data_9TNR # _entry.id 9TNR # _audit_conform.dict_name mmcif_pdbx.dic _audit_conform.dict_version 5.412 _audit_conform.dict_location http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic # loop_ _database_2.database_id _database_2.database_code _database_2.pdbx_database_accession _database_2.pdbx_DOI PDB 9TNR pdb_00009tnr 10.2210/pdb9tnr/pdb WWPDB D_1292153052 ? ? BMRB 35028 ? 10.13018/BMR35028 # _pdbx_audit_revision_history.ordinal 1 _pdbx_audit_revision_history.data_content_type 'Structure model' _pdbx_audit_revision_history.major_revision 1 _pdbx_audit_revision_history.minor_revision 0 _pdbx_audit_revision_history.revision_date 2026-04-08 _pdbx_audit_revision_history.part_number ? # _pdbx_audit_revision_details.ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.data_content_type 'Structure model' _pdbx_audit_revision_details.provider repository _pdbx_audit_revision_details.type 'Initial release' _pdbx_audit_revision_details.description ? _pdbx_audit_revision_details.details ? # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr . _pdbx_database_status.entry_id 9TNR _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2025-12-16 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site PDBE _pdbx_database_status.process_site PDBE _pdbx_database_status.status_code_cs . _pdbx_database_status.status_code_nmr_data REL _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y # _pdbx_database_related.db_name BMRB _pdbx_database_related.details 'L12 G-quadruplex-forming aptamer targeting HMGB1 protein' _pdbx_database_related.db_id 35028 _pdbx_database_related.content_type unspecified # loop_ _pdbx_contact_author.id _pdbx_contact_author.email _pdbx_contact_author.name_first _pdbx_contact_author.name_last _pdbx_contact_author.name_mi _pdbx_contact_author.role _pdbx_contact_author.identifier_ORCID 2 janez.plavec@ki.si Janez Plavec ? 'principal investigator/group leader' 0000-0003-1570-8602 3 montesar@unina.it Daniela Montesarchio ? 'principal investigator/group leader' 0000-0001-6295-6911 # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Trajkovski, M.' 1 0000-0002-8047-2950 'Platella, C.' 2 0000-0002-6997-1767 'Napolitano, E.' 3 0000-0001-6160-1860 'Esposito, C.L.' 4 0000-0003-0624-6821 'Catuogno, S.' 5 0000-0002-1653-4205 'Musumeci, D.' 6 0000-0001-7624-1933 'Plavec, J.' 7 0000-0003-1570-8602 'Montesarchio, D.' 8 0000-0001-6295-6911 # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country UK _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev Int.J.Biol.Macromol. _citation.journal_id_ASTM IJBMDR _citation.journal_id_CSD 0708 _citation.journal_id_ISSN 0141-8130 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume 357 _citation.language ? _citation.page_first 151585 _citation.page_last 151585 _citation.title ;Unraveling the NMR structures of G-quadruplex-forming aptamers acting as inhibitors of High Mobility Group Box 1 (HMGB1) pathological activity. ; _citation.year 2026 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1016/j.ijbiomac.2026.151585 _citation.pdbx_database_id_PubMed 41881226 _citation.pdbx_database_id_patent ? _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Trajkovski, M.' 1 ? primary 'Platella, C.' 2 ? primary 'Musumeci, D.' 3 ? primary 'Napolitano, E.' 4 ? primary 'Esposito, C.L.' 5 ? primary 'Catuogno, S.' 6 ? primary 'Plavec, J.' 7 ? primary 'Montesarchio, D.' 8 ? # _entity.id 1 _entity.type polymer _entity.src_method syn _entity.pdbx_description 'DNA (26-MER)' _entity.formula_weight 8209.282 _entity.pdbx_number_of_molecules 1 _entity.pdbx_ec ? _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.details ? # _entity_poly.entity_id 1 _entity_poly.type polydeoxyribonucleotide _entity_poly.nstd_linkage no _entity_poly.nstd_monomer no _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code ;(DT)(DT)(DA)(DG)(DG)(DG)(DA)(DT)(DT)(DG)(DG)(DG)(DA)(DA)(DT)(DG)(DG)(DG)(DT)(DA) (DT)(DG)(DG)(DG)(DT)(DT) ; _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can TTAGGGATTGGGAATGGGTATGGGTT _entity_poly.pdbx_strand_id A _entity_poly.pdbx_target_identifier ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 DT n 1 2 DT n 1 3 DA n 1 4 DG n 1 5 DG n 1 6 DG n 1 7 DA n 1 8 DT n 1 9 DT n 1 10 DG n 1 11 DG n 1 12 DG n 1 13 DA n 1 14 DA n 1 15 DT n 1 16 DG n 1 17 DG n 1 18 DG n 1 19 DT n 1 20 DA n 1 21 DT n 1 22 DG n 1 23 DG n 1 24 DG n 1 25 DT n 1 26 DT n # _pdbx_entity_src_syn.entity_id 1 _pdbx_entity_src_syn.pdbx_src_id 1 _pdbx_entity_src_syn.pdbx_alt_source_flag sample _pdbx_entity_src_syn.pdbx_beg_seq_num 1 _pdbx_entity_src_syn.pdbx_end_seq_num 26 _pdbx_entity_src_syn.organism_scientific 'Homo sapiens' _pdbx_entity_src_syn.organism_common_name ? _pdbx_entity_src_syn.ncbi_taxonomy_id 9606 _pdbx_entity_src_syn.details ? # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight DA 'DNA linking' y "2'-DEOXYADENOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O6 P' 331.222 DG 'DNA linking' y "2'-DEOXYGUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O7 P' 347.221 DT 'DNA linking' y "THYMIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H15 N2 O8 P' 322.208 # loop_ _pdbx_poly_seq_scheme.asym_id _pdbx_poly_seq_scheme.entity_id _pdbx_poly_seq_scheme.seq_id _pdbx_poly_seq_scheme.mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.ndb_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.auth_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.auth_mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_strand_id _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_ins_code _pdbx_poly_seq_scheme.hetero A 1 1 DT 1 1 1 DT DT A . n A 1 2 DT 2 2 2 DT DT A . n A 1 3 DA 3 3 3 DA DA A . n A 1 4 DG 4 4 4 DG DG A . n A 1 5 DG 5 5 5 DG DG A . n A 1 6 DG 6 6 6 DG DG A . n A 1 7 DA 7 7 7 DA DA A . n A 1 8 DT 8 8 8 DT DT A . n A 1 9 DT 9 9 9 DT DT A . n A 1 10 DG 10 10 10 DG DG A . n A 1 11 DG 11 11 11 DG DG A . n A 1 12 DG 12 12 12 DG DG A . n A 1 13 DA 13 13 13 DA DA A . n A 1 14 DA 14 14 14 DA DA A . n A 1 15 DT 15 15 15 DT DT A . n A 1 16 DG 16 16 16 DG DG A . n A 1 17 DG 17 17 17 DG DG A . n A 1 18 DG 18 18 18 DG DG A . n A 1 19 DT 19 19 19 DT DT A . n A 1 20 DA 20 20 20 DA DA A . n A 1 21 DT 21 21 21 DT DT A . n A 1 22 DG 22 22 22 DG DG A . n A 1 23 DG 23 23 23 DG DG A . n A 1 24 DG 24 24 24 DG DG A . n A 1 25 DT 25 25 25 DT DT A . n A 1 26 DT 26 26 26 DT DT A . n # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 9TNR _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'SOLUTION NMR' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 9TNR _struct.title 'L12 G-quadruplex-forming aptamer targeting HMGB1 protein' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 9TNR _struct_keywords.text 'aptamer, HMGB1, G-quadruplex, DNA' _struct_keywords.pdbx_keywords DNA # _struct_asym.id A _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag N _struct_asym.pdbx_modified N _struct_asym.entity_id 1 _struct_asym.details ? # _struct_ref.id 1 _struct_ref.db_name PDB _struct_ref.db_code 9TNR _struct_ref.pdbx_db_accession 9TNR _struct_ref.pdbx_db_isoform ? _struct_ref.entity_id 1 _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code ? _struct_ref.pdbx_align_begin 1 # _struct_ref_seq.align_id 1 _struct_ref_seq.ref_id 1 _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code 9TNR _struct_ref_seq.pdbx_strand_id A _struct_ref_seq.seq_align_beg 1 _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code ? _struct_ref_seq.seq_align_end 26 _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code ? _struct_ref_seq.pdbx_db_accession 9TNR _struct_ref_seq.db_align_beg 1 _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code ? _struct_ref_seq.db_align_end 26 _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code ? _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg 1 _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 26 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details monomeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'NMR Distance Restraints' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'not applicable' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0 # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role hydrog1 hydrog ? ? A DA 3 N1 ? ? ? 1_555 A DT 15 N3 ? ? A DA 3 A DT 15 1_555 ? ? ? ? ? ? 'REVERSED WATSON-CRICK' ? ? ? hydrog2 hydrog ? ? A DA 3 N6 ? ? ? 1_555 A DT 15 O2 ? ? A DA 3 A DT 15 1_555 ? ? ? ? ? ? 'REVERSED WATSON-CRICK' ? ? ? hydrog3 hydrog ? ? A DG 4 N7 ? ? ? 1_555 A DG 12 N2 ? ? A DG 4 A DG 12 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog4 hydrog ? ? A DG 4 O6 ? ? ? 1_555 A DG 12 N1 ? ? A DG 4 A DG 12 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog5 hydrog ? ? A DG 4 N1 ? ? ? 1_555 A DG 22 O6 ? ? A DG 4 A DG 22 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog6 hydrog ? ? A DG 4 N2 ? ? ? 1_555 A DG 22 N7 ? ? A DG 4 A DG 22 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog7 hydrog ? ? A DG 5 N1 ? ? ? 1_555 A DG 11 O6 ? ? A DG 5 A DG 11 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog8 hydrog ? ? A DG 5 N2 ? ? ? 1_555 A DG 11 N7 ? ? A DG 5 A DG 11 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog9 hydrog ? ? A DG 5 N7 ? ? ? 1_555 A DG 23 N2 ? ? A DG 5 A DG 23 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog10 hydrog ? ? A DG 5 O6 ? ? ? 1_555 A DG 23 N1 ? ? A DG 5 A DG 23 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog11 hydrog ? ? A DG 6 N1 ? ? ? 1_555 A DG 10 O6 ? ? A DG 6 A DG 10 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog12 hydrog ? ? A DG 6 N2 ? ? ? 1_555 A DG 10 N7 ? ? A DG 6 A DG 10 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog13 hydrog ? ? A DG 6 N7 ? ? ? 1_555 A DG 24 N2 ? ? A DG 6 A DG 24 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog14 hydrog ? ? A DG 6 O6 ? ? ? 1_555 A DG 24 N1 ? ? A DG 6 A DG 24 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog15 hydrog ? ? A DA 7 N1 ? ? ? 1_555 A DT 25 N3 ? ? A DA 7 A DT 25 1_555 ? ? ? ? ? ? 'REVERSED WATSON-CRICK' ? ? ? hydrog16 hydrog ? ? A DA 7 N6 ? ? ? 1_555 A DT 25 O2 ? ? A DA 7 A DT 25 1_555 ? ? ? ? ? ? 'REVERSED WATSON-CRICK' ? ? ? hydrog17 hydrog ? ? A DT 8 N3 ? ? ? 1_555 A DT 25 O2 ? ? A DT 8 A DT 25 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_13_PAIR ? ? ? hydrog18 hydrog ? ? A DT 8 O2 ? ? ? 1_555 A DT 25 N3 ? ? A DT 8 A DT 25 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_13_PAIR ? ? ? hydrog19 hydrog ? ? A DG 10 N1 ? ? ? 1_555 A DG 18 O6 ? ? A DG 10 A DG 18 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog20 hydrog ? ? A DG 10 N2 ? ? ? 1_555 A DG 18 N7 ? ? A DG 10 A DG 18 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog21 hydrog ? ? A DG 11 N1 ? ? ? 1_555 A DG 17 O6 ? ? A DG 11 A DG 17 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog22 hydrog ? ? A DG 11 N2 ? ? ? 1_555 A DG 17 N7 ? ? A DG 11 A DG 17 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog23 hydrog ? ? A DG 12 N7 ? ? ? 1_555 A DG 16 N2 ? ? A DG 12 A DG 16 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog24 hydrog ? ? A DG 12 O6 ? ? ? 1_555 A DG 16 N1 ? ? A DG 12 A DG 16 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog25 hydrog ? ? A DG 16 N7 ? ? ? 1_555 A DG 22 N2 ? ? A DG 16 A DG 22 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog26 hydrog ? ? A DG 16 O6 ? ? ? 1_555 A DG 22 N1 ? ? A DG 16 A DG 22 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog27 hydrog ? ? A DG 17 N1 ? ? ? 1_555 A DG 23 O6 ? ? A DG 17 A DG 23 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog28 hydrog ? ? A DG 17 N2 ? ? ? 1_555 A DG 23 N7 ? ? A DG 17 A DG 23 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog29 hydrog ? ? A DG 18 N1 ? ? ? 1_555 A DG 24 O6 ? ? A DG 18 A DG 24 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog30 hydrog ? ? A DG 18 N2 ? ? ? 1_555 A DG 24 N7 ? ? A DG 18 A DG 24 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog31 hydrog ? ? A DA 20 N1 ? ? ? 1_555 A DG 22 N2 ? ? A DA 20 A DG 22 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_10_PAIR ? ? ? hydrog32 hydrog ? ? A DA 20 N6 ? ? ? 1_555 A DG 22 N3 ? ? A DA 20 A DG 22 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_10_PAIR ? ? ? # _struct_conn_type.id hydrog _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # _pdbx_entry_details.entry_id 9TNR _pdbx_entry_details.compound_details ? _pdbx_entry_details.source_details ? _pdbx_entry_details.nonpolymer_details ? _pdbx_entry_details.sequence_details ? _pdbx_entry_details.has_ligand_of_interest ? _pdbx_entry_details.has_protein_modification N # loop_ _pdbx_validate_rmsd_angle.id _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_model_num _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_value _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_target_value _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_deviation _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_standard_deviation _pdbx_validate_rmsd_angle.linker_flag 1 1 C6 A DT 1 ? ? C5 A DT 1 ? ? C7 A DT 1 ? ? 119.21 122.90 -3.69 0.60 N 2 1 "O4'" A DT 2 ? ? "C1'" A DT 2 ? ? N1 A DT 2 ? ? 110.96 108.30 2.66 0.30 N 3 1 "O4'" A DA 3 ? ? "C1'" A DA 3 ? ? N9 A DA 3 ? ? 110.45 108.30 2.15 0.30 N 4 1 C5 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? N1 A DA 3 ? ? 121.16 117.70 3.46 0.50 N 5 1 N1 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? N6 A DA 3 ? ? 113.72 118.60 -4.88 0.60 N 6 1 "O4'" A DG 4 ? ? "C1'" A DG 4 ? ? N9 A DG 4 ? ? 111.17 108.30 2.87 0.30 N 7 1 "O4'" A DG 5 ? ? "C1'" A DG 5 ? ? N9 A DG 5 ? ? 110.61 108.30 2.31 0.30 N 8 1 "O4'" A DG 6 ? ? "C1'" A DG 6 ? ? N9 A DG 6 ? ? 111.21 108.30 2.91 0.30 N 9 1 C4 A DA 7 ? ? C5 A DA 7 ? ? C6 A DA 7 ? ? 113.76 117.00 -3.24 0.50 N 10 1 C5 A DA 7 ? ? C6 A DA 7 ? ? N1 A DA 7 ? ? 121.45 117.70 3.75 0.50 N 11 1 N1 A DA 7 ? ? C6 A DA 7 ? ? N6 A DA 7 ? ? 113.46 118.60 -5.14 0.60 N 12 1 "O4'" A DT 8 ? ? "C1'" A DT 8 ? ? N1 A DT 8 ? ? 110.73 108.30 2.43 0.30 N 13 1 C6 A DT 8 ? ? C5 A DT 8 ? ? C7 A DT 8 ? ? 119.27 122.90 -3.63 0.60 N 14 1 "O4'" A DT 9 ? ? "C1'" A DT 9 ? ? N1 A DT 9 ? ? 111.15 108.30 2.85 0.30 N 15 1 C6 A DT 9 ? ? C5 A DT 9 ? ? C7 A DT 9 ? ? 118.94 122.90 -3.96 0.60 N 16 1 "O4'" A DG 10 ? ? "C1'" A DG 10 ? ? N9 A DG 10 ? ? 114.61 108.30 6.31 0.30 N 17 1 "O4'" A DG 11 ? ? "C1'" A DG 11 ? ? N9 A DG 11 ? ? 114.38 108.30 6.08 0.30 N 18 1 "O4'" A DG 12 ? ? "C1'" A DG 12 ? ? N9 A DG 12 ? ? 112.17 108.30 3.87 0.30 N 19 1 "O4'" A DA 13 ? ? "C1'" A DA 13 ? ? N9 A DA 13 ? ? 110.26 108.30 1.96 0.30 N 20 1 C4 A DA 13 ? ? C5 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? 113.50 117.00 -3.50 0.50 N 21 1 C5 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? N1 A DA 13 ? ? 121.23 117.70 3.53 0.50 N 22 1 N1 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? N6 A DA 13 ? ? 113.17 118.60 -5.43 0.60 N 23 1 C4 A DA 14 ? ? C5 A DA 14 ? ? C6 A DA 14 ? ? 113.52 117.00 -3.48 0.50 N 24 1 C5 A DA 14 ? ? C6 A DA 14 ? ? N1 A DA 14 ? ? 121.17 117.70 3.47 0.50 N 25 1 N1 A DA 14 ? ? C6 A DA 14 ? ? N6 A DA 14 ? ? 112.70 118.60 -5.90 0.60 N 26 1 "O4'" A DG 16 ? ? "C1'" A DG 16 ? ? N9 A DG 16 ? ? 110.25 108.30 1.95 0.30 N 27 1 "O4'" A DG 17 ? ? "C1'" A DG 17 ? ? N9 A DG 17 ? ? 112.13 108.30 3.83 0.30 N 28 1 "O4'" A DG 18 ? ? "C1'" A DG 18 ? ? N9 A DG 18 ? ? 110.56 108.30 2.26 0.30 N 29 1 "O4'" A DT 19 ? ? "C1'" A DT 19 ? ? N1 A DT 19 ? ? 114.18 108.30 5.88 0.30 N 30 1 C6 A DT 19 ? ? C5 A DT 19 ? ? C7 A DT 19 ? ? 118.56 122.90 -4.34 0.60 N 31 1 "O4'" A DA 20 ? ? "C1'" A DA 20 ? ? N9 A DA 20 ? ? 111.30 108.30 3.00 0.30 N 32 1 C4 A DA 20 ? ? C5 A DA 20 ? ? C6 A DA 20 ? ? 113.68 117.00 -3.32 0.50 N 33 1 C5 A DA 20 ? ? C6 A DA 20 ? ? N1 A DA 20 ? ? 121.32 117.70 3.62 0.50 N 34 1 N1 A DA 20 ? ? C6 A DA 20 ? ? N6 A DA 20 ? ? 112.97 118.60 -5.63 0.60 N 35 1 "O4'" A DT 21 ? ? "C1'" A DT 21 ? ? N1 A DT 21 ? ? 111.45 108.30 3.15 0.30 N 36 1 C6 A DT 21 ? ? C5 A DT 21 ? ? C7 A DT 21 ? ? 119.16 122.90 -3.74 0.60 N 37 1 "O4'" A DG 22 ? ? "C1'" A DG 22 ? ? N9 A DG 22 ? ? 110.93 108.30 2.63 0.30 N 38 1 "O4'" A DG 23 ? ? "C1'" A DG 23 ? ? N9 A DG 23 ? ? 112.07 108.30 3.77 0.30 N 39 1 "O4'" A DT 25 ? ? "C1'" A DT 25 ? ? N1 A DT 25 ? ? 110.54 108.30 2.24 0.30 N 40 1 C6 A DT 25 ? ? C5 A DT 25 ? ? C7 A DT 25 ? ? 118.63 122.90 -4.27 0.60 N 41 1 "O4'" A DT 26 ? ? "C1'" A DT 26 ? ? N1 A DT 26 ? ? 113.73 108.30 5.43 0.30 N 42 1 C6 A DT 26 ? ? C5 A DT 26 ? ? C7 A DT 26 ? ? 119.18 122.90 -3.72 0.60 N 43 2 "O4'" A DT 1 ? ? "C1'" A DT 1 ? ? N1 A DT 1 ? ? 113.37 108.30 5.07 0.30 N 44 2 C6 A DT 1 ? ? C5 A DT 1 ? ? C7 A DT 1 ? ? 119.29 122.90 -3.61 0.60 N 45 2 C6 A DT 2 ? ? C5 A DT 2 ? ? C7 A DT 2 ? ? 119.23 122.90 -3.67 0.60 N 46 2 C4 A DA 3 ? ? C5 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? 113.53 117.00 -3.47 0.50 N 47 2 C5 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? N1 A DA 3 ? ? 121.39 117.70 3.69 0.50 N 48 2 N1 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? N6 A DA 3 ? ? 112.49 118.60 -6.11 0.60 N 49 2 "O4'" A DG 4 ? ? "C1'" A DG 4 ? ? N9 A DG 4 ? ? 111.28 108.30 2.98 0.30 N 50 2 "O4'" A DG 5 ? ? "C1'" A DG 5 ? ? N9 A DG 5 ? ? 111.73 108.30 3.43 0.30 N 51 2 "O4'" A DG 6 ? ? "C1'" A DG 6 ? ? N9 A DG 6 ? ? 111.56 108.30 3.26 0.30 N 52 2 "O4'" A DA 7 ? ? "C1'" A DA 7 ? ? N9 A DA 7 ? ? 110.60 108.30 2.30 0.30 N 53 2 C4 A DA 7 ? ? C5 A DA 7 ? ? C6 A DA 7 ? ? 113.38 117.00 -3.62 0.50 N 54 2 C5 A DA 7 ? ? C6 A DA 7 ? ? N1 A DA 7 ? ? 121.51 117.70 3.81 0.50 N 55 2 N1 A DA 7 ? ? C6 A DA 7 ? ? N6 A DA 7 ? ? 112.90 118.60 -5.70 0.60 N 56 2 "O4'" A DT 8 ? ? "C1'" A DT 8 ? ? N1 A DT 8 ? ? 111.22 108.30 2.92 0.30 N 57 2 C6 A DT 9 ? ? C5 A DT 9 ? ? C7 A DT 9 ? ? 118.78 122.90 -4.12 0.60 N 58 2 "O4'" A DG 10 ? ? "C1'" A DG 10 ? ? N9 A DG 10 ? ? 117.41 108.30 9.11 0.30 N 59 2 "O4'" A DG 11 ? ? "C1'" A DG 11 ? ? N9 A DG 11 ? ? 113.34 108.30 5.04 0.30 N 60 2 "O4'" A DG 12 ? ? "C1'" A DG 12 ? ? N9 A DG 12 ? ? 110.99 108.30 2.69 0.30 N 61 2 "O4'" A DA 13 ? ? "C1'" A DA 13 ? ? N9 A DA 13 ? ? 111.23 108.30 2.93 0.30 N 62 2 C4 A DA 13 ? ? C5 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? 113.82 117.00 -3.18 0.50 N 63 2 C5 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? N1 A DA 13 ? ? 121.13 117.70 3.43 0.50 N 64 2 N1 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? N6 A DA 13 ? ? 113.32 118.60 -5.28 0.60 N 65 2 "O4'" A DA 14 ? ? "C1'" A DA 14 ? ? N9 A DA 14 ? ? 110.21 108.30 1.91 0.30 N 66 2 C4 A DA 14 ? ? C5 A DA 14 ? ? C6 A DA 14 ? ? 113.66 117.00 -3.34 0.50 N 67 2 C5 A DA 14 ? ? C6 A DA 14 ? ? N1 A DA 14 ? ? 121.15 117.70 3.45 0.50 N 68 2 N1 A DA 14 ? ? C6 A DA 14 ? ? N6 A DA 14 ? ? 113.15 118.60 -5.45 0.60 N 69 2 C6 A DT 15 ? ? C5 A DT 15 ? ? C7 A DT 15 ? ? 119.11 122.90 -3.79 0.60 N 70 2 "O4'" A DG 16 ? ? "C1'" A DG 16 ? ? N9 A DG 16 ? ? 110.51 108.30 2.21 0.30 N 71 2 "O4'" A DG 17 ? ? "C1'" A DG 17 ? ? N9 A DG 17 ? ? 112.15 108.30 3.85 0.30 N 72 2 "O4'" A DG 18 ? ? "C1'" A DG 18 ? ? N9 A DG 18 ? ? 110.13 108.30 1.83 0.30 N 73 2 "O4'" A DT 19 ? ? "C1'" A DT 19 ? ? N1 A DT 19 ? ? 114.61 108.30 6.31 0.30 N 74 2 C6 A DT 19 ? ? C5 A DT 19 ? ? C7 A DT 19 ? ? 118.79 122.90 -4.11 0.60 N 75 2 "O4'" A DA 20 ? ? "C1'" A DA 20 ? ? N9 A DA 20 ? ? 111.27 108.30 2.97 0.30 N 76 2 C4 A DA 20 ? ? C5 A DA 20 ? ? C6 A DA 20 ? ? 113.52 117.00 -3.48 0.50 N 77 2 C5 A DA 20 ? ? C6 A DA 20 ? ? N1 A DA 20 ? ? 121.23 117.70 3.53 0.50 N 78 2 N1 A DA 20 ? ? C6 A DA 20 ? ? N6 A DA 20 ? ? 113.05 118.60 -5.55 0.60 N 79 2 "O4'" A DT 21 ? ? "C1'" A DT 21 ? ? N1 A DT 21 ? ? 114.36 108.30 6.06 0.30 N 80 2 C6 A DT 21 ? ? C5 A DT 21 ? ? C7 A DT 21 ? ? 118.54 122.90 -4.36 0.60 N 81 2 "O4'" A DG 22 ? ? "C1'" A DG 22 ? ? N9 A DG 22 ? ? 111.94 108.30 3.64 0.30 N 82 2 "O4'" A DG 23 ? ? "C1'" A DG 23 ? ? N9 A DG 23 ? ? 110.91 108.30 2.61 0.30 N 83 2 "O4'" A DG 24 ? ? "C1'" A DG 24 ? ? N9 A DG 24 ? ? 112.61 108.30 4.31 0.30 N 84 2 "O4'" A DT 25 ? ? "C1'" A DT 25 ? ? N1 A DT 25 ? ? 112.94 108.30 4.64 0.30 N 85 2 "O4'" A DT 26 ? ? "C1'" A DT 26 ? ? N1 A DT 26 ? ? 111.29 108.30 2.99 0.30 N 86 2 C6 A DT 26 ? ? C5 A DT 26 ? ? C7 A DT 26 ? ? 119.22 122.90 -3.68 0.60 N 87 3 C6 A DT 1 ? ? C5 A DT 1 ? ? C7 A DT 1 ? ? 119.03 122.90 -3.87 0.60 N 88 3 "O4'" A DT 2 ? ? "C1'" A DT 2 ? ? N1 A DT 2 ? ? 113.92 108.30 5.62 0.30 N 89 3 N3 A DT 2 ? ? C2 A DT 2 ? ? O2 A DT 2 ? ? 118.67 122.30 -3.63 0.60 N 90 3 "O4'" A DA 3 ? ? "C1'" A DA 3 ? ? N9 A DA 3 ? ? 111.29 108.30 2.99 0.30 N 91 3 C4 A DA 3 ? ? C5 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? 113.59 117.00 -3.41 0.50 N 92 3 C5 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? N1 A DA 3 ? ? 121.30 117.70 3.60 0.50 N 93 3 N1 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? N6 A DA 3 ? ? 112.90 118.60 -5.70 0.60 N 94 3 "O4'" A DG 4 ? ? "C1'" A DG 4 ? ? N9 A DG 4 ? ? 110.78 108.30 2.48 0.30 N 95 3 "O4'" A DG 6 ? ? "C1'" A DG 6 ? ? N9 A DG 6 ? ? 111.58 108.30 3.28 0.30 N 96 3 "O4'" A DA 7 ? ? "C1'" A DA 7 ? ? N9 A DA 7 ? ? 110.40 108.30 2.10 0.30 N 97 3 C4 A DA 7 ? ? C5 A DA 7 ? ? C6 A DA 7 ? ? 113.53 117.00 -3.47 0.50 N 98 3 C5 A DA 7 ? ? C6 A DA 7 ? ? N1 A DA 7 ? ? 121.49 117.70 3.79 0.50 N 99 3 N1 A DA 7 ? ? C6 A DA 7 ? ? N6 A DA 7 ? ? 112.70 118.60 -5.90 0.60 N 100 3 "O4'" A DT 8 ? ? "C1'" A DT 8 ? ? N1 A DT 8 ? ? 110.51 108.30 2.21 0.30 N 101 3 "O4'" A DT 9 ? ? "C1'" A DT 9 ? ? N1 A DT 9 ? ? 110.86 108.30 2.56 0.30 N 102 3 C6 A DT 9 ? ? C5 A DT 9 ? ? C7 A DT 9 ? ? 119.10 122.90 -3.80 0.60 N 103 3 "O4'" A DG 10 ? ? "C1'" A DG 10 ? ? N9 A DG 10 ? ? 117.38 108.30 9.08 0.30 N 104 3 "O4'" A DG 11 ? ? "C1'" A DG 11 ? ? N9 A DG 11 ? ? 112.83 108.30 4.53 0.30 N 105 3 "C3'" A DG 12 ? ? "C2'" A DG 12 ? ? "C1'" A DG 12 ? ? 97.46 102.40 -4.94 0.80 N 106 3 "O4'" A DG 12 ? ? "C1'" A DG 12 ? ? N9 A DG 12 ? ? 114.01 108.30 5.71 0.30 N 107 3 "O4'" A DA 13 ? ? "C1'" A DA 13 ? ? N9 A DA 13 ? ? 111.99 108.30 3.69 0.30 N 108 3 C4 A DA 13 ? ? C5 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? 113.79 117.00 -3.21 0.50 N 109 3 C5 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? N1 A DA 13 ? ? 121.07 117.70 3.37 0.50 N 110 3 N1 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? N6 A DA 13 ? ? 112.69 118.60 -5.91 0.60 N 111 3 C4 A DA 14 ? ? C5 A DA 14 ? ? C6 A DA 14 ? ? 113.78 117.00 -3.22 0.50 N 112 3 C5 A DA 14 ? ? C6 A DA 14 ? ? N1 A DA 14 ? ? 121.30 117.70 3.60 0.50 N 113 3 N1 A DA 14 ? ? C6 A DA 14 ? ? N6 A DA 14 ? ? 113.48 118.60 -5.12 0.60 N 114 3 C6 A DT 15 ? ? C5 A DT 15 ? ? C7 A DT 15 ? ? 118.30 122.90 -4.60 0.60 N 115 3 "O4'" A DG 16 ? ? "C1'" A DG 16 ? ? N9 A DG 16 ? ? 110.41 108.30 2.11 0.30 N 116 3 "O4'" A DG 17 ? ? "C1'" A DG 17 ? ? N9 A DG 17 ? ? 112.93 108.30 4.63 0.30 N 117 3 "O4'" A DG 18 ? ? "C1'" A DG 18 ? ? N9 A DG 18 ? ? 111.13 108.30 2.83 0.30 N 118 3 "O4'" A DT 19 ? ? "C1'" A DT 19 ? ? N1 A DT 19 ? ? 112.07 108.30 3.77 0.30 N 119 3 C6 A DT 19 ? ? C5 A DT 19 ? ? C7 A DT 19 ? ? 119.01 122.90 -3.89 0.60 N 120 3 "O4'" A DA 20 ? ? "C1'" A DA 20 ? ? N9 A DA 20 ? ? 111.83 108.30 3.53 0.30 N 121 3 C4 A DA 20 ? ? C5 A DA 20 ? ? C6 A DA 20 ? ? 113.65 117.00 -3.35 0.50 N 122 3 C5 A DA 20 ? ? C6 A DA 20 ? ? N1 A DA 20 ? ? 121.31 117.70 3.61 0.50 N 123 3 N1 A DA 20 ? ? C6 A DA 20 ? ? N6 A DA 20 ? ? 113.23 118.60 -5.37 0.60 N 124 3 "O4'" A DT 21 ? ? "C1'" A DT 21 ? ? N1 A DT 21 ? ? 111.57 108.30 3.27 0.30 N 125 3 C6 A DT 21 ? ? C5 A DT 21 ? ? C7 A DT 21 ? ? 119.14 122.90 -3.76 0.60 N 126 3 "O4'" A DG 22 ? ? "C1'" A DG 22 ? ? N9 A DG 22 ? ? 112.43 108.30 4.13 0.30 N 127 3 "O4'" A DG 23 ? ? "C1'" A DG 23 ? ? N9 A DG 23 ? ? 111.19 108.30 2.89 0.30 N 128 3 "O4'" A DG 24 ? ? "C1'" A DG 24 ? ? N9 A DG 24 ? ? 113.33 108.30 5.03 0.30 N 129 3 "O4'" A DT 25 ? ? "C1'" A DT 25 ? ? N1 A DT 25 ? ? 113.20 108.30 4.90 0.30 N 130 3 C6 A DT 25 ? ? C5 A DT 25 ? ? C7 A DT 25 ? ? 118.81 122.90 -4.09 0.60 N 131 3 "O4'" A DT 26 ? ? "C1'" A DT 26 ? ? N1 A DT 26 ? ? 111.84 108.30 3.54 0.30 N 132 3 C6 A DT 26 ? ? C5 A DT 26 ? ? C7 A DT 26 ? ? 119.15 122.90 -3.75 0.60 N 133 4 "O4'" A DT 1 ? ? "C1'" A DT 1 ? ? N1 A DT 1 ? ? 111.69 108.30 3.39 0.30 N 134 4 C6 A DT 1 ? ? C5 A DT 1 ? ? C7 A DT 1 ? ? 119.28 122.90 -3.62 0.60 N 135 4 "O4'" A DT 2 ? ? "C1'" A DT 2 ? ? N1 A DT 2 ? ? 110.38 108.30 2.08 0.30 N 136 4 C4 A DA 3 ? ? C5 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? 113.79 117.00 -3.21 0.50 N 137 4 C5 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? N1 A DA 3 ? ? 121.31 117.70 3.61 0.50 N 138 4 N1 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? N6 A DA 3 ? ? 113.43 118.60 -5.17 0.60 N 139 4 "O4'" A DG 4 ? ? "C1'" A DG 4 ? ? N9 A DG 4 ? ? 111.71 108.30 3.41 0.30 N 140 4 "O4'" A DG 5 ? ? "C1'" A DG 5 ? ? N9 A DG 5 ? ? 110.61 108.30 2.31 0.30 N 141 4 "O4'" A DG 6 ? ? "C1'" A DG 6 ? ? N9 A DG 6 ? ? 112.12 108.30 3.82 0.30 N 142 4 "O4'" A DA 7 ? ? "C1'" A DA 7 ? ? N9 A DA 7 ? ? 113.16 108.30 4.86 0.30 N 143 4 C4 A DA 7 ? ? C5 A DA 7 ? ? C6 A DA 7 ? ? 113.55 117.00 -3.45 0.50 N 144 4 C5 A DA 7 ? ? C6 A DA 7 ? ? N1 A DA 7 ? ? 121.40 117.70 3.70 0.50 N 145 4 N1 A DA 7 ? ? C6 A DA 7 ? ? N6 A DA 7 ? ? 112.71 118.60 -5.89 0.60 N 146 4 "O4'" A DT 8 ? ? "C1'" A DT 8 ? ? N1 A DT 8 ? ? 111.20 108.30 2.90 0.30 N 147 4 "O4'" A DT 9 ? ? "C1'" A DT 9 ? ? N1 A DT 9 ? ? 110.61 108.30 2.31 0.30 N 148 4 C6 A DT 9 ? ? C5 A DT 9 ? ? C7 A DT 9 ? ? 118.95 122.90 -3.95 0.60 N 149 4 "O4'" A DG 10 ? ? "C1'" A DG 10 ? ? N9 A DG 10 ? ? 113.19 108.30 4.89 0.30 N 150 4 "O4'" A DG 11 ? ? "C1'" A DG 11 ? ? N9 A DG 11 ? ? 115.53 108.30 7.23 0.30 N 151 4 "O4'" A DG 12 ? ? "C1'" A DG 12 ? ? N9 A DG 12 ? ? 112.13 108.30 3.83 0.30 N 152 4 "O4'" A DA 13 ? ? "C1'" A DA 13 ? ? N9 A DA 13 ? ? 111.20 108.30 2.90 0.30 N 153 4 C4 A DA 13 ? ? C5 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? 113.70 117.00 -3.30 0.50 N 154 4 C5 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? N1 A DA 13 ? ? 121.22 117.70 3.52 0.50 N 155 4 N1 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? N6 A DA 13 ? ? 113.12 118.60 -5.48 0.60 N 156 4 C4 A DA 14 ? ? C5 A DA 14 ? ? C6 A DA 14 ? ? 113.59 117.00 -3.41 0.50 N 157 4 C5 A DA 14 ? ? C6 A DA 14 ? ? N1 A DA 14 ? ? 121.27 117.70 3.57 0.50 N 158 4 N1 A DA 14 ? ? C6 A DA 14 ? ? N6 A DA 14 ? ? 113.16 118.60 -5.44 0.60 N 159 4 C6 A DT 15 ? ? C5 A DT 15 ? ? C7 A DT 15 ? ? 119.22 122.90 -3.68 0.60 N 160 4 "O4'" A DG 17 ? ? "C1'" A DG 17 ? ? N9 A DG 17 ? ? 113.14 108.30 4.84 0.30 N 161 4 "O4'" A DG 18 ? ? "C1'" A DG 18 ? ? N9 A DG 18 ? ? 111.59 108.30 3.29 0.30 N 162 4 "O4'" A DT 19 ? ? "C1'" A DT 19 ? ? N1 A DT 19 ? ? 112.23 108.30 3.93 0.30 N 163 4 C6 A DT 19 ? ? C5 A DT 19 ? ? C7 A DT 19 ? ? 118.97 122.90 -3.93 0.60 N 164 4 "O4'" A DA 20 ? ? "C1'" A DA 20 ? ? N9 A DA 20 ? ? 111.39 108.30 3.09 0.30 N 165 4 C4 A DA 20 ? ? C5 A DA 20 ? ? C6 A DA 20 ? ? 113.84 117.00 -3.16 0.50 N 166 4 C5 A DA 20 ? ? C6 A DA 20 ? ? N1 A DA 20 ? ? 121.32 117.70 3.62 0.50 N 167 4 N1 A DA 20 ? ? C6 A DA 20 ? ? N6 A DA 20 ? ? 113.03 118.60 -5.57 0.60 N 168 4 "O4'" A DT 21 ? ? "C1'" A DT 21 ? ? N1 A DT 21 ? ? 111.20 108.30 2.90 0.30 N 169 4 C6 A DT 21 ? ? C5 A DT 21 ? ? C7 A DT 21 ? ? 119.24 122.90 -3.66 0.60 N 170 4 "O4'" A DG 22 ? ? "C1'" A DG 22 ? ? N9 A DG 22 ? ? 112.26 108.30 3.96 0.30 N 171 4 "O4'" A DG 23 ? ? "C1'" A DG 23 ? ? N9 A DG 23 ? ? 111.62 108.30 3.32 0.30 N 172 4 "O4'" A DG 24 ? ? "C1'" A DG 24 ? ? N9 A DG 24 ? ? 111.83 108.30 3.53 0.30 N 173 4 "O4'" A DT 25 ? ? "C1'" A DT 25 ? ? N1 A DT 25 ? ? 110.68 108.30 2.38 0.30 N 174 4 C6 A DT 25 ? ? C5 A DT 25 ? ? C7 A DT 25 ? ? 118.77 122.90 -4.13 0.60 N 175 4 "O4'" A DT 26 ? ? "C1'" A DT 26 ? ? N1 A DT 26 ? ? 111.12 108.30 2.82 0.30 N 176 4 C6 A DT 26 ? ? C5 A DT 26 ? ? C7 A DT 26 ? ? 119.18 122.90 -3.72 0.60 N 177 5 "O4'" A DT 1 ? ? "C1'" A DT 1 ? ? N1 A DT 1 ? ? 111.71 108.30 3.41 0.30 N 178 5 C6 A DT 1 ? ? C5 A DT 1 ? ? C7 A DT 1 ? ? 119.24 122.90 -3.66 0.60 N 179 5 "O4'" A DT 2 ? ? "C1'" A DT 2 ? ? N1 A DT 2 ? ? 110.19 108.30 1.89 0.30 N 180 5 C6 A DT 2 ? ? C5 A DT 2 ? ? C7 A DT 2 ? ? 119.23 122.90 -3.67 0.60 N 181 5 "O4'" A DA 3 ? ? "C1'" A DA 3 ? ? N9 A DA 3 ? ? 110.82 108.30 2.52 0.30 N 182 5 C4 A DA 3 ? ? C5 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? 113.85 117.00 -3.15 0.50 N 183 5 C5 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? N1 A DA 3 ? ? 121.22 117.70 3.52 0.50 N 184 5 N1 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? N6 A DA 3 ? ? 113.18 118.60 -5.42 0.60 N 185 5 "O4'" A DG 4 ? ? "C1'" A DG 4 ? ? N9 A DG 4 ? ? 111.42 108.30 3.12 0.30 N 186 5 "O4'" A DG 5 ? ? "C1'" A DG 5 ? ? N9 A DG 5 ? ? 111.11 108.30 2.81 0.30 N 187 5 "O4'" A DG 6 ? ? "C1'" A DG 6 ? ? N9 A DG 6 ? ? 111.30 108.30 3.00 0.30 N 188 5 C4 A DA 7 ? ? C5 A DA 7 ? ? C6 A DA 7 ? ? 113.71 117.00 -3.29 0.50 N 189 5 C5 A DA 7 ? ? C6 A DA 7 ? ? N1 A DA 7 ? ? 121.33 117.70 3.63 0.50 N 190 5 N1 A DA 7 ? ? C6 A DA 7 ? ? N6 A DA 7 ? ? 113.35 118.60 -5.25 0.60 N 191 5 "O4'" A DT 9 ? ? "C1'" A DT 9 ? ? N1 A DT 9 ? ? 111.42 108.30 3.12 0.30 N 192 5 C6 A DT 9 ? ? C5 A DT 9 ? ? C7 A DT 9 ? ? 119.21 122.90 -3.69 0.60 N 193 5 "O4'" A DG 10 ? ? "C1'" A DG 10 ? ? N9 A DG 10 ? ? 118.02 108.30 9.72 0.30 N 194 5 "O4'" A DG 11 ? ? "C1'" A DG 11 ? ? N9 A DG 11 ? ? 113.17 108.30 4.87 0.30 N 195 5 "O4'" A DG 12 ? ? "C1'" A DG 12 ? ? N9 A DG 12 ? ? 111.16 108.30 2.86 0.30 N 196 5 "O4'" A DA 13 ? ? "C1'" A DA 13 ? ? N9 A DA 13 ? ? 111.37 108.30 3.07 0.30 N 197 5 C4 A DA 13 ? ? C5 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? 113.84 117.00 -3.16 0.50 N 198 5 C5 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? N1 A DA 13 ? ? 121.18 117.70 3.48 0.50 N 199 5 N1 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? N6 A DA 13 ? ? 114.04 118.60 -4.56 0.60 N 200 5 C4 A DA 14 ? ? C5 A DA 14 ? ? C6 A DA 14 ? ? 113.69 117.00 -3.31 0.50 N 201 5 C5 A DA 14 ? ? C6 A DA 14 ? ? N1 A DA 14 ? ? 121.20 117.70 3.50 0.50 N 202 5 N1 A DA 14 ? ? C6 A DA 14 ? ? N6 A DA 14 ? ? 113.12 118.60 -5.48 0.60 N 203 5 C6 A DT 15 ? ? C5 A DT 15 ? ? C7 A DT 15 ? ? 119.13 122.90 -3.77 0.60 N 204 5 "O4'" A DG 17 ? ? "C1'" A DG 17 ? ? N9 A DG 17 ? ? 111.87 108.30 3.57 0.30 N 205 5 "O4'" A DG 18 ? ? "C1'" A DG 18 ? ? N9 A DG 18 ? ? 110.12 108.30 1.82 0.30 N 206 5 "O4'" A DT 19 ? ? "C1'" A DT 19 ? ? N1 A DT 19 ? ? 113.54 108.30 5.24 0.30 N 207 5 C6 A DT 19 ? ? C5 A DT 19 ? ? C7 A DT 19 ? ? 118.84 122.90 -4.06 0.60 N 208 5 "O4'" A DA 20 ? ? "C1'" A DA 20 ? ? N9 A DA 20 ? ? 111.22 108.30 2.92 0.30 N 209 5 C4 A DA 20 ? ? C5 A DA 20 ? ? C6 A DA 20 ? ? 113.73 117.00 -3.27 0.50 N 210 5 C5 A DA 20 ? ? C6 A DA 20 ? ? N1 A DA 20 ? ? 121.36 117.70 3.66 0.50 N 211 5 N1 A DA 20 ? ? C6 A DA 20 ? ? N6 A DA 20 ? ? 113.07 118.60 -5.53 0.60 N 212 5 "O4'" A DT 21 ? ? "C1'" A DT 21 ? ? N1 A DT 21 ? ? 111.04 108.30 2.74 0.30 N 213 5 C6 A DT 21 ? ? C5 A DT 21 ? ? C7 A DT 21 ? ? 119.07 122.90 -3.83 0.60 N 214 5 "O4'" A DG 22 ? ? "C1'" A DG 22 ? ? N9 A DG 22 ? ? 111.43 108.30 3.13 0.30 N 215 5 "O4'" A DG 23 ? ? "C1'" A DG 23 ? ? N9 A DG 23 ? ? 111.45 108.30 3.15 0.30 N 216 5 "O4'" A DG 24 ? ? "C1'" A DG 24 ? ? N9 A DG 24 ? ? 111.23 108.30 2.93 0.30 N 217 5 "O4'" A DT 25 ? ? "C1'" A DT 25 ? ? N1 A DT 25 ? ? 112.61 108.30 4.31 0.30 N 218 5 C6 A DT 25 ? ? C5 A DT 25 ? ? C7 A DT 25 ? ? 118.43 122.90 -4.47 0.60 N 219 5 "O4'" A DT 26 ? ? "C1'" A DT 26 ? ? N1 A DT 26 ? ? 111.74 108.30 3.44 0.30 N 220 5 C6 A DT 26 ? ? C5 A DT 26 ? ? C7 A DT 26 ? ? 119.04 122.90 -3.86 0.60 N 221 6 "O4'" A DT 1 ? ? "C1'" A DT 1 ? ? N1 A DT 1 ? ? 111.49 108.30 3.19 0.30 N 222 6 C6 A DT 1 ? ? C5 A DT 1 ? ? C7 A DT 1 ? ? 119.26 122.90 -3.64 0.60 N 223 6 "O4'" A DT 2 ? ? "C1'" A DT 2 ? ? N1 A DT 2 ? ? 112.96 108.30 4.66 0.30 N 224 6 "O4'" A DA 3 ? ? "C1'" A DA 3 ? ? N9 A DA 3 ? ? 111.28 108.30 2.98 0.30 N 225 6 C4 A DA 3 ? ? C5 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? 113.68 117.00 -3.32 0.50 N 226 6 C5 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? N1 A DA 3 ? ? 121.29 117.70 3.59 0.50 N 227 6 N1 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? N6 A DA 3 ? ? 113.86 118.60 -4.74 0.60 N 228 6 "O4'" A DG 4 ? ? "C1'" A DG 4 ? ? N9 A DG 4 ? ? 110.87 108.30 2.57 0.30 N 229 6 "O4'" A DG 6 ? ? "C1'" A DG 6 ? ? N9 A DG 6 ? ? 110.88 108.30 2.58 0.30 N 230 6 C4 A DA 7 ? ? C5 A DA 7 ? ? C6 A DA 7 ? ? 113.87 117.00 -3.13 0.50 N 231 6 C5 A DA 7 ? ? C6 A DA 7 ? ? N1 A DA 7 ? ? 121.28 117.70 3.58 0.50 N 232 6 N1 A DA 7 ? ? C6 A DA 7 ? ? N6 A DA 7 ? ? 113.66 118.60 -4.94 0.60 N 233 6 "O4'" A DT 9 ? ? "C1'" A DT 9 ? ? N1 A DT 9 ? ? 110.82 108.30 2.52 0.30 N 234 6 C6 A DT 9 ? ? C5 A DT 9 ? ? C7 A DT 9 ? ? 118.81 122.90 -4.09 0.60 N 235 6 "O4'" A DG 10 ? ? "C1'" A DG 10 ? ? N9 A DG 10 ? ? 113.15 108.30 4.85 0.30 N 236 6 "O4'" A DG 11 ? ? "C1'" A DG 11 ? ? N9 A DG 11 ? ? 114.36 108.30 6.06 0.30 N 237 6 "C3'" A DG 12 ? ? "C2'" A DG 12 ? ? "C1'" A DG 12 ? ? 97.51 102.40 -4.89 0.80 N 238 6 "O4'" A DG 12 ? ? "C1'" A DG 12 ? ? N9 A DG 12 ? ? 115.06 108.30 6.76 0.30 N 239 6 "O4'" A DA 13 ? ? "C1'" A DA 13 ? ? N9 A DA 13 ? ? 111.68 108.30 3.38 0.30 N 240 6 C4 A DA 13 ? ? C5 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? 113.67 117.00 -3.33 0.50 N 241 6 C5 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? N1 A DA 13 ? ? 121.22 117.70 3.52 0.50 N 242 6 N1 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? N6 A DA 13 ? ? 112.45 118.60 -6.15 0.60 N 243 6 C4 A DA 14 ? ? C5 A DA 14 ? ? C6 A DA 14 ? ? 113.67 117.00 -3.33 0.50 N 244 6 C5 A DA 14 ? ? C6 A DA 14 ? ? N1 A DA 14 ? ? 121.30 117.70 3.60 0.50 N 245 6 N1 A DA 14 ? ? C6 A DA 14 ? ? N6 A DA 14 ? ? 113.53 118.60 -5.07 0.60 N 246 6 C6 A DT 15 ? ? C5 A DT 15 ? ? C7 A DT 15 ? ? 118.40 122.90 -4.50 0.60 N 247 6 "O4'" A DG 17 ? ? "C1'" A DG 17 ? ? N9 A DG 17 ? ? 113.66 108.30 5.36 0.30 N 248 6 "O4'" A DG 18 ? ? "C1'" A DG 18 ? ? N9 A DG 18 ? ? 112.14 108.30 3.84 0.30 N 249 6 "O4'" A DT 19 ? ? "C1'" A DT 19 ? ? N1 A DT 19 ? ? 111.55 108.30 3.25 0.30 N 250 6 C6 A DT 19 ? ? C5 A DT 19 ? ? C7 A DT 19 ? ? 119.07 122.90 -3.83 0.60 N 251 6 "O4'" A DA 20 ? ? "C1'" A DA 20 ? ? N9 A DA 20 ? ? 111.55 108.30 3.25 0.30 N 252 6 C4 A DA 20 ? ? C5 A DA 20 ? ? C6 A DA 20 ? ? 113.83 117.00 -3.17 0.50 N 253 6 C5 A DA 20 ? ? C6 A DA 20 ? ? N1 A DA 20 ? ? 121.38 117.70 3.68 0.50 N 254 6 N1 A DA 20 ? ? C6 A DA 20 ? ? N6 A DA 20 ? ? 113.23 118.60 -5.37 0.60 N 255 6 "O4'" A DT 21 ? ? "C1'" A DT 21 ? ? N1 A DT 21 ? ? 111.10 108.30 2.80 0.30 N 256 6 C6 A DT 21 ? ? C5 A DT 21 ? ? C7 A DT 21 ? ? 119.21 122.90 -3.69 0.60 N 257 6 "O4'" A DG 22 ? ? "C1'" A DG 22 ? ? N9 A DG 22 ? ? 112.27 108.30 3.97 0.30 N 258 6 "O4'" A DG 23 ? ? "C1'" A DG 23 ? ? N9 A DG 23 ? ? 113.32 108.30 5.02 0.30 N 259 6 "O4'" A DG 24 ? ? "C1'" A DG 24 ? ? N9 A DG 24 ? ? 111.37 108.30 3.07 0.30 N 260 6 "O4'" A DT 25 ? ? "C1'" A DT 25 ? ? N1 A DT 25 ? ? 113.93 108.30 5.63 0.30 N 261 6 C6 A DT 25 ? ? C5 A DT 25 ? ? C7 A DT 25 ? ? 118.79 122.90 -4.11 0.60 N 262 6 "O4'" A DT 26 ? ? "C1'" A DT 26 ? ? N1 A DT 26 ? ? 110.72 108.30 2.42 0.30 N 263 6 C6 A DT 26 ? ? C5 A DT 26 ? ? C7 A DT 26 ? ? 119.05 122.90 -3.85 0.60 N 264 7 "O4'" A DT 1 ? ? "C1'" A DT 1 ? ? N1 A DT 1 ? ? 111.97 108.30 3.67 0.30 N 265 7 "O4'" A DT 2 ? ? "C1'" A DT 2 ? ? N1 A DT 2 ? ? 110.14 108.30 1.84 0.30 N 266 7 C4 A DA 3 ? ? C5 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? 113.86 117.00 -3.14 0.50 N 267 7 C5 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? N1 A DA 3 ? ? 121.30 117.70 3.60 0.50 N 268 7 N1 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? N6 A DA 3 ? ? 113.34 118.60 -5.26 0.60 N 269 7 "O4'" A DG 4 ? ? "C1'" A DG 4 ? ? N9 A DG 4 ? ? 111.45 108.30 3.15 0.30 N 270 7 "O4'" A DG 5 ? ? "C1'" A DG 5 ? ? N9 A DG 5 ? ? 110.70 108.30 2.40 0.30 N 271 7 "O4'" A DG 6 ? ? "C1'" A DG 6 ? ? N9 A DG 6 ? ? 111.38 108.30 3.08 0.30 N 272 7 C4 A DA 7 ? ? C5 A DA 7 ? ? C6 A DA 7 ? ? 113.70 117.00 -3.30 0.50 N 273 7 C5 A DA 7 ? ? C6 A DA 7 ? ? N1 A DA 7 ? ? 121.44 117.70 3.74 0.50 N 274 7 N1 A DA 7 ? ? C6 A DA 7 ? ? N6 A DA 7 ? ? 112.61 118.60 -5.99 0.60 N 275 7 "O4'" A DT 9 ? ? "C1'" A DT 9 ? ? N1 A DT 9 ? ? 111.11 108.30 2.81 0.30 N 276 7 C6 A DT 9 ? ? C5 A DT 9 ? ? C7 A DT 9 ? ? 119.01 122.90 -3.89 0.60 N 277 7 "O4'" A DG 10 ? ? "C1'" A DG 10 ? ? N9 A DG 10 ? ? 113.54 108.30 5.24 0.30 N 278 7 "O4'" A DG 11 ? ? "C1'" A DG 11 ? ? N9 A DG 11 ? ? 115.09 108.30 6.79 0.30 N 279 7 "O4'" A DG 12 ? ? "C1'" A DG 12 ? ? N9 A DG 12 ? ? 111.78 108.30 3.48 0.30 N 280 7 "O4'" A DA 13 ? ? "C1'" A DA 13 ? ? N9 A DA 13 ? ? 111.72 108.30 3.42 0.30 N 281 7 C4 A DA 13 ? ? C5 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? 113.65 117.00 -3.35 0.50 N 282 7 C5 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? N1 A DA 13 ? ? 121.25 117.70 3.55 0.50 N 283 7 N1 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? N6 A DA 13 ? ? 112.95 118.60 -5.65 0.60 N 284 7 "O4'" A DA 14 ? ? "C1'" A DA 14 ? ? N9 A DA 14 ? ? 110.47 108.30 2.17 0.30 N 285 7 C4 A DA 14 ? ? C5 A DA 14 ? ? C6 A DA 14 ? ? 113.58 117.00 -3.42 0.50 N 286 7 C5 A DA 14 ? ? C6 A DA 14 ? ? N1 A DA 14 ? ? 121.28 117.70 3.58 0.50 N 287 7 N1 A DA 14 ? ? C6 A DA 14 ? ? N6 A DA 14 ? ? 112.80 118.60 -5.80 0.60 N 288 7 C6 A DT 15 ? ? C5 A DT 15 ? ? C7 A DT 15 ? ? 119.20 122.90 -3.70 0.60 N 289 7 "O4'" A DG 16 ? ? "C1'" A DG 16 ? ? N9 A DG 16 ? ? 110.37 108.30 2.07 0.30 N 290 7 "O4'" A DG 17 ? ? "C1'" A DG 17 ? ? N9 A DG 17 ? ? 113.01 108.30 4.71 0.30 N 291 7 "O4'" A DG 18 ? ? "C1'" A DG 18 ? ? N9 A DG 18 ? ? 110.61 108.30 2.31 0.30 N 292 7 "O4'" A DT 19 ? ? "C1'" A DT 19 ? ? N1 A DT 19 ? ? 114.74 108.30 6.44 0.30 N 293 7 C6 A DT 19 ? ? C5 A DT 19 ? ? C7 A DT 19 ? ? 119.08 122.90 -3.82 0.60 N 294 7 "O4'" A DA 20 ? ? "C1'" A DA 20 ? ? N9 A DA 20 ? ? 111.58 108.30 3.28 0.30 N 295 7 C4 A DA 20 ? ? C5 A DA 20 ? ? C6 A DA 20 ? ? 113.70 117.00 -3.30 0.50 N 296 7 C5 A DA 20 ? ? C6 A DA 20 ? ? N1 A DA 20 ? ? 121.42 117.70 3.72 0.50 N 297 7 N1 A DA 20 ? ? C6 A DA 20 ? ? N6 A DA 20 ? ? 113.81 118.60 -4.79 0.60 N 298 7 "O4'" A DT 21 ? ? "C1'" A DT 21 ? ? N1 A DT 21 ? ? 110.72 108.30 2.42 0.30 N 299 7 C6 A DT 21 ? ? C5 A DT 21 ? ? C7 A DT 21 ? ? 118.94 122.90 -3.96 0.60 N 300 7 "O4'" A DG 22 ? ? "C1'" A DG 22 ? ? N9 A DG 22 ? ? 113.08 108.30 4.78 0.30 N 301 7 "O4'" A DG 23 ? ? "C1'" A DG 23 ? ? N9 A DG 23 ? ? 111.26 108.30 2.96 0.30 N 302 7 "O4'" A DG 24 ? ? "C1'" A DG 24 ? ? N9 A DG 24 ? ? 111.77 108.30 3.47 0.30 N 303 7 "O4'" A DT 25 ? ? "C1'" A DT 25 ? ? N1 A DT 25 ? ? 110.56 108.30 2.26 0.30 N 304 7 C6 A DT 25 ? ? C5 A DT 25 ? ? C7 A DT 25 ? ? 118.83 122.90 -4.07 0.60 N 305 7 "O4'" A DT 26 ? ? "C1'" A DT 26 ? ? N1 A DT 26 ? ? 111.57 108.30 3.27 0.30 N 306 8 "O4'" A DT 1 ? ? "C1'" A DT 1 ? ? N1 A DT 1 ? ? 111.21 108.30 2.91 0.30 N 307 8 "O4'" A DT 2 ? ? "C1'" A DT 2 ? ? N1 A DT 2 ? ? 110.21 108.30 1.91 0.30 N 308 8 C6 A DT 2 ? ? C5 A DT 2 ? ? C7 A DT 2 ? ? 119.29 122.90 -3.61 0.60 N 309 8 C4 A DA 3 ? ? C5 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? 113.88 117.00 -3.12 0.50 N 310 8 C5 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? N1 A DA 3 ? ? 121.48 117.70 3.78 0.50 N 311 8 N1 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? N6 A DA 3 ? ? 113.82 118.60 -4.78 0.60 N 312 8 "O4'" A DG 4 ? ? "C1'" A DG 4 ? ? N9 A DG 4 ? ? 111.95 108.30 3.65 0.30 N 313 8 "O4'" A DG 5 ? ? "C1'" A DG 5 ? ? N9 A DG 5 ? ? 110.85 108.30 2.55 0.30 N 314 8 "O4'" A DG 6 ? ? "C1'" A DG 6 ? ? N9 A DG 6 ? ? 111.36 108.30 3.06 0.30 N 315 8 C4 A DA 7 ? ? C5 A DA 7 ? ? C6 A DA 7 ? ? 113.71 117.00 -3.29 0.50 N 316 8 C5 A DA 7 ? ? C6 A DA 7 ? ? N1 A DA 7 ? ? 121.47 117.70 3.77 0.50 N 317 8 N1 A DA 7 ? ? C6 A DA 7 ? ? N6 A DA 7 ? ? 112.67 118.60 -5.93 0.60 N 318 8 "O4'" A DT 9 ? ? "C1'" A DT 9 ? ? N1 A DT 9 ? ? 111.23 108.30 2.93 0.30 N 319 8 C6 A DT 9 ? ? C5 A DT 9 ? ? C7 A DT 9 ? ? 118.95 122.90 -3.95 0.60 N 320 8 "O4'" A DG 10 ? ? "C1'" A DG 10 ? ? N9 A DG 10 ? ? 113.46 108.30 5.16 0.30 N 321 8 "O4'" A DG 11 ? ? "C1'" A DG 11 ? ? N9 A DG 11 ? ? 115.57 108.30 7.27 0.30 N 322 8 "O4'" A DG 12 ? ? "C1'" A DG 12 ? ? N9 A DG 12 ? ? 113.22 108.30 4.92 0.30 N 323 8 "O4'" A DA 13 ? ? "C1'" A DA 13 ? ? "C2'" A DA 13 ? ? 100.32 105.90 -5.58 0.80 N 324 8 "O4'" A DA 13 ? ? "C1'" A DA 13 ? ? N9 A DA 13 ? ? 113.74 108.30 5.44 0.30 N 325 8 C5 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? N1 A DA 13 ? ? 121.10 117.70 3.40 0.50 N 326 8 N1 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? N6 A DA 13 ? ? 113.54 118.60 -5.06 0.60 N 327 8 C4 A DA 14 ? ? C5 A DA 14 ? ? C6 A DA 14 ? ? 113.67 117.00 -3.33 0.50 N 328 8 C5 A DA 14 ? ? C6 A DA 14 ? ? N1 A DA 14 ? ? 121.31 117.70 3.61 0.50 N 329 8 N1 A DA 14 ? ? C6 A DA 14 ? ? N6 A DA 14 ? ? 113.20 118.60 -5.40 0.60 N 330 8 C6 A DT 15 ? ? C5 A DT 15 ? ? C7 A DT 15 ? ? 119.06 122.90 -3.84 0.60 N 331 8 "O4'" A DG 17 ? ? "C1'" A DG 17 ? ? N9 A DG 17 ? ? 112.75 108.30 4.45 0.30 N 332 8 "O4'" A DG 18 ? ? "C1'" A DG 18 ? ? N9 A DG 18 ? ? 110.51 108.30 2.21 0.30 N 333 8 "O4'" A DT 19 ? ? "C1'" A DT 19 ? ? N1 A DT 19 ? ? 113.91 108.30 5.61 0.30 N 334 8 C6 A DT 19 ? ? C5 A DT 19 ? ? C7 A DT 19 ? ? 118.98 122.90 -3.92 0.60 N 335 8 "O4'" A DA 20 ? ? "C1'" A DA 20 ? ? N9 A DA 20 ? ? 111.37 108.30 3.07 0.30 N 336 8 C4 A DA 20 ? ? C5 A DA 20 ? ? C6 A DA 20 ? ? 113.75 117.00 -3.25 0.50 N 337 8 C5 A DA 20 ? ? C6 A DA 20 ? ? N1 A DA 20 ? ? 121.34 117.70 3.64 0.50 N 338 8 N1 A DA 20 ? ? C6 A DA 20 ? ? N6 A DA 20 ? ? 113.22 118.60 -5.38 0.60 N 339 8 "O4'" A DT 21 ? ? "C1'" A DT 21 ? ? N1 A DT 21 ? ? 111.09 108.30 2.79 0.30 N 340 8 C6 A DT 21 ? ? C5 A DT 21 ? ? C7 A DT 21 ? ? 119.07 122.90 -3.83 0.60 N 341 8 "O4'" A DG 22 ? ? "C1'" A DG 22 ? ? N9 A DG 22 ? ? 112.00 108.30 3.70 0.30 N 342 8 "O4'" A DG 23 ? ? "C1'" A DG 23 ? ? N9 A DG 23 ? ? 111.32 108.30 3.02 0.30 N 343 8 "O4'" A DG 24 ? ? "C1'" A DG 24 ? ? N9 A DG 24 ? ? 111.67 108.30 3.37 0.30 N 344 8 "O4'" A DT 25 ? ? "C1'" A DT 25 ? ? N1 A DT 25 ? ? 110.36 108.30 2.06 0.30 N 345 8 C6 A DT 25 ? ? C5 A DT 25 ? ? C7 A DT 25 ? ? 118.78 122.90 -4.12 0.60 N 346 8 "O4'" A DT 26 ? ? "C1'" A DT 26 ? ? N1 A DT 26 ? ? 111.56 108.30 3.26 0.30 N 347 9 "O4'" A DT 1 ? ? "C1'" A DT 1 ? ? N1 A DT 1 ? ? 111.84 108.30 3.54 0.30 N 348 9 C6 A DT 1 ? ? C5 A DT 1 ? ? C7 A DT 1 ? ? 119.22 122.90 -3.68 0.60 N 349 9 C4 A DA 3 ? ? C5 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? 113.53 117.00 -3.47 0.50 N 350 9 C5 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? N1 A DA 3 ? ? 121.42 117.70 3.72 0.50 N 351 9 N1 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? N6 A DA 3 ? ? 112.32 118.60 -6.28 0.60 N 352 9 "O4'" A DG 4 ? ? "C1'" A DG 4 ? ? N9 A DG 4 ? ? 111.72 108.30 3.42 0.30 N 353 9 "O4'" A DG 5 ? ? "C1'" A DG 5 ? ? N9 A DG 5 ? ? 111.66 108.30 3.36 0.30 N 354 9 "O4'" A DG 6 ? ? "C1'" A DG 6 ? ? N9 A DG 6 ? ? 112.77 108.30 4.47 0.30 N 355 9 "O4'" A DA 7 ? ? "C1'" A DA 7 ? ? N9 A DA 7 ? ? 112.89 108.30 4.59 0.30 N 356 9 C4 A DA 7 ? ? C5 A DA 7 ? ? C6 A DA 7 ? ? 113.26 117.00 -3.74 0.50 N 357 9 C5 A DA 7 ? ? C6 A DA 7 ? ? N1 A DA 7 ? ? 121.81 117.70 4.11 0.50 N 358 9 N1 A DA 7 ? ? C6 A DA 7 ? ? N6 A DA 7 ? ? 112.15 118.60 -6.45 0.60 N 359 9 "O4'" A DT 8 ? ? "C1'" A DT 8 ? ? N1 A DT 8 ? ? 110.85 108.30 2.55 0.30 N 360 9 C6 A DT 8 ? ? C5 A DT 8 ? ? C7 A DT 8 ? ? 119.25 122.90 -3.65 0.60 N 361 9 C6 A DT 9 ? ? C5 A DT 9 ? ? C7 A DT 9 ? ? 119.14 122.90 -3.76 0.60 N 362 9 "O4'" A DG 10 ? ? "C1'" A DG 10 ? ? N9 A DG 10 ? ? 115.07 108.30 6.77 0.30 N 363 9 "O4'" A DG 11 ? ? "C1'" A DG 11 ? ? N9 A DG 11 ? ? 114.53 108.30 6.23 0.30 N 364 9 "O4'" A DG 12 ? ? "C1'" A DG 12 ? ? N9 A DG 12 ? ? 111.60 108.30 3.30 0.30 N 365 9 "O4'" A DA 13 ? ? "C1'" A DA 13 ? ? N9 A DA 13 ? ? 111.52 108.30 3.22 0.30 N 366 9 C4 A DA 13 ? ? C5 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? 113.67 117.00 -3.33 0.50 N 367 9 C5 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? N1 A DA 13 ? ? 121.28 117.70 3.58 0.50 N 368 9 N1 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? N6 A DA 13 ? ? 113.03 118.60 -5.57 0.60 N 369 9 "O4'" A DA 14 ? ? "C1'" A DA 14 ? ? N9 A DA 14 ? ? 110.65 108.30 2.35 0.30 N 370 9 C4 A DA 14 ? ? C5 A DA 14 ? ? C6 A DA 14 ? ? 113.57 117.00 -3.43 0.50 N 371 9 C5 A DA 14 ? ? C6 A DA 14 ? ? N1 A DA 14 ? ? 121.27 117.70 3.57 0.50 N 372 9 N1 A DA 14 ? ? C6 A DA 14 ? ? N6 A DA 14 ? ? 112.86 118.60 -5.74 0.60 N 373 9 C6 A DT 15 ? ? C5 A DT 15 ? ? C7 A DT 15 ? ? 119.07 122.90 -3.83 0.60 N 374 9 "O4'" A DG 16 ? ? "C1'" A DG 16 ? ? N9 A DG 16 ? ? 110.47 108.30 2.17 0.30 N 375 9 "O4'" A DG 17 ? ? "C1'" A DG 17 ? ? N9 A DG 17 ? ? 112.07 108.30 3.77 0.30 N 376 9 "O4'" A DG 18 ? ? "C1'" A DG 18 ? ? N9 A DG 18 ? ? 110.23 108.30 1.93 0.30 N 377 9 "O4'" A DT 19 ? ? "C1'" A DT 19 ? ? N1 A DT 19 ? ? 114.52 108.30 6.22 0.30 N 378 9 C6 A DT 19 ? ? C5 A DT 19 ? ? C7 A DT 19 ? ? 118.75 122.90 -4.15 0.60 N 379 9 "O4'" A DA 20 ? ? "C1'" A DA 20 ? ? N9 A DA 20 ? ? 111.19 108.30 2.89 0.30 N 380 9 C4 A DA 20 ? ? C5 A DA 20 ? ? C6 A DA 20 ? ? 113.51 117.00 -3.49 0.50 N 381 9 C5 A DA 20 ? ? C6 A DA 20 ? ? N1 A DA 20 ? ? 121.21 117.70 3.51 0.50 N 382 9 N1 A DA 20 ? ? C6 A DA 20 ? ? N6 A DA 20 ? ? 113.07 118.60 -5.53 0.60 N 383 9 "O4'" A DT 21 ? ? "C1'" A DT 21 ? ? N1 A DT 21 ? ? 114.25 108.30 5.95 0.30 N 384 9 C6 A DT 21 ? ? C5 A DT 21 ? ? C7 A DT 21 ? ? 118.57 122.90 -4.33 0.60 N 385 9 "O4'" A DG 22 ? ? "C1'" A DG 22 ? ? N9 A DG 22 ? ? 111.17 108.30 2.87 0.30 N 386 9 "O4'" A DG 23 ? ? "C1'" A DG 23 ? ? N9 A DG 23 ? ? 111.51 108.30 3.21 0.30 N 387 9 "O4'" A DG 24 ? ? "C1'" A DG 24 ? ? N9 A DG 24 ? ? 111.01 108.30 2.71 0.30 N 388 9 "O4'" A DT 25 ? ? "C1'" A DT 25 ? ? N1 A DT 25 ? ? 111.53 108.30 3.23 0.30 N 389 9 C6 A DT 25 ? ? C5 A DT 25 ? ? C7 A DT 25 ? ? 118.81 122.90 -4.09 0.60 N 390 9 "O4'" A DT 26 ? ? "C1'" A DT 26 ? ? N1 A DT 26 ? ? 111.85 108.30 3.55 0.30 N 391 9 C6 A DT 26 ? ? C5 A DT 26 ? ? C7 A DT 26 ? ? 119.20 122.90 -3.70 0.60 N 392 10 "O4'" A DT 1 ? ? "C1'" A DT 1 ? ? N1 A DT 1 ? ? 111.65 108.30 3.35 0.30 N 393 10 C6 A DT 1 ? ? C5 A DT 1 ? ? C7 A DT 1 ? ? 119.23 122.90 -3.67 0.60 N 394 10 "O4'" A DT 2 ? ? "C1'" A DT 2 ? ? N1 A DT 2 ? ? 110.42 108.30 2.12 0.30 N 395 10 "O4'" A DA 3 ? ? "C1'" A DA 3 ? ? N9 A DA 3 ? ? 110.18 108.30 1.88 0.30 N 396 10 C4 A DA 3 ? ? C5 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? 113.83 117.00 -3.17 0.50 N 397 10 C5 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? N1 A DA 3 ? ? 121.28 117.70 3.58 0.50 N 398 10 N1 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? N6 A DA 3 ? ? 113.32 118.60 -5.28 0.60 N 399 10 "O4'" A DG 4 ? ? "C1'" A DG 4 ? ? N9 A DG 4 ? ? 111.62 108.30 3.32 0.30 N 400 10 "O4'" A DG 5 ? ? "C1'" A DG 5 ? ? N9 A DG 5 ? ? 110.28 108.30 1.98 0.30 N 401 10 "O4'" A DG 6 ? ? "C1'" A DG 6 ? ? N9 A DG 6 ? ? 111.41 108.30 3.11 0.30 N 402 10 C4 A DA 7 ? ? C5 A DA 7 ? ? C6 A DA 7 ? ? 113.62 117.00 -3.38 0.50 N 403 10 C5 A DA 7 ? ? C6 A DA 7 ? ? N1 A DA 7 ? ? 121.50 117.70 3.80 0.50 N 404 10 N1 A DA 7 ? ? C6 A DA 7 ? ? N6 A DA 7 ? ? 112.75 118.60 -5.85 0.60 N 405 10 "O4'" A DT 9 ? ? "C1'" A DT 9 ? ? N1 A DT 9 ? ? 110.90 108.30 2.60 0.30 N 406 10 C6 A DT 9 ? ? C5 A DT 9 ? ? C7 A DT 9 ? ? 118.92 122.90 -3.98 0.60 N 407 10 "O4'" A DG 10 ? ? "C1'" A DG 10 ? ? N9 A DG 10 ? ? 113.57 108.30 5.27 0.30 N 408 10 "O4'" A DG 11 ? ? "C1'" A DG 11 ? ? N9 A DG 11 ? ? 115.38 108.30 7.08 0.30 N 409 10 "O4'" A DG 12 ? ? "C1'" A DG 12 ? ? N9 A DG 12 ? ? 112.01 108.30 3.71 0.30 N 410 10 "O4'" A DA 13 ? ? "C1'" A DA 13 ? ? N9 A DA 13 ? ? 111.26 108.30 2.96 0.30 N 411 10 C4 A DA 13 ? ? C5 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? 113.74 117.00 -3.26 0.50 N 412 10 C5 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? N1 A DA 13 ? ? 121.30 117.70 3.60 0.50 N 413 10 N1 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? N6 A DA 13 ? ? 113.10 118.60 -5.50 0.60 N 414 10 C4 A DA 14 ? ? C5 A DA 14 ? ? C6 A DA 14 ? ? 113.68 117.00 -3.32 0.50 N 415 10 C5 A DA 14 ? ? C6 A DA 14 ? ? N1 A DA 14 ? ? 121.15 117.70 3.45 0.50 N 416 10 N1 A DA 14 ? ? C6 A DA 14 ? ? N6 A DA 14 ? ? 113.28 118.60 -5.32 0.60 N 417 10 C6 A DT 15 ? ? C5 A DT 15 ? ? C7 A DT 15 ? ? 119.22 122.90 -3.68 0.60 N 418 10 "O4'" A DG 17 ? ? "C1'" A DG 17 ? ? N9 A DG 17 ? ? 112.97 108.30 4.67 0.30 N 419 10 "O4'" A DG 18 ? ? "C1'" A DG 18 ? ? N9 A DG 18 ? ? 111.56 108.30 3.26 0.30 N 420 10 "O4'" A DT 19 ? ? "C1'" A DT 19 ? ? N1 A DT 19 ? ? 112.20 108.30 3.90 0.30 N 421 10 C6 A DT 19 ? ? C5 A DT 19 ? ? C7 A DT 19 ? ? 118.97 122.90 -3.93 0.60 N 422 10 "O4'" A DA 20 ? ? "C1'" A DA 20 ? ? N9 A DA 20 ? ? 111.33 108.30 3.03 0.30 N 423 10 C4 A DA 20 ? ? C5 A DA 20 ? ? C6 A DA 20 ? ? 113.72 117.00 -3.28 0.50 N 424 10 C5 A DA 20 ? ? C6 A DA 20 ? ? N1 A DA 20 ? ? 121.43 117.70 3.73 0.50 N 425 10 N1 A DA 20 ? ? C6 A DA 20 ? ? N6 A DA 20 ? ? 113.01 118.60 -5.59 0.60 N 426 10 "O4'" A DT 21 ? ? "C1'" A DT 21 ? ? N1 A DT 21 ? ? 111.22 108.30 2.92 0.30 N 427 10 C6 A DT 21 ? ? C5 A DT 21 ? ? C7 A DT 21 ? ? 119.17 122.90 -3.73 0.60 N 428 10 "O4'" A DG 22 ? ? "C1'" A DG 22 ? ? N9 A DG 22 ? ? 112.05 108.30 3.75 0.30 N 429 10 "O4'" A DG 23 ? ? "C1'" A DG 23 ? ? N9 A DG 23 ? ? 111.58 108.30 3.28 0.30 N 430 10 "O4'" A DG 24 ? ? "C1'" A DG 24 ? ? N9 A DG 24 ? ? 111.81 108.30 3.51 0.30 N 431 10 "O4'" A DT 25 ? ? "C1'" A DT 25 ? ? N1 A DT 25 ? ? 110.28 108.30 1.98 0.30 N 432 10 C6 A DT 25 ? ? C5 A DT 25 ? ? C7 A DT 25 ? ? 118.80 122.90 -4.10 0.60 N 433 10 "O4'" A DT 26 ? ? "C1'" A DT 26 ? ? N1 A DT 26 ? ? 111.40 108.30 3.10 0.30 N 434 10 C6 A DT 26 ? ? C5 A DT 26 ? ? C7 A DT 26 ? ? 119.25 122.90 -3.65 0.60 N # loop_ _pdbx_validate_planes.id _pdbx_validate_planes.PDB_model_num _pdbx_validate_planes.auth_comp_id _pdbx_validate_planes.auth_asym_id _pdbx_validate_planes.auth_seq_id _pdbx_validate_planes.PDB_ins_code _pdbx_validate_planes.label_alt_id _pdbx_validate_planes.rmsd _pdbx_validate_planes.type 1 1 DT A 2 ? ? 0.084 'SIDE CHAIN' 2 1 DT A 9 ? ? 0.075 'SIDE CHAIN' 3 1 DG A 17 ? ? 0.058 'SIDE CHAIN' 4 2 DT A 2 ? ? 0.094 'SIDE CHAIN' 5 2 DT A 9 ? ? 0.090 'SIDE CHAIN' 6 2 DG A 12 ? ? 0.061 'SIDE CHAIN' 7 2 DG A 24 ? ? 0.081 'SIDE CHAIN' 8 3 DT A 9 ? ? 0.064 'SIDE CHAIN' 9 3 DA A 13 ? ? 0.073 'SIDE CHAIN' 10 3 DA A 14 ? ? 0.059 'SIDE CHAIN' 11 3 DG A 24 ? ? 0.076 'SIDE CHAIN' 12 4 DT A 2 ? ? 0.080 'SIDE CHAIN' 13 4 DT A 8 ? ? 0.073 'SIDE CHAIN' 14 4 DT A 9 ? ? 0.092 'SIDE CHAIN' 15 4 DG A 10 ? ? 0.053 'SIDE CHAIN' 16 4 DA A 13 ? ? 0.054 'SIDE CHAIN' 17 4 DG A 17 ? ? 0.055 'SIDE CHAIN' 18 4 DG A 24 ? ? 0.056 'SIDE CHAIN' 19 5 DG A 12 ? ? 0.061 'SIDE CHAIN' 20 5 DG A 24 ? ? 0.066 'SIDE CHAIN' 21 5 DT A 25 ? ? 0.061 'SIDE CHAIN' 22 6 DA A 13 ? ? 0.071 'SIDE CHAIN' 23 6 DG A 17 ? ? 0.084 'SIDE CHAIN' 24 6 DG A 24 ? ? 0.050 'SIDE CHAIN' 25 7 DT A 2 ? ? 0.088 'SIDE CHAIN' 26 7 DA A 3 ? ? 0.055 'SIDE CHAIN' 27 7 DT A 9 ? ? 0.080 'SIDE CHAIN' 28 7 DA A 13 ? ? 0.050 'SIDE CHAIN' 29 7 DT A 25 ? ? 0.066 'SIDE CHAIN' 30 8 DT A 2 ? ? 0.061 'SIDE CHAIN' 31 8 DA A 3 ? ? 0.054 'SIDE CHAIN' 32 8 DT A 9 ? ? 0.083 'SIDE CHAIN' 33 8 DG A 12 ? ? 0.063 'SIDE CHAIN' 34 8 DT A 25 ? ? 0.064 'SIDE CHAIN' 35 9 DT A 2 ? ? 0.093 'SIDE CHAIN' 36 9 DT A 8 ? ? 0.082 'SIDE CHAIN' 37 9 DT A 9 ? ? 0.063 'SIDE CHAIN' 38 9 DA A 13 ? ? 0.055 'SIDE CHAIN' 39 10 DT A 2 ? ? 0.079 'SIDE CHAIN' 40 10 DT A 9 ? ? 0.101 'SIDE CHAIN' 41 10 DA A 13 ? ? 0.054 'SIDE CHAIN' # _pdbx_nmr_ensemble.entry_id 9TNR _pdbx_nmr_ensemble.conformers_calculated_total_number 100 _pdbx_nmr_ensemble.conformers_submitted_total_number 10 _pdbx_nmr_ensemble.conformer_selection_criteria 'structures with the lowest energy' _pdbx_nmr_ensemble.representative_conformer ? _pdbx_nmr_ensemble.average_constraints_per_residue ? _pdbx_nmr_ensemble.average_constraint_violations_per_residue ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.average_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_upper_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_lower_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.distance_constraint_violation_method ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_torsion_angle_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.average_torsion_angle_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.torsion_angle_constraint_violation_method ? # _pdbx_nmr_representative.entry_id 9TNR _pdbx_nmr_representative.conformer_id 1 _pdbx_nmr_representative.selection_criteria 'lowest energy' # loop_ _pdbx_nmr_sample_details.solution_id _pdbx_nmr_sample_details.contents _pdbx_nmr_sample_details.solvent_system _pdbx_nmr_sample_details.label _pdbx_nmr_sample_details.type _pdbx_nmr_sample_details.details 1 '1.0 mM DNA (26-MER), 20 mM potassium phosphate, 100 mM KCl, 90% H2O/10% D2O' '90% H2O/10% D2O' L12_1 solution ? 2 '0.2 mM NA-95%,U-5% 13C, U-5% 15N DNA (26-MER), 20 mM potassium phosphate, 100 mM KCl, 90% H2O/10% D2O' '90% H2O/10% D2O' L12_2 solution ? # loop_ _pdbx_nmr_exptl_sample.solution_id _pdbx_nmr_exptl_sample.component _pdbx_nmr_exptl_sample.concentration _pdbx_nmr_exptl_sample.concentration_range _pdbx_nmr_exptl_sample.concentration_units _pdbx_nmr_exptl_sample.isotopic_labeling 1 'DNA (26-MER)' 1.0 ? mM 'natural abundance' 1 'potassium phosphate' 20 ? mM 'natural abundance' 1 KCl 100 ? mM 'natural abundance' 2 'DNA (26-MER)' 0.2 ? mM 'NA-95%,U-5% 13C, U-5% 15N' 2 'potassium phosphate' 20 ? mM 'natural abundance' 2 KCl 100 ? mM 'natural abundance' # _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.conditions_id 1 _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.temperature 298 _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pressure_units bar _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pressure 1 _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pH 7.0 _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.ionic_strength 120 _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.details ? _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.ionic_strength_err ? _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.ionic_strength_units mM _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.label L12_NA _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pH_err ? _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pH_units pH _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pressure_err ? _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.temperature_err ? _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.temperature_units K # loop_ _pdbx_nmr_exptl.experiment_id _pdbx_nmr_exptl.conditions_id _pdbx_nmr_exptl.solution_id _pdbx_nmr_exptl.type _pdbx_nmr_exptl.spectrometer_id _pdbx_nmr_exptl.sample_state 1 1 1 '2D 1H-1H NOESY' 1 isotropic 2 1 1 '2D 1H-1H NOESY' 2 isotropic 3 1 2 '2D 1H-15N HSQC' 1 isotropic # _pdbx_nmr_refine.entry_id 9TNR _pdbx_nmr_refine.method 'simulated annealing' _pdbx_nmr_refine.details ? _pdbx_nmr_refine.software_ordinal 2 # loop_ _pdbx_nmr_software.ordinal _pdbx_nmr_software.classification _pdbx_nmr_software.name _pdbx_nmr_software.version _pdbx_nmr_software.authors 1 'chemical shift assignment' NMRFAM-SPARKY ? 'Lee W., Tonelli M., Makley J.L.' 2 'structure calculation' Amber ? 'Case, Darden, Cheatham III, Simmerling, Wang, Duke, Luo, ... and Kollman' 3 'data analysis' TopSpin ? 'Bruker Biospin' # loop_ _chem_comp_atom.comp_id _chem_comp_atom.atom_id _chem_comp_atom.type_symbol _chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_atom.pdbx_stereo_config _chem_comp_atom.pdbx_ordinal DA OP3 O N N 1 DA P P N N 2 DA OP1 O N N 3 DA OP2 O N N 4 DA "O5'" O N N 5 DA "C5'" C N N 6 DA "C4'" C N R 7 DA "O4'" O N N 8 DA "C3'" C N S 9 DA "O3'" O N N 10 DA "C2'" C N N 11 DA "C1'" C N R 12 DA N9 N Y N 13 DA C8 C Y N 14 DA N7 N Y N 15 DA C5 C Y N 16 DA C6 C Y N 17 DA N6 N N N 18 DA N1 N Y N 19 DA C2 C Y N 20 DA N3 N Y N 21 DA C4 C Y N 22 DA HOP3 H N N 23 DA HOP2 H N N 24 DA "H5'" H N N 25 DA "H5''" H N N 26 DA "H4'" H N N 27 DA "H3'" H N N 28 DA "HO3'" H N N 29 DA "H2'" H N N 30 DA "H2''" H N N 31 DA "H1'" H N N 32 DA H8 H N N 33 DA H61 H N N 34 DA H62 H N N 35 DA H2 H N N 36 DG OP3 O N N 37 DG P P N N 38 DG OP1 O N N 39 DG OP2 O N N 40 DG "O5'" O N N 41 DG "C5'" C N N 42 DG "C4'" C N R 43 DG "O4'" O N N 44 DG "C3'" C N S 45 DG "O3'" O N N 46 DG "C2'" C N N 47 DG "C1'" C N R 48 DG N9 N Y N 49 DG C8 C Y N 50 DG N7 N Y N 51 DG C5 C Y N 52 DG C6 C N N 53 DG O6 O N N 54 DG N1 N N N 55 DG C2 C N N 56 DG N2 N N N 57 DG N3 N N N 58 DG C4 C Y N 59 DG HOP3 H N N 60 DG HOP2 H N N 61 DG "H5'" H N N 62 DG "H5''" H N N 63 DG "H4'" H N N 64 DG "H3'" H N N 65 DG "HO3'" H N N 66 DG "H2'" H N N 67 DG "H2''" H N N 68 DG "H1'" H N N 69 DG H8 H N N 70 DG H1 H N N 71 DG H21 H N N 72 DG H22 H N N 73 DT OP3 O N N 74 DT P P N N 75 DT OP1 O N N 76 DT OP2 O N N 77 DT "O5'" O N N 78 DT "C5'" C N N 79 DT "C4'" C N R 80 DT "O4'" O N N 81 DT "C3'" C N S 82 DT "O3'" O N N 83 DT "C2'" C N N 84 DT "C1'" C N R 85 DT N1 N N N 86 DT C2 C N N 87 DT O2 O N N 88 DT N3 N N N 89 DT C4 C N N 90 DT O4 O N N 91 DT C5 C N N 92 DT C7 C N N 93 DT C6 C N N 94 DT HOP3 H N N 95 DT HOP2 H N N 96 DT "H5'" H N N 97 DT "H5''" H N N 98 DT "H4'" H N N 99 DT "H3'" H N N 100 DT "HO3'" H N N 101 DT "H2'" H N N 102 DT "H2''" H N N 103 DT "H1'" H N N 104 DT H3 H N N 105 DT H71 H N N 106 DT H72 H N N 107 DT H73 H N N 108 DT H6 H N N 109 # loop_ _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_ordinal DA OP3 P sing N N 1 DA OP3 HOP3 sing N N 2 DA P OP1 doub N N 3 DA P OP2 sing N N 4 DA P "O5'" sing N N 5 DA OP2 HOP2 sing N N 6 DA "O5'" "C5'" sing N N 7 DA "C5'" "C4'" sing N N 8 DA "C5'" "H5'" sing N N 9 DA "C5'" "H5''" sing N N 10 DA "C4'" "O4'" sing N N 11 DA "C4'" "C3'" sing N N 12 DA "C4'" "H4'" sing N N 13 DA "O4'" "C1'" sing N N 14 DA "C3'" "O3'" sing N N 15 DA "C3'" "C2'" sing N N 16 DA "C3'" "H3'" sing N N 17 DA "O3'" "HO3'" sing N N 18 DA "C2'" "C1'" sing N N 19 DA "C2'" "H2'" sing N N 20 DA "C2'" "H2''" sing N N 21 DA "C1'" N9 sing N N 22 DA "C1'" "H1'" sing N N 23 DA N9 C8 sing Y N 24 DA N9 C4 sing Y N 25 DA C8 N7 doub Y N 26 DA C8 H8 sing N N 27 DA N7 C5 sing Y N 28 DA C5 C6 sing Y N 29 DA C5 C4 doub Y N 30 DA C6 N6 sing N N 31 DA C6 N1 doub Y N 32 DA N6 H61 sing N N 33 DA N6 H62 sing N N 34 DA N1 C2 sing Y N 35 DA C2 N3 doub Y N 36 DA C2 H2 sing N N 37 DA N3 C4 sing Y N 38 DG OP3 P sing N N 39 DG OP3 HOP3 sing N N 40 DG P OP1 doub N N 41 DG P OP2 sing N N 42 DG P "O5'" sing N N 43 DG OP2 HOP2 sing N N 44 DG "O5'" "C5'" sing N N 45 DG "C5'" "C4'" sing N N 46 DG "C5'" "H5'" sing N N 47 DG "C5'" "H5''" sing N N 48 DG "C4'" "O4'" sing N N 49 DG "C4'" "C3'" sing N N 50 DG "C4'" "H4'" sing N N 51 DG "O4'" "C1'" sing N N 52 DG "C3'" "O3'" sing N N 53 DG "C3'" "C2'" sing N N 54 DG "C3'" "H3'" sing N N 55 DG "O3'" "HO3'" sing N N 56 DG "C2'" "C1'" sing N N 57 DG "C2'" "H2'" sing N N 58 DG "C2'" "H2''" sing N N 59 DG "C1'" N9 sing N N 60 DG "C1'" "H1'" sing N N 61 DG N9 C8 sing Y N 62 DG N9 C4 sing Y N 63 DG C8 N7 doub Y N 64 DG C8 H8 sing N N 65 DG N7 C5 sing Y N 66 DG C5 C6 sing N N 67 DG C5 C4 doub Y N 68 DG C6 O6 doub N N 69 DG C6 N1 sing N N 70 DG N1 C2 sing N N 71 DG N1 H1 sing N N 72 DG C2 N2 sing N N 73 DG C2 N3 doub N N 74 DG N2 H21 sing N N 75 DG N2 H22 sing N N 76 DG N3 C4 sing N N 77 DT OP3 P sing N N 78 DT OP3 HOP3 sing N N 79 DT P OP1 doub N N 80 DT P OP2 sing N N 81 DT P "O5'" sing N N 82 DT OP2 HOP2 sing N N 83 DT "O5'" "C5'" sing N N 84 DT "C5'" "C4'" sing N N 85 DT "C5'" "H5'" sing N N 86 DT "C5'" "H5''" sing N N 87 DT "C4'" "O4'" sing N N 88 DT "C4'" "C3'" sing N N 89 DT "C4'" "H4'" sing N N 90 DT "O4'" "C1'" sing N N 91 DT "C3'" "O3'" sing N N 92 DT "C3'" "C2'" sing N N 93 DT "C3'" "H3'" sing N N 94 DT "O3'" "HO3'" sing N N 95 DT "C2'" "C1'" sing N N 96 DT "C2'" "H2'" sing N N 97 DT "C2'" "H2''" sing N N 98 DT "C1'" N1 sing N N 99 DT "C1'" "H1'" sing N N 100 DT N1 C2 sing N N 101 DT N1 C6 sing N N 102 DT C2 O2 doub N N 103 DT C2 N3 sing N N 104 DT N3 C4 sing N N 105 DT N3 H3 sing N N 106 DT C4 O4 doub N N 107 DT C4 C5 sing N N 108 DT C5 C7 sing N N 109 DT C5 C6 doub N N 110 DT C7 H71 sing N N 111 DT C7 H72 sing N N 112 DT C7 H73 sing N N 113 DT C6 H6 sing N N 114 # loop_ _ndb_struct_conf_na.entry_id _ndb_struct_conf_na.feature 9TNR 'double helix' 9TNR 'quadruple helix' # loop_ _ndb_struct_na_base_pair.model_number _ndb_struct_na_base_pair.i_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.j_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.shear _ndb_struct_na_base_pair.stretch _ndb_struct_na_base_pair.stagger _ndb_struct_na_base_pair.buckle _ndb_struct_na_base_pair.propeller _ndb_struct_na_base_pair.opening _ndb_struct_na_base_pair.pair_number _ndb_struct_na_base_pair.pair_name _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_28 _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_12 1 A DA 3 1_555 A DT 15 1_555 -0.152 1.293 -0.709 -5.048 -39.726 170.779 1 A_DA3:DT15_A A 3 ? A 15 ? 21 2 1 A DG 22 1_555 A DG 16 1_555 2.214 2.969 -0.017 5.824 -3.637 -89.822 2 A_DG22:DG16_A A 22 ? A 16 ? 6 3 1 A DG 23 1_555 A DG 17 1_555 -2.056 -3.017 -0.024 -7.301 3.396 93.095 3 A_DG23:DG17_A A 23 ? A 17 ? 6 3 1 A DG 5 1_555 A DG 11 1_555 2.180 3.041 -0.154 -1.457 1.188 -91.691 4 A_DG5:DG11_A A 5 ? A 11 ? 6 3 1 A DG 6 1_555 A DG 24 1_555 -2.623 -2.617 0.491 -15.275 0.198 88.827 5 A_DG6:DG24_A A 6 ? A 24 ? 6 3 1 A DG 10 1_555 A DG 18 1_555 2.524 2.711 0.205 -5.582 -0.950 -88.479 6 A_DG10:DG18_A A 10 ? A 18 ? 6 3 1 A DA 7 1_555 A DT 25 1_555 0.155 1.451 -1.134 -28.594 17.624 142.886 7 A_DA7:DT25_A A 7 ? A 25 ? 21 2 # loop_ _ndb_struct_na_base_pair_step.model_number _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_comp_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_symmetry_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_comp_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_symmetry_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_comp_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_symmetry_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_comp_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_symmetry_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.shift _ndb_struct_na_base_pair_step.slide _ndb_struct_na_base_pair_step.rise _ndb_struct_na_base_pair_step.tilt _ndb_struct_na_base_pair_step.roll _ndb_struct_na_base_pair_step.twist _ndb_struct_na_base_pair_step.x_displacement _ndb_struct_na_base_pair_step.y_displacement _ndb_struct_na_base_pair_step.helical_rise _ndb_struct_na_base_pair_step.inclination _ndb_struct_na_base_pair_step.tip _ndb_struct_na_base_pair_step.helical_twist _ndb_struct_na_base_pair_step.step_number _ndb_struct_na_base_pair_step.step_name _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_PDB_ins_code_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_PDB_ins_code_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_PDB_ins_code_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_PDB_ins_code_2 1 A DA 3 1_555 A DT 15 1_555 A DG 22 1_555 A DG 16 1_555 -2.709 0.503 -0.274 -66.055 156.714 -7.972 0.526 -1.031 -1.531 -82.615 -34.822 -170.091 1 AA_DA3DG22:DG16DT15_AA A 3 ? A 15 ? A 22 ? A 16 ? 1 A DG 22 1_555 A DG 16 1_555 A DG 23 1_555 A DG 17 1_555 -2.343 -2.464 -0.110 78.259 -159.301 137.731 -1.214 1.180 0.322 -79.727 -39.167 179.094 2 AA_DG22DG23:DG17DG16_AA A 22 ? A 16 ? A 23 ? A 17 ? 1 A DG 23 1_555 A DG 17 1_555 A DG 5 1_555 A DG 11 1_555 2.220 3.082 0.238 -2.216 -0.887 -179.152 -1.541 1.110 0.238 0.443 -1.108 -179.153 3 AA_DG23DG5:DG11DG17_AA A 23 ? A 17 ? A 5 ? A 11 ? 1 A DG 5 1_555 A DG 11 1_555 A DG 6 1_555 A DG 24 1_555 2.014 1.248 2.792 9.975 -0.922 -62.817 -1.152 2.269 2.497 0.879 9.506 -63.530 4 AA_DG5DG6:DG24DG11_AA A 5 ? A 11 ? A 6 ? A 24 ? 1 A DG 6 1_555 A DG 24 1_555 A DG 10 1_555 A DG 18 1_555 -1.891 -3.171 0.642 -3.494 10.679 179.033 -1.586 0.945 0.640 5.340 1.747 179.038 5 AA_DG6DG10:DG18DG24_AA A 6 ? A 24 ? A 10 ? A 18 ? 1 A DG 10 1_555 A DG 18 1_555 A DA 7 1_555 A DT 25 1_555 4.842 2.673 1.804 8.602 -29.550 -146.431 -1.318 2.542 1.895 15.399 4.483 -147.668 6 AA_DG10DA7:DT25DG18_AA A 10 ? A 18 ? A 7 ? A 25 ? # _pdbx_audit_support.funding_organization 'Slovenian Research Agency' _pdbx_audit_support.country Slovenia _pdbx_audit_support.grant_number ? _pdbx_audit_support.ordinal 1 # loop_ _pdbx_nmr_spectrometer.spectrometer_id _pdbx_nmr_spectrometer.model _pdbx_nmr_spectrometer.type _pdbx_nmr_spectrometer.manufacturer _pdbx_nmr_spectrometer.field_strength _pdbx_nmr_spectrometer.details 1 'AVANCE NEO' ? Bruker 600 ? 2 'AVANCE NEO' ? Bruker 800 ? # _atom_sites.entry_id 9TNR _atom_sites.Cartn_transf_matrix[1][1] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[1][2] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[1][3] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[2][1] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[2][2] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[2][3] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[3][1] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[3][2] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[3][3] ? _atom_sites.Cartn_transf_vector[1] ? _atom_sites.Cartn_transf_vector[2] ? _atom_sites.Cartn_transf_vector[3] ? _atom_sites.Cartn_transform_axes ? _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0.00000 _atom_sites.solution_primary ? _atom_sites.solution_secondary ? _atom_sites.solution_hydrogens ? _atom_sites.special_details ? # loop_ _atom_type.symbol C H N O P # loop_ #