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ASN D 711 LYS D 717 1 ? 7 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 GLU 376 A . ? GLU 376 A PRO 377 A ? PRO 377 A 1 1.27 2 GLU 376 B . ? GLU 376 B PRO 377 B ? PRO 377 B 1 1.25 3 GLU 376 C . ? GLU 376 C PRO 377 C ? PRO 377 C 1 1.25 4 GLU 376 D . ? GLU 376 D PRO 377 D ? PRO 377 D 1 1.25 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 4 ? AA2 ? 4 ? AA3 ? 4 ? AA4 ? 4 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA1 3 4 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA2 3 4 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA3 3 4 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA4 3 4 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 LYS A 329 ? TYR A 335 ? LYS A 329 TYR A 335 AA1 2 VAL A 338 ? ASP A 344 ? VAL A 338 ASP A 344 AA1 3 ASP A 700 ? VAL A 710 ? ASP A 700 VAL A 710 AA1 4 ARG A 687 ? GLY A 692 ? ARG A 687 GLY A 692 AA2 1 LYS B 329 ? TYR B 335 ? LYS B 329 TYR B 335 AA2 2 VAL B 338 ? ASP B 344 ? VAL B 338 ASP B 344 AA2 3 ASP B 700 ? VAL B 710 ? ASP B 700 VAL B 710 AA2 4 ARG B 687 ? GLY B 692 ? ARG B 687 GLY B 692 AA3 1 LYS C 329 ? TYR C 335 ? LYS C 329 TYR C 335 AA3 2 VAL C 338 ? ASP C 344 ? VAL C 338 ASP C 344 AA3 3 ASP C 700 ? VAL C 710 ? ASP C 700 VAL C 710 AA3 4 ARG C 687 ? GLY C 692 ? ARG C 687 GLY C 692 AA4 1 LYS D 329 ? TYR D 335 ? LYS D 329 TYR D 335 AA4 2 VAL D 338 ? ASP D 344 ? VAL D 338 ASP D 344 AA4 3 ASP D 700 ? VAL D 710 ? ASP D 700 VAL D 710 AA4 4 ARG D 687 ? GLY D 692 ? ARG D 687 GLY D 692 # loop_ _pdbx_struct_sheet_hbond.sheet_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_1 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_2 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_seq_id AA1 1 2 N PHE A 330 ? N PHE A 330 O LEU A 342 ? O LEU A 342 AA1 2 3 N ARG A 339 ? N ARG A 339 O GLU A 709 ? O GLU A 709 AA1 3 4 O ARG A 702 ? O ARG A 702 N LEU A 689 ? N LEU A 689 AA2 1 2 N PHE B 330 ? N PHE B 330 O LEU B 342 ? O LEU B 342 AA2 2 3 N ARG B 339 ? N ARG B 339 O GLU B 709 ? O GLU B 709 AA2 3 4 O ARG B 702 ? O ARG B 702 N LEU B 689 ? N LEU B 689 AA3 1 2 N PHE C 330 ? N PHE C 330 O LEU C 342 ? O LEU C 342 AA3 2 3 N ARG C 339 ? N ARG C 339 O GLU C 709 ? O GLU C 709 AA3 3 4 O ARG C 702 ? O ARG C 702 N LEU C 689 ? N LEU C 689 AA4 1 2 N PHE D 330 ? N PHE D 330 O LEU D 342 ? O LEU D 342 AA4 2 3 N ARG D 339 ? N ARG D 339 O GLU D 709 ? O GLU D 709 AA4 3 4 O ARG D 702 ? O ARG D 702 N LEU D 689 ? N LEU D 689 # _pdbx_entry_details.entry_id 9MKF _pdbx_entry_details.nonpolymer_details ? _pdbx_entry_details.sequence_details ? _pdbx_entry_details.compound_details ? _pdbx_entry_details.source_details ? _pdbx_entry_details.has_ligand_of_interest Y _pdbx_entry_details.has_protein_modification N # loop_ _pdbx_validate_torsion.id _pdbx_validate_torsion.PDB_model_num _pdbx_validate_torsion.auth_comp_id _pdbx_validate_torsion.auth_asym_id _pdbx_validate_torsion.auth_seq_id _pdbx_validate_torsion.PDB_ins_code _pdbx_validate_torsion.label_alt_id _pdbx_validate_torsion.phi _pdbx_validate_torsion.psi 1 1 ASN A 292 ? ? -79.97 -169.31 2 1 GLU A 493 ? ? 60.52 65.68 3 1 LYS A 531 ? ? -128.92 -168.52 4 1 ASN B 292 ? ? -79.96 -169.33 5 1 GLU B 493 ? ? 60.49 65.68 6 1 LYS B 531 ? ? -128.89 -168.57 7 1 ASN C 292 ? ? -79.96 -169.33 8 1 GLU C 493 ? ? 60.58 65.63 9 1 LYS C 531 ? ? -128.91 -168.54 10 1 ASN D 292 ? ? -79.96 -169.37 11 1 GLU D 493 ? ? 60.58 65.60 12 1 LYS D 531 ? ? -128.91 -168.54 # _em_3d_fitting.id 1 _em_3d_fitting.entry_id 9MKF _em_3d_fitting.method ? _em_3d_fitting.target_criteria ? _em_3d_fitting.details ? _em_3d_fitting.overall_b_value ? _em_3d_fitting.ref_space ? _em_3d_fitting.ref_protocol ? # _em_3d_reconstruction.entry_id 9MKF _em_3d_reconstruction.id 1 _em_3d_reconstruction.method ? _em_3d_reconstruction.algorithm ? _em_3d_reconstruction.citation_id ? _em_3d_reconstruction.details ? _em_3d_reconstruction.resolution 2.83 _em_3d_reconstruction.resolution_method 'FSC 0.143 CUT-OFF' _em_3d_reconstruction.magnification_calibration ? _em_3d_reconstruction.nominal_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.actual_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.num_particles 50412 _em_3d_reconstruction.euler_angles_details ? _em_3d_reconstruction.num_class_averages ? _em_3d_reconstruction.refinement_type ? _em_3d_reconstruction.image_processing_id 1 _em_3d_reconstruction.symmetry_type POINT # _em_buffer.id 1 _em_buffer.specimen_id 1 _em_buffer.name ? _em_buffer.details ? _em_buffer.pH 8 # _em_entity_assembly.id 1 _em_entity_assembly.parent_id 0 _em_entity_assembly.source RECOMBINANT _em_entity_assembly.type COMPLEX _em_entity_assembly.name 'transient receptor potential vanilloid 2 bound to AV2-1 agonist' _em_entity_assembly.details ? _em_entity_assembly.synonym ? _em_entity_assembly.oligomeric_details ? _em_entity_assembly.entity_id_list 1 # _em_imaging.entry_id 9MKF _em_imaging.id 1 _em_imaging.astigmatism ? _em_imaging.electron_beam_tilt_params ? _em_imaging.residual_tilt ? _em_imaging.microscope_model 'TFS KRIOS' _em_imaging.specimen_holder_type ? _em_imaging.specimen_holder_model ? _em_imaging.details ? _em_imaging.date ? _em_imaging.accelerating_voltage 300 _em_imaging.illumination_mode 'FLOOD BEAM' _em_imaging.mode 'BRIGHT FIELD' _em_imaging.nominal_cs ? _em_imaging.nominal_defocus_min 5000 _em_imaging.nominal_defocus_max 25000 _em_imaging.calibrated_defocus_min ? _em_imaging.calibrated_defocus_max ? _em_imaging.tilt_angle_min ? _em_imaging.tilt_angle_max ? _em_imaging.nominal_magnification ? _em_imaging.calibrated_magnification ? _em_imaging.electron_source 'FIELD EMISSION GUN' _em_imaging.citation_id ? _em_imaging.temperature ? _em_imaging.detector_distance ? _em_imaging.recording_temperature_minimum ? _em_imaging.recording_temperature_maximum ? _em_imaging.alignment_procedure ? _em_imaging.c2_aperture_diameter ? _em_imaging.specimen_id 1 _em_imaging.cryogen ? _em_imaging.objective_aperture ? _em_imaging.microscope_serial_number ? _em_imaging.microscope_version ? # _em_vitrification.entry_id 9MKF _em_vitrification.id 1 _em_vitrification.specimen_id 1 _em_vitrification.cryogen_name ETHANE _em_vitrification.humidity ? _em_vitrification.temp ? _em_vitrification.chamber_temperature ? _em_vitrification.instrument ? _em_vitrification.method ? _em_vitrification.time_resolved_state ? _em_vitrification.citation_id ? _em_vitrification.details ? # _em_experiment.entry_id 9MKF _em_experiment.id 1 _em_experiment.reconstruction_method 'SINGLE PARTICLE' _em_experiment.aggregation_state PARTICLE _em_experiment.entity_assembly_id 1 # loop_ _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_model_num _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.polymer_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.occupancy_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_ins_code _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_seq_id 1 1 Y 1 A MET 1 ? A MET 1 2 1 Y 1 A THR 2 ? A THR 2 3 1 Y 1 A SER 3 ? A SER 3 4 1 Y 1 A ALA 4 ? A ALA 4 5 1 Y 1 A SER 5 ? A SER 5 6 1 Y 1 A SER 6 ? A SER 6 7 1 Y 1 A PRO 7 ? A PRO 7 8 1 Y 1 A PRO 8 ? A PRO 8 9 1 Y 1 A ALA 9 ? A ALA 9 10 1 Y 1 A PHE 10 ? A PHE 10 11 1 Y 1 A ARG 11 ? A ARG 11 12 1 Y 1 A LEU 12 ? A LEU 12 13 1 Y 1 A GLU 13 ? A GLU 13 14 1 Y 1 A THR 14 ? A THR 14 15 1 Y 1 A SER 15 ? A SER 15 16 1 Y 1 A ASP 16 ? A ASP 16 17 1 Y 1 A GLY 17 ? A GLY 17 18 1 Y 1 A ASP 18 ? A ASP 18 19 1 Y 1 A GLU 19 ? A GLU 19 20 1 Y 1 A GLU 20 ? A GLU 20 21 1 Y 1 A GLY 21 ? A GLY 21 22 1 Y 1 A ASN 22 ? A ASN 22 23 1 Y 1 A ALA 23 ? A ALA 23 24 1 Y 1 A GLU 24 ? A GLU 24 25 1 Y 1 A VAL 25 ? A VAL 25 26 1 Y 1 A ASN 26 ? A ASN 26 27 1 Y 1 A LYS 27 ? A LYS 27 28 1 Y 1 A GLY 28 ? A GLY 28 29 1 Y 1 A LYS 29 ? A LYS 29 30 1 Y 1 A GLN 30 ? A GLN 30 31 1 Y 1 A GLU 31 ? A GLU 31 32 1 Y 1 A PRO 32 ? A PRO 32 33 1 Y 1 A PRO 33 ? A PRO 33 34 1 Y 1 A PRO 34 ? A PRO 34 35 1 Y 1 A MET 35 ? A MET 35 36 1 Y 1 A GLU 36 ? A GLU 36 37 1 Y 1 A SER 37 ? A SER 37 38 1 Y 1 A PRO 38 ? A PRO 38 39 1 Y 1 A PHE 39 ? A PHE 39 40 1 Y 1 A GLN 40 ? A GLN 40 41 1 Y 1 A ARG 41 ? A ARG 41 42 1 Y 1 A GLU 42 ? A GLU 42 43 1 Y 1 A ASP 43 ? A ASP 43 44 1 Y 1 A ARG 44 ? A ARG 44 45 1 Y 1 A ASN 45 ? A ASN 45 46 1 Y 1 A SER 46 ? A SER 46 47 1 Y 1 A SER 47 ? A SER 47 48 1 Y 1 A PRO 48 ? A PRO 48 49 1 Y 1 A GLN 49 ? A GLN 49 50 1 Y 1 A ILE 50 ? A ILE 50 51 1 Y 1 A LYS 51 ? A LYS 51 52 1 Y 1 A VAL 52 ? A VAL 52 53 1 Y 1 A ASN 53 ? A ASN 53 54 1 Y 1 A LEU 54 ? A LEU 54 55 1 Y 1 A ASN 55 ? A ASN 55 56 1 Y 1 A PHE 56 ? A PHE 56 57 1 Y 1 A ILE 57 ? A ILE 57 58 1 Y 1 A LYS 58 ? A LYS 58 59 1 Y 1 A ARG 59 ? A ARG 59 60 1 Y 1 A PRO 60 ? A PRO 60 61 1 Y 1 A PRO 61 ? A PRO 61 62 1 Y 1 A LYS 62 ? A LYS 62 63 1 Y 1 A ASN 63 ? A ASN 63 64 1 Y 1 A THR 64 ? A THR 64 65 1 Y 1 A SER 65 ? A SER 65 66 1 Y 1 A ALA 66 ? A ALA 66 67 1 Y 1 A PRO 67 ? A PRO 67 68 1 Y 1 A SER 68 ? A SER 68 69 1 Y 1 A GLN 69 ? A GLN 69 70 1 Y 1 A GLN 70 ? A GLN 70 71 1 Y 1 A GLU 71 ? A GLU 71 72 1 Y 1 A PRO 72 ? A PRO 72 73 1 Y 1 A ASP 73 ? A ASP 73 74 1 Y 1 A ARG 74 ? A ARG 74 75 1 Y 1 A ASP 418 ? A ASP 418 76 1 Y 1 A GLN 419 ? A GLN 419 77 1 Y 1 A PRO 420 ? A PRO 420 78 1 Y 1 A ALA 421 ? A ALA 421 79 1 Y 1 A ILE 422 ? A ILE 422 80 1 Y 1 A PRO 423 ? A PRO 423 81 1 Y 1 A SER 424 ? A SER 424 82 1 Y 1 A SER 425 ? A SER 425 83 1 Y 1 A LYS 426 ? A LYS 426 84 1 Y 1 A ALA 427 ? A ALA 427 85 1 Y 1 A THR 428 ? A THR 428 86 1 Y 1 A PRO 565 ? A PRO 565 87 1 Y 1 A LYS 566 ? A LYS 566 88 1 Y 1 A ALA 567 ? A ALA 567 89 1 Y 1 A PRO 568 ? A PRO 568 90 1 Y 1 A GLU 569 ? A GLU 569 91 1 Y 1 A ASP 570 ? A ASP 570 92 1 Y 1 A ASN 571 ? A ASN 571 93 1 Y 1 A ASN 572 ? A ASN 572 94 1 Y 1 A SER 573 ? A SER 573 95 1 Y 1 A THR 574 ? A THR 574 96 1 Y 1 A VAL 575 ? A VAL 575 97 1 Y 1 A THR 576 ? A THR 576 98 1 Y 1 A GLU 577 ? A GLU 577 99 1 Y 1 A GLN 578 ? A GLN 578 100 1 Y 1 A PRO 579 ? A PRO 579 101 1 Y 1 A THR 580 ? A THR 580 102 1 Y 1 A VAL 581 ? 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