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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.692 ? 6871 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 4.825 ? 907 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.047 ? 529 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.005 ? 1026 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 9MML _struct.title 'RB1 Fab bound to 1A6 anti-idiotype Fab' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 9MML _struct_keywords.text 'Fab anti idiotype RSV, IMMUNE SYSTEM' _struct_keywords.pdbx_keywords 'IMMUNE SYSTEM' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 PDB 9MML 9MML ? 1 ? 1 2 PDB 9MML 9MML ? 2 ? 1 3 PDB 9MML 9MML ? 3 ? 1 4 PDB 9MML 9MML ? 4 ? 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 9MML H 1 ? 223 ? 9MML 1 ? 223 ? 1 223 2 2 9MML L 1 ? 217 ? 9MML 1 ? 217 ? 1 217 3 3 9MML M 1 ? 231 ? 9MML 1 ? 231 ? 1 231 4 4 9MML N 1 ? 214 ? 9MML 1 ? 214 ? 1 214 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details tetrameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 4 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'not applicable' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 GLN B 81 ? GLU B 85 ? GLN L 81 GLU L 85 5 ? 5 HELX_P HELX_P2 AA2 SER B 126 ? ASN B 133 ? SER L 126 ASN L 133 1 ? 8 HELX_P HELX_P3 AA3 THR B 186 ? LYS B 191 ? THR L 186 LYS L 191 1 ? 6 HELX_P HELX_P4 AA4 SER C 53 ? GLY C 57 ? SER M 53 GLY M 57 5 ? 5 HELX_P HELX_P5 AA5 LYS C 89 ? THR C 93 ? LYS M 89 THR M 93 5 ? 5 HELX_P HELX_P6 AA6 SER C 200 ? GLY C 204 ? SER M 200 GLY M 204 1 ? 5 HELX_P HELX_P7 AA7 GLN D 79 ? PHE D 83 ? GLN N 79 PHE N 83 5 ? 5 HELX_P HELX_P8 AA8 SER D 121 ? GLY D 128 ? SER N 121 GLY N 128 1 ? 8 HELX_P HELX_P9 AA9 LYS D 183 ? LYS D 188 ? LYS N 183 LYS N 188 1 ? 6 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? A CYS 22 SG ? ? ? 1_555 A CYS 96 SG ? ? H CYS 22 H CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.988 ? ? disulf2 disulf ? ? B CYS 22 SG ? ? ? 1_555 B CYS 90 SG ? ? L CYS 22 L CYS 90 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? ? disulf3 disulf ? ? C CYS 22 SG ? ? ? 1_555 C CYS 98 SG ? ? M CYS 22 M CYS 98 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? ? disulf4 disulf ? ? D CYS 23 SG ? ? ? 1_555 D CYS 88 SG ? ? N CYS 23 N CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.043 ? ? # _struct_conn_type.id disulf _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _pdbx_modification_feature.ordinal _pdbx_modification_feature.label_comp_id _pdbx_modification_feature.label_asym_id _pdbx_modification_feature.label_seq_id _pdbx_modification_feature.label_alt_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_alt_id _pdbx_modification_feature.auth_comp_id _pdbx_modification_feature.auth_asym_id _pdbx_modification_feature.auth_seq_id _pdbx_modification_feature.PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.symmetry _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.modified_residue_symmetry _pdbx_modification_feature.comp_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id _pdbx_modification_feature.ref_pcm_id _pdbx_modification_feature.ref_comp_id _pdbx_modification_feature.type _pdbx_modification_feature.category 1 CYS A 22 ? CYS A 96 ? CYS H 22 ? 1_555 CYS H 96 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 2 CYS B 22 ? CYS B 90 ? CYS L 22 ? 1_555 CYS L 90 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 3 CYS C 22 ? CYS C 98 ? CYS M 22 ? 1_555 CYS M 98 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 4 CYS D 23 ? CYS D 88 ? CYS N 23 ? 1_555 CYS N 88 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 PHE 152 A . ? PHE 152 H PRO 153 A ? PRO 153 H 1 -0.20 2 GLU 154 A . ? GLU 154 H PRO 155 A ? PRO 155 H 1 1.42 3 TYR 145 B . ? TYR 145 L PRO 146 B ? PRO 146 L 1 0.16 4 PHE 160 C . ? PHE 160 M PRO 161 C ? PRO 161 M 1 -3.32 5 GLU 162 C . ? GLU 162 M PRO 163 C ? PRO 163 M 1 -1.47 6 PHE 94 D . ? PHE 94 N PRO 95 D ? PRO 95 N 1 -0.76 7 TYR 140 D . ? TYR 140 N PRO 141 D ? PRO 141 N 1 1.63 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 4 ? AA2 ? 6 ? AA3 ? 4 ? AA4 ? 4 ? AA5 ? 4 ? AA6 ? 3 ? AA7 ? 4 ? AA8 ? 5 ? AA9 ? 4 ? AB1 ? 4 ? AB2 ? 4 ? AB3 ? 4 ? AB4 ? 4 ? AB5 ? 6 ? AB6 ? 4 ? AB7 ? 4 ? AB8 ? 4 ? AB9 ? 3 ? AC1 ? 4 ? AC2 ? 5 ? AC3 ? 4 ? AC4 ? 4 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA1 3 4 ? anti-parallel AA2 1 2 ? parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA2 3 4 ? anti-parallel AA2 4 5 ? anti-parallel AA2 5 6 ? anti-parallel AA3 1 2 ? parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA3 3 4 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA4 3 4 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA5 3 4 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA7 3 4 ? anti-parallel AA8 1 2 ? parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA8 3 4 ? anti-parallel AA8 4 5 ? anti-parallel AA9 1 2 ? parallel AA9 2 3 ? anti-parallel AA9 3 4 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB1 2 3 ? anti-parallel AB1 3 4 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB2 2 3 ? anti-parallel AB2 3 4 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB3 2 3 ? anti-parallel AB3 3 4 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB4 2 3 ? anti-parallel AB4 3 4 ? anti-parallel AB5 1 2 ? parallel AB5 2 3 ? anti-parallel AB5 3 4 ? anti-parallel AB5 4 5 ? anti-parallel AB5 5 6 ? anti-parallel AB6 1 2 ? parallel AB6 2 3 ? anti-parallel AB6 3 4 ? anti-parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB7 2 3 ? anti-parallel AB7 3 4 ? anti-parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB8 2 3 ? anti-parallel AB8 3 4 ? anti-parallel AB9 1 2 ? anti-parallel AB9 2 3 ? anti-parallel AC1 1 2 ? anti-parallel AC1 2 3 ? anti-parallel AC1 3 4 ? anti-parallel AC2 1 2 ? parallel AC2 2 3 ? anti-parallel AC2 3 4 ? anti-parallel AC2 4 5 ? anti-parallel AC3 1 2 ? anti-parallel AC3 2 3 ? anti-parallel AC3 3 4 ? anti-parallel AC4 1 2 ? anti-parallel AC4 2 3 ? anti-parallel AC4 3 4 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 GLN A 3 ? 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TYR H 182 PRO H 191 AA5 4 VAL A 175 ? LEU A 176 ? VAL H 175 LEU H 176 AA6 1 VAL A 156 ? TRP A 160 ? VAL H 156 TRP H 160 AA6 2 ILE A 201 ? HIS A 206 ? ILE H 201 HIS H 206 AA6 3 THR A 211 ? LYS A 216 ? THR H 211 LYS H 216 AA7 1 ALA B 3 ? THR B 5 ? ALA L 3 THR L 5 AA7 2 ILE B 18 ? THR B 25 ? ILE L 18 THR L 25 AA7 3 THR B 72 ? ILE B 77 ? THR L 72 ILE L 77 AA7 4 PHE B 64 ? SER B 69 ? PHE L 64 SER L 69 AA8 1 SER B 9 ? SER B 11 ? SER L 9 SER L 11 AA8 2 THR B 106 ? THR B 109 ? THR L 106 THR L 109 AA8 3 ALA B 86 ? ASP B 94 ? ALA L 86 ASP L 94 AA8 4 THR B 33 ? GLN B 40 ? THR L 33 GLN L 40 AA8 5 LYS B 47 ? TYR B 51 ? LYS L 47 TYR L 51 AA9 1 SER B 9 ? SER B 11 ? SER L 9 SER L 11 AA9 2 THR B 106 ? THR B 109 ? THR L 106 THR L 109 AA9 3 ALA B 86 ? ASP B 94 ? ALA L 86 ASP L 94 AA9 4 GLY B 99 ? PHE B 102 ? GLY L 99 PHE L 102 AB1 1 SER B 119 ? PHE B 123 ? SER L 119 PHE L 123 AB1 2 ALA B 135 ? PHE B 144 ? ALA L 135 PHE L 144 AB1 3 LYS B 176 ? LEU B 185 ? LYS L 176 LEU L 185 AB1 4 VAL B 164 ? THR B 166 ? 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