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EMDB EMD-61339 ? ? # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal _pdbx_audit_revision_history.data_content_type _pdbx_audit_revision_history.major_revision _pdbx_audit_revision_history.minor_revision _pdbx_audit_revision_history.revision_date _pdbx_audit_revision_history.part_number 1 'Structure model' 1 0 2025-07-09 ? 2 'Structure model' 1 1 2025-07-16 ? # _pdbx_audit_revision_details.ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.data_content_type 'Structure model' _pdbx_audit_revision_details.provider repository _pdbx_audit_revision_details.type 'Initial release' _pdbx_audit_revision_details.description ? _pdbx_audit_revision_details.details ? # loop_ _pdbx_audit_revision_group.ordinal _pdbx_audit_revision_group.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_group.data_content_type _pdbx_audit_revision_group.group 1 2 'Structure model' 'Data collection' 2 2 'Structure model' 'Database references' # loop_ _pdbx_audit_revision_category.ordinal _pdbx_audit_revision_category.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_category.data_content_type _pdbx_audit_revision_category.category 1 2 'Structure model' citation 2 2 'Structure model' em_admin # loop_ _pdbx_audit_revision_item.ordinal _pdbx_audit_revision_item.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_item.data_content_type _pdbx_audit_revision_item.item 1 2 'Structure model' '_citation.journal_volume' 2 2 'Structure model' '_citation.page_first' 3 2 'Structure model' '_citation.page_last' 4 2 'Structure model' '_citation.pdbx_database_id_PubMed' 5 2 'Structure model' '_citation.title' 6 2 'Structure model' '_em_admin.last_update' # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 9JC1 _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2024-08-28 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site PDBJ _pdbx_database_status.process_site PDBJ _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y # _pdbx_database_related.db_name EMDB _pdbx_database_related.details 'Engineering of ATP synthase' _pdbx_database_related.db_id EMD-61339 _pdbx_database_related.content_type 'associated EM volume' # _pdbx_contact_author.id 4 _pdbx_contact_author.email hnoji@g.ecc.u-tokyo.ac.jp _pdbx_contact_author.name_first Hiroyuki _pdbx_contact_author.name_last Noji _pdbx_contact_author.name_mi ? _pdbx_contact_author.role 'principal investigator/group leader' _pdbx_contact_author.identifier_ORCID 0000-0002-8842-6836 # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Hamaguchi-Suzuki, N.' 1 0009-0000-9002-349X 'Ueno, H.' 2 0000-0001-5331-4335 'Yasuda, K.' 3 ? 'Marui, R.' 4 ? 'Adachi, N.' 5 ? 'Senda, T.' 6 ? 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(doi: 10.1074/jbc.M111210200),based on pTR19-ASDS, which was created by Suzuki et al. (doi: 10.1074/jbc.M111210200) ; 5 polymer man 'ATP synthase subunit b' 18601.707 3 ? ? ? ;the same molecule as chain B,L and N; the full sequence is MGEAAHGISGGTIIYQLLMFIILLALLRKFAWQPLMNIMKQREEHIANEIDQAEKRRQEA EKLLEEQRELMKQSRQEAQALIENARKLAEEQKEQIVASARAEAERVKETAKKEIEREKE QAMAALREQVASLSVLIASKVIEKELTEQDQRKLIEAYIKDVQEVGGAR ; 6 polymer man 'ATP synthase subunit b' 19437.396 3 ? ? ? 'based on pTR19-ASDS, which was created by Suzuki et al. (doi: 10.1074/jbc.M111210200)' 7 non-polymer syn "ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE" 427.201 1 ? ? ? ? 8 non-polymer syn 'MAGNESIUM ION' 24.305 4 ? ? ? ? # loop_ _entity_name_com.entity_id _entity_name_com.name 1 'ATP synthase F1 sector subunit beta,F-ATPase subunit beta' 2 'ATP synthase F1 sector gamma subunit,F-ATPase gamma subunit' 3 'ATP synthase F1 sector epsilon subunit,F-ATPase epsilon subunit' 4 'ATP synthase F1 sector subunit alpha,F-ATPase subunit alpha' # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no ;MHHHHHHHHHHMTRGRVIQVMGPVVDVKFENGHLPAIYNALKIQHKARNENEVDIDLTLEVALHLGDDTVRTIAMASTDG LIRGMEVIDTGAPISVPVGEVTLGRVFNVLGEPIDLEGDIPADARRDPIHRPAPKFEELATEVEILETGIKVVDLLAPYI KGGKIGLFGGAGVGKTVLIQELIHNIAQEHGGISVFAGVGERTREGNDLYHEMKDSGVISKTAMVFGQMNEPPGARMRVA LTGLTMAEYFRDEQGQDVLLFIDNIFRFTQAGSEVSALLGRMPSAVGYQPTLATEMGQLQERITSTAKGSITSIQAIYVP ADDYTDPAPATTFSHLDATTNLERKLAEMGIYPAVDPLASTSRALAPEIVGEEHYQVARKVQQTLQRYKELQDIIAILGM DELSDEDKLVVHRARRIQFFLSQNFHVAEQFTGQPGSYVPVKETVRGFKEILEGKYDHLPEDAFRLVGRIEEVVEKAKAM GVEV ; ;MHHHHHHHHHHMTRGRVIQVMGPVVDVKFENGHLPAIYNALKIQHKARNENEVDIDLTLEVALHLGDDTVRTIAMASTDG LIRGMEVIDTGAPISVPVGEVTLGRVFNVLGEPIDLEGDIPADARRDPIHRPAPKFEELATEVEILETGIKVVDLLAPYI KGGKIGLFGGAGVGKTVLIQELIHNIAQEHGGISVFAGVGERTREGNDLYHEMKDSGVISKTAMVFGQMNEPPGARMRVA LTGLTMAEYFRDEQGQDVLLFIDNIFRFTQAGSEVSALLGRMPSAVGYQPTLATEMGQLQERITSTAKGSITSIQAIYVP ADDYTDPAPATTFSHLDATTNLERKLAEMGIYPAVDPLASTSRALAPEIVGEEHYQVARKVQQTLQRYKELQDIIAILGM DELSDEDKLVVHRARRIQFFLSQNFHVAEQFTGQPGSYVPVKETVRGFKEILEGKYDHLPEDAFRLVGRIEEVVEKAKAM GVEV ; D,E,F ? 2 'polypeptide(L)' no no ;MASLRDIKTRINATKKTSQITKAMEMVSTSKLNRAEQNAKSFVPYMEKIQEVVANVALGAGGASHPMLVSRPVKKTGYLV ITSDRGLAGAYNSNVLRLVYQTIQKRHASPDEYAIIVIGRVGLSFFRKRNMPVILDITRLPDQPSFADIKEIARKTVGLF ADGTFDELYMYYNHYVSAIQQEVTERKLLPLTDLAENKQRTVYEFEPSQEEILDVLLPQYAESLIYGALLDAKASEHAAR MTAMKNATDNANELIRTLTLSYNRARQAAITQEITEIVAGANALQ ; ;MASLRDIKTRINATKKTSQITKAMEMVSTSKLNRAEQNAKSFVPYMEKIQEVVANVALGAGGASHPMLVSRPVKKTGYLV ITSDRGLAGAYNSNVLRLVYQTIQKRHASPDEYAIIVIGRVGLSFFRKRNMPVILDITRLPDQPSFADIKEIARKTVGLF ADGTFDELYMYYNHYVSAIQQEVTERKLLPLTDLAENKQRTVYEFEPSQEEILDVLLPQYAESLIYGALLDAKASEHAAR MTAMKNATDNANELIRTLTLSYNRARQAAITQEITEIVAGANALQ ; G ? 3 'polypeptide(L)' no no ;MKTIHVSVVTPDGPVYEDDVEMVSVKAKSGELGILPGHIPLVAPLEISAARLKKGGKTQYIAVSGGFLEVRPDKVTILAQ AAERAED ; ;MKTIHVSVVTPDGPVYEDDVEMVSVKAKSGELGILPGHIPLVAPLEISAARLKKGGKTQYIAVSGGFLEVRPDKVTILAQ AAERAED ; H ? 4 'polypeptide(L)' no no ;MGIAKAVAYSARPLTDEELRALSDVFAQKVGKQTLEIENIIDPELIGGVRLRIGNRIYDGSVSGQLERIRRQLIGGSGGS IRAEEISALIKQQIENYESQIQVSDVGTVIQVGDGIARAHGLDNVMSGELVEFANGVMGMALNLEENNVGIVILGPYTGI KEGDEVRRTGRIMEVPVGEALIGRVVNPLGQPVDGLGPVETTETRPIESPAPGVMDRRSVHEPLQTGIKAIDALVPIGRG QRELIIGDRQTGKTSVAIDTIINQKDQNMISIYVAIGQKESTVRTVVETLRKHGALDYTIVVTASASQPAPLLFLAPYAG VAMGEYFMYKGKHVLVVYDDLSKQAAAYRELSLLLRRPPGREAYPGDIFYLHSRLLERAAKLSDAKGGGSLTALPFVETQ AGDISAYIPTNVISITDGQIFLQSDLFFSGVRPAINAGLSVSRVGGAAQIKAMKKVAGTLRLDLAAYRELEAFAQFGSDL DKATQAKLARGARTVEVLKQDLHQPIPVEKQVLIIYALTRGFLDDIPVEDVRRFEKEFYLFLDQNGQHLLEHIRTTKDLP NEDDLNKAIEAFKKTFVVSQ ; ;MGIAKAVAYSARPLTDEELRALSDVFAQKVGKQTLEIENIIDPELIGGVRLRIGNRIYDGSVSGQLERIRRQLIGGSGGS IRAEEISALIKQQIENYESQIQVSDVGTVIQVGDGIARAHGLDNVMSGELVEFANGVMGMALNLEENNVGIVILGPYTGI KEGDEVRRTGRIMEVPVGEALIGRVVNPLGQPVDGLGPVETTETRPIESPAPGVMDRRSVHEPLQTGIKAIDALVPIGRG QRELIIGDRQTGKTSVAIDTIINQKDQNMISIYVAIGQKESTVRTVVETLRKHGALDYTIVVTASASQPAPLLFLAPYAG VAMGEYFMYKGKHVLVVYDDLSKQAAAYRELSLLLRRPPGREAYPGDIFYLHSRLLERAAKLSDAKGGGSLTALPFVETQ AGDISAYIPTNVISITDGQIFLQSDLFFSGVRPAINAGLSVSRVGGAAQIKAMKKVAGTLRLDLAAYRELEAFAQFGSDL DKATQAKLARGARTVEVLKQDLHQPIPVEKQVLIIYALTRGFLDDIPVEDVRRFEKEFYLFLDQNGQHLLEHIRTTKDLP NEDDLNKAIEAFKKTFVVSQ ; I,J,K ? 5 'polypeptide(L)' no no ;MGEAAHGISGGTIIYQLLMFIILLALLRKFAWQPLMNIMKQREEHIANEIDQAEKRRQEAEKLLEEQRELMKQSRQEAQA LIENARKLAEEQKEQIVASARAEAERVKETAKKEIEREKEQAMAALREQVASLSVLIASKVI(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) ; ;MGEAAHGISGGTIIYQLLMFIILLALLRKFAWQPLMNIMKQREEHIANEIDQAEKRRQEAEKLLEEQRELMKQSRQEAQA LIENARKLAEEQKEQIVASARAEAERVKETAKKEIEREKEQAMAALREQVASLSVLIASKVIXXXXXXXXXXXXXXXXXX XXXXXXXXX ; A,C,M ? 6 'polypeptide(L)' no no ;MGEAAHGISGGTIIYQLLMFIILLALLRKFAWQPLMNIMKQREEHIANEIDQAEKRRQEAEKLLEEQRELMKQSRQEAQA LIENARKLAEEQKEQIVASARAEAERVKETAKKEIEREKEQAMAALREQVASLSVLIASKVIEKELTEQDQRKLIEAYIK DVQEVGGAR ; ;MGEAAHGISGGTIIYQLLMFIILLALLRKFAWQPLMNIMKQREEHIANEIDQAEKRRQEAEKLLEEQRELMKQSRQEAQA LIENARKLAEEQKEQIVASARAEAERVKETAKKEIEREKEQAMAALREQVASLSVLIASKVIEKELTEQDQRKLIEAYIK DVQEVGGAR ; B,L,N ? # loop_ _pdbx_entity_nonpoly.entity_id _pdbx_entity_nonpoly.name _pdbx_entity_nonpoly.comp_id 7 "ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE" ADP 8 'MAGNESIUM ION' MG # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id 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THR n 1 91 GLY n 1 92 ALA n 1 93 PRO n 1 94 ILE n 1 95 SER n 1 96 VAL n 1 97 PRO n 1 98 VAL n 1 99 GLY n 1 100 GLU n 1 101 VAL n 1 102 THR n 1 103 LEU n 1 104 GLY n 1 105 ARG n 1 106 VAL n 1 107 PHE n 1 108 ASN n 1 109 VAL n 1 110 LEU n 1 111 GLY n 1 112 GLU n 1 113 PRO n 1 114 ILE n 1 115 ASP n 1 116 LEU n 1 117 GLU n 1 118 GLY n 1 119 ASP n 1 120 ILE n 1 121 PRO n 1 122 ALA n 1 123 ASP n 1 124 ALA n 1 125 ARG n 1 126 ARG n 1 127 ASP n 1 128 PRO n 1 129 ILE n 1 130 HIS n 1 131 ARG n 1 132 PRO n 1 133 ALA n 1 134 PRO n 1 135 LYS n 1 136 PHE n 1 137 GLU n 1 138 GLU n 1 139 LEU n 1 140 ALA n 1 141 THR n 1 142 GLU n 1 143 VAL n 1 144 GLU n 1 145 ILE n 1 146 LEU n 1 147 GLU n 1 148 THR n 1 149 GLY n 1 150 ILE n 1 151 LYS n 1 152 VAL n 1 153 VAL n 1 154 ASP n 1 155 LEU n 1 156 LEU n 1 157 ALA n 1 158 PRO n 1 159 TYR n 1 160 ILE n 1 161 LYS n 1 162 GLY n 1 163 GLY n 1 164 LYS n 1 165 ILE n 1 166 GLY n 1 167 LEU n 1 168 PHE n 1 169 GLY n 1 170 GLY n 1 171 ALA n 1 172 GLY n 1 173 VAL n 1 174 GLY n 1 175 LYS n 1 176 THR n 1 177 VAL n 1 178 LEU n 1 179 ILE n 1 180 GLN n 1 181 GLU n 1 182 LEU n 1 183 ILE n 1 184 HIS n 1 185 ASN n 1 186 ILE n 1 187 ALA n 1 188 GLN n 1 189 GLU n 1 190 HIS n 1 191 GLY n 1 192 GLY n 1 193 ILE n 1 194 SER n 1 195 VAL n 1 196 PHE n 1 197 ALA n 1 198 GLY n 1 199 VAL n 1 200 GLY n 1 201 GLU n 1 202 ARG n 1 203 THR n 1 204 ARG n 1 205 GLU n 1 206 GLY n 1 207 ASN n 1 208 ASP n 1 209 LEU n 1 210 TYR n 1 211 HIS n 1 212 GLU n 1 213 MET n 1 214 LYS n 1 215 ASP n 1 216 SER n 1 217 GLY n 1 218 VAL n 1 219 ILE n 1 220 SER n 1 221 LYS n 1 222 THR n 1 223 ALA n 1 224 MET n 1 225 VAL n 1 226 PHE n 1 227 GLY n 1 228 GLN n 1 229 MET n 1 230 ASN n 1 231 GLU n 1 232 PRO n 1 233 PRO n 1 234 GLY n 1 235 ALA n 1 236 ARG n 1 237 MET n 1 238 ARG n 1 239 VAL n 1 240 ALA n 1 241 LEU n 1 242 THR n 1 243 GLY n 1 244 LEU n 1 245 THR n 1 246 MET n 1 247 ALA n 1 248 GLU n 1 249 TYR n 1 250 PHE n 1 251 ARG n 1 252 ASP n 1 253 GLU n 1 254 GLN n 1 255 GLY n 1 256 GLN n 1 257 ASP 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'Escherichia coli' 562 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 6 1 sample 'Biological sequence' 1 169 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 'Bacillus sp. PS3' 2334 ? ? ? ? ? ? ? ? 'Escherichia coli' 562 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ADP non-polymer n "ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE" ? 'C10 H15 N5 O10 P2' 427.201 ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 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S N N 8 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP A0A0M4U1P9_BACP3 A0A0M4U1P9 ? 1 ;MTRGRVIQVMGPVVDVKFENGHLPAIYNALKIQHKARNENEVDIDLTLEVALHLGDDTVRTIAMASTDGLIRGMEVIDTG APISVPVGEVTLGRVFNVLGEPIDLEGDIPADARRDPIHRPAPKFEELATEVEILETGIKVVDLLAPYIKGGKIGLFGGA GVGKTVLIQELIHNIAQEHGGISVFAGVGERTREGNDLYHEMKDSGVISKTAMVFGQMNEPPGARMRVALTGLTMAEYFR DEQGQDVLLFIDNIFRFTQAGSEVSALLGRMPSAVGYQPTLATEMGQLQERITSTAKGSITSIQAIYVPADDYTDPAPAT TFSHLDATTNLERKLAEMGIYPAVDPLASTSRALAPEIVGEEHYQVARKVQQTLQRYKELQDIIAILGMDELSDEDKLVV HRARRIQFFLSQNFHVAEQFTGQPGSYVPVKETVRGFKEILEGKYDHLPEDAFRLVGRIEEVVEKAKAMGVEV ; 1 2 UNP A0A0M4TPJ7_BACP3 A0A0M4TPJ7 ? 2 ;MASLRDIKTRINATKKTSQITKAMEMVSTSKLNRAEQNAKSFVPYMEKIQEVVANVALGAGGASHPMLVSRPVKKTGYLV ITSDRGLAGAYNSNVLRLVYQTIQKRHASPDEYAIIVIGRVGLSFFRKRNMPVILDITRLPDQPSFADIKEIARKTVGLF ADGTFDELYMYYNHYVSAIQQEVTERKLLPLTDLAENKQRTVYEFEPSQEEILDVLLPQYAESLIYGALLDAKASEHAAR MTAMKNATDNANELIRTLTLSYNRARQAAITQEITEIVAGANALQ ; 1 3 UNP A0A0M5MQR7_BACP3 A0A0M5MQR7 ? 3 ;MKTIHVSVVTPDGPVYEDDVEMVSVKAKSGELGILPGHIPLVAPLEISAARLKKGGKTQYIAVSGGFLEVRPDKVTILAQ AAERAED ; 1 4 PDB 9JC1 9JC1 ? 4 ? 1 5 UNP A0A0M3VGF9_BACP3 A0A0M3VGF9 ? 4 ;SIRAEEISALIKQQIENYESQIQVSDVGTVIQVGDGIARAHGLDNVMSGELVEFANGVMGMALNLEENNVGIVILGPYTG IKEGDEVRRTGRIMEVPVGEALIGRVVNPLGQPVDGLGPVETTETRPIESRAPGVMDRRSVHEPLQTGIKAIDALVPIGR GQRELIIGDRQTGKTSVAIDTIINQKDQNMICIYVAIGQKESTVRTVVETLRKHGALDYTIVVTASASQPAPLLFLAPYA GVAMGEYFMYKGKHVLVVYDDLSKQAAAYRELSLLLRRPPGREAYPGDIFYLHSRLLERAAKLSDAKGGGSLTALPFVET QAGDISAYIPTNVISITDGQIFLQSDLFFSGVRPAINAGLSVSRVGGAAQIKAMKKVAGTLRLDLAAYRELEAFAQFGSD LDKATQAKLARGARTVEVLKQDLHQPIPVEKQVLIIYALTRGFLDDIPVEDVRRFEKEFYLWLDQNGQHLLEHIRTTKDL PNEDDLNKAIEAFKKTFVVSQ ; 2 6 PDB 9JC1 9JC1 ? 5 ? 1 7 PDB 9JC1 9JC1 ? 6 ? 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 9JC1 D 12 ? 484 ? 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A0A0M3VGF9 2 ? 502 ? 80 580 12 6 9JC1 A 1 ? 169 ? 9JC1 -1 ? 619 ? -1 619 13 7 9JC1 B 1 ? 169 ? 9JC1 -1 ? 167 ? -1 167 14 6 9JC1 C 1 ? 169 ? 9JC1 -1 ? 619 ? -1 619 15 7 9JC1 L 1 ? 169 ? 9JC1 -1 ? 167 ? -1 167 16 6 9JC1 M 1 ? 169 ? 9JC1 -1 ? 619 ? -1 619 17 7 9JC1 N 1 ? 169 ? 9JC1 -1 ? 167 ? -1 167 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 1 9JC1 MET D 1 ? UNP A0A0M4U1P9 ? ? 'initiating methionine' -10 1 1 9JC1 HIS D 2 ? UNP A0A0M4U1P9 ? ? 'expression tag' -9 2 1 9JC1 HIS D 3 ? UNP A0A0M4U1P9 ? ? 'expression tag' -8 3 1 9JC1 HIS D 4 ? UNP A0A0M4U1P9 ? ? 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UNP A0A0M4U1P9 ? ? 'expression tag' -1 21 2 9JC1 HIS E 11 ? UNP A0A0M4U1P9 ? ? 'expression tag' 0 22 3 9JC1 MET F 1 ? UNP A0A0M4U1P9 ? ? 'initiating methionine' -10 23 3 9JC1 HIS F 2 ? UNP A0A0M4U1P9 ? ? 'expression tag' -9 24 3 9JC1 HIS F 3 ? UNP A0A0M4U1P9 ? ? 'expression tag' -8 25 3 9JC1 HIS F 4 ? UNP A0A0M4U1P9 ? ? 'expression tag' -7 26 3 9JC1 HIS F 5 ? UNP A0A0M4U1P9 ? ? 'expression tag' -6 27 3 9JC1 HIS F 6 ? UNP A0A0M4U1P9 ? ? 'expression tag' -5 28 3 9JC1 HIS F 7 ? UNP A0A0M4U1P9 ? ? 'expression tag' -4 29 3 9JC1 HIS F 8 ? UNP A0A0M4U1P9 ? ? 'expression tag' -3 30 3 9JC1 HIS F 9 ? UNP A0A0M4U1P9 ? ? 'expression tag' -2 31 3 9JC1 HIS F 10 ? UNP A0A0M4U1P9 ? ? 'expression tag' -1 32 3 9JC1 HIS F 11 ? UNP A0A0M4U1P9 ? ? 'expression tag' 0 33 7 9JC1 PRO I 210 ? UNP A0A0M3VGF9 ARG 132 variant 210 34 7 9JC1 SER I 271 ? UNP A0A0M3VGF9 CYS 193 variant 271 35 7 9JC1 PHE I 541 ? UNP A0A0M3VGF9 TRP 463 variant 541 36 9 9JC1 PRO J 210 ? 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UNP A0A0M3VGF9 TRP 463 variant 541 42 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details tetradecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 14 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'not applicable' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 GLY A 99 ? 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SER I 87 ILE I 94 1 ? 8 HELX_P HELX_P72 AH9 GLY F 178 ? ILE F 182 ? GLY I 178 ILE I 182 5 ? 5 HELX_P HELX_P73 AI1 GLY F 213 ? ARG F 217 ? GLY I 213 ARG I 217 5 ? 5 HELX_P HELX_P74 AI2 ILE F 228 ? VAL F 235 ? ILE I 228 VAL I 235 1 ? 8 HELX_P HELX_P75 AI3 GLY F 252 ? GLN F 264 ? GLY I 252 GLN I 264 1 ? 13 HELX_P HELX_P76 AI4 LYS F 279 ? HIS F 293 ? LYS I 279 HIS I 293 1 ? 15 HELX_P HELX_P77 AI5 PRO F 309 ? TYR F 329 ? PRO I 309 TYR I 329 1 ? 21 HELX_P HELX_P78 AI6 ASP F 340 ? LEU F 355 ? ASP I 340 LEU I 355 1 ? 16 HELX_P HELX_P79 AI7 GLY F 360 ? TYR F 364 ? GLY I 360 TYR I 364 5 ? 5 HELX_P HELX_P80 AI8 ILE F 368 ? GLU F 377 ? ILE I 368 GLU I 377 1 ? 10 HELX_P HELX_P81 AI9 ALA F 406 ? SER F 414 ? ALA I 406 SER I 414 1 ? 9 HELX_P HELX_P82 AJ1 GLN F 423 ? GLY F 430 ? GLN I 423 GLY I 430 1 ? 8 HELX_P HELX_P83 AJ2 VAL F 444 ? GLN F 449 ? VAL I 444 GLN I 449 5 ? 6 HELX_P HELX_P84 AJ3 ILE F 450 ? GLU F 471 ? ILE I 450 GLU I 471 1 ? 22 HELX_P HELX_P85 AJ4 THR F 484 ? LEU F 498 ? 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SER K 87 GLN K 92 1 ? 6 HELX_P HELX_P114 AM6 GLY H 178 ? ILE H 182 ? GLY K 178 ILE K 182 5 ? 5 HELX_P HELX_P115 AM7 ILE H 228 ? VAL H 235 ? ILE K 228 VAL K 235 1 ? 8 HELX_P HELX_P116 AM8 GLY H 252 ? ASN H 263 ? GLY K 252 ASN K 263 1 ? 12 HELX_P HELX_P117 AM9 LYS H 279 ? HIS H 293 ? LYS K 279 HIS K 293 1 ? 15 HELX_P HELX_P118 AN1 PRO H 309 ? TYR H 329 ? PRO K 309 TYR K 329 1 ? 21 HELX_P HELX_P119 AN2 LEU H 341 ? LEU H 355 ? LEU K 341 LEU K 355 1 ? 15 HELX_P HELX_P120 AN3 GLY H 360 ? TYR H 364 ? GLY K 360 TYR K 364 5 ? 5 HELX_P HELX_P121 AN4 ASP H 367 ? GLU H 377 ? ASP K 367 GLU K 377 1 ? 11 HELX_P HELX_P122 AN5 ALA H 406 ? SER H 414 ? ALA K 406 SER K 414 1 ? 9 HELX_P HELX_P123 AN6 ILE H 450 ? ALA H 472 ? ILE K 450 ALA K 472 1 ? 23 HELX_P HELX_P124 AN7 ASP H 481 ? LYS H 499 ? ASP K 481 LYS K 499 1 ? 19 HELX_P HELX_P125 AN8 PRO H 507 ? ARG H 520 ? PRO K 507 ARG K 520 1 ? 14 HELX_P HELX_P126 AN9 PRO H 527 ? GLU H 529 ? PRO K 527 GLU K 529 5 ? 3 HELX_P HELX_P127 AO1 ASP H 530 ? ASN H 545 ? 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THR N 145 VAL N 163 1 ? 19 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role metalc1 metalc ? ? 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TYR 341 D PRO 353 A ? PRO 342 D 1 -0.67 2 TYR 352 B . ? TYR 341 E PRO 353 B ? PRO 342 E 1 0.13 3 TYR 352 C . ? TYR 341 F PRO 353 C ? PRO 342 F 1 2.12 4 ARG 432 F . ? ARG 432 I PRO 433 F ? PRO 433 I 1 -4.60 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 7 ? AA2 ? 2 ? AA3 ? 7 ? AA4 ? 2 ? AA5 ? 14 ? AA6 ? 14 ? AA7 ? 2 ? AA8 ? 7 ? AA9 ? 2 ? AB1 ? 7 ? AB2 ? 2 ? AB3 ? 8 ? AB4 ? 2 ? AB5 ? 5 ? AB6 ? 6 ? AB7 ? 2 ? AB8 ? 2 ? AB9 ? 11 ? AC1 ? 2 ? AC2 ? 8 ? AC3 ? 2 ? AC4 ? 8 ? AC5 ? 11 ? AC6 ? 2 ? AC7 ? 8 ? 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