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_refine.pdbx_diffrn_id ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.overall_SU_R_free ? _refine.overall_FOM_free_R_set ? _refine.overall_FOM_work_R_set ? _refine.pdbx_average_fsc_overall ? _refine.pdbx_average_fsc_work ? _refine.pdbx_average_fsc_free ? # _struct.entry_id 9LQQ _struct.title 'Structure of transposase-activated RAG target capture complex with X-form U-shaped target DNA (TCC-UDX)' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 9LQQ _struct_keywords.text 'RAG, Transposase, TCC, evolution, DNA BINDING PROTEIN/DNA, DNA BINDING PROTEIN-DNA complex' _struct_keywords.pdbx_keywords 'DNA BINDING PROTEIN/DNA' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? 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A DT 37 N3 ? ? ? 1_555 B DA 23 N1 ? ? I DT 37 J DA 23 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog36 hydrog ? ? A DT 37 O4 ? ? ? 1_555 B DA 23 N6 ? ? I DT 37 J DA 23 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog37 hydrog ? ? A DC 38 N3 ? ? ? 1_555 B DG 22 N1 ? ? I DC 38 J DG 22 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog38 hydrog ? ? A DC 38 N4 ? ? ? 1_555 B DG 22 O6 ? ? I DC 38 J DG 22 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog39 hydrog ? ? A DC 38 O2 ? ? ? 1_555 B DG 22 N2 ? ? I DC 38 J DG 22 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog40 hydrog ? ? A DT 39 N3 ? ? ? 1_555 B DA 21 N1 ? ? I DT 39 J DA 21 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog41 hydrog ? ? A DT 39 O4 ? ? ? 1_555 B DA 21 N6 ? ? I DT 39 J DA 21 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog42 hydrog ? ? A DG 40 N1 ? ? ? 1_555 B DC 20 N3 ? ? I DG 40 J DC 20 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog43 hydrog ? ? A DG 40 N2 ? ? ? 1_555 B DC 20 O2 ? ? I DG 40 J DC 20 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog44 hydrog ? ? 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WATSON-CRICK ? ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference metalc ? ? hydrog ? ? # loop_ _pdbx_struct_conn_angle.id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.value _pdbx_struct_conn_angle.value_esd 1 SG ? 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J 42 ? I 19 ? J 41 ? 1 A DA 19 1_555 B DT 41 1_555 A DA 20 1_555 B DT 40 1_555 -0.678 1.987 3.702 -4.348 1.709 44.077 2.451 0.433 3.820 2.270 5.774 44.312 2 II_DA19DA20:DT40DT41_JJ I 19 ? J 41 ? I 20 ? J 40 ? 1 A DA 20 1_555 B DT 40 1_555 A DT 21 1_555 B DA 39 1_555 0.271 -0.104 3.356 -4.900 3.539 27.303 -1.070 -1.746 3.220 7.383 10.222 27.952 3 II_DA20DT21:DA39DT40_JJ I 20 ? J 40 ? I 21 ? J 39 ? 1 A DT 21 1_555 B DA 39 1_555 A DA 22 1_555 B DT 38 1_555 -0.116 0.604 3.227 -3.915 5.235 41.212 0.297 -0.249 3.273 7.381 5.520 41.705 4 II_DT21DA22:DT38DA39_JJ I 21 ? J 39 ? I 22 ? J 38 ? 1 A DA 22 1_555 B DT 38 1_555 A DG 23 1_555 B DC 37 1_555 0.498 -1.233 3.034 -3.799 6.941 29.992 -3.482 -1.575 2.609 13.126 7.184 30.995 5 II_DA22DG23:DC37DT38_JJ I 22 ? J 38 ? I 23 ? J 37 ? 1 A DG 23 1_555 B DC 37 1_555 A DA 24 1_555 B DT 36 1_555 -0.182 -0.884 3.777 7.428 17.144 35.766 -3.425 1.191 2.977 25.856 -11.202 40.211 6 II_DG23DA24:DT36DC37_JJ I 23 ? J 37 ? I 24 ? 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