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I . n # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 9OTH _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 9OTH _struct.title 'D3 prohead 1' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 9OTH _struct_keywords.text 'Icosahedral symmetry, bacteriophage, procapsid, capsid, HK97 fold, VIRUS LIKE PARTICLE' _struct_keywords.pdbx_keywords 'VIRUS LIKE PARTICLE' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 1 ? D N N 1 ? E N N 1 ? F N N 1 ? G N N 1 ? H N N 1 ? I N N 1 ? # _struct_ref.id 1 _struct_ref.db_name UNP _struct_ref.db_code Q9XJT3_BPD3 _struct_ref.pdbx_db_accession Q9XJT3 _struct_ref.pdbx_db_isoform ? _struct_ref.entity_id 1 _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code ;MSDFEKQIGELNASLKQVGDQIKSQAEQVNTQIANFGEMNKETRAKVDELLTAQGELQARLSAAEQAMLANEKRDGGEEA PKTAGQMVAESLKEQGVTSSLRGSHRVSMPRSAITSIDGSGGALVAPDRRPGVVAAPQRRLTIRDLVAPGTTESNSVEYV RETGFVNNAAPVSEGTQKPYSDLTFELENAPVRTIAHLFKASRQILDDASALQSYIDARARYGLMLVEECQLLYGNGTGA NLHGIIPQAQAYAPPSGVVVTAEQRIDRIRLAILQAQLAEFPASGIVLNPIDWALIELNKDAENRYIIGSPQNGTTPTLW RLPVVETQAITQDEFLTGAFSLGAQIFDRMDIEVLVSTENDKDFENNMVTIRAEERLAFAVYRPEAFVTGSLTAS ; _struct_ref.pdbx_align_begin 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 9OTH A 1 ? 395 ? 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UNP Q9XJT3 ASN 299 conflict 299 18 # loop_ _pdbx_struct_assembly.id _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 'complete icosahedral assembly' ? 540-meric 540 2 'icosahedral asymmetric unit' ? nonameric 9 3 'icosahedral pentamer' ? 45-meric 45 4 'icosahedral 23 hexamer' ? 54-meric 54 5 'icosahedral asymmetric unit, std point frame' ? nonameric 9 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list 1 '(1-60)' A,B,C,D,E,F,G,H,I 2 1 A,B,C,D,E,F,G,H,I 3 '(1-5)' A,B,C,D,E,F,G,H,I 4 '(1,2,6,10,23,24)' A,B,C,D,E,F,G,H,I 5 P A,B,C,D,E,F,G,H,I # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'not applicable' # loop_ _pdbx_struct_oper_list.id _pdbx_struct_oper_list.type _pdbx_struct_oper_list.name _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[3] P 'transform to point frame' ? ? 0.00000000 -1.00000000 0.00000000 0.00000 0.85065090 0.00000000 -0.52573097 0.00000 0.52573097 0.00000000 0.85065090 0.00000 1 'identity operation' 1_555 x,y,z 1.00000000 0.00000000 0.00000000 0.00000 0.00000000 1.00000000 0.00000000 0.00000 0.00000000 0.00000000 1.00000000 0.00000 2 'point symmetry operation' ? ? 0.86180331 -0.42532555 0.27639327 0.00000 0.42532555 0.30901699 -0.85065074 0.00000 0.27639327 0.85065073 0.44721369 0.00000 3 'point symmetry operation' ? ? 0.63819636 -0.26286564 0.72360698 0.00000 0.26286565 -0.80901699 -0.52573107 0.00000 0.72360698 0.52573107 -0.44721335 0.00000 4 'point symmetry operation' ? ? 0.63819636 0.26286564 0.72360698 0.00000 -0.26286565 -0.80901699 0.52573107 0.00000 0.72360698 -0.52573107 -0.44721335 0.00000 5 'point symmetry operation' ? ? 0.86180331 0.42532555 0.27639327 0.00000 -0.42532555 0.30901699 0.85065074 0.00000 0.27639327 -0.85065073 0.44721369 0.00000 6 'point symmetry operation' ? ? -0.44721390 0.00000000 0.89442704 0.00000 0.00000000 -1.00000000 0.00000000 0.00000 0.89442704 0.00000000 0.44721390 0.00000 7 'point symmetry operation' ? ? -0.13819680 0.95105651 0.27639310 0.00000 -0.42532555 -0.30901699 0.85065074 0.00000 0.89442709 0.00000016 0.44721379 0.00000 8 'point symmetry operation' ? ? 0.36180337 0.58778525 -0.72360681 0.00000 -0.26286565 0.80901699 0.52573107 0.00000 0.89442718 0.00000010 0.44721362 0.00000 9 'point symmetry operation' ? ? 0.36180337 -0.58778525 -0.72360681 0.00000 0.26286565 0.80901699 -0.52573107 0.00000 0.89442718 -0.00000010 0.44721362 0.00000 10 'point symmetry operation' ? ? -0.13819680 -0.95105651 0.27639310 0.00000 0.42532555 -0.30901699 -0.85065074 0.00000 0.89442709 -0.00000016 0.44721379 0.00000 11 'point symmetry operation' ? ? 0.44721390 0.00000000 -0.89442704 0.00000 0.00000000 -1.00000000 0.00000000 0.00000 -0.89442704 0.00000000 -0.44721390 0.00000 12 'point symmetry operation' ? ? 0.13819680 -0.95105651 -0.27639310 0.00000 -0.42532555 -0.30901699 0.85065074 0.00000 -0.89442709 -0.00000016 -0.44721379 0.00000 13 'point symmetry operation' ? ? -0.36180337 -0.58778525 0.72360681 0.00000 -0.26286565 0.80901699 0.52573107 0.00000 -0.89442718 -0.00000010 -0.44721362 0.00000 14 'point symmetry operation' ? ? -0.36180337 0.58778525 0.72360681 0.00000 0.26286565 0.80901699 -0.52573107 0.00000 -0.89442718 0.00000010 -0.44721362 0.00000 15 'point symmetry operation' ? ? 0.13819680 0.95105651 -0.27639310 0.00000 0.42532555 -0.30901699 -0.85065074 0.00000 -0.89442709 0.00000016 -0.44721379 0.00000 16 'point symmetry operation' ? ? -1.00000000 0.00000000 0.00000000 0.00000 0.00000000 1.00000000 0.00000000 0.00000 0.00000000 0.00000000 -1.00000000 0.00000 17 'point symmetry operation' ? ? -0.86180331 0.42532555 -0.27639327 0.00000 0.42532555 0.30901699 -0.85065074 0.00000 -0.27639327 -0.85065073 -0.44721369 0.00000 18 'point symmetry operation' ? ? -0.63819636 0.26286564 -0.72360698 0.00000 0.26286565 -0.80901699 -0.52573107 0.00000 -0.72360698 -0.52573107 0.44721335 0.00000 19 'point symmetry operation' ? ? -0.63819636 -0.26286564 -0.72360698 0.00000 -0.26286565 -0.80901699 0.52573107 0.00000 -0.72360698 0.52573107 0.44721335 0.00000 20 'point symmetry operation' ? ? -0.86180331 -0.42532555 -0.27639327 0.00000 -0.42532555 0.30901699 0.85065074 0.00000 -0.27639327 0.85065073 -0.44721369 0.00000 21 'point symmetry operation' ? 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