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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.465 ? 10075 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 3.289 ? 1022 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.039 ? 1207 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.003 ? 1265 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 9L3W _struct.title 'Cryo-EM structure of the chemokine-like receptor 1 in complex with chemerin and Gi1' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 9L3W _struct_keywords.text 'GPCR, CMKLR1, MEMBRANE PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'MEMBRANE PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP GNAI1_HUMAN P63096 ? 1 ;MGCTLSAEDKAAVERSKMIDRNLREDGEKAAREVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHEAGYSEEECKQYKAVVYSNTIQS IIAIIRAMGRLKIDFGDSARADDARQLFVLAGAAEEGFMTAELAGVIKRLWKDSGVQACFNRSREYQLNDSAAYYLNDLD RIAQPNYIPTQQDVLRTRVKTTGIVETHFTFKDLHFKMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSDYDLVLAEDEEM NRMHESMKLFDSICNNKWFTDTSIILFLNKKDLFEEKIKKSPLTICYPEYAGSNTYEEAAAYIQCQFEDLNKRKDTKEIY THFTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLKDCGLF ; 1 2 UNP GBB1_HUMAN P62873 ? 2 ;MSELDQLRQEAEQLKNQIRDARKACADATLSQITNNIDPVGRIQMRTRRTLRGHLAKIYAMHWGTDSRLLVSASQDGKLI IWDSYTTNKVHAIPLRSSWVMTCAYAPSGNYVACGGLDNICSIYNLKTREGNVRVSRELAGHTGYLSCCRFLDDNQIVTS SGDTTCALWDIETGQQTTTFTGHTGDVMSLSLAPDTRLFVSGACDASAKLWDVREGMCRQTFTGHESDINAICFFPNGNA FATGSDDATCRLFDLRADQELMTYSHDNIICGITSVSFSKSGRLLLAGYDDFNCNVWDALKADRAGVLAGHDNRVSCLGV TDDGMAVATGSWDSFLKIWN ; 1 3 UNP GBG2_HUMAN P59768 ? 3 MASNNTASIAQARKLVEQLKMEANIDRIKVSKAAADLMAYCEAHAKEDPLLTPVPASENPFREKKFFCAIL 1 4 UNP RARR2_HUMAN Q99969 ? 4 ;ELTEAQRRGLQVALEEFHKHPPVQWAFQETSVESAVDTPFPAGIFVRLEFKLQQTSCRKRDWKKPECKVRPNGRKRKCLA CIKLGSEDKVLGRLVHCPIETQVLREAEEHQETQCLRVQRAGEDPHSFYFPGQFAFS ; 21 5 UNP CML1_HUMAN Q99788 ? 5 ;MRMEDEDYNTSISYGDEYPDYLDSIVVLEDLSPLEARVTRIFLVVVYSIVCFLGILGNGLVIIIATFKMKKTVNMVWFLN LAVADFLFNVFLPIHITYAAMDYHWVFGTAMCKISNFLLIHNMFTSVFLLTIISSDRCISVLLPVWSQNHRSVRLAYMAC MVIWVLAFFLSSPSLVFRDTANLHGKISCFNNFSLSTPGSSSWPTHSQMDPVGYSRHMVVTVTRFLCGFLVPVLIITACY LTIVCKLQRNRLAKTKKPFKIIVTIIITFFLCWCPYHTLNLLELHHTAMPGSVFSLGLPLATALAIANSCMNPILYVFMG QDFKKFKVALFSRLVNALSEDTGHSSYPSHRSFTKMSSMNERTSMNERETGML ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 9L3W A 1 ? 354 ? 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UNP P63096 ALA 326 'engineered mutation' 326 5 5 9L3W GLU R 374 ? UNP Q99788 ? ? 'expression tag' 374 6 5 9L3W PHE R 375 ? UNP Q99788 ? ? 'expression tag' 375 7 5 9L3W LEU R 376 ? UNP Q99788 ? ? 'expression tag' 376 8 5 9L3W GLU R 377 ? UNP Q99788 ? ? 'expression tag' 377 9 5 9L3W VAL R 378 ? UNP Q99788 ? ? 'expression tag' 378 10 5 9L3W LEU R 379 ? UNP Q99788 ? ? 'expression tag' 379 11 5 9L3W PHE R 380 ? UNP Q99788 ? ? 'expression tag' 380 12 5 9L3W GLN R 381 ? UNP Q99788 ? ? 'expression tag' 381 13 5 9L3W GLY R 382 ? UNP Q99788 ? ? 'expression tag' 382 14 5 9L3W PRO R 383 ? UNP Q99788 ? ? 'expression tag' 383 15 5 9L3W TRP R 384 ? UNP Q99788 ? ? 'expression tag' 384 16 5 9L3W SER R 385 ? UNP Q99788 ? ? 'expression tag' 385 17 5 9L3W HIS R 386 ? UNP Q99788 ? ? 'expression tag' 386 18 5 9L3W PRO R 387 ? UNP Q99788 ? ? 'expression tag' 387 19 5 9L3W GLN R 388 ? UNP Q99788 ? ? 'expression tag' 388 20 5 9L3W PHE R 389 ? UNP Q99788 ? ? 'expression tag' 389 21 5 9L3W GLU R 390 ? 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UNP Q99788 ? ? 'expression tag' 407 39 5 9L3W GLN R 408 ? UNP Q99788 ? ? 'expression tag' 408 40 5 9L3W PHE R 409 ? UNP Q99788 ? ? 'expression tag' 409 41 5 9L3W GLU R 410 ? UNP Q99788 ? ? 'expression tag' 410 42 5 9L3W LYS R 411 ? UNP Q99788 ? ? 'expression tag' 411 43 5 9L3W ASP R 412 ? UNP Q99788 ? ? 'expression tag' 412 44 5 9L3W TYR R 413 ? UNP Q99788 ? ? 'expression tag' 413 45 5 9L3W LYS R 414 ? UNP Q99788 ? ? 'expression tag' 414 46 5 9L3W ASP R 415 ? UNP Q99788 ? ? 'expression tag' 415 47 5 9L3W ASP R 416 ? UNP Q99788 ? ? 'expression tag' 416 48 5 9L3W ASP R 417 ? UNP Q99788 ? ? 'expression tag' 417 49 5 9L3W ASP R 418 ? UNP Q99788 ? ? 'expression tag' 418 50 5 9L3W LYS R 419 ? UNP Q99788 ? ? 'expression tag' 419 51 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details pentameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 5 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'not applicable' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 GLU A 8 ? ALA A 31 ? GLU A 8 ALA A 31 1 ? 24 HELX_P HELX_P2 AA2 GLU A 207 ? GLU A 216 ? GLU A 207 GLU A 216 5 ? 10 HELX_P HELX_P3 AA3 SER A 228 ? TYR A 230 ? SER A 228 TYR A 230 5 ? 3 HELX_P HELX_P4 AA4 ARG A 242 ? ASN A 255 ? ARG A 242 ASN A 255 1 ? 14 HELX_P HELX_P5 AA5 ASN A 256 ? THR A 260 ? ASN A 256 THR A 260 5 ? 5 HELX_P HELX_P6 AA6 LYS A 270 ? ILE A 278 ? LYS A 270 ILE A 278 1 ? 9 HELX_P HELX_P7 AA7 TYR A 296 ? LEU A 310 ? TYR A 296 LEU A 310 1 ? 15 HELX_P HELX_P8 AA8 LYS A 330 ? CYS A 351 ? LYS A 330 CYS A 351 1 ? 22 HELX_P HELX_P9 AA9 LEU B 7 ? ALA B 26 ? LEU B 7 ALA B 26 1 ? 20 HELX_P HELX_P10 AB1 THR B 29 ? THR B 34 ? THR B 29 THR B 34 1 ? 6 HELX_P HELX_P11 AB2 ALA C 10 ? ALA C 23 ? ALA C 10 ALA C 23 1 ? 14 HELX_P HELX_P12 AB3 LYS C 29 ? HIS C 44 ? LYS C 29 HIS C 44 1 ? 16 HELX_P HELX_P13 AB4 ALA C 45 ? ASP C 48 ? ALA C 45 ASP C 48 5 ? 4 HELX_P HELX_P14 AB5 THR D 3 ? GLU D 15 ? THR L 23 GLU L 35 1 ? 13 HELX_P HELX_P15 AB6 ARG D 60 ? LYS D 64 ? 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GLY R 320 LEU R 330 1 ? 11 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? A CYS 47 SG ? ? ? 1_555 A CYS 224 SG ? ? A CYS 47 A CYS 224 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf2 disulf ? ? D CYS 57 SG ? ? ? 1_555 D CYS 67 SG ? ? L CYS 77 L CYS 87 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf3 disulf ? ? D CYS 78 SG ? ? ? 1_555 D CYS 97 SG ? ? L CYS 98 L CYS 117 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf4 disulf ? ? D CYS 81 SG ? ? ? 1_555 D CYS 115 SG ? ? L CYS 101 L CYS 135 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf5 disulf ? ? E CYS 112 SG ? ? ? 1_555 E CYS 189 SG ? ? R CYS 112 R CYS 189 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? ? # _struct_conn_type.id disulf _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _pdbx_modification_feature.ordinal _pdbx_modification_feature.label_comp_id _pdbx_modification_feature.label_asym_id _pdbx_modification_feature.label_seq_id _pdbx_modification_feature.label_alt_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_alt_id _pdbx_modification_feature.auth_comp_id _pdbx_modification_feature.auth_asym_id _pdbx_modification_feature.auth_seq_id _pdbx_modification_feature.PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.symmetry _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.modified_residue_symmetry _pdbx_modification_feature.comp_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id _pdbx_modification_feature.ref_pcm_id _pdbx_modification_feature.ref_comp_id _pdbx_modification_feature.type _pdbx_modification_feature.category 1 CYS A 47 ? CYS A 224 ? CYS A 47 ? 1_555 CYS A 224 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 2 CYS D 57 ? CYS D 67 ? CYS L 77 ? 1_555 CYS L 87 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 3 CYS D 78 ? CYS D 97 ? CYS L 98 ? 1_555 CYS L 117 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 4 CYS D 81 ? CYS D 115 ? CYS L 101 ? 1_555 CYS L 135 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 5 CYS E 112 ? CYS E 189 ? CYS R 112 ? 1_555 CYS R 189 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 6 ? AA2 ? 4 ? AA3 ? 4 ? AA4 ? 4 ? AA5 ? 4 ? AA6 ? 4 ? AA7 ? 4 ? AA8 ? 4 ? AA9 ? 2 ? 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THR B 165 ASP B 170 AA5 4 GLN B 176 ? PHE B 180 ? GLN B 176 PHE B 180 AA6 1 VAL B 187 ? LEU B 192 ? VAL B 187 LEU B 192 AA6 2 LEU B 198 ? ALA B 203 ? LEU B 198 ALA B 203 AA6 3 ALA B 208 ? ASP B 212 ? ALA B 208 ASP B 212 AA6 4 CYS B 218 ? PHE B 222 ? CYS B 218 PHE B 222 AA7 1 ILE B 229 ? PHE B 234 ? ILE B 229 PHE B 234 AA7 2 ALA B 240 ? SER B 245 ? ALA B 240 SER B 245 AA7 3 CYS B 250 ? ASP B 254 ? CYS B 250 ASP B 254 AA7 4 GLN B 259 ? TYR B 264 ? GLN B 259 TYR B 264 AA8 1 ILE B 273 ? PHE B 278 ? ILE B 273 PHE B 278 AA8 2 LEU B 284 ? TYR B 289 ? LEU B 284 TYR B 289 AA8 3 CYS B 294 ? ASP B 298 ? CYS B 294 ASP B 298 AA8 4 ARG B 304 ? LEU B 308 ? ARG B 304 LEU B 308 AA9 1 TRP D 25 ? GLN D 28 ? TRP L 45 GLN L 48 AA9 2 GLN D 53 ? ARG D 58 ? GLN L 73 ARG L 78 AB1 1 ASP E 179 ? ALA E 181 ? ASP R 179 ALA R 181 AB1 2 SER E 188 ? PHE E 190 ? 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N PHE A 189 O PHE A 196 ? O PHE A 196 AA1 2 3 O PHE A 199 ? O PHE A 199 N LEU A 38 ? N LEU A 38 AA1 3 4 N LEU A 39 ? N LEU A 39 O ILE A 222 ? O ILE A 222 AA1 4 5 N VAL A 225 ? N VAL A 225 O PHE A 267 ? O PHE A 267 AA1 5 6 N LEU A 266 ? N LEU A 266 O TYR A 320 ? O TYR A 320 AA2 1 2 N ARG B 49 ? N ARG B 49 O ILE B 338 ? O ILE B 338 AA2 2 3 O LYS B 337 ? O LYS B 337 N THR B 329 ? N THR B 329 AA2 3 4 O GLY B 330 ? O GLY B 330 N CYS B 317 ? N CYS B 317 AA3 1 2 N TYR B 59 ? N TYR B 59 O ALA B 73 ? O ALA B 73 AA3 2 3 N LEU B 70 ? N LEU B 70 O TRP B 82 ? O TRP B 82 AA3 3 4 N ASP B 83 ? N ASP B 83 O ASN B 88 ? O ASN B 88 AA4 1 2 N ALA B 104 ? N ALA B 104 O ALA B 113 ? O ALA B 113 AA4 2 3 N CYS B 114 ? N CYS B 114 O SER B 122 ? O SER B 122 AA4 3 4 N ILE B 123 ? N ILE B 123 O ARG B 137 ? O ARG B 137 AA5 1 2 N ARG B 150 ? N ARG B 150 O VAL B 158 ? O VAL B 158 AA5 2 3 N THR B 159 ? N THR B 159 O ALA B 167 ? O ALA B 167 AA5 3 4 N CYS B 166 ? N CYS B 166 O PHE B 180 ? O PHE B 180 AA6 1 2 N MET B 188 ? N MET B 188 O GLY B 202 ? O GLY B 202 AA6 2 3 N PHE B 199 ? N PHE B 199 O TRP B 211 ? O TRP B 211 AA6 3 4 N LEU B 210 ? N LEU B 210 O GLN B 220 ? O GLN B 220 AA7 1 2 N CYS B 233 ? N CYS B 233 O ALA B 242 ? O ALA B 242 AA7 2 3 N PHE B 241 ? N PHE B 241 O PHE B 253 ? O PHE B 253 AA7 3 4 N CYS B 250 ? N CYS B 250 O TYR B 264 ? O TYR B 264 AA8 1 2 N SER B 275 ? N SER B 275 O GLY B 288 ? O GLY B 288 AA8 2 3 N ALA B 287 ? N ALA B 287 O ASN B 295 ? O ASN B 295 AA8 3 4 N VAL B 296 ? N VAL B 296 O GLY B 306 ? O GLY B 306 AA9 1 2 N ALA D 26 ? N ALA L 46 O THR D 55 ? O THR L 75 AB1 1 2 N ALA E 181 ? N ALA R 181 O SER E 188 ? 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