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C . n C 1 1261 PHE 1261 1286 ? ? ? C . n C 1 1262 GLU 1262 1287 ? ? ? C . n C 1 1263 LYS 1263 1288 ? ? ? C . n # loop_ _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.hetero D 2 NAG 1 D NAG 1 A NAG 1232 n D 2 NAG 2 D NAG 2 A NAG 1233 n E 3 NAG 1 E NAG 1 A NAG 1239 n E 3 NAG 2 E NAG 2 A NAG 1240 n E 3 BMA 3 E BMA 3 A BMA 1241 n F 2 NAG 1 F NAG 1 A NAG 1245 n F 2 NAG 2 F NAG 2 A NAG 1246 n G 2 NAG 1 G NAG 1 B NAG 1232 n G 2 NAG 2 G NAG 2 B NAG 1233 n H 3 NAG 1 H NAG 1 B NAG 1239 n H 3 NAG 2 H NAG 2 B NAG 1240 n H 3 BMA 3 H BMA 3 B BMA 1241 n I 2 NAG 1 I NAG 1 B NAG 1245 n I 2 NAG 2 I NAG 2 B NAG 1246 n J 2 NAG 1 J NAG 1 C NAG 1232 n J 2 NAG 2 J NAG 2 C NAG 1233 n K 3 NAG 1 K NAG 1 C NAG 1239 n K 3 NAG 2 K NAG 2 C NAG 1240 n K 3 BMA 3 K BMA 3 C BMA 1241 n L 2 NAG 1 L NAG 1 C NAG 1245 n L 2 NAG 2 L NAG 2 C NAG 1246 n # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code M 4 NAG 1 1301 1226 NAG NAG A . 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_em_3d_fitting.details 'The 3.9Angstrom map was used for model building and refinement.' _em_3d_fitting.overall_b_value ? _em_3d_fitting.ref_space REAL _em_3d_fitting.ref_protocol 'AB INITIO MODEL' # _em_3d_fitting_list.id 1 _em_3d_fitting_list.3d_fitting_id 1 _em_3d_fitting_list.pdb_entry_id . _em_3d_fitting_list.pdb_chain_id . _em_3d_fitting_list.pdb_chain_residue_range . _em_3d_fitting_list.details ? _em_3d_fitting_list.chain_id ? _em_3d_fitting_list.chain_residue_range ? _em_3d_fitting_list.source_name SwissModel _em_3d_fitting_list.type 'in silico model' _em_3d_fitting_list.accession_code ? _em_3d_fitting_list.initial_refinement_model_id ? # _em_3d_reconstruction.entry_id 9TMF _em_3d_reconstruction.id 1 _em_3d_reconstruction.method ? _em_3d_reconstruction.algorithm 'BACK PROJECTION' _em_3d_reconstruction.citation_id ? _em_3d_reconstruction.details ;The estimated GS-FSC map resolution was 3.4Angstrom, but that the map was manually low-pass filtered to 3.9Angstrom during postprocessing in Relion/4.0, to achieve more uniform distribution of map features. ; _em_3d_reconstruction.resolution 3.90 _em_3d_reconstruction.resolution_method 'FSC 0.143 CUT-OFF' _em_3d_reconstruction.magnification_calibration ? _em_3d_reconstruction.nominal_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.actual_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.num_particles 37658 _em_3d_reconstruction.euler_angles_details ? _em_3d_reconstruction.num_class_averages 1 _em_3d_reconstruction.refinement_type ? _em_3d_reconstruction.image_processing_id 1 _em_3d_reconstruction.symmetry_type POINT # _em_buffer.id 1 _em_buffer.specimen_id 1 _em_buffer.name ? _em_buffer.details TBS _em_buffer.pH 7.4 # _em_entity_assembly.id 1 _em_entity_assembly.parent_id 0 _em_entity_assembly.source RECOMBINANT _em_entity_assembly.type VIRUS _em_entity_assembly.name 'Severe acute respiratory syndrome coronavirus' _em_entity_assembly.details ? _em_entity_assembly.synonym ? _em_entity_assembly.oligomeric_details ? _em_entity_assembly.entity_id_list 1 # _em_imaging.entry_id 9TMF _em_imaging.id 1 _em_imaging.astigmatism ? _em_imaging.electron_beam_tilt_params ? _em_imaging.residual_tilt ? _em_imaging.microscope_model 'TFS GLACIOS' _em_imaging.specimen_holder_type ? 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A GLN 384 68 1 Y 1 A ILE 410 ? A ILE 385 69 1 Y 1 A ALA 411 ? A ALA 386 70 1 Y 1 A PRO 412 ? A PRO 387 71 1 Y 1 A GLY 413 ? A GLY 388 72 1 Y 1 A GLN 414 ? A GLN 389 73 1 Y 1 A THR 415 ? A THR 390 74 1 Y 1 A GLY 416 ? A GLY 391 75 1 Y 1 A THR 417 ? A THR 392 76 1 Y 1 A ILE 418 ? A ILE 393 77 1 Y 1 A ALA 419 ? A ALA 394 78 1 Y 1 A ASP 420 ? A ASP 395 79 1 Y 1 A TYR 421 ? A TYR 396 80 1 Y 1 A ASN 422 ? A ASN 397 81 1 Y 1 A ASN 437 ? A ASN 412 82 1 Y 1 A SER 438 ? A SER 413 83 1 Y 1 A ASN 439 ? A ASN 414 84 1 Y 1 A LYS 440 ? A LYS 415 85 1 Y 1 A LEU 441 ? A LEU 416 86 1 Y 1 A ASP 442 ? A ASP 417 87 1 Y 1 A SER 443 ? A SER 418 88 1 Y 1 A ASN 444 ? A ASN 419 89 1 Y 1 A GLY 445 ? A GLY 420 90 1 Y 1 A GLY 446 ? A GLY 421 91 1 Y 1 A GLY 447 ? A GLY 422 92 1 Y 1 A ASN 448 ? A ASN 423 93 1 Y 1 A TYR 449 ? A TYR 424 94 1 Y 1 A ASN 450 ? A ASN 425 95 1 Y 1 A TYR 451 ? A TYR 426 96 1 Y 1 A MET 452 ? A MET 427 97 1 Y 1 A TYR 453 ? A TYR 428 98 1 Y 1 A ARG 454 ? A ARG 429 99 1 Y 1 A LEU 455 ? A LEU 430 100 1 Y 1 A PHE 456 ? A PHE 431 101 1 Y 1 A ARG 457 ? A ARG 432 102 1 Y 1 A LYS 458 ? A LYS 433 103 1 Y 1 A SER 459 ? A SER 434 104 1 Y 1 A LYS 460 ? A LYS 435 105 1 Y 1 A LEU 461 ? A LEU 436 106 1 Y 1 A LYS 462 ? A LYS 437 107 1 Y 1 A PRO 463 ? A PRO 438 108 1 Y 1 A PHE 464 ? A PHE 439 109 1 Y 1 A GLU 465 ? A GLU 440 110 1 Y 1 A ARG 466 ? A ARG 441 111 1 Y 1 A ASP 467 ? A ASP 442 112 1 Y 1 A ILE 468 ? A ILE 443 113 1 Y 1 A SER 469 ? A SER 444 114 1 Y 1 A THR 470 ? A THR 445 115 1 Y 1 A GLU 471 ? A GLU 446 116 1 Y 1 A ILE 472 ? A ILE 447 117 1 Y 1 A TYR 473 ? A TYR 448 118 1 Y 1 A GLN 474 ? A GLN 449 119 1 Y 1 A ALA 475 ? A ALA 450 120 1 Y 1 A GLY 476 ? A GLY 451 121 1 Y 1 A ASN 477 ? A ASN 452 122 1 Y 1 A THR 478 ? A THR 453 123 1 Y 1 A PRO 479 ? A PRO 454 124 1 Y 1 A CYS 480 ? A CYS 455 125 1 Y 1 A LYS 481 ? A LYS 456 126 1 Y 1 A GLY 482 ? A GLY 457 127 1 Y 1 A VAL 483 ? A VAL 458 128 1 Y 1 A ALA 484 ? A ALA 459 129 1 Y 1 A GLY 485 ? A GLY 460 130 1 Y 1 A PHE 486 ? 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