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EMDB EMD-48455 ? ? # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal _pdbx_audit_revision_history.data_content_type _pdbx_audit_revision_history.major_revision _pdbx_audit_revision_history.minor_revision _pdbx_audit_revision_history.revision_date _pdbx_audit_revision_history.part_number 1 'Structure model' 1 0 2025-05-28 ? 2 'EM metadata' 1 0 2025-05-28 ? 3 FSC 1 0 2025-05-28 ? 4 'Half map' 1 0 2025-05-28 1 5 'Half map' 1 0 2025-05-28 2 6 Image 1 0 2025-05-28 ? 7 'Primary map' 1 0 2025-05-28 ? 8 'Structure model' 1 1 2025-07-02 ? # loop_ _pdbx_audit_revision_details.ordinal _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_details.data_content_type _pdbx_audit_revision_details.provider _pdbx_audit_revision_details.type _pdbx_audit_revision_details.description _pdbx_audit_revision_details.details 1 1 'Structure model' repository 'Initial release' ? ? 2 2 'EM metadata' repository 'Initial release' ? ? 3 3 FSC repository 'Initial release' ? ? 4 4 'Half map' repository 'Initial 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'Structure of native murine cardiac thin filament variant I82N in troponin T at pCa=5.8 in Ca2+-free rotated state (upper strand)' _pdbx_database_related.db_id EMD-48455 _pdbx_database_related.content_type 'associated EM volume' # _pdbx_contact_author.id 2 _pdbx_contact_author.email galkinve@evms.edu _pdbx_contact_author.name_first Vitold _pdbx_contact_author.name_last Galkin _pdbx_contact_author.name_mi E _pdbx_contact_author.role 'principal investigator/group leader' _pdbx_contact_author.identifier_ORCID 0000-0003-1138-7565 # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Risi, C.M.' 1 0000-0002-3145-2072 'Galkin, V.E.' 2 0000-0003-1138-7565 # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country UK _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev J.Mol.Cell.Cardiol. _citation.journal_id_ASTM ? _citation.journal_id_CSD ? _citation.journal_id_ISSN 1095-8584 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume 204 _citation.language ? _citation.page_first 55 _citation.page_last 67 _citation.title ;The role of the troponin T interactions with actin in regulation of cardiac thin filament revealed by the troponin T pathogenic variant Ile79Asn. ; _citation.year 2025 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1016/j.yjmcc.2025.05.005 _citation.pdbx_database_id_PubMed 40412797 _citation.pdbx_database_id_patent ? _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Risi, C.M.' 1 ? primary 'Landim-Vieira, M.' 2 ? primary 'Belknap, B.' 3 ? primary 'Chase, P.B.' 4 ? primary 'Pinto, J.R.' 5 ? primary 'Galkin, V.E.' 6 ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description 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'polypeptide(L)' no no ;MCDDEETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITN WDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDG VTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEK SYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVLSGGTTMYPGIADRMQKEIT ALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDEAGPSIVHRKCF ; ;MCDDEETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITN WDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDG VTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEK SYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVLSGGTTMYPGIADRMQKEIT ALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDEAGPSIVHRKCF ; A,B,C,D,E,F,G ? 2 'polypeptide(L)' no no ;MDDIYKAAVEQLTEEQKNEFKAAFDIFVLGAEDGCISTKELGKVMRMLGQNPTPEELQEMIDEVDEDGSGTVDFDEFLVM MVRCMKDDSKGKSEEELSDLFRMFDKNADGYIDLDELKMMLQATGETITEDDIEELMKDGDKNNDGRIDYDEFLEFMKGV E ; ;MDDIYKAAVEQLTEEQKNEFKAAFDIFVLGAEDGCISTKELGKVMRMLGQNPTPEELQEMIDEVDEDGSGTVDFDEFLVM MVRCMKDDSKGKSEEELSDLFRMFDKNADGYIDLDELKMMLQATGETITEDDIEELMKDGDKNNDGRIDYDEFLEFMKGV E ; H ? 3 'polypeptide(L)' no no ;MADESSDAAGEPQPAPAPVRRRSSANYRAYATEPHAKKKSKISASRKLQLKTLMLQIAKQEMEREAEERRGEKGRVLRTR CQPLELDGLGFEELQDLCRQLHARVDKVDEERYDVEAKVTKNITEIADLTQKIYDLRGKFKRPTLRRVRISADAMMQALL GTRAKESLDLRAHLKQVKKEDIEKENREVGDWRKNIDALSGMEGRKKKFEG ; ;MADESSDAAGEPQPAPAPVRRRSSANYRAYATEPHAKKKSKISASRKLQLKTLMLQIAKQEMEREAEERRGEKGRVLRTR CQPLELDGLGFEELQDLCRQLHARVDKVDEERYDVEAKVTKNITEIADLTQKIYDLRGKFKRPTLRRVRISADAMMQALL GTRAKESLDLRAHLKQVKKEDIEKENREVGDWRKNIDALSGMEGRKKKFEG ; I ? 4 'polypeptide(L)' no no ;MSDIEEVVEEYEEEEQEEAAVEEQEEAAEEDAEAEAETEETRAEEDEEEEEAKEAEDGPMEESKPKPRSFMPNLVPPKNP DGERVDFDDIHRKRMEKDLNELQALIEAHFENRKKEEEELVSLKDRIERRRAERAEQQRIRNEREKERQNRLAEERARRE EEENRRKAEDEARKKKALSNMMHFGGYIQKQAQTERKSGKRQTEREKKKKILAERRKVLAIDHLNEDQLREKAKELWQSI YNLEAEKFDLQEKFKQQKYEINVLRNRINDNQKVSKTRGKAKVTGRWK ; ;MSDIEEVVEEYEEEEQEEAAVEEQEEAAEEDAEAEAETEETRAEEDEEEEEAKEAEDGPMEESKPKPRSFMPNLVPPKNP DGERVDFDDIHRKRMEKDLNELQALIEAHFENRKKEEEELVSLKDRIERRRAERAEQQRIRNEREKERQNRLAEERARRE EEENRRKAEDEARKKKALSNMMHFGGYIQKQAQTERKSGKRQTEREKKKKILAERRKVLAIDHLNEDQLREKAKELWQSI YNLEAEKFDLQEKFKQQKYEINVLRNRINDNQKVSKTRGKAKVTGRWK ; J,K ? 5 'polypeptide(L)' no no ;MDAIKKKMQMLKLDKENALDRAEQAEADKKAAEDRSKQLEDELVSLQKKLKGTEDELDKYSEALKDAQEKLELAEKKATD AEADVASLNRRIQLVEEELDRAQERLATALQKLEEAEKAADESERGMKVIESRAQKDEEKMEIQEIQLKEAKHIAEDADR KYEEVARKLVIIESDLERAEERAELSEGKCAELEEELKTVTNNLKSLEAQAEKYSQKEDKYEEEIKVLSDKLKEAETRAE FAERSVTKLEKSIDDLEDELYAQKLKYKAISEELDHALNDMTSI ; ;MDAIKKKMQMLKLDKENALDRAEQAEADKKAAEDRSKQLEDELVSLQKKLKGTEDELDKYSEALKDAQEKLELAEKKATD AEADVASLNRRIQLVEEELDRAQERLATALQKLEEAEKAADESERGMKVIESRAQKDEEKMEIQEIQLKEAKHIAEDADR KYEEVARKLVIIESDLERAEERAELSEGKCAELEEELKTVTNNLKSLEAQAEKYSQKEDKYEEEIKVLSDKLKEAETRAE FAERSVTKLEKSIDDLEDELYAQKLKYKAISEELDHALNDMTSI ; L,M,N,O ? # loop_ _pdbx_entity_nonpoly.entity_id _pdbx_entity_nonpoly.name _pdbx_entity_nonpoly.comp_id 6 "ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE" ADP 7 'MAGNESIUM ION' MG # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET n 1 2 CYS n 1 3 ASP n 1 4 ASP n 1 5 GLU n 1 6 GLU n 1 7 THR n 1 8 THR n 1 9 ALA n 1 10 LEU n 1 11 VAL n 1 12 CYS n 1 13 ASP n 1 14 ASN n 1 15 GLY n 1 16 SER n 1 17 GLY n 1 18 LEU n 1 19 VAL n 1 20 LYS n 1 21 ALA n 1 22 GLY n 1 23 PHE n 1 24 ALA n 1 25 GLY n 1 26 ASP n 1 27 ASP n 1 28 ALA n 1 29 PRO n 1 30 ARG n 1 31 ALA n 1 32 VAL n 1 33 PHE n 1 34 PRO n 1 35 SER n 1 36 ILE n 1 37 VAL n 1 38 GLY n 1 39 ARG n 1 40 PRO n 1 41 ARG n 1 42 HIS n 1 43 GLN n 1 44 GLY n 1 45 VAL n 1 46 MET n 1 47 VAL n 1 48 GLY n 1 49 MET n 1 50 GLY n 1 51 GLN n 1 52 LYS n 1 53 ASP n 1 54 SER n 1 55 TYR n 1 56 VAL n 1 57 GLY n 1 58 ASP n 1 59 GLU n 1 60 ALA n 1 61 GLN n 1 62 SER n 1 63 LYS n 1 64 ARG n 1 65 GLY n 1 66 ILE n 1 67 LEU n 1 68 THR n 1 69 LEU n 1 70 LYS n 1 71 TYR n 1 72 PRO n 1 73 ILE n 1 74 GLU n 1 75 HIS 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ASP O 2 ASP O 55 1 ? 54 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role metalc1 metalc ? ? 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