 277 ? ? 39.86 50.07 11 1 LYS D 238 ? ? 54.25 -144.06 12 1 TRP D 277 ? ? 39.93 49.99 # _em_3d_fitting.id 1 _em_3d_fitting.entry_id 9IPM _em_3d_fitting.method ? _em_3d_fitting.target_criteria ? _em_3d_fitting.details ? _em_3d_fitting.overall_b_value ? _em_3d_fitting.ref_space ? _em_3d_fitting.ref_protocol ? # _em_3d_reconstruction.entry_id 9IPM _em_3d_reconstruction.id 1 _em_3d_reconstruction.method ? _em_3d_reconstruction.algorithm ? _em_3d_reconstruction.citation_id ? _em_3d_reconstruction.details ? _em_3d_reconstruction.resolution 3.56 _em_3d_reconstruction.resolution_method 'FSC 0.143 CUT-OFF' _em_3d_reconstruction.magnification_calibration ? _em_3d_reconstruction.nominal_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.actual_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.num_particles 111066 _em_3d_reconstruction.euler_angles_details ? _em_3d_reconstruction.num_class_averages ? _em_3d_reconstruction.refinement_type ? _em_3d_reconstruction.image_processing_id 1 _em_3d_reconstruction.symmetry_type POINT # _em_buffer.id 1 _em_buffer.specimen_id 1 _em_buffer.name ? _em_buffer.details '20mM HEPES(pH 7.5), 150mM KCl, 2mM beta-mercaptoethanol' _em_buffer.pH 7.5 # _em_entity_assembly.id 1 _em_entity_assembly.parent_id 0 _em_entity_assembly.source RECOMBINANT _em_entity_assembly.type COMPLEX _em_entity_assembly.name Connexin36 _em_entity_assembly.details ;BRIL-fused connexin36 gap junction intercellular channel is reconstituted into lipid nanodiscs with soybean polar lipids and MSP1E1. Carbenoxolone dissolved in 10% (v/v) DMSO is treated to the sample with 20-fold molar excess to Cx36 protomer. ; _em_entity_assembly.synonym ? _em_entity_assembly.oligomeric_details ? _em_entity_assembly.entity_id_list 1 # _em_image_scans.entry_id 9IPM _em_image_scans.id 1 _em_image_scans.number_digital_images ? _em_image_scans.details ? _em_image_scans.scanner_model ? _em_image_scans.sampling_size ? _em_image_scans.od_range ? _em_image_scans.quant_bit_size ? _em_image_scans.citation_id ? _em_image_scans.dimension_height 4092 _em_image_scans.dimension_width 5096 _em_image_scans.frames_per_image ? _em_image_scans.image_recording_id 1 _em_image_scans.used_frames_per_image ? # _em_imaging.entry_id 9IPM _em_imaging.id 1 _em_imaging.astigmatism ? _em_imaging.electron_beam_tilt_params ? _em_imaging.residual_tilt ? _em_imaging.microscope_model 'TFS KRIOS' _em_imaging.specimen_holder_type ? _em_imaging.specimen_holder_model ? _em_imaging.details ? _em_imaging.date ? _em_imaging.accelerating_voltage 300 _em_imaging.illumination_mode 'FLOOD BEAM' _em_imaging.mode 'BRIGHT FIELD' _em_imaging.nominal_cs 2.7 _em_imaging.nominal_defocus_min 500 _em_imaging.nominal_defocus_max 2000 _em_imaging.calibrated_defocus_min ? _em_imaging.calibrated_defocus_max ? _em_imaging.tilt_angle_min ? _em_imaging.tilt_angle_max ? _em_imaging.nominal_magnification 120000 _em_imaging.calibrated_magnification ? _em_imaging.electron_source 'FIELD EMISSION GUN' _em_imaging.citation_id ? _em_imaging.temperature ? _em_imaging.detector_distance ? _em_imaging.recording_temperature_minimum ? _em_imaging.recording_temperature_maximum ? _em_imaging.alignment_procedure ? _em_imaging.c2_aperture_diameter 70 _em_imaging.specimen_id 1 _em_imaging.cryogen NITROGEN # _em_sample_support.id 1 _em_sample_support.film_material ? _em_sample_support.method ? _em_sample_support.grid_material COPPER _em_sample_support.grid_mesh_size 200 _em_sample_support.grid_type 'Quantifoil R1.2/1.3' _em_sample_support.details ? _em_sample_support.specimen_id 1 _em_sample_support.citation_id ? # _em_vitrification.entry_id 9IPM _em_vitrification.id 1 _em_vitrification.specimen_id 1 _em_vitrification.cryogen_name ETHANE _em_vitrification.humidity 95 _em_vitrification.temp ? _em_vitrification.chamber_temperature 277 _em_vitrification.instrument 'FEI VITROBOT MARK IV' _em_vitrification.method ? _em_vitrification.time_resolved_state ? _em_vitrification.citation_id ? _em_vitrification.details ? # _em_experiment.entry_id 9IPM _em_experiment.id 1 _em_experiment.reconstruction_method 'SINGLE PARTICLE' _em_experiment.aggregation_state PARTICLE _em_experiment.entity_assembly_id 1 # _em_single_particle_entity.entry_id 9IPM _em_single_particle_entity.id 1 _em_single_particle_entity.image_processing_id 1 _em_single_particle_entity.point_symmetry C6 # loop_ _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_model_num _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.polymer_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.occupancy_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_ins_code _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_seq_id 1 1 Y 1 E MET 1 ? 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