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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.718 ? 99495 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 5.526 ? 9936 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.048 ? 10970 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.006 ? 12886 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 9NRX _struct.title 'Venezuelan Equine Encephalitis Virus in complex with the single domain antibody V2B3' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 9NRX _struct_keywords.text ;Venezuelan Equine Encephalitis virus, Virus-Like Particle, VIRUS LIKE PARTICLE, single domain antibody, nanobody, Viral protein-Immune System complex ; _struct_keywords.pdbx_keywords 'Viral protein/Immune System' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 2 ? D N N 2 ? E N N 1 ? F N N 2 ? G N N 3 ? H N N 3 ? 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SER v 250 ALA v 255 1 ? 6 HELX_P HELX_P86 AJ5 PRO Z 256 ? CYS Z 259 ? PRO v 256 CYS v 259 5 ? 4 HELX_P HELX_P87 AJ6 PRO Z 283 ? PHE Z 287 ? PRO v 283 PHE v 287 5 ? 5 HELX_P HELX_P88 AJ7 THR AA 2 ? ASN AA 7 ? THR w 2 ASN w 7 1 ? 6 HELX_P HELX_P89 AJ8 GLU AA 8 ? THR AA 12 ? GLU w 8 THR w 12 5 ? 5 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? 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F CYS 202 SG ? ? ? 1_555 F CYS 220 SG ? ? Q CYS 202 Q CYS 220 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? ? disulf38 disulf ? ? G CYS 22 SG ? ? ? 1_555 G CYS 94 SG ? ? X CYS 22 X CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf39 disulf ? ? H CYS 22 SG ? ? ? 1_555 H CYS 94 SG ? ? Y CYS 22 Y CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf40 disulf ? ? I CYS 22 SG ? ? ? 1_555 I CYS 94 SG ? ? Z CYS 22 Z CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf41 disulf ? ? J CYS 49 SG ? ? ? 1_555 J CYS 114 SG ? ? b CYS 49 b CYS 114 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf42 disulf ? ? J CYS 62 SG ? ? ? 1_555 J CYS 94 SG ? ? b CYS 62 b CYS 94 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf43 disulf ? ? J CYS 63 SG ? ? ? 1_555 J CYS 96 SG ? ? b CYS 63 b CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.049 ? ? disulf44 disulf ? ? J CYS 259 SG ? ? ? 1_555 J CYS 271 SG ? ? b CYS 259 b CYS 271 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf45 disulf ? ? J CYS 301 SG ? ? ? 1_555 J CYS 376 SG ? ? b CYS 301 b CYS 376 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.048 ? ? disulf46 disulf ? ? J CYS 306 SG ? ? ? 1_555 J CYS 380 SG ? ? b CYS 306 b CYS 380 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.048 ? ? disulf47 disulf ? ? J CYS 328 SG ? ? ? 1_555 J CYS 370 SG ? ? b CYS 328 b CYS 370 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? ? disulf48 disulf ? ? K CYS 62 SG ? ? ? 1_555 K CYS 94 SG ? ? g CYS 62 g CYS 94 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf49 disulf ? ? K CYS 63 SG ? ? ? 1_555 K CYS 96 SG ? ? g CYS 63 g CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? ? disulf50 disulf ? ? K CYS 259 SG ? ? ? 1_555 K CYS 271 SG ? ? g CYS 259 g CYS 271 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? ? disulf51 disulf ? ? K CYS 301 SG ? ? ? 1_555 K CYS 376 SG ? ? g CYS 301 g CYS 376 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? ? disulf52 disulf ? ? K CYS 306 SG ? ? ? 1_555 K CYS 380 SG ? ? g CYS 306 g CYS 380 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.047 ? ? disulf53 disulf ? ? K CYS 328 SG ? ? ? 1_555 K CYS 370 SG ? ? g CYS 328 g CYS 370 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf54 disulf ? ? L CYS 19 SG ? ? ? 1_555 L CYS 123 SG ? ? j CYS 19 j CYS 123 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf55 disulf ? ? L CYS 22 SG ? ? ? 1_555 L CYS 27 SG ? ? j CYS 22 j CYS 27 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf56 disulf ? ? L CYS 90 SG ? ? ? 1_555 L CYS 104 SG ? ? j CYS 90 j CYS 104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.999 ? ? disulf57 disulf ? ? L CYS 151 SG ? ? ? 1_555 L CYS 266 SG ? ? j CYS 151 j CYS 266 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? ? disulf58 disulf ? ? L CYS 200 SG ? ? ? 1_555 L CYS 226 SG ? ? j CYS 200 j CYS 226 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf59 disulf ? ? L CYS 202 SG ? ? ? 1_555 L CYS 220 SG ? ? j CYS 202 j CYS 220 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? ? disulf60 disulf ? ? M CYS 19 SG ? ? ? 1_555 M CYS 123 SG ? ? n CYS 19 n CYS 123 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf61 disulf ? ? M CYS 22 SG ? ? ? 1_555 M CYS 27 SG ? ? n CYS 22 n CYS 27 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? ? disulf62 disulf ? ? M CYS 90 SG ? ? ? 1_555 M CYS 104 SG ? ? n CYS 90 n CYS 104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf63 disulf ? ? M CYS 151 SG ? ? ? 1_555 M CYS 266 SG ? ? n CYS 151 n CYS 266 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf64 disulf ? ? M CYS 200 SG ? ? ? 1_555 M CYS 226 SG ? ? n CYS 200 n CYS 226 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? ? disulf65 disulf ? ? M CYS 202 SG ? ? ? 1_555 M CYS 220 SG ? ? n CYS 202 n CYS 220 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? ? disulf66 disulf ? ? N CYS 62 SG ? ? ? 1_555 N CYS 94 SG ? ? o CYS 62 o CYS 94 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf67 disulf ? ? N CYS 63 SG ? ? ? 1_555 N CYS 96 SG ? ? o CYS 63 o CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? ? disulf68 disulf ? ? N CYS 259 SG ? ? ? 1_555 N CYS 271 SG ? ? o CYS 259 o CYS 271 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? ? disulf69 disulf ? ? N CYS 301 SG ? ? ? 1_555 N CYS 376 SG ? ? o CYS 301 o CYS 376 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf70 disulf ? ? N CYS 306 SG ? ? ? 1_555 N CYS 380 SG ? ? o CYS 306 o CYS 380 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? ? disulf71 disulf ? ? N CYS 328 SG ? ? ? 1_555 N CYS 370 SG ? ? o CYS 328 o CYS 370 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf72 disulf ? ? O CYS 19 SG ? ? ? 1_555 O CYS 123 SG ? ? q CYS 19 q CYS 123 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? ? disulf73 disulf ? ? 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A SER 100 Z GLY 104 I B GLY 100 Z 1 5.05 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 4 ? AA2 ? 8 ? AA3 ? 4 ? AA4 ? 2 ? AA5 ? 2 ? AA6 ? 4 ? AA7 ? 4 ? AA8 ? 5 ? AA9 ? 4 ? AB1 ? 6 ? AB2 ? 4 ? AB3 ? 4 ? AB4 ? 2 ? AB5 ? 2 ? AB6 ? 2 ? AB7 ? 4 ? AB8 ? 2 ? AB9 ? 2 ? AC1 ? 5 ? AC2 ? 2 ? AC3 ? 4 ? AC4 ? 3 ? AC5 ? 3 ? AC6 ? 2 ? AC7 ? 3 ? AC8 ? 3 ? AC9 ? 3 ? AD1 ? 3 ? AD2 ? 2 ? AD3 ? 5 ? AD4 ? 3 ? AD5 ? 2 ? AD6 ? 3 ? AD7 ? 3 ? AD8 ? 3 ? AD9 ? 3 ? AE1 ? 5 ? AE2 ? 4 ? AE3 ? 8 ? AE4 ? 4 ? AE5 ? 2 ? AE6 ? 2 ? AE7 ? 2 ? AE8 ? 4 ? AE9 ? 2 ? AF1 ? 2 ? AF2 ? 2 ? AF3 ? 5 ? AF4 ? 3 ? AF5 ? 2 ? AF6 ? 3 ? AF7 ? 3 ? AF8 ? 3 ? AF9 ? 3 ? AG1 ? 4 ? AG2 ? 7 ? AG3 ? 4 ? AG4 ? 7 ? AG5 ? 4 ? AG6 ? 7 ? AG7 ? 4 ? AG8 ? 10 ? AG9 ? 3 ? AH1 ? 2 ? AH2 ? 4 ? AH3 ? 4 ? AH4 ? 5 ? AH5 ? 4 ? AH6 ? 6 ? AH7 ? 4 ? AH8 ? 2 ? AH9 ? 2 ? AI1 ? 2 ? AI2 ? 2 ? AI3 ? 4 ? AI4 ? 2 ? AI5 ? 5 ? AI6 ? 2 ? AI7 ? 4 ? AI8 ? 4 ? AI9 ? 3 ? AJ1 ? 2 ? AJ2 ? 3 ? AJ3 ? 4 ? AJ4 ? 3 ? AJ5 ? 3 ? 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AY2 ? 4 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA1 3 4 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA2 2 8 ? anti-parallel AA2 3 4 ? anti-parallel AA2 3 5 ? anti-parallel AA2 5 6 ? anti-parallel AA2 7 8 ? anti-parallel AA3 1 4 ? anti-parallel AA3 2 4 ? anti-parallel AA3 3 4 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA6 3 4 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA7 3 4 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA8 3 4 ? anti-parallel AA8 4 5 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AA9 2 3 ? anti-parallel AA9 3 4 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB1 2 3 ? anti-parallel AB1 2 6 ? anti-parallel AB1 3 4 ? anti-parallel AB1 5 6 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB2 2 3 ? anti-parallel AB2 3 4 ? anti-parallel AB3 1 4 ? anti-parallel AB3 2 4 ? anti-parallel AB3 3 4 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB7 2 3 ? anti-parallel AB7 3 4 ? anti-parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB9 1 2 ? anti-parallel AC1 1 2 ? anti-parallel AC1 2 3 ? anti-parallel AC1 3 4 ? anti-parallel AC1 4 5 ? anti-parallel AC2 1 2 ? anti-parallel AC3 1 2 ? anti-parallel AC3 2 3 ? anti-parallel AC3 3 4 ? anti-parallel AC4 1 2 ? anti-parallel AC4 2 3 ? anti-parallel AC5 1 2 ? anti-parallel AC5 2 3 ? anti-parallel AC6 1 2 ? anti-parallel AC7 1 2 ? anti-parallel AC7 2 3 ? anti-parallel AC8 1 2 ? anti-parallel AC8 2 3 ? anti-parallel AC9 1 2 ? anti-parallel AC9 2 3 ? anti-parallel AD1 1 2 ? anti-parallel AD1 2 3 ? anti-parallel AD2 1 2 ? anti-parallel AD3 1 2 ? anti-parallel AD3 2 3 ? anti-parallel AD3 2 5 ? anti-parallel AD3 3 4 ? anti-parallel AD4 1 2 ? anti-parallel AD4 2 3 ? anti-parallel AD5 1 2 ? anti-parallel AD6 1 2 ? anti-parallel AD6 2 3 ? anti-parallel AD7 1 2 ? anti-parallel AD7 2 3 ? anti-parallel AD8 1 2 ? anti-parallel AD8 2 3 ? anti-parallel AD9 1 2 ? anti-parallel AD9 2 3 ? anti-parallel AE1 1 2 ? anti-parallel AE1 2 3 ? anti-parallel AE1 3 4 ? anti-parallel AE1 4 5 ? anti-parallel AE2 1 2 ? anti-parallel AE2 2 3 ? anti-parallel AE2 3 4 ? anti-parallel AE3 1 2 ? anti-parallel AE3 2 3 ? anti-parallel AE3 2 8 ? anti-parallel AE3 3 4 ? anti-parallel AE3 3 5 ? anti-parallel AE3 5 6 ? anti-parallel AE3 7 8 ? anti-parallel AE4 1 4 ? anti-parallel AE4 2 4 ? anti-parallel AE4 3 4 ? anti-parallel AE5 1 2 ? anti-parallel AE6 1 2 ? anti-parallel AE7 1 2 ? anti-parallel AE8 1 2 ? anti-parallel AE8 2 3 ? anti-parallel AE8 3 4 ? anti-parallel AE9 1 2 ? anti-parallel AF1 1 2 ? anti-parallel AF2 1 2 ? anti-parallel AF3 1 2 ? anti-parallel AF3 2 3 ? anti-parallel AF3 2 5 ? anti-parallel AF3 3 4 ? anti-parallel AF4 1 2 ? anti-parallel AF4 2 3 ? anti-parallel AF5 1 2 ? anti-parallel AF6 1 2 ? anti-parallel AF6 2 3 ? anti-parallel AF7 1 2 ? anti-parallel AF7 2 3 ? anti-parallel AF8 1 2 ? anti-parallel AF8 2 3 ? anti-parallel AF9 1 2 ? anti-parallel AF9 2 3 ? anti-parallel AG1 1 2 ? anti-parallel AG1 2 3 ? anti-parallel AG1 3 4 ? anti-parallel AG2 1 7 ? parallel AG2 2 3 ? anti-parallel AG2 2 5 ? anti-parallel AG2 3 4 ? anti-parallel AG2 5 6 ? anti-parallel AG2 5 7 ? anti-parallel AG3 1 2 ? anti-parallel AG3 2 3 ? anti-parallel AG3 3 4 ? anti-parallel AG4 1 7 ? parallel AG4 2 3 ? anti-parallel AG4 2 5 ? anti-parallel AG4 3 4 ? anti-parallel AG4 5 6 ? anti-parallel AG4 5 7 ? anti-parallel AG5 1 2 ? anti-parallel AG5 2 3 ? anti-parallel AG5 3 4 ? anti-parallel AG6 1 7 ? parallel AG6 2 3 ? anti-parallel AG6 2 5 ? anti-parallel AG6 3 4 ? anti-parallel AG6 5 6 ? anti-parallel AG6 5 7 ? anti-parallel AG7 1 2 ? anti-parallel AG7 2 3 ? anti-parallel AG7 3 4 ? anti-parallel AG8 1 2 ? anti-parallel AG8 2 3 ? anti-parallel AG8 2 7 ? anti-parallel AG8 2 10 ? anti-parallel AG8 3 4 ? anti-parallel AG8 3 5 ? anti-parallel AG8 5 6 ? anti-parallel AG8 7 8 ? 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anti-parallel AI8 2 3 ? anti-parallel AI8 3 4 ? anti-parallel AI9 1 2 ? anti-parallel AI9 2 3 ? anti-parallel AJ1 1 2 ? anti-parallel AJ2 1 2 ? anti-parallel AJ2 2 3 ? anti-parallel AJ3 1 2 ? anti-parallel AJ3 2 3 ? anti-parallel AJ3 3 4 ? anti-parallel AJ4 1 2 ? anti-parallel AJ4 2 3 ? anti-parallel AJ5 1 2 ? anti-parallel AJ5 2 3 ? anti-parallel AJ6 1 2 ? anti-parallel AJ7 1 2 ? anti-parallel AJ7 2 3 ? anti-parallel AJ7 2 5 ? anti-parallel AJ7 3 4 ? anti-parallel AJ8 1 2 ? anti-parallel AJ8 2 3 ? anti-parallel AJ9 1 2 ? anti-parallel AK1 1 2 ? anti-parallel AK1 2 3 ? anti-parallel AK2 1 2 ? anti-parallel AK2 2 3 ? anti-parallel AK2 3 4 ? anti-parallel AK3 1 2 ? anti-parallel AK3 2 3 ? anti-parallel AK4 1 2 ? anti-parallel AK4 2 3 ? anti-parallel AK5 1 2 ? anti-parallel AK5 2 3 ? anti-parallel AK5 3 4 ? anti-parallel AK5 4 5 ? anti-parallel AK6 1 2 ? anti-parallel AK6 2 3 ? anti-parallel AK6 3 4 ? anti-parallel AK7 1 2 ? anti-parallel AK7 2 3 ? anti-parallel AK7 2 6 ? anti-parallel AK7 3 4 ? anti-parallel AK7 5 6 ? anti-parallel AK8 1 2 ? anti-parallel AK8 2 3 ? anti-parallel AK8 3 4 ? anti-parallel AK9 1 4 ? anti-parallel AK9 2 4 ? anti-parallel AK9 3 4 ? anti-parallel AL1 1 2 ? anti-parallel AL2 1 2 ? anti-parallel AL3 1 2 ? anti-parallel AL4 1 2 ? anti-parallel AL4 2 3 ? anti-parallel AL4 3 4 ? anti-parallel AL5 1 2 ? anti-parallel AL6 1 2 ? anti-parallel AL7 1 2 ? anti-parallel AL8 1 2 ? anti-parallel AL8 2 3 ? anti-parallel AL8 2 5 ? anti-parallel AL8 3 4 ? anti-parallel AL9 1 2 ? anti-parallel AL9 2 3 ? anti-parallel AM1 1 2 ? anti-parallel AM2 1 2 ? anti-parallel AM3 1 2 ? anti-parallel AM3 2 3 ? anti-parallel AM3 3 4 ? anti-parallel AM4 1 2 ? anti-parallel AM4 2 3 ? anti-parallel AM5 1 2 ? anti-parallel AM5 2 3 ? anti-parallel AM6 1 2 ? anti-parallel AM6 2 3 ? anti-parallel AM6 3 4 ? anti-parallel AM7 1 2 ? anti-parallel AM7 2 3 ? anti-parallel AM7 3 4 ? anti-parallel AM7 3 5 ? anti-parallel AM7 5 6 ? anti-parallel AM8 1 4 ? anti-parallel AM8 2 4 ? anti-parallel AM8 3 4 ? 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