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EMDB EMD-48164 ? ? # _pdbx_audit_revision_history.ordinal 1 _pdbx_audit_revision_history.data_content_type 'Structure model' _pdbx_audit_revision_history.major_revision 1 _pdbx_audit_revision_history.minor_revision 0 _pdbx_audit_revision_history.revision_date 2025-08-13 _pdbx_audit_revision_history.part_number ? # _pdbx_audit_revision_details.ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.data_content_type 'Structure model' _pdbx_audit_revision_details.provider repository _pdbx_audit_revision_details.type 'Initial release' _pdbx_audit_revision_details.description ? _pdbx_audit_revision_details.details ? # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 9MD1 _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2024-12-05 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site RCSB _pdbx_database_status.process_site RCSB _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y # _pdbx_database_related.db_name EMDB _pdbx_database_related.details 'Buspirone-bound serotonin 1A (5-HT1A) receptor-Gz protein complex' _pdbx_database_related.db_id EMD-48164 _pdbx_database_related.content_type 'associated EM volume' # _pdbx_contact_author.id 2 _pdbx_contact_author.email Daniel.Wacker@mssm.edu _pdbx_contact_author.name_first Daniel _pdbx_contact_author.name_last Wacker _pdbx_contact_author.name_mi ? _pdbx_contact_author.role 'principal investigator/group leader' _pdbx_contact_author.identifier_ORCID 0000-0003-4951-7230 # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Warren, A.L.' 1 0000-0002-1538-8648 'Zilberg, G.' 2 0000-0002-6575-508X 'Wacker, D.' 3 0000-0003-4951-7230 # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country US _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev 'Sci Adv' _citation.journal_id_ASTM ? _citation.journal_id_CSD ? _citation.journal_id_ISSN 2375-2548 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume 11 _citation.language ? _citation.page_first eadu9851 _citation.page_last eadu9851 _citation.title 'Structural determinants of G protein subtype selectivity at the serotonin receptor 5-HT1A.' _citation.year 2025 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1126/sciadv.adu9851 _citation.pdbx_database_id_PubMed 40749070 _citation.pdbx_database_id_patent ? _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Warren, A.L.' 1 0000-0002-1538-8648 primary 'Zilberg, G.' 2 0000-0002-6575-508X primary 'Abbassi, A.' 3 ? primary 'Abraham, A.' 4 0000-0002-5971-6834 primary 'Yang, S.' 5 0000-0001-7616-1976 primary 'Wacker, D.' 6 0000-0003-4951-7230 # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer man 'Guanine nucleotide-binding protein G(z) subunit alpha' 40978.699 1 ? ? ? ? 2 polymer man 'Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1' 39418.086 1 ? ? ? ? 3 polymer man 'Soluble cytochrome b562,5-hydroxytryptamine receptor 1A' 61375.930 2 ? L125W 'residues 1-25 of the 5-HT receptor deleted' 'N-terminally truncated 5-HT1A receptor with a flag and his tag followed by a TEV cleavage site and BRIL at the N-terminus.' 4 polymer man 'Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(O) subunit gamma-2' 8506.765 1 ? ? ? ;Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(O) subunit gamma-2 with a GSAGSAGSA linker connecting it to the N-terminus of Guanine nucleotide-binding protein G(z) subunit alpha ; 5 non-polymer syn Buspirone 385.503 2 ? ? ? ? 6 non-polymer syn CHOLESTEROL 386.654 8 ? ? ? ? 7 non-polymer syn ;[(2R)-1-[oxidanyl-[(2R,3R,5S,6R)-2,3,5,6-tetrakis(oxidanyl)-4-phosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phosphoryl]oxy-3-tetradecanoyloxy-propan-2-yl] (5E,8E)-hexadeca-5,8,11,14-tetraenoate ; 854.895 2 ? ? ? ? # loop_ _entity_name_com.entity_id _entity_name_com.name 1 'G(x) alpha chain,Gz-alpha' 2 'Transducin beta chain 1' 3 'Cytochrome b-562,5-HT-1A,5-HT1A,G-21,Serotonin receptor 1A' 4 'G gamma-I' # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no ;MGCRQSSEEKEAARRSRRIDRHLRSESQRQRREIKLLLLGTSNSGKSTIVKQMKIIHSGGFNLEACKEYKPLIIYNAIDS LTRIIRALAALRIDFHNPDRAYDAVQLFALTGPAESKGEITPELLGVMRRLWADPGAQACFSRSSEYHLEDNAAYYLNDL ERIAAADYIPTVEDILRSRDMTTGIVENKFTFKELTFKMVDVGGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVELSGYDLKLYEDNQ TSRMAESLRLFDSICNNNWFINTSLILFLNKKDLLAEKIRRIPLTICFPEYKGQNTYEEAAVYIQRQFEDLNRNKETKEI YSHFTCATDTSNIQFVFDAVTDVIIQNNLKYIGLC ; ;MGCRQSSEEKEAARRSRRIDRHLRSESQRQRREIKLLLLGTSNSGKSTIVKQMKIIHSGGFNLEACKEYKPLIIYNAIDS LTRIIRALAALRIDFHNPDRAYDAVQLFALTGPAESKGEITPELLGVMRRLWADPGAQACFSRSSEYHLEDNAAYYLNDL ERIAAADYIPTVEDILRSRDMTTGIVENKFTFKELTFKMVDVGGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVELSGYDLKLYEDNQ TSRMAESLRLFDSICNNNWFINTSLILFLNKKDLLAEKIRRIPLTICFPEYKGQNTYEEAAVYIQRQFEDLNRNKETKEI YSHFTCATDTSNIQFVFDAVTDVIIQNNLKYIGLC ; A ? 2 'polypeptide(L)' no no ;MHHHHHHLEVLFQGPGSSGSELDQLRQEAEQLKNQIRDARKACADATLSQITNNIDPVGRIQMRTRRTLRGHLAKIYAMH WGTDSRLLVSASQDGKLIIWDSYTTNKVHAIPLRSSWVMTCAYAPSGNYVACGGLDNICSIYNLKTREGNVRVSRELAGH TGYLSCCRFLDDNQIVTSSGDTTCALWDIETGQQTTTFTGHTGDVMSLSLAPDTRLFVSGACDASAKLWDVREGMCRQTF TGHESDINAICFFPNGNAFATGSDDATCRLFDLRADQELMTYSHDNIICGITSVSFSKSGRLLLAGYDDFNCNVWDALKA DRAGVLAGHDNRVSCLGVTDDGMAVATGSWDSFLKIWN ; ;MHHHHHHLEVLFQGPGSSGSELDQLRQEAEQLKNQIRDARKACADATLSQITNNIDPVGRIQMRTRRTLRGHLAKIYAMH WGTDSRLLVSASQDGKLIIWDSYTTNKVHAIPLRSSWVMTCAYAPSGNYVACGGLDNICSIYNLKTREGNVRVSRELAGH TGYLSCCRFLDDNQIVTSSGDTTCALWDIETGQQTTTFTGHTGDVMSLSLAPDTRLFVSGACDASAKLWDVREGMCRQTF TGHESDINAICFFPNGNAFATGSDDATCRLFDLRADQELMTYSHDNIICGITSVSFSKSGRLLLAGYDDFNCNVWDALKA DRAGVLAGHDNRVSCLGVTDDGMAVATGSWDSFLKIWN ; B ? 3 'polypeptide(L)' no no ;MKTIIALSYIFCLVFADYKDDDDAKLQTMHHHHHHHHHHENLYFQGGTTADLEDNWETLNDNLKVIEKADNAAQVKDALT KMRAAALDAQKATPPKLEDKSPDSPEMKDFRHGFDILVGQIDDALKLANEGKVKEAQAAAEQLKTTRNAYIQKYLTGISD 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MASNNTASIAQARKLVEQLKMEANIDRIKVSKAAADLMAYCEAHAKEDPLLTPVPASENPFREKKFFCAILGSAGSAGSA MASNNTASIAQARKLVEQLKMEANIDRIKVSKAAADLMAYCEAHAKEDPLLTPVPASENPFREKKFFCAILGSAGSAGSA G ? # loop_ _pdbx_entity_nonpoly.entity_id _pdbx_entity_nonpoly.name _pdbx_entity_nonpoly.comp_id 5 Buspirone YLX 6 CHOLESTEROL CLR 7 ;[(2R)-1-[oxidanyl-[(2R,3R,5S,6R)-2,3,5,6-tetrakis(oxidanyl)-4-phosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phosphoryl]oxy-3-tetradecanoyloxy-propan-2-yl] (5E,8E)-hexadeca-5,8,11,14-tetraenoate ; J40 # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET n 1 2 GLY n 1 3 CYS n 1 4 ARG n 1 5 GLN n 1 6 SER n 1 7 SER n 1 8 GLU n 1 9 GLU n 1 10 LYS n 1 11 GLU n 1 12 ALA n 1 13 ALA n 1 14 ARG n 1 15 ARG n 1 16 SER n 1 17 ARG n 1 18 ARG n 1 19 ILE n 1 20 ASP n 1 21 ARG n 1 22 HIS n 1 23 LEU n 1 24 ARG n 1 25 SER n 1 26 GLU n 1 27 SER n 1 28 GLN n 1 29 ARG n 1 30 GLN n 1 31 ARG n 1 32 ARG n 1 33 GLU n 1 34 ILE n 1 35 LYS n 1 36 LEU n 1 37 LEU n 1 38 LEU n 1 39 LEU 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LYS n 1 212 TRP n 1 213 ILE n 1 214 HIS n 1 215 CYS n 1 216 PHE n 1 217 GLU n 1 218 GLY n 1 219 VAL n 1 220 THR n 1 221 ALA n 1 222 ILE n 1 223 ILE n 1 224 PHE n 1 225 CYS n 1 226 VAL n 1 227 GLU n 1 228 LEU n 1 229 SER n 1 230 GLY n 1 231 TYR n 1 232 ASP n 1 233 LEU n 1 234 LYS n 1 235 LEU n 1 236 TYR n 1 237 GLU n 1 238 ASP n 1 239 ASN n 1 240 GLN n 1 241 THR n 1 242 SER n 1 243 ARG n 1 244 MET n 1 245 ALA n 1 246 GLU n 1 247 SER n 1 248 LEU n 1 249 ARG n 1 250 LEU n 1 251 PHE n 1 252 ASP n 1 253 SER n 1 254 ILE n 1 255 CYS n 1 256 ASN n 1 257 ASN n 1 258 ASN n 1 259 TRP n 1 260 PHE n 1 261 ILE n 1 262 ASN n 1 263 THR n 1 264 SER n 1 265 LEU n 1 266 ILE n 1 267 LEU n 1 268 PHE n 1 269 LEU n 1 270 ASN n 1 271 LYS n 1 272 LYS n 1 273 ASP n 1 274 LEU n 1 275 LEU n 1 276 ALA n 1 277 GLU n 1 278 LYS n 1 279 ILE n 1 280 ARG n 1 281 ARG n 1 282 ILE n 1 283 PRO n 1 284 LEU n 1 285 THR n 1 286 ILE n 1 287 CYS n 1 288 PHE n 1 289 PRO n 1 290 GLU n 1 291 TYR n 1 292 LYS n 1 293 GLY n 1 294 GLN 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UNP P08908 LEU 125 'engineered mutation' 125 134 # loop_ _pdbx_struct_assembly.id _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 author_defined_assembly ? tetrameric 4 2 author_defined_assembly ? monomeric 1 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list 1 1 A,B,D,E,L,M,N,O,P,Q 2 1 C,F,G,H,I,J,K # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 SER A 6 ? ARG A 32 ? SER A 6 ARG A 32 1 ? 27 HELX_P HELX_P2 AA2 THR A 330 ? ILE A 352 ? THR A 330 ILE A 352 1 ? 23 HELX_P HELX_P3 AA3 ASN B 34 ? ALA B 44 ? ASN B 16 ALA B 26 1 ? 11 HELX_P HELX_P4 AA4 THR B 47 ? THR B 52 ? THR B 29 THR B 34 1 ? 6 HELX_P HELX_P5 AA5 GLN C 166 ? GLU C 194 ? GLN C 36 GLU C 64 1 ? 29 HELX_P HELX_P6 AA6 ASN C 199 ? VAL C 219 ? ASN C 69 VAL C 89 1 ? 21 HELX_P HELX_P7 AA7 VAL C 219 ? ASN C 230 ? VAL C 89 ASN C 100 1 ? 12 HELX_P HELX_P8 AA8 GLY C 235 ? ASP C 270 ? GLY C 105 ASP C 140 1 ? 36 HELX_P HELX_P9 AA9 ASP C 270 ? LYS C 277 ? ASP C 140 LYS C 147 1 ? 8 HELX_P HELX_P10 AB1 THR C 279 ? ILE C 297 ? THR C 149 ILE C 167 1 ? 19 HELX_P HELX_P11 AB2 ILE C 299 ? LEU C 303 ? ILE C 169 LEU C 173 5 ? 5 HELX_P HELX_P12 AB3 ASP C 322 ? PHE C 334 ? ASP C 192 PHE C 204 1 ? 13 HELX_P HELX_P13 AB4 PHE C 334 ? LYS C 358 ? PHE C 204 LYS C 228 1 ? 25 HELX_P HELX_P14 AB5 ALA C 461 ? LEU C 498 ? ALA C 331 LEU C 368 1 ? 38 HELX_P HELX_P15 AB6 PRO C 499 ? CYS C 501 ? 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PHE R 204 LYS R 228 1 ? 25 HELX_P HELX_P30 AD3 ALA E 461 ? ALA E 468 ? ALA R 331 ALA R 338 1 ? 8 HELX_P HELX_P31 AD4 VAL E 474 ? LEU E 498 ? VAL R 344 LEU R 368 1 ? 25 HELX_P HELX_P32 AD5 PRO E 499 ? CYS E 501 ? PRO R 369 CYS R 371 5 ? 3 HELX_P HELX_P33 AD6 PRO E 508 ? SER E 521 ? PRO R 378 SER R 391 1 ? 14 HELX_P HELX_P34 AD7 SER E 521 ? ALA E 531 ? SER R 391 ALA R 401 1 ? 11 HELX_P HELX_P35 AD8 ASN E 534 ? ILE E 545 ? 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CYS C 317 ? CYS C 109 ? 1_555 CYS C 187 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 2 CYS E 239 ? CYS E 317 ? CYS R 109 ? 1_555 CYS R 187 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 6 ? AA2 ? 4 ? AA3 ? 4 ? AA4 ? 4 ? AA5 ? 4 ? AA6 ? 4 ? AA7 ? 4 ? AA8 ? 4 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? parallel AA1 3 4 ? parallel AA1 4 5 ? parallel AA1 5 6 ? parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA2 3 4 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA3 3 4 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA4 3 4 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA5 3 4 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA6 3 4 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA7 3 4 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA8 3 4 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 VAL A 186 ? 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ARG B 304 VAL B 307 # loop_ _pdbx_struct_sheet_hbond.sheet_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_1 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_2 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_seq_id AA1 1 2 N PHE A 190 ? N PHE A 190 O PHE A 197 ? O PHE A 197 AA1 2 3 O LYS A 198 ? O LYS A 198 N ILE A 34 ? N ILE A 34 AA1 3 4 O LYS A 35 ? O LYS A 35 N ALA A 221 ? N ALA A 221 AA1 4 5 N VAL A 226 ? N VAL A 226 O ASN A 270 ? O ASN A 270 AA1 5 6 N LEU A 267 ? N LEU A 267 O TYR A 321 ? O TYR A 321 AA2 1 2 N LEU B 69 ? N LEU B 51 O LEU B 354 ? O LEU B 336 AA2 2 3 O LYS B 355 ? O LYS B 337 N THR B 347 ? N THR B 329 AA2 3 4 O GLY B 348 ? O GLY B 330 N CYS B 335 ? N CYS B 317 AA3 1 2 N HIS B 80 ? N HIS B 62 O VAL B 89 ? O VAL B 71 AA3 2 3 N SER B 92 ? N SER B 74 O LYS B 96 ? O LYS B 78 AA3 3 4 N ILE B 99 ? N ILE B 81 O HIS B 109 ? O HIS B 91 AA4 1 2 N THR B 120 ? N THR B 102 O GLY B 133 ? O GLY B 115 AA4 2 3 N VAL B 130 ? N VAL B 112 O TYR B 142 ? O TYR B 124 AA4 3 4 N CYS B 139 ? N CYS B 121 O LEU B 157 ? O LEU B 139 AA5 1 2 N SER B 165 ? N SER B 147 O SER B 178 ? O SER B 160 AA5 2 3 N THR B 177 ? N THR B 159 O ALA B 185 ? O ALA B 167 AA5 3 4 N CYS B 184 ? N CYS B 166 O PHE B 198 ? 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O GLY B 306 # _pdbx_entry_details.entry_id 9MD1 _pdbx_entry_details.nonpolymer_details ? _pdbx_entry_details.sequence_details ? _pdbx_entry_details.compound_details ? _pdbx_entry_details.source_details ? _pdbx_entry_details.has_ligand_of_interest Y _pdbx_entry_details.has_protein_modification Y # loop_ _pdbx_validate_torsion.id _pdbx_validate_torsion.PDB_model_num _pdbx_validate_torsion.auth_comp_id _pdbx_validate_torsion.auth_asym_id _pdbx_validate_torsion.auth_seq_id _pdbx_validate_torsion.PDB_ins_code _pdbx_validate_torsion.label_alt_id _pdbx_validate_torsion.phi _pdbx_validate_torsion.psi 1 1 ARG A 32 ? ? -95.46 36.73 2 1 GLU A 217 ? ? -135.63 -45.69 3 1 THR A 330 ? ? -97.16 31.42 4 1 ASP B 27 ? ? -108.00 -82.49 5 1 CYS B 114 ? ? -123.93 -161.73 6 1 ASN B 119 ? ? -87.26 34.42 7 1 THR B 143 ? ? -109.25 41.87 8 1 LEU B 308 ? ? -109.23 53.16 9 1 LEU C 104 ? ? -127.65 -52.46 10 1 SER C 168 ? ? -128.86 -76.09 11 1 ASP C 180 ? ? 49.60 -122.85 12 1 ASP C 183 ? ? 53.30 75.36 13 1 PRO C 184 ? ? -57.31 -9.72 14 1 ASP C 185 ? ? -93.57 32.19 15 1 LYS R 147 ? ? -145.06 20.34 16 1 MET R 172 ? ? -79.56 -71.53 17 1 ASP R 185 ? ? 38.62 48.65 18 1 LYS R 191 ? ? -96.79 31.43 19 1 PHE R 204 ? ? -135.48 -53.27 20 1 CYS R 375 ? ? -145.97 46.09 # _em_3d_fitting.id 1 _em_3d_fitting.entry_id 9MD1 _em_3d_fitting.method ? _em_3d_fitting.target_criteria ? _em_3d_fitting.details ? _em_3d_fitting.overall_b_value ? _em_3d_fitting.ref_space ? _em_3d_fitting.ref_protocol ? # _em_3d_reconstruction.entry_id 9MD1 _em_3d_reconstruction.id 1 _em_3d_reconstruction.method ? _em_3d_reconstruction.algorithm ? _em_3d_reconstruction.citation_id ? _em_3d_reconstruction.details ? _em_3d_reconstruction.resolution 3.03 _em_3d_reconstruction.resolution_method 'FSC 0.143 CUT-OFF' _em_3d_reconstruction.magnification_calibration ? _em_3d_reconstruction.nominal_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.actual_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.num_particles 447065 _em_3d_reconstruction.euler_angles_details ? _em_3d_reconstruction.num_class_averages ? _em_3d_reconstruction.refinement_type ? _em_3d_reconstruction.image_processing_id 1 _em_3d_reconstruction.symmetry_type POINT # _em_buffer.id 1 _em_buffer.specimen_id 1 _em_buffer.name ? _em_buffer.details ? _em_buffer.pH 7.4 # loop_ _em_entity_assembly.id _em_entity_assembly.parent_id _em_entity_assembly.source _em_entity_assembly.type _em_entity_assembly.name _em_entity_assembly.details _em_entity_assembly.synonym _em_entity_assembly.oligomeric_details _em_entity_assembly.entity_id_list 1 0 'MULTIPLE SOURCES' COMPLEX 'Serotonin 1A (5-HT1A) receptor-Gz protein complex' 'Serotonin 1A (5-HT1A) receptor-Gz protein complex with components purified separately and assembled in vitro.' ? ? '1, 2, 3, 4' 2 1 RECOMBINANT COMPLEX 'Serotonin 1A (5-HT1A) receptor' ? ? ? 3 3 1 RECOMBINANT COMPLEX 'Gz protein' ? ? ? '1, 2, 4' # _em_imaging.entry_id 9MD1 _em_imaging.id 1 _em_imaging.astigmatism ? _em_imaging.electron_beam_tilt_params ? _em_imaging.residual_tilt ? _em_imaging.microscope_model 'TFS KRIOS' _em_imaging.specimen_holder_type ? _em_imaging.specimen_holder_model ? _em_imaging.details ? _em_imaging.date ? _em_imaging.accelerating_voltage 300 _em_imaging.illumination_mode 'FLOOD BEAM' _em_imaging.mode 'BRIGHT FIELD' _em_imaging.nominal_cs ? _em_imaging.nominal_defocus_min 500 _em_imaging.nominal_defocus_max 1800 _em_imaging.calibrated_defocus_min ? _em_imaging.calibrated_defocus_max ? _em_imaging.tilt_angle_min ? _em_imaging.tilt_angle_max ? _em_imaging.nominal_magnification ? _em_imaging.calibrated_magnification ? _em_imaging.electron_source 'FIELD EMISSION GUN' _em_imaging.citation_id ? _em_imaging.temperature ? _em_imaging.detector_distance ? _em_imaging.recording_temperature_minimum ? _em_imaging.recording_temperature_maximum ? _em_imaging.alignment_procedure ? _em_imaging.c2_aperture_diameter ? _em_imaging.specimen_id 1 _em_imaging.cryogen ? # _em_sample_support.id 1 _em_sample_support.film_material ? _em_sample_support.method ? _em_sample_support.grid_material COPPER _em_sample_support.grid_mesh_size ? _em_sample_support.grid_type 'Quantifoil R1.2/1.3' _em_sample_support.details ? _em_sample_support.specimen_id 1 _em_sample_support.citation_id ? # _em_vitrification.entry_id 9MD1 _em_vitrification.id 1 _em_vitrification.specimen_id 1 _em_vitrification.cryogen_name ETHANE _em_vitrification.humidity ? _em_vitrification.temp ? _em_vitrification.chamber_temperature ? _em_vitrification.instrument 'LEICA EM GP' _em_vitrification.method ? _em_vitrification.time_resolved_state ? _em_vitrification.citation_id ? _em_vitrification.details 'Blot force 3 for 3-5 seconds was used and subsequent grids were screened for ice thickness prior to data collection.' # _em_experiment.entry_id 9MD1 _em_experiment.id 1 _em_experiment.reconstruction_method 'SINGLE PARTICLE' _em_experiment.aggregation_state PARTICLE _em_experiment.entity_assembly_id 1 # _em_single_particle_entity.entry_id 9MD1 _em_single_particle_entity.id 1 _em_single_particle_entity.image_processing_id 1 _em_single_particle_entity.point_symmetry C1 # loop_ _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_model_num _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.polymer_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.occupancy_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_ins_code _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_seq_id 1 1 Y 1 A MET 1 ? 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A ALA 137 103 1 Y 1 A GLN 138 ? A GLN 138 104 1 Y 1 A ALA 139 ? A ALA 139 105 1 Y 1 A CYS 140 ? A CYS 140 106 1 Y 1 A PHE 141 ? A PHE 141 107 1 Y 1 A SER 142 ? A SER 142 108 1 Y 1 A ARG 143 ? A ARG 143 109 1 Y 1 A SER 144 ? A SER 144 110 1 Y 1 A SER 145 ? A SER 145 111 1 Y 1 A GLU 146 ? A GLU 146 112 1 Y 1 A TYR 147 ? A TYR 147 113 1 Y 1 A HIS 148 ? A HIS 148 114 1 Y 1 A LEU 149 ? A LEU 149 115 1 Y 1 A GLU 150 ? A GLU 150 116 1 Y 1 A ASP 151 ? A ASP 151 117 1 Y 1 A ASN 152 ? A ASN 152 118 1 Y 1 A ALA 153 ? A ALA 153 119 1 Y 1 A ALA 154 ? A ALA 154 120 1 Y 1 A TYR 155 ? A TYR 155 121 1 Y 1 A TYR 156 ? A TYR 156 122 1 Y 1 A LEU 157 ? A LEU 157 123 1 Y 1 A ASN 158 ? A ASN 158 124 1 Y 1 A ASP 159 ? A ASP 159 125 1 Y 1 A LEU 160 ? A LEU 160 126 1 Y 1 A GLU 161 ? A GLU 161 127 1 Y 1 A ARG 162 ? A ARG 162 128 1 Y 1 A ILE 163 ? A ILE 163 129 1 Y 1 A ALA 164 ? A ALA 164 130 1 Y 1 A ALA 165 ? A ALA 165 131 1 Y 1 A ALA 166 ? A ALA 166 132 1 Y 1 A ASP 167 ? A ASP 167 133 1 Y 1 A TYR 168 ? 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