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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.585 ? 35849 ? f_angle_d ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 5.127 ? 3652 ? f_dihedral_angle_d ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.043 ? 4014 ? f_chiral_restr ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.005 ? 4718 ? f_plane_restr ? ? ? # _struct.entry_id 9UKA _struct.title 'CryoEM structure of Brucella melitensis CobN-CobS-CobT holoenzyme with AMPPNP (conformation 3)' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 9UKA _struct_keywords.text 'Cobaltochelatase holoenzyme, CobN-CobS-CobT complex, AMPPNP, LIGASE' _struct_keywords.pdbx_keywords LIGASE # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 1 ? D N N 1 ? E N N 1 ? F N N 1 ? G N N 2 ? H N N 2 ? I N N 3 ? J N N 4 ? K N N 4 ? L N N 4 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP A0AB36PZV1_BRUML A0AB36PZV1 ? 1 ;MNKVERDIANLPDTTVSVREVFGIDSDMMVPAYAAGDSYVPELDPDYLFDRQTTLAILAGFAYNRRVMVSGYHGTGKSTH IEQVAARLNWPCVRVNLDSHVSRIDLVGKDAIVVKEGVQVTEFKDGILPWAYQHNVALVFDEYDAGRPDVMFVIQRVLES SGRLTLLDQSRVIRPHPAFRLFATANTVGLGDTTGLYHGTQQINQAQMDRWSIVTTLNYLPHDNEVNIVLVKAKHYQNAE GREIVNKMVRVADMTRQAFINGDLSTVMSPRTVITWAENAAIFNDVGFAFRLTFLNKCDELERATVAEFYQRAFGVELPE SAANIVLA ; 1 2 UNP A0AB36PXH5_BRUML A0AB36PXH5 ? 2 ;MSGQMSGIGDNSRDRKTGPVDSEPFKRAITACVRAISGDHEMEVAFSHDRPALSANRARLPDLPKRPTAHDIAVTRGLGD SMALRQARHNPRIHAALAPEGKQARAIFDAVEQARVEAIGARAMAGVADNLSTMLADKYSRANFSAVTTKEDAPLEEAVS LLLREKLTGRPAPAEAGQVLELWRDWIEQKASADIARLGENLEDQQAFARTVRDMLASMDMAEELSQEEPSDDEEQNDEQ TPDSDENEEGGDENQEGSDSAESEESDSSSDEGEQGEMDAADASADEMDDSEDIDAETPGDTRRPNQPFANFAEHVDYKV FTREFDEEVEATDLCDEAELDRLRGFLDKQLANLQGVVGRLANRLQRRLMAQQNRSWDFDLEEGYLDSARLVRIVIDPTQ PLSYKQERDTDFRDTVVTLVLDNSGSMRGRPITVAATCADILARTLERCGVKVEILGFTTKAWKGGQSREAWLGRGKPAN PGRLNDLRHIVYKSADAPWRRARRNLGLMMREGLLKENIDGEALIWAHQRLLGRPEQRKILMMISDGAPVDDSTLSVNPG NYLERHLRAVIEEIETRSPVELIAIGIGHDVTRYYQRAVTIVDAEELAGAMTEQLASLFEEQGAAASVRGRRRAGRR ; 1 3 UNP A0AB36PS61_BRUML A0AB36PS61 ? 3 ;MHLLLAQKGTISDGNEAVDLGQTPGEIVFLSAADTELASIAQAHRLAPDMPSLRLANFLGLTHPMSVDAYVERTARHAKL IVVRIIGGETYWPYGLEALHACAITHGAKMAVLPGDDKPDHGLDRFSTIPAGERDDLWHYLIESGAANTHGFLAYCKALI SGCEKPEAAAPLLKAGLWWPGEAVSSLTSVQRHWADPAAPVAAIILYRALVQSGQTQPVDALIAALQARGLNPLPIFVSS LKDPLSAAVVDGLFEDCPPDIVLNATGFAISSPGAERKPTVLDKRGNMVLQVIFSGTPKTVWEASQQGLLARDLAMNVAL PEVDGRVLSRAVSFKSAQQFDASVEANIVTHEPHPDRVAFVAELAANWVRLKRKPPAERRVALILANYPNRDGRLGNGVG LDTPAGTVEVLRAMAAEGYRVGEIPADSDALMRALMAGPTNAARDGREIRETISLNQYKALFGKLALTIQAEVEARWGAP ENDPYFARELDAFALPLMRFGETFVGIQPARGYNIDPKETYHSLDLVPPHGYIAYYAYLRAVAGVDAVVHMGKHGNLEWL PGKALALSQNCYPEAVFGPMPHIYPFIVNDPGEGTQAKRRASAVIIDHLTPPLTRAESYGPLKDLEALVDEYYEASGVDP RRLLRLKAQILDLVRDIGLDRDAGIHDHDDEDMALQKLDAYLCDLKEMQIRDGLHVFGLAPQARLLTDLLVALARVPRGI PVSLGGAPGDQSLQRAIAADAGLGEGFDPLDCNMAEPWAGAKPDMLLAASPATWRIAGDTVERIEILAAQLVAGEVPCPE DWTQTRAVLQSIEEQLRPMVVSCGPSEIDGFLAALSGRFVPPGPSGAPTRGRPDVLPTGRNFFSTDSRAVPTPAAWELGK KSAELLITRYTQDHGEWPTSFGLTAWGTSNMRTGGDDIAQALALIGVQPVWDMASRRVTGYEIVPPAKLARPRVDVTLRI SGFFRDAFPEQIALFDKAVRAVGALDEDVEDNPIAARMKAEQARLVAGGADPQTAERRAGYRVFGSKPGAYGAGLQALID ENGWAGRNDLAEAWLVWGGYAYGAGEEGQAERGLLEERLRSVQAVVQNQDNREHDLLDSDDYYQFEGGMAATVESLTGAM PSVYHNDHSRPEKPVIRALEEELSRVVRGRAANPKWIAGVMRHGYKGAAEIAATVDYLFAFAATTGKVGNHHFEAVYQAY IADRAVHDFMAEKNPAALAETAAKLNEAIERGFWTPRSNSARFELENLSVHLQKLNPERAING ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 9UKA A 1 ? 328 ? 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A0AB36PS61 1 ? 1263 ? 1 1263 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details nonameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 9 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'not applicable' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 VAL A 18 ? PHE A 22 ? VAL A 18 PHE A 22 1 ? 5 HELX_P HELX_P2 AA2 ASP A 50 ? TYR A 63 ? ASP A 50 TYR A 63 1 ? 14 HELX_P HELX_P3 AA3 SER A 78 ? LEU A 88 ? SER A 78 LEU A 88 1 ? 11 HELX_P HELX_P4 AA4 SER A 102 ? VAL A 107 ? SER A 102 VAL A 107 1 ? 6 HELX_P HELX_P5 AA5 GLY A 126 ? GLN A 133 ? GLY A 126 GLN A 133 1 ? 8 HELX_P HELX_P6 AA6 PHE A 152 ? GLU A 159 ? PHE A 152 GLU A 159 1 ? 8 HELX_P HELX_P7 AA7 ALA A 206 ? TRP A 211 ? ALA A 206 TRP A 211 1 ? 6 HELX_P HELX_P8 AA8 PRO A 221 ? ALA A 233 ? PRO A 221 ALA A 233 1 ? 13 HELX_P HELX_P9 AA9 LYS A 234 ? GLN A 237 ? LYS A 234 GLN A 237 5 ? 4 HELX_P HELX_P10 AB1 ASN A 238 ? GLY A 262 ? ASN A 238 GLY A 262 1 ? 25 HELX_P HELX_P11 AB2 SER A 269 ? ASN A 284 ? SER A 269 ASN A 284 1 ? 16 HELX_P HELX_P12 AB3 VAL A 286 ? LEU A 292 ? VAL A 286 LEU A 292 1 ? 7 HELX_P HELX_P13 AB4 ASP A 299 ? GLY A 315 ? ASP A 299 GLY A 315 1 ? 17 HELX_P HELX_P14 AB5 ALA A 322 ? VAL A 326 ? ALA A 322 VAL A 326 5 ? 5 HELX_P HELX_P15 AB6 VAL B 18 ? GLY B 23 ? 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SER C 78 ASN C 89 1 ? 12 HELX_P HELX_P30 AD3 SER C 102 ? VAL C 107 ? SER C 102 VAL C 107 1 ? 6 HELX_P HELX_P31 AD4 ILE C 127 ? HIS C 134 ? ILE C 127 HIS C 134 1 ? 8 HELX_P HELX_P32 AD5 ARG C 147 ? VAL C 157 ? ARG C 147 VAL C 157 1 ? 11 HELX_P HELX_P33 AD6 LEU C 158 ? SER C 160 ? LEU C 158 SER C 160 5 ? 3 HELX_P HELX_P34 AD7 ALA C 206 ? ARG C 210 ? ALA C 206 ARG C 210 5 ? 5 HELX_P HELX_P35 AD8 PRO C 221 ? VAL C 231 ? PRO C 221 VAL C 231 1 ? 11 HELX_P HELX_P36 AD9 LYS C 232 ? GLN C 237 ? LYS C 232 GLN C 237 5 ? 6 HELX_P HELX_P37 AE1 ASN C 238 ? ASN C 261 ? ASN C 238 ASN C 261 1 ? 24 HELX_P HELX_P38 AE2 SER C 269 ? ASN C 284 ? SER C 269 ASN C 284 1 ? 16 HELX_P HELX_P39 AE3 PHE C 288 ? PHE C 294 ? PHE C 288 PHE C 294 1 ? 7 HELX_P HELX_P40 AE4 ASP C 299 ? PHE C 314 ? ASP C 299 PHE C 314 1 ? 16 HELX_P HELX_P41 AE5 VAL D 18 ? GLY D 23 ? VAL D 18 GLY D 23 1 ? 6 HELX_P HELX_P42 AE6 ASP D 50 ? TYR D 63 ? ASP D 50 TYR D 63 1 ? 14 HELX_P HELX_P43 AE7 LYS D 77 ? LEU D 88 ? 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