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M LPE 1 C28 # _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma 90.00 _cell.angle_gamma_esd ? _cell.entry_id 9JXZ _cell.details ? _cell.formula_units_Z ? _cell.length_a 1.00 _cell.length_a_esd ? _cell.length_b 1.00 _cell.length_b_esd ? _cell.length_c 1.00 _cell.length_c_esd ? _cell.volume ? _cell.volume_esd ? _cell.Z_PDB ? _cell.reciprocal_angle_alpha ? _cell.reciprocal_angle_beta ? _cell.reciprocal_angle_gamma ? _cell.reciprocal_angle_alpha_esd ? _cell.reciprocal_angle_beta_esd ? _cell.reciprocal_angle_gamma_esd ? _cell.reciprocal_length_a ? _cell.reciprocal_length_b ? _cell.reciprocal_length_c ? _cell.reciprocal_length_a_esd ? _cell.reciprocal_length_b_esd ? _cell.reciprocal_length_c_esd ? _cell.pdbx_unique_axis ? _cell.pdbx_esd_method ? # _symmetry.entry_id 9JXZ _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' _symmetry.pdbx_full_space_group_name_H-M ? # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 9JXZ _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _refine.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine.entry_id 9JXZ _refine.pdbx_diffrn_id ? _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.ls_number_reflns_obs ? _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.ls_d_res_low ? _refine.ls_d_res_high . _refine.ls_percent_reflns_obs ? _refine.ls_R_factor_obs ? _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_R_work ? _refine.ls_R_factor_R_free ? _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_percent_reflns_R_free ? _refine.ls_number_reflns_R_free ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.occupancy_min ? _refine.occupancy_max ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.B_iso_mean ? _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method ? _refine.details ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.003 ? 4939 ? f_bond_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.546 ? 6694 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 6.653 ? 732 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.039 ? 786 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.004 ? 810 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 9JXZ _struct.title 'V gamma9 V delta2 TCR and CD3 complex' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 9JXZ _struct_keywords.text 'T cell receptor, gamma delta TCR, immune cell, IMMUNE SYSTEM' _struct_keywords.pdbx_keywords 'IMMUNE SYSTEM' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 2 ? D N N 3 ? E N N 3 ? F N N 4 ? G N N 5 ? H N N 6 ? I N N 7 ? J N N 8 ? K N N 8 ? L N N 7 ? M N N 8 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP CD3Z_HUMAN P20963 ? 1 ;MKWKALFTAAILQAQLPITEAQSFGLLDPKLCYLLDGILFIYGVILTALFLRVKFSRSADAPAYQQGQNQLYNELNLGRR EEYDVLDKRRGRDPEMGGKPQRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQA LPPR ; 1 2 UNP CD3D_HUMAN P04234 ? 2 ;MEHSTFLSGLVLATLLSQVSPFKIPIEELEDRVFVNCNTSITWVEGTVGTLLSDITRLDLGKRILDPRGIYRCNGTDIYK DKESTVQVHYRMCQSCVELDPATVAGIIVTDVIATLLLALGVFCFAGHETGRLSGAADTQALLRNDQVYQPLRDRDDAQY SHLGGNWARNK ; 1 3 UNP CD3E_HUMAN P07766 ? 3 ;MQSGTHWRVLGLCLLSVGVWGQDGNEEMGGITQTPYKVSISGTTVILTCPQYPGSEILWQHNDKNIGGDEDDKNIGSDED HLSLKEFSELEQSGYYVCYPRGSKPEDANFYLYLRARVCENCMEMDVMSVATIVIVDICITGGLLLLVYYWSKNRKAKAK PVTRGAGAGGRQRGQNKERPPPVPNPDYEPIRKGQRDLYSGLNQRRI ; 1 4 UNP CD3G_HUMAN P09693 ? 4 ;MEQGKGLAVLILAIILLQGTLAQSIKGNHLVKVYDYQEDGSVLLTCDAEAKNITWFKDGKMIGFLTEDKKKWNLGSNAKD PRGMYQCKGSQNKSKPLQVYYRMCQNCIELNAATISGFLFAEIVSIFVLAVGVYFIAGQDGVRQSRASDKQTLLPNDQLY QPLKDREDDQYSHLQGNQLRRN ; 1 5 UNP TRDV2_HUMAN A0JD36 ? 5 ;MQRISSLIHLSLFWAGVMSAIELVPEHQTVPVSIGVPATLRCSMKGEAIGNYYINWYRKTQGNTMTFIYREKDIYGPGFK DNFQGDIDIAKNLAVLKILAPSERDEGSYYCACDT ; 1 6 UNP TRDC_HUMAN B7Z8K6 ? 5 ;SQPHTKPSVFVMKNGTNVACLVKEFYPKDIRINLVSSKKITEFDPAIVISPSGKYNAVKLGKYEDSNSVTCSVQHDNKTV HSTDFEVKTDSTDHVKPKETENTKQPSKSCHKPKAIVHTEKVNMMSLTVLGLRMLFAKTVAVNFLLTAKLFFL ; 1 7 UNP TRGV9_HUMAN Q99603 ? 6 ;MLSLLHTSTLAVLGALCVYGAGHLEQPQISSTKTLSKTARLECVVSGITISATSVYWYRERPGEVIQFLVSISYDGTVRK ESGIPSGKFEVDRIPETSTSTLTIHNVEKQDIATYYCALWE ; 1 8 UNP TRGC1_HUMAN P0CF51 ? 6 ;DKQLDADVSPKPTIFLPSIAETKLQKAGTYLCLLEKFFPDVIKIHWQEKKSNTILGSQEGNTMKTNDTYMKFSWLTVPEK SLDKEHRCIVRHENNKNGVDQEIIFPPIKTDVITMDPKDNCSKDANDTLLLQLTNTSAYYMYLLLLLKSVVYFAIITCCL LRRTAFCCNGEKS ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 9JXZ a 1 ? 164 ? P20963 1 ? 164 ? 1 164 2 1 9JXZ b 1 ? 164 ? P20963 1 ? 164 ? 1 164 3 2 9JXZ d 1 ? 171 ? P04234 1 ? 171 ? 1 171 4 3 9JXZ e 1 ? 207 ? P07766 1 ? 207 ? 1 207 5 3 9JXZ f 1 ? 207 ? P07766 1 ? 207 ? 1 207 6 4 9JXZ g 1 ? 182 ? P09693 1 ? 182 ? 1 182 7 5 9JXZ m 1 ? 115 ? A0JD36 1 ? 115 ? -1 113 8 6 9JXZ m 140 ? 292 ? B7Z8K6 1 ? 153 ? 138 290 9 7 9JXZ n 1 ? 121 ? Q99603 1 ? 121 ? -17 103 10 8 9JXZ n 143 ? 315 ? P0CF51 1 ? 173 ? 125 297 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 1 9JXZ SER a 165 ? UNP P20963 ? ? 'expression tag' 165 1 1 9JXZ ALA a 166 ? UNP P20963 ? ? 'expression tag' 166 2 2 9JXZ SER b 165 ? UNP P20963 ? ? 'expression tag' 165 3 2 9JXZ ALA b 166 ? UNP P20963 ? ? 'expression tag' 166 4 7 9JXZ LEU m 116 ? UNP A0JD36 ? ? linker 114 5 7 9JXZ GLY m 117 ? UNP A0JD36 ? ? linker 115 6 7 9JXZ MET m 118 ? UNP A0JD36 ? ? linker 116 7 7 9JXZ GLY m 119 ? UNP A0JD36 ? ? linker 117 8 7 9JXZ GLY m 120 ? UNP A0JD36 ? ? linker 118 9 7 9JXZ GLU m 121 ? UNP A0JD36 ? ? linker 119 10 7 9JXZ TYR m 122 ? UNP A0JD36 ? ? linker 120 11 7 9JXZ THR m 123 ? UNP A0JD36 ? ? linker 121 12 7 9JXZ ASP m 124 ? UNP A0JD36 ? ? linker 122 13 7 9JXZ LYS m 125 ? UNP A0JD36 ? ? linker 123 14 7 9JXZ LEU m 126 ? UNP A0JD36 ? ? linker 124 15 7 9JXZ ILE m 127 ? UNP A0JD36 ? ? linker 125 16 7 9JXZ PHE m 128 ? UNP A0JD36 ? ? linker 126 17 7 9JXZ GLY m 129 ? UNP A0JD36 ? ? linker 127 18 7 9JXZ LYS m 130 ? UNP A0JD36 ? ? linker 128 19 7 9JXZ GLY m 131 ? UNP A0JD36 ? ? linker 129 20 7 9JXZ THR m 132 ? UNP A0JD36 ? ? linker 130 21 7 9JXZ ARG m 133 ? UNP A0JD36 ? ? linker 131 22 7 9JXZ VAL m 134 ? UNP A0JD36 ? ? linker 132 23 7 9JXZ THR m 135 ? UNP A0JD36 ? ? linker 133 24 7 9JXZ VAL m 136 ? UNP A0JD36 ? ? linker 134 25 7 9JXZ GLU m 137 ? UNP A0JD36 ? ? linker 135 26 7 9JXZ PRO m 138 ? UNP A0JD36 ? ? linker 136 27 7 9JXZ ARG m 139 ? UNP A0JD36 ? ? linker 137 28 9 9JXZ ALA n 122 ? UNP Q99603 ? ? linker 104 29 9 9JXZ GLN n 123 ? UNP Q99603 ? ? linker 105 30 9 9JXZ GLN n 124 ? UNP Q99603 ? ? linker 106 31 9 9JXZ GLU n 125 ? UNP Q99603 ? ? linker 107 32 9 9JXZ LEU n 126 ? UNP Q99603 ? ? linker 108 33 9 9JXZ GLY n 127 ? UNP Q99603 ? ? linker 109 34 9 9JXZ LYS n 128 ? UNP Q99603 ? ? linker 110 35 9 9JXZ LYS n 129 ? UNP Q99603 ? ? linker 111 36 9 9JXZ ILE n 130 ? UNP Q99603 ? ? linker 112 37 9 9JXZ LYS n 131 ? UNP Q99603 ? ? linker 113 38 9 9JXZ VAL n 132 ? UNP Q99603 ? ? linker 114 39 9 9JXZ PHE n 133 ? UNP Q99603 ? ? linker 115 40 9 9JXZ GLY n 134 ? UNP Q99603 ? ? linker 116 41 9 9JXZ PRO n 135 ? UNP Q99603 ? ? linker 117 42 9 9JXZ GLY n 136 ? UNP Q99603 ? ? linker 118 43 9 9JXZ THR n 137 ? UNP Q99603 ? ? linker 119 44 9 9JXZ LYS n 138 ? UNP Q99603 ? ? linker 120 45 9 9JXZ LEU n 139 ? UNP Q99603 ? ? linker 121 46 9 9JXZ ILE n 140 ? UNP Q99603 ? ? linker 122 47 9 9JXZ ILE n 141 ? UNP Q99603 ? ? linker 123 48 9 9JXZ THR n 142 ? UNP Q99603 ? ? linker 124 49 10 9JXZ GLU n 189 ? UNP P0CF51 GLN 47 conflict 171 50 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details octameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 8 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'not applicable' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 LYS A 30 ? 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THR n 252 THR n 288 1 ? 37 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? 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