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K ? ? 1 G 129 1 K 437 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.577 ? ? metalc21 metalc ? ? A G 141 OP2 ? ? ? 1_555 N MG . MG ? ? 1 G 136 1 MG 412 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.993 ? ? metalc22 metalc ? ? A G 141 O6 ? ? ? 1_555 NA K . K ? ? 1 G 136 1 K 438 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 3.483 ? ? metalc23 metalc ? ? A G 147 N7 ? ? ? 1_555 U MG . MG ? ? 1 G 142 1 MG 419 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.053 ? ? metalc24 metalc ? ? A C 150 OP2 ? ? ? 1_555 NA K . K ? ? 1 C 145 1 K 438 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.467 ? ? metalc25 metalc ? ? A A 159 OP2 ? ? ? 1_555 S MG . MG ? ? 1 A 154 1 MG 417 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.764 ? ? metalc26 metalc ? ? A G 160 N7 ? ? ? 1_555 S MG . MG ? ? 1 G 155 1 MG 417 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.111 ? ? metalc27 metalc ? ? A A 191 OP2 ? ? ? 1_555 M MG . MG ? ? 1 A 186 1 MG 411 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.295 ? ? metalc28 metalc ? ? A G 199 O6 ? ? ? 1_555 EA K . K ? ? 1 G 194 1 K 429 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 3.205 ? ? metalc29 metalc ? ? A U 239 O4 ? ? ? 1_555 MA K . K ? ? 1 U 234 1 K 437 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 3.396 ? ? metalc30 metalc ? ? A G 244 OP1 ? ? ? 1_555 L MG . MG ? ? 1 G 239 1 MG 410 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.137 ? ? metalc31 metalc ? ? A U 261 O4 ? ? ? 1_555 IA K . K ? ? 1 U 256 1 K 433 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 3.298 ? ? metalc32 metalc ? ? A C 266 "O4'" ? ? ? 1_555 OA K . K ? ? 1 C 261 1 K 439 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.985 ? ? metalc33 metalc ? ? A G 274 OP2 ? ? ? 1_555 JA K . K ? ? 1 G 269 1 K 434 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.484 ? ? metalc34 metalc ? ? A A 288 OP2 ? ? ? 1_555 T MG . MG ? ? 1 A 283 1 MG 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.533 ? ? metalc35 metalc ? ? A U 290 OP1 ? ? ? 1_555 Z MG . MG ? ? 1 U 285 1 MG 424 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.408 ? ? metalc36 metalc ? ? A G 293 O6 ? ? ? 1_555 GA K . K ? ? 1 G 288 1 K 431 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.658 ? ? metalc37 metalc ? ? A G 325 OP2 ? ? ? 1_555 HA K . K ? ? 1 G 320 1 K 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.519 ? ? metalc38 metalc ? ? A C 363 OP1 ? ? ? 1_555 C MG . MG ? ? 1 C 358 1 MG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.962 ? ? metalc39 metalc ? ? A C 363 OP2 ? ? ? 1_555 GA K . K ? ? 1 C 358 1 K 431 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.942 ? ? metalc40 metalc ? ? A G 364 OP2 ? ? ? 1_555 C MG . MG ? ? 1 G 359 1 MG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.286 ? ? metalc41 metalc ? ? A G 364 "O5'" ? ? ? 1_555 GA K . K ? ? 1 G 359 1 K 431 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 3.097 ? ? metalc42 metalc ? ? A C 365 OP1 ? ? ? 1_555 G MG . MG ? ? 1 C 360 1 MG 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.898 ? ? metalc43 metalc ? ? A C 377 OP2 ? ? ? 1_555 K MG . MG ? ? 1 C 372 1 MG 409 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.329 ? ? metalc44 metalc ? ? A G 379 OP2 ? ? ? 1_555 G MG . MG ? ? 1 G 374 1 MG 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.764 ? ? metalc45 metalc ? ? A U 380 OP1 ? ? ? 1_555 W MG . MG ? ? 1 U 375 1 MG 421 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.098 ? ? metalc46 metalc ? ? A U 380 "O3'" ? ? ? 1_555 AA K . K ? ? 1 U 375 1 K 425 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 3.107 ? ? metalc47 metalc ? ? A U 380 "O2'" ? ? ? 1_555 AA K . K ? ? 1 U 375 1 K 425 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 3.460 ? ? metalc48 metalc ? ? A A 381 OP2 ? ? ? 1_555 AA K . K ? ? 1 A 376 1 K 425 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 3.262 ? ? metalc49 metalc ? ? A A 381 OP2 ? ? ? 1_555 FA K . K ? ? 1 A 376 1 K 430 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 3.084 ? ? metalc50 metalc ? ? A C 382 OP1 ? ? ? 1_555 C MG . MG ? ? 1 C 377 1 MG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.577 ? ? metalc51 metalc ? ? A C 382 OP2 ? ? ? 1_555 W MG . MG ? ? 1 C 377 1 MG 421 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.871 ? ? metalc52 metalc ? ? A C 382 OP1 ? ? ? 1_555 GA K . K ? ? 1 C 377 1 K 431 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 3.290 ? ? metalc53 metalc ? ? A C 382 "O5'" ? ? ? 1_555 GA K . K ? ? 1 C 377 1 K 431 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.857 ? ? metalc54 metalc ? ? A C 382 "O4'" ? ? ? 1_555 GA K . K ? ? 1 C 377 1 K 431 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 3.129 ? ? metalc55 metalc ? ? W MG . MG ? ? ? 1_555 B U 6 "O3'" ? ? 1 MG 421 6 U 0 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.854 ? ? hydrog1 hydrog ? ? A G 8 N1 ? ? ? 1_555 A C 266 N3 ? ? 1 G 3 1 C 261 1_555 ? ? ? ? ? ? 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A G 23 O6 ? ? ? 1_555 A C 258 N4 ? ? 1 G 18 1 C 253 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog39 hydrog ? ? A C 24 N3 ? ? ? 1_555 A G 257 N1 ? ? 1 C 19 1 G 252 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog40 hydrog ? ? A C 24 N4 ? ? ? 1_555 A G 257 O6 ? ? 1 C 19 1 G 252 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog41 hydrog ? ? A C 24 O2 ? ? ? 1_555 A G 257 N2 ? ? 1 C 19 1 G 252 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog42 hydrog ? ? A A 25 N1 ? ? ? 1_555 A U 256 N3 ? ? 1 A 20 1 U 251 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog43 hydrog ? ? A A 25 N6 ? ? ? 1_555 A U 256 O4 ? ? 1 A 20 1 U 251 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog44 hydrog ? ? A G 26 N1 ? ? ? 1_555 A C 255 N3 ? ? 1 G 21 1 C 250 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog45 hydrog ? ? A G 26 N2 ? ? ? 1_555 A C 255 O2 ? ? 1 G 21 1 C 250 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog46 hydrog ? ? A G 26 O6 ? ? ? 1_555 A C 255 N4 ? ? 1 G 21 1 C 250 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog47 hydrog ? ? 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RECONSTRUCTION ? 13 1 ? ? ? ? ? # _em_specimen.concentration ? _em_specimen.details ? _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.id 1 _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # loop_ _ndb_struct_conf_na.entry_id _ndb_struct_conf_na.feature 9QTK 'double helix' 9QTK 'a-form double helix' 9QTK 'hairpin loop' 9QTK tetraloop 9QTK 'bulge loop' 9QTK 'mismatched base pair' 9QTK 'internal loop' 9QTK 'triple helix' 9QTK 'quadruple helix' 9QTK 'three-way junction' # loop_ _ndb_struct_na_base_pair.model_number _ndb_struct_na_base_pair.i_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.j_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.shear _ndb_struct_na_base_pair.stretch _ndb_struct_na_base_pair.stagger _ndb_struct_na_base_pair.buckle _ndb_struct_na_base_pair.propeller _ndb_struct_na_base_pair.opening _ndb_struct_na_base_pair.pair_number _ndb_struct_na_base_pair.pair_name _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_28 _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_12 1 A G 8 1_555 A C 266 1_555 -0.277 -0.168 -0.411 -8.294 -8.760 2.489 1 1_G3:C261_1 1 3 ? 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