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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.723 ? 13877 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 5.242 ? 1393 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.048 ? 1505 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.006 ? 1822 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 9L9P _struct.title 'Cryo-EM structure of bacteriophage T1 tail tip complex' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 9L9P _struct_keywords.text 'tail tip complex, VIRAL PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'VIRAL PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? F N N 6 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP A0A3S9W0W9_BPT1 A0A3S9W0W9 ? 1 ;MIQKVISGSKGGSQKPHNPVEMEDNLISINKIKILLAVSDGEIDETFSLKQLMFNSVPVQNEDGSFNFEGVKAEFRPGTQ TQEYIKGMEDSSSEVTVNREVTTDNPYTISVTNKTLSAIRIKMFMPRGVRIESNGDKNGVRVEYEVQQAVDGGSFETVLT DVIEGKTMSGYDRSRRVNLPNFNNQVIFRVVRKTPDSNDSNVVDAIQVKSYAEVIDAKFRYPLTGLLFVEFDSKMFPNQL PTISIRKRWKIVNVPSNYDPESRTYNGNWDGTFKKAWTNNPAWVLYDLMINQRYGLDQKELGIAVDKWALYEAAQYCDQM VPDGKGGTEPRYLCDVIIQSQTDAYKVIRDICSIFRGMSFWNGESISVIIDRPREPAYIFTNDNVVNGDFSYTFASEKSM YTTCNVMFDDEQNMYQQDVEPVFDREATLRFGNNVTSITAIGCTRRSEANRRGRWILKTNLRSTTVNFATGLEGMIPTIG DVVAIADNFWSSNLTMNLSGRLLEVSGSQIFLPFRVDARAGDFIIVNKPDGKPVKRTISSVSADGKTIEVNIGFGFPVKP NTVFAIDRTDIALQQYVVTKIDKGDDDEEFTYKITAVEYDPNKYDEIDYGVNIDDRPTSIVEPDQIPRPKNVQVSSESRI VQGMSVETMIVSWDKVPYAVFYDVQWRKDNGNWQNVPQTANKEVYVEGIYAGNYQVRVRSVAGSGTTSGWSNIVAATLTG KQGEPGRPINLTATDDVVFGIRTKWGFSDGSGDTAYTELQQSPDGTVDNASLLSLIPYPQHEYYHSPMPGGNIVWYRVRT VDRIGNVSQWTDFVRGMASTNVDDIIGEISVDIENSPGYEWLVDNATDNAAQNSANAEAAIENALANDKDAIYMKKENGK RKAEYTKSLKLIADETQARVTAIEQLKASFGDQISASNSELREVIATETEALSREIDQLKAQIGDDIQASLTDIREVIAT ETEALSREIDQLKAQIGDDIQASLTDIREAIANETEARTQADLTLSARLGNNEAALAQKLDSWSNADSTGAMYGVKLGLK YNGQEYSAGMAMSLVGSGAAVKAQILFEASRFAIMTGMNGQTQYPFVVENGQVILSSAIIKNGFITNAMIGNFIQSNNYV FNQSGWRLDKGGTFENYGSDGEGAMKQTNTTISVRDASGRLRVQIGRLTGSW ; 1 2 UNP Q6XQC0_BPT1 Q6XQC0 ? 2 ;MNDVKVIKLSGSLGRRFGVFHRYAVDSYPEAIRALSSQVDGFKEYMQSEVGSRSKFAIFVDGVNVGHHEEEKFKCAKEIR IVPIPTGSKTGGLFQVVLGAAIMVAAFYTGGASLALMGTMSSSLFMMGGAMVLGGVMQMISPQPGGANFEVQSSKNKPSY AFGGAVNTTAAGYPLPVPYGYRAGGGATFSAGSYAEDMS ; 1 3 UNP A0A3S9W0Y3_BPT1 A0A3S9W0Y3 ? 3 ;MSENKKLYDEESGKSLFHNCLQSLYPGEIITLIEVDGSKFGAQVYRFHGENIQYTPEEIMQAQQTGTLPPKEITFRGEKY GARPFGISGISFDSSGKATKPQLTVANIDSRVSAMIRAYNGLMQAKVTIWITQRELINSDGSIADGAYRKLVYYIERPNY VDKSVARFDLTSPYDMDGIMIPSRLTQSVCYFAQRGWYKTGKGCGYNGQNGYFDKDNNPVDDPSLDFCPGTVTACRLRFG ANNELDFGGCAVASLQRKNQ ; 1 4 UNP Q6XQC3_BPT1 Q6XQC3 ? 4 ;MATLDTFGWCTQVQGGGGSLTTTNSDRSIQFGNGYMQLASSGFNTTRREYSVVYAGEDFMAVYDFCNSHRIKPFAWTPPD GKIGIWVVKPNSLGAKPVSRDVMEINVTFMEQFTSME ; 1 5 UNP TMP_BPT1 Q6XQC4 ? 5 ;MVDKVAGLSLDVDVSTVQRAVKSLKEFSKANDQAADSMGSLINESEVAKQKAKEHAEQLRRQRKEYEAVEKAIDPTVSKM ERLKIASQQLDKLWQQGVVPDETFFRLGEMLDLQNAKLARSRAMLTEEGQAALQEAKAKEQAAVRSKAFMDALNGQVNAI GKTHAELMELKAAELGLSKEAAPLIAKLKDQGRAMNAAGISAGEYRQAMRMLPAQITDVVTSLASGMPVWMVAIQQGGQI KDSFGGIGNTFKVLLSYINPVTAGVGVLVGSLGILAKAGYDSYKSITDIQNALIETGGYAGVTAEELDSVSKKIAQTSNS TIGSIREIVTELASSGKYTREQIQNITKATAEWSASTGKSASQIISEFEKIASDPVKGLKKLNEQYNFLEKGQLTYIDTL SRTKGETEAVSEATKLFADVMEKRMKSIADNATPLEKMWSDIKQWASDAWGWVGDHTLGALNLIIDVVQGTVIQVKMILA KGDEYISNFIASAIKATQSLPGMSDFGADVLKEQENIVKSSRDNYDQLASDLDAINARVEKGEMGYIEAMRQRRTLEKQY SEETKEAIRKEAEEIEKRNRERNKQSKIVRSPTEQFDKELISLRAQLKVLQEHKEIGQKLSAQRKALFTTEATIAVLREA SSKRQLSAEEKALLASQERVIELAKQKAEIGDQIVKQQQLNDLTDKSLKFVNEMTAATEQLNASRGLSTRDMERQAELAK ITTDYINSGGSEGDEKLQNMIKAQNDYYAAEDAKRADWLAGAESAFADYGDAAMDMYGNVNEIASSALNGMSDMMVQFLT TGKANFEDFAKNIIGMIIKMIAQMVIFNTISGMMGGKTWSFAGGASSGASAASQATPTPAASVFRSVSSGGAAVSLAAAA GSVATSGFNASNSAPKVVNHSGGGTVVDVSGMEVKVDNGSDPRGISQGVEMMFKKMIRESCSQGGEVYNYIQEKTGG ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 9L9P S 1 ? 1172 ? A0A3S9W0W9 1 ? 1172 ? 1 1172 2 2 9L9P A 1 ? 199 ? Q6XQC0 1 ? 199 ? 1 199 3 3 9L9P J 1 ? 260 ? A0A3S9W0Y3 1 ? 260 ? 1 260 4 4 9L9P H 1 ? 117 ? Q6XQC3 1 ? 117 ? 1 117 5 5 9L9P B 1 ? 957 ? Q6XQC4 1 ? 957 ? 1 957 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details pentameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 5 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'not applicable' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 SER A 48 ? LYS A 50 ? SER S 48 LYS S 50 5 ? 3 HELX_P HELX_P2 AA2 ALA A 282 ? ASN A 291 ? ALA S 282 ASN S 291 1 ? 10 HELX_P HELX_P3 AA3 ASP A 306 ? ASP A 318 ? ASP S 306 ASP S 318 1 ? 13 HELX_P HELX_P4 AA4 ASP A 343 ? SER A 353 ? ASP S 343 SER S 353 1 ? 11 HELX_P HELX_P5 AA5 VAL A 385 ? ASP A 389 ? VAL S 385 ASP S 389 5 ? 5 HELX_P HELX_P6 AA6 SER A 396 ? MET A 400 ? SER S 396 MET S 400 5 ? 5 HELX_P HELX_P7 AA7 ARG A 425 ? ARG A 430 ? ARG S 425 ARG S 430 5 ? 6 HELX_P HELX_P8 AA8 ARG A 445 ? ARG A 462 ? ARG S 445 ARG S 462 1 ? 18 HELX_P HELX_P9 AA9 GLY A 471 ? ILE A 476 ? GLY S 471 ILE S 476 5 ? 6 HELX_P HELX_P10 AB1 ASN A 602 ? TYR A 609 ? ASN S 602 TYR S 609 1 ? 8 HELX_P HELX_P11 AB2 VAL A 767 ? SER A 771 ? VAL S 767 SER S 771 5 ? 5 HELX_P HELX_P12 AB3 ALA B 101 ? TYR B 108 ? ALA A 101 TYR A 108 1 ? 8 HELX_P HELX_P13 AB4 ALA B 112 ? MET B 126 ? ALA A 112 MET A 126 1 ? 15 HELX_P HELX_P14 AB5 GLY B 135 ? SER B 141 ? GLY A 135 SER A 141 1 ? 7 HELX_P HELX_P15 AB6 PHE C 17 ? GLN C 22 ? PHE J 17 GLN J 22 1 ? 6 HELX_P HELX_P16 AB7 THR C 55 ? GLY C 66 ? THR J 55 GLY J 66 1 ? 12 HELX_P HELX_P17 AB8 SER C 110 ? TYR C 119 ? SER J 110 TYR J 119 1 ? 10 HELX_P HELX_P18 AB9 ASN C 120 ? MET C 123 ? ASN J 120 MET J 123 5 ? 4 HELX_P HELX_P19 AC1 GLU C 135 ? ILE C 137 ? GLU J 135 ILE J 137 5 ? 3 HELX_P HELX_P20 AC2 TYR C 191 ? GLY C 196 ? TYR J 191 GLY J 196 1 ? 6 HELX_P HELX_P21 AC3 THR C 231 ? GLY C 240 ? THR J 231 GLY J 240 1 ? 10 HELX_P HELX_P22 AC4 ASP D 58 ? HIS D 69 ? ASP H 58 HIS H 69 1 ? 12 HELX_P HELX_P23 AC5 PRO E 922 ? SER E 942 ? PRO B 922 SER B 942 1 ? 21 HELX_P HELX_P24 AC6 GLY E 945 ? THR E 955 ? GLY B 945 THR B 955 1 ? 11 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # _struct_conn.id metalc1 _struct_conn.conn_type_id metalc _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag ? _struct_conn.pdbx_PDB_id ? _struct_conn.ptnr1_label_asym_id C _struct_conn.ptnr1_label_comp_id CYS _struct_conn.ptnr1_label_seq_id 190 _struct_conn.ptnr1_label_atom_id SG _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id ? _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code ? _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id ? _struct_conn.ptnr1_symmetry 1_555 _struct_conn.ptnr2_label_asym_id F _struct_conn.ptnr2_label_comp_id SF4 _struct_conn.ptnr2_label_seq_id . _struct_conn.ptnr2_label_atom_id FE3 _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id ? _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code ? _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id J _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id CYS _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id 190 _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id J _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id SF4 _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id 301 _struct_conn.ptnr2_symmetry 1_555 _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id ? _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id ? _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id ? _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id ? _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id ? _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code ? _struct_conn.details ? _struct_conn.pdbx_dist_value 2.253 _struct_conn.pdbx_value_order ? _struct_conn.pdbx_role ? # _struct_conn_type.id metalc _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _pdbx_struct_conn_angle.id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.value _pdbx_struct_conn_angle.value_esd 1 SG ? C CYS 190 ? J CYS 190 ? 1_555 FE3 ? F SF4 . ? J SF4 301 ? 1_555 S1 ? F SF4 . ? J SF4 301 ? 1_555 103.6 ? 2 SG ? C CYS 190 ? J CYS 190 ? 1_555 FE3 ? F SF4 . ? J SF4 301 ? 1_555 S2 ? F SF4 . ? J SF4 301 ? 1_555 151.5 ? 3 S1 ? F SF4 . ? J SF4 301 ? 1_555 FE3 ? F SF4 . ? J SF4 301 ? 1_555 S2 ? F SF4 . ? J SF4 301 ? 1_555 104.2 ? 4 SG ? C CYS 190 ? J CYS 190 ? 1_555 FE3 ? F SF4 . ? J SF4 301 ? 1_555 S4 ? F SF4 . ? J SF4 301 ? 1_555 75.3 ? 5 S1 ? F SF4 . ? J SF4 301 ? 1_555 FE3 ? F SF4 . ? J SF4 301 ? 1_555 S4 ? F SF4 . ? J SF4 301 ? 1_555 104.2 ? 6 S2 ? F SF4 . ? J SF4 301 ? 1_555 FE3 ? F SF4 . ? J SF4 301 ? 1_555 S4 ? F SF4 . ? J SF4 301 ? 1_555 104.0 ? # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 3 ? AA2 ? 3 ? AA3 ? 4 ? AA4 ? 3 ? AA5 ? 3 ? AA6 ? 2 ? AA7 ? 2 ? AA8 ? 2 ? AA9 ? 2 ? AB1 ? 6 ? AB2 ? 3 ? AB3 ? 3 ? AB4 ? 3 ? AB5 ? 3 ? AB6 ? 4 ? AB7 ? 3 ? AB8 ? 4 ? AB9 ? 7 ? AC1 ? 2 ? AC2 ? 2 ? AC3 ? 4 ? 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