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? -36.98 133.77 299 1 PRO FB 264 ? ? -92.87 53.21 300 1 ALA GB 32 ? ? -97.05 57.82 301 1 THR GB 192 ? ? 42.98 72.35 302 1 TYR GB 196 ? ? 52.80 76.55 303 1 PRO GB 197 ? ? -37.16 134.75 304 1 PRO GB 264 ? ? -92.29 53.20 305 1 GLU HB 189 ? ? -92.35 50.12 306 1 THR HB 192 ? ? 42.80 71.62 307 1 TYR HB 196 ? ? 53.54 76.89 308 1 PRO HB 197 ? ? -37.59 122.46 309 1 PRO HB 264 ? ? -90.31 54.04 310 1 ILE 11 125 ? ? 54.33 84.79 311 1 ILE 20 125 ? ? 24.09 74.50 # _space_group_symop.id 1 _space_group_symop.operation_xyz x,y,z # _em_3d_fitting.id 1 _em_3d_fitting.entry_id 9SQR _em_3d_fitting.method ? _em_3d_fitting.target_criteria 'Cross-correlation coefficient' _em_3d_fitting.details ? _em_3d_fitting.overall_b_value 33.7 _em_3d_fitting.ref_space REAL _em_3d_fitting.ref_protocol OTHER # _em_3d_fitting_list.id 1 _em_3d_fitting_list.3d_fitting_id 1 _em_3d_fitting_list.pdb_entry_id . _em_3d_fitting_list.pdb_chain_id . _em_3d_fitting_list.pdb_chain_residue_range . _em_3d_fitting_list.details 'model produced in ModelAngelo' _em_3d_fitting_list.chain_id ? _em_3d_fitting_list.chain_residue_range ? _em_3d_fitting_list.source_name Other _em_3d_fitting_list.type 'in silico model' _em_3d_fitting_list.accession_code ? _em_3d_fitting_list.initial_refinement_model_id ? # _em_3d_reconstruction.entry_id 9SQR _em_3d_reconstruction.id 1 _em_3d_reconstruction.method ? _em_3d_reconstruction.algorithm 'FOURIER SPACE' _em_3d_reconstruction.citation_id ? _em_3d_reconstruction.details 'Icosahedral reconstruction with symmetry relaxation by marginalization to reconstruct interior cargo density and encapculin shell.' _em_3d_reconstruction.resolution 3.73 _em_3d_reconstruction.resolution_method 'FSC 0.143 CUT-OFF' _em_3d_reconstruction.magnification_calibration ? _em_3d_reconstruction.nominal_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.actual_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.num_particles 41954 _em_3d_reconstruction.euler_angles_details ? _em_3d_reconstruction.num_class_averages 1 _em_3d_reconstruction.refinement_type ? _em_3d_reconstruction.image_processing_id 1 _em_3d_reconstruction.symmetry_type POINT # _em_buffer.id 1 _em_buffer.specimen_id 1 _em_buffer.name ? _em_buffer.details '150 mM NaCl, 50 mM Tris-HCl, pH 8.0' _em_buffer.pH 8 # loop_ _em_entity_assembly.id _em_entity_assembly.parent_id _em_entity_assembly.source _em_entity_assembly.type _em_entity_assembly.name _em_entity_assembly.details _em_entity_assembly.synonym _em_entity_assembly.oligomeric_details _em_entity_assembly.entity_id_list 1 0 RECOMBINANT COMPLEX 'Rhodospirillum rubrum encapsulin complex' ;Complex of the encapsulin nanocompartment and 4 decamers of the encapsulated ferritin. Ordered targeting peptides from the latter are modelled. ; ? ? '1, 2' 2 1 RECOMBINANT COMPLEX 'Rhodospirillum rubrum encapsulated ferritin' ? ? ? 1 3 2 RECOMBINANT COMPLEX 'Rhodospirillum rubrum encapsulated ferritin localisation peptide' 'Ordered localisation peptide from the encapsulated ferritin' ? ? 2 # _em_imaging.entry_id 9SQR _em_imaging.id 1 _em_imaging.astigmatism ? _em_imaging.electron_beam_tilt_params ? _em_imaging.residual_tilt ? _em_imaging.microscope_model 'TFS GLACIOS' _em_imaging.specimen_holder_type ? _em_imaging.specimen_holder_model 'FEI TITAN KRIOS AUTOGRID HOLDER' _em_imaging.details ? _em_imaging.date ? _em_imaging.accelerating_voltage 200 _em_imaging.illumination_mode 'FLOOD BEAM' _em_imaging.mode 'BRIGHT FIELD' _em_imaging.nominal_cs 2.7 _em_imaging.nominal_defocus_min 600 _em_imaging.nominal_defocus_max 1600 _em_imaging.calibrated_defocus_min ? _em_imaging.calibrated_defocus_max ? _em_imaging.tilt_angle_min ? _em_imaging.tilt_angle_max ? _em_imaging.nominal_magnification ? _em_imaging.calibrated_magnification ? _em_imaging.electron_source 'FIELD EMISSION GUN' _em_imaging.citation_id ? _em_imaging.temperature ? _em_imaging.detector_distance ? _em_imaging.recording_temperature_minimum 80 _em_imaging.recording_temperature_maximum ? _em_imaging.alignment_procedure 'COMA FREE' _em_imaging.c2_aperture_diameter ? _em_imaging.specimen_id 1 _em_imaging.cryogen NITROGEN _em_imaging.objective_aperture ? _em_imaging.microscope_serial_number ? _em_imaging.microscope_version ? # _em_sample_support.id 1 _em_sample_support.film_material ? _em_sample_support.method ? _em_sample_support.grid_material COPPER _em_sample_support.grid_mesh_size ? _em_sample_support.grid_type Quantifoil _em_sample_support.details ? _em_sample_support.specimen_id 1 _em_sample_support.citation_id ? # _em_vitrification.entry_id 9SQR _em_vitrification.id 1 _em_vitrification.specimen_id 1 _em_vitrification.cryogen_name ETHANE _em_vitrification.humidity 100 _em_vitrification.temp ? _em_vitrification.chamber_temperature 281 _em_vitrification.instrument 'FEI VITROBOT MARK IV' _em_vitrification.method ? _em_vitrification.time_resolved_state ? _em_vitrification.citation_id ? _em_vitrification.details ;4 uL of sample was applied to the grids, which were then blotted 100% humidity blot force 5 wait time 10 s blot time 3 seconds ; # _em_experiment.entry_id 9SQR _em_experiment.id 1 _em_experiment.reconstruction_method 'SINGLE PARTICLE' _em_experiment.aggregation_state PARTICLE _em_experiment.entity_assembly_id 1 # _em_single_particle_entity.entry_id 9SQR _em_single_particle_entity.id 1 _em_single_particle_entity.image_processing_id 1 _em_single_particle_entity.point_symmetry I # loop_ _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_model_num _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.polymer_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.occupancy_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_ins_code _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_seq_id 1 1 Y 1 A0 ALA 59 ? A ALA 59 2 1 Y 1 A0 GLU 60 ? A GLU 60 3 1 Y 1 A0 GLU 61 ? A GLU 61 4 1 Y 1 A0 PRO 62 ? A PRO 62 5 1 Y 1 A0 LYS 63 ? A LYS 63 6 1 Y 1 A0 ALA 64 ? A ALA 64 7 1 Y 1 A0 ALA 65 ? A ALA 65 8 1 Y 1 A0 GLY 66 ? A GLY 66 9 1 Y 1 A0 SER 67 ? A SER 67 10 1 Y 1 A0 ALA 68 ? A ALA 68 11 1 Y 1 A0 LEU 273 ? A LEU 273 12 1 Y 1 A0 SER 274 ? A SER 274 13 1 Y 1 A0 GLN 275 ? A GLN 275 14 1 Y 1 A0 ALA 276 ? A ALA 276 15 1 Y 1 A0 ALA 277 ? A ALA 277 16 1 Y 1 A0 THR 278 ? A THR 278 17 1 Y 1 A0 LYS 279 ? A LYS 279 18 1 Y 1 A0 ALA 280 ? A ALA 280 19 1 Y 1 A ALA 59 ? B ALA 59 20 1 Y 1 A GLU 60 ? B GLU 60 21 1 Y 1 A GLU 61 ? B GLU 61 22 1 Y 1 A PRO 62 ? B PRO 62 23 1 Y 1 A LYS 63 ? B LYS 63 24 1 Y 1 A ALA 64 ? B ALA 64 25 1 Y 1 A ALA 65 ? B ALA 65 26 1 Y 1 A GLY 66 ? B GLY 66 27 1 Y 1 A SER 67 ? B SER 67 28 1 Y 1 A ALA 68 ? B ALA 68 29 1 Y 1 A LEU 273 ? B LEU 273 30 1 Y 1 A SER 274 ? B SER 274 31 1 Y 1 A GLN 275 ? B GLN 275 32 1 Y 1 A ALA 276 ? B ALA 276 33 1 Y 1 A ALA 277 ? B ALA 277 34 1 Y 1 A THR 278 ? B THR 278 35 1 Y 1 A LYS 279 ? B LYS 279 36 1 Y 1 A ALA 280 ? B ALA 280 37 1 Y 1 B ALA 59 ? C ALA 59 38 1 Y 1 B GLU 60 ? C GLU 60 39 1 Y 1 B GLU 61 ? C GLU 61 40 1 Y 1 B PRO 62 ? C PRO 62 41 1 Y 1 B LYS 63 ? C LYS 63 42 1 Y 1 B ALA 64 ? C ALA 64 43 1 Y 1 B ALA 65 ? C ALA 65 44 1 Y 1 B GLY 66 ? C GLY 66 45 1 Y 1 B SER 67 ? C SER 67 46 1 Y 1 B ALA 68 ? C ALA 68 47 1 Y 1 B LEU 273 ? C LEU 273 48 1 Y 1 B SER 274 ? C SER 274 49 1 Y 1 B GLN 275 ? C GLN 275 50 1 Y 1 B ALA 276 ? C ALA 276 51 1 Y 1 B ALA 277 ? C ALA 277 52 1 Y 1 B THR 278 ? C THR 278 53 1 Y 1 B LYS 279 ? C LYS 279 54 1 Y 1 B ALA 280 ? C ALA 280 55 1 Y 1 C ALA 59 ? D ALA 59 56 1 Y 1 C GLU 60 ? D GLU 60 57 1 Y 1 C GLU 61 ? D GLU 61 58 1 Y 1 C PRO 62 ? D PRO 62 59 1 Y 1 C LYS 63 ? D LYS 63 60 1 Y 1 C ALA 64 ? D ALA 64 61 1 Y 1 C ALA 65 ? D ALA 65 62 1 Y 1 C GLY 66 ? D GLY 66 63 1 Y 1 C SER 67 ? D SER 67 64 1 Y 1 C ALA 68 ? D ALA 68 65 1 Y 1 C LEU 273 ? D LEU 273 66 1 Y 1 C SER 274 ? D SER 274 67 1 Y 1 C GLN 275 ? D GLN 275 68 1 Y 1 C ALA 276 ? D ALA 276 69 1 Y 1 C ALA 277 ? D ALA 277 70 1 Y 1 C THR 278 ? D THR 278 71 1 Y 1 C LYS 279 ? D LYS 279 72 1 Y 1 C ALA 280 ? D ALA 280 73 1 Y 1 D ALA 59 ? E ALA 59 74 1 Y 1 D GLU 60 ? E GLU 60 75 1 Y 1 D GLU 61 ? E GLU 61 76 1 Y 1 D PRO 62 ? E PRO 62 77 1 Y 1 D LYS 63 ? E LYS 63 78 1 Y 1 D ALA 64 ? E ALA 64 79 1 Y 1 D ALA 65 ? E ALA 65 80 1 Y 1 D GLY 66 ? E GLY 66 81 1 Y 1 D SER 67 ? E SER 67 82 1 Y 1 D ALA 68 ? E ALA 68 83 1 Y 1 D LEU 273 ? E LEU 273 84 1 Y 1 D SER 274 ? E SER 274 85 1 Y 1 D GLN 275 ? E GLN 275 86 1 Y 1 D ALA 276 ? E ALA 276 87 1 Y 1 D ALA 277 ? E ALA 277 88 1 Y 1 D THR 278 ? E THR 278 89 1 Y 1 D LYS 279 ? E LYS 279 90 1 Y 1 D ALA 280 ? E ALA 280 91 1 Y 1 E ALA 59 ? F ALA 59 92 1 Y 1 E GLU 60 ? F GLU 60 93 1 Y 1 E GLU 61 ? F GLU 61 94 1 Y 1 E PRO 62 ? F PRO 62 95 1 Y 1 E LYS 63 ? F LYS 63 96 1 Y 1 E ALA 64 ? F ALA 64 97 1 Y 1 E ALA 65 ? F ALA 65 98 1 Y 1 E GLY 66 ? F GLY 66 99 1 Y 1 E SER 67 ? F SER 67 100 1 Y 1 E ALA 68 ? F ALA 68 101 1 Y 1 E LEU 273 ? F LEU 273 102 1 Y 1 E SER 274 ? F SER 274 103 1 Y 1 E GLN 275 ? F GLN 275 104 1 Y 1 E ALA 276 ? F ALA 276 105 1 Y 1 E ALA 277 ? F ALA 277 106 1 Y 1 E THR 278 ? F THR 278 107 1 Y 1 E LYS 279 ? F LYS 279 108 1 Y 1 E ALA 280 ? F ALA 280 109 1 Y 1 F ALA 59 ? G ALA 59 110 1 Y 1 F GLU 60 ? G GLU 60 111 1 Y 1 F GLU 61 ? G GLU 61 112 1 Y 1 F PRO 62 ? G PRO 62 113 1 Y 1 F LYS 63 ? G LYS 63 114 1 Y 1 F ALA 64 ? G ALA 64 115 1 Y 1 F ALA 65 ? G ALA 65 116 1 Y 1 F GLY 66 ? G GLY 66 117 1 Y 1 F SER 67 ? G SER 67 118 1 Y 1 F ALA 68 ? G ALA 68 119 1 Y 1 F LEU 273 ? G LEU 273 120 1 Y 1 F SER 274 ? G SER 274 121 1 Y 1 F GLN 275 ? G GLN 275 122 1 Y 1 F ALA 276 ? G ALA 276 123 1 Y 1 F ALA 277 ? G ALA 277 124 1 Y 1 F THR 278 ? G THR 278 125 1 Y 1 F LYS 279 ? G LYS 279 126 1 Y 1 F ALA 280 ? G ALA 280 127 1 Y 1 G ALA 59 ? H ALA 59 128 1 Y 1 G GLU 60 ? H GLU 60 129 1 Y 1 G GLU 61 ? H GLU 61 130 1 Y 1 G PRO 62 ? H PRO 62 131 1 Y 1 G LYS 63 ? H LYS 63 132 1 Y 1 G ALA 64 ? 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