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_refine.pdbx_ls_cross_valid_method ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values 'REAL-SPACE (WEIGHTED MAP SUM AT ATOM CENTERS)' _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_real_space_R ? _refine.pdbx_density_correlation ? _refine.pdbx_pd_number_of_powder_patterns ? _refine.pdbx_pd_number_of_points ? _refine.pdbx_pd_meas_number_of_points ? _refine.pdbx_pd_proc_ls_prof_R_factor ? _refine.pdbx_pd_proc_ls_prof_wR_factor ? _refine.pdbx_pd_Marquardt_correlation_coeff ? _refine.pdbx_pd_Fsqrd_R_factor ? _refine.pdbx_pd_ls_matrix_band_width ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.pdbx_diffrn_id ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.overall_SU_R_free ? _refine.overall_FOM_free_R_set ? _refine.overall_FOM_work_R_set ? _refine.pdbx_average_fsc_overall ? _refine.pdbx_average_fsc_work ? _refine.pdbx_average_fsc_free ? # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_Zscore _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.003 ? 25188 ? f_bond_d ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.655 ? 35064 ? f_angle_d ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 17.519 ? 5813 ? f_dihedral_angle_d ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.039 ? 4160 ? f_chiral_restr ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.004 ? 3692 ? f_plane_restr ? ? ? # _struct.entry_id 9UH7 _struct.title 'large lobe of human Ribonuclease MRP' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 9UH7 _struct_keywords.text 'RNase MRP, RNA BINDING PROTEIN/RNA, RNA BINDING PROTEIN-RNA complex' _struct_keywords.pdbx_keywords 'RNA BINDING PROTEIN/RNA' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? F N N 6 ? G N N 7 ? H N N 8 ? I N N 8 ? J N N 9 ? K N N 10 ? L N N 11 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 PDB 9UH7 9UH7 ? 1 ? 1 2 UNP POP1_HUMAN Q99575 ? 2 ;MSNAKERKHAKKMRNQPTNVTLSSGFVADRGVKHHSGGEKPFQAQKQEPHPGTSRQRQTRVNPHSLPDPEVNEQSSSKGM FRKKGGWKAGPEGTSQEIPKYITASTFAQARAAEISAMLKAVTQKSSNSLVFQTLPRHMRRRAMSHNVKRLPRRLQEIAQ KEAEKAVHQKKEHSKNKCHKARRCHMNRTLEFNRRQKKNIWLETHIWHAKRFHMVKKWGYCLGERPTVKSHRACYRAMTN RCLLQDLSYYCCLELKGKEEEILKALSGMCNIDTGLTFAAVHCLSGKRQGSLVLYRVNKYPREMLGPVTFIWKSQRTPGD PSESRQLWIWLHPTLKQDILEEIKAACQCVEPIKSAVCIADPLPTPSQEKSQTELPDEKIGKKRKRKDDGENAKPIKKII GDGTRDPCLPYSWISPTTGIIISDLTMEMNRFRLIGPLSHSILTEAIKAASVHTVGEDTEETPHRWWIETCKKPDSVSLH CRQEAIFELLGGITSPAEIPAGTILGLTVGDPRINLPQKKSKALPNPEKCQDNEKVRQLLLEGVPVECTHSFIWNQDICK SVTENKISDQDLNRMRSELLVPGSQLILGPHESKIPILLIQQPGKVTGEDRLGWGSGWDVLLPKGWGMAFWIPFIYRGVR VGGLKESAVHSQYKRSPNVPGDFPDCPAGMLFAEEQAKNLLEKYKRRPPAKRPNYVKLGTLAPFCCPWEQLTQDWESRVQ AYEEPSVASSPNGKESDLRRSEVPCAPMPKKTHQPSDEVGTSIEHPREAEEVMDAGCQESAGPERITDQEASENHVAATG SHLCVLRSRKLLKQLSAWCGPSSEDSRGGRRAPGRGQQGLTREACLSILGHFPRALVWVSLSLLSKGSPEPHTMICVPAK EDFLQLHEDWHYCGPQESKHSDPFRSKILKQKEKKKREKRQKPGRASSDGPAGEEPVAGQEALTLGLWSGPLPRVTLHCS RTLLGFVTQGDFSMAVGCGEALGFVSLTGLLDMLSSQPAAQRGLVLLRPPASLQYRFARIAIEV ; 1 3 UNP RPP29_HUMAN O95707 ? 3 ;MKSVIYHALSQKEANDSDVQPSGAQRAEAFVRAFLKRSTPRMSPQAREDQLQRKAVVLEYFTRHKRKEKKKKAKGLSARQ RRELRLFDIKPEQQRYSLFLPLHELWKQYIRDLCSGLKPDTQPQMIQAKLLKADLHGAIISVTKSKCPSYVGITGILLQE TKHIFKIITKEDRLKVIPKLNCVFTVETDGFISYIYGSKFQLRSSERSAKKFKAKGTIDL ; 1 4 UNP POP5_HUMAN Q969H6 ? 4 ;MVRFKHRYLLCELVSDDPRCRLSLDDRVLSSLVRDTIARVHGTFGAAACSIGFAVRYLNAYTGIVLLRCRKEFYQLVWSA LPFITYLENKGHRYPCFFNTLHVGGTIRTCQKFLIQYNRRQLLILLQNCTDEGEREAIQKSVTRSCLLEEEEESGEEAAE AME ; 1 5 UNP RPP25_HUMAN Q9BUL9 ? 5 ;MENFRKVRSEEAPAGCGAEGGGPGSGPFADLAPGAVHMRVKEGSKIRNLMAFATASMAQPATRAIVFSGCGRATTKTVTC AEILKRRLAGLHQVTRLRYRSVREVWQSLPPGPTQGQTPGEPAASLSVLKNVPGLAILLSKDALDPRQPGYQPPNPHPGP SSPPAAPASKRSLGEPAAGEGSAKRSQPEPGVADEDQTA ; 1 6 UNP POP7_HUMAN O75817 ? 6 ;MAENREPRGAVEAELDPVEYTLRKRLPSRLPRRPNDIYVNMKTDFKAQLARCQKLLDGGARGQNACSEIYIHGLGLAINR AINIALQLQAGSFGSLQVAANTSTVELVDELEPETDTREPLTRIRNNSAIHIRVFRVTPK ; 1 7 UNP RPP14_HUMAN O95059 ? 7 ;MPAPAATYERVVYKNPSEYHYMKVCLEFQDCGVGLNAAQFKQLLISAVKDLFGEVDAALPLDILTYEEKTLSAILRICSS GLVKLWSSLTLLGSYKGKKCAFRVIQVSPFLLALSGNSRELVLD ; 1 8 UNP RPP30_HUMAN P78346 ? 8 ;MAVFADLDLRAGSDLKALRGLVETAAHLGYSVVAINHIVDFKEKKQEIEKPVAVSELFTTLPIVQGKSRPIKILTRLTII VSDPSHCNVLRATSSRARLYDVVAVFPKTEKLFHIACTHLDVDLVCITVTEKLPFYFKRPPINVAIDRGLAFELVYSPAI KDSTMRRYTISSALNLMQICKGKNVIISSAAERPLEIRGPYDVANLGLLFGLSESDAKAAVSTNCRAALLHGETRKTAFG IISTVKKPRPSEGDEDCLPASKKAKCEG ; 1 9 UNP CR021_HUMAN Q32NC0 ? 9 ;MRQKHYLEAAARGLHDSCPGQARYLLWAYTSSHDDKSTFEETCPYCFQLLVLDNSRVRLKPKARLTPKIQKLLNREARNY TLSFKEAKMVKKFKDSKSVLLITCKTCNRTVKHHGKSRSFVSTLKSNPATPTSKLSLKTPERRTANPNHDMSGSKGKSPA SVFRTPTSGQSVSTCSSKNTSKTKKHFSQLKMLLSQNESQKIPKVDFRNFLSSLKGGLLK ; 1 10 UNP RPP40_HUMAN O75818 ? 10 ;MATLRRLREAPRHLLVCEKSNFGNHKSRHRHLVQTHYYNYRVSFLIPECGILSEELKNLVMNTGPYYFVKNLPLHELITP EFISTFIKKGSCYALTYNTHIDEDNTVALLPNGKLILSLDKDTYEETGLQGHPSQFSGRKIMKFIVSIDLMELSLNLDSK KYERISWSFKEKKPLKFDFLLAWHKTGSEESTMMSYFSKYQIQEHQPKVALSTLRDLQCPVLQSSELEGTPEVSCRALEL FDWLGAVFSNVDLNNEPNNFISTYCCPEPSTVVAKAYLCTITGFILPEKICLLLEHLCHYFDEPKLAPWVTLSVQGFADS PVSWEKNEHGFRKGGEHLYNFVIFNNQDYWLQMAVGANDHCPP ; 1 11 UNP NEPRO_HUMAN Q6NW34 ? 11 ;MMAAVPPGLEPWNRVRIPKAGNRSAVTVQNPGAALDLCIAAVIKECHLVILSLKSQTLDAETDVLCAVLYSNHNRMGRHK PHLALKQVEQCLKRLKNMNLEGSIQDLFELFSSNENQPLTTKVCVVPSQPVVELVLMKVLGACKLLLRLLDCCCKTFLLT VKHLGLQEFIILNLVMVGLVSRLWVLYKGVLKRLILLYEPLFGLLQEVARIQPMPYFKDFTFPSDITEFLGQPYFEAFKK KMPIAFAAKGINKLLNKLFLINEQSPRASEETLLGISKKAKQMKINVQNNVDLGQPVKNKRVFKEESSEFDVRAFCNQLK HKATQETSFDFKCSQSRLKTTKYSSQKVIGTPHAKSFVQRFREAESFTQLSEEIQMAVVWCRSKKLKAQAIFLGNKLLKS NRLKHLEAQGTSLPKKLECIKTSICNHLLRGSGIKTSKHHLRQRRSQNKFLRRQRKPQRKLQSTLLREIQQFSQGTRKSA TDTSAKWRLSHCTVHRTDLYPNSKQLLNSGVSMPVIQTKEKMIHENLRGIHENETDSWTVMQINKNSTSGTIKETDDIDD IFALMGV ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 9UH7 A 1 ? 270 ? 9UH7 1 ? 270 ? 1 270 2 2 9UH7 B 1 ? 1024 ? Q99575 1 ? 1024 ? 1 1024 3 3 9UH7 D 1 ? 220 ? O95707 1 ? 220 ? 1 220 4 4 9UH7 E 1 ? 163 ? Q969H6 1 ? 163 ? 1 163 5 5 9UH7 F 1 ? 199 ? Q9BUL9 1 ? 199 ? 1 199 6 6 9UH7 G 1 ? 140 ? O75817 1 ? 140 ? 1 140 7 7 9UH7 H 1 ? 124 ? O95059 1 ? 124 ? 1 124 8 8 9UH7 I 1 ? 268 ? P78346 1 ? 268 ? 1 268 9 8 9UH7 J 1 ? 268 ? P78346 1 ? 268 ? 1 268 10 9 9UH7 K 1 ? 220 ? Q32NC0 1 ? 220 ? 1 220 11 10 9UH7 L 1 ? 363 ? O75818 1 ? 363 ? 1 363 12 11 9UH7 M 1 ? 567 ? Q6NW34 1 ? 567 ? 1 567 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details 12-meric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 12 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'mass spectrometry' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'not applicable' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 THR B 103 ? 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ASP B 532 GLU B 542 1 ? 11 HELX_P HELX_P16 AB7 PRO B 545 ? THR B 549 ? PRO B 545 THR B 549 5 ? 5 HELX_P HELX_P17 AB8 SER B 551 ? TRP B 554 ? SER B 551 TRP B 554 5 ? 4 HELX_P HELX_P18 AB9 ASN B 555 ? ASN B 565 ? ASN B 555 ASN B 565 1 ? 11 HELX_P HELX_P19 AC1 SER B 568 ? SER B 577 ? SER B 568 SER B 577 1 ? 10 HELX_P HELX_P20 AC2 GLY B 627 ? GLY B 638 ? GLY B 627 GLY B 638 1 ? 12 HELX_P HELX_P21 AC3 GLY B 643 ? ARG B 655 ? GLY B 643 ARG B 655 1 ? 13 HELX_P HELX_P22 AC4 CYS B 666 ? LYS B 685 ? CYS B 666 LYS B 685 1 ? 20 HELX_P HELX_P23 AC5 ASN B 694 ? GLY B 699 ? ASN B 694 GLY B 699 1 ? 6 HELX_P HELX_P24 AC6 TRP B 708 ? TYR B 722 ? TRP B 708 TYR B 722 1 ? 15 HELX_P HELX_P25 AC7 SER B 808 ? GLY B 820 ? SER B 808 GLY B 820 1 ? 13 HELX_P HELX_P26 AC8 THR B 841 ? PHE B 852 ? THR B 841 PHE B 852 1 ? 12 HELX_P HELX_P27 AC9 ALA B 879 ? ASP B 889 ? ALA B 879 ASP B 889 1 ? 11 HELX_P HELX_P28 AD1 ARG B 905 ? LYS B 919 ? ARG B 905 LYS B 919 1 ? 15 HELX_P HELX_P29 AD2 ARG B 954 ? CYS B 959 ? 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GLY E 42 SER E 50 1 ? 9 HELX_P HELX_P44 AE8 TYR D 74 ? SER D 79 ? TYR E 74 SER E 79 1 ? 6 HELX_P HELX_P45 AE9 ALA D 80 ? ILE D 84 ? ALA E 80 ILE E 84 5 ? 5 HELX_P HELX_P46 AF1 THR D 106 ? LEU D 126 ? THR E 106 LEU E 126 1 ? 21 HELX_P HELX_P47 AF2 ASP D 131 ? THR D 143 ? ASP E 131 THR E 143 1 ? 13 HELX_P HELX_P48 AF3 ARG D 144 ? LEU D 147 ? ARG E 144 LEU E 147 5 ? 4 HELX_P HELX_P49 AF4 LYS E 45 ? GLN E 59 ? LYS F 45 GLN F 59 1 ? 15 HELX_P HELX_P50 AF5 ALA E 73 ? LEU E 88 ? ALA F 73 LEU F 88 1 ? 16 HELX_P HELX_P51 AF6 ASP F 44 ? GLY F 58 ? ASP G 44 GLY G 58 1 ? 15 HELX_P HELX_P52 AF7 LEU F 76 ? SER F 92 ? LEU G 76 SER G 92 1 ? 17 HELX_P HELX_P53 AF8 ASN G 36 ? GLY G 53 ? ASN H 36 GLY H 53 1 ? 18 HELX_P HELX_P54 AF9 LEU G 82 ? LEU G 92 ? LEU H 82 LEU H 92 1 ? 11 HELX_P HELX_P55 AG1 ASP H 14 ? GLY H 29 ? ASP I 14 GLY I 29 1 ? 16 HELX_P HELX_P56 AG2 HIS H 86 ? ALA H 92 ? HIS I 86 ALA I 92 1 ? 7 HELX_P HELX_P57 AG3 SER H 94 ? TYR H 100 ? 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'G-C PAIR' ? ? ? # _struct_conn_type.id hydrog _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # _struct_mon_prot_cis.pdbx_id 1 _struct_mon_prot_cis.label_comp_id GLU _struct_mon_prot_cis.label_seq_id 268 _struct_mon_prot_cis.label_asym_id K _struct_mon_prot_cis.label_alt_id . _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code ? _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id GLU _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id 268 _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id L _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 PRO _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 269 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 K _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 ? _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 PRO _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 269 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 L _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num 1 _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle -1.28 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 2 ? AA2 ? 6 ? AA3 ? 6 ? AA4 ? 8 ? AA5 ? 7 ? AA6 ? 4 ? 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OXT O N N 520 VAL H H N N 521 VAL H2 H N N 522 VAL HA H N N 523 VAL HB H N N 524 VAL HG11 H N N 525 VAL HG12 H N N 526 VAL HG13 H N N 527 VAL HG21 H N N 528 VAL HG22 H N N 529 VAL HG23 H N N 530 VAL HXT H N N 531 # loop_ _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_ordinal A OP3 P sing N N 1 A OP3 HOP3 sing N N 2 A P OP1 doub N N 3 A P OP2 sing N N 4 A P "O5'" sing N N 5 A OP2 HOP2 sing N N 6 A "O5'" "C5'" sing N N 7 A "C5'" "C4'" sing N N 8 A "C5'" "H5'" sing N N 9 A "C5'" "H5''" sing N N 10 A "C4'" "O4'" sing N N 11 A "C4'" "C3'" sing N N 12 A "C4'" "H4'" sing N N 13 A "O4'" "C1'" sing N N 14 A "C3'" "O3'" sing N N 15 A "C3'" "C2'" sing N N 16 A "C3'" "H3'" sing N N 17 A "O3'" "HO3'" sing N N 18 A "C2'" "O2'" sing N N 19 A "C2'" "C1'" sing N N 20 A "C2'" "H2'" sing N N 21 A "O2'" "HO2'" sing N N 22 A "C1'" N9 sing N N 23 A "C1'" "H1'" 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