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_entity_src_gen.host_org_common_name _entity_src_gen.pdbx_host_org_scientific_name _entity_src_gen.pdbx_host_org_ncbi_taxonomy_id _entity_src_gen.host_org_genus _entity_src_gen.pdbx_host_org_gene _entity_src_gen.pdbx_host_org_organ _entity_src_gen.host_org_species _entity_src_gen.pdbx_host_org_tissue _entity_src_gen.pdbx_host_org_tissue_fraction _entity_src_gen.pdbx_host_org_strain _entity_src_gen.pdbx_host_org_variant _entity_src_gen.pdbx_host_org_cell_line _entity_src_gen.pdbx_host_org_atcc _entity_src_gen.pdbx_host_org_culture_collection _entity_src_gen.pdbx_host_org_cell _entity_src_gen.pdbx_host_org_organelle _entity_src_gen.pdbx_host_org_cellular_location _entity_src_gen.pdbx_host_org_vector_type _entity_src_gen.pdbx_host_org_vector _entity_src_gen.host_org_details _entity_src_gen.expression_system_id _entity_src_gen.plasmid_name _entity_src_gen.plasmid_details _entity_src_gen.pdbx_description 1 1 sample 'Biological sequence' 1 406 human ? 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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.560 ? 40432 ? f_angle_d ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 6.234 ? 4080 ? f_dihedral_angle_d ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.036 ? 4665 ? f_chiral_restr ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.004 ? 5136 ? f_plane_restr ? ? ? # _struct.entry_id 9QO0 _struct.title 'Pre-activated 9-subunit COP9 signalosome and neddylated SCF (Skp1-Skp2-Cks1) complex structure' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 9QO0 _struct_keywords.text 'E3 ligases, COP9 signalosome, LIGASE' _struct_keywords.pdbx_keywords LIGASE # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? F N N 6 ? G N N 7 ? H N N 8 ? I N N 9 ? J N N 10 ? K N N 11 ? L N N 12 ? M N N 13 ? N N N 14 ? O N N 15 ? P N N 16 ? Q N N 17 ? R N N 17 ? S N N 17 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP CSN4_HUMAN Q9BT78 ? 1 ;MAAAVRQDLAQLMNSSGSHKDLAGKYRQILEKAIQLSGAEQLEALKAFVEAMVNENVSLVISRQLLTDFCTHLPNLPDST AKEIYHFTLEKIQPRVISFEEQVASIRQHLASIYEKEEDWRNAAQVLVGIPLETGQKQYNVDYKLETYLKIARLYLEDDD PVQAEAYINRASLLQNESTNEQLQIHYKVCYARVLDYRRKFIEAAQRYNELSYKTIVHESERLEALKHALHCTILASAGQ QRSRMLATLFKDERCQQLAAYGILEKMYLDRIIRGNQLQEFAAMLMPHQKATTADGSSILDRAVIEHNLLSASKLYNNIT FEELGALLEIPAAKAEKIASQMITEGRMNGFIDQIDGIVHFETREALPTWDKQIQSLCFQVNNLLEKISQTAPEWTAQAM EAQMAQ ; 1 2 UNP CSN7B_HUMAN Q9H9Q2 ? 2 ;MAGEQKPSSNLLEQFILLAKGTSGSALTALISQVLEAPGVYVFGELLELANVQELAEGANAAYLQLLNLFAYGTYPDYIA NKESLPELSTAQQNKLKHLTIVSLASRMKCIPYSVLLKDLEMRNLRELEDLIIEAVYTDIIQGKLDQRNQLLEVDFCIGR DIRKKDINNIVKTLHEWCDGCEAVLLGIEQQVLRANQYKENHNRTQQQVEAEVTNIKKTLKATASSSAQEMEQQLAEREC PPHAEQRQPTKKMSKVKGLVSSRH ; 1 3 UNP NEDD8_HUMAN Q15843 ? 3 MLIKVKTLTGKEIEIDIEPTDKVERIKERVEEKEGIPPQQQRLIYSGKQMNDEKTAADYKILGGSVLHLVLALRGG 1 4 UNP CKS1_HUMAN P61024 ? 4 MSHKQIYYSDKYDDEEFEYRHVMLPKDIAKLVPKTHLMSESEWRNLGVQQSQGWVHYMIHEPEPHILLFRRPLPKKPKK 1 5 UNP CSN9_HUMAN Q8WXC6 ? 5 MKPAVDEMFPEGAGPYVDLDEAGGSTGLLMDLAANEKAVHADFFNDFEDLFDDDDIQ 1 6 UNP CSN1_HUMAN Q13098 ? 6 ;MPLPVQVFNLQGAVEPMQIDVDPQEDPQNAPDVNYVVENPSLDLEQYAASYSGLMRIERLQFIADHCPTLRVEALKMALS FVQRTFNVDMYEEIHRKLSEATRSSLRELQNAPDAIPESGVEPPALDTAWVEATRKKALLKLEKLDTDLKNYKGNSIKES IRRGHDDLGDHYLDCGDLSNALKCYSRARDYCTSAKHVINMCLNVIKVSVYLQNWSHVLSYVSKAESTPEIAEQRGERDS QTQAILTKLKCAAGLAELAARKYKQAAKCLLLASFDHCDFPELLSPSNVAIYGGLCALATFDRQELQRNVISSSSFKLFL ELEPQVRDIIFKFYESKYASCLKMLDEMKDNLLLDMYLAPHVRTLYTQIRNRALIQYFSPYVSADMHRMAAAFNTTVAAL EDELTQLILEGLISARVDSHSKILYARDVDQRSTTFEKSLLMGKEFQRRAKAMMLRAAVLRNQIHVKSPPREGSQGELTP ANSQSRMSTNM ; 1 7 UNP CSN2_HUMAN P61201 ? 7 ;MSDMEDDFMCDDEEDYDLEYSEDSNSEPNVDLENQYYNSKALKEDDPKAALSSFQKVLELEGEKGEWGFKALKQMIKINF KLTNFPEMMNRYKQLLTYIRSAVTRNYSEKSINSILDYISTSKQMDLLQEFYETTLEALKDAKNDRLWFKTNTKLGKLYL EREEYGKLQKILRQLHQSCQTDDGEDDLKKGTQLLEIYALEIQMYTAQKNNKKLKALYEQSLHIKSAIPHPLIMGVIREC GGKMHLREGEFEKAHTDFFEAFKNYDESGSPRRTTCLKYLVLANMLMKSGINPFDSQEAKPYKNDPEILAMTNLVSAYQN NDITEFEKILKTNHSNIMDDPFIREHIEELLRNIRTQVLIKLIKPYTRIHIPFISKELNIDVADVESLLVQCILDNTIHG RIDQVNQLLELDHQKRGGARYTALDKWTNQLNSLNQAVVSKLA ; 1 8 UNP CSN3_HUMAN Q9UNS2 ? 8 ;MASALEQFVNSVRQLSAQGQMTQLCELINKSGELLAKNLSHLDTVLGALDVQEHSLGVLAVLFVKFSMPSVPDFETLFSQ VQLFISTCNGEHIRYATDTFAGLCHQLTNALVERKQPLRGIGILKQAIDKMQMNTNQLTSIHADLCQLCLLAKCFKPALP YLDVDMMDICKENGAYDAKHFLCYYYYGGMIYTGLKNFERALYFYEQAITTPAMAVSHIMLESYKKYILVSLILLGKVQQ LPKYTSQIVGRFIKPLSNAYHELAQVYSTNNPSELRNLVNKHSETFTRDNNMGLVKQCLSSLYKKNIQRLTKTFLTLSLQ DMASRVQLSGPQEAEKYVLHMIEDGEIFASINQKDGMVSFHDNPEKYNNPAMLHNIDQEMLKCIELDERLKAMDQEITVN PQFVQKSMGSQEDDSGNKPSSYS ; 1 9 UNP CSN5_HUMAN Q92905 ? 9 ;MAASGSGMAQKTWELANNMQEAQSIDEIYKYDKKQQQEILAAKPWTKDHHYFKYCKISALALLKMVMHARSGGNLEVMGL MLGKVDGETMIIMDSFALPVEGTETRVNAQAAAYEYMAAYIENAKQVGRLENAIGWYHSHPGYGCWLSGIDVSTQMLNQQ FQEPFVAVVIDPTRTISAGKVNLGAFRTYPKGYKPPDEGPSEYQTIPLNKIEDFGVHCKQYYALEVSYFKSSLDRKLLEL LWNKYWVNTLSSSSLLTNADYTTGQVFDLSEKLEQSEAQLGRGSFMLGLETHDRKSEDKLAKATRDSCKTTIEAIHGLMS QVIKDKLFNQINIS ; 1 10 UNP CSN6_HUMAN Q7L5N1 ? 10 ;MAAAAAAAAATNGTGGSSGMEVDAAVVPSVMACGVTGSVSVALHPLVILNISDHWIRMRSQEGRPVQVIGALIGKQEGRN IEVMNSFELLSHTVEEKIIIDKEYYYTKEEQFKQVFKELEFLGWYTTGGPPDPSDIHVHKQVCEIIESPLFLKLNPMTKH TDLPVSVFESVIDIINGEATMLFAELTYTLATEEAERIGVDHVARMTATGSGENSTVAEHLIAQHSAIKMLHSRVKLILE YVKASEAGEVPFNHEILREAYALCHCLPVLSTDKFKTDFYDQCNDVGLMAYLGTITKTCNTMNQFVNKFNVLYDRQGIGR RMRGLFF ; 1 11 UNP CSN8_HUMAN Q99627 ? 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Q13309 1 ? 424 ? 1 424 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details 15-meric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 15 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'not applicable' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 ALA A 4 ? 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J ASP 97 J ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.566 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? metalc ? ? # loop_ _pdbx_struct_conn_angle.id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.value _pdbx_struct_conn_angle.value_esd 1 SG ? 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ALA J 78 HIS J 80 AB5 2 VAL M 70 ? GLY M 73 ? VAL J 70 GLY J 73 AB5 3 PHE M 103 ? TYR M 106 ? PHE J 103 TYR J 106 AB6 1 ILE N 4 ? GLN N 7 ? ILE L 4 GLN L 7 AB6 2 ILE N 13 ? VAL N 16 ? ILE L 13 VAL L 16 AB7 1 THR O 139 ? LEU O 140 ? THR M 139 LEU M 140 AB7 2 ALA O 162 ? PHE O 163 ? ALA M 162 PHE M 163 AB8 1 HIS O 185 ? ASP O 187 ? HIS M 185 ASP M 187 AB8 2 ASN O 210 ? GLU O 214 ? ASN M 210 GLU M 214 AB8 3 ARG O 234 ? SER O 238 ? ARG M 234 SER M 238 AB8 4 GLU O 260 ? ASN O 262 ? GLU M 260 ASN M 262 AB9 1 HIS O 314 ? ASP O 316 ? HIS M 314 ASP M 316 AB9 2 HIS O 339 ? SER O 341 ? HIS M 339 SER M 341 AB9 3 THR O 364 ? GLN O 366 ? THR M 364 GLN M 366 AB9 4 GLN O 387 ? ILE O 388 ? 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