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_refine.ls_restrained_S_obs ? _refine.ls_shift_over_esd_max ? _refine.ls_shift_over_esd_mean ? _refine.ls_structure_factor_coef ? _refine.ls_weighting_details ? _refine.ls_weighting_scheme ? _refine.ls_wR_factor_all ? _refine.ls_wR_factor_obs ? _refine.ls_wR_factor_R_free ? _refine.ls_wR_factor_R_work ? _refine.occupancy_max ? _refine.occupancy_min ? _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.pdbx_R_complete ? _refine.ls_R_factor_gt ? _refine.ls_goodness_of_fit_gt ? _refine.ls_goodness_of_fit_ref ? _refine.ls_shift_over_su_max ? _refine.ls_shift_over_su_max_lt ? _refine.ls_shift_over_su_mean ? _refine.ls_shift_over_su_mean_lt ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F ? _refine.pdbx_ls_sigma_Fsqd ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values 'REAL-SPACE (WEIGHTED MAP SUM AT ATOM CENTERS)' _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_real_space_R ? _refine.pdbx_density_correlation ? _refine.pdbx_pd_number_of_powder_patterns ? _refine.pdbx_pd_number_of_points ? _refine.pdbx_pd_meas_number_of_points ? _refine.pdbx_pd_proc_ls_prof_R_factor ? _refine.pdbx_pd_proc_ls_prof_wR_factor ? _refine.pdbx_pd_Marquardt_correlation_coeff ? _refine.pdbx_pd_Fsqrd_R_factor ? _refine.pdbx_pd_ls_matrix_band_width ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.pdbx_diffrn_id ? _refine.overall_SU_B ? 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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.759 ? 6957 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 14.262 ? 1822 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.077 ? 774 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.011 ? 892 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 9J5L _struct.title 'Complex structure of influenza hemagglutinin HA stem with CR9114 Fab and FISW84 Fab' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 9J5L _struct_keywords.text 'antigen, complex, VIRAL PROTEIN/IMMUNE SYSTEM, VIRAL PROTEIN-IMMUNE SYSTEM complex' _struct_keywords.pdbx_keywords 'VIRAL PROTEIN/IMMUNE SYSTEM' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? F N N 1 ? G N N 6 ? H N N 6 ? I N N 7 ? J N N 7 ? K N N 7 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 PDB 9J5L 9J5L ? 1 ? 1 2 PDB 9J5L 9J5L ? 2 ? 1 3 PDB 9J5L 9J5L ? 3 ? 1 4 PDB 9J5L 9J5L ? 4 ? 1 5 PDB 9J5L 9J5L ? 5 ? 1 6 PDB 9J5L 9J5L ? 6 ? 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 9J5L 2 1 ? 195 ? 9J5L 1 ? 195 ? 1 195 2 2 9J5L B 1 ? 216 ? 9J5L 1 ? 216 ? 1 216 3 3 9J5L C 1 ? 451 ? 9J5L 1 ? 451 ? 1 451 4 4 9J5L D 1 ? 215 ? 9J5L 1 ? 215 ? 1 215 5 5 9J5L E 1 ? 446 ? 9J5L 1 ? 446 ? 1 446 6 1 9J5L J 1 ? 195 ? 9J5L 62 ? 256 ? 62 256 7 6 9J5L 1 1 ? 61 ? 9J5L 1 ? 326 ? 1 326 8 6 9J5L H 1 ? 61 ? 9J5L 59 ? 119 ? 59 119 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details octameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 8 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 LYS A 39 ? GLN A 62 ? LYS 2 39 GLN 2 62 1 ? 24 HELX_P HELX_P2 AA2 TRP A 92 ? LEU A 126 ? TRP 2 92 LEU 2 126 1 ? 35 HELX_P HELX_P3 AA3 ASN A 145 ? GLY A 155 ? ASN 2 145 GLY 2 155 1 ? 11 HELX_P HELX_P4 AA4 ASP A 158 ? ASP A 174 ? ASP 2 158 ASP 2 174 1 ? 17 HELX_P HELX_P5 AA5 ASN F 46 ? SER F 54 ? ASN J 107 SER J 115 1 ? 9 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? A CYS 93 SG ? ? ? 1_555 G CYS 42 SG ? ? 2 CYS 93 1 CYS 307 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.021 ? ? disulf2 disulf ? ? A CYS 124 SG ? ? ? 1_555 H CYS 4 SG ? ? 2 CYS 124 H CYS 62 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.149 ? ? disulf3 disulf ? ? A CYS 137 SG ? ? ? 1_555 G CYS 4 SG ? ? 2 CYS 137 1 CYS 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf4 disulf ? ? B CYS 22 SG ? ? ? 1_555 B CYS 89 SG ? ? B CYS 22 B CYS 89 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf5 disulf ? ? C CYS 22 SG ? ? ? 1_555 C CYS 96 SG ? ? C CYS 22 C CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf6 disulf ? ? D CYS 23 SG ? ? ? 1_555 D CYS 88 SG ? ? D CYS 23 D CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf7 disulf ? ? E CYS 22 SG ? ? ? 1_555 E CYS 96 SG ? ? E CYS 22 E CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf8 disulf ? ? F CYS 47 SG ? ? ? 1_555 G CYS 20 SG ? ? J CYS 108 1 CYS 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.133 ? ? covale1 covale one ? G ASN 11 ND2 ? ? ? 1_555 K NAG . C1 ? ? 1 ASN 11 1 NAG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.422 ? N-Glycosylation # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? # loop_ _pdbx_modification_feature.ordinal _pdbx_modification_feature.label_comp_id _pdbx_modification_feature.label_asym_id _pdbx_modification_feature.label_seq_id _pdbx_modification_feature.label_alt_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_alt_id _pdbx_modification_feature.auth_comp_id _pdbx_modification_feature.auth_asym_id _pdbx_modification_feature.auth_seq_id _pdbx_modification_feature.PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.symmetry _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.modified_residue_symmetry _pdbx_modification_feature.comp_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id _pdbx_modification_feature.ref_pcm_id _pdbx_modification_feature.ref_comp_id _pdbx_modification_feature.type _pdbx_modification_feature.category 1 NAG K . ? ASN G 11 ? NAG 1 402 ? 1_555 ASN 1 11 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 2 CYS A 93 ? CYS G 42 ? CYS 2 93 ? 1_555 CYS 1 307 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 3 CYS A 124 ? CYS H 4 ? CYS 2 124 ? 1_555 CYS H 62 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 4 CYS A 137 ? CYS G 4 ? CYS 2 137 ? 1_555 CYS 1 4 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 5 CYS B 22 ? CYS B 89 ? CYS B 22 ? 1_555 CYS B 89 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 6 CYS C 22 ? CYS C 96 ? CYS C 22 ? 1_555 CYS C 96 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 7 CYS D 23 ? CYS D 88 ? CYS D 23 ? 1_555 CYS D 88 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 8 CYS E 22 ? CYS E 96 ? CYS E 22 ? 1_555 CYS E 96 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 9 CYS F 47 ? CYS G 20 ? CYS J 108 ? 1_555 CYS 1 20 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 5 ? AA2 ? 2 ? AA3 ? 2 ? AA4 ? 3 ? AA5 ? 4 ? AA6 ? 4 ? AA7 ? 6 ? AA8 ? 4 ? AA9 ? 4 ? AB1 ? 6 ? AB2 ? 3 ? AB3 ? 5 ? AB4 ? 2 ? AB5 ? 2 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA1 3 4 ? anti-parallel AA1 4 5 ? anti-parallel AA2 1 2 ? parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA5 3 4 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA6 3 4 ? anti-parallel AA7 1 2 ? parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA7 3 4 ? anti-parallel AA7 4 5 ? anti-parallel AA7 5 6 ? anti-parallel AA8 1 2 ? parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA8 3 4 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AA9 2 3 ? anti-parallel AA9 3 4 ? anti-parallel AB1 1 2 ? parallel AB1 2 3 ? anti-parallel AB1 3 4 ? anti-parallel AB1 4 5 ? anti-parallel AB1 5 6 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB2 2 3 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB3 2 3 ? anti-parallel AB3 3 4 ? anti-parallel AB3 4 5 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 GLY A 31 ? 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