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;MVTIRLARHGAKKRPFYQVVVADSRNARNGRFIERVGFFNPIASEKEEGTRLDLDRIAHWVGQGATISDRVAALIKEVNK AA ; P ? 17 'polypeptide(L)' no no ;MTDKIRTLQGRVVSDKMEKSIVVAIERFVKHPIYGKFIKRTTKLHVHDENNECGIGDVVEIRECRPLSKTKSWTLVRVVE KAVL ; ;MTDKIRTLQGRVVSDKMEKSIVVAIERFVKHPIYGKFIKRTTKLHVHDENNECGIGDVVEIRECRPLSKTKSWTLVRVVE KAVL ; Q ? 18 'polypeptide(L)' no no MARYFRRRKFCRFTAEGVQEIDYKDIATLKNYITESGKIVPSRITGTRAKYQRQLARAIKRARYLSLLPYTDRHQ MARYFRRRKFCRFTAEGVQEIDYKDIATLKNYITESGKIVPSRITGTRAKYQRQLARAIKRARYLSLLPYTDRHQ R ? 19 'polypeptide(L)' no no ;MPRSLKKGPFIDLHLLKKVEKAVESGDKKPLRTWSRRSTIFPNMIGLTIAVHNGRQHVPVFVTDEMVGHKLGEFAPTRTY RGHAADKKAKKK ; ;MPRSLKKGPFIDLHLLKKVEKAVESGDKKPLRTWSRRSTIFPNMIGLTIAVHNGRQHVPVFVTDEMVGHKLGEFAPTRTY RGHAADKKAKKK ; S ? 20 'polypeptide(L)' no no ;MANIKSAKKRAIQSEKARKHNASRRSMMRTFIKKVYAAIEAGDKAAAQKAFNEMQPIVDRQAAKGLIHKNKAARHKANLT AQINKLA ; ;MANIKSAKKRAIQSEKARKHNASRRSMMRTFIKKVYAAIEAGDKAAAQKAFNEMQPIVDRQAAKGLIHKNKAARHKANLT AQINKLA ; T ? 21 'polypeptide(L)' no no MPVIKVRENEPFDVALRRFKRSCEKAGVLAEVRRREFYEKPTTERKRAKASAVKRHAKKLARENARRTRLY MPVIKVRENEPFDVALRRFKRSCEKAGVLAEVRRREFYEKPTTERKRAKASAVKRHAKKLARENARRTRLY U ? 22 'polypeptide(L)' no no ;MHHHHHHASGLVPRGSHMKQHQSADNSQGQLYIVPTPIGNLADITQRALEVLQAVDLIAAEDTRHTGLLLQHFGINARLF ALHDHNEQQKAETLLAKLQEGQNIALVSDAGTPLINDPGYHLVRTCREAGIRVVPLPGPCAAITALSAAGLPSDRFCYEG FLPAKSKGRRDALKAIEAEPRTLIFYESTHRLLDSLEDIVAVLGESRYVVLARELTKTWETIHGAPVGELLAWVKEDENR RKGEMVLIVEGHKAQEEDLPADALRTLALLQAELPLKKAAALAAEIHGVKKNALYKYALEQQG ; ;MHHHHHHASGLVPRGSHMKQHQSADNSQGQLYIVPTPIGNLADITQRALEVLQAVDLIAAEDTRHTGLLLQHFGINARLF ALHDHNEQQKAETLLAKLQEGQNIALVSDAGTPLINDPGYHLVRTCREAGIRVVPLPGPCAAITALSAAGLPSDRFCYEG FLPAKSKGRRDALKAIEAEPRTLIFYESTHRLLDSLEDIVAVLGESRYVVLARELTKTWETIHGAPVGELLAWVKEDENR RKGEMVLIVEGHKAQEEDLPADALRTLALLQAELPLKKAAALAAEIHGVKKNALYKYALEQQG ; V,W ? # loop_ _pdbx_entity_nonpoly.entity_id _pdbx_entity_nonpoly.name _pdbx_entity_nonpoly.comp_id 23 "5'-{[(3S)-3-amino-3-carboxypropyl](ethyl)amino}-5'-deoxyadenosine" AN6 24 'MAGNESIUM ION' MG 25 water HOH # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 A n 1 2 A n 1 3 A n 1 4 U n 1 5 U n 1 6 G n 1 7 A n 1 8 A n 1 9 G n 1 10 A n 1 11 G n 1 12 U n 1 13 U n 1 14 U n 1 15 G n 1 16 A n 1 17 U n 1 18 C n 1 19 A n 1 20 U n 1 21 G n 1 22 G n 1 23 C n 1 24 U n 1 25 C n 1 26 A n 1 27 G n 1 28 A n 1 29 U n 1 30 U n 1 31 G n 1 32 A n 1 33 A n 1 34 C n 1 35 G n 1 36 C n 1 37 U n 1 38 G n 1 39 G n 1 40 C n 1 41 G n 1 42 G n 1 43 C n 1 44 A n 1 45 G n 1 46 G n 1 47 C n 1 48 C n 1 49 U n 1 50 A n 1 51 A n 1 52 C n 1 53 A n 1 54 C n 1 55 A n 1 56 U n 1 57 G n 1 58 C n 1 59 A n 1 60 A n 1 61 G n 1 62 U n 1 63 C n 1 64 G n 1 65 A n 1 66 A n 1 67 C n 1 68 G n 1 69 G n 1 70 U n 1 71 A n 1 72 A n 1 73 C n 1 74 A n 1 75 G n 1 76 G n 1 77 A n 1 78 A n 1 79 G n 1 80 A n 1 81 A n 1 82 G n 1 83 C n 1 84 U n 1 85 U n 1 86 G n 1 87 C n 1 88 U n 1 89 U n 1 90 C n 1 91 U n 1 92 U n 1 93 U n 1 94 G n 1 95 C n 1 96 U n 1 97 G n 1 98 A n 1 99 C n 1 100 G n 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1 201 G n 1 202 G n 1 203 G n 1 204 G n 1 205 A n 1 206 C n 1 207 C n 1 208 U n 1 209 U n 1 210 C n 1 211 G n 1 212 G n 1 213 G n 1 214 C n 1 215 C n 1 216 U n 1 217 C n 1 218 U n 1 219 U n 1 220 G n 1 221 C n 1 222 C n 1 223 A n 1 224 U n 1 225 C n 1 226 G n 1 227 G n 1 228 A n 1 229 U n 1 230 G n 1 231 U n 1 232 G n 1 233 C n 1 234 C n 1 235 C n 1 236 A n 1 237 G n 1 238 A n 1 239 U n 1 240 G n 1 241 G n 1 242 G n 1 243 A n 1 244 U n 1 245 U n 1 246 A n 1 247 G n 1 248 C n 1 249 U n 1 250 A n 1 251 G n 1 252 U n 1 253 A n 1 254 G n 1 255 G n 1 256 U n 1 257 G n 1 258 G n 1 259 G n 1 260 G n 1 261 U n 1 262 A n 1 263 A n 1 264 C n 1 265 G n 1 266 G n 1 267 C n 1 268 U n 1 269 C n 1 270 A n 1 271 C n 1 272 C n 1 273 U n 1 274 A n 1 275 G n 1 276 G n 1 277 C n 1 278 G n 1 279 A n 1 280 C n 1 281 G n 1 282 A n 1 283 U n 1 284 C n 1 285 C n 1 286 C n 1 287 U n 1 288 A n 1 289 G n 1 290 C n 1 291 U n 1 292 G n 1 293 G n 1 294 U n 1 295 C n 1 296 U n 1 297 G n 1 298 A n 1 299 G n 1 300 A n 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1 401 C n 1 402 G n 1 403 C n 1 404 G n 1 405 U n 1 406 G n 1 407 U n 1 408 A n 1 409 U n 1 410 G n 1 411 A n 1 412 A n 1 413 G n 1 414 A n 1 415 A n 1 416 G n 1 417 G n 1 418 C n 1 419 C n 1 420 U n 1 421 U n 1 422 C n 1 423 G n 1 424 G n 1 425 G n 1 426 U n 1 427 U n 1 428 G n 1 429 U n 1 430 A n 1 431 A n 1 432 A n 1 433 G n 1 434 U n 1 435 A n 1 436 C n 1 437 U n 1 438 U n 1 439 U n 1 440 C n 1 441 A n 1 442 G n 1 443 C n 1 444 G n 1 445 G n 1 446 G n 1 447 G n 1 448 A n 1 449 G n 1 450 G n 1 451 A n 1 452 A n 1 453 G n 1 454 G n 1 455 G n 1 456 A n 1 457 G n 1 458 U n 1 459 A n 1 460 A n 1 461 A n 1 462 G n 1 463 U n 1 464 U n 1 465 A n 1 466 A n 1 467 U n 1 468 A n 1 469 C n 1 470 C n 1 471 U n 1 472 U n 1 473 U n 1 474 G n 1 475 C n 1 476 U n 1 477 C n 1 478 A n 1 479 U n 1 480 U n 1 481 G n 1 482 A n 1 483 C n 1 484 G n 1 485 U n 1 486 U n 1 487 A n 1 488 C n 1 489 C n 1 490 C n 1 491 G n 1 492 C n 1 493 A n 1 494 G n 1 495 A n 1 496 A n 1 497 G n 1 498 A n 1 499 A n 1 500 G n 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2 ;MATVSMRDMLKAGVHFGHQTRYWNPKMKPFIFGARNKVHIINLEKTVPMFNEALAELNKIASRKGKILFVGTKRAASEAV KDAALSCDQFFVNHRWLGGMLTNWKTVRQSIKRLKDLETQSQDGTFDKLTKKEALMRTRELEKLENSLGGIKDMGGLPDA LFVIDADHEHIAIKEANNLGIPVFAIVDTNSDPDGVDFVIPGNDDAIRAVTLYLGAVAATVREGRSQDLASQAEESFVEA E ; 1 3 UNP RS3_ECOLI P0A7V3 ? 3 ;MGQKVHPNGIRLGIVKPWNSTWFANTKEFADNLDSDFKVRQYLTKELAKASVSRIVIERPAKSIRVTIHTARPGIVIGKK GEDVEKLRKVVADIAGVPAQINIAEVRKPELDAKLVADSITSQLERRVMFRRAMKRAVQNAMRLGAKGIKVEVSGRLGGA EIARTEWYREGRVPLHTLRADIDYNTSEAHTTYGVIGVKVWIFKGEILGGMAAVEQPEKPAAQPKKQQRKGRK ; 1 4 UNP RS4_ECOLI P0A7V8 ? 4 ;MARYLGPKLKLSRREGTDLFLKSGVRAIDTKCKIEQAPGQHGARKPRLSDYGVQLREKQKVRRIYGVLERQFRNYYKEAA RLKGNTGENLLALLEGRLDNVVYRMGFGATRAEARQLVSHKAIMVNGRVVNIASYQVSPNDVVSIREKAKKQSRVKAALE LAEQREKPTWLEVDAGKMEGTFKRKPERSDLSADINEHLIVELYSK ; 1 5 UNP RS5_ECOLI P0A7W1 ? 5 ;MAHIEKQAGELQEKLIAVNRVSKTVKGGRIFSFTALTVVGDGNGRVGFGYGKAREVPAAIQKAMEKARRNMINVALNNGT LQHPVKGVHTGSRVFMQPASEGTGIIAGGAMRAVLEVAGVHNVLAKAYGSTNPINVVRATIDGLENMNSPEMVAAKRGKS VEEILGK ; 1 6 UNP RS6_ECOLI P02358 ? 6 ;MRHYEIVFMVHPDQSEQVPGMIERYTAAITGAEGKIHRLEDWGRRQLAYPINKLHKAHYVLMNVEAPQEVIDELETTFRF NDAVIRSMVMRTKHAVTEASPMVKAKDERRERRDDFANETADDAEAGDSEEEEEE ; 1 7 UNP RS7_ECOLI P02359 ? 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A G 289 A MG 1617 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.997 ? ? metalc13 metalc ? ? A G 299 O6 ? ? ? 1_555 RB MG . MG ? ? A G 299 A MG 1647 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.284 ? ? metalc14 metalc ? ? A G 324 N7 ? ? ? 1_555 RA MG . MG ? ? A G 324 A MG 1621 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.049 ? ? metalc15 metalc ? ? A C 328 OP1 ? ? ? 1_555 HA MG . MG ? ? A C 328 A MG 1611 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.533 ? ? metalc16 metalc ? ? A C 352 OP2 ? ? ? 1_555 SA MG . MG ? ? A C 352 A MG 1622 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.625 ? ? metalc17 metalc ? ? A G 362 N7 ? ? ? 1_555 TA MG . MG ? ? A G 362 A MG 1623 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.091 ? ? metalc18 metalc ? ? A U 398 OP2 ? ? ? 1_555 Y MG . MG ? ? A U 398 A MG 1602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.634 ? ? metalc19 metalc ? ? A A 441 OP2 ? ? ? 1_555 CA MG . MG ? ? A A 441 A MG 1606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.114 ? ? metalc20 metalc ? ? A C 504 OP1 ? ? ? 1_555 WC MG . MG ? ? A C 504 A MG 1678 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.459 ? ? metalc21 metalc ? ? A G 505 OP1 ? ? ? 1_555 WC MG . MG ? ? A G 505 A MG 1678 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.263 ? ? metalc22 metalc ? ? A A 509 OP2 ? ? ? 1_555 VA MG . MG ? ? A A 509 A MG 1625 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.346 ? ? metalc23 metalc ? ? A A 510 OP2 ? ? ? 1_555 VA MG . MG ? ? A A 510 A MG 1625 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? ? metalc24 metalc ? ? A U 516 O4 ? ? ? 1_555 SB MG . MG ? ? A U 516 A MG 1648 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.205 ? ? metalc25 metalc ? ? A G 529 OP1 ? ? ? 1_555 DA MG . MG ? ? A G 529 A MG 1607 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.105 ? ? metalc26 metalc ? ? A U 531 O2 ? ? ? 1_555 UC MG . MG ? ? A U 531 A MG 1676 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.334 ? ? metalc27 metalc ? ? A C 536 OP1 ? ? ? 1_555 WA MG . MG ? ? A C 536 A MG 1626 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.399 ? ? metalc28 metalc ? ? A C 536 OP2 ? ? ? 1_555 FC MG . MG ? ? A C 536 A MG 1661 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.952 ? ? metalc29 metalc ? ? A A 547 OP1 ? ? ? 1_555 XA MG . MG ? ? A A 547 A MG 1627 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.091 ? ? metalc30 metalc ? ? A G 558 OP1 ? ? ? 1_555 RB MG . MG ? ? A G 558 A MG 1647 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.109 ? ? metalc31 metalc ? ? A G 558 O6 ? ? ? 1_555 VB MG . MG ? ? A G 558 A MG 1651 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.935 ? ? metalc32 metalc ? ? A A 560 OP2 ? ? ? 1_555 YA MG . MG ? ? A A 560 A MG 1628 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.092 ? ? metalc33 metalc ? ? A G 567 OP2 ? ? ? 1_555 AC MG . MG ? ? A G 567 A MG 1656 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.586 ? ? metalc34 metalc ? ? A A 572 OP2 ? ? ? 1_555 ZA MG . MG ? ? A A 572 A MG 1629 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.357 ? ? metalc35 metalc ? ? A A 572 OP1 ? ? ? 1_555 NB MG . MG ? ? A A 572 A MG 1643 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.472 ? ? metalc36 metalc ? ? A A 573 OP2 ? ? ? 1_555 ZA MG . MG ? ? A A 573 A MG 1629 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.883 ? ? metalc37 metalc ? ? A A 574 OP2 ? ? ? 1_555 ZA MG . MG ? ? A A 574 A MG 1629 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.089 ? ? metalc38 metalc ? ? A C 576 OP1 ? ? ? 1_555 OB MG . MG ? ? A C 576 A MG 1644 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.972 ? ? metalc39 metalc ? ? A C 578 OP1 ? ? ? 1_555 AB MG . MG ? ? A C 578 A MG 1630 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.325 ? ? metalc40 metalc ? ? A C 580 OP2 ? ? ? 1_555 CC MG . MG ? ? A C 580 A MG 1658 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.742 ? ? metalc41 metalc ? ? A G 584 O6 ? ? ? 1_555 YB MG . MG ? ? A G 584 A MG 1654 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.940 ? ? metalc42 metalc ? ? A G 588 OP1 ? ? ? 1_555 ZB MG . MG ? ? A G 588 A MG 1655 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.361 ? ? metalc43 metalc ? ? A G 588 OP2 ? ? ? 1_555 ZB MG . MG ? ? A G 588 A MG 1655 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.924 ? ? metalc44 metalc ? ? A A 596 OP2 ? ? ? 1_555 WB MG . MG ? ? A A 596 A MG 1652 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.631 ? ? metalc45 metalc ? ? A G 597 OP2 ? ? ? 1_555 WB MG . MG ? ? A G 597 A MG 1652 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.064 ? ? metalc46 metalc ? ? A U 598 O4 ? ? ? 1_555 WB MG . MG ? ? A U 598 A MG 1652 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.583 ? ? metalc47 metalc ? ? A A 608 OP2 ? ? ? 1_555 CB MG . MG ? ? A A 608 A MG 1632 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.050 ? ? metalc48 metalc ? ? A G 664 O6 ? ? ? 1_555 HC MG . MG ? ? A G 664 A MG 1663 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.472 ? ? metalc49 metalc ? ? A G 669 OP1 ? ? ? 1_555 KC MG . MG ? ? A G 669 A MG 1666 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.217 ? ? metalc50 metalc ? ? A G 741 O6 ? ? ? 1_555 HC MG . MG ? ? A G 741 A MG 1663 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.356 ? ? metalc51 metalc ? ? A G 760 OP2 ? ? ? 1_555 PB MG . MG ? ? A G 760 A MG 1645 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.469 ? ? metalc52 metalc ? ? A A 768 OP2 ? ? ? 1_555 EC MG . MG ? ? A A 768 A MG 1660 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.408 ? ? metalc53 metalc ? ? A C 770 OP1 ? ? ? 1_555 LA MG . MG ? ? A C 770 A MG 1615 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.134 ? ? metalc54 metalc ? ? A A 807 OP1 ? ? ? 1_555 KC MG . MG ? ? A A 807 A MG 1666 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.899 ? ? metalc55 metalc ? ? A A 814 OP2 ? ? ? 1_555 FB MG . MG ? ? A A 814 A MG 1635 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.362 ? ? metalc56 metalc ? ? A G 858 N7 ? ? ? 1_555 GB MG . MG ? ? A G 858 A MG 1636 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.640 ? ? metalc57 metalc ? ? A G 869 N7 ? ? ? 1_555 GB MG . MG ? ? A G 869 A MG 1636 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.342 ? ? metalc58 metalc ? ? A U 891 OP2 ? ? ? 1_555 HB MG . MG ? ? A U 891 A MG 1637 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.517 ? ? metalc59 metalc ? ? A G 1401 OP2 ? ? ? 1_555 KB MG . MG ? ? A G 1401 A MG 1640 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.169 ? ? metalc60 metalc ? ? A B8T 1402 "O2'" ? ? ? 1_555 ZC MG . MG ? ? A B8T 1402 W MG 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.926 ? ? metalc61 metalc ? ? W GLU 61 OE1 ? ? ? 1_555 ZC MG . MG ? ? W GLU 44 W MG 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.316 ? ? metalc62 metalc ? ? W GLU 61 OE2 ? ? ? 1_555 ZC MG . MG ? ? W GLU 44 W MG 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.290 ? ? metalc63 metalc ? ? W ASP 117 OD1 ? ? ? 1_555 ZC MG . MG ? ? W ASP 100 W MG 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.130 ? ? hydrog1 hydrog ? ? A A 3 N3 ? ? ? 1_555 A G 628 N2 ? ? A A 3 A G 628 1_555 ? ? ? ? ? ? 'A-G MISPAIR' ? ? ? hydrog2 hydrog ? ? A G 9 N1 ? ? ? 1_555 A C 25 N3 ? ? A G 9 A C 25 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog3 hydrog ? ? A G 9 N2 ? ? ? 1_555 A C 25 O2 ? ? A G 9 A C 25 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog4 hydrog ? ? A G 9 O6 ? ? ? 1_555 A C 25 N4 ? ? A G 9 A C 25 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog5 hydrog ? ? A A 10 N1 ? ? ? 1_555 A U 24 N3 ? ? A A 10 A U 24 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog6 hydrog ? ? A A 10 N6 ? ? ? 1_555 A U 24 O4 ? ? A A 10 A U 24 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog7 hydrog ? ? A G 11 N1 ? ? ? 1_555 A C 23 N3 ? ? A G 11 A C 23 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog8 hydrog ? ? A G 11 N2 ? ? ? 1_555 A C 23 O2 ? ? A G 11 A C 23 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog9 hydrog ? ? A G 11 O6 ? ? ? 1_555 A C 23 N4 ? ? A G 11 A C 23 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog10 hydrog ? ? A U 12 N3 ? ? ? 1_555 A G 22 O6 ? ? A U 12 A G 22 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? ? hydrog11 hydrog ? ? A U 12 O2 ? ? ? 1_555 A G 22 N1 ? ? A U 12 A G 22 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? ? hydrog12 hydrog ? ? A U 13 O4 ? ? ? 1_555 A U 20 N3 ? ? A U 13 A U 20 1_555 ? ? ? ? ? ? 'U-U MISPAIR' ? ? ? hydrog13 hydrog ? ? A U 13 N3 ? ? ? 1_555 A A 915 N7 ? ? A U 13 A A 915 1_555 ? ? ? ? ? ? HOOGSTEEN ? ? ? hydrog14 hydrog ? ? A U 13 O4 ? ? ? 1_555 A A 915 N6 ? ? A U 13 A A 915 1_555 ? ? ? ? ? ? HOOGSTEEN ? ? ? hydrog15 hydrog ? ? A G 15 N1 ? ? ? 1_555 A U 920 O2 ? ? A G 15 A U 920 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? ? hydrog16 hydrog ? ? A G 15 O6 ? ? ? 1_555 A U 920 N3 ? ? A G 15 A U 920 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? ? hydrog17 hydrog ? ? A A 16 N6 ? ? ? 1_555 A A 919 N1 ? ? A A 16 A A 919 1_555 ? ? ? ? ? ? 'A-A MISPAIR' ? ? ? hydrog18 hydrog ? ? A U 17 N3 ? ? ? 1_555 A A 918 N1 ? ? A U 17 A A 918 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog19 hydrog ? ? A U 17 O4 ? ? ? 1_555 A A 918 N6 ? ? A U 17 A A 918 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog20 hydrog ? ? A U 17 O2 ? ? ? 1_555 A G 1079 N2 ? ? A U 17 A G 1079 1_555 ? ? ? ? ? ? 'U-G MISPAIR' ? ? ? hydrog21 hydrog ? ? A C 18 N3 ? ? ? 1_555 A G 917 N1 ? ? A C 18 A G 917 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog22 hydrog ? ? A C 18 N4 ? ? ? 1_555 A G 917 O6 ? ? A C 18 A G 917 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog23 hydrog ? ? A C 18 O2 ? ? ? 1_555 A G 917 N2 ? ? A C 18 A G 917 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog24 hydrog ? ? A A 19 N1 ? ? ? 1_555 A U 916 N3 ? ? A A 19 A U 916 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog25 hydrog ? ? A A 19 N6 ? ? ? 1_555 A U 916 O4 ? ? A A 19 A U 916 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog26 hydrog ? ? A U 20 O2 ? ? ? 1_555 A A 915 N6 ? ? A U 20 A A 915 1_555 ? ? ? ? ? ? 'U-A PAIR' ? ? ? hydrog27 hydrog ? ? A G 21 N2 ? ? ? 1_555 A A 914 N7 ? ? A G 21 A A 914 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_11_PAIR ? ? ? hydrog28 hydrog ? ? A G 21 N3 ? ? ? 1_555 A A 914 N6 ? ? A G 21 A A 914 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_11_PAIR ? ? ? hydrog29 hydrog ? ? A G 22 N2 ? ? ? 1_555 A A 913 N3 ? ? A G 22 A A 913 1_555 ? ? ? ? ? ? 'G-A MISPAIR' ? ? ? hydrog30 hydrog ? ? A C 23 N4 ? ? ? 1_555 A U 561 O4 ? ? A C 23 A U 561 1_555 ? ? ? ? ? ? 'C-U MISPAIR' ? ? ? hydrog31 hydrog ? ? A C 25 N4 ? ? ? 1_555 A A 559 N1 ? ? A C 25 A A 559 1_555 ? ? ? ? ? ? 'C-A MISPAIR' ? ? ? hydrog32 hydrog ? ? A A 26 N6 ? ? ? 1_555 A G 558 N3 ? ? A A 26 A G 558 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_11_PAIR ? ? ? hydrog33 hydrog ? ? A A 26 N7 ? ? ? 1_555 A G 558 N2 ? ? A A 26 A G 558 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_11_PAIR ? ? ? hydrog34 hydrog ? ? A G 27 N1 ? ? ? 1_555 A C 556 N3 ? ? A G 27 A C 556 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog35 hydrog ? ? A G 27 N2 ? ? ? 1_555 A C 556 O2 ? ? A G 27 A C 556 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog36 hydrog ? ? A G 27 O6 ? ? ? 1_555 A C 556 N4 ? ? A G 27 A C 556 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog37 hydrog ? ? A A 28 N1 ? ? ? 1_555 A U 555 N3 ? ? A A 28 A U 555 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog38 hydrog ? ? A A 28 N6 ? ? ? 1_555 A U 555 O4 ? ? A A 28 A U 555 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog39 hydrog ? ? A U 29 N3 ? ? ? 1_555 A A 554 N1 ? ? A U 29 A A 554 1_555 ? ? ? ? ? ? 'U-A PAIR' ? ? ? hydrog40 hydrog ? ? A U 30 N3 ? ? ? 1_555 A A 553 N1 ? ? A U 30 A A 553 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog41 hydrog ? ? A U 30 O4 ? ? ? 1_555 A A 553 N6 ? ? A U 30 A A 553 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog42 hydrog ? ? A A 32 N1 ? ? ? 1_555 A U 552 N3 ? ? A A 32 A U 552 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog43 hydrog ? ? A A 32 N6 ? ? ? 1_555 A U 552 O4 ? ? A A 32 A U 552 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog44 hydrog ? ? A A 33 N1 ? ? ? 1_555 A U 551 N3 ? ? A A 33 A U 551 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog45 hydrog ? ? A A 33 N6 ? ? ? 1_555 A U 551 O4 ? ? A A 33 A U 551 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog46 hydrog ? ? A C 34 N3 ? ? ? 1_555 A G 550 N1 ? ? A C 34 A G 550 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog47 hydrog ? ? A C 34 N4 ? ? ? 1_555 A G 550 O6 ? ? A C 34 A G 550 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog48 hydrog ? ? A C 34 O2 ? ? ? 1_555 A G 550 N2 ? ? A C 34 A G 550 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog49 hydrog ? ? 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N N 377 ILE CD1 HD11 sing N N 378 ILE CD1 HD12 sing N N 379 ILE CD1 HD13 sing N N 380 ILE OXT HXT sing N N 381 LEU N CA sing N N 382 LEU N H sing N N 383 LEU N H2 sing N N 384 LEU CA C sing N N 385 LEU CA CB sing N N 386 LEU CA HA sing N N 387 LEU C O doub N N 388 LEU C OXT sing N N 389 LEU CB CG sing N N 390 LEU CB HB2 sing N N 391 LEU CB HB3 sing N N 392 LEU CG CD1 sing N N 393 LEU CG CD2 sing N N 394 LEU CG HG sing N N 395 LEU CD1 HD11 sing N N 396 LEU CD1 HD12 sing N N 397 LEU CD1 HD13 sing N N 398 LEU CD2 HD21 sing N N 399 LEU CD2 HD22 sing N N 400 LEU CD2 HD23 sing N N 401 LEU OXT HXT sing N N 402 LYS N CA sing N N 403 LYS N H sing N N 404 LYS N H2 sing N N 405 LYS CA C sing N N 406 LYS CA CB sing N N 407 LYS CA HA sing N N 408 LYS C O doub N N 409 LYS C OXT sing N N 410 LYS CB CG sing N N 411 LYS CB HB2 sing N N 412 LYS CB HB3 sing N N 413 LYS CG CD sing N N 414 LYS CG HG2 sing N N 415 LYS CG HG3 sing N N 416 LYS CD CE sing N N 417 LYS CD HD2 sing N N 418 LYS CD HD3 sing N N 419 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TRP CH2 HH2 sing N N 586 TRP OXT HXT sing N N 587 TYR N CA sing N N 588 TYR N H sing N N 589 TYR N H2 sing N N 590 TYR CA C sing N N 591 TYR CA CB sing N N 592 TYR CA HA sing N N 593 TYR C O doub N N 594 TYR C OXT sing N N 595 TYR CB CG sing N N 596 TYR CB HB2 sing N N 597 TYR CB HB3 sing N N 598 TYR CG CD1 doub Y N 599 TYR CG CD2 sing Y N 600 TYR CD1 CE1 sing Y N 601 TYR CD1 HD1 sing N N 602 TYR CD2 CE2 doub Y N 603 TYR CD2 HD2 sing N N 604 TYR CE1 CZ doub Y N 605 TYR CE1 HE1 sing N N 606 TYR CE2 CZ sing Y N 607 TYR CE2 HE2 sing N N 608 TYR CZ OH sing N N 609 TYR OH HH sing N N 610 TYR OXT HXT sing N N 611 U OP3 P sing N N 612 U OP3 HOP3 sing N N 613 U P OP1 doub N N 614 U P OP2 sing N N 615 U P "O5'" sing N N 616 U OP2 HOP2 sing N N 617 U "O5'" "C5'" sing N N 618 U "C5'" "C4'" sing N N 619 U "C5'" "H5'" sing N N 620 U "C5'" "H5''" sing N N 621 U "C4'" "O4'" sing N N 622 U "C4'" "C3'" sing N N 623 U "C4'" "H4'" sing N N 624 U "O4'" "C1'" sing N N 625 U "C3'" "O3'" sing N N 626 U "C3'" "C2'" sing N N 627 U "C3'" "H3'" sing N N 628 U "O3'" "HO3'" sing N N 629 U "C2'" "O2'" sing N N 630 U "C2'" "C1'" sing N N 631 U "C2'" "H2'" sing N N 632 U "O2'" "HO2'" sing N N 633 U "C1'" N1 sing N N 634 U "C1'" "H1'" sing N N 635 U N1 C2 sing N N 636 U N1 C6 sing N N 637 U C2 O2 doub N N 638 U C2 N3 sing N N 639 U N3 C4 sing N N 640 U N3 H3 sing N N 641 U C4 O4 doub N N 642 U C4 C5 sing N N 643 U C5 C6 doub N N 644 U C5 H5 sing N N 645 U C6 H6 sing N N 646 VAL N CA sing N N 647 VAL N H sing N N 648 VAL N H2 sing N N 649 VAL CA C sing N N 650 VAL CA CB sing N N 651 VAL CA HA sing N N 652 VAL C O doub N N 653 VAL C OXT sing N N 654 VAL CB CG1 sing N N 655 VAL CB CG2 sing N N 656 VAL CB HB sing N N 657 VAL CG1 HG11 sing N N 658 VAL CG1 HG12 sing N N 659 VAL CG1 HG13 sing N N 660 VAL CG2 HG21 sing N N 661 VAL CG2 HG22 sing N N 662 VAL CG2 HG23 sing N N 663 VAL OXT HXT sing N N 664 # _em_admin.current_status REL _em_admin.deposition_date 2025-08-11 _em_admin.deposition_site RCSB _em_admin.entry_id 9PZG _em_admin.last_update 2025-09-24 _em_admin.map_release_date 2025-09-24 _em_admin.title ;Bacterial ribosomal 2'-O-methyltransferase RsmI in complex with the small ribosomal subunit ; # _em_ctf_correction.details ? _em_ctf_correction.em_image_processing_id 1 _em_ctf_correction.id 1 _em_ctf_correction.type 'PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION' # loop_ _em_entity_assembly_molwt.entity_assembly_id _em_entity_assembly_molwt.experimental_flag _em_entity_assembly_molwt.id _em_entity_assembly_molwt.units _em_entity_assembly_molwt.value 1 NO 1 MEGADALTONS 0.92 1 YES 2 MEGADALTONS 0.066 1 NO 3 MEGADALTONS 0.85 # loop_ _em_entity_assembly_naturalsource.cell _em_entity_assembly_naturalsource.cellular_location _em_entity_assembly_naturalsource.entity_assembly_id _em_entity_assembly_naturalsource.id _em_entity_assembly_naturalsource.ncbi_tax_id _em_entity_assembly_naturalsource.organism _em_entity_assembly_naturalsource.organelle _em_entity_assembly_naturalsource.organ 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'IMAGE ACQUISITION' ? 2 ? ? 1 Leginon ? ? MASKING ? 3 ? ? ? ? ? ? 'CTF CORRECTION' ? 4 1 ? ? cryoSPARC ? ? 'LAYERLINE INDEXING' ? 5 ? ? ? ? ? ? 'DIFFRACTION INDEXING' ? 6 ? ? ? ? ? ? 'MODEL FITTING' ? 7 ? 1 ? 'UCSF ChimeraX' ? ? OTHER ? 8 ? ? ? ? ? ? 'INITIAL EULER ASSIGNMENT' ? 9 1 ? ? cryoSPARC ? ? 'FINAL EULER ASSIGNMENT' ? 10 1 ? ? cryoSPARC ? ? CLASSIFICATION ? 11 1 ? ? cryoSPARC ? ? RECONSTRUCTION ? 12 1 ? ? cryoSPARC ? ? 'MODEL REFINEMENT' ? 13 ? 1 ? PHENIX ? ? 'MODEL REFINEMENT' ? 14 ? 1 ? Coot ? ? 'VOLUME SELECTION' ? 15 1 1 1 ? ? ? 'SERIES ALIGNMENT' ? 16 1 1 1 ? ? ? 'MOLECULAR REPLACEMENT' ? 17 1 1 1 ? ? ? 'LATTICE DISTORTION CORRECTION' ? 18 1 1 1 ? ? ? 'SYMMETRY DETERMINATION' ? 19 1 1 1 ? ? ? 'CRYSTALLOGRAPHY MERGING' ? 20 1 1 1 ? ? ? # _em_specimen.concentration ? _em_specimen.details ;Recombinant RsmI (1.2 uM), delta-rsmI 30S (0.4 uM), and the SAM analog NM6 (24 uM) were incubated for 30 minutes at 37C to prepare the complex. ; _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.id 1 _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # loop_ _ndb_struct_conf_na.entry_id _ndb_struct_conf_na.feature 9PZG 'double helix' 9PZG 'a-form double helix' 9PZG 'parallel strands' 9PZG 'hairpin loop' 9PZG tetraloop 9PZG 'bulge loop' 9PZG 'mismatched base pair' 9PZG 'internal loop' 9PZG 'triple helix' 9PZG 'quadruple helix' 9PZG 'three-way junction' 9PZG 'four-way junction' # loop_ _ndb_struct_na_base_pair.model_number _ndb_struct_na_base_pair.i_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.j_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.shear _ndb_struct_na_base_pair.stretch _ndb_struct_na_base_pair.stagger _ndb_struct_na_base_pair.buckle _ndb_struct_na_base_pair.propeller _ndb_struct_na_base_pair.opening _ndb_struct_na_base_pair.pair_number _ndb_struct_na_base_pair.pair_name _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_28 _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_12 1 A G 558 1_555 A A 26 1_555 6.543 -4.050 -0.189 -15.122 5.625 1.193 1 A_G558:A26_A A 558 ? A 26 ? 11 5 1 A G 9 1_555 A C 25 1_555 -0.221 -0.120 -0.175 -4.187 1.905 -0.392 2 A_G9:C25_A A 9 ? A 25 ? 19 1 1 A A 10 1_555 A U 24 1_555 -0.440 -0.041 0.141 -0.874 -7.121 4.987 3 A_A10:U24_A A 10 ? A 24 ? 20 1 1 A G 11 1_555 A C 23 1_555 -0.176 0.019 0.072 -4.089 -7.748 2.903 4 A_G11:C23_A A 11 ? A 23 ? 19 1 1 A U 12 1_555 A G 22 1_555 2.440 -0.315 0.077 -1.886 -4.297 -4.074 5 A_U12:G22_A A 12 ? A 22 ? 28 1 1 A A 914 1_555 A G 21 1_555 -6.837 -3.959 -0.304 2.088 0.340 -1.022 6 A_A914:G21_A A 914 ? A 21 ? 11 9 1 A A 915 1_555 A U 13 1_555 0.557 -3.207 -0.177 -5.307 -3.926 70.454 7 A_A915:U13_A A 915 ? A 13 ? 23 3 1 A U 916 1_555 A A 19 1_555 -0.261 0.260 -0.461 11.631 -14.407 5.538 8 A_U916:A19_A A 916 ? A 19 ? 20 1 1 A G 917 1_555 A C 18 1_555 -0.382 -0.175 0.352 -4.581 -7.809 5.501 9 A_G917:C18_A A 917 ? A 18 ? 19 1 1 A A 918 1_555 A U 17 1_555 0.152 0.512 0.307 -0.376 -8.405 7.046 10 A_A918:U17_A A 918 ? 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