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ILE D 686 SER D 698 1 ? 13 HELX_P HELX_P44 AE8 THR C 687 ? SER C 698 ? THR D 707 SER D 718 1 ? 12 HELX_P HELX_P45 AE9 THR C 709 ? GLN C 716 ? THR D 729 GLN D 736 1 ? 8 HELX_P HELX_P46 AF1 LEU C 744 ? GLY C 759 ? LEU D 764 GLY D 779 1 ? 16 HELX_P HELX_P47 AF2 GLY C 759 ? ASP C 771 ? GLY D 779 ASP D 791 1 ? 13 HELX_P HELX_P48 AF3 SER C 790 ? PHE C 816 ? SER D 810 PHE D 836 1 ? 27 HELX_P HELX_P49 AF4 GLU D 418 ? ASP D 421 ? GLU C 438 ASP C 441 5 ? 4 HELX_P HELX_P50 AF5 GLY D 425 ? GLY D 439 ? GLY C 445 GLY C 459 1 ? 15 HELX_P HELX_P51 AF6 ASN D 463 ? TYR D 471 ? ASN C 483 TYR C 491 1 ? 9 HELX_P HELX_P52 AF7 THR D 484 ? GLU D 489 ? THR C 504 GLU C 509 1 ? 6 HELX_P HELX_P53 AF8 ALA D 524 ? VAL D 545 ? ALA C 544 VAL C 565 1 ? 22 HELX_P HELX_P54 AF9 ASN D 577 ? GLN D 588 ? ASN C 597 GLN C 608 1 ? 12 HELX_P HELX_P55 AG1 SER D 597 ? VAL D 632 ? SER C 617 VAL C 652 1 ? 36 HELX_P HELX_P56 AG2 SER D 637 ? GLN D 644 ? SER C 657 GLN C 664 1 ? 8 HELX_P HELX_P57 AG3 GLY D 655 ? ARG D 663 ? GLY C 675 ARG C 683 1 ? 9 HELX_P HELX_P58 AG4 ILE D 666 ? ALA D 679 ? ILE C 686 ALA C 699 1 ? 14 HELX_P HELX_P59 AG5 THR D 687 ? LYS D 697 ? THR C 707 LYS C 717 1 ? 11 HELX_P HELX_P60 AG6 SER D 708 ? GLN D 716 ? SER C 728 GLN C 736 1 ? 9 HELX_P HELX_P61 AG7 ARG D 745 ? GLY D 759 ? ARG C 765 GLY C 779 1 ? 15 HELX_P HELX_P62 AG8 GLY D 759 ? TYR D 770 ? GLY C 779 TYR C 790 1 ? 12 HELX_P HELX_P63 AG9 LEU D 791 ? ASN D 793 ? LEU C 811 ASN C 813 5 ? 3 HELX_P HELX_P64 AH1 VAL D 794 ? PHE D 816 ? VAL C 814 PHE C 836 1 ? 23 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? A CYS 591 SG ? ? ? 1_555 C CYS 591 SG ? ? A CYS 611 D CYS 611 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.924 ? ? disulf2 disulf ? ? A CYS 720 SG ? ? ? 1_555 A CYS 775 SG ? ? A CYS 740 A CYS 795 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? ? disulf3 disulf ? ? B CYS 591 SG ? ? ? 1_555 D CYS 591 SG ? ? B CYS 611 C CYS 611 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.132 ? ? disulf4 disulf ? ? D CYS 720 SG ? ? ? 1_555 D CYS 775 SG ? ? C CYS 740 C CYS 795 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? ? # _struct_conn_type.id disulf _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _pdbx_modification_feature.ordinal _pdbx_modification_feature.label_comp_id _pdbx_modification_feature.label_asym_id _pdbx_modification_feature.label_seq_id _pdbx_modification_feature.label_alt_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_alt_id _pdbx_modification_feature.auth_comp_id _pdbx_modification_feature.auth_asym_id _pdbx_modification_feature.auth_seq_id _pdbx_modification_feature.PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.symmetry _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.modified_residue_symmetry _pdbx_modification_feature.comp_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id _pdbx_modification_feature.ref_pcm_id _pdbx_modification_feature.ref_comp_id _pdbx_modification_feature.type _pdbx_modification_feature.category 1 CYS A 591 ? CYS C 591 ? CYS A 611 ? 1_555 CYS D 611 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 2 CYS A 720 ? CYS A 775 ? CYS A 740 ? 1_555 CYS A 795 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 3 CYS B 591 ? CYS D 591 ? CYS B 611 ? 1_555 CYS C 611 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 4 CYS D 720 ? CYS D 775 ? CYS C 740 ? 1_555 CYS C 795 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 SER 405 A . ? SER 425 A PRO 406 A ? PRO 426 A 1 -1.66 2 GLU 680 A . ? GLU 700 A PRO 681 A ? PRO 701 A 1 14.17 3 LYS 718 A . ? LYS 738 A PRO 719 A ? PRO 739 A 1 3.93 4 SER 405 B . ? SER 425 B PRO 406 B ? PRO 426 B 1 -1.93 5 GLU 680 B . ? GLU 700 B PRO 681 B ? PRO 701 B 1 -1.22 6 LYS 718 B . ? LYS 738 B PRO 719 B ? PRO 739 B 1 4.66 7 SER 405 C . ? SER 425 D PRO 406 C ? PRO 426 D 1 -1.98 8 GLU 680 C . ? GLU 700 D PRO 681 C ? PRO 701 D 1 -1.12 9 LYS 718 C . ? LYS 738 D PRO 719 C ? PRO 739 D 1 4.73 10 SER 405 D . ? SER 425 C PRO 406 D ? PRO 426 C 1 -1.64 11 GLU 680 D . ? GLU 700 C PRO 681 D ? PRO 701 C 1 14.07 12 LYS 718 D . ? LYS 738 C PRO 719 D ? PRO 739 C 1 3.82 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 2 ? AA2 ? 2 ? AA3 ? 3 ? AA4 ? 4 ? AA5 ? 2 ? AA6 ? 2 ? AA7 ? 3 ? AA8 ? 2 ? AA9 ? 2 ? AB1 ? 2 ? AB2 ? 2 ? AB3 ? 3 ? AB4 ? 2 ? AB5 ? 2 ? AB6 ? 2 ? AB7 ? 2 ? AB8 ? 3 ? AB9 ? 4 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA4 1 2 ? parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA4 3 4 ? anti-parallel AA5 1 2 ? parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA9 1 2 ? parallel AB1 1 2 ? parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB3 2 3 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB5 1 2 ? parallel AB6 1 2 ? parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB8 2 3 ? anti-parallel AB9 1 2 ? parallel AB9 2 3 ? anti-parallel AB9 3 4 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 VAL A 397 ? THR A 401 ? VAL A 417 THR A 421 AA1 2 TYR A 442 ? ILE A 446 ? TYR A 462 ILE A 466 AA2 1 MET A 409 ? TYR A 410 ? MET A 429 TYR A 430 AA2 2 TYR A 423 ? GLU A 424 ? TYR A 443 GLU A 444 AA3 1 ALA A 477 ? ALA A 479 ? ALA A 497 ALA A 499 AA3 2 GLY A 735 ? PRO A 739 ? GLY A 755 PRO A 759 AA3 3 ILE A 491 ? PHE A 493 ? ILE A 511 PHE A 513 AA4 1 ALA A 648 ? GLY A 650 ? ALA A 668 GLY A 670 AA4 2 PHE A 702 ? GLU A 707 ? PHE A 722 GLU A 727 AA4 3 ILE A 502 ? LYS A 507 ? ILE A 522 LYS A 527 AA4 4 THR A 722 ? VAL A 725 ? THR A 742 VAL A 745 AA5 1 VAL B 397 ? THR B 401 ? VAL B 417 THR B 421 AA5 2 TYR B 442 ? ILE B 446 ? TYR B 462 ILE B 466 AA6 1 MET B 409 ? TYR B 410 ? MET B 429 TYR B 430 AA6 2 TYR B 423 ? GLU B 424 ? TYR B 443 GLU B 444 AA7 1 ALA B 477 ? THR B 482 ? ALA B 497 THR B 502 AA7 2 TYR B 734 ? PRO B 739 ? TYR B 754 PRO B 759 AA7 3 ILE B 491 ? PHE B 493 ? ILE B 511 PHE B 513 AA8 1 ILE B 504 ? LYS B 507 ? ILE B 524 LYS B 527 AA8 2 THR B 722 ? VAL B 725 ? THR B 742 VAL B 745 AA9 1 ALA B 648 ? GLY B 650 ? ALA B 668 GLY B 670 AA9 2 PHE B 702 ? PHE B 704 ? PHE B 722 PHE B 724 AB1 1 VAL C 397 ? THR C 401 ? VAL D 417 THR D 421 AB1 2 TYR C 442 ? ILE C 446 ? TYR D 462 ILE D 466 AB2 1 MET C 409 ? TYR C 410 ? MET D 429 TYR D 430 AB2 2 TYR C 423 ? GLU C 424 ? TYR D 443 GLU D 444 AB3 1 ALA C 477 ? THR C 482 ? ALA D 497 THR D 502 AB3 2 TYR C 734 ? PRO C 739 ? TYR D 754 PRO D 759 AB3 3 ILE C 491 ? PHE C 493 ? ILE D 511 PHE D 513 AB4 1 ILE C 504 ? LYS C 507 ? ILE D 524 LYS D 527 AB4 2 THR C 722 ? VAL C 725 ? THR D 742 VAL D 745 AB5 1 ALA C 648 ? GLY C 650 ? ALA D 668 GLY D 670 AB5 2 PHE C 702 ? PHE C 704 ? PHE D 722 PHE D 724 AB6 1 VAL D 397 ? THR D 401 ? VAL C 417 THR C 421 AB6 2 TYR D 442 ? ILE D 446 ? TYR C 462 ILE C 466 AB7 1 MET D 409 ? TYR D 410 ? MET C 429 TYR C 430 AB7 2 TYR D 423 ? GLU D 424 ? TYR C 443 GLU C 444 AB8 1 ALA D 477 ? ALA D 479 ? ALA C 497 ALA C 499 AB8 2 GLY D 735 ? PRO D 739 ? GLY C 755 PRO C 759 AB8 3 ILE D 491 ? PHE D 493 ? ILE C 511 PHE C 513 AB9 1 ALA D 648 ? GLY D 650 ? ALA C 668 GLY C 670 AB9 2 PHE D 702 ? GLU D 707 ? PHE C 722 GLU C 727 AB9 3 ILE D 502 ? LYS D 507 ? ILE C 522 LYS C 527 AB9 4 THR D 722 ? VAL D 725 ? THR C 742 VAL C 745 # loop_ _pdbx_struct_sheet_hbond.sheet_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_1 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_2 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_seq_id AA1 1 2 N VAL A 397 ? N VAL A 417 O LYS A 443 ? O LYS A 463 AA2 1 2 N MET A 409 ? N MET A 429 O GLU A 424 ? O GLU A 444 AA3 1 2 N ALA A 477 ? N ALA A 497 O ALA A 737 ? O ALA A 757 AA3 2 3 O THR A 738 ? O THR A 758 N ASP A 492 ? N ASP A 512 AA4 1 2 N ALA A 648 ? N ALA A 668 O ALA A 703 ? O ALA A 723 AA4 2 3 O PHE A 704 ? O PHE A 724 N MET A 505 ? N MET A 525 AA4 3 4 N ILE A 506 ? N ILE A 526 O MET A 723 ? O MET A 743 AA5 1 2 N VAL B 397 ? N VAL B 417 O LYS B 443 ? O LYS B 463 AA6 1 2 N MET B 409 ? N MET B 429 O GLU B 424 ? O GLU B 444 AA7 1 2 N LEU B 481 ? N LEU B 501 O GLY B 735 ? O GLY B 755 AA7 2 3 O THR B 738 ? O THR B 758 N ASP B 492 ? N ASP B 512 AA8 1 2 N ILE B 506 ? N ILE B 526 O MET B 723 ? O MET B 743 AA9 1 2 N GLY B 650 ? N GLY B 670 O ALA B 703 ? O ALA B 723 AB1 1 2 N VAL C 397 ? N VAL D 417 O LYS C 443 ? O LYS D 463 AB2 1 2 N MET C 409 ? N MET D 429 O GLU C 424 ? O GLU D 444 AB3 1 2 N LEU C 481 ? N LEU D 501 O GLY C 735 ? O GLY D 755 AB3 2 3 O THR C 738 ? O THR D 758 N ASP C 492 ? N ASP D 512 AB4 1 2 N ILE C 506 ? N ILE D 526 O MET C 723 ? O MET D 743 AB5 1 2 N GLY C 650 ? N GLY D 670 O ALA C 703 ? O ALA D 723 AB6 1 2 N VAL D 397 ? N VAL C 417 O LYS D 443 ? O LYS C 463 AB7 1 2 N MET D 409 ? N MET C 429 O GLU D 424 ? O GLU C 444 AB8 1 2 N ALA D 477 ? N ALA C 497 O ALA D 737 ? O ALA C 757 AB8 2 3 O THR D 738 ? O THR C 758 N ASP D 492 ? N ASP C 512 AB9 1 2 N ALA D 648 ? N ALA C 668 O ALA D 703 ? O ALA C 723 AB9 2 3 O PHE D 704 ? O PHE C 724 N MET D 505 ? N MET C 525 AB9 3 4 N ILE D 506 ? N ILE C 526 O MET D 723 ? O MET C 743 # _pdbx_entry_details.entry_id 9QPW _pdbx_entry_details.nonpolymer_details ? _pdbx_entry_details.sequence_details ? _pdbx_entry_details.compound_details ? _pdbx_entry_details.source_details ? _pdbx_entry_details.has_ligand_of_interest Y _pdbx_entry_details.has_protein_modification Y # loop_ _pdbx_validate_rmsd_angle.id _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_model_num _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_value _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_target_value _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_deviation _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_standard_deviation _pdbx_validate_rmsd_angle.linker_flag 1 1 CA B CYS 611 ? ? 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Manual model building, refinement and validation were performed using Refmac 5 Servalcat followed by model building in Coot and Real Space Refinement in Phenix. ; _em_3d_fitting.overall_b_value ? _em_3d_fitting.ref_space REAL _em_3d_fitting.ref_protocol 'RIGID BODY FIT' # loop_ _em_3d_fitting_list.id _em_3d_fitting_list.3d_fitting_id _em_3d_fitting_list.pdb_entry_id _em_3d_fitting_list.pdb_chain_id _em_3d_fitting_list.pdb_chain_residue_range _em_3d_fitting_list.details _em_3d_fitting_list.chain_id _em_3d_fitting_list.chain_residue_range _em_3d_fitting_list.source_name _em_3d_fitting_list.type _em_3d_fitting_list.accession_code _em_3d_fitting_list.initial_refinement_model_id 1 1 3UA8 ? ? ? ? ? PDB 'experimental model' 3UA8 1 2 1 . . . 'Our TMD region of GluA4:G2restI' ? ? 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