data_9OGU # _entry.id 9OGU # _audit_conform.dict_name mmcif_pdbx.dic _audit_conform.dict_version 5.406 _audit_conform.dict_location http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic # loop_ _database_2.database_id _database_2.database_code _database_2.pdbx_database_accession _database_2.pdbx_DOI PDB 9OGU pdb_00009ogu 10.2210/pdb9ogu/pdb WWPDB D_1000295538 ? ? EMDB EMD-70476 ? ? # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal _pdbx_audit_revision_history.data_content_type _pdbx_audit_revision_history.major_revision _pdbx_audit_revision_history.minor_revision _pdbx_audit_revision_history.revision_date _pdbx_audit_revision_history.part_number 1 'Structure model' 1 0 2025-08-27 ? 2 'EM metadata' 1 0 2025-08-27 ? 3 FSC 1 0 2025-08-27 ? 4 'Half map' 1 0 2025-08-27 1 5 'Half map' 1 0 2025-08-27 2 6 Image 1 0 2025-08-27 ? 7 Mask 1 0 2025-08-27 ? 8 'Primary map' 1 0 2025-08-27 ? 9 'Structure model' 1 1 2025-09-10 ? 10 FSC 1 0 2025-08-27 ? 11 'Half map' 1 0 2025-08-27 1 12 'Half map' 1 0 2025-08-27 2 13 Image 1 0 2025-08-27 ? 14 Mask 1 0 2025-08-27 ? 15 'Primary map' 1 0 2025-08-27 ? 16 'Structure model' 1 2 2025-10-08 ? 17 'EM metadata' 1 1 2025-10-08 ? # loop_ _pdbx_audit_revision_details.ordinal _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_details.data_content_type _pdbx_audit_revision_details.provider _pdbx_audit_revision_details.type _pdbx_audit_revision_details.description _pdbx_audit_revision_details.details 1 1 'Structure model' repository 'Initial release' ? 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_pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 9OGU _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2025-05-01 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site RCSB _pdbx_database_status.process_site RCSB _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y # _pdbx_database_related.db_name EMDB _pdbx_database_related.details 'HIV-1 Env BG505 SOSIP.664-dPG-His in complex with PGT122 and 3BNC117 Fabs' _pdbx_database_related.db_id EMD-70476 _pdbx_database_related.content_type 'associated EM volume' # _pdbx_contact_author.id 2 _pdbx_contact_author.email andrew@scripps.edu _pdbx_contact_author.name_first Andrew _pdbx_contact_author.name_last Ward _pdbx_contact_author.name_mi B. _pdbx_contact_author.role 'principal investigator/group leader' _pdbx_contact_author.identifier_ORCID 0000-0001-7153-3769 # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Andrade, T.G.' 1 0000-0002-6904-6889 'Ozorowski, G.' 2 0000-0002-9695-8138 'Ward, A.B.' 3 0000-0001-7153-3769 # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country US _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev J.Virol. _citation.journal_id_ASTM JOVIAM _citation.journal_id_CSD 0825 _citation.journal_id_ISSN 1098-5514 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume 99 _citation.language ? _citation.page_first e0091325 _citation.page_last e0091325 _citation.title 'A modification to heptad repeat 1 of gp41 improves yield and/or quality of soluble pre-fusion HIV-1 envelope glycoprotein trimers.' _citation.year 2025 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1128/jvi.00913-25 _citation.pdbx_database_id_PubMed 40862550 _citation.pdbx_database_id_patent ? _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Chaturbhuj, D.N.' 1 0000-0003-0276-0671 primary 'Sliepen, K.' 2 ? primary 'Cupo, A.' 3 ? primary 'Steinberg, B.' 4 ? primary 'Kazimierczyk, S.' 5 ? primary 'Munawar, T.' 6 ? primary 'Kramer, K.' 7 ? primary 'Yasmeen, A.' 8 ? primary 'Andrade, T.G.' 9 ? primary 'Lee, W.-H.' 10 ? primary 'van der Maas, L.' 11 ? primary 'Gibson, G.' 12 ? primary 'Feliciano, O.' 13 ? primary 'Del Moral Sanchez, I.' 14 ? primary 'Schermer, E.' 15 ? primary 'Bronson, R.' 16 ? primary 'Benner, A.' 17 ? primary 'Prabhakaran, M.' 18 ? primary 'Mason, R.' 19 ? primary 'Klasse, P.J.' 20 0000-0001-8222-278X primary 'Ward, A.B.' 21 0000-0001-7153-3769 primary 'Ozorowski, G.' 22 0000-0002-9695-8138 primary 'Sanders, R.W.' 23 ? primary 'Moore, J.P.' 24 0000-0002-9902-6096 # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer man 'HIV-1 Envelope Glycoprotein BG505 SOSIP.664 gp120' 57945.977 3 ? 'T332N, A501C' 'UNP residues 30-505' ? 2 polymer man 'Envelope glycoprotein gp160' 18596.820 3 ? 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;alpha-D-mannopyranose-(1-3)-[alpha-D-mannopyranose-(1-6)]beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; 910.823 4 ? ? ? ? 12 branched man 'beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose' 586.542 4 ? ? ? ? 13 branched man ;alpha-D-mannopyranose-(1-2)-alpha-D-mannopyranose-(1-2)-alpha-D-mannopyranose-(1-3)-[alpha-D-mannopyranose-(1-6)]beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; 1235.105 2 ? ? ? ? 14 branched man 'beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose' 383.349 1 ? ? ? ? 15 non-polymer man 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose 221.208 28 ? ? ? ? # _entity_name_com.entity_id 2 _entity_name_com.name 'Env polyprotein' # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no ;MDAMKRGLCCVLLLCGAVFVSPSQEIHARFRRGARAENLWVTVYYGVPVWKDAETTLFCASDAKAYETEKHNVWATHACV PTDPNPQEIHLENVTEEFNMWKNNMVEQMHTDIISLWDQSLKPCVKLTPLCVTLQCTNVTNNITDDMRGELKNCSFNMTT ELRDKKQKVYSLFYRLDVVQINENQGNRSNNSNKEYRLINCNTSAITQACPKVSFEPIPIHYCAPAGFAILKCKDKKFNG TGPCPSVSTVQCTHGIKPVVSTQLLLNGSLAEEEVMIRSENITNNAKNILVQFNTPVQINCTRPNNNTRKSIRIGPGQAF YATGDIIGDIRQAHCNVSKATWNETLGKVVKQLRKHFGNNTIIRFANSSGGDLEVTTHSFNCGGEFFYCNTSGLFNSTWI SNTSVQGSNSTGSNDSITLPCRIKQIINMWQRIGQAMYAPPIQGVIRCVSNITGLILTRDGGSTNSTTETFRPGGGDMRD NWRSELYKYKVVKIEPLGVAPTRCKRRVVGRRRRRR ; ;MDAMKRGLCCVLLLCGAVFVSPSQEIHARFRRGARAENLWVTVYYGVPVWKDAETTLFCASDAKAYETEKHNVWATHACV PTDPNPQEIHLENVTEEFNMWKNNMVEQMHTDIISLWDQSLKPCVKLTPLCVTLQCTNVTNNITDDMRGELKNCSFNMTT ELRDKKQKVYSLFYRLDVVQINENQGNRSNNSNKEYRLINCNTSAITQACPKVSFEPIPIHYCAPAGFAILKCKDKKFNG TGPCPSVSTVQCTHGIKPVVSTQLLLNGSLAEEEVMIRSENITNNAKNILVQFNTPVQINCTRPNNNTRKSIRIGPGQAF YATGDIIGDIRQAHCNVSKATWNETLGKVVKQLRKHFGNNTIIRFANSSGGDLEVTTHSFNCGGEFFYCNTSGLFNSTWI SNTSVQGSNSTGSNDSITLPCRIKQIINMWQRIGQAMYAPPIQGVIRCVSNITGLILTRDGGSTNSTTETFRPGGGDMRD NWRSELYKYKVVKIEPLGVAPTRCKRRVVGRRRRRR ; A,E,C ? 2 'polypeptide(L)' no no ;AVGIGAVFLGFLGAAGSTMGAASMTLTVQARNLLSGIVQQQSNLLRAPEAQQHLPGTVWGIKQLQARVLAVERYLRDQQL LGIWGCSGKLICCTNVPWNSSWSNRNLSEIWDNMTWLQWDKEISNYTQIIYGLLEESQNQQEKNEQDLLALDGSGSGGSG HHHHHHHH ; ;AVGIGAVFLGFLGAAGSTMGAASMTLTVQARNLLSGIVQQQSNLLRAPEAQQHLPGTVWGIKQLQARVLAVERYLRDQQL LGIWGCSGKLICCTNVPWNSSWSNRNLSEIWDNMTWLQWDKEISNYTQIIYGLLEESQNQQEKNEQDLLALDGSGSGGSG HHHHHHHH ; F,D,B ? 3 'polypeptide(L)' no no ;QVQLLQSGAAVTKPGASVRVSCEASGYNIRDYFIHWWRQAPGQGLQWVGWINPKTGQPNNPRQFQGRVSLTRHASWDFDT YSFYMDLKALRSDDTAVYFCARQRSDYWDFDVWGSGTQVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPV TVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSC ; ;QVQLLQSGAAVTKPGASVRVSCEASGYNIRDYFIHWWRQAPGQGLQWVGWINPKTGQPNNPRQFQGRVSLTRHASWDFDT YSFYMDLKALRSDDTAVYFCARQRSDYWDFDVWGSGTQVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPV TVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSC ; H,M,P ? 4 'polypeptide(L)' no no ;DIQMTQSPSSLSASVGDTVTITCQANGYLNWYQQRRGKAPKLLIYDGSKLERGVPSRFSGRRWGQEYNLTINNLQPEDIA TYFCQVYEFVVPGTRLDLKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDS KDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC ; ;DIQMTQSPSSLSASVGDTVTITCQANGYLNWYQQRRGKAPKLLIYDGSKLERGVPSRFSGRRWGQEYNLTINNLQPEDIA TYFCQVYEFVVPGTRLDLKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDS KDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC ; I,L,Q ? 5 'polypeptide(L)' no no ;QVHLQESGPGLVKPSETLSLTCNVSGTLVRDNYWSWIRQPLGKQPEWIGYVHDSGDTNYNPSLKSRVHLSLDKSKNLVSL RLTGVTAADSAIYYCATTKHGRRIYGVVAFKEWFTYFYMDVWGKGTSVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCL VKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPKSC ; ;QVHLQESGPGLVKPSETLSLTCNVSGTLVRDNYWSWIRQPLGKQPEWIGYVHDSGDTNYNPSLKSRVHLSLDKSKNLVSL RLTGVTAADSAIYYCATTKHGRRIYGVVAFKEWFTYFYMDVWGKGTSVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCL VKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPKSC ; J,N,R ? 6 'polypeptide(L)' no no ;TFVSVAPGQTARITCGEESLGSRSVIWYQQRPGQAPSLIIYNNNDRPSGIPDRFSGSPGSTFGTTATLTITSVEAGDEAD YYCHIWDSRRPTNWVFGEGTTLIVLSQPKAAPSVTLFPPSSEELQANKATLVCLISDFYPGAVTVAWKADSSPVKAGVET TTPSKQSNNKYAASSYLSLTPEQWKSHKSYSCQVTHEGSTVEKTVAPTECS ; ;TFVSVAPGQTARITCGEESLGSRSVIWYQQRPGQAPSLIIYNNNDRPSGIPDRFSGSPGSTFGTTATLTITSVEAGDEAD YYCHIWDSRRPTNWVFGEGTTLIVLSQPKAAPSVTLFPPSSEELQANKATLVCLISDFYPGAVTVAWKADSSPVKAGVET TTPSKQSNNKYAASSYLSLTPEQWKSHKSYSCQVTHEGSTVEKTVAPTECS ; K,O,S ? # _pdbx_entity_nonpoly.entity_id 15 _pdbx_entity_nonpoly.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _pdbx_entity_nonpoly.comp_id NAG # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET n 1 2 ASP n 1 3 ALA n 1 4 MET n 1 5 LYS n 1 6 ARG n 1 7 GLY n 1 8 LEU n 1 9 CYS n 1 10 CYS n 1 11 VAL n 1 12 LEU n 1 13 LEU n 1 14 LEU n 1 15 CYS n 1 16 GLY n 1 17 ALA n 1 18 VAL n 1 19 PHE n 1 20 VAL n 1 21 SER n 1 22 PRO n 1 23 SER n 1 24 GLN n 1 25 GLU n 1 26 ILE n 1 27 HIS n 1 28 ALA n 1 29 ARG n 1 30 PHE n 1 31 ARG n 1 32 ARG n 1 33 GLY n 1 34 ALA n 1 35 ARG n 1 36 ALA n 1 37 GLU n 1 38 ASN n 1 39 LEU n 1 40 TRP n 1 41 VAL n 1 42 THR n 1 43 VAL n 1 44 TYR n 1 45 TYR n 1 46 GLY n 1 47 VAL n 1 48 PRO n 1 49 VAL n 1 50 TRP n 1 51 LYS n 1 52 ASP n 1 53 ALA n 1 54 GLU n 1 55 THR n 1 56 THR n 1 57 LEU n 1 58 PHE n 1 59 CYS n 1 60 ALA n 1 61 SER n 1 62 ASP n 1 63 ALA n 1 64 LYS n 1 65 ALA n 1 66 TYR n 1 67 GLU n 1 68 THR n 1 69 GLU n 1 70 LYS n 1 71 HIS n 1 72 ASN n 1 73 VAL n 1 74 TRP n 1 75 ALA n 1 76 THR n 1 77 HIS n 1 78 ALA n 1 79 CYS n 1 80 VAL n 1 81 PRO n 1 82 THR n 1 83 ASP n 1 84 PRO n 1 85 ASN n 1 86 PRO n 1 87 GLN n 1 88 GLU n 1 89 ILE n 1 90 HIS n 1 91 LEU n 1 92 GLU n 1 93 ASN n 1 94 VAL n 1 95 THR n 1 96 GLU 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'Homo sapiens' 9606 ? ? ? ? ? ? ? human 'Homo sapiens' 9606 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 7 oligosaccharide 8 oligosaccharide 9 oligosaccharide 10 oligosaccharide 11 oligosaccharide 12 oligosaccharide 13 oligosaccharide 14 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_descriptor.ordinal _pdbx_entity_branch_descriptor.entity_id _pdbx_entity_branch_descriptor.descriptor _pdbx_entity_branch_descriptor.type _pdbx_entity_branch_descriptor.program _pdbx_entity_branch_descriptor.program_version 1 7 DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1-ROH 'Glycam Condensed Sequence' GMML 1.0 2 7 'WURCS=2.0/1,2,1/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O]/1-1/a4-b1' WURCS PDB2Glycan 1.1.0 3 7 '[][D-1-deoxy-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{}}' LINUCS PDB-CARE ? 4 8 DManpa1-3DManpb1-4DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1-ROH 'Glycam Condensed Sequence' GMML 1.0 5 8 'WURCS=2.0/3,4,3/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O][a1122h-1b_1-5][a1122h-1a_1-5]/1-1-2-3/a4-b1_b4-c1_c3-d1' WURCS PDB2Glycan 1.1.0 6 8 '[][D-1-deoxy-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-Manp]{[(3+1)][a-D-Manp]{}}}}' LINUCS PDB-CARE ? 7 9 'DManpa1-2DManpa1-3[DManpa1-6]DManpb1-4DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1-ROH' 'Glycam Condensed Sequence' GMML 1.0 8 9 'WURCS=2.0/3,6,5/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O][a1122h-1b_1-5][a1122h-1a_1-5]/1-1-2-3-3-3/a4-b1_b4-c1_c3-d1_c6-f1_d2-e1' WURCS PDB2Glycan 1.1.0 9 9 '[][D-1-deoxy-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-Manp]{[(3+1)][a-D-Manp]{[(2+1)][a-D-Manp]{}}[(6+1)][a-D-Manp]{}}}}' LINUCS PDB-CARE ? 10 10 DManpa1-6DManpb1-4DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1-ROH 'Glycam Condensed Sequence' GMML 1.0 11 10 'WURCS=2.0/3,4,3/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O][a1122h-1b_1-5][a1122h-1a_1-5]/1-1-2-3/a4-b1_b4-c1_c6-d1' WURCS PDB2Glycan 1.1.0 12 10 '[][D-1-deoxy-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-Manp]{[(6+1)][a-D-Manp]{}}}}' LINUCS PDB-CARE ? 13 11 'DManpa1-3[DManpa1-6]DManpb1-4DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1-ROH' 'Glycam Condensed Sequence' GMML 1.0 14 11 'WURCS=2.0/3,5,4/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O][a1122h-1b_1-5][a1122h-1a_1-5]/1-1-2-3-3/a4-b1_b4-c1_c3-d1_c6-e1' WURCS PDB2Glycan 1.1.0 15 11 '[][D-1-deoxy-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-Manp]{[(3+1)][a-D-Manp]{}[(6+1)][a-D-Manp]{}}}}' LINUCS PDB-CARE ? 16 12 DManpb1-4DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1-ROH 'Glycam Condensed Sequence' GMML 1.0 17 12 'WURCS=2.0/2,3,2/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O][a1122h-1b_1-5]/1-1-2/a4-b1_b4-c1' WURCS PDB2Glycan 1.1.0 18 12 '[][D-1-deoxy-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-Manp]{}}}' LINUCS PDB-CARE ? 19 13 'DManpa1-2DManpa1-2DManpa1-3[DManpa1-6]DManpb1-4DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1-ROH' 'Glycam Condensed Sequence' GMML 1.0 20 13 'WURCS=2.0/3,7,6/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O][a1122h-1b_1-5][a1122h-1a_1-5]/1-1-2-3-3-3-3/a4-b1_b4-c1_c3-d1_c6-g1_d2-e1_e2-f1' WURCS PDB2Glycan 1.1.0 21 13 ;[][D-1-deoxy-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-Manp]{[(3+1)][a-D-Manp]{[(2+1)][a-D-Manp]{[(2+1)][a-D-Manp]{}}}[(6+1)][a-D-Manp]{}}}} ; LINUCS PDB-CARE ? 22 14 DManpb1-4DGlcpNAcb1-ROH 'Glycam Condensed Sequence' GMML 1.0 23 14 'WURCS=2.0/2,2,1/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O][a1122h-1b_1-5]/1-2/a4-b1' WURCS PDB2Glycan 1.1.0 24 14 '[][D-1-deoxy-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-Manp]{}}' LINUCS PDB-CARE ? # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order _pdbx_entity_branch_link.details 1 7 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 2 8 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 3 8 3 BMA C1 O1 2 NAG O4 HO4 sing ? 4 8 4 MAN C1 O1 3 BMA O3 HO3 sing ? 5 9 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 6 9 3 BMA C1 O1 2 NAG O4 HO4 sing ? 7 9 4 MAN C1 O1 3 BMA O3 HO3 sing ? 8 9 5 MAN C1 O1 4 MAN O2 HO2 sing ? 9 9 6 MAN C1 O1 3 BMA O6 HO6 sing ? 10 10 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 11 10 3 BMA C1 O1 2 NAG O4 HO4 sing ? 12 10 4 MAN C1 O1 3 BMA O6 HO6 sing ? 13 11 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 14 11 3 BMA C1 O1 2 NAG O4 HO4 sing ? 15 11 4 MAN C1 O1 3 BMA O3 HO3 sing ? 16 11 5 MAN C1 O1 3 BMA O6 HO6 sing ? 17 12 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 18 12 3 BMA C1 O1 2 NAG O4 HO4 sing ? 19 13 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 20 13 3 BMA C1 O1 2 NAG O4 HO4 sing ? 21 13 4 MAN C1 O1 3 BMA O3 HO3 sing ? 22 13 5 MAN C1 O1 4 MAN O2 HO2 sing ? 23 13 6 MAN C1 O1 5 MAN O2 HO2 sing ? 24 13 7 MAN C1 O1 3 BMA O6 HO6 sing ? 25 14 2 BMA C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 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E ASN 133 E NAG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale23 covale one ? E ASN 142 ND2 ? ? ? 1_555 IA NAG . C1 ? ? E ASN 137 i NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.461 ? N-Glycosylation covale24 covale one ? E ASN 153 ND2 ? ? ? 1_555 AA NAG . C1 ? ? E ASN 156 a NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? N-Glycosylation covale25 covale one ? E ASN 157 ND2 ? ? ? 1_555 GB NAG . C1 ? ? E ASN 160 E NAG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? N-Glycosylation covale26 covale one ? E ASN 202 ND2 ? ? ? 1_555 BA NAG . C1 ? ? E ASN 197 b NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? N-Glycosylation covale27 covale one ? E ASN 239 ND2 ? ? ? 1_555 HB NAG . C1 ? ? E ASN 234 E NAG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? N-Glycosylation covale28 covale one ? E ASN 267 ND2 ? ? ? 1_555 CA NAG . C1 ? ? E ASN 262 c NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale29 covale one ? E ASN 281 ND2 ? ? ? 1_555 DA NAG . C1 ? ? E ASN 276 d NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? N-Glycosylation covale30 covale one ? 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