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EMDB EMD-64886 ? ? # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal _pdbx_audit_revision_history.data_content_type _pdbx_audit_revision_history.major_revision _pdbx_audit_revision_history.minor_revision _pdbx_audit_revision_history.revision_date _pdbx_audit_revision_history.part_number 1 'Structure model' 1 0 2026-06-10 ? 2 'EM metadata' 1 0 2026-06-10 ? 3 FSC 1 0 2026-06-10 ? 4 'Half map' 1 0 2026-06-10 1 5 'Half map' 1 0 2026-06-10 2 6 Image 1 0 2026-06-10 ? 7 Mask 1 0 2026-06-10 1 8 'Primary map' 1 0 2026-06-10 ? # loop_ _pdbx_audit_revision_details.ordinal _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_details.data_content_type _pdbx_audit_revision_details.provider _pdbx_audit_revision_details.type _pdbx_audit_revision_details.description _pdbx_audit_revision_details.details 1 1 'Structure model' repository 'Initial release' ? ? 2 2 'EM metadata' repository 'Initial release' ? ? 3 3 FSC repository 'Initial release' ? ? 4 4 'Half map' repository 'Initial release' ? ? 5 5 'Half map' repository 'Initial release' ? ? 6 6 Image repository 'Initial release' ? ? 7 7 Mask repository 'Initial release' ? ? 8 8 'Primary map' repository 'Initial release' ? ? # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 9V9S _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2025-06-02 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site PDBJ _pdbx_database_status.process_site PDBC _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y # _pdbx_database_related.db_name EMDB _pdbx_database_related.details 'Cryo-EM structure of the ncPRC1.1 complex bound to the H2AK119ubH2BK120ub-modified nucleosome' _pdbx_database_related.db_id EMD-64886 _pdbx_database_related.content_type 'associated EM volume' # _pdbx_contact_author.id 3 _pdbx_contact_author.email huangjing@shsmu.edu.com _pdbx_contact_author.name_first Jing _pdbx_contact_author.name_last Huang _pdbx_contact_author.name_mi ? _pdbx_contact_author.role 'principal investigator/group leader' _pdbx_contact_author.identifier_ORCID 0000-0002-0481-8702 # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Yu, Y.' 1 0009-0005-3856-5802 'Cai, D.' 2 ? 'Zhang, Y.Z.' 3 0000-0002-2746-0096 'Huang, J.' 4 0000-0002-0481-8702 # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country ? _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev 'To Be Published' _citation.journal_id_ASTM ? _citation.journal_id_CSD 0353 _citation.journal_id_ISSN ? _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume ? _citation.language ? _citation.page_first ? _citation.page_last ? _citation.title 'Structural mechanisms of PRC1-mediated interplay between gene repression and activation' _citation.year ? _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI ? _citation.pdbx_database_id_PubMed ? _citation.pdbx_database_id_patent ? _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Yu, Y.' 1 0009-0005-3856-5802 primary 'Cai, D.' 2 ? primary 'Zhang, Y.Z.' 3 0000-0002-2746-0096 primary 'Huang, J.' 4 0000-0002-0481-8702 # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer man 'RING1 and YY1-binding protein' 24863.625 2 ? ? ? ? 2 polymer man 'Histone H3' 15435.126 2 ? ? ? ? 3 polymer man 'Histone H4' 11394.426 2 ? ? ? ? 4 polymer man 'Histone H2A' 14083.398 2 ? 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PRHLQLAVRNDEELNKLLGRVTIAQGGVLPNIQSVLLPKCTESSKSAKSK ; C,G ? 5 'polypeptide(L)' no no ;MPDPAKSAPAAKKGSKKAVTKTQKKDGKKRRKTRKESYAIYVYKVLKQVHPDTGISSKAMSIMNSFVNDVFERIAGEASR LAHYNKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTCYTSAK ; ;MPDPAKSAPAAKKGSKKAVTKTQKKDGKKRRKTRKESYAIYVYKVLKQVHPDTGISSKAMSIMNSFVNDVFERIAGEASR LAHYNKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTCYTSAK ; D,H ? 6 'polypeptide(L)' no no MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGC MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGC K,O ? 7 polydeoxyribonucleotide no no ;(DC)(DG)(DA)(DG)(DA)(DA)(DT)(DC)(DC)(DC)(DG)(DG)(DT)(DG)(DC)(DC)(DG)(DA)(DG)(DG) (DC)(DC)(DG)(DC)(DT)(DC)(DA)(DA)(DT)(DT)(DG)(DG)(DT)(DC)(DG)(DT)(DA)(DG)(DA)(DC) (DA)(DG)(DC)(DT)(DC)(DT)(DA)(DG)(DC)(DA)(DC)(DC)(DG)(DC)(DT)(DT)(DA)(DA)(DA)(DC) (DG)(DC)(DA)(DC)(DG)(DT)(DA)(DC)(DG)(DC)(DG)(DC)(DT)(DG)(DT)(DC)(DC)(DC)(DC)(DC) (DG)(DC)(DG)(DT)(DT)(DT)(DT)(DA)(DA)(DC)(DC)(DG)(DC)(DC)(DA)(DA)(DG)(DG)(DG)(DG) (DA)(DT)(DT)(DA)(DC)(DT)(DC)(DC)(DC)(DT)(DA)(DG)(DT)(DC)(DT)(DC)(DC)(DA)(DG)(DG) (DC)(DA) ; ;CGAGAATCCCGGTGCCGAGGCCGCTCAATTGGTCGTAGACAGCTCTAGCACCGCTTAAACGCACGTACGCGCTGTCCCCC GCGTTTTAACCGCCAAGGGGATTACTCCCTAGTCTCCAGGCA ; I ? 8 polydeoxyribonucleotide no no ;(DT)(DG)(DC)(DC)(DT)(DG)(DG)(DA)(DG)(DA)(DC)(DT)(DA)(DG)(DG)(DG)(DA)(DG)(DT)(DA) (DA)(DT)(DC)(DC)(DC)(DC)(DT)(DT)(DG)(DG)(DC)(DG)(DG)(DT)(DT)(DA)(DA)(DA)(DA)(DC) (DG)(DC)(DG)(DG)(DG)(DG)(DG)(DA)(DC)(DA)(DG)(DC)(DG)(DC)(DG)(DT)(DA)(DC)(DG)(DT) (DG)(DC)(DG)(DT)(DT)(DT)(DA)(DA)(DG)(DC)(DG)(DG)(DT)(DG)(DC)(DT)(DA)(DG)(DA)(DG) (DC)(DT)(DG)(DT)(DC)(DT)(DA)(DC)(DG)(DA)(DC)(DC)(DA)(DA)(DT)(DT)(DG)(DA)(DG)(DC) (DG)(DG)(DC)(DC)(DT)(DC)(DG)(DG)(DC)(DA)(DC)(DC)(DG)(DG)(DG)(DA)(DT)(DT)(DC)(DT) (DC)(DG)(DA) ; ;TGCCTGGAGACTAGGGAGTAATCCCCTTGGCGGTTAAAACGCGGGGGACAGCGCGTACGTGCGTTTAAGCGGTGCTAGAG CTGTCTACGACCAATTGAGCGGCCTCGGCACCGGGATTCTCGA ; J ? # _pdbx_entity_nonpoly.entity_id 9 _pdbx_entity_nonpoly.name 'ZINC ION' _pdbx_entity_nonpoly.comp_id ZN # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET n 1 2 THR n 1 3 MET n 1 4 GLY n 1 5 ASP n 1 6 LYS n 1 7 LYS n 1 8 SER n 1 9 PRO n 1 10 THR n 1 11 ARG n 1 12 PRO n 1 13 LYS n 1 14 ARG n 1 15 GLN n 1 16 ALA n 1 17 LYS n 1 18 PRO n 1 19 ALA n 1 20 ALA n 1 21 ASP n 1 22 GLU n 1 23 GLY n 1 24 PHE n 1 25 TRP n 1 26 ASP n 1 27 CYS n 1 28 SER n 1 29 VAL n 1 30 CYS n 1 31 THR n 1 32 PHE n 1 33 ARG n 1 34 ASN n 1 35 SER n 1 36 ALA n 1 37 GLU n 1 38 ALA n 1 39 PHE n 1 40 LYS n 1 41 CYS n 1 42 SER n 1 43 ILE n 1 44 CYS n 1 45 ASP n 1 46 VAL n 1 47 ARG n 1 48 LYS n 1 49 GLY n 1 50 THR n 1 51 SER n 1 52 THR n 1 53 ARG n 1 54 LYS n 1 55 PRO n 1 56 ARG n 1 57 ILE n 1 58 ASN n 1 59 SER n 1 60 GLN n 1 61 LEU n 1 62 VAL n 1 63 ALA n 1 64 GLN n 1 65 GLN n 1 66 VAL n 1 67 ALA n 1 68 GLN n 1 69 GLN n 1 70 TYR n 1 71 ALA n 1 72 THR n 1 73 PRO n 1 74 PRO n 1 75 PRO n 1 76 PRO n 1 77 LYS n 1 78 LYS n 1 79 GLU n 1 80 LYS n 1 81 LYS n 1 82 GLU n 1 83 LYS n 1 84 VAL n 1 85 GLU n 1 86 LYS n 1 87 GLN n 1 88 ASP n 1 89 LYS n 1 90 GLU n 1 91 LYS n 1 92 PRO n 1 93 GLU n 1 94 LYS n 1 95 ASP n 1 96 LYS n 1 97 GLU n 1 98 ILE n 1 99 SER n 1 100 PRO n 1 101 SER n 1 102 VAL n 1 103 THR n 1 104 LYS n 1 105 LYS n 1 106 ASN n 1 107 THR n 1 108 ASN n 1 109 LYS n 1 110 LYS n 1 111 THR n 1 112 LYS n 1 113 PRO n 1 114 LYS n 1 115 SER n 1 116 ASP n 1 117 ILE n 1 118 LEU n 1 119 LYS n 1 120 ASP n 1 121 PRO n 1 122 PRO n 1 123 SER n 1 124 GLU n 1 125 ALA n 1 126 ASN n 1 127 SER n 1 128 ILE n 1 129 GLN n 1 130 SER n 1 131 ALA n 1 132 ASN n 1 133 ALA n 1 134 THR n 1 135 THR n 1 136 LYS n 1 137 THR n 1 138 SER n 1 139 GLU n 1 140 THR n 1 141 ASN n 1 142 HIS n 1 143 THR n 1 144 SER n 1 145 ARG n 1 146 PRO n 1 147 ARG n 1 148 LEU n 1 149 LYS n 1 150 ASN n 1 151 VAL n 1 152 ASP n 1 153 ARG n 1 154 SER n 1 155 THR n 1 156 ALA n 1 157 GLN n 1 158 GLN n 1 159 LEU n 1 160 ALA n 1 161 VAL n 1 162 THR n 1 163 VAL n 1 164 GLY n 1 165 ASN n 1 166 VAL n 1 167 THR n 1 168 VAL n 1 169 ILE n 1 170 ILE n 1 171 THR n 1 172 ASP n 1 173 PHE n 1 174 LYS n 1 175 GLU n 1 176 LYS n 1 177 THR n 1 178 ARG n 1 179 SER n 1 180 SER n 1 181 SER n 1 182 THR n 1 183 SER n 1 184 SER n 1 185 SER n 1 186 THR n 1 187 VAL n 1 188 THR n 1 189 SER n 1 190 SER n 1 191 ALA n 1 192 GLY n 1 193 SER n 1 194 GLU n 1 195 GLN n 1 196 GLN n 1 197 ASN n 1 198 GLN n 1 199 SER n 1 200 SER n 1 201 SER n 1 202 GLY n 1 203 SER n 1 204 GLU n 1 205 SER n 1 206 THR n 1 207 ASP n 1 208 LYS n 1 209 GLY n 1 210 SER n 1 211 SER n 1 212 ARG n 1 213 SER n 1 214 SER n 1 215 THR n 1 216 PRO n 1 217 LYS n 1 218 GLY n 1 219 ASP n 1 220 MET n 1 221 SER n 1 222 ALA n 1 223 VAL n 1 224 ASN n 1 225 ASP n 1 226 GLU n 1 227 SER n 1 228 PHE n 2 1 MET n 2 2 ALA n 2 3 ARG n 2 4 THR n 2 5 LYS n 2 6 GLN n 2 7 THR n 2 8 ALA n 2 9 ARG n 2 10 LYS n 2 11 SER n 2 12 THR n 2 13 GLY n 2 14 GLY n 2 15 LYS n 2 16 ALA n 2 17 PRO n 2 18 ARG n 2 19 LYS n 2 20 GLN n 2 21 LEU n 2 22 ALA n 2 23 THR n 2 24 LYS n 2 25 ALA n 2 26 ALA 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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.4884 ? 19210 ? f_angle_d ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.0328 ? 2201 ? f_chiral_restr ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.0032 ? 1586 ? f_plane_restr ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 29.0933 ? 3536 ? f_dihedral_angle_d ? ? ? # _struct.entry_id 9V9S _struct.title 'Cryo-EM structure of the ncPRC1.1 complex bound to the H2AK119ubH2BK120ub-modified nucleosome' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 9V9S _struct_keywords.text 'nucleosome modification, transcriptional regulation, GENE REGULATION' _struct_keywords.pdbx_keywords 'GENE REGULATION' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 2 ? D N N 3 ? E N N 4 ? F N N 5 ? G N N 2 ? H N N 3 ? I N N 4 ? J N N 5 ? K N N 6 ? L N N 6 ? M N N 7 ? N N N 8 ? O N N 9 ? P N N 9 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP RYBP_HUMAN Q8N488 ? 1 ;MTMGDKKSPTRPKRQAKPAADEGFWDCSVCTFRNSAEAFKCSICDVRKGTSTRKPRINSQLVAQQVAQQYATPPPPKKEK KEKVEKQDKEKPEKDKEISPSVTKKNTNKKTKPKSDILKDPPSEANSIQSANATTKTSETNHTSRPRLKNVDRSTAQQLA VTVGNVTVIITDFKEKTRSSSTSSSTVTSSAGSEQQNQSSSGSESTDKGSSRSSTPKGDMSAVNDESF ; 1 2 UNP A0A310TTQ1_XENLA A0A310TTQ1 ? 2 ;MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPATGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFK TDLRFQSSAVMALQEASEAYLVALFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA ; 1 3 UNP H4_XENLA P62799 ? 3 ;MSGRGKGGKGLGKGGAKRHRKVLRDNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEETRGVLKVFLENVIRDAVTYTEHAKRK TVTAMDVVYALKRQGRTLYGFGG ; 1 4 UNP Q6AZJ8_XENLA Q6AZJ8 ? 4 ;MSGRGKQGGKTRAKAKTRSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGNYAERVGAGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKTRII PRHLQLAVRNDEELNKLLGRVTIAQGGVLPNIQSVLLPKKTESSKSAKSK ; 1 5 UNP A0A8J0TWI5_XENLA A0A8J0TWI5 ? 5 ;MPDPAKSAPAAKKGSKKAVTKTQKKDGKKRRKTRKESYAIYVYKVLKQVHPDTGISSKAMSIMNSFVNDVFERIAGEASR LAHYNKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSAK ; 1 6 UNP UBB_HUMAN P0CG47 ? 6 MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGG 153 7 PDB 9V9S 9V9S ? 7 ? 1 8 PDB 9V9S 9V9S ? 8 ? 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 9V9S L 1 ? 228 ? Q8N488 1 ? 228 ? 1 228 2 1 9V9S N 1 ? 228 ? Q8N488 1 ? 228 ? 1 228 3 2 9V9S A 1 ? 136 ? A0A310TTQ1 1 ? 136 ? 0 135 4 3 9V9S B 1 ? 103 ? P62799 1 ? 103 ? 0 102 5 4 9V9S C 1 ? 130 ? Q6AZJ8 1 ? 130 ? 0 129 6 5 9V9S D 1 ? 126 ? A0A8J0TWI5 1 ? 126 ? -3 122 7 2 9V9S E 1 ? 136 ? A0A310TTQ1 1 ? 136 ? 0 135 8 3 9V9S F 1 ? 103 ? P62799 1 ? 103 ? 0 102 9 4 9V9S G 1 ? 130 ? Q6AZJ8 1 ? 130 ? 0 129 10 5 9V9S H 1 ? 126 ? A0A8J0TWI5 1 ? 126 ? -3 122 11 6 9V9S K 1 ? 76 ? P0CG47 153 ? 228 ? 1 76 12 6 9V9S O 1 ? 76 ? P0CG47 153 ? 228 ? 1 76 13 7 9V9S I 1 ? 122 ? 9V9S 3 ? 124 ? 3 124 14 8 9V9S J 1 ? 123 ? 9V9S 24 ? 146 ? 24 146 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 5 9V9S CYS C 120 ? UNP Q6AZJ8 LYS 120 'engineered mutation' 119 1 6 9V9S CYS D 121 ? UNP A0A8J0TWI5 LYS 121 'engineered mutation' 117 2 9 9V9S CYS G 120 ? UNP Q6AZJ8 LYS 120 'engineered mutation' 119 3 10 9V9S CYS H 121 ? UNP A0A8J0TWI5 LYS 121 'engineered mutation' 117 4 11 9V9S CYS K 76 ? UNP P0CG47 GLY 228 'engineered mutation' 76 5 12 9V9S CYS O 76 ? UNP P0CG47 GLY 228 'engineered mutation' 76 6 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details tetradecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 14 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'not applicable' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 SER A 59 ? GLN A 68 ? SER L 59 GLN L 68 1 ? 10 HELX_P HELX_P2 AA2 GLY C 45 ? SER C 58 ? GLY A 44 SER A 57 1 ? 14 HELX_P HELX_P3 AA3 ARG C 64 ? LYS C 80 ? ARG A 63 LYS A 79 1 ? 17 HELX_P HELX_P4 AA4 GLN C 86 ? ALA C 115 ? GLN A 85 ALA A 114 1 ? 30 HELX_P HELX_P5 AA5 MET C 121 ? GLY C 133 ? MET A 120 GLY A 132 1 ? 13 HELX_P HELX_P6 AA6 ASP D 25 ? ILE D 30 ? ASP B 24 ILE B 29 5 ? 6 HELX_P HELX_P7 AA7 THR D 31 ? GLY D 42 ? THR B 30 GLY B 41 1 ? 12 HELX_P HELX_P8 AA8 ILE D 51 ? ALA D 77 ? ILE B 50 ALA B 76 1 ? 27 HELX_P HELX_P9 AA9 THR D 83 ? GLN D 94 ? THR B 82 GLN B 93 1 ? 12 HELX_P HELX_P10 AB1 THR E 17 ? ALA E 22 ? THR C 16 ALA C 21 1 ? 6 HELX_P HELX_P11 AB2 PRO E 27 ? LYS E 37 ? PRO C 26 LYS C 36 1 ? 11 HELX_P HELX_P12 AB3 ALA E 46 ? ASN E 74 ? ALA C 45 ASN C 73 1 ? 29 HELX_P HELX_P13 AB4 ILE E 80 ? ASN E 90 ? ILE C 79 ASN C 89 1 ? 11 HELX_P HELX_P14 AB5 ASP E 91 ? LEU E 98 ? ASP C 90 LEU C 97 1 ? 8 HELX_P HELX_P15 AB6 ALA F 39 ? GLN F 48 ? ALA D 35 GLN D 44 1 ? 10 HELX_P HELX_P16 AB7 SER F 56 ? ASN F 85 ? SER D 52 ASN D 81 1 ? 30 HELX_P HELX_P17 AB8 THR F 91 ? LEU F 103 ? THR D 87 LEU D 99 1 ? 13 HELX_P HELX_P18 AB9 GLY F 105 ? SER F 124 ? GLY D 101 SER D 120 1 ? 20 HELX_P HELX_P19 AC1 GLY G 45 ? GLN G 56 ? GLY E 44 GLN E 55 1 ? 12 HELX_P HELX_P20 AC2 ARG G 64 ? ASP G 78 ? ARG E 63 ASP E 77 1 ? 15 HELX_P HELX_P21 AC3 GLN G 86 ? ALA G 115 ? GLN E 85 ALA E 114 1 ? 30 HELX_P HELX_P22 AC4 MET G 121 ? GLY G 133 ? MET E 120 GLY E 132 1 ? 13 HELX_P HELX_P23 AC5 THR H 31 ? GLY H 43 ? THR F 30 GLY F 42 1 ? 13 HELX_P HELX_P24 AC6 LEU H 50 ? ALA H 77 ? LEU F 49 ALA F 76 1 ? 28 HELX_P HELX_P25 AC7 THR H 83 ? GLN H 94 ? THR F 82 GLN F 93 1 ? 12 HELX_P HELX_P26 AC8 THR I 17 ? GLY I 23 ? THR G 16 GLY G 22 1 ? 7 HELX_P HELX_P27 AC9 PRO I 27 ? LYS I 37 ? PRO G 26 LYS G 36 1 ? 11 HELX_P HELX_P28 AD1 ALA I 46 ? ASN I 74 ? ALA G 45 ASN G 73 1 ? 29 HELX_P HELX_P29 AD2 ILE I 80 ? ASN I 90 ? ILE G 79 ASN G 89 1 ? 11 HELX_P HELX_P30 AD3 ASP I 91 ? LEU I 98 ? ASP G 90 LEU G 97 1 ? 8 HELX_P HELX_P31 AD4 ALA J 39 ? HIS J 50 ? ALA H 35 HIS H 46 1 ? 12 HELX_P HELX_P32 AD5 SER J 57 ? ASN J 85 ? SER H 53 ASN H 81 1 ? 29 HELX_P HELX_P33 AD6 THR J 91 ? LEU J 103 ? THR H 87 LEU H 99 1 ? 13 HELX_P HELX_P34 AD7 GLY J 105 ? SER J 124 ? GLY H 101 SER H 120 1 ? 20 HELX_P HELX_P35 AD8 THR K 22 ? GLU K 34 ? THR K 22 GLU K 34 1 ? 13 HELX_P HELX_P36 AD9 PRO K 37 ? ASP K 39 ? PRO K 37 ASP K 39 5 ? 3 HELX_P HELX_P37 AE1 THR K 55 ? TYR K 59 ? THR K 55 TYR K 59 5 ? 5 HELX_P HELX_P38 AE2 THR L 22 ? GLU L 34 ? THR O 22 GLU O 34 1 ? 13 HELX_P HELX_P39 AE3 PRO L 37 ? GLN L 41 ? PRO O 37 GLN O 41 5 ? 5 HELX_P HELX_P40 AE4 THR L 55 ? TYR L 59 ? THR O 55 TYR O 59 5 ? 5 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role metalc1 metalc ? ? A CYS 27 SG ? ? ? 1_555 O ZN . ZN ? ? L CYS 27 L ZN 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.330 ? ? metalc2 metalc ? ? A CYS 30 SG ? ? ? 1_555 O ZN . ZN ? ? L CYS 30 L ZN 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.331 ? ? metalc3 metalc ? ? A CYS 41 SG ? ? ? 1_555 O ZN . ZN ? ? L CYS 41 L ZN 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.330 ? ? metalc4 metalc ? ? A CYS 44 SG ? ? ? 1_555 O ZN . ZN ? ? L CYS 44 L ZN 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.329 ? ? metalc5 metalc ? ? B CYS 27 SG ? ? ? 1_555 P ZN . ZN ? ? N CYS 27 N ZN 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.334 ? ? metalc6 metalc ? ? B CYS 30 SG ? ? ? 1_555 P ZN . ZN ? ? N CYS 30 N ZN 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.329 ? ? metalc7 metalc ? ? B CYS 41 SG ? ? ? 1_555 P ZN . ZN ? ? N CYS 41 N ZN 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.326 ? ? metalc8 metalc ? ? B CYS 44 SG ? ? ? 1_555 P ZN . ZN ? ? N CYS 44 N ZN 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.329 ? ? hydrog1 hydrog ? ? M DG 2 N1 ? ? ? 1_555 N DC 121 N3 ? ? I DG 4 J DC 144 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog2 hydrog ? ? M DG 2 N2 ? ? ? 1_555 N DC 121 O2 ? ? 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