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E GLU 346 OE2 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 9L8L _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 9L8L _struct.title 'Structure of GPCR megacomplex bound to agonists' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 9L8L _struct_keywords.text 'GPCR, membrane protein' _struct_keywords.pdbx_keywords 'MEMBRANE PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? F N N 6 ? 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P04896 1 ? 394 ? 1 394 2 2 9L8L B 13 ? 351 ? P54311 2 ? 340 ? 2 340 3 3 9L8L C 1 ? 392 ? P49407 2 ? 393 ? 2 393 4 4 9L8L G 1 ? 68 ? P63212 1 ? 68 ? 1 68 5 5 9L8L R 9 ? 421 ? P07550 1 ? 413 ? 1 413 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 2 9L8L MET B 1 ? UNP P54311 ? ? 'initiating methionine' -10 1 2 9L8L HIS B 2 ? UNP P54311 ? ? 'expression tag' -9 2 2 9L8L HIS B 3 ? UNP P54311 ? ? 'expression tag' -8 3 2 9L8L HIS B 4 ? UNP P54311 ? ? 'expression tag' -7 4 2 9L8L HIS B 5 ? UNP P54311 ? ? 'expression tag' -6 5 2 9L8L HIS B 6 ? UNP P54311 ? ? 'expression tag' -5 6 2 9L8L HIS B 7 ? UNP P54311 ? ? 'expression tag' -4 7 2 9L8L GLY B 8 ? UNP P54311 ? ? 'expression tag' -3 8 2 9L8L SER B 9 ? UNP P54311 ? ? 'expression tag' -2 9 2 9L8L LEU B 10 ? UNP P54311 ? ? 'expression tag' -1 10 2 9L8L LEU B 11 ? UNP P54311 ? ? 'expression tag' 0 11 2 9L8L GLN B 12 ? UNP P54311 ? ? 'expression tag' 1 12 5 9L8L ASP R 1 ? UNP P07550 ? ? 'expression tag' -7 13 5 9L8L TYR R 2 ? UNP P07550 ? ? 'expression tag' -6 14 5 9L8L LYS R 3 ? UNP P07550 ? ? 'expression tag' -5 15 5 9L8L ASP R 4 ? UNP P07550 ? ? 'expression tag' -4 16 5 9L8L ASP R 5 ? UNP P07550 ? ? 'expression tag' -3 17 5 9L8L ASP R 6 ? UNP P07550 ? ? 'expression tag' -2 18 5 9L8L ASP R 7 ? UNP P07550 ? ? 'expression tag' -1 19 5 9L8L ALA R 8 ? UNP P07550 ? ? 'expression tag' 0 20 5 9L8L ARG R 24 ? UNP P07550 GLY 16 variant 16 21 5 9L8L GLN R 35 ? UNP P07550 GLU 27 variant 27 22 5 9L8L ARG R 281 ? UNP P07550 LYS 273 'engineered mutation' 273 23 5 9L8L SER R 284 ? UNP P07550 GLY 276 'engineered mutation' 276 24 5 9L8L VAL R 285 ? UNP P07550 ILE 277 'engineered mutation' 277 25 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details pentameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 5 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'not applicable' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 ASP A 11 ? ALA A 39 ? ASP A 11 ALA A 39 1 ? 29 HELX_P HELX_P2 AA2 ARG A 231 ? GLN A 236 ? ARG A 231 GLN A 236 1 ? 6 HELX_P HELX_P3 AA3 ASN A 264 ? ASN A 279 ? ASN A 264 ASN A 279 1 ? 16 HELX_P HELX_P4 AA4 ARG A 280 ? ARG A 283 ? ARG A 280 ARG A 283 5 ? 4 HELX_P HELX_P5 AA5 LYS A 293 ? GLY A 304 ? LYS A 293 GLY A 304 1 ? 12 HELX_P HELX_P6 AA6 ASP A 331 ? SER A 352 ? ASP A 331 SER A 352 1 ? 22 HELX_P HELX_P7 AA7 GLU A 370 ? TYR A 391 ? GLU A 370 TYR A 391 1 ? 22 HELX_P HELX_P8 AA8 SER B 13 ? CYS B 36 ? SER B 2 CYS B 25 1 ? 24 HELX_P HELX_P9 AA9 THR C 97 ? GLY C 108 ? THR C 98 GLY C 109 1 ? 12 HELX_P HELX_P10 AB1 LEU C 305 ? ALA C 309 ? LEU C 306 ALA C 310 5 ? 5 HELX_P HELX_P11 AB2 GLN D 11 ? GLU D 22 ? GLN G 11 GLU G 22 1 ? 12 HELX_P HELX_P12 AB3 ALA D 23 ? ILE D 25 ? ALA G 23 ILE G 25 5 ? 3 HELX_P HELX_P13 AB4 LYS D 29 ? HIS D 44 ? LYS G 29 HIS G 44 1 ? 16 HELX_P HELX_P14 AB5 VAL E 39 ? PHE E 69 ? VAL R 31 PHE R 61 1 ? 31 HELX_P HELX_P15 AB6 GLU E 70 ? GLN E 73 ? GLU R 62 GLN R 65 5 ? 4 HELX_P HELX_P16 AB7 THR E 74 ? VAL E 94 ? THR R 66 VAL R 86 1 ? 21 HELX_P HELX_P17 AB8 VAL E 94 ? MET E 104 ? VAL R 86 MET R 96 1 ? 11 HELX_P HELX_P18 AB9 GLY E 110 ? SER E 145 ? GLY R 102 SER R 137 1 ? 36 HELX_P HELX_P19 AC1 SER E 145 ? LEU E 153 ? SER R 137 LEU R 145 1 ? 9 HELX_P HELX_P20 AC2 THR E 154 ? HIS E 180 ? THR R 146 HIS R 172 1 ? 27 HELX_P HELX_P21 AC3 ALA E 189 ? ASN E 195 ? ALA R 181 ASN R 187 1 ? 7 HELX_P HELX_P22 AC4 ASN E 204 ? PHE E 216 ? ASN R 196 PHE R 208 1 ? 13 HELX_P HELX_P23 AC5 PHE E 216 ? GLY E 246 ? PHE R 208 GLY R 238 1 ? 31 HELX_P HELX_P24 AC6 ALA E 279 ? GLN E 307 ? ALA R 271 GLN R 299 1 ? 29 HELX_P HELX_P25 AC7 ARG E 312 ? VAL E 325 ? ARG R 304 VAL R 317 1 ? 14 HELX_P HELX_P26 AC8 VAL E 325 ? CYS E 335 ? VAL R 317 CYS R 327 1 ? 11 HELX_P HELX_P27 AC9 SER E 337 ? LEU E 347 ? SER R 329 LEU R 339 1 ? 11 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? E CYS 114 SG ? ? ? 1_555 E CYS 199 SG ? ? R CYS 106 R CYS 191 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf2 disulf ? ? E CYS 192 SG ? ? ? 1_555 E CYS 198 SG ? ? R CYS 184 R CYS 190 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? ? # _struct_conn_type.id disulf _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _pdbx_modification_feature.ordinal _pdbx_modification_feature.label_comp_id _pdbx_modification_feature.label_asym_id _pdbx_modification_feature.label_seq_id _pdbx_modification_feature.label_alt_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_alt_id _pdbx_modification_feature.auth_comp_id _pdbx_modification_feature.auth_asym_id _pdbx_modification_feature.auth_seq_id _pdbx_modification_feature.PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.symmetry _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.modified_residue_symmetry _pdbx_modification_feature.comp_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id _pdbx_modification_feature.ref_pcm_id _pdbx_modification_feature.ref_comp_id _pdbx_modification_feature.type _pdbx_modification_feature.category 1 CYS E 114 ? CYS E 199 ? CYS R 106 ? 1_555 CYS R 191 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 2 CYS E 192 ? CYS E 198 ? CYS R 184 ? 1_555 CYS R 190 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 6 ? AA2 ? 4 ? AA3 ? 4 ? AA4 ? 4 ? AA5 ? 4 ? AA6 ? 4 ? AA7 ? 4 ? AA8 ? 4 ? AA9 ? 4 ? AB1 ? 2 ? AB2 ? 4 ? AB3 ? 2 ? AB4 ? 3 ? AB5 ? 5 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? parallel AA1 3 4 ? parallel AA1 4 5 ? parallel AA1 5 6 ? parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA2 3 4 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA3 3 4 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA4 3 4 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA5 3 4 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA6 3 4 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA7 3 4 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA8 3 4 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AA9 2 3 ? anti-parallel AA9 3 4 ? anti-parallel AB1 1 2 ? parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB2 2 3 ? anti-parallel AB2 3 4 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB4 2 3 ? anti-parallel AB5 1 2 ? parallel AB5 2 3 ? anti-parallel AB5 3 4 ? anti-parallel AB5 4 5 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 PHE A 212 ? 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