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EMDB EMD-49281 ? ? # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal _pdbx_audit_revision_history.data_content_type _pdbx_audit_revision_history.major_revision _pdbx_audit_revision_history.minor_revision _pdbx_audit_revision_history.revision_date _pdbx_audit_revision_history.part_number 1 'Structure model' 1 0 2025-11-19 ? 2 'EM metadata' 1 0 2025-11-19 ? 3 Image 1 0 2025-11-19 ? 4 'Primary map' 1 0 2025-11-19 ? # loop_ _pdbx_audit_revision_details.ordinal _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_details.data_content_type _pdbx_audit_revision_details.provider _pdbx_audit_revision_details.type _pdbx_audit_revision_details.description _pdbx_audit_revision_details.details 1 1 'Structure model' repository 'Initial release' ? ? 2 2 'EM metadata' repository 'Initial release' ? ? 3 3 Image repository 'Initial release' ? ? 4 4 'Primary map' repository 'Initial release' ? ? # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? 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_pdbx_contact_author.identifier_ORCID 0000-0003-3621-3772 # _audit_author.name 'Hodgkinson-Bean, J.' _audit_author.pdbx_ordinal 1 _audit_author.identifier_ORCID 0000-0001-9583-8794 # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country ? _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev 'To Be Published' _citation.journal_id_ASTM ? _citation.journal_id_CSD 0353 _citation.journal_id_ISSN ? _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume ? _citation.language ? _citation.page_first ? _citation.page_last ? _citation.title 'Icosahedral capsid assembly of phage JohannRWettstein (Bas63)' _citation.year ? _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI ? _citation.pdbx_database_id_PubMed ? _citation.pdbx_database_id_patent ? _citation.unpublished_flag ? # 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TGKTATTNDGGATSKKNTGNTTTSLGNGKLNCQLLFDLDANGVRELTSAEDNALAKCSMSAKTRKGVTTFSDEAERNAGA ALNSTAGNGKALQKHSVNPNKKGTY ; A,B ? 2 'polypeptide(L)' no no ;MKTDFALNLGGDYVATLGSDSVYVAHGDLKITGNQIRIIPEDDKATQVAQRLHIRCLLRSGEVFFNTSAGFPYLQLAKFK QKTSIFDNYMKAYLVETRDVSNIYNYSSSMDNAQRKVTVNFDATTTTDILTDITQEVNI ; ;MKTDFALNLGGDYVATLGSDSVYVAHGDLKITGNQIRIIPEDDKATQVAQRLHIRCLLRSGEVFFNTSAGFPYLQLAKFK QKTSIFDNYMKAYLVETRDVSNIYNYSSSMDNAQRKVTVNFDATTTTDILTDITQEVNI ; C,D ? 3 'polypeptide(L)' no no ;MSVKDSTAGASFRCYQLAVGSETTAFNDKPTSHAKDSMQMDYFDNLQFTCNVSYTSQKNKVTSDDTTFEIYNLNKEMRAK FKTVGATVMLRAGYTTGFKRDANGDLIIEYDNLPLIYLGTIEYAYTYKRGVDMITKVICSNDKMERTTIKTSISYKAGTT RKNVIRDLVNRLGFSLIDEDLSSIDGYTYKNGFSVWGSVAEALTKVCEESSLRWYTFNKQIRVVPFNAKARQLSWEIYPY NVIDSLQGYYRRTRKVLKKENKTVIKVKTGVRCKIHLDGRIKMGDNVTIRESEDFEGQYRVKGLSHNLDFTGGAWTTELD LEKVE ; ;MSVKDSTAGASFRCYQLAVGSETTAFNDKPTSHAKDSMQMDYFDNLQFTCNVSYTSQKNKVTSDDTTFEIYNLNKEMRAK FKTVGATVMLRAGYTTGFKRDANGDLIIEYDNLPLIYLGTIEYAYTYKRGVDMITKVICSNDKMERTTIKTSISYKAGTT RKNVIRDLVNRLGFSLIDEDLSSIDGYTYKNGFSVWGSVAEALTKVCEESSLRWYTFNKQIRVVPFNAKARQLSWEIYPY NVIDSLQGYYRRTRKVLKKENKTVIKVKTGVRCKIHLDGRIKMGDNVTIRESEDFEGQYRVKGLSHNLDFTGGAWTTELD LEKVE ; E ? 4 'polypeptide(L)' no no ;MAQYTVDSFIVELGFSEKVVKGLQRVEKMSMQAAQRIERNINKAFDVKPNKSSQEALNRIVKNAQSASGRINKALNSSLN LDSQGVKSLKKLETQAKKTAKGINKSLRDAMKVDGKITIKTGRGRGGQSIPPVGGGAPRGPRVDVAQRQMERMFNNNFYS GLTRRLETIGGQGNQMAASFRGSLQGIYNKYKGTGKVGEYEMEVKKLIDVTKRWVIAENARLKSVKEAAWLQDRANSSLR QLVGGFVSAYALLELSQKTIEAGVKRQSAQLASTAIFGADTQQARMFAASFAHQIGQNYTDTMKQYSNFAAGAQPTLGFQ GTQEFYKNAAMFARIRGATDEDLKGIMVAFQQMASKGKVQAEELRGQLGDRLAGAVQLFADAIGKTPQELDKMMQDGKLL AQDVLPKVSERMAELVKQAGGMNAVSKQTATSMGQAKAMWDNTLVALFNNSSEGISQLSNSVAMFLQGSLGSTQALGVVI GNLLKGASNLLDFVTDFMYRTSALYYYARAWYKDLDNSQQKLIKSAGEFLGTVVTIGGVVAVVSKAVKLLSGLVGGGIFG KILQRLGVSAAGTAAAGEAAAAAGGVTATRMALGTVGSALMLRGSTDPNAAKNYSEVTLPKPFENAVANITNPKRPMFFD ENGQLQFAQYTQDVEGNRKLIDNGLSNWEIIMDKLSTSIDNFANKFNQTPMMMTPSGLPMQTKQTLNVTFNLDGKQIATK MVDITDKNQEDILLSSSYPEEE ; ;MAQYTVDSFIVELGFSEKVVKGLQRVEKMSMQAAQRIERNINKAFDVKPNKSSQEALNRIVKNAQSASGRINKALNSSLN LDSQGVKSLKKLETQAKKTAKGINKSLRDAMKVDGKITIKTGRGRGGQSIPPVGGGAPRGPRVDVAQRQMERMFNNNFYS GLTRRLETIGGQGNQMAASFRGSLQGIYNKYKGTGKVGEYEMEVKKLIDVTKRWVIAENARLKSVKEAAWLQDRANSSLR QLVGGFVSAYALLELSQKTIEAGVKRQSAQLASTAIFGADTQQARMFAASFAHQIGQNYTDTMKQYSNFAAGAQPTLGFQ GTQEFYKNAAMFARIRGATDEDLKGIMVAFQQMASKGKVQAEELRGQLGDRLAGAVQLFADAIGKTPQELDKMMQDGKLL AQDVLPKVSERMAELVKQAGGMNAVSKQTATSMGQAKAMWDNTLVALFNNSSEGISQLSNSVAMFLQGSLGSTQALGVVI GNLLKGASNLLDFVTDFMYRTSALYYYARAWYKDLDNSQQKLIKSAGEFLGTVVTIGGVVAVVSKAVKLLSGLVGGGIFG KILQRLGVSAAGTAAAGEAAAAAGGVTATRMALGTVGSALMLRGSTDPNAAKNYSEVTLPKPFENAVANITNPKRPMFFD ENGQLQFAQYTQDVEGNRKLIDNGLSNWEIIMDKLSTSIDNFANKFNQTPMMMTPSGLPMQTKQTLNVTFNLDGKQIATK MVDITDKNQEDILLSSSYPEEE ; F ? 5 'polypeptide(L)' no no ;MKSPVTRMSGYVSECLDEFRKELYTGLPAIIQSFDSKTQTATVKPLYSINGLPMPEITGVPVQFPSGGGASLTFPVKTND RCWLAFSMLPLDDFVVNDKNTQMETNMRRTHDISDCVAFVGICTRTQNFKPDPTAVRLHFGDSVLRVTDDGNFYFEGDVH ISKNLYVKEEVHGSDFISDTTGVSFNEHTHHYYWTDPAGEADTTEAQ ; ;MKSPVTRMSGYVSECLDEFRKELYTGLPAIIQSFDSKTQTATVKPLYSINGLPMPEITGVPVQFPSGGGASLTFPVKTND RCWLAFSMLPLDDFVVNDKNTQMETNMRRTHDISDCVAFVGICTRTQNFKPDPTAVRLHFGDSVLRVTDDGNFYFEGDVH ISKNLYVKEEVHGSDFISDTTGVSFNEHTHHYYWTDPAGEADTTEAQ ; G ? 6 'polypeptide(L)' no no ;MAGLTTTGLQTLRYQEIFDNIKSRLLRDISPNLDVSEDSQLGLFLASIARSLADTHEVLSEIYDGGTIDKAEGFNLDDIT ALNAVYRYVAQATRGQVEFTGTTGATIPSTTRLRSTAGNIFYPVSGITLTPSYCVEAVLEVNSLRTDANYVIIIDNVIFS YQPKSSDTITVLLTELADAINGGIVAKAEVINDGSALRVYKDEGDIIARTNPMVVTATTFLTFTKITTIHDVVAEEVGAI PALAGTLIEIETTVDGLDSVYNRYDLTTGRNEETDTELRQRYLESLAVTGVGTLDAIVAAVKRVQGVSDASGVENDTEET SSEGLPPKSFKIVVVGGQNDNVAQAIWDTKPAGIRAYGAIFGTAYDLGNLAHNVYFSRPTPKYAFVKVSYSLYDEESLTI PEEDIRDSIVQGINAYGRTLKVGNDVIPNRIYGYIYDVIKGVEINEIKVALSNNQSVPPSDGQYTTARITVDGDQYTVWE SSQYTIAKE ; ;MAGLTTTGLQTLRYQEIFDNIKSRLLRDISPNLDVSEDSQLGLFLASIARSLADTHEVLSEIYDGGTIDKAEGFNLDDIT ALNAVYRYVAQATRGQVEFTGTTGATIPSTTRLRSTAGNIFYPVSGITLTPSYCVEAVLEVNSLRTDANYVIIIDNVIFS YQPKSSDTITVLLTELADAINGGIVAKAEVINDGSALRVYKDEGDIIARTNPMVVTATTFLTFTKITTIHDVVAEEVGAI PALAGTLIEIETTVDGLDSVYNRYDLTTGRNEETDTELRQRYLESLAVTGVGTLDAIVAAVKRVQGVSDASGVENDTEET SSEGLPPKSFKIVVVGGQNDNVAQAIWDTKPAGIRAYGAIFGTAYDLGNLAHNVYFSRPTPKYAFVKVSYSLYDEESLTI PEEDIRDSIVQGINAYGRTLKVGNDVIPNRIYGYIYDVIKGVEINEIKVALSNNQSVPPSDGQYTTARITVDGDQYTVWE SSQYTIAKE ; H,I,K,L ? 7 'polypeptide(L)' no no ;MFQKIDNVYYKTLDERTVTQFKDKFIYTSLLKAVTDELQTLEDVSWQMHTERNIRKAVGQQLDNIGSLIKVPRPLGADDE TYRAMLYIQIFLRRSDTTPTFLQNAIMTLYNATFSQIFEHITPMTAGIVVRVNTRNNVIDTAYTLAKIAATTIGSAVILR DVTLNGTAWTPVEVADSALAIVDDKDNWFVTDANKGLVTNNTGGSLEKNLLGSLADAGVRDAYFKVDRTANSGSVDYLKV NKNYNATDNYIVGKETVAGGDYGVMAEVAQIIKGRKDKSQQEGSS ; ;MFQKIDNVYYKTLDERTVTQFKDKFIYTSLLKAVTDELQTLEDVSWQMHTERNIRKAVGQQLDNIGSLIKVPRPLGADDE TYRAMLYIQIFLRRSDTTPTFLQNAIMTLYNATFSQIFEHITPMTAGIVVRVNTRNNVIDTAYTLAKIAATTIGSAVILR DVTLNGTAWTPVEVADSALAIVDDKDNWFVTDANKGLVTNNTGGSLEKNLLGSLADAGVRDAYFKVDRTANSGSVDYLKV NKNYNATDNYIVGKETVAGGDYGVMAEVAQIIKGRKDKSQQEGSS ; J,M ? 8 'polypeptide(L)' no no ;MSQYIPVPDTEWSTQTVTLDGTVFVIELKYKERLDRWFLTLSDVDGNVLLSEKKCLADQSITGRYVIPSLAGELFVERMY GTDLQPTRNNFGREKAFELNYYTQEDMRLMENL ; ;MSQYIPVPDTEWSTQTVTLDGTVFVIELKYKERLDRWFLTLSDVDGNVLLSEKKCLADQSITGRYVIPSLAGELFVERMY GTDLQPTRNNFGREKAFELNYYTQEDMRLMENL ; N,O ? 9 'polypeptide(L)' no no ;MAFLNWSTDEVDADGNQLKVLPPPEIQATGLLRGEPMGRQWFNYILNYLLKKANGTVGEVRSFATEQPDLVANGWNLIKT ETGTASTSTKNLYTYEFVGA ; ;MAFLNWSTDEVDADGNQLKVLPPPEIQATGLLRGEPMGRQWFNYILNYLLKKANGTVGEVRSFATEQPDLVANGWNLIKT ETGTASTSTKNLYTYEFVGA ; S,T,U,P,Q,R ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET n 1 2 LEU n 1 3 TRP n 1 4 ASP n 1 5 SER n 1 6 ASN n 1 7 MET n 1 8 GLN n 1 9 ILE n 1 10 LYS n 1 11 TYR n 1 12 SER n 1 13 GLY n 1 14 LYS n 1 15 ASP n 1 16 GLY n 1 17 ILE n 1 18 TYR n 1 19 PHE n 1 20 HIS n 1 21 LEU n 1 22 ARG n 1 23 ASP n 1 24 ASN n 1 25 VAL n 1 26 ASP n 1 27 ALA n 1 28 PHE n 1 29 LEU n 1 30 THR n 1 31 LEU n 1 32 SER n 1 33 ALA n 1 34 THR n 1 35 GLU n 1 36 ASN n 1 37 MET n 1 38 GLU n 1 39 PHE n 1 40 ASP n 1 41 SER n 1 42 PRO n 1 43 MET n 1 44 GLN n 1 45 VAL n 1 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U N N 9 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP A0AAE7VVH7_9CAUD A0AAE7VVH7 ? 1 ;MLWDSNMQIKYSGKDGIYFHLRDNVDAFLTLSATENMEFDSPMQVTTQNMQSGQTVTDNVQRAPRTITISGVVVVGYEGS LLLTRQGQLVENFIDTLESWRDQKQIISVICKDGIKIDDSIITSFKASKDVGISNGLRVQLTFQEINFKAIVGQTDVSAA TGKTATTNDGGATSKKNTGNTTTSLGNGKLNCQLLFDLDANGVRELTSAEDNALAKCSMSAKTRKGVTTFSDEAERNAGA ALNSTAGNGKALQKHSVNPNKKGTY ; 1 2 UNP A0AAE8B0J9_9CAUD A0AAE8B0J9 ? 2 ;MKTDFALNLGGDYVATLGSDSVYVAHGDLKITGNQIRIIPEDDKATQVAQRLHIRCLLRSGEVFFNTSAGFPYLQLAKFK QKTSIFDNYMKAYLVETRDVSNIYNYSSSMDNAQRKVTVNFDATTTTDILTDITQEVNI ; 1 3 UNP A0AAE7VWE1_9CAUD A0AAE7VWE1 ? 3 ;MSVKDSTAGASFRCYQLAVGSETTAFNDKPTSHAKDSMQMDYFDNLQFTCNVSYTSQKNKVTSDDTTFEIYNLNKEMRAK FKTVGATVMLRAGYTTGFKRDANGDLIIEYDNLPLIYLGTIEYAYTYKRGVDMITKVICSNDKMERTTIKTSISYKAGTT RKNVIRDLVNRLGFSLIDEDLSSIDGYTYKNGFSVWGSVAEALTKVCEESSLRWYTFNKQIRVVPFNAKARQLSWEIYPY NVIDSLQGYYRRTRKVLKKENKTVIKVKTGVRCKIHLDGRIKMGDNVTIRESEDFEGQYRVKGLSHNLDFTGGAWTTELD LEKVE ; 1 4 UNP A0AAE7VV46_9CAUD A0AAE7VV46 ? 4 ;MAQYTVDSFIVELGFSEKVVKGLQRVEKMSMQAAQRIERNINKAFDVKPNKSSQEALNRIVKNAQSASGRINKALNSSLN LDSQGVKSLKKLETQAKKTAKGINKSLRDAMKVDGKITIKTGRGRGGQSIPPVGGGAPRGPRVDVAQRQMERMFNNNFYS GLTRRLETIGGQGNQMAASFRGSLQGIYNKYKGTGKVGEYEMEVKKLIDVTKRWVIAENARLKSVKEAAWLQDRANSSLR QLVGGFVSAYALLELSQKTIEAGVKRQSAQLASTAIFGADTQQARMFAASFAHQIGQNYTDTMKQYSNFAAGAQPTLGFQ GTQEFYKNAAMFARIRGATDEDLKGIMVAFQQMASKGKVQAEELRGQLGDRLAGAVQLFADAIGKTPQELDKMMQDGKLL AQDVLPKVSERMAELVKQAGGMNAVSKQTATSMGQAKAMWDNTLVALFNNSSEGISQLSNSVAMFLQGSLGSTQALGVVI GNLLKGASNLLDFVTDFMYRTSALYYYARAWYKDLDNSQQKLIKSAGEFLGTVVTIGGVVAVVSKAVKLLSGLVGGGIFG KILQRLGVSAAGTAAAGEAAAAAGGVTATRMALGTVGSALMLRGSTDPNAAKNYSEVTLPKPFENAVANITNPKRPMFFD ENGQLQFAQYTQDVEGNRKLIDNGLSNWEIIMDKLSTSIDNFANKFNQTPMMMTPSGLPMQTKQTLNVTFNLDGKQIATK MVDITDKNQEDILLSSSYPEEE ; 1 5 UNP A0AAE8B143_9CAUD A0AAE8B143 ? 5 ;MKSPVTRMSGYVSECLDEFRKELYTGLPAIIQSFDSKTQTATVKPLYSINGLPMPEITGVPVQFPSGGGASLTFPVKTND RCWLAFSMLPLDDFVVNDKNTQMETNMRRTHDISDCVAFVGICTRTQNFKPDPTAVRLHFGDSVLRVTDDGNFYFEGDVH ISKNLYVKEEVHGSDFISDTTGVSFNEHTHHYYWTDPAGEADTTEAQ ; 1 6 UNP A0AAE8B2A9_9CAUD A0AAE8B2A9 ? 6 ;MAGLTTTGLQTLRYQEIFDNIKSRLLRDISPNLDVSEDSQLGLFLASIARSLADTHEVLSEIYDGGTIDKAEGFNLDDIT ALNAVYRYVAQATRGQVEFTGTTGATIPSTTRLRSTAGNIFYPVSGITLTPSYCVEAVLEVNSLRTDANYVIIIDNVIFS YQPKSSDTITVLLTELADAINGGIVAKAEVINDGSALRVYKDEGDIIARTNPMVVTATTFLTFTKITTIHDVVAEEVGAI PALAGTLIEIETTVDGLDSVYNRYDLTTGRNEETDTELRQRYLESLAVTGVGTLDAIVAAVKRVQGVSDASGVENDTEET SSEGLPPKSFKIVVVGGQNDNVAQAIWDTKPAGIRAYGAIFGTAYDLGNLAHNVYFSRPTPKYAFVKVSYSLYDEESLTI PEEDIRDSIVQGINAYGRTLKVGNDVIPNRIYGYIYDVIKGVEINEIKVALSNNQSVPPSDGQYTTARITVDGDQYTVWE SSQYTIAKE ; 1 7 UNP A0AAE8B2H1_9CAUD A0AAE8B2H1 ? 7 ;MFQKIDNVYYKTLDERTVTQFKDKFIYTSLLKAVTDELQTLEDVSWQMHTERNIRKAVGQQLDNIGSLIKVPRPLGADDE TYRAMLYIQIFLRRSDTTPTFLQNAIMTLYNATFSQIFEHITPMTAGIVVRVNTRNNVIDTAYTLAKIAATTIGSAVILR DVTLNGTAWTPVEVADSALAIVDDKDNWFVTDANKGLVTNNTGGSLEKNLLGSLADAGVRDAYFKVDRTANSGSVDYLKV NKNYNATDNYIVGKETVAGGDYGVMAEVAQIIKGRKDKSQQEGSS ; 1 8 UNP A0AAE7VUR9_9CAUD A0AAE7VUR9 ? 8 ;MSQYIPVPDTEWSTQTVTLDGTVFVIELKYKERLDRWFLTLSDVDGNVLLSEKKCLADQSITGRYVIPSLAGELFVERMY GTDLQPTRNNFGREKAFELNYYTQEDMRLMENL ; 1 9 UNP A0AAE8B758_9CAUD A0AAE8B758 ? 9 ;MAFLNWSTDEVDADGNQLKVLPPPEIQATGLLRGEPMGRQWFNYILNYLLKKANGTVGEVRSFATEQPDLVANGWNLIKT ETGTASTSTKNLYTYEFVGA ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 9NDY A 1 ? 265 ? 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A0AAE8B758 1 ? 100 ? 1 100 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details 63-meric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 63 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1,2,3 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'not applicable' # loop_ _pdbx_struct_oper_list.id _pdbx_struct_oper_list.type _pdbx_struct_oper_list.name _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 1 'identity operation' 1_555 x,y,z 1.0 -0.0 0.0 0.0 -0.0 1.0 -0.0 0.0 0.0 -0.0 1.0 0.0 2 'point symmetry operation' ? ? -0.500000 -0.866025 0.0 656.02430 0.866025 -0.500000 -0.0 175.46419 0.0 -0.0 1.0 0.0 3 'point symmetry operation' ? ? -0.500000 0.866025 0.0 176.05570 -0.866025 -0.500000 -0.0 655.86581 0.0 -0.0 1.0 -0.0 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 LEU A 89 ? 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SER L 460 TYR L 464 5 ? 5 HELX_P HELX_P86 AJ5 ASN M 7 ? ARG M 16 ? ASN M 7 ARG M 16 1 ? 10 HELX_P HELX_P87 AJ6 VAL M 18 ? LYS M 22 ? VAL M 18 LYS M 22 5 ? 5 HELX_P HELX_P88 AJ7 PHE M 25 ? THR M 50 ? PHE M 25 THR M 50 1 ? 26 HELX_P HELX_P89 AJ8 GLY M 59 ? ILE M 69 ? GLY M 59 ILE M 69 1 ? 11 HELX_P HELX_P90 AJ9 ASP M 78 ? ARG M 94 ? ASP M 78 ARG M 94 1 ? 17 HELX_P HELX_P91 AK1 THR M 98 ? TYR M 110 ? THR M 98 TYR M 110 1 ? 13 HELX_P HELX_P92 AK2 ASP M 140 ? ALA M 149 ? ASP M 140 ALA M 149 1 ? 10 HELX_P HELX_P93 AK3 THR N 103 ? GLU N 111 ? THR N 103 GLU N 111 1 ? 9 HELX_P HELX_P94 AK4 THR O 103 ? GLU O 111 ? THR O 103 GLU O 111 1 ? 9 HELX_P HELX_P95 AK5 PRO P 23 ? ALA P 28 ? PRO S 23 ALA S 28 1 ? 6 HELX_P HELX_P96 AK6 ARG P 39 ? GLY P 55 ? ARG S 39 GLY S 55 1 ? 17 HELX_P HELX_P97 AK7 GLN P 67 ? ALA P 72 ? GLN S 67 ALA S 72 1 ? 6 HELX_P HELX_P98 AK8 PRO Q 23 ? GLY Q 30 ? PRO T 23 GLY T 30 1 ? 8 HELX_P HELX_P99 AK9 TRP Q 41 ? GLY Q 55 ? 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Particle number and resolution are reported from the consensus reconstruction used (EMD-49262). ; _em_3d_reconstruction.resolution 3.83 _em_3d_reconstruction.resolution_method 'FSC 0.143 CUT-OFF' _em_3d_reconstruction.magnification_calibration ? _em_3d_reconstruction.nominal_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.actual_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.num_particles 14390 _em_3d_reconstruction.euler_angles_details ? _em_3d_reconstruction.num_class_averages ? _em_3d_reconstruction.refinement_type ? _em_3d_reconstruction.image_processing_id 1 _em_3d_reconstruction.symmetry_type POINT # _em_buffer.id 1 _em_buffer.specimen_id 1 _em_buffer.name ? _em_buffer.details ? _em_buffer.pH 7.4 # _em_entity_assembly.id 1 _em_entity_assembly.parent_id 0 _em_entity_assembly.source NATURAL _em_entity_assembly.type VIRUS _em_entity_assembly.name 'Escherichia phage JohannRWettstein' _em_entity_assembly.details ? _em_entity_assembly.synonym ? _em_entity_assembly.oligomeric_details ? _em_entity_assembly.entity_id_list 3,9,8,4,6 # _em_imaging.entry_id 9NDY _em_imaging.id 1 _em_imaging.astigmatism ? _em_imaging.electron_beam_tilt_params ? _em_imaging.residual_tilt ? _em_imaging.microscope_model 'TFS KRIOS' _em_imaging.specimen_holder_type ? _em_imaging.specimen_holder_model ? _em_imaging.details ? _em_imaging.date ? _em_imaging.accelerating_voltage 300 _em_imaging.illumination_mode 'FLOOD BEAM' _em_imaging.mode 'BRIGHT FIELD' _em_imaging.nominal_cs ? _em_imaging.nominal_defocus_min 1000 _em_imaging.nominal_defocus_max 4000 _em_imaging.calibrated_defocus_min ? _em_imaging.calibrated_defocus_max ? _em_imaging.tilt_angle_min ? _em_imaging.tilt_angle_max ? _em_imaging.nominal_magnification ? _em_imaging.calibrated_magnification ? _em_imaging.electron_source 'FIELD EMISSION GUN' _em_imaging.citation_id ? _em_imaging.temperature ? _em_imaging.detector_distance ? _em_imaging.recording_temperature_minimum ? _em_imaging.recording_temperature_maximum ? _em_imaging.alignment_procedure ? _em_imaging.c2_aperture_diameter ? _em_imaging.specimen_id 1 _em_imaging.cryogen ? _em_imaging.objective_aperture ? _em_imaging.microscope_serial_number ? _em_imaging.microscope_version ? # _em_virus_entity.id 1 _em_virus_entity.virus_host_category ? _em_virus_entity.virus_type VIRION _em_virus_entity.virus_isolate SPECIES _em_virus_entity.entity_assembly_id 1 _em_virus_entity.enveloped NO _em_virus_entity.empty NO _em_virus_entity.details ? # _em_vitrification.entry_id 9NDY _em_vitrification.id 1 _em_vitrification.specimen_id 1 _em_vitrification.cryogen_name ETHANE-PROPANE _em_vitrification.humidity ? _em_vitrification.temp ? _em_vitrification.chamber_temperature ? _em_vitrification.instrument ? _em_vitrification.method ? _em_vitrification.time_resolved_state ? _em_vitrification.citation_id ? _em_vitrification.details ? # _em_experiment.entry_id 9NDY _em_experiment.id 1 _em_experiment.reconstruction_method 'SINGLE PARTICLE' _em_experiment.aggregation_state PARTICLE _em_experiment.entity_assembly_id 1 # loop_ _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_model_num _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.polymer_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.occupancy_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_ins_code _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_seq_id 1 1 Y 1 A MET 1 ? 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