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'principal investigator/group leader' 0000-0001-9195-2282 4 gdbowman@jhu.edu Gregory Bowman D 'principal investigator/group leader' 0000-0001-8025-4315 # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Nodelman, I.M.' 1 0000-0003-1181-6913 'Folkwein, H.J.' 2 0000-0002-2951-5863 'Armache, J.-P.' 3 0000-0001-9195-2282 'Bowman, G.D.' 4 0000-0001-8025-4315 # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country US _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev Nat.Struct.Mol.Biol. _citation.journal_id_ASTM ? _citation.journal_id_CSD ? _citation.journal_id_ISSN 1545-9985 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume 32 _citation.language ? _citation.page_first 1445 _citation.page_last 1455 _citation.title 'A competitive 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;TRAKAKTRSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGNYAERVGAGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKTRIIPRHLQLAVRN DEELNKLLGRVTIAQGGVLPNIQSVLLPKK ; C,G ? 3 'polypeptide(L)' no no ;TRKESYAIYVYKVLKQVHPDTGISCKAMSIMNSFVNDVFERIAGEASRLAHYNKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHAV SEGTKAVTKYTSAK ; ;TRKESYAIYVYKVLKQVHPDTGISCKAMSIMNSFVNDVFERIAGEASRLAHYNKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHAV SEGTKAVTKYTSAK ; D,H ? 4 'polypeptide(L)' no no ;HRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSSAVMALQEASEAYLVALFEDTNLCAIHAKRVT IMPKDIQLARRIRGERA ; ;HRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSSAVMALQEASEAYLVALFEDTNLCAIHAKRVT IMPKDIQLARRIRGERA ; E,A ? 5 'polypeptide(L)' no no ;KIPTRFSNRQNKTVNYNIDYSDDDLLESEDDYGSEEALSEENVHEASANPQPEDFHGIDIVINHRLKTSLEEGKVLEKTV PDLNNCKENYEFLIKWTDESHLHNTWETYESIGQVRGLKRLDNYCKQFIIEDQQVRLDPYVTAEDIEIMDMERERRLDEF EEFHVPERIIDSQRASLEDGTSQLQYLVKWRRLNYDEATWENATDIVKLAPEQVKHFQNRENSKILPQYSSNYTSQRPRF EKLSVQPPFIKGGELRDFQLTGINWMAFLWSKGDNGILADEMGLGKTVQTVAFISWLIFARRQNGPHIIVVPLSTMPAWL 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EEFHVPERIIDSQRASLEDGTSQLQYLVKWRRLNYDEATWENATDIVKLAPEQVKHFQNRENSKILPQYSSNYTSQRPRF EKLSVQPPFIKGGELRDFQLTGINWMAFLWSKGDNGILADEMGLGKTVQTVAFISWLIFARRQNGPHIIVVPLSTMPAWL DTFEKWAPDLNCICYMGNQKSRDTIREYEFYTNPRAKGKKTMKFNVLLTTYEYILKDRAELGSIKWQFMAVDEAHRLKNA ESSLYESLNSFKVANRMLITGTPLQNNIKELAALVNFLMPGRFTIDQEIDFENQDEEQEEYIHDLHRRIQPFILRRLKKD VEKSLPSKTERILRVELSDVQTEYYKNILTKNYSALTAGAKGGHFSLLNIMNELKKASNHPYLFDNAEERVLQKFGDGKM TRENVLRGLIMSSGKMVLLDQLLTRLKKDGHRVLIFSQMVRMLDILGDYLSIKGINFQRLDGTVPSAQRRISIDHFNSPD SNDFVFLLSTRAGGLGINLMTADTVVIFDSDWNPQADLQAMARAHRIGQKNHVMVYRLVSKDTVEEEVLERARKKMILEY AIISLGVTDGNKYTKKNEPNAGELSAILKFGAGNMFTATDNQKKGEDGNGDDVLNHAEDHVTTPDLGESHLGGEEFLKQF EVTDYKADIDWDDIIPEEELKKLQDEEQKRKDEEYVKEQLEMMNRRDNALKKIKNSVNGDGTAANSDSDDDSTSRSSRRR ARANDMDSIGESEVRALYKAILKFGNLKEILDELIADGTLPVKSFEKYGETYDEMMEAAKDCVHEEEKNRKEILEKLEKH ATAYRAKLKSGEIKAENQPKDNPLTRLSLKKREKKAVLFNFKGVKSLNAESLLSRVEDLKYLKNLINSNYKDDPLKFSLG NNTPKPVQNWSSNWTKEEDEKLLIGVFKYGYGSWTQIRDDPFLGITDKIFLNEVHNPVAKKSASSSDTTPTPSKKGKGIT GSSKKVPGAIHLGRRVDYLLSFLR ; L,K ? 6 polydeoxyribonucleotide no no ;(DC)(DC)(DC)(DT)(DA)(DT)(DA)(DC)(DG)(DC)(DG)(DG)(DC)(DC)(DG)(DC)(DC)(DC)(DT)(DG) (DG)(DA)(DG)(DA)(DA)(DT)(DC)(DC)(DC)(DG)(DG)(DT)(DG)(DC)(DC)(DG)(DA)(DG)(DG)(DC) (DC)(DG)(DC)(DT)(DC)(DA)(DA)(DT)(DT)(DG)(DG)(DT)(DC)(DG)(DT)(DA)(DG)(DA)(DC)(DA) (DG)(DC)(DT)(DC)(DT)(DA)(DG)(DC)(DA)(DA)(DC)(DC)(DG)(DC)(DT)(DT)(DA)(DA)(DA)(DC) (DG)(DC)(DA)(DC)(DG)(DT)(DA)(DC)(DG)(DC)(DG)(DC)(DT)(DG)(DT)(DC)(DC)(DC)(DC)(DC) (DG)(DC)(DG)(DT)(DT)(DT)(DT)(DA)(DA)(DC)(DC)(DG)(DC)(DC)(DA)(DA)(DG)(DG)(DG)(DG) (DA)(DT)(DT)(DA)(DC)(DT)(DC)(DC)(DC)(DT)(DA)(DG)(DT)(DC)(DT)(DC)(DC)(DA)(DG)(DG) (DC)(DA)(DC)(DG)(DT)(DG)(DT)(DC)(DA)(DG)(DA)(DT)(DA)(DT)(DA)(DT)(DA)(DC)(DA)(DT) (DC)(DC) ; ;CCCTATACGCGGCCGCCCTGGAGAATCCCGGTGCCGAGGCCGCTCAATTGGTCGTAGACAGCTCTAGCAACCGCTTAAAC GCACGTACGCGCTGTCCCCCGCGTTTTAACCGCCAAGGGGATTACTCCCTAGTCTCCAGGCACGTGTCAGATATATACAT CC ; I ? 7 polydeoxyribonucleotide no no ;(DG)(DG)(DA)(DT)(DG)(DT)(DA)(DT)(DA)(DT)(DA)(DT)(DC)(DT)(DG)(DA)(DC)(DA)(DC)(DG) 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J HIS 1131 CG 1204 1 Y 1 K HIS 1252 ? ND1 ? J HIS 1131 ND1 1205 1 Y 1 K HIS 1252 ? CD2 ? J HIS 1131 CD2 1206 1 Y 1 K HIS 1252 ? CE1 ? J HIS 1131 CE1 1207 1 Y 1 K HIS 1252 ? NE2 ? J HIS 1131 NE2 1208 1 Y 1 K LEU 1253 ? CG ? J LEU 1132 CG 1209 1 Y 1 K LEU 1253 ? CD1 ? J LEU 1132 CD1 1210 1 Y 1 K LEU 1253 ? CD2 ? J LEU 1132 CD2 1211 1 Y 1 K ARG 1255 ? CG ? J ARG 1134 CG 1212 1 Y 1 K ARG 1255 ? CD ? J ARG 1134 CD 1213 1 Y 1 K ARG 1255 ? NE ? J ARG 1134 NE 1214 1 Y 1 K ARG 1255 ? CZ ? J ARG 1134 CZ 1215 1 Y 1 K ARG 1255 ? NH1 ? J ARG 1134 NH1 1216 1 Y 1 K ARG 1255 ? NH2 ? J ARG 1134 NH2 1217 1 Y 1 K ARG 1256 ? CG ? J ARG 1135 CG 1218 1 Y 1 K ARG 1256 ? CD ? J ARG 1135 CD 1219 1 Y 1 K ARG 1256 ? NE ? J ARG 1135 NE 1220 1 Y 1 K ARG 1256 ? CZ ? J ARG 1135 CZ 1221 1 Y 1 K ARG 1256 ? NH1 ? J ARG 1135 NH1 1222 1 Y 1 K ARG 1256 ? NH2 ? J ARG 1135 NH2 1223 1 Y 1 K VAL 1257 ? CG1 ? J VAL 1136 CG1 1224 1 Y 1 K VAL 1257 ? CG2 ? J VAL 1136 CG2 1225 1 Y 1 K ASP 1258 ? CG ? 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E N N 2 ? F N N 3 ? G N N 4 ? H N N 4 ? I N N 5 ? J N N 5 ? K N N 6 ? L N N 7 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP H4_XENLA P62799 ? 1 ;AKRHRKVLRDNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEETRGVLKVFLENVIRDAVTYTEHAKRKTVTAMDVVYALKRQG RTLYGFGG ; 16 2 UNP Q6AZJ8_XENLA Q6AZJ8 ? 2 ;TRAKAKTRSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGNYAERVGAGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKTRIIPRHLQLAVRN DEELNKLLGRVTIAQGGVLPNIQSVLLPKK ; 11 3 UNP A0A8J1LZU9_XENLA A0A8J1LZU9 ? 3 ;TRKESYAIYVYKVLKQVHPDTGISSKAMSIMNSFVNDVFERIAGEASRLAHYNKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHAV SEGTKAVTKYTSAK ; 33 4 UNP H32_XENLA P84233 ? 4 ;HRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSSAVMALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVT IMPKDIQLARRIRGERA ; 40 5 UNP CHD1_YEAST P32657 ? 5 ;KIPTRFSNRQNKTVNYNIDYSDDDLLESEDDYGSEEALSEENVHEASANPQPEDFHGIDIVINHRLKTSLEEGKVLEKTV PDLNNCKENYEFLIKWTDESHLHNTWETYESIGQVRGLKRLDNYCKQFIIEDQQVRLDPYVTAEDIEIMDMERERRLDEF EEFHVPERIIDSQRASLEDGTSQLQYLVKWRRLNYDEATWENATDIVKLAPEQVKHFQNRENSKILPQYSSNYTSQRPRF EKLSVQPPFIKGGELRDFQLTGINWMAFLWSKGDNGILADEMGLGKTVQTVAFISWLIFARRQNGPHIIVVPLSTMPAWL DTFEKWAPDLNCICYMGNQKSRDTIREYEFYTNPRAKGKKTMKFNVLLTTYEYILKDRAELGSIKWQFMAVDEAHRLKNA ESSLYESLNSFKVANRMLITGTPLQNNIKELAALVNFLMPGRFTIDQEIDFENQDEEQEEYIHDLHRRIQPFILRRLKKD VEKSLPSKTERILRVELSDVQTEYYKNILTKNYSALTAGAKGGHFSLLNIMNELKKASNHPYLFDNAEERVLQKFGDGKM TRENVLRGLIMSSGKMVLLDQLLTRLKKDGHRVLIFSQMVRMLDILGDYLSIKGINFQRLDGTVPSAQRRISIDHFNSPD SNDFVFLLSTRAGGLGINLMTADTVVIFDSDWNPQADLQAMARAHRIGQKNHVMVYRLVSKDTVEEEVLERARKKMILEY AIISLGVTDGNKYTKKNEPNAGELSAILKFGAGNMFTATDNQKKLEDLNLDDVLNHAEDHVTTPDLGESHLGGEEFLKQF EVTDYKADIDWDDIIPEEELKKLQDEEQKRKDEEYVKEQLEMMNRRDNALKKIKNSVNGDGTAANSDSDDDSTSRSSRRR ARANDMDSIGESEVRALYKAILKFGNLKEILDELIADGTLPVKSFEKYGETYDEMMEAAKDCVHEEEKNRKEILEKLEKH ATAYRAKLKSGEIKAENQPKDNPLTRLSLKKREKKAVLFNFKGVKSLNAESLLSRVEDLKYLKNLINSNYKDDPLKFSLG NNTPKPVQNWSSNWTKEEDEKLLIGVFKYGYGSWTQIRDDPFLGITDKIFLNEVHNPVAKKSASSSDTTPTPSKKGKGIT GSSKKVPGAIHLGRRVDYLLSFLR ; 122 6 PDB 9N6K 9N6K ? 6 ? 1 7 PDB 9N6K 9N6K ? 7 ? 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 9N6K B 1 ? 88 ? 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P32657 122 ? 1265 ? 122 1265 11 6 9N6K I 1 ? 162 ? 9N6K -91 ? 70 ? -91 70 12 7 9N6K J 1 ? 162 ? 9N6K -70 ? 91 ? -70 91 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 3 9N6K CYS D 25 ? UNP A0A8J1LZU9 SER 57 conflict 53 1 6 9N6K CYS H 25 ? UNP A0A8J1LZU9 SER 57 conflict 53 2 7 9N6K ALA E 64 ? UNP P84233 GLY 103 conflict 102 3 8 9N6K ALA A 64 ? UNP P84233 GLY 103 conflict 102 4 9 9N6K GLY L 765 ? UNP P32657 LEU 886 'engineered mutation' 886 5 9 9N6K GLY L 768 ? UNP P32657 LEU 889 'engineered mutation' 889 6 9 9N6K GLY L 770 ? 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UNP P32657 LEU 891 'engineered mutation' 891 10 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dodecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 12 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'not applicable' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 ASP A 10 ? 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WATSON-CRICK ? ? ? hydrog36 hydrog ? ? K DC 16 N3 ? ? ? 1_555 L DG 147 N1 ? ? I DC -76 J DG 76 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog37 hydrog ? ? K DC 16 N4 ? ? ? 1_555 L DG 147 O6 ? ? I DC -76 J DG 76 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog38 hydrog ? ? K DC 16 O2 ? ? ? 1_555 L DG 147 N2 ? ? I DC -76 J DG 76 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog39 hydrog ? ? K DC 17 N3 ? ? ? 1_555 L DG 146 N1 ? ? I DC -75 J DG 75 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog40 hydrog ? ? K DC 17 N4 ? ? ? 1_555 L DG 146 O6 ? ? I DC -75 J DG 75 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog41 hydrog ? ? K DC 17 O2 ? ? ? 1_555 L DG 146 N2 ? ? I DC -75 J DG 75 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog42 hydrog ? ? K DC 18 N3 ? ? ? 1_555 L DG 145 N1 ? ? I DC -74 J DG 74 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog43 hydrog ? ? K DC 18 N4 ? ? ? 1_555 L DG 145 O6 ? ? I DC -74 J DG 74 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog44 hydrog ? ? K DC 18 O2 ? ? ? 1_555 L DG 145 N2 ? ? 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