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_citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Yang, C.' 1 0000-0002-3481-119X primary 'Nagai, S.' 2 0009-0005-0212-479X primary 'Chen, D.-H.' 3 0000-0002-5247-0106 # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer nat 'General transcription and DNA repair factor IIH subunit TFB5' 8243.490 1 ? ? ? ? 2 polymer nat 'General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPD/RAD3' 89899.047 1 5.6.2.3 ? ? ? 3 polymer nat 'RNA polymerase II transcription factor B subunit 3' 38188.438 1 ? ? ? ? 4 polymer nat 'General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB' 95461.664 1 3.6.4.12 ? ? ? 5 polymer nat 'SWI/SNF chromatin-remodeling complex subunit SNF5' 102642.172 1 ? ? ? ? 6 polymer nat 'Transcription initiation factor TFIID 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5 ;MNNQPQGTNSVPNSIGNIFSNIGTPSFNMAQIPQQLYQSLTPQQLQMIQQRHQQLLRSRLQQQQQQQQQTSPPPQTHQSP PPPPQQSQPIANQSATSTPPPPPAPHNLHPQIGQVPLAPAPINLPPQIAQLPLATQQQVLNKLRQQAIAKNNPQVVNAIT VAQQQVQRQIEQQKGQQTAQTQLEQQRQLLVQQQQQQQLRNQIQRQQQQQFRHHVQIQQQQQKQQQQQQQHQQQQQQQQQ QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQGQIPQSQQVPQVRSMSGQPPTNVQPTIGQLPQLPKLNLPKYQTIQYDPPETK LPYPTYWSDKKADTDTLLYEQIIQRDKINKYSLIRETNGYDPFSIYGFSNKEYISRLWHTLKYYQDLKNTRMKSITSTSQ KIPSASIWGNGYSGYGNGITNTTTRVIPQVEVGNRKHYLEDKLKVYKQAMNETSEQLVPIRLEFDQDRDRFFLRDTLLWN KNDKLIKIEDFVDDMLRDYRFEDATREQHIDTICQSIQEQIQEFQGNPYIELNQDRLGGDDLRIRIKLDIVVGQNQLIDQ FEWDISNSDNCPEEFAESMCQELELPGEFVTAIAHSIREQVHMYHKSLALLGYNFDGSAIEDDDIRSRMLPTITLDDVYR PAAESKIFTPNLLQISAAELERLDKDKDRDTRRKRRQGRSNRRGMLALSGTSASNTSMNGVHNTVAAGNASSLPPGEILL PDIADIPRTFRTPVPSTLMPGGVDVGPSVESYELRNTTTYKSRPDRPKPVSPPCYIIDHIPGHSLLLSIKLPGKVNTKEE FAAAPNDTSSGTNAMLPSPESLKTKLNSNIRAGVTIPSIPNPIANHTVTNSPNPTLQPVIPGGAASKSVPTPSLPIAPPV APHDSEATLLTNSNNGSSNNNTQNT ; 1 6 UNP TAF14_YEAST P35189 ? 6 ;MVATVKRTIRIKTQQHILPEVPPVENFPVRQWSIEIVLLDDEGKEIPATIFDKVIYHLHPTFANPNRTFTDPPFRIEEQG WGGFPLDISVFLLEKAGERKIPHDLNFLQESYEVEHVIQIPLNKPLLTEELAKSGSTEETTANTGTIGKRRTTTNTTAEP KAKRAKTGSASTVKGSVDLEKLAFGLTKLNEDDLVGVVQMVTDNKTPEMNVTNNVEEGEFIIDLYSLPEGLLKSLWDYVK KNTE ; 1 7 PDB 9PB7 9PB7 ? 7 ? 1 8 PDB 9PB7 9PB7 ? 8 ? 1 9 UNP TFB4_YEAST Q12004 ? 9 ;MDAISDPTFKHARSRKQVTEESPSLLTVIIEIAPKLWTTFDEEGNEKGSIIKVLEALIVFLNAHLAFNSANKVAVIAAYS QGIKYLYPESTSALKASESENKTRSDLKIINSDMYRRFRNVDETLVEEIYKLFELEKKQIEQNSQRSTLAGAMSAGLTYV NRISKESVTTSLKSRLLVLTCGSGSSKDEIFQYIPIMNCIFSATKMKCPIDVVKIGGSKESTFLQQTTDATNGVYLHVES TEGLIQYLATAMFIDPSLRPIIVKPNHGSVDFRTSCYLTGRVVAVGFICSVCLCVLSIIPPGNKCPACDSQFDEHVIAKL KRKPVVPRLKAKKKVTKP ; 1 10 UNP SSL1_YEAST Q04673 ? 10 ;MAPVVISESEEDEDRVAITRRTKRQVHFDGEGDDRVDQQQQQHSSSHRDRDKHVQRKKKKRLSNRNLQGSNGGYAWEDEI KRSWDLVKVDDEGDMASLVASIVEARKKRTAKKNITPYQRGIIRSLILTLDCSEAMLEKDLRPNRHAMIIQYAIDFVHEF FDQNPISQMGIIIMRNGLAQLVSQVSGNPQDHIDALKSIRKQEPKGNPSLQNALEMARGLLLPVPAHCTREVLIVFGSLS TTDPGDIHQTIDSLVSEKIRVKVLGLSAQVAICKELCKATNYGDESFYKILLDETHLKELFNEAVTPLPVNKINKGFTLV KMGFPTRIFEDTPTFCSCHSKLVYGGYFCPNCHSKVCSLPTVCPCCDLMLILSTHLARSYHHLMPLKTFAEVPTTEKFRS EDCFSCQSRFPILKNHKNGKLLTSSRYRCEDCKQEFCVDCDVFIHEILHNCPGCESKPVIT ; 1 11 UNP TFB1_YEAST P32776 ? 11 ;MSHSGAAIFEKVSGIIAINEDVSPAELTWRSTDGDKVHTVVLSTIDKLQATPASSEKMMLRLIGKVDESKKRKDNEGNEV VPKPQRHMFSFNNRTVMDNIKMTLQQIISRYKDADIYEEKRRREESAQHTETPMSSSSVTAGTPTPHLDTPQLNNGAPLI NTAKLDDSLSKEKLLTNLKLQQSLLKGNKVLMKVFQETVINAGLPPSEFWSTRIPLLRAFALSTSQKVGPYNVLSTIKPV ASSENKVNVNLSREKILNIFENYPIVKKAYTDNVPKNFKEPEFWARFFSSKLFRKLRGEKIMQNDRGDVIIDRYLTLDQE FDRKDDDMLLHPVKKIIDLDGNIQDDPVVRGNRPDFTMQPGVDINGNSDGTVDILKGMNRLSEKMIMALKNEYSRTNLQN KSNITNDEEDEDNDERNELKIDDLNESYKTNYAIIHLKRNAHEKTTDNDAKSSADSIKNADLKVSNQQMLQQLSLVMDNL INKLDLNQVVPNNEVSNKINKRVITAIKINAKQAKHNNVNSALGSFVDNTSQANELEVKSTLPIDLLESCRMLHTTCCEF LKHFYIHFQSGEQKQASTVKKLYNHLKDCIEKLNELFQDVLNGDGESMSNTCTAYLKPVLNSITLATHKYDEYFNEYNNN SN ; 1 12 UNP TFB2_YEAST Q02939 ? 12 ;MSDYSLKHSVTQYLEEIPQQVQNRLYTSPATCLAIYRILPPLAKFFIMAMVFNENEVPLLDLDKWVNSNGKLQFQNAIKS MKSLHLLIPNKSSGTLMINLNPTFKISLRNALTGGEVQNSFGVVVEENVVSLDLLDEYSANKWETILHFMVGTPLAKIPS EKVLNLLKHSKLMEEVNSTGEFKITNEGFQFLLQEINSQLWTLLLQYLKMIETSKMDLVDVLHFIFMLGALEVGKAYKID ALSETQRIMLQDMRDYGLVFQKHSNDSIFYPTKLALMLTSDTKTIRSASNAMDSVLRQNREEPSVNEDGANGKSTTDITT SDDLNKAGLKNQDIPDGSLIVETNFKIYSYSNSPLQIAVLSLFVHLKARFVNMVLGQITRESIRRALTNGITADQIIAYL ETHAHPQMRRLAEEKLEKKLELDPNCKEPLQVLPPTVVDQIRLWQLELDRVITYEGSLYSDFETSQEYNLLSKYAQDIGV LLWKDDKKKKFFISKEGNSQVLDFAKRKLKKKQ ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 9PB7 5 1 ? 72 ? Q3E7C1 1 ? 72 ? 1 72 2 2 9PB7 0 1 ? 778 ? P06839 1 ? 778 ? 1 778 3 3 9PB7 3 1 ? 321 ? Q03290 1 ? 321 ? 1 321 4 4 9PB7 7 1 ? 843 ? Q00578 1 ? 843 ? 1 843 5 5 9PB7 8 1 ? 905 ? P18480 1 ? 905 ? 1 905 6 6 9PB7 9 1 ? 244 ? P35189 1 ? 244 ? 1 244 7 7 9PB7 N 1 ? 26 ? 9PB7 -67 ? -42 ? -67 -42 8 8 9PB7 T 1 ? 26 ? 9PB7 42 ? 67 ? 42 67 9 9 9PB7 4 1 ? 338 ? Q12004 1 ? 338 ? 1 338 10 10 9PB7 6 1 ? 461 ? Q04673 1 ? 461 ? 1 461 11 11 9PB7 1 1 ? 642 ? P32776 1 ? 642 ? 1 642 12 12 9PB7 2 1 ? 513 ? Q02939 1 ? 513 ? 1 513 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details 12-meric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 12 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 ASP A 13 ? MET A 27 ? ASP 5 13 MET 5 27 1 ? 15 HELX_P HELX_P2 AA2 LYS A 46 ? SER A 59 ? LYS 5 46 SER 5 59 1 ? 14 HELX_P HELX_P3 AA3 TYR B 18 ? TYR B 24 ? TYR 0 18 TYR 0 24 1 ? 7 HELX_P HELX_P4 AA4 TYR B 24 ? LEU B 32 ? TYR 0 24 LEU 0 32 1 ? 9 HELX_P HELX_P5 AA5 LYS B 48 ? TYR B 63 ? LYS 0 48 TYR 0 63 1 ? 16 HELX_P HELX_P6 AA6 THR B 75 ? GLU B 96 ? THR 0 75 GLU 0 96 1 ? 22 HELX_P HELX_P7 AA7 ARG B 111 ? CYS B 115 ? ARG 0 111 CYS 0 115 5 ? 5 HELX_P HELX_P8 AA8 HIS B 117 ? LYS B 122 ? HIS 0 117 LYS 0 122 1 ? 6 HELX_P HELX_P9 AA9 LYS B 125 ? MET B 136 ? LYS 0 125 MET 0 136 1 ? 12 HELX_P HELX_P10 AB1 GLY B 139 ? ASP B 148 ? GLY 0 139 ASP 0 148 1 ? 10 HELX_P HELX_P11 AB2 CYS B 156 ? ASN B 161 ? CYS 0 156 ASN 0 161 1 ? 6 HELX_P HELX_P12 AB3 GLU B 166 ? TYR B 170 ? GLU 0 166 TYR 0 170 5 ? 5 HELX_P HELX_P13 AB4 SER B 177 ? GLU B 187 ? SER 0 177 GLU 0 187 1 ? 11 HELX_P HELX_P14 AB5 CYS B 191 ? ARG B 197 ? CYS 0 191 ARG 0 197 1 ? 7 HELX_P HELX_P15 AB6 TYR B 210 ? ASP B 215 ? 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ASP 0 467 LEU 0 473 1 ? 7 HELX_P HELX_P30 AD3 ARG B 509 ? ARG B 513 ? ARG 0 509 ARG 0 513 5 ? 5 HELX_P HELX_P31 AD4 ASP B 515 ? THR B 533 ? ASP 0 515 THR 0 533 1 ? 19 HELX_P HELX_P32 AD5 SER B 543 ? MET B 557 ? SER 0 543 MET 0 557 1 ? 15 HELX_P HELX_P33 AD6 ILE B 559 ? LYS B 565 ? ILE 0 559 LYS 0 565 1 ? 7 HELX_P HELX_P34 AD7 ASP B 575 ? ASN B 592 ? ASP 0 575 ASN 0 592 1 ? 18 HELX_P HELX_P35 AD8 ASP B 613 ? GLY B 617 ? ASP 0 613 GLY 0 617 5 ? 5 HELX_P HELX_P36 AD9 SER B 632 ? ARG B 647 ? SER 0 632 ARG 0 647 1 ? 16 HELX_P HELX_P37 AE1 ARG B 649 ? PHE B 656 ? ARG 0 649 PHE 0 656 1 ? 8 HELX_P HELX_P38 AE2 HIS B 661 ? LEU B 666 ? HIS 0 661 LEU 0 666 1 ? 6 HELX_P HELX_P39 AE3 ARG B 684 ? LEU B 693 ? ARG 0 684 LEU 0 693 5 ? 10 HELX_P HELX_P40 AE4 PRO B 694 ? GLN B 699 ? PRO 0 694 GLN 0 699 1 ? 6 HELX_P HELX_P41 AE5 ASP B 703 ? LEU B 708 ? ASP 0 703 LEU 0 708 5 ? 6 HELX_P HELX_P42 AE6 SER B 709 ? ALA B 725 ? SER 0 709 ALA 0 725 1 ? 17 HELX_P HELX_P43 AE7 ASP B 729 ? GLN B 733 ? 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