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C . n # _pdbx_entity_instance_feature.ordinal 1 _pdbx_entity_instance_feature.comp_id O6E _pdbx_entity_instance_feature.asym_id ? _pdbx_entity_instance_feature.seq_num ? _pdbx_entity_instance_feature.auth_comp_id O6E _pdbx_entity_instance_feature.auth_asym_id ? _pdbx_entity_instance_feature.auth_seq_num ? _pdbx_entity_instance_feature.feature_type 'SUBJECT OF INVESTIGATION' _pdbx_entity_instance_feature.details ? # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code D 3 O6E 1 1001 701 O6E O6E B . E 3 O6E 1 1001 701 O6E O6E A . # _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma 90.00 _cell.angle_gamma_esd ? _cell.entry_id 9IUZ _cell.details ? _cell.formula_units_Z ? _cell.length_a 1.00 _cell.length_a_esd ? _cell.length_b 1.00 _cell.length_b_esd ? _cell.length_c 1.00 _cell.length_c_esd ? _cell.volume ? _cell.volume_esd ? _cell.Z_PDB ? _cell.reciprocal_angle_alpha ? _cell.reciprocal_angle_beta ? _cell.reciprocal_angle_gamma ? _cell.reciprocal_angle_alpha_esd ? _cell.reciprocal_angle_beta_esd ? _cell.reciprocal_angle_gamma_esd ? _cell.reciprocal_length_a ? _cell.reciprocal_length_b ? _cell.reciprocal_length_c ? _cell.reciprocal_length_a_esd ? _cell.reciprocal_length_b_esd ? _cell.reciprocal_length_c_esd ? _cell.pdbx_unique_axis ? _cell.pdbx_esd_method ? # _symmetry.entry_id 9IUZ _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' _symmetry.pdbx_full_space_group_name_H-M ? # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 9IUZ _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _refine.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine.entry_id 9IUZ _refine.pdbx_diffrn_id ? _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.ls_number_reflns_obs ? _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.ls_d_res_low ? _refine.ls_d_res_high . _refine.ls_percent_reflns_obs ? _refine.ls_R_factor_obs ? _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_R_work ? _refine.ls_R_factor_R_free ? _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_percent_reflns_R_free ? _refine.ls_number_reflns_R_free ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.occupancy_min ? _refine.occupancy_max ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.B_iso_mean ? _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method ? _refine.details ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.002 ? 8513 ? f_bond_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.518 ? 11518 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 4.747 ? 1226 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.039 ? 1290 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.004 ? 1477 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 9IUZ _struct.title 'Constitutively active mutant(Y276H) of Arabidopsis phytochrome B(phyB) in complex with phytochrome-interacting factor 6(PIF6)' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 9IUZ _struct_keywords.text 'Phytochrome, Phytochrome-interacting factor, Signal complex, GENE REGULATION' _struct_keywords.pdbx_keywords 'GENE REGULATION' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 2 ? D N N 3 ? E N N 3 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP PHYB_ARATH P14713 ? 1 ;MVSGVGGSGGGRGGGRGGEEEPSSSHTPNNRRGGEQAQSSGTKSLRPRSNTESMSKAIQQYTVDARLHAVFEQSGESGKS FDYSQSLKTTTYGSSVPEQQITAYLSRIQRGGYIQPFGCMIAVDESSFRIIGYSENAREMLGIMPQSVPTLEKPEILAMG TDVRSLFTSSSSILLERAFVAREITLLNPVWIHSKNTGKPFYAILHRIDVGVVIDLEPARTEDPALSIAGAVQSQKLAVR AISQLQALPGGDIKLLCDTVVESVRDLTGYDRVMVYKFHEDEHGEVVAESKRDDLEPYIGLHYPATDIPQASRFLFKQNR VRMIVDCNATPVLVVQDDRLTQSMCLVGSTLRAPHGCHSQYMANMGSIASLAMAVIINGNEDDGSNVASGRSSMRLWGLV VCHHTSSRCIPFPLRYACEFLMQAFGLQLNMELQLALQMSEKRVLRTQTLLCDMLLRDSPAGIVTQSPSIMDLVKCDGAA FLYHGKYYPLGVAPSEVQIKDVVEWLLANHADSTGLSTDSLGDAGYPGAAALGDAVCGMAVAYITKRDFLFWFRSHTAKE IKWGGAKHHPEDKDDGQRMHPRSSFQAFLEVVKSRSQPWETAEMDAIHSLQLILRDSFKESEAAMNSKVVDGVVQPCRDM AGEQGIDELGAVAREMVRLIETATVPIFAVDAGGCINGWNAKIAELTGLSVEEAMGKSLVSDLIYKENEATVNKLLSRAL RGDEEKNVEVKLKTFSPELQGKAVFVVVNACSSKDYLNNIVGVCFVGQDVTSQKIVMDKFINIQGDYKAIVHSPNPLIPP IFAADENTCCLEWNMAMEKLTGWSRSEVIGKMIVGEVFGSCCMLKGPDALTKFMIVLHNAIGGQDTDKFPFPFFDRNGKF VQALLTANKRVSLEGKVIGAFCFLQIPS ; 1 2 UNP PIF6_ARATH Q8L5W7 ? 2 ;MMFLPTDYCCRLSDQEYMELVFENGQILAKGQRSNVSLHNQRTKSIMDLYEAEYNEDFMKSIIHGGGGAITNLGDTQVVP QSHVAAAHETNMLESNKHVD ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 9IUZ B 6 ? 913 ? 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'expression tag' 0 17 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details trimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 3 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'not applicable' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 SER A 60 ? 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SER C 45 TYR C 54 1 ? 10 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 ASN 193 A . ? ASN 188 B PRO 194 A ? PRO 189 B 1 6.09 2 SER 472 A . ? SER 467 B PRO 473 A ? PRO 468 B 1 -0.71 3 ASN 193 B . ? ASN 188 A PRO 194 B ? PRO 189 A 1 -4.05 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 7 ? AA2 ? 6 ? AA3 ? 5 ? AA4 ? 7 ? AA5 ? 6 ? AA6 ? 5 ? 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N TYR A 133 AA4 3 4 O GLY B 137 ? O GLY A 132 N ALA B 127 ? N ALA A 122 AA4 4 5 N VAL B 128 ? N VAL A 123 O VAL B 217 ? O VAL A 212 AA4 5 6 O VAL B 218 ? O VAL A 213 N HIS B 211 ? N HIS A 206 AA4 6 7 O PHE B 206 ? O PHE A 201 N ILE B 197 ? N ILE A 192 AA5 1 2 O TYR B 308 ? O TYR A 303 N GLY B 289 ? N GLY A 284 AA5 2 3 O GLU B 290 ? O GLU A 285 N LYS B 282 ? N LYS A 277 AA5 3 4 N HIS B 281 ? N HIS A 276 O LEU B 404 ? O LEU A 399 AA5 4 5 O ARG B 400 ? O ARG A 395 N ILE B 382 ? N ILE A 377 AA5 5 6 O ALA B 377 ? O ALA A 372 N ARG B 327 ? N ARG A 322 AA6 1 2 O LYS B 491 ? O LYS A 486 N TYR B 488 ? N TYR A 483 AA6 2 3 N GLY B 483 ? N GLY A 478 O PHE B 558 ? O PHE A 553 AA6 3 4 O ARG B 559 ? O ARG A 554 N GLY B 543 ? N GLY A 538 AA6 4 5 O VAL B 546 ? O VAL A 541 N LEU B 521 ? N LEU A 516 AA7 1 2 N VAL C 26 ? N VAL C 21 O LEU C 33 ? 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C 10-60 PDB 'experimental model' 8YB4 ? # _em_3d_reconstruction.entry_id 9IUZ _em_3d_reconstruction.id 1 _em_3d_reconstruction.method ? _em_3d_reconstruction.algorithm ? _em_3d_reconstruction.citation_id ? _em_3d_reconstruction.details ? _em_3d_reconstruction.resolution 3.19 _em_3d_reconstruction.resolution_method 'FSC 0.143 CUT-OFF' _em_3d_reconstruction.magnification_calibration ? _em_3d_reconstruction.nominal_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.actual_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.num_particles 366884 _em_3d_reconstruction.euler_angles_details ? _em_3d_reconstruction.num_class_averages ? _em_3d_reconstruction.refinement_type ? _em_3d_reconstruction.image_processing_id 1 _em_3d_reconstruction.symmetry_type POINT # _em_buffer.id 1 _em_buffer.specimen_id 1 _em_buffer.name ? _em_buffer.details ? _em_buffer.pH 8.0 # loop_ _em_entity_assembly.id _em_entity_assembly.parent_id _em_entity_assembly.source _em_entity_assembly.type _em_entity_assembly.name _em_entity_assembly.details _em_entity_assembly.synonym _em_entity_assembly.oligomeric_details _em_entity_assembly.entity_id_list 1 0 RECOMBINANT COMPLEX 'Ternary complex of phyB mutant(Y276H) with PIF6' ? ? ? 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