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_refine.pdbx_ls_cross_valid_method ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values 'REAL-SPACE (WEIGHTED MAP SUM AT ATOM CENTERS)' _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_real_space_R ? _refine.pdbx_density_correlation ? _refine.pdbx_pd_number_of_powder_patterns ? _refine.pdbx_pd_number_of_points ? _refine.pdbx_pd_meas_number_of_points ? _refine.pdbx_pd_proc_ls_prof_R_factor ? _refine.pdbx_pd_proc_ls_prof_wR_factor ? _refine.pdbx_pd_Marquardt_correlation_coeff ? _refine.pdbx_pd_Fsqrd_R_factor ? _refine.pdbx_pd_ls_matrix_band_width ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? 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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.567 ? 23019 ? f_angle_d ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 21.078 ? 3036 ? f_dihedral_angle_d ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.041 ? 2515 ? f_chiral_restr ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.004 ? 2610 ? f_plane_restr ? ? ? # _struct.entry_id 9LQP _struct.title 'Structure of transposase-activated RAG (RAG1 E962N) target capture complex with disordered U-shaped target DNA (TCC-UD)' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 9LQP _struct_keywords.text 'RAG, Transposase, TCC, evolution, DNA BINDING PROTEIN/DNA, DNA BINDING PROTEIN-DNA complex' _struct_keywords.pdbx_keywords 'DNA BINDING PROTEIN/DNA' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 1 ? D N N 2 ? E N N 3 ? F N N 4 ? G N N 5 ? H N N 6 ? I N N 7 ? J N N 8 ? 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P15919 261 ? 1008 ? 261 1008 2 2 9LQP B 4 ? 91 ? P08046 333 ? 420 ? -98 -11 3 3 9LQP B 103 ? 437 ? P21784 1 ? 335 ? 1 335 4 4 9LQP B 438 ? 457 ? P21784 342 ? 361 ? 336 355 5 1 9LQP C 3 ? 750 ? P15919 261 ? 1008 ? 261 1008 6 2 9LQP D 4 ? 91 ? P08046 333 ? 420 ? -98 -11 7 3 9LQP D 103 ? 437 ? P21784 1 ? 335 ? 1 335 8 4 9LQP D 438 ? 457 ? 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'expression tag' -101 5 2 9LQP PRO B 2 ? UNP P08046 ? ? 'expression tag' -100 6 2 9LQP MET B 3 ? UNP P08046 ? ? 'expression tag' -99 7 2 9LQP ASP B 20 ? UNP P08046 ARG 349 conflict -82 8 2 9LQP SER B 22 ? UNP P08046 ASP 351 conflict -80 9 2 9LQP ASN B 23 ? UNP P08046 GLU 352 conflict -79 10 2 9LQP ASP B 92 ? UNP P08046 ? ? linker -10 11 2 9LQP GLY B 93 ? UNP P08046 ? ? linker -9 12 2 9LQP GLY B 94 ? UNP P08046 ? ? linker -8 13 2 9LQP GLY B 95 ? UNP P08046 ? ? linker -7 14 2 9LQP ASN B 96 ? UNP P08046 ? ? linker -6 15 2 9LQP GLY B 97 ? UNP P08046 ? ? linker -5 16 2 9LQP SER B 98 ? UNP P08046 ? ? linker -4 17 2 9LQP GLY B 99 ? UNP P08046 ? ? linker -3 18 2 9LQP GLY B 100 ? UNP P08046 ? ? linker -2 19 2 9LQP SER B 101 ? UNP P08046 ? ? linker -1 20 2 9LQP GLY B 102 ? UNP P08046 ? ? linker 0 21 5 9LQP GLY C 1 ? UNP P15919 ? ? 'expression tag' 259 22 5 9LQP PRO C 2 ? UNP P15919 ? ? 'expression tag' 260 23 5 9LQP MET C 590 ? UNP P15919 ARG 848 conflict 848 24 5 9LQP ASN C 704 ? UNP P15919 GLU 962 'engineered mutation' 962 25 6 9LQP GLY D 1 ? UNP P08046 ? ? 'expression tag' -101 26 6 9LQP PRO D 2 ? UNP P08046 ? ? 'expression tag' -100 27 6 9LQP MET D 3 ? UNP P08046 ? ? 'expression tag' -99 28 6 9LQP ASP D 20 ? UNP P08046 ARG 349 conflict -82 29 6 9LQP SER D 22 ? UNP P08046 ASP 351 conflict -80 30 6 9LQP ASN D 23 ? UNP P08046 GLU 352 conflict -79 31 6 9LQP ASP D 92 ? UNP P08046 ? ? linker -10 32 6 9LQP GLY D 93 ? UNP P08046 ? ? linker -9 33 6 9LQP GLY D 94 ? UNP P08046 ? ? linker -8 34 6 9LQP GLY D 95 ? UNP P08046 ? ? linker -7 35 6 9LQP ASN D 96 ? UNP P08046 ? ? linker -6 36 6 9LQP GLY D 97 ? UNP P08046 ? ? linker -5 37 6 9LQP SER D 98 ? UNP P08046 ? ? linker -4 38 6 9LQP GLY D 99 ? UNP P08046 ? ? linker -3 39 6 9LQP GLY D 100 ? UNP P08046 ? ? linker -2 40 6 9LQP SER D 101 ? UNP P08046 ? ? linker -1 41 6 9LQP GLY D 102 ? UNP P08046 ? ? linker 0 42 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details decameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 10 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'not applicable' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 VAL A 208 ? 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