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UNP P42212 SER 65 conflict 818 9 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details tetrameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 4 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'not applicable' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 THR A 196 ? LYS A 204 ? THR A 196 LYS A 204 1 ? 9 HELX_P HELX_P2 AA2 LYS A 204 ? ILE A 209 ? LYS A 204 ILE A 209 1 ? 6 HELX_P HELX_P3 AA3 GLN A 211 ? TYR A 224 ? GLN A 211 TYR A 224 1 ? 14 HELX_P HELX_P4 AA4 TYR A 224 ? ASP A 244 ? TYR A 224 ASP A 244 1 ? 21 HELX_P HELX_P5 AA5 MET A 246 ? TYR A 257 ? MET A 246 TYR A 257 1 ? 12 HELX_P HELX_P6 AA6 ASP A 259 ? LYS A 264 ? ASP A 259 LYS A 264 1 ? 6 HELX_P HELX_P7 AA7 ALA A 267 ? LEU A 285 ? ALA A 267 LEU A 285 1 ? 19 HELX_P HELX_P8 AA8 GLU A 286 ? GLU A 298 ? GLU A 286 GLU A 298 1 ? 13 HELX_P HELX_P9 AA9 ARG B 328 ? ASP B 392 ? ARG D 273 ASP D 337 1 ? 65 HELX_P HELX_P10 AB1 THR B 393 ? ASP B 423 ? THR D 338 ASP D 368 1 ? 31 HELX_P HELX_P11 AB2 ALA C 8 ? GLN C 26 ? ALA E 8 GLN E 26 1 ? 19 HELX_P HELX_P12 AB3 SER C 36 ? ILE C 41 ? SER E 36 ILE E 41 1 ? 6 HELX_P HELX_P13 AB4 LYS C 46 ? ASN C 51 ? LYS E 46 ASN E 51 1 ? 6 HELX_P HELX_P14 AB5 ASN C 51 ? HIS C 79 ? ASN E 51 HIS E 79 1 ? 29 HELX_P HELX_P15 AB6 PRO C 730 ? ASP C 754 ? PRO E 681 ASP E 705 1 ? 25 HELX_P HELX_P16 AB7 GLU C 758 ? THR C 763 ? GLU E 709 THR E 714 1 ? 6 HELX_P HELX_P17 AB8 VAL C 768 ? TRP C 778 ? VAL E 719 TRP E 729 1 ? 11 HELX_P HELX_P18 AB9 VAL C 782 ? TYR C 789 ? VAL E 733 TYR E 740 1 ? 8 HELX_P HELX_P19 AC1 ASP C 790 ? THR C 796 ? ASP E 741 THR E 747 1 ? 7 HELX_P HELX_P20 AC2 SER D 2 ? LEU D 9 ? SER C 2 LEU C 9 1 ? 8 HELX_P HELX_P21 AC3 GLY D 14 ? LYS D 20 ? GLY C 14 LYS C 20 1 ? 7 HELX_P HELX_P22 AC4 LEU D 21 ? PHE D 26 ? LEU C 21 PHE C 26 1 ? 6 HELX_P HELX_P23 AC5 TRP D 28 ? ALA D 35 ? TRP C 28 ALA C 35 1 ? 8 HELX_P HELX_P24 AC6 ALA D 35 ? LEU D 52 ? ALA C 35 LEU C 52 1 ? 18 HELX_P HELX_P25 AC7 SER D 53 ? GLY D 67 ? SER C 53 GLY C 67 1 ? 15 HELX_P HELX_P26 AC8 PRO D 541 ? ARG D 571 ? PRO C 541 ARG C 571 1 ? 31 HELX_P HELX_P27 AC9 ARG D 571 ? ASP D 590 ? ARG C 571 ASP C 590 1 ? 20 HELX_P HELX_P28 AD1 ARG D 597 ? SER D 617 ? ARG C 597 SER C 617 1 ? 21 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # _struct_conn.id disulf1 _struct_conn.conn_type_id disulf _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag ? _struct_conn.pdbx_PDB_id ? _struct_conn.ptnr1_label_asym_id B _struct_conn.ptnr1_label_comp_id CYS _struct_conn.ptnr1_label_seq_id 326 _struct_conn.ptnr1_label_atom_id SG _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id ? _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code ? _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id ? _struct_conn.ptnr1_symmetry 1_555 _struct_conn.ptnr2_label_asym_id B _struct_conn.ptnr2_label_comp_id CYS _struct_conn.ptnr2_label_seq_id 329 _struct_conn.ptnr2_label_atom_id SG _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id ? _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code ? _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id D _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id CYS _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id 271 _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id D _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id CYS _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id 274 _struct_conn.ptnr2_symmetry 1_555 _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id ? _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id ? _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id ? _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id ? _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id ? _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code ? _struct_conn.details ? _struct_conn.pdbx_dist_value 2.036 _struct_conn.pdbx_value_order ? _struct_conn.pdbx_role ? # _struct_conn_type.id disulf _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # _pdbx_modification_feature.ordinal 1 _pdbx_modification_feature.label_comp_id CYS _pdbx_modification_feature.label_asym_id B _pdbx_modification_feature.label_seq_id 326 _pdbx_modification_feature.label_alt_id ? _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_comp_id CYS _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_asym_id B _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_seq_id 329 _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_alt_id ? _pdbx_modification_feature.auth_comp_id CYS _pdbx_modification_feature.auth_asym_id D _pdbx_modification_feature.auth_seq_id 271 _pdbx_modification_feature.PDB_ins_code ? _pdbx_modification_feature.symmetry 1_555 _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_comp_id CYS _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_asym_id D _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_seq_id 274 _pdbx_modification_feature.modified_residue_PDB_ins_code ? _pdbx_modification_feature.modified_residue_symmetry 1_555 _pdbx_modification_feature.comp_id_linking_atom SG _pdbx_modification_feature.modified_residue_id_linking_atom SG _pdbx_modification_feature.modified_residue_id . _pdbx_modification_feature.ref_pcm_id . _pdbx_modification_feature.ref_comp_id . _pdbx_modification_feature.type None _pdbx_modification_feature.category 'Disulfide bridge' # _pdbx_entry_details.entry_id 9NA9 _pdbx_entry_details.nonpolymer_details ? _pdbx_entry_details.sequence_details ? _pdbx_entry_details.compound_details ? _pdbx_entry_details.source_details ? _pdbx_entry_details.has_ligand_of_interest ? _pdbx_entry_details.has_protein_modification Y # loop_ _pdbx_validate_close_contact.id _pdbx_validate_close_contact.PDB_model_num _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_2 _pdbx_validate_close_contact.dist 1 1 OG E SER 5 ? ? OG1 E THR 77 ? ? 2.16 2 1 O A MET 236 ? ? N A ARG 240 ? ? 2.18 3 1 O D ARG 273 ? ? OG1 D THR 276 ? ? 2.18 4 1 O A LEU 219 ? ? N A GLY 223 ? ? 2.19 # loop_ _pdbx_validate_torsion.id _pdbx_validate_torsion.PDB_model_num _pdbx_validate_torsion.auth_comp_id _pdbx_validate_torsion.auth_asym_id _pdbx_validate_torsion.auth_seq_id _pdbx_validate_torsion.PDB_ins_code _pdbx_validate_torsion.label_alt_id _pdbx_validate_torsion.phi _pdbx_validate_torsion.psi 1 1 TYR A 224 ? ? -101.33 -60.32 2 1 LYS D 272 ? ? 61.55 -8.09 3 1 ASN E 84 ? ? 56.34 -127.01 4 1 TRP E 707 ? ? -171.19 141.82 5 1 THR E 714 ? ? -160.99 118.43 6 1 ASP E 722 ? ? 68.62 -8.56 7 1 HIS E 732 ? ? -174.14 148.30 8 1 LYS C 68 ? ? 72.52 -4.86 # _pdbx_validate_peptide_omega.id 1 _pdbx_validate_peptide_omega.PDB_model_num 1 _pdbx_validate_peptide_omega.auth_comp_id_1 LYS _pdbx_validate_peptide_omega.auth_asym_id_1 D _pdbx_validate_peptide_omega.auth_seq_id_1 272 _pdbx_validate_peptide_omega.PDB_ins_code_1 ? _pdbx_validate_peptide_omega.label_alt_id_1 ? _pdbx_validate_peptide_omega.auth_comp_id_2 ARG _pdbx_validate_peptide_omega.auth_asym_id_2 D _pdbx_validate_peptide_omega.auth_seq_id_2 273 _pdbx_validate_peptide_omega.PDB_ins_code_2 ? _pdbx_validate_peptide_omega.label_alt_id_2 ? _pdbx_validate_peptide_omega.omega 142.63 # _space_group_symop.id 1 _space_group_symop.operation_xyz x,y,z # _em_3d_fitting.id 1 _em_3d_fitting.entry_id 9NA9 _em_3d_fitting.method ? _em_3d_fitting.target_criteria ? _em_3d_fitting.details ? _em_3d_fitting.overall_b_value ? _em_3d_fitting.ref_space ? _em_3d_fitting.ref_protocol ? # _em_3d_reconstruction.entry_id 9NA9 _em_3d_reconstruction.id 1 _em_3d_reconstruction.method ? _em_3d_reconstruction.algorithm ? _em_3d_reconstruction.citation_id ? _em_3d_reconstruction.details ? _em_3d_reconstruction.resolution 5.9 _em_3d_reconstruction.resolution_method 'FSC 0.143 CUT-OFF' _em_3d_reconstruction.magnification_calibration ? _em_3d_reconstruction.nominal_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.actual_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.num_particles 72002 _em_3d_reconstruction.euler_angles_details ? _em_3d_reconstruction.num_class_averages 1 _em_3d_reconstruction.refinement_type ? _em_3d_reconstruction.image_processing_id 1 _em_3d_reconstruction.symmetry_type POINT # _em_buffer.id 1 _em_buffer.specimen_id 1 _em_buffer.name ? _em_buffer.details ? _em_buffer.pH 7.5 # _em_entity_assembly.id 1 _em_entity_assembly.parent_id 0 _em_entity_assembly.source RECOMBINANT _em_entity_assembly.type COMPLEX _em_entity_assembly.name 'Augmin tetramer complex tripod' _em_entity_assembly.details ? _em_entity_assembly.synonym ? _em_entity_assembly.oligomeric_details ? _em_entity_assembly.entity_id_list '1, 2, 3, 4' # _em_imaging.entry_id 9NA9 _em_imaging.id 1 _em_imaging.astigmatism ? _em_imaging.electron_beam_tilt_params ? _em_imaging.residual_tilt ? _em_imaging.microscope_model 'TFS GLACIOS' _em_imaging.specimen_holder_type ? _em_imaging.specimen_holder_model ? _em_imaging.details ? _em_imaging.date ? _em_imaging.accelerating_voltage 200 _em_imaging.illumination_mode 'FLOOD BEAM' _em_imaging.mode 'BRIGHT FIELD' _em_imaging.nominal_cs ? _em_imaging.nominal_defocus_min 600 _em_imaging.nominal_defocus_max 1800 _em_imaging.calibrated_defocus_min ? _em_imaging.calibrated_defocus_max ? _em_imaging.tilt_angle_min ? _em_imaging.tilt_angle_max ? 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