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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.000 0.016 20508 ? r_bond_other_d ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 1.537 1.638 28395 ? r_angle_refined_deg ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.471 1.572 47303 ? r_angle_other_deg ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 5.681 5.000 2494 ? r_dihedral_angle_1_deg ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 7.863 5.000 421 ? r_dihedral_angle_2_deg ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 14.876 10.000 3991 ? r_dihedral_angle_3_deg ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 16.827 10.000 995 ? r_dihedral_angle_6_deg ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.073 0.200 3266 ? r_chiral_restr ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.073 0.200 1 ? r_chiral_restr_other ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.006 0.020 23701 ? r_gen_planes_refined ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.001 0.020 4633 ? r_gen_planes_other ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.206 0.200 3719 ? r_nbd_refined ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.181 0.200 15900 ? r_symmetry_nbd_other ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.167 0.200 10016 ? r_nbtor_refined ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.071 0.200 11092 ? r_symmetry_nbtor_other ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.111 0.200 143 ? r_xyhbond_nbd_refined ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 6.264 8.937 10084 ? r_mcbond_it ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 6.262 8.937 10084 ? r_mcbond_other ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 10.437 16.053 12542 ? r_mcangle_it ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 10.437 16.055 12543 ? r_mcangle_other ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 7.886 10.150 10935 ? r_scbond_it ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 7.885 10.151 10936 ? r_scbond_other ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 13.657 18.131 15853 ? r_scangle_it ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 13.657 18.132 15854 ? r_scangle_other ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 22.570 105.717 77010 ? r_lrange_it ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 22.569 105.718 77011 ? r_lrange_other ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.241 0.050 3688 ? r_ncsr_local_group_1 ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.208 0.050 4133 ? r_ncsr_local_group_2 ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.235 0.050 3694 ? r_ncsr_local_group_3 ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.199 0.050 15078 ? r_ncsr_local_group_4 ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.197 0.050 3871 ? r_ncsr_local_group_5 ? ? ? # loop_ _refine_ls_restr_ncs.pdbx_refine_id _refine_ls_restr_ncs.dom_id _refine_ls_restr_ncs.ncs_model_details _refine_ls_restr_ncs.rms_dev_B_iso _refine_ls_restr_ncs.rms_dev_position _refine_ls_restr_ncs.weight_B_iso _refine_ls_restr_ncs.weight_position _refine_ls_restr_ncs.pdbx_ordinal _refine_ls_restr_ncs.pdbx_type _refine_ls_restr_ncs.pdbx_asym_id _refine_ls_restr_ncs.pdbx_auth_asym_id _refine_ls_restr_ncs.pdbx_number _refine_ls_restr_ncs.pdbx_rms _refine_ls_restr_ncs.pdbx_weight _refine_ls_restr_ncs.pdbx_ens_id 'ELECTRON MICROSCOPY' 1 ? ? 0.24053 ? 0.05003 1 'Local ncs' ? F ? ? ? 1 'ELECTRON MICROSCOPY' 2 ? ? 0.24053 ? 0.05003 2 'Local ncs' ? F ? ? ? 1 'ELECTRON MICROSCOPY' 3 ? ? 0.20763 ? 0.05004 3 'Local ncs' ? F ? ? ? 2 'ELECTRON MICROSCOPY' 4 ? ? 0.20763 ? 0.05004 4 'Local ncs' ? F ? ? ? 2 'ELECTRON MICROSCOPY' 5 ? ? 0.23469 ? 0.05004 5 'Local ncs' ? F ? ? ? 3 'ELECTRON MICROSCOPY' 6 ? ? 0.23469 ? 0.05004 6 'Local ncs' ? F ? ? ? 3 'ELECTRON MICROSCOPY' 7 ? ? 0.19892 ? 0.05004 7 'Local ncs' ? F ? ? ? 4 'ELECTRON MICROSCOPY' 8 ? ? 0.19892 ? 0.05004 8 'Local ncs' ? F ? ? ? 4 'ELECTRON MICROSCOPY' 9 ? ? 0.19706 ? 0.05004 9 'Local ncs' ? F ? ? ? 5 'ELECTRON MICROSCOPY' 10 ? ? 0.19706 ? 0.05004 10 'Local ncs' ? F ? ? ? 5 # loop_ _refine_ls_shell.pdbx_refine_id _refine_ls_shell.d_res_high _refine_ls_shell.d_res_low _refine_ls_shell.number_reflns_all _refine_ls_shell.number_reflns_obs _refine_ls_shell.number_reflns_R_free _refine_ls_shell.number_reflns_R_work _refine_ls_shell.percent_reflns_obs _refine_ls_shell.percent_reflns_R_free _refine_ls_shell.R_factor_all _refine_ls_shell.R_factor_obs _refine_ls_shell.R_factor_R_free_error _refine_ls_shell.R_factor_R_work _refine_ls_shell.redundancy_reflns_all _refine_ls_shell.redundancy_reflns_obs _refine_ls_shell.wR_factor_all _refine_ls_shell.wR_factor_obs _refine_ls_shell.wR_factor_R_free _refine_ls_shell.wR_factor_R_work _refine_ls_shell.pdbx_R_complete _refine_ls_shell.correlation_coeff_Fo_to_Fc _refine_ls_shell.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free _refine_ls_shell.correlation_coeff_I_to_Fcsqd_work _refine_ls_shell.correlation_coeff_I_to_Fcsqd_free _refine_ls_shell.pdbx_total_number_of_bins_used _refine_ls_shell.pdbx_phase_error _refine_ls_shell.pdbx_fsc_work _refine_ls_shell.pdbx_fsc_free _refine_ls_shell.R_factor_R_free 'ELECTRON MICROSCOPY' 2.600 2.668 38683 . 0 38683 100.0000 . 0.759 . . 0.759 . . . . . 0.759 . . . . . 20 . 0.520 . . 'ELECTRON MICROSCOPY' 2.668 2.741 37860 . 0 37860 100.0000 . 0.543 . . 0.543 . . . . . 0.543 . . . . . 20 . 0.620 . . 'ELECTRON MICROSCOPY' 2.741 2.820 36629 . 0 36629 100.0000 . 0.507 . . 0.507 . . . . . 0.507 . . . . . 20 . 0.666 . . 'ELECTRON MICROSCOPY' 2.820 2.907 35647 . 0 35647 100.0000 . 0.462 . . 0.462 . . . . . 0.462 . . . . . 20 . 0.716 . . 'ELECTRON MICROSCOPY' 2.907 3.002 34427 . 0 34427 100.0000 . 0.423 . . 0.423 . . . . . 0.423 . . . . . 20 . 0.765 . . 'ELECTRON MICROSCOPY' 3.002 3.107 33531 . 0 33531 100.0000 . 0.376 . . 0.376 . . . . . 0.376 . . . . . 20 . 0.808 . . 'ELECTRON MICROSCOPY' 3.107 3.225 32194 . 0 32194 100.0000 . 0.325 . . 0.325 . . . . . 0.325 . . . . . 20 . 0.850 . . 'ELECTRON MICROSCOPY' 3.225 3.356 31057 . 0 31057 100.0000 . 0.287 . . 0.287 . . . . . 0.287 . . . . . 20 . 0.884 . . 'ELECTRON MICROSCOPY' 3.356 3.506 29705 . 0 29705 100.0000 . 0.265 . . 0.265 . . . . . 0.265 . . . . . 20 . 0.907 . . 'ELECTRON MICROSCOPY' 3.506 3.677 28438 . 0 28438 100.0000 . 0.255 . . 0.255 . . . . . 0.255 . . . . . 20 . 0.924 . . 'ELECTRON MICROSCOPY' 3.677 3.875 27022 . 0 27022 100.0000 . 0.251 . . 0.251 . . . . . 0.251 . . . . . 20 . 0.937 . . 'ELECTRON MICROSCOPY' 3.875 4.110 25570 . 0 25570 100.0000 . 0.256 . . 0.256 . . . . . 0.256 . . . . . 20 . 0.944 . . 'ELECTRON MICROSCOPY' 4.110 4.394 24075 . 0 24075 100.0000 . 0.267 . . 0.267 . . . . . 0.267 . . . . . 20 . 0.947 . . 'ELECTRON MICROSCOPY' 4.394 4.746 22396 . 0 22396 100.0000 . 0.269 . . 0.269 . . . . . 0.269 . . . . . 20 . 0.949 . . 'ELECTRON MICROSCOPY' 4.746 5.199 20494 . 0 20494 100.0000 . 0.251 . . 0.251 . . . . . 0.251 . . . . . 20 . 0.946 . . 'ELECTRON MICROSCOPY' 5.199 5.812 18614 . 0 18614 100.0000 . 0.250 . . 0.250 . . . . . 0.250 . . . . . 20 . 0.920 . . 'ELECTRON MICROSCOPY' 5.812 6.710 16378 . 0 16378 100.0000 . 0.327 . . 0.327 . . . . . 0.327 . . . . . 20 . 0.869 . . 'ELECTRON MICROSCOPY' 6.710 8.215 13853 . 0 13853 100.0000 . 0.355 . . 0.355 . . . . . 0.355 . . . . . 20 . 0.859 . . 'ELECTRON MICROSCOPY' 8.215 11.607 10720 . 0 10720 100.0000 . 0.270 . . 0.270 . . . . . 0.270 . . . . . 20 . 0.913 . . 'ELECTRON MICROSCOPY' 11.607 191.000 5873 . 0 5873 100.0000 . 0.603 . . 0.603 . . . . . 0.603 . . . . . 20 . 0.956 . . # loop_ _struct_ncs_dom.id _struct_ncs_dom.pdbx_ens_id _struct_ncs_dom.details 1 1 F 2 1 F 3 2 F 4 2 F 5 3 F 6 3 F 7 4 F 8 4 F 9 5 F 10 5 F # loop_ _struct_ncs_dom_lim.pdbx_ens_id _struct_ncs_dom_lim.dom_id _struct_ncs_dom_lim.pdbx_component_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_comp_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_seq_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_alt_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_asym_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_comp_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_seq_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_alt_id _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_asym_id _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_seq_id _struct_ncs_dom_lim.end_auth_asym_id _struct_ncs_dom_lim.end_auth_comp_id _struct_ncs_dom_lim.end_auth_seq_id _struct_ncs_dom_lim.pdbx_refine_code _struct_ncs_dom_lim.selection_details 1 1 1 F GLN 187 . F LYS 354 . D GLN 187 D LYS 354 1 ? 1 2 1 F GLN 187 . F LYS 354 . D GLN 187 D LYS 354 1 ? 2 3 2 F GLN 187 . F LYS 354 . D GLN 187 D LYS 354 1 ? 2 4 2 F GLN 187 . F LYS 354 . D GLN 187 D LYS 354 1 ? 3 5 3 F GLN 187 . F LYS 354 . D GLN 187 D LYS 354 1 ? 3 6 3 F GLN 187 . F LYS 354 . D GLN 187 D LYS 354 1 ? 4 7 4 F GLN 19 . F ASP 694 . D GLN 19 D ASP 694 1 ? 4 8 4 F GLN 19 . F ASP 694 . D GLN 19 D ASP 694 1 ? 5 9 5 F GLN 187 . F LYS 354 . D GLN 187 D LYS 354 1 ? 5 10 5 F GLN 187 . F LYS 354 . D GLN 187 D LYS 354 1 ? # loop_ _struct_ncs_ens.id _struct_ncs_ens.details 1 'Local NCS retraints between domains: 1 2' 2 'Local NCS retraints between domains: 3 4' 3 'Local NCS retraints between domains: 5 6' 4 'Local NCS retraints between domains: 7 8' 5 'Local NCS retraints between domains: 9 10' # _struct.entry_id 9T25 _struct.title 'yeast core m6A Methyltransferase Complex (ycMTC)' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 9T25 _struct_keywords.text 'Methyltransferase complex, m6A writer, mRNA processing, RNA modifications, RNA BINDING PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'RNA BINDING PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? F N N 5 ? G N N 1 ? H N N 1 ? I N N 1 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP FL2D_YEAST P38236 ? 1 ;MNYMAYDYDPQHSLETSFNNLAFHPHQQSQQQALYESGERNDARPGLMNTLGQASKMNNSMLPQGSSASPLTGQHSLNST TNFNMPPSMNTYNYQNVPQASMRNTLNHNNIMNGATANDYWLDPMNNMTNNKDTNGNPNDSMSSMSNMTAKTSINSTAFK NSFVPFNHVTALSMNNVNSNEMNSNKDDRMEALEVELQIKESQIESLENEIQRLKKIFNEGLNYKQNEHKYEKENCHIPQ TFELPASLEVIFRKLSSSLHAKEKELAETKENLESILTALALNPTNSVTKYGRYDAESIAHKMVVRLENLTNENKEMAKM LAYGRSKETQIELQLAKKENLELREKIASLEAHLASKESSKEDVAN ; 1 2 UNP ZC3HD_YEAST P40167 ? 2 ;MMNKVDQIIGYKKYEVKLPKDRQVKKNKSKGGNVDQIDTKREKDKMRAFGEERKKFLDKMAKNKKKNTSRKDREKPKEVE KENYKREDKRLKEQKKLSLAKEFRFKEPNSEAINQNTAAENGKPKPQTGLDFDIDHQTVSKIMIDQAIQTSSPLNVQLTE LFNDNVLDVSKDSQFVLQDMEFTSWERRWSNCSTTSNATTVSSVPDPKYNINYNDITSFNSVALITEDLNISASSNGLHE RGKKLLQQEMEYSNKVKNVTIGLERLCMDEKPVPDAGITMQQASRWSEFPTCCDQAAI ; 1 3 UNP MTA70_YEAST P41833 ? 3 ;MINDKLVHFLIQNYDDILRAPLSGQLKDVYSLYISGGYDDEMQKLRNDKDEVLQFEQFWNDLQDIIFATPQSIQFDQNLL VADRPEKIVYLDVFSLKILYNKFHAFYYTLKSSSSSCEEKVSSLTTKPEADSEKDQLLGRLLGVLNWDVNVSNQGLPREQ LSNRLQNLLREKPSSFQLAKERAKYTTEVIEYIPICSDYSHASLLSTSVYIVNNKIVSLQWSKISACQENHPGLIECIQS KIHFIPNIKPQTDISLGDCSYLDTCHKLNTCRYIHYLQYIPSCLQERADRETASENKRIRSNVSIPFYTLGNCSAHCIKK ALPAQWIRCDVRKFDFRVLGKFSVVIADPAWNIHMNLPYGTCNDIELLGLPLHELQDEGIIFLWVTGRAIELGKESLNNW GYNVINEVSWIKTNQLGRTIVTGRTGHWLNHSKEHLLVGLKGNPKWINKHIDVDLIVSMTRETSRKPDELYGIAERLAGT HARKLEIFGRDHNTRPGWFTIGNQLTGNCIYEMDVERKYQEFMKSKTGTSHTGTKKIDKKQPSKLQQQHQQQYWNNMDMG SGKYYAEAKQNPMNQKHTPFESKQQQKQQFQTLNNLYFAQ ; 1 4 UNP MET14_YEAST P25583 ? 4 ;MAFQDPTYDQNKSRHINNSHLQGPNQETIEMKSKHVSFKPSRDFHTNDYSNNYIHGKSLPQQHVTNIENRVDGYPKLQKL FQAKAKQINQFATTPFGCKIGIDSIVPTLNHWIQNENLTFDVVMIGCLTENQFIYPILTQLPLDRLISKPGFLFIWANSQ KINELTKLLNNEIWAKKFRRSEELVFVPIDKKSPFYPGLDQDDETLMEKMQWHCWMCITGTVRRSTDGHLIHCNVDTDLS IETKDTTNGAVPSHLYRIAENFSTATRRLHIIPARTGYETPVKVRPGWVIVSPDVMLDNFSPKRYKEEIANLGSNIPLKN EIELLRPRSPVQKAQ ; 1 5 UNP VIR_YEAST P53185 ? 5 ;MQKCAGHAPLVTAASRVSQDTVDALLQAILKAYHKLASIDSHINDPVEIAFKLINSFKYLPISGSSVKDFESELRELDVF SPLLQSAVTAANNSNIIWDLIAVLFAYISIHKQLHPLILHNLNIWKDFMADNDEETATTTDGDSMNFGVLSLLSIVQNFE EITPNLFEFLKLGLRSTLLKIWVAQWQRYDPSATNLINGDEKISSWITKDYQVDFFIITSLASTSSLEVLPSHYFVYKIS KRISHFPNLIDPKLYRSAISTIMENGISDNGGGENSSDKIDPTDLSFHLQVLMEVIDHPELNYLQENRLILLLDIALNYL ILVPTHCLHSNFGELGSTQSLASTLNIIQFLLSKFLINMGSISQLINQYNRKCITTNNINNNNINNNGVINGSTNTTSTT TTTITNNNNNSNNSSISNNNRKIDWTQSYQTRYQIPYWFEDSILPPIPPISKSLFTFDKNLDHESDSIMIVNDVLRCLNL TILLISKLLRDYDDLKINPLIQSSDDHSNEDNHVIIEQYMQLYLVPLFTSLLLAQQLKDRGQERDEGHKEKEENINLIGS SSVKKLFSQLIFFSSLKLCENLVIKEKNLALYHLIKFATKVSLDDLILQKISINLLNHLFFHQIRDGSDDDNLIKKLCLK NQLSFQALKDYITLWNDGSEVYNAFYKELFYEEQPKIKPIKLTTSDLLKLFPEDVQFVISTPPNTITSASTSDNCTSSQS AAQKNIENFTTLSKYDVYSSTSFIPSTSKNTNTNVSKQQQQPQNSTPCSSNRFLFNKSSLISQESNGSNNNSGTQGPGSM NESYSLDNSFNTTNTNMTRQPTTLTRATDAMTTAPTTPIPYKNTSGSSNNNLWIESPMTNFKGSTISKSTNKSKMVNTGK NYILGGHNKVKNNSRAQSIHIDDFENENN ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 9T25 F 1 ? 366 ? 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