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_citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country US _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev Biorxiv _citation.journal_id_ASTM ? _citation.journal_id_CSD ? _citation.journal_id_ISSN 2692-8205 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume ? _citation.language ? _citation.page_first ? _citation.page_last ? _citation.title 'Virus glycoprotein nanodisc platform for vaccine design.' _citation.year 2025 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1101/2025.05.02.651272 _citation.pdbx_database_id_PubMed 40666859 _citation.pdbx_database_id_patent ? _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Rantalainen, K.' 1 0000-0002-3158-9183 primary 'Liguori, A.' 2 ? primary 'Ozorowski, G.' 3 ? primary 'Flynn, C.' 4 ? primary 'Steichen, J.M.' 5 ? primary 'Swanson, O.' 6 0000-0001-8162-8358 primary 'Madden, P.J.' 7 ? primary 'Baboo, S.' 8 0000-0002-4547-5160 primary 'Phulera, S.' 9 0000-0002-1272-7712 primary 'Gharpure, A.' 10 ? primary 'Lu, D.' 11 ? primary 'Kalyuzhniy, O.' 12 ? primary 'Skog, P.' 13 ? primary 'Terada, S.' 14 ? primary 'Shil, M.' 15 ? primary 'Diedrich, J.K.' 16 ? primary 'Georgeson, E.' 17 ? primary 'Tingle, R.' 18 ? primary 'Eskandarzadeh, S.' 19 ? primary 'Lee, W.H.' 20 ? primary 'Alavi, N.' 21 ? primary 'Goodwin, D.' 22 ? primary 'Kubitz, M.' 23 ? primary 'Amirzehni, S.' 24 ? primary 'Himansu, S.' 25 ? primary 'Sok, D.' 26 ? primary 'Lee, J.H.' 27 ? primary 'Yates, J.R.' 28 ? primary 'Paulson, J.C.' 29 ? primary 'Crotty, S.' 30 0000-0002-6484-6262 primary 'Schiffner, T.' 31 ? primary 'Ward, A.B.' 32 0000-0001-7153-3769 primary 'Schief, W.R.' 33 ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer man 'BG18 Fab heavy chain' 25043.186 3 ? ? ? ? 2 polymer man 'BG18 Fab light chain' 22937.352 3 ? ? ? ? 3 polymer man '10E8 Fab heavy chain' 25447.475 1 ? ? ? ? 4 polymer man 'VRC01 Fab heavy chain' 24367.631 3 ? ? ? ? 5 polymer man '10E8 Fab light chain' 22989.459 1 ? ? ? ? 6 polymer man 'VRC01 Fab light chain' 23172.686 3 ? ? ? ? 7 polymer man 'Envelope glycoprotein gp160' 81468.094 3 ? ? ? ? 8 branched man 'beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose' 586.542 1 ? ? ? ? 9 branched man ;alpha-D-mannopyranose-(1-3)-beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; 748.682 1 ? ? ? ? 10 branched man 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1072.964 1 ? ? ? ? 18 non-polymer syn 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose 221.208 30 ? ? ? ? # _entity_name_com.entity_id 7 _entity_name_com.name 'Env polyprotein' # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no ;QVQLRESGPGLVKPSETLSLSCTVSNDSRPSDHSWTWVRQSPGKALEWIGDIHYNGATTYNPSLRSRVRIELDQSIPRFS LKMTSMTAADTGMYYCARNAIRIYGVVALGEWFHYGMDVWGQGTAVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVK DYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSC ; ;QVQLRESGPGLVKPSETLSLSCTVSNDSRPSDHSWTWVRQSPGKALEWIGDIHYNGATTYNPSLRSRVRIELDQSIPRFS LKMTSMTAADTGMYYCARNAIRIYGVVALGEWFHYGMDVWGQGTAVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVK DYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSC ; D,F,I ? 2 'polypeptide(L)' no no ;SSELTQPPSVSVSPGQTARITCSGAPLTSRFTYWYRQKPGQAPVLIISRSSQRSSGWSGRFSASWSGTTVTLTIRGVQAD DEADYYCQSSDTSDSYKMFGGGTKLTVLGQPKAAPSVTLFPPSSEELQANKATLVCLISDFYPGAVTVAWKADSSPVKAG VETTTPSKQSNNKYAASSYLSLTPEQWKSHRSYSCQVTHEGSTVEKTVAPTECS ; ;SSELTQPPSVSVSPGQTARITCSGAPLTSRFTYWYRQKPGQAPVLIISRSSQRSSGWSGRFSASWSGTTVTLTIRGVQAD DEADYYCQSSDTSDSYKMFGGGTKLTVLGQPKAAPSVTLFPPSSEELQANKATLVCLISDFYPGAVTVAWKADSSPVKAG VETTTPSKQSNNKYAASSYLSLTPEQWKSHRSYSCQVTHEGSTVEKTVAPTECS ; E,G,J ? 3 'polypeptide(L)' no no ;EVQLVESGGGLVKPGGSLRLSCSASGFDFDNAWMTWVRQPPGKGLEWVGRITGPGEGWSVDYAAPVEGRFTISRLNSINF LYLEMNNLRMEDSGLYFCARTGKYYDFWSGYPPGEEYFQDWGRGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLV KDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPKSCDK ; ;EVQLVESGGGLVKPGGSLRLSCSASGFDFDNAWMTWVRQPPGKGLEWVGRITGPGEGWSVDYAAPVEGRFTISRLNSINF LYLEMNNLRMEDSGLYFCARTGKYYDFWSGYPPGEEYFQDWGRGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLV KDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPKSCDK ; H ? 4 'polypeptide(L)' no no ;QVQLVQSGGQMKKPGESMRISCRASGYEFIDCTLNWIRLAPGKRPEWMGWLKPRGGAVNYARPLQGRVTMTRDVYSDTAF LELRSLTVDDTAVYFCTRGKNCDYNWDFEHWGRGTPVIVSSPSTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTV SWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKAEPKSC ; ;QVQLVQSGGQMKKPGESMRISCRASGYEFIDCTLNWIRLAPGKRPEWMGWLKPRGGAVNYARPLQGRVTMTRDVYSDTAF LELRSLTVDDTAVYFCTRGKNCDYNWDFEHWGRGTPVIVSSPSTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTV SWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKAEPKSC ; K,N,P ? 5 'polypeptide(L)' no no ;SYELTQETGVSVALGRTVTITCRGDSLRSHYASWYQKKPGQAPILLFYGKNNRPSGVPDRFSGSASGNRASLTISGAQAE DDAEYYCSSRDKSGSRLSVFGGGTKLTVLSQPKAAPSVTLFPPSSEELQANKATLVCLISDFYPGAVTVAWKADSSPVKA GVETTTPSKQSNNKYAASSYLSLTPEQWKSHRSYSCQVTHEGSTVEKTVAPTECS ; ;SYELTQETGVSVALGRTVTITCRGDSLRSHYASWYQKKPGQAPILLFYGKNNRPSGVPDRFSGSASGNRASLTISGAQAE DDAEYYCSSRDKSGSRLSVFGGGTKLTVLSQPKAAPSVTLFPPSSEELQANKATLVCLISDFYPGAVTVAWKADSSPVKA GVETTTPSKQSNNKYAASSYLSLTPEQWKSHRSYSCQVTHEGSTVEKTVAPTECS ; L ? 6 'polypeptide(L)' no no ;EIVLTQSPGTLSLSPGETAIISCRTSQYGSLAWYQQRPGQAPRLVIYSGSTRAAGIPDRFSGSRWGPDYNLTISNLESGD FGVYYCQQYEFFGQGTKVQVDIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVT EQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLRSPVTKSFNRGEC ; ;EIVLTQSPGTLSLSPGETAIISCRTSQYGSLAWYQQRPGQAPRLVIYSGSTRAAGIPDRFSGSRWGPDYNLTISNLESGD FGVYYCQQYEFFGQGTKVQVDIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVT EQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLRSPVTKSFNRGEC ; M,Q,O ? 7 'polypeptide(L)' no no ;TGAENLWVTVYYGVPVWKDAETTLFCASDAKAYETEKHNVWATHACVPTDPNPQEIHLENVIEEFNMWKNNMVEQMHEDI ISLWDQSLKPCVKLTPLCVTLQCTNVTNNITDDMRGELKNCSFNMTTELRDKKQKVYSLFYRLDVVQINENQGNRSNNSN KEYRLINCNTSAITQACPKVSFEPIPIHYCAPAGFAILKCKDKKFNGTGPCPSVSTVQCTHGIKPVVSTQLLLNGSLAEE EVIIRSENITNNAKNILVQLNTPVQINCTRPNNNTVKSIRIGPGQAFYYTGDIIGDIRQAHCNVSKATWNETLGKVVKQL RKHFGNNTIIRFAQSSGGDLEVTTHSFNCGGEFFYCNTSGLFNSTWISNTSVQGSNSTGSNDSITLPCRIKQIINMWQRI GQAMYAPPIQGVIRCVSNITGLILTRDGGSTNSTTETFRPGGGDMRDNWRSELYKYKVVKIEPLGVAPTRCKRRVVGSHS GSGGSGSGGHAAVGIGAVSLGFLGAAGSTMGAASMTLTVQARNLLSGIVQQQSNLLRAPEPQQHLLKDTHWGIKQLQARV LAVEHYLRDQQLLGIWGCSGKLICCTNVPWNSSWSNRDLSEIWDKMTWLQWDKEISNYTQIIYGLLEESQNQQEKNEQDL LALDKWASLWNWFDITNWLWYIKIFIMIVGGLIGLSIVFAVLSVIHRVRGSGGSGLEVLFQGPGSLEWSHPQFEKGGGSG GGSGGGSWSHPQFEK ; ;TGAENLWVTVYYGVPVWKDAETTLFCASDAKAYETEKHNVWATHACVPTDPNPQEIHLENVIEEFNMWKNNMVEQMHEDI ISLWDQSLKPCVKLTPLCVTLQCTNVTNNITDDMRGELKNCSFNMTTELRDKKQKVYSLFYRLDVVQINENQGNRSNNSN KEYRLINCNTSAITQACPKVSFEPIPIHYCAPAGFAILKCKDKKFNGTGPCPSVSTVQCTHGIKPVVSTQLLLNGSLAEE EVIIRSENITNNAKNILVQLNTPVQINCTRPNNNTVKSIRIGPGQAFYYTGDIIGDIRQAHCNVSKATWNETLGKVVKQL RKHFGNNTIIRFAQSSGGDLEVTTHSFNCGGEFFYCNTSGLFNSTWISNTSVQGSNSTGSNDSITLPCRIKQIINMWQRI GQAMYAPPIQGVIRCVSNITGLILTRDGGSTNSTTETFRPGGGDMRDNWRSELYKYKVVKIEPLGVAPTRCKRRVVGSHS GSGGSGSGGHAAVGIGAVSLGFLGAAGSTMGAASMTLTVQARNLLSGIVQQQSNLLRAPEPQQHLLKDTHWGIKQLQARV LAVEHYLRDQQLLGIWGCSGKLICCTNVPWNSSWSNRDLSEIWDKMTWLQWDKEISNYTQIIYGLLEESQNQQEKNEQDL LALDKWASLWNWFDITNWLWYIKIFIMIVGGLIGLSIVFAVLSVIHRVRGSGGSGLEVLFQGPGSLEWSHPQFEKGGGSG GGSGGGSWSHPQFEK ; A,B,C ? # _pdbx_entity_nonpoly.entity_id 18 _pdbx_entity_nonpoly.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _pdbx_entity_nonpoly.comp_id NAG # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 GLN n 1 2 VAL n 1 3 GLN n 1 4 LEU n 1 5 ARG n 1 6 GLU n 1 7 SER n 1 8 GLY n 1 9 PRO n 1 10 GLY n 1 11 LEU n 1 12 VAL n 1 13 LYS n 1 14 PRO n 1 15 SER n 1 16 GLU n 1 17 THR n 1 18 LEU n 1 19 SER n 1 20 LEU n 1 21 SER n 1 22 CYS n 1 23 THR n 1 24 VAL n 1 25 SER n 1 26 ASN n 1 27 ASP n 1 28 SER n 1 29 ARG n 1 30 PRO n 1 31 SER n 1 32 ASP n 1 33 HIS n 1 34 SER n 1 35 TRP n 1 36 THR n 1 37 TRP n 1 38 VAL n 1 39 ARG n 1 40 GLN n 1 41 SER n 1 42 PRO n 1 43 GLY n 1 44 LYS n 1 45 ALA n 1 46 LEU n 1 47 GLU n 1 48 TRP n 1 49 ILE n 1 50 GLY n 1 51 ASP n 1 52 ILE n 1 53 HIS n 1 54 TYR n 1 55 ASN n 1 56 GLY n 1 57 ALA n 1 58 THR n 1 59 THR n 1 60 TYR n 1 61 ASN n 1 62 PRO n 1 63 SER n 1 64 LEU n 1 65 ARG n 1 66 SER n 1 67 ARG n 1 68 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C CYS 385 C CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf45 disulf ? ? P CYS 471 SG ? ? ? 1_555 P CYS 585 SG ? ? C CYS 501 C CYS 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.044 ? ? disulf46 disulf ? ? P CYS 578 SG ? ? ? 1_555 P CYS 584 SG ? ? C CYS 598 C CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf47 disulf ? ? Q CYS 23 SG ? ? ? 1_555 Q CYS 86 SG ? ? O CYS 23 O CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.041 ? ? covale1 covale one ? A ASN 26 ND2 ? ? ? 1_555 IA NAG . C1 ? ? D ASN 26 D NAG 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale2 covale one ? C ASN 26 ND2 ? ? ? 1_555 JA NAG . C1 ? ? F ASN 26 F NAG 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? N-Glycosylation covale3 covale one ? F ASN 26 ND2 ? ? ? 1_555 KA NAG . C1 ? ? I ASN 26 I NAG 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale4 covale one ? N ASN 105 ND2 ? ? ? 1_555 PA NAG . C1 ? ? A ASN 133 A NAG 805 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale5 covale one ? N ASN 109 ND2 ? ? ? 1_555 LA NAG . C1 ? ? A ASN 137 A NAG 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale6 covale one ? N ASN 120 ND2 ? ? ? 1_555 QA NAG . C1 ? ? A ASN 156 A NAG 806 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale7 covale one ? N ASN 124 ND2 ? ? ? 1_555 MA NAG . C1 ? ? A ASN 160 A NAG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? N-Glycosylation covale8 covale one ? N ASN 169 ND2 ? ? ? 1_555 RA NAG . C1 ? ? A ASN 197 A NAG 807 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? N-Glycosylation covale9 covale one ? N ASN 206 ND2 ? ? ? 1_555 NA NAG . C1 ? ? A ASN 234 A NAG 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? N-Glycosylation covale10 covale one ? N ASN 234 ND2 ? ? ? 1_555 S NAG . C1 ? ? A ASN 262 S NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? N-Glycosylation covale11 covale one ? N ASN 248 ND2 ? ? ? 1_555 R NAG . C1 ? ? A ASN 276 R NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale12 covale one ? N ASN 267 ND2 ? ? ? 1_555 VA NAG . C1 ? ? A ASN 295 A NAG 811 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.428 ? N-Glycosylation covale13 covale one ? N ASN 273 ND2 ? ? ? 1_555 OA NAG . C1 ? ? A ASN 301 A NAG 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale14 covale one ? N ASN 303 ND2 ? ? ? 1_555 T NAG . C1 ? ? A ASN 332 T NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.431 ? N-Glycosylation covale15 covale one ? N ASN 310 ND2 ? ? ? 1_555 SA NAG . C1 ? ? A ASN 339 A NAG 808 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? N-Glycosylation covale16 covale one ? N ASN 357 ND2 ? ? ? 1_555 TA NAG . C1 ? ? A ASN 386 A NAG 809 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? N-Glycosylation covale17 covale one ? N ASN 363 ND2 ? ? ? 1_555 U NAG . C1 ? ? A ASN 392 U NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.453 ? N-Glycosylation covale18 covale one ? N ASN 418 ND2 ? ? ? 1_555 UA NAG . C1 ? ? A ASN 448 A NAG 810 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? N-Glycosylation covale19 covale one ? O ASN 105 ND2 ? ? ? 1_555 WA NAG . C1 ? ? B ASN 133 B NAG 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale20 covale one ? O ASN 109 ND2 ? ? ? 1_555 XA NAG . C1 ? ? B ASN 137 B NAG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? N-Glycosylation covale21 covale one ? O ASN 120 ND2 ? ? ? 1_555 V NAG . C1 ? ? B ASN 156 V NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale22 covale one ? O ASN 124 ND2 ? ? ? 1_555 YA NAG . C1 ? ? B ASN 160 B NAG 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale23 covale one ? O ASN 169 ND2 ? ? ? 1_555 W NAG . C1 ? ? B ASN 197 W NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale24 covale one ? O ASN 206 ND2 ? ? ? 1_555 ZA NAG . C1 ? ? B ASN 234 B NAG 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? N-Glycosylation covale25 covale one ? O ASN 234 ND2 ? ? ? 1_555 X NAG . C1 ? ? B ASN 262 X NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? N-Glycosylation covale26 covale one ? O ASN 248 ND2 ? ? ? 1_555 Y NAG . C1 ? ? B ASN 276 Y NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale27 covale one ? O ASN 267 ND2 ? ? ? 1_555 AB NAG . C1 ? ? B ASN 295 B NAG 805 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? N-Glycosylation covale28 covale one ? O ASN 273 ND2 ? ? ? 1_555 BB NAG . C1 ? ? B ASN 301 B NAG 806 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? N-Glycosylation covale29 covale one ? O ASN 303 ND2 ? ? ? 1_555 Z NAG . C1 ? ? B ASN 332 Z NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? N-Glycosylation covale30 covale one ? O ASN 310 ND2 ? ? ? 1_555 CB NAG . C1 ? ? B ASN 339 B NAG 807 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? N-Glycosylation covale31 covale one ? O ASN 357 ND2 ? ? ? 1_555 AA NAG . C1 ? ? B ASN 386 a NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.430 ? N-Glycosylation covale32 covale one ? O ASN 363 ND2 ? ? ? 1_555 BA NAG . C1 ? ? B ASN 392 b NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? N-Glycosylation covale33 covale one ? O ASN 418 ND2 ? ? ? 1_555 DB NAG . C1 ? ? B ASN 448 B NAG 808 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.429 ? N-Glycosylation covale34 covale one ? P ASN 105 ND2 ? ? ? 1_555 EB NAG . C1 ? ? C ASN 133 C NAG 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale35 covale one ? P ASN 109 ND2 ? ? ? 1_555 FB NAG . C1 ? ? C ASN 137 C NAG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? N-Glycosylation covale36 covale one ? P ASN 120 ND2 ? ? ? 1_555 CA NAG . C1 ? ? C ASN 156 c NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? N-Glycosylation covale37 covale one ? P ASN 124 ND2 ? ? ? 1_555 GB NAG . C1 ? ? C ASN 160 C NAG 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? N-Glycosylation covale38 covale one ? P ASN 169 ND2 ? ? ? 1_555 HB NAG . C1 ? ? C ASN 197 C NAG 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale39 covale one ? P ASN 206 ND2 ? ? ? 1_555 IB NAG . C1 ? ? C ASN 234 C NAG 805 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.431 ? N-Glycosylation covale40 covale one ? P ASN 234 ND2 ? ? ? 1_555 DA NAG . C1 ? ? C ASN 262 d NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale41 covale one ? P ASN 248 ND2 ? ? ? 1_555 EA NAG . C1 ? ? C ASN 276 e NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale42 covale one ? P ASN 267 ND2 ? ? ? 1_555 JB NAG . C1 ? ? C ASN 295 C NAG 806 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? N-Glycosylation covale43 covale one ? P ASN 273 ND2 ? ? ? 1_555 KB NAG . C1 ? ? C ASN 301 C NAG 807 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? N-Glycosylation covale44 covale one ? P ASN 303 ND2 ? ? ? 1_555 FA NAG . C1 ? ? C ASN 332 f NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? N-Glycosylation covale45 covale one ? P ASN 357 ND2 ? ? ? 1_555 GA NAG . C1 ? ? C ASN 386 g NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? N-Glycosylation covale46 covale one ? P ASN 363 ND2 ? ? ? 1_555 HA NAG . C1 ? ? C ASN 392 h NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? N-Glycosylation covale47 covale one ? P ASN 418 ND2 ? ? ? 1_555 LB NAG . C1 ? ? C ASN 448 C NAG 808 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale48 covale both ? R NAG . O4 ? ? ? 1_555 R NAG . C1 ? ? R NAG 1 R NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? ? covale49 covale both ? R NAG . O4 ? ? ? 1_555 R BMA . C1 ? ? R NAG 2 R BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? ? covale50 covale both ? S NAG . O4 ? ? ? 1_555 S NAG . C1 ? ? S NAG 1 S NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale51 covale both ? S NAG . O4 ? ? ? 1_555 S BMA . C1 ? ? S NAG 2 S BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? ? covale52 covale both ? S BMA . O3 ? ? ? 1_555 S MAN . C1 ? ? S BMA 3 S MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? ? covale53 covale both ? T NAG . O4 ? ? ? 1_555 T NAG . C1 ? ? T NAG 1 T NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? ? covale54 covale both ? T NAG . O4 ? ? ? 1_555 T BMA . C1 ? ? T NAG 2 T BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? ? covale55 covale both ? T BMA . O3 ? ? ? 1_555 T MAN . C1 ? ? T BMA 3 T MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? ? covale56 covale both ? T BMA . O6 ? ? ? 1_555 T MAN . C1 ? ? T BMA 3 T MAN 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? ? covale57 covale both ? T MAN . O2 ? ? ? 1_555 T MAN . C1 ? ? T MAN 4 T MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? ? covale58 covale both ? T MAN . O2 ? ? ? 1_555 T MAN . C1 ? ? T MAN 5 T MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? ? covale59 covale both ? T MAN . O6 ? ? ? 1_555 T MAN . C1 ? ? T MAN 7 T MAN 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? ? covale60 covale both ? T MAN . O3 ? ? ? 1_555 T MAN . C1 ? ? T MAN 7 T MAN 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? ? covale61 covale both ? T MAN . O2 ? ? ? 1_555 T MAN . C1 ? ? T MAN 8 T MAN 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.450 ? ? covale62 covale both ? U NAG . O4 ? ? ? 1_555 U NAG . C1 ? ? U NAG 1 U NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.453 ? ? covale63 covale both ? U NAG . O4 ? ? ? 1_555 U BMA . C1 ? ? U NAG 2 U BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.469 ? ? covale64 covale both ? U BMA . O6 ? ? ? 1_555 U MAN . C1 ? ? U BMA 3 U MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? ? covale65 covale both ? U BMA . O3 ? ? ? 1_555 U MAN . C1 ? ? U BMA 3 U MAN 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? ? covale66 covale both ? U MAN . O3 ? ? ? 1_555 U MAN . C1 ? ? U MAN 4 U MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? ? covale67 covale both ? U MAN . O2 ? ? ? 1_555 U MAN . C1 ? ? U MAN 5 U MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? ? covale68 covale both ? V NAG . O4 ? ? ? 1_555 V NAG . C1 ? ? V NAG 1 V NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale69 covale both ? W NAG . O4 ? ? ? 1_555 W NAG . C1 ? ? W NAG 1 W NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.474 ? ? covale70 covale both ? X NAG . O4 ? ? ? 1_555 X NAG . C1 ? ? X NAG 1 X NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? ? covale71 covale both ? X NAG . O4 ? ? ? 1_555 X BMA . C1 ? ? X NAG 2 X BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale72 covale both ? X BMA . O3 ? ? ? 1_555 X MAN . C1 ? ? X BMA 3 X MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? ? covale73 covale both ? X BMA . O6 ? ? ? 1_555 X MAN . C1 ? ? X BMA 3 X MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? ? covale74 covale both ? Y NAG . O4 ? ? ? 1_555 Y NAG . C1 ? ? Y NAG 1 Y NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? ? covale75 covale both ? Y NAG . O4 ? ? ? 1_555 Y BMA . C1 ? ? Y NAG 2 Y BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? ? covale76 covale both ? Y BMA . O6 ? ? ? 1_555 Y MAN . C1 ? ? Y BMA 3 Y MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale77 covale both ? Y BMA . O3 ? ? ? 1_555 Y MAN . C1 ? ? Y BMA 3 Y MAN 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale78 covale both ? Y MAN . O2 ? ? ? 1_555 Y MAN . C1 ? ? Y MAN 4 Y MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? ? covale79 covale both ? Y MAN . O6 ? ? ? 1_555 Y MAN . C1 ? ? Y MAN 4 Y MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? ? covale80 covale both ? Z NAG . O4 ? ? ? 1_555 Z NAG . C1 ? ? Z NAG 1 Z NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale81 covale both ? Z NAG . O4 ? ? ? 1_555 Z BMA . C1 ? ? Z NAG 2 Z BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? ? covale82 covale both ? Z BMA . O3 ? ? ? 1_555 Z MAN . C1 ? ? Z BMA 3 Z MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? ? covale83 covale both ? Z BMA . O6 ? ? ? 1_555 Z MAN . C1 ? ? Z BMA 3 Z MAN 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale84 covale both ? Z MAN . O2 ? ? ? 1_555 Z MAN . C1 ? ? Z MAN 4 Z MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale85 covale both ? Z MAN . O2 ? ? ? 1_555 Z MAN . C1 ? ? Z MAN 5 Z MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? ? covale86 covale both ? Z MAN . O6 ? ? ? 1_555 Z MAN . C1 ? ? Z MAN 7 Z MAN 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale87 covale both ? Z MAN . O3 ? ? ? 1_555 Z MAN . C1 ? ? Z MAN 7 Z MAN 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale88 covale both ? Z MAN . O2 ? ? ? 1_555 Z MAN . C1 ? ? Z MAN 8 Z MAN 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale89 covale both ? AA NAG . O4 ? ? ? 1_555 AA NAG . C1 ? ? a NAG 1 a NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? ? covale90 covale both ? BA NAG . O4 ? ? ? 1_555 BA NAG . C1 ? ? b NAG 1 b NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? ? covale91 covale both ? BA NAG . O4 ? ? ? 1_555 BA BMA . C1 ? ? b NAG 2 b BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale92 covale both ? BA BMA . O6 ? ? ? 1_555 BA MAN . C1 ? ? b BMA 3 b MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale93 covale both ? CA NAG . O4 ? ? ? 1_555 CA NAG . C1 ? ? c NAG 1 c NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale94 covale both ? DA NAG . O4 ? ? ? 1_555 DA NAG . C1 ? ? d NAG 1 d NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? ? covale95 covale both ? DA NAG . O4 ? ? ? 1_555 DA BMA . C1 ? ? d NAG 2 d BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.469 ? ? covale96 covale both ? DA BMA . O6 ? ? ? 1_555 DA MAN . C1 ? ? d BMA 3 d MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? ? covale97 covale both ? EA NAG . O4 ? ? ? 1_555 EA NAG . C1 ? ? e NAG 1 e NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? ? covale98 covale both ? EA NAG . O4 ? ? ? 1_555 EA BMA . C1 ? ? e NAG 2 e BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? ? covale99 covale both ? EA BMA . O3 ? ? ? 1_555 EA MAN . C1 ? ? e BMA 3 e MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale100 covale both ? EA BMA . O6 ? ? ? 1_555 EA MAN . C1 ? ? e BMA 3 e MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? ? covale101 covale both ? FA NAG . O4 ? ? ? 1_555 FA NAG . C1 ? ? f NAG 1 f NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? ? covale102 covale both ? FA NAG . O4 ? ? ? 1_555 FA BMA . C1 ? ? f NAG 2 f BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? ? covale103 covale both ? FA BMA . O3 ? ? ? 1_555 FA MAN . C1 ? ? f BMA 3 f MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? ? covale104 covale both ? FA BMA . O6 ? ? ? 1_555 FA MAN . C1 ? ? f BMA 3 f MAN 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? ? covale105 covale both ? FA MAN . O2 ? ? ? 1_555 FA MAN . C1 ? ? f MAN 4 f MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? ? covale106 covale both ? FA MAN . O2 ? ? ? 1_555 FA MAN . 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AG2 ? 6 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA1 3 4 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 1 4 ? anti-parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA2 4 5 ? anti-parallel AA2 4 6 ? anti-parallel AA3 1 6 ? parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA3 2 4 ? anti-parallel AA3 4 5 ? anti-parallel AA3 4 6 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA5 3 4 ? anti-parallel AA6 1 7 ? parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA6 2 5 ? anti-parallel AA6 3 4 ? anti-parallel AA6 5 6 ? anti-parallel AA6 5 7 ? anti-parallel AA7 1 6 ? parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA7 2 4 ? anti-parallel AA7 4 5 ? anti-parallel AA7 4 6 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA9 1 2 ? parallel AA9 2 3 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB1 2 3 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB2 2 3 ? 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SER H 17 CYS H 22 AB1 2 PHE E 80 ? ASN E 86 A PHE H 77 ASN H 82 AB1 3 PHE E 70 ? LEU E 75 ? PHE H 67 LEU H 72 AB2 1 VAL E 60 ? ASP E 61 ? VAL H 57 ASP H 58 AB2 2 GLU E 46 ? ILE E 51 ? GLU H 46 ILE H 51 AB2 3 THR E 35 ? ARG E 38 ? THR H 35 ARG H 38 AB2 4 PHE E 97 ? THR E 101 ? PHE H 91 THR H 95 AB2 5 PHE E 118 L TRP E 121 ? PHE H 100 TRP H 103 AB3 1 GLN F 3 ? SER F 7 ? GLN I 3 SER I 7 AB3 2 LEU F 18 ? SER F 25 ? LEU I 18 SER I 25 AB3 3 ARG F 78 ? MET F 83 ? ARG I 77 MET I 82 AB3 4 VAL F 68 ? ASP F 73 ? VAL I 67 ASP I 72 AB4 1 HIS F 33 ? GLN F 40 ? HIS I 33 GLN I 39 AB4 2 LEU F 46 ? ILE F 52 ? LEU I 45 ILE I 51 AB4 3 THR F 58 ? TYR F 60 ? THR I 57 TYR I 59 AB4 4 GLY F 92 ? ILE F 103 ? GLY I 88 ILE I 99 AB4 5 TRP F 112 H HIS F 114 J TRP I 100 HIS I 100 AB4 6 VAL F 119 ? TRP F 120 ? VAL I 102 TRP I 103 AB4 7 THR F 124 ? VAL F 126 ? THR I 107 VAL I 109 AB5 1 SER G 9 ? VAL G 12 ? SER J 9 VAL J 13 AB5 2 TYR G 33 ? GLN G 37 ? TYR J 34 GLN J 38 AB5 3 VAL G 44 ? ILE G 47 ? 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