data_9Q80 # _entry.id 9Q80 # _audit_conform.dict_name mmcif_pdbx.dic _audit_conform.dict_version 5.409 _audit_conform.dict_location http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic # loop_ _database_2.database_id _database_2.database_code _database_2.pdbx_database_accession _database_2.pdbx_DOI PDB 9Q80 pdb_00009q80 10.2210/pdb9q80/pdb WWPDB D_1292144906 ? ? EMDB EMD-52879 ? ? # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal _pdbx_audit_revision_history.data_content_type _pdbx_audit_revision_history.major_revision _pdbx_audit_revision_history.minor_revision _pdbx_audit_revision_history.revision_date _pdbx_audit_revision_history.part_number 1 'Structure model' 1 0 2026-01-14 ? 2 'EM metadata' 1 0 2026-01-14 ? 3 'Additional map' 1 0 2026-01-14 1 4 FSC 1 0 2026-01-14 ? 5 'Half map' 1 0 2026-01-14 1 6 'Half map' 1 0 2026-01-14 2 7 Image 1 0 2026-01-14 ? 8 'Primary map' 1 0 2026-01-14 ? # loop_ _pdbx_audit_revision_details.ordinal _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_details.data_content_type _pdbx_audit_revision_details.provider _pdbx_audit_revision_details.type _pdbx_audit_revision_details.description _pdbx_audit_revision_details.details 1 1 'Structure model' repository 'Initial release' ? ? 2 2 'EM metadata' repository 'Initial release' ? ? 3 3 'Additional map' repository 'Initial release' ? ? 4 4 FSC repository 'Initial release' ? ? 5 5 'Half map' repository 'Initial release' ? ? 6 6 'Half map' repository 'Initial release' ? ? 7 7 Image repository 'Initial release' ? ? 8 8 'Primary map' repository 'Initial release' ? ? # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 9Q80 _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2025-02-21 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site PDBE _pdbx_database_status.process_site PDBE _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible N # _pdbx_database_related.db_name EMDB _pdbx_database_related.details 'Ku70/80 with Ku70 linker and SAP domain bound to a 153 bp H2AX nucleosome' _pdbx_database_related.db_id EMD-52879 _pdbx_database_related.content_type 'associated EM volume' # _pdbx_contact_author.id 2 _pdbx_contact_author.email ac853@leicester.ac.uk _pdbx_contact_author.name_first Amanda _pdbx_contact_author.name_last Chaplin _pdbx_contact_author.name_mi K _pdbx_contact_author.role 'principal investigator/group leader' _pdbx_contact_author.identifier_ORCID 0000-0002-9606-8346 # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Hall, C.' 1 0009-0006-1812-5516 'Chaplin, A.K.' 2 ? # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country UK _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev 'Nat Commun' _citation.journal_id_ASTM ? _citation.journal_id_CSD ? _citation.journal_id_ISSN 2041-1723 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume ? _citation.language ? _citation.page_first ? _citation.page_last ? _citation.title 'Cryo-EM structures of NHEJ assemblies with nucleosomes.' _citation.year 2025 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1038/s41467-025-67376-2 _citation.pdbx_database_id_PubMed 41444611 _citation.pdbx_database_id_patent ? _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Hall, C.' 1 ? primary 'Frit, P.' 2 0000-0002-6571-8860 primary 'Kefala-Stavridi, A.' 3 ? primary 'Pelletier, A.' 4 ? primary 'Hardwick, S.W.' 5 0000-0001-9246-1864 primary 'Amin, H.' 6 0000-0002-5467-6642 primary 'Bilyard, M.K.' 7 ? primary 'Maia De Oliviera, T.' 8 0000-0003-3231-8112 primary 'Tariq, A.' 9 0000-0003-0657-5764 primary 'Zahid, S.' 10 0000-0002-1354-9209 primary 'Chirgadze, D.Y.' 11 0000-0001-9942-0993 primary 'Balasubramanian, S.' 12 0000-0002-0281-5815 primary 'Meek, K.' 13 0000-0002-0454-4414 primary 'Ropars, V.' 14 ? primary 'Charbonnier, J.B.' 15 0000-0002-5219-1983 primary 'Modesti, M.' 16 0000-0002-4964-331X primary 'Calsou, P.' 17 0000-0001-7951-9806 primary 'Britton, S.' 18 0000-0002-7008-5316 primary 'Blundell, T.L.' 19 0000-0002-2708-8992 primary 'Schalch, T.' 20 0000-0002-0758-3013 primary 'Chaplin, A.K.' 21 0000-0002-9606-8346 # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer man 'X-ray repair cross-complementing protein 6' 69945.039 2 3.6.4.-,4.2.99.- ? ? ? 2 polymer man 'X-ray repair cross-complementing protein 5' 82812.438 2 3.6.4.- ? ? ? 3 polymer man 'Histone H2AX' 15172.605 2 ? ? ? ? 4 polymer man 'Histone H2B type 1-J' 13935.239 2 ? ? ? ? 5 polymer man 'Histone H3.1' 15437.167 2 ? ? ? ? 6 polymer man 'Histone H4' 11394.426 2 ? ? ? ? 7 polymer man DNA 46998.945 1 ? ? ? ? 8 polymer man DNA 47457.234 1 ? ? ? ? # loop_ _entity_name_com.entity_id _entity_name_com.name 1 ;5'-deoxyribose-5-phosphate lyase Ku70,5'-dRP lyase Ku70,70 kDa subunit of Ku antigen,ATP-dependent DNA helicase 2 subunit 1,ATP-dependent DNA helicase II 70 kDa subunit,CTC box-binding factor 75 kDa subunit,CTCBF,DNA repair protein XRCC6,Lupus Ku autoantigen protein p70,Ku70,Thyroid-lupus autoantigen,TLAA,X-ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 6 ; 2 ;86 kDa subunit of Ku antigen,ATP-dependent DNA helicase 2 subunit 2,ATP-dependent DNA helicase II 80 kDa subunit,CTC box-binding factor 85 kDa subunit,CTCBF,DNA repair protein XRCC5,Ku80,Ku86,Lupus Ku autoantigen protein p86,Nuclear factor IV,Thyroid-lupus autoantigen,TLAA,X-ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 5 (double-strand-break rejoining) ; 3 'H2a/x,Histone H2A.X' 4 'Histone H2B.1,Histone H2B.r,H2B/r' 5 'Histone H3/a,Histone H3/b,Histone H3/c,Histone H3/d,Histone H3/f,Histone H3/h,Histone H3/i,Histone H3/j,Histone H3/k,Histone H3/l' # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no ;MSGWESYYKTEGDEEAEEEQEENLEASGDYKYSGRDSLIFLVDASKAMFESQSEDELTPFDMSIQCIQSVYISKIISSDR DLLAVVFYGTEKDKNSVNFKNIYVLQELDNPGAKRILELDQFKGQQGQKRFQDMMGHGSDYSLSEVLWVCANLFSDVQFK MSHKRIMLFTNEDNPHGNDSAKASRARTKAGDLRDTGIFLDLMHLKKPGGFDISLFYRDIISIAEDEDLRVHFEESSKLE DLLRKVRAKETRKRALSRLKLKLNKDIVISVGIYNLVQKALKPPPIKLYRETNEPVKTKTRTFNTSTGGLLLPSDTKRSQ IYGSRQIILEKEETEELKRFDDPGLMLMGFKPLVLLKKHHYLRPSLFVYPEESLVIGSSTLFSALLIKCLEKEVAALCRY TPRRNIPPYFVALVPQEEELDDQKIQVTPPGFQLVFLPFADDKRKMPFTEKIMATPEQVGKMKAIVEKLRFTYRSDSFEN PVLQQHFRNLEALALDLMEPEQAVDLTLPKVEAMNKRLGSLVDEFKELVYPPDYNPEGKVTKRKHDNEGSGSKRPKVEYS EEELKTHISKGTLGKFTVPMLKEACRAYGLKSGLKKQELLEALTKHFQD ; ;MSGWESYYKTEGDEEAEEEQEENLEASGDYKYSGRDSLIFLVDASKAMFESQSEDELTPFDMSIQCIQSVYISKIISSDR DLLAVVFYGTEKDKNSVNFKNIYVLQELDNPGAKRILELDQFKGQQGQKRFQDMMGHGSDYSLSEVLWVCANLFSDVQFK MSHKRIMLFTNEDNPHGNDSAKASRARTKAGDLRDTGIFLDLMHLKKPGGFDISLFYRDIISIAEDEDLRVHFEESSKLE DLLRKVRAKETRKRALSRLKLKLNKDIVISVGIYNLVQKALKPPPIKLYRETNEPVKTKTRTFNTSTGGLLLPSDTKRSQ IYGSRQIILEKEETEELKRFDDPGLMLMGFKPLVLLKKHHYLRPSLFVYPEESLVIGSSTLFSALLIKCLEKEVAALCRY TPRRNIPPYFVALVPQEEELDDQKIQVTPPGFQLVFLPFADDKRKMPFTEKIMATPEQVGKMKAIVEKLRFTYRSDSFEN PVLQQHFRNLEALALDLMEPEQAVDLTLPKVEAMNKRLGSLVDEFKELVYPPDYNPEGKVTKRKHDNEGSGSKRPKVEYS EEELKTHISKGTLGKFTVPMLKEACRAYGLKSGLKKQELLEALTKHFQD ; K,M ? 2 'polypeptide(L)' no no ;MVRSGNKAAVVLCMDVGFTMSNSIPGIESPFEQAKKVITMFVQRQVFAENKDEIALVLFGTDGTDNPLSGGDQYQNITVH RHLMLPDFDLLEDIESKIQPGSQQADFLDALIVSMDVIQHETIGKKFEKRHIEIFTDLSSRFSKSQLDIIIHSLKKCDIS LQFFLPFSLGKEDGSGDRGDGPFRLGGHGPSFPLKGITEQQKEGLEIVKMVMISLEGEDGLDEIYSFSESLRKLCVFKKI ERHSIHWPCRLTIGSNLSIRIAAYKSILQERVKKTWTVVDAKTLKKEDIQKETVYCLNDDDETEVLKEDIIQGFRYGSDI VPFSKVDEEQMKYKSEGKCFSVLGFCKSSQVQRRFFMGNQVLKVFAARDDEAAAVALSSLIHALDDLDMVAIVRYAYDKR ANPQVGVAFPHIKHNYECLVYVQLPFMEDLRQYMFSSLKNSKKYAPTEAQLNAVDALIDSMSLAKKDEKTDTLEDLFPTT KIPNPRFQRLFQCLLHRALHPREPLPPIQQHIWNMLNPPAEVTTKSQIPLSKIKTLFPLIEAKKKDQVTAQEIFQDNHED GPTAKKLKTEQGGAHFSVSSLAEGSVTSVGSVNPAENFRVLVKQKKASFEEASNQLINHIEQFLDTNETPYFMKSIDCIR AFREEAIKFSEEQRFNNFLKALQEKVEIKQLNHFWEIVVQDGITLITKEEASGSSVTAEEAKKFLAPKDKPSGDTAAVFE EGGDVDDLLDMI ; ;MVRSGNKAAVVLCMDVGFTMSNSIPGIESPFEQAKKVITMFVQRQVFAENKDEIALVLFGTDGTDNPLSGGDQYQNITVH RHLMLPDFDLLEDIESKIQPGSQQADFLDALIVSMDVIQHETIGKKFEKRHIEIFTDLSSRFSKSQLDIIIHSLKKCDIS LQFFLPFSLGKEDGSGDRGDGPFRLGGHGPSFPLKGITEQQKEGLEIVKMVMISLEGEDGLDEIYSFSESLRKLCVFKKI ERHSIHWPCRLTIGSNLSIRIAAYKSILQERVKKTWTVVDAKTLKKEDIQKETVYCLNDDDETEVLKEDIIQGFRYGSDI VPFSKVDEEQMKYKSEGKCFSVLGFCKSSQVQRRFFMGNQVLKVFAARDDEAAAVALSSLIHALDDLDMVAIVRYAYDKR ANPQVGVAFPHIKHNYECLVYVQLPFMEDLRQYMFSSLKNSKKYAPTEAQLNAVDALIDSMSLAKKDEKTDTLEDLFPTT KIPNPRFQRLFQCLLHRALHPREPLPPIQQHIWNMLNPPAEVTTKSQIPLSKIKTLFPLIEAKKKDQVTAQEIFQDNHED GPTAKKLKTEQGGAHFSVSSLAEGSVTSVGSVNPAENFRVLVKQKKASFEEASNQLINHIEQFLDTNETPYFMKSIDCIR AFREEAIKFSEEQRFNNFLKALQEKVEIKQLNHFWEIVVQDGITLITKEEASGSSVTAEEAKKFLAPKDKPSGDTAAVFE EGGDVDDLLDMI ; L,N ? 3 'polypeptide(L)' no no ;MSGRGKTGGKARAKAKSRSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGHYAERVGAGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKTRII PRHLQLAIRNDEELNKLLGGVTIAQGGVLPNIQAVLLPKKTSATVGPKAPSGGKKATQASQEY ; ;MSGRGKTGGKARAKAKSRSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGHYAERVGAGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKTRII PRHLQLAIRNDEELNKLLGGVTIAQGGVLPNIQAVLLPKKTSATVGPKAPSGGKKATQASQEY ; C,G ? 4 'polypeptide(L)' no no ;MPEPAKSAPAPKKGSKKAVTKAQKKDGKKRKRSRKESYSIYVYKVLKQVHPDTGISSKAMGIMNSFVNDIFERIAGEASR LAHYNKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSAK ; ;MPEPAKSAPAPKKGSKKAVTKAQKKDGKKRKRSRKESYSIYVYKVLKQVHPDTGISSKAMGIMNSFVNDIFERIAGEASR LAHYNKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSAK ; D,H ? 5 'polypeptide(L)' no no ;MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPATGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFK TDLRFQSSAVMALQEACEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA ; ;MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPATGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFK TDLRFQSSAVMALQEACEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA ; E,A ? 6 'polypeptide(L)' no no ;MSGRGKGGKGLGKGGAKRHRKVLRDNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEETRGVLKVFLENVIRDAVTYTEHAKRK TVTAMDVVYALKRQGRTLYGFGG ; ;MSGRGKGGKGLGKGGAKRHRKVLRDNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEETRGVLKVFLENVIRDAVTYTEHAKRK TVTAMDVVYALKRQGRTLYGFGG ; F,B ? 7 polydeoxyribonucleotide no no ;(DA)(DT)(DC)(DC)(DT)(DG)(DG)(DA)(DG)(DA)(DA)(DT)(DC)(DC)(DC)(DG)(DG)(DT)(DG)(DC) (DC)(DG)(DA)(DG)(DG)(DC)(DC)(DG)(DC)(DT)(DC)(DA)(DA)(DT)(DT)(DG)(DG)(DT)(DC)(DG) (DT)(DA)(DG)(DA)(DC)(DA)(DG)(DC)(DT)(DC)(DT)(DA)(DG)(DC)(DA)(DC)(DC)(DG)(DC)(DT) (DT)(DA)(DA)(DA)(DC)(DG)(DC)(DA)(DC)(DG)(DT)(DA)(DC)(DG)(DC)(DG)(DC)(DT)(DG)(DT) (DC)(DC)(DC)(DC)(DC)(DG)(DC)(DG)(DT)(DT)(DT)(DT)(DA)(DA)(DC)(DC)(DG)(DC)(DC)(DA) (DA)(DG)(DG)(DG)(DG)(DA)(DT)(DT)(DA)(DC)(DT)(DC)(DC)(DC)(DT)(DA)(DG)(DT)(DC)(DT) (DC)(DC)(DA)(DG)(DG)(DC)(DA)(DC)(DG)(DT)(DG)(DT)(DC)(DA)(DG)(DA)(DT)(DA)(DT)(DA) (DT)(DA)(DC)(DA)(DT)(DC)(DC)(DT)(DG)(DT)(DG)(DA)(DT) ; ;ATCCTGGAGAATCCCGGTGCCGAGGCCGCTCAATTGGTCGTAGACAGCTCTAGCACCGCTTAAACGCACGTACGCGCTGT CCCCCGCGTTTTAACCGCCAAGGGGATTACTCCCTAGTCTCCAGGCACGTGTCAGATATATACATCCTGTGAT ; I ? 8 polydeoxyribonucleotide no no ;(DA)(DT)(DC)(DA)(DC)(DA)(DG)(DG)(DA)(DT)(DG)(DT)(DA)(DT)(DA)(DT)(DA)(DT)(DC)(DT) (DG)(DA)(DC)(DA)(DC)(DG)(DT)(DG)(DC)(DC)(DT)(DG)(DG)(DA)(DG)(DA)(DC)(DT)(DA)(DG) (DG)(DG)(DA)(DG)(DT)(DA)(DA)(DT)(DC)(DC)(DC)(DC)(DT)(DT)(DG)(DG)(DC)(DG)(DG)(DT) (DT)(DA)(DA)(DA)(DA)(DC)(DG)(DC)(DG)(DG)(DG)(DG)(DG)(DA)(DC)(DA)(DG)(DC)(DG)(DC) (DG)(DT)(DA)(DC)(DG)(DT)(DG)(DC)(DG)(DT)(DT)(DT)(DA)(DA)(DG)(DC)(DG)(DG)(DT)(DG) (DC)(DT)(DA)(DG)(DA)(DG)(DC)(DT)(DG)(DT)(DC)(DT)(DA)(DC)(DG)(DA)(DC)(DC)(DA)(DA) (DT)(DT)(DG)(DA)(DG)(DC)(DG)(DG)(DC)(DC)(DT)(DC)(DG)(DG)(DC)(DA)(DC)(DC)(DG)(DG) (DG)(DA)(DT)(DT)(DC)(DT)(DC)(DC)(DA)(DG)(DG)(DA)(DT) ; ;ATCACAGGATGTATATATCTGACACGTGCCTGGAGACTAGGGAGTAATCCCCTTGGCGGTTAAAACGCGGGGGACAGCGC GTACGTGCGTTTAAGCGGTGCTAGAGCTGTCTACGACCAATTGAGCGGCCTCGGCACCGGGATTCTCCAGGAT ; J ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET n 1 2 SER n 1 3 GLY n 1 4 TRP n 1 5 GLU n 1 6 SER n 1 7 TYR n 1 8 TYR n 1 9 LYS n 1 10 THR n 1 11 GLU n 1 12 GLY n 1 13 ASP n 1 14 GLU n 1 15 GLU n 1 16 ALA n 1 17 GLU n 1 18 GLU n 1 19 GLU n 1 20 GLN n 1 21 GLU n 1 22 GLU n 1 23 ASN n 1 24 LEU n 1 25 GLU n 1 26 ALA n 1 27 SER n 1 28 GLY n 1 29 ASP n 1 30 TYR n 1 31 LYS n 1 32 TYR n 1 33 SER n 1 34 GLY n 1 35 ARG n 1 36 ASP n 1 37 SER n 1 38 LEU n 1 39 ILE n 1 40 PHE n 1 41 LEU n 1 42 VAL n 1 43 ASP n 1 44 ALA n 1 45 SER n 1 46 LYS n 1 47 ALA n 1 48 MET n 1 49 PHE n 1 50 GLU n 1 51 SER n 1 52 GLN n 1 53 SER n 1 54 GLU n 1 55 ASP n 1 56 GLU n 1 57 LEU n 1 58 THR n 1 59 PRO n 1 60 PHE n 1 61 ASP n 1 62 MET n 1 63 SER n 1 64 ILE n 1 65 GLN n 1 66 CYS n 1 67 ILE n 1 68 GLN n 1 69 SER n 1 70 VAL n 1 71 TYR n 1 72 ILE n 1 73 SER n 1 74 LYS n 1 75 ILE n 1 76 ILE n 1 77 SER n 1 78 SER n 1 79 ASP n 1 80 ARG n 1 81 ASP n 1 82 LEU n 1 83 LEU n 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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.570 ? 40486 ? f_angle_d ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 25.193 ? 6339 ? f_dihedral_angle_d ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.037 ? 4708 ? f_chiral_restr ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.004 ? 4173 ? f_plane_restr ? ? ? # _struct.entry_id 9Q80 _struct.title 'Ku70/80 with Ku70 linker and SAP domain bound to a 153 bp H2AX nucleosome' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 9Q80 _struct_keywords.text 'DNA-binding protein, NHEJ, Ku70/80, nucleosome, DNA BINDING PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'DNA BINDING PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? F N N 6 ? G N N 3 ? H N N 4 ? I N N 1 ? J N N 2 ? K N N 5 ? L N N 6 ? M N N 7 ? N N N 8 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP XRCC6_HUMAN P12956 ? 1 ;MSGWESYYKTEGDEEAEEEQEENLEASGDYKYSGRDSLIFLVDASKAMFESQSEDELTPFDMSIQCIQSVYISKIISSDR DLLAVVFYGTEKDKNSVNFKNIYVLQELDNPGAKRILELDQFKGQQGQKRFQDMMGHGSDYSLSEVLWVCANLFSDVQFK MSHKRIMLFTNEDNPHGNDSAKASRARTKAGDLRDTGIFLDLMHLKKPGGFDISLFYRDIISIAEDEDLRVHFEESSKLE DLLRKVRAKETRKRALSRLKLKLNKDIVISVGIYNLVQKALKPPPIKLYRETNEPVKTKTRTFNTSTGGLLLPSDTKRSQ IYGSRQIILEKEETEELKRFDDPGLMLMGFKPLVLLKKHHYLRPSLFVYPEESLVIGSSTLFSALLIKCLEKEVAALCRY TPRRNIPPYFVALVPQEEELDDQKIQVTPPGFQLVFLPFADDKRKMPFTEKIMATPEQVGKMKAIVEKLRFTYRSDSFEN PVLQQHFRNLEALALDLMEPEQAVDLTLPKVEAMNKRLGSLVDEFKELVYPPDYNPEGKVTKRKHDNEGSGSKRPKVEYS EEELKTHISKGTLGKFTVPMLKEACRAYGLKSGLKKQELLEALTKHFQD ; 1 2 UNP XRCC5_HUMAN P13010 ? 2 ;MVRSGNKAAVVLCMDVGFTMSNSIPGIESPFEQAKKVITMFVQRQVFAENKDEIALVLFGTDGTDNPLSGGDQYQNITVH RHLMLPDFDLLEDIESKIQPGSQQADFLDALIVSMDVIQHETIGKKFEKRHIEIFTDLSSRFSKSQLDIIIHSLKKCDIS LQFFLPFSLGKEDGSGDRGDGPFRLGGHGPSFPLKGITEQQKEGLEIVKMVMISLEGEDGLDEIYSFSESLRKLCVFKKI ERHSIHWPCRLTIGSNLSIRIAAYKSILQERVKKTWTVVDAKTLKKEDIQKETVYCLNDDDETEVLKEDIIQGFRYGSDI VPFSKVDEEQMKYKSEGKCFSVLGFCKSSQVQRRFFMGNQVLKVFAARDDEAAAVALSSLIHALDDLDMVAIVRYAYDKR ANPQVGVAFPHIKHNYECLVYVQLPFMEDLRQYMFSSLKNSKKYAPTEAQLNAVDALIDSMSLAKKDEKTDTLEDLFPTT KIPNPRFQRLFQCLLHRALHPREPLPPIQQHIWNMLNPPAEVTTKSQIPLSKIKTLFPLIEAKKKDQVTAQEIFQDNHED GPTAKKLKTEQGGAHFSVSSLAEGSVTSVGSVNPAENFRVLVKQKKASFEEASNQLINHIEQFLDTNETPYFMKSIDCIR AFREEAIKFSEEQRFNNFLKALQEKVEIKQLNHFWEIVVQDGITLITKEEASGSSVTAEEAKKFLAPKDKPSGDTAAVFE EGGDVDDLLDMI ; 1 3 UNP H2AX_HUMAN P16104 ? 3 ;MSGRGKTGGKARAKAKSRSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGHYAERVGAGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKTRII PRHLQLAIRNDEELNKLLGGVTIAQGGVLPNIQAVLLPKKTSATVGPKAPSGGKKATQASQEY ; 1 4 UNP H2B1J_HUMAN P06899 ? 4 ;MPEPAKSAPAPKKGSKKAVTKAQKKDGKKRKRSRKESYSIYVYKVLKQVHPDTGISSKAMGIMNSFVNDIFERIAGEASR LAHYNKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSAK ; 1 5 UNP H31_HUMAN P68431 ? 5 ;MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPATGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFK TDLRFQSSAVMALQEACEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA ; 1 6 UNP H4_HUMAN P62805 ? 6 ;MSGRGKGGKGLGKGGAKRHRKVLRDNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEETRGVLKVFLENVIRDAVTYTEHAKRK TVTAMDVVYALKRQGRTLYGFGG ; 1 7 PDB 9Q80 9Q80 ? 7 ? 1 8 PDB 9Q80 9Q80 ? 8 ? 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 9Q80 K 1 ? 609 ? 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P62805 1 ? 103 ? 0 102 13 7 9Q80 I 1 ? 153 ? 9Q80 1 ? 153 ? 1 153 14 8 9Q80 J 1 ? 153 ? 9Q80 1 ? 153 ? 1 153 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details 14-meric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 14 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'not applicable' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 SER A 45 ? GLU A 50 ? SER K 45 GLU K 50 1 ? 6 HELX_P HELX_P2 AA2 THR A 58 ? SER A 78 ? THR K 58 SER K 78 1 ? 21 HELX_P HELX_P3 AA3 ALA A 113 ? GLN A 121 ? ALA K 113 GLN K 121 1 ? 9 HELX_P HELX_P4 AA4 LYS A 123 ? MET A 134 ? LYS K 123 MET K 134 1 ? 12 HELX_P HELX_P5 AA5 SER A 142 ? ASP A 156 ? SER K 142 ASP K 156 1 ? 15 HELX_P HELX_P6 AA6 ASP A 179 ? GLY A 197 ? ASP K 179 GLY K 197 1 ? 19 HELX_P HELX_P7 AA7 LYS A 238 ? GLU A 250 ? LYS K 238 GLU K 250 1 ? 13 HELX_P HELX_P8 AA8 GLU A 330 ? LYS A 338 ? GLU K 330 LYS K 338 1 ? 9 HELX_P HELX_P9 AA9 GLY A 377 ? GLU A 393 ? GLY K 377 GLU K 393 1 ? 17 HELX_P HELX_P10 AB1 THR A 455 ? LEU A 469 ? THR K 455 LEU K 469 1 ? 15 HELX_P HELX_P11 AB2 GLN A 484 ? LEU A 495 ? GLN K 484 LEU K 495 1 ? 12 HELX_P HELX_P12 AB3 ALA A 513 ? GLY A 519 ? ALA K 513 GLY K 519 1 ? 7 HELX_P HELX_P13 AB4 SER A 520 ? TYR A 530 ? SER K 520 TYR K 530 1 ? 11 HELX_P HELX_P14 AB5 GLU A 563 ? GLY A 571 ? GLU K 563 GLY K 571 1 ? 9 HELX_P HELX_P15 AB6 THR A 572 ? LYS A 575 ? 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LYS L 325 GLN L 330 1 ? 6 HELX_P HELX_P30 AD3 GLN B 352 ? PHE B 356 ? GLN L 352 PHE L 356 5 ? 5 HELX_P HELX_P31 AD4 ASP B 370 ? LEU B 387 ? ASP L 370 LEU L 387 1 ? 18 HELX_P HELX_P32 AD5 SER B 441 ? ALA B 445 ? SER L 441 ALA L 445 5 ? 5 HELX_P HELX_P33 AD6 THR B 447 ? MET B 461 ? THR L 447 MET L 461 1 ? 15 HELX_P HELX_P34 AD7 ASN B 484 ? HIS B 500 ? ASN L 484 HIS L 500 1 ? 17 HELX_P HELX_P35 AD8 GLN B 509 ? LEU B 516 ? GLN L 509 LEU L 516 1 ? 8 HELX_P HELX_P36 AD9 PRO B 519 ? THR B 524 ? PRO L 519 THR L 524 1 ? 6 HELX_P HELX_P37 AE1 SER B 526 ? PHE B 537 ? SER L 526 PHE L 537 1 ? 12 HELX_P HELX_P38 AE2 SER C 17 ? ALA C 22 ? SER C 16 ALA C 21 1 ? 6 HELX_P HELX_P39 AE3 PRO C 27 ? GLY C 38 ? PRO C 26 GLY C 37 1 ? 12 HELX_P HELX_P40 AE4 ALA C 46 ? ASN C 74 ? ALA C 45 ASN C 73 1 ? 29 HELX_P HELX_P41 AE5 ILE C 80 ? ASP C 91 ? ILE C 79 ASP C 90 1 ? 12 HELX_P HELX_P42 AE6 ASP C 91 ? LEU C 98 ? ASP C 90 LEU C 97 1 ? 8 HELX_P HELX_P43 AE7 TYR D 38 ? HIS D 50 ? 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