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_citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Vigneron, S.F.' 1 0000-0003-2671-3044 primary 'Ohno, S.' 2 0000-0002-2414-5066 primary 'Braz, J.' 3 ? primary 'Kim, J.Y.' 4 0000-0002-6816-5958 primary 'Kweon, O.S.' 5 0000-0001-6588-3420 primary 'Webb, C.' 6 0000-0003-2784-0408 primary 'Billesbolle, C.' 7 0000-0001-8084-1552 primary 'Bhardwaj, K.' 8 0009-0000-1769-0210 primary 'Irwin, J.' 9 0000-0002-1195-6417 primary 'Manglik, A.' 10 0000-0002-7173-3741 primary 'Basbaum, A.I.' 11 0000-0002-1710-6333 primary 'Ellman, J.A.' 12 0000-0001-9320-5512 primary 'Shoichet, B.K.' 13 0000-0002-6098-7367 # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer man 'Kappa-Opioid Receptor' 43626.902 2 ? ? ? ? 2 polymer man 'Nanobody 6M' 14418.919 1 ? ? ? ? 3 polymer man 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GLU E 88 THR E 92 5 ? 5 HELX_P HELX_P30 AD3 ASN D 31 ? SER D 33 ? ASN H 28 SER H 30 5 ? 3 HELX_P HELX_P31 AD4 ARG D 90 ? THR D 94 ? ARG H 86 THR H 90 5 ? 5 HELX_P HELX_P32 AD5 TYR D 105 ? ALA D 110 ? TYR H 101 ALA H 106 1 ? 6 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? A CYS 139 SG ? ? ? 1_555 A CYS 218 SG ? ? A CYS 131 A CYS 210 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf2 disulf ? ? C CYS 22 SG ? ? ? 1_555 C CYS 95 SG ? ? E CYS 24 E CYS 97 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf3 disulf ? ? D CYS 25 SG ? ? ? 1_555 D CYS 99 SG ? ? H CYS 22 H CYS 95 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf4 disulf ? ? E CYS 24 SG ? ? ? 1_555 E CYS 89 SG ? ? L CYS 23 L CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? # _struct_conn_type.id disulf _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _pdbx_modification_feature.ordinal _pdbx_modification_feature.label_comp_id _pdbx_modification_feature.label_asym_id _pdbx_modification_feature.label_seq_id _pdbx_modification_feature.label_alt_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_alt_id _pdbx_modification_feature.auth_comp_id _pdbx_modification_feature.auth_asym_id _pdbx_modification_feature.auth_seq_id _pdbx_modification_feature.PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.symmetry _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.modified_residue_symmetry _pdbx_modification_feature.comp_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id _pdbx_modification_feature.ref_pcm_id _pdbx_modification_feature.ref_comp_id _pdbx_modification_feature.type _pdbx_modification_feature.category 1 CYS A 139 ? CYS A 218 ? CYS A 131 ? 1_555 CYS A 210 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 2 CYS C 22 ? CYS C 95 ? CYS E 24 ? 1_555 CYS E 97 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 3 CYS D 25 ? CYS D 99 ? CYS H 22 ? 1_555 CYS H 95 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 4 CYS E 24 ? CYS E 89 ? CYS L 23 ? 1_555 CYS L 88 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 2 ? AA2 ? 2 ? AA3 ? 4 ? AA4 ? 4 ? AA5 ? 6 ? AA6 ? 4 ? AA7 ? 4 ? AA8 ? 5 ? AA9 ? 5 ? AB1 ? 6 ? AB2 ? 4 ? 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SER L 10 SER L 12 AB2 2 THR E 103 ? GLU E 106 ? THR L 102 GLU L 105 AB2 3 THR E 86 ? SER E 92 ? THR L 85 SER L 91 AB2 4 ILE E 97 ? PHE E 99 ? ILE L 96 PHE L 98 AB3 1 ILE E 22 ? ARG E 25 ? ILE L 21 ARG L 24 AB3 2 ASP E 71 ? ILE E 76 ? ASP L 70 ILE L 75 AB3 3 PHE E 63 ? SER E 66 ? PHE L 62 SER L 65 # loop_ _pdbx_struct_sheet_hbond.sheet_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_1 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_2 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_seq_id AA1 1 2 N LYS A 208 ? N LYS A 200 O GLU A 217 ? O GLU A 209 AA2 1 2 N LYS B 208 ? N LYS B 200 O GLU B 217 ? O GLU B 209 AA3 1 2 N VAL C 5 ? N VAL E 7 O ALA C 23 ? O ALA E 25 AA3 2 3 N CYS C 22 ? N CYS E 24 O VAL C 78 ? O VAL E 80 AA3 3 4 O MET C 82 ? O MET E 84 N LEU C 18 ? N LEU E 20 AA4 1 2 N VAL C 5 ? N VAL E 7 O ALA C 23 ? O ALA E 25 AA4 2 3 N CYS C 22 ? N CYS E 24 O VAL C 78 ? O VAL E 80 AA4 3 4 O GLN C 81 ? O GLN E 83 N THR C 68 ? N THR E 70 AA5 1 2 N VAL C 12 ? N VAL E 14 O THR C 118 ? O THR E 120 AA5 2 3 O THR C 115 ? O THR E 117 N TYR C 93 ? N TYR E 95 AA5 3 4 O TYR C 94 ? O TYR E 96 N PHE C 37 ? N PHE E 39 AA5 4 5 N ARG C 38 ? N ARG E 40 O GLU C 46 ? O GLU E 48 AA5 5 6 N SER C 50 ? N SER E 52 O LYS C 58 ? O LYS E 60 AA6 1 2 N VAL C 12 ? N VAL E 14 O THR C 118 ? O THR E 120 AA6 2 3 O THR C 115 ? O THR E 117 N TYR C 93 ? N TYR E 95 AA6 3 4 N ALA C 97 ? N ALA E 99 O GLY C 110 ? O GLY E 112 AA7 1 2 N VAL D 8 ? N VAL H 5 O ALA D 26 ? O ALA H 23 AA7 2 3 N LEU D 23 ? N LEU H 20 O LEU D 84 ? 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