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;MSGNREQVFPTRMTLGLMKTKLKGANQGYSLLKRKSEALTKRFRDITKRIDDAKQKMGRVMQTAAFSLAEVSYATGENIG YQVQESVSTARFKVRARQENVSGVYLSQFESYIDPEINDFRLTGLGRGGQQVQRAKEIYSRAVETLVELASLQTAFIILD EVIKVTNRRVNAIEHVIIPRTENTIAYINSELDELDREEFYRLKKVQEKKQNETAKLDAEMKLKRDRAEQDASEVAADEE PQGETLVADQEDDVIF ; ;MSGNREQVFPTRMTLGLMKTKLKGANQGYSLLKRKSEALTKRFRDITKRIDDAKQKMGRVMQTAAFSLAEVSYATGENIG YQVQESVSTARFKVRARQENVSGVYLSQFESYIDPEINDFRLTGLGRGGQQVQRAKEIYSRAVETLVELASLQTAFIILD EVIKVTNRRVNAIEHVIIPRTENTIAYINSELDELDREEFYRLKKVQEKKQNETAKLDAEMKLKRDRAEQDASEVAADEE PQGETLVADQEDDVIF ; M ? 5 'polypeptide(L)' no no ;MAEKRTLIAVIADEDTTTGLLLAGIGQITPETQEKNFFVYQEGKTTKEEITDKFNHFTEERDDIAILLINQHIAENIRAR VDSFTNAFPAILEIPSKDHPYDPEKDSVLKRVRKLFGE ; ;MAEKRTLIAVIADEDTTTGLLLAGIGQITPETQEKNFFVYQEGKTTKEEITDKFNHFTEERDDIAILLINQHIAENIRAR VDSFTNAFPAILEIPSKDHPYDPEKDSVLKRVRKLFGE ; N ? 6 'polypeptide(L)' no no ;MGQSSSISSSNEEGSSHSKKFTNSKDILAYFNNKAQQQVTIPELVSFKGNLQIEDLNTPISHKALCNSLYFPQNHAMIVG IVTNMLRVLSNFPLMKSSYEPITGYGLLKCILLLNRARCAKFLKTKSYDQLKLLFISLSLQKTDKEELSEESENDGNKEL 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'polypeptide(L)' no no ;MVLSDKELFAINKKAVEQGFNVKPRLNYNTVSGVNGPLVILEKVKFPRYNEIVNLTLPDGTVRQGQVLEIRGDRAIVQVF EGTSGIDVKKTTVEFTGESLRIPVSEDMLGRIFDGSGRPIDNGPKVFAEDYLDINGSPINPYARIYPEEMISTGVSAIDT MNSIARGQKIPIFSASGLPHNEIAAQICRQAGLVRPTKDVHDGHEENFSIVFAAMGVNLETARFFKQDFEENGSLERTSL FLNLANDPTIERIITPRLALTTAEYLAYQTERHVLTILTDMSSYADALREVSAAREEVPGRRGYPGYMYTDLSTIYERAG RVEGRNGSITQIPILTMPNDDITHPIPDLTGYITEGQIFVDRQLHNKGIYPPINVLPSLSRLMKSAIGEGMTRKDHGDVS NQLYAKYAIGKDAAAMKAVVGEEALSIEDKLSLEFLEKFEKTFITQGAYEDRTVFESLDQAWSLLRIYPKEMLNRISPKI LDEFYDRARDDADEDEEDPDTRSSGKKKDASQEESLI ; ;MVLSDKELFAINKKAVEQGFNVKPRLNYNTVSGVNGPLVILEKVKFPRYNEIVNLTLPDGTVRQGQVLEIRGDRAIVQVF EGTSGIDVKKTTVEFTGESLRIPVSEDMLGRIFDGSGRPIDNGPKVFAEDYLDINGSPINPYARIYPEEMISTGVSAIDT MNSIARGQKIPIFSASGLPHNEIAAQICRQAGLVRPTKDVHDGHEENFSIVFAAMGVNLETARFFKQDFEENGSLERTSL FLNLANDPTIERIITPRLALTTAEYLAYQTERHVLTILTDMSSYADALREVSAAREEVPGRRGYPGYMYTDLSTIYERAG RVEGRNGSITQIPILTMPNDDITHPIPDLTGYITEGQIFVDRQLHNKGIYPPINVLPSLSRLMKSAIGEGMTRKDHGDVS 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# _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 9NN1 _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.B_iso_max ? _refine.B_iso_mean 145.34 _refine.B_iso_min ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.details ? _refine.diff_density_max ? _refine.diff_density_max_esd ? _refine.diff_density_min ? _refine.diff_density_min_esd ? _refine.diff_density_rms ? _refine.diff_density_rms_esd ? _refine.entry_id 9NN1 _refine.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine.ls_abs_structure_details ? _refine.ls_abs_structure_Flack ? _refine.ls_abs_structure_Flack_esd ? _refine.ls_abs_structure_Rogers ? _refine.ls_abs_structure_Rogers_esd ? 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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.4688 ? 53401 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.0394 ? 6009 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.0033 ? 6943 ? f_plane_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 5.4212 ? 5373 ? f_dihedral_angle_d ? ? # _struct.entry_id 9NN1 _struct.title 'Yeast V1-ATPase bound to Rtc5p' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 9NN1 _struct_keywords.text 'Vacuolar ATPase, V1-ATPase, Rtc5p, protein structure, PROTON TRANSPORT' _struct_keywords.pdbx_keywords 'PROTON TRANSPORT' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 1 ? D N N 2 ? E N N 3 ? F N N 2 ? G N N 3 ? H N N 2 ? I N N 3 ? J N N 4 ? K N N 5 ? L N N 6 ? M N N 7 ? N N N 7 ? O N N 7 ? P N N 8 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP B3LH69_YEAS1 B3LH69 ? 1 ;MAGAIENARKEIKRISLEDHAESEYGAIYSVSGPVVIAENMIGCAMYELVKVGHDNLVGEVIRIDGDKATIQVYEETAGL TVGDPVLRTGKPLSVELGPGLMETIYDGIQRPLKAIKEESQSIYIPRGIDTPALDRTIKWQFTPGKFQVGDHISGGDIYG SVFENSLISSHKILLPPRSRGTITWIAPAGEYTLDEKILEVEFDGKKSDFTLYHTWPVRVPRPVTEKLSADYPLLTGQRV LDALFPCVQGGTTCIPGAFGCGKTVISQSLSKYSNSDAIIYVGCGERGNEMAEVLMEFPELYTEMSGTKEPIMKRTTLVA NTSNMPVAAREASIYTGITLAEYFRDQGKNVSMIADSSSRWAEALREISGRLGEMPADQGFPAYLGAKLASFYERAGKAV ALGSPDRTGSVSIVAAVSPAGGDFSDPVTTATLGITQVFWGLDKKLAQRKHFPSINTSVSYSKYTNVLNKFYDSNYPEFP VLRDRMKEILSNAEELEQVVQLVGKSALSDSDKITLDVATLIKEDFLQQNGYSTYDAFCPIWKTFDMMRAFISYHDEAQK AVANGANWSKLADSTGDVKHAVSSSKFFEPSRGEKEVHGEFEKLLSTMQERFAESTD ; 1 2 UNP VATE_YEAST P22203 ? 2 ;MSSAITALTPNQVNDELNKMQAFIRKEAEEKAKEIQLKADQEYEIEKTNIVRNETNNIDGNFKSKLKKAMLSQQITKSTI ANKMRLKVLSAREQSLDGIFEETKEKLSGIANNRDEYKPILQSLIVEALLKLLEPKAIVKALERDVDLIESMKDDIMREY GEKAQRAPLEEIVISNDYLNKDLVSGGVVVSNASDKIEINNTLEERLKLLSEEALPAIRLELYGPSKTRKFFD ; 1 3 PDB 9NN1 9NN1 ? 3 ? 1 4 UNP VATD_YEAST P32610 ? 4 ;MSGNREQVFPTRMTLGLMKTKLKGANQGYSLLKRKSEALTKRFRDITKRIDDAKQKMGRVMQTAAFSLAEVSYATGENIG YQVQESVSTARFKVRARQENVSGVYLSQFESYIDPEINDFRLTGLGRGGQQVQRAKEIYSRAVETLVELASLQTAFIILD EVIKVTNRRVNAIEHVIIPRTENTIAYINSELDELDREEFYRLKKVQEKKQNETAKLDAEMKLKRDRAEQDASEVAADEE PQGETLVADQEDDVIF ; 1 5 UNP VATF_YEAST P39111 ? 5 ;MAEKRTLIAVIADEDTTTGLLLAGIGQITPETQEKNFFVYQEGKTTKEEITDKFNHFTEERDDIAILLINQHIAENIRAR VDSFTNAFPAILEIPSKDHPYDPEKDSVLKRVRKLFGE ; 1 6 UNP RTC5_YEAS1 B3LJG1 ? 6 ;MGQSSSISSSNEEGSSHSKKFTNSKDILAYFNNKAQQQVTIPELVSFKGNLQIEDLNTPISHKALCNSLYFPQNHAMIVG IVTNMLRVLSNFPLMKSSYEPITGYGLLKCILLLNRARCAKFLKTKSYDQLKLLFISLSLQKTDKEELSEESENDGNKEL TIKQIITGFDDVDTEMLCIPADFMLQFLTWLLILTVDCPTTNSKLDNTETHDQWGNFKVSALNLLRTMNPDVVGDIESHS ITFQQFSTAIRTVMPNLLKPLENLMEHFFYLQHDLVDHDTNLSSIQDSKVMTPALLAQLSTGLPKELFIHKLQSLYIGRK SGFSMRSLQAKVFKWMAPSILVVSGMRITNSEEYAAEKNPRYRHFLEEFPKLKESDQMMDASHLNKRKTTFAVYIDDPWK VTNKDYFGDLNTRIIEISPRQDIYKVNQKGTIYFNTIGGGIGIGDKQPLIKPASKRYIPGNVSLTFDSTLEFAVFRNTGY GGSLDPGLLSMERKEENSPYELHFLIQDVEVWGCGGEKELEEQIKQLEWEEAESKRRQQINLRSLGEDRALLEMAGLVGQ HQGGGSM ; 1 7 UNP VATB_YEAST P16140 ? 7 ;MVLSDKELFAINKKAVEQGFNVKPRLNYNTVSGVNGPLVILEKVKFPRYNEIVNLTLPDGTVRQGQVLEIRGDRAIVQVF EGTSGIDVKKTTVEFTGESLRIPVSEDMLGRIFDGSGRPIDNGPKVFAEDYLDINGSPINPYARIYPEEMISTGVSAIDT MNSIARGQKIPIFSASGLPHNEIAAQICRQAGLVRPTKDVHDGHEENFSIVFAAMGVNLETARFFKQDFEENGSLERTSL FLNLANDPTIERIITPRLALTTAEYLAYQTERHVLTILTDMSSYADALREVSAAREEVPGRRGYPGYMYTDLSTIYERAG RVEGRNGSITQIPILTMPNDDITHPIPDLTGYITEGQIFVDRQLHNKGIYPPINVLPSLSRLMKSAIGEGMTRKDHGDVS NQLYAKYAIGKDAAAMKAVVGEEALSIEDKLSLEFLEKFEKTFITQGAYEDRTVFESLDQAWSLLRIYPKEMLNRISPKI LDEFYDRARDDADEDEEDPDTRSSGKKKDASQEESLI ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 9NN1 A 1 ? 617 ? 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AD8 ? 3 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 1 6 ? anti-parallel AA1 1 35 ? anti-parallel AA1 2 5 ? anti-parallel AA1 3 4 ? anti-parallel AA1 3 6 ? anti-parallel AA1 4 5 ? anti-parallel AA1 4 46 ? anti-parallel AA1 7 8 ? anti-parallel AA1 7 42 ? anti-parallel AA1 8 11 ? anti-parallel AA1 9 10 ? anti-parallel AA1 9 12 ? anti-parallel AA1 10 11 ? anti-parallel AA1 10 32 ? anti-parallel AA1 13 14 ? anti-parallel AA1 13 18 ? anti-parallel AA1 13 49 ? anti-parallel AA1 14 17 ? anti-parallel AA1 15 16 ? anti-parallel AA1 15 18 ? anti-parallel AA1 16 17 ? anti-parallel AA1 16 39 ? anti-parallel AA1 19 20 ? parallel AA1 19 21 ? anti-parallel AA1 21 22 ? anti-parallel AA1 22 38 ? anti-parallel AA1 23 24 ? parallel AA1 23 25 ? anti-parallel AA1 25 26 ? anti-parallel AA1 26 45 ? anti-parallel AA1 27 28 ? parallel AA1 27 29 ? anti-parallel AA1 29 30 ? anti-parallel AA1 30 31 ? anti-parallel AA1 31 37 ? anti-parallel AA1 32 33 ? anti-parallel AA1 33 36 ? anti-parallel AA1 34 35 ? anti-parallel AA1 34 37 ? anti-parallel AA1 35 36 ? anti-parallel AA1 38 44 ? anti-parallel AA1 39 40 ? anti-parallel AA1 40 43 ? anti-parallel AA1 41 42 ? anti-parallel AA1 41 44 ? anti-parallel AA1 42 43 ? anti-parallel AA1 45 51 ? anti-parallel AA1 46 47 ? anti-parallel AA1 47 50 ? anti-parallel AA1 48 49 ? anti-parallel AA1 48 51 ? anti-parallel AA1 49 50 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA3 1 5 ? parallel AA3 2 7 ? anti-parallel AA3 3 8 ? parallel AA3 4 5 ? parallel AA3 4 6 ? parallel AA3 6 8 ? parallel AA3 7 8 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA4 3 4 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA5 3 4 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA9 1 5 ? parallel AA9 2 7 ? anti-parallel AA9 3 8 ? parallel AA9 3 9 ? parallel AA9 4 5 ? parallel AA9 4 6 ? parallel AA9 6 8 ? parallel AA9 7 8 ? anti-parallel AA9 9 10 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB1 2 3 ? anti-parallel AB1 3 4 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB2 2 3 ? anti-parallel AB2 3 4 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB5 1 5 ? parallel AB5 2 7 ? anti-parallel AB5 3 8 ? parallel AB5 4 5 ? parallel AB5 4 6 ? parallel AB5 6 8 ? parallel AB5 7 8 ? anti-parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB6 2 3 ? anti-parallel AB6 3 4 ? anti-parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB7 2 3 ? anti-parallel AB7 3 4 ? anti-parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB9 1 2 ? anti-parallel AC1 1 2 ? anti-parallel AC2 1 2 ? parallel AC2 2 3 ? parallel AC2 3 4 ? parallel AC3 1 2 ? anti-parallel AC4 1 10 ? anti-parallel AC4 2 3 ? anti-parallel AC4 2 10 ? anti-parallel AC4 3 4 ? anti-parallel AC4 4 5 ? anti-parallel AC4 6 7 ? anti-parallel AC4 7 8 ? anti-parallel AC4 8 9 ? anti-parallel AC4 9 10 ? anti-parallel AC5 1 2 ? anti-parallel AC6 1 2 ? anti-parallel AC7 1 4 ? parallel AC7 2 7 ? parallel AC7 2 8 ? parallel AC7 3 4 ? parallel AC7 3 5 ? parallel AC7 5 7 ? parallel AC7 6 7 ? anti-parallel AC7 8 9 ? anti-parallel AC8 1 2 ? anti-parallel AC9 1 2 ? anti-parallel AD1 1 2 ? parallel AD1 2 3 ? parallel AD1 3 4 ? parallel AD1 4 5 ? parallel AD2 1 2 ? anti-parallel AD3 1 2 ? anti-parallel AD4 1 2 ? parallel AD4 2 3 ? parallel AD4 3 4 ? anti-parallel AD5 1 2 ? anti-parallel AD6 1 2 ? parallel AD6 2 3 ? parallel AD6 3 4 ? parallel AD6 4 5 ? parallel AD6 5 6 ? anti-parallel AD7 1 2 ? anti-parallel AD7 2 3 ? anti-parallel AD8 1 2 ? parallel AD8 2 3 ? parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 GLY A 26 ? 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