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445 464 464 THR THR I . n I 3 446 THR 446 465 465 THR THR I . n I 3 447 GLU 447 466 466 GLU GLU I . n I 3 448 ILE 448 467 467 ILE ILE I . n I 3 449 PHE 449 468 468 PHE PHE I . n I 3 450 ARG 450 469 469 ARG ARG I . n I 3 451 PRO 451 470 470 PRO PRO I . n I 3 452 GLY 452 471 471 GLY GLY I . n I 3 453 GLY 453 472 472 GLY GLY I . n I 3 454 GLY 454 473 473 GLY GLY I . n I 3 455 ASP 455 474 474 ASP ASP I . n I 3 456 MET 456 475 475 MET MET I . n I 3 457 ARG 457 476 476 ARG ARG I . n I 3 458 ASP 458 477 477 ASP ASP I . n I 3 459 ASN 459 478 478 ASN ASN I . n I 3 460 TRP 460 479 479 TRP TRP I . n I 3 461 ARG 461 480 480 ARG ARG I . n I 3 462 SER 462 481 481 SER SER I . n I 3 463 GLU 463 482 482 GLU GLU I . n I 3 464 LEU 464 483 483 LEU LEU I . n I 3 465 TYR 465 484 484 TYR TYR I . n I 3 466 LYS 466 485 485 LYS LYS I . n I 3 467 TYR 467 486 486 TYR TYR I . n I 3 468 LYS 468 487 487 LYS LYS I . n I 3 469 VAL 469 488 488 VAL VAL I . n I 3 470 VAL 470 489 489 VAL VAL I . n I 3 471 ARG 471 490 490 ARG ARG I . n I 3 472 ILE 472 491 491 ILE ILE I . n I 3 473 GLU 473 492 492 GLU GLU I . n I 3 474 PRO 474 493 493 PRO PRO I . n I 3 475 LEU 475 494 494 LEU LEU I . n I 3 476 GLY 476 495 495 GLY GLY I . n I 3 477 VAL 477 496 496 VAL VAL I . n I 3 478 ALA 478 497 497 ALA ALA I . n I 3 479 PRO 479 498 498 PRO PRO I . n I 3 480 THR 480 499 499 THR THR I . n I 3 481 LYS 481 500 500 LYS LYS I . n I 3 482 CYS 482 501 501 CYS CYS I . n I 3 483 LYS 483 502 502 LYS LYS I . n I 3 484 ARG 484 503 503 ARG ARG I . n I 3 485 ARG 485 504 504 ARG ARG I . n I 3 486 VAL 486 505 505 VAL VAL I . n I 3 487 VAL 487 506 506 VAL VAL I . n I 3 488 GLN 488 507 ? ? ? I . n # loop_ _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.hetero J 4 NAG 1 J NAG 1 A NAG 509 n J 4 NAG 2 J NAG 2 A NAG 510 n K 4 NAG 1 K NAG 1 A NAG 511 n K 4 NAG 2 K NAG 2 A NAG 512 n L 4 NAG 1 L NAG 1 F NAG 509 n L 4 NAG 2 L NAG 2 F NAG 510 n M 4 NAG 1 M NAG 1 F NAG 511 n M 4 NAG 2 M NAG 2 F NAG 512 n N 4 NAG 1 N NAG 1 I NAG 509 n N 4 NAG 2 N NAG 2 I NAG 510 n O 4 NAG 1 O NAG 1 I NAG 511 n O 4 NAG 2 O NAG 2 I NAG 512 n # _pdbx_entity_instance_feature.ordinal 1 _pdbx_entity_instance_feature.comp_id NAG _pdbx_entity_instance_feature.asym_id ? _pdbx_entity_instance_feature.seq_num ? _pdbx_entity_instance_feature.auth_comp_id NAG _pdbx_entity_instance_feature.auth_asym_id ? _pdbx_entity_instance_feature.auth_seq_num ? _pdbx_entity_instance_feature.feature_type 'SUBJECT OF INVESTIGATION' _pdbx_entity_instance_feature.details ? # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code P 5 NAG 1 701 665 NAG NAG B . Q 5 NAG 1 601 507 NAG NAG A . R 5 NAG 1 602 508 NAG NAG A . S 5 NAG 1 603 513 NAG NAG A . T 5 NAG 1 604 514 NAG NAG A . U 5 NAG 1 605 515 NAG NAG A . V 5 NAG 1 606 516 NAG NAG A . W 5 NAG 1 701 665 NAG NAG E . X 5 NAG 1 601 507 NAG NAG F . Y 5 NAG 1 602 508 NAG NAG F . Z 5 NAG 1 603 513 NAG NAG F . AA 5 NAG 1 604 514 NAG NAG F . BA 5 NAG 1 605 515 NAG NAG F . CA 5 NAG 1 606 516 NAG NAG F . DA 5 NAG 1 701 665 NAG NAG H . EA 5 NAG 1 601 507 NAG NAG I . FA 5 NAG 1 602 508 NAG NAG I . GA 5 NAG 1 603 513 NAG NAG I . HA 5 NAG 1 604 514 NAG NAG I . IA 5 NAG 1 605 515 NAG NAG I . 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UNP Q1AII4 ILE 136 conflict 646 21 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details nonameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 9 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'not applicable' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 ARG A 83 ? 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N-Glycosylation covale27 covale one ? I ASN 370 ND2 ? ? ? 1_555 IA NAG . C1 ? ? I ASN 386 I NAG 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.510 ? N-Glycosylation covale28 covale both ? J NAG . O4 ? ? ? 1_555 J NAG . C1 ? ? J NAG 1 J NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.390 ? ? covale29 covale both ? K NAG . O4 ? ? ? 1_555 K NAG . C1 ? ? K NAG 1 K NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.391 ? ? covale30 covale both ? L NAG . O4 ? ? ? 1_555 L NAG . C1 ? ? L NAG 1 L NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.391 ? ? covale31 covale both ? M NAG . O4 ? ? ? 1_555 M NAG . C1 ? ? M NAG 1 M NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.392 ? ? covale32 covale both ? N NAG . O4 ? ? ? 1_555 N NAG . C1 ? ? N NAG 1 N NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.390 ? ? covale33 covale both ? O NAG . O4 ? ? ? 1_555 O NAG . C1 ? ? O NAG 1 O NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.391 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? # loop_ _pdbx_modification_feature.ordinal _pdbx_modification_feature.label_comp_id _pdbx_modification_feature.label_asym_id _pdbx_modification_feature.label_seq_id _pdbx_modification_feature.label_alt_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_alt_id _pdbx_modification_feature.auth_comp_id _pdbx_modification_feature.auth_asym_id _pdbx_modification_feature.auth_seq_id _pdbx_modification_feature.PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.symmetry _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.modified_residue_symmetry _pdbx_modification_feature.comp_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id _pdbx_modification_feature.ref_pcm_id _pdbx_modification_feature.ref_comp_id _pdbx_modification_feature.type _pdbx_modification_feature.category 1 NAG AA . ? 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RECONSTRUCTION ? 13 1 ? ? cryoSPARC ? ? # _em_specimen.concentration ? _em_specimen.details ? _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.id 1 _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # loop_ _pdbx_audit_support.funding_organization _pdbx_audit_support.country _pdbx_audit_support.grant_number _pdbx_audit_support.ordinal 'Other private' 'United States' 'W.W.Smith Charitable Trust #A2404' 1 'National Institutes of Health/National Institute Of Allergy and Infectious Diseases (NIH/NIAID)' 'United States' AI166916-01A1 2 # loop_ _pdbx_entity_branch_list.entity_id _pdbx_entity_branch_list.comp_id _pdbx_entity_branch_list.num _pdbx_entity_branch_list.hetero 4 NAG 1 n 4 NAG 2 n # _atom_sites.entry_id 9OAJ _atom_sites.Cartn_transf_matrix[1][1] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[1][2] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[1][3] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[2][1] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[2][2] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[2][3] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[3][1] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[3][2] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[3][3] ? _atom_sites.Cartn_transf_vector[1] ? _atom_sites.Cartn_transf_vector[2] ? _atom_sites.Cartn_transf_vector[3] ? _atom_sites.Cartn_transform_axes ? _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0.00000 _atom_sites.solution_primary ? _atom_sites.solution_secondary ? _atom_sites.solution_hydrogens ? _atom_sites.special_details ? # loop_ _atom_type.symbol C N O S # loop_ #