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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.568 ? 5030 ? f_angle_d ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 4.444 ? 468 ? f_dihedral_angle_d ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.044 ? 580 ? f_chiral_restr ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.004 ? 604 ? f_plane_restr ? ? ? # _struct.entry_id 9VND _struct.title 'Structure of the Bacteroides fragilis NCTC9343 T6SS Hcp2-Hcp3 Heterohexamer in Complex with the Effector Bte1' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 9VND _struct_keywords.text 'Bacteroides fragilis, T6SS, Hcp, effector, STRUCTURAL PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'STRUCTURAL PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 2 ? D N N 2 ? E N N 3 ? F N N 1 ? G N N 2 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP A0A380Z0E1_BACFN A0A380Z0E1 ? 1 ;MELFSFLQVDSDLTAWFILDGQEYEMSHFDINFAQSVDHKGQPQDEVRGGIMSITLSQTLPENIYRWGMTSIPKNGSVIF KSKTTNPPLKINFINAYCIRFNRSIANEGGLESQLVISPDEMLINGISFDNHWVK ; 1 2 UNP Q5LDT5_BACFN Q5LDT5 ? 2 ;MFGHKSFLRIGALGDSSISGLYKDSYELENCHFSFNQGTNTDGKPQTDVRGGTLYLTYAGLPQDDMLRWILNSKKYEDGA IVICDDSDEPLEKILFEQAACTGLNIEYTQKGKAYIHTKIILQVRKIKVGETTFENRWTINE ; 1 3 UNP Q5LDT7_BACFN Q5LDT7 ? 3 ;MGKEIEIKKLPEFEAMVNAGNTTYTGLVEGIGYVYWTTETLYFIRTNPEQLWAIPKYQQIPFPYFQRKDAIIETKTLHTL HVLSKDELLKLDYDAYYAFYGIVEEMLKFIHRADAIKSYCEIPLPIIKSKGALKGNDARNGILSLGSQINDQIGAPLDAA NMLMDNKHIGKIGDGLSLISIIDEVGNGEYWSAAGDILLFAAGKTKLSPYMTVISLGTWMYETDLMQWRLACINYSDYKK TLIKYRELQKKFESGDKSVEEKMNECHKILNSHYIEMQKNLGNLGVKF ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 9VND B 1 ? 135 ? A0A380Z0E1 1 ? 135 ? 1 135 2 2 9VND C 1 ? 142 ? Q5LDT5 1 ? 142 ? 1 142 3 2 9VND A 1 ? 142 ? Q5LDT5 1 ? 142 ? 1 142 4 2 9VND D 1 ? 142 ? Q5LDT5 1 ? 142 ? 1 142 5 3 9VND J 1 ? 288 ? Q5LDT7 1 ? 288 ? 1 288 6 1 9VND E 1 ? 135 ? A0A380Z0E1 1 ? 135 ? 1 135 7 2 9VND F 1 ? 142 ? Q5LDT5 1 ? 142 ? 1 142 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details heptameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 7 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'not applicable' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 TYR A 65 ? 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AA8 ? 4 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA2 3 4 ? anti-parallel AA2 4 5 ? anti-parallel AA2 5 6 ? anti-parallel AA2 6 7 ? anti-parallel AA2 7 8 ? anti-parallel AA2 8 9 ? anti-parallel AA2 9 10 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA3 3 4 ? anti-parallel AA3 4 5 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA5 3 4 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA6 3 4 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA7 3 4 ? anti-parallel AA7 4 5 ? parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA8 3 4 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 TYR A 24 ? 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LEU F 54 ALA F 59 # loop_ _pdbx_struct_sheet_hbond.sheet_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_1 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_2 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_seq_id AA1 1 2 O TYR A 24 ? O TYR B 24 N PHE A 17 ? N PHE B 17 AA1 2 3 N ILE A 18 ? N ILE B 18 O SER A 77 ? O SER B 77 AA2 1 2 O LEU B 122 ? O LEU C 122 N LEU B 54 ? N LEU C 54 AA2 2 3 O THR B 57 ? O THR C 57 N ASN B 30 ? N ASN C 30 AA2 3 4 O CYS B 31 ? O CYS C 31 N ILE A 105 ? N ILE B 105 AA2 4 5 N ILE A 99 ? N ILE B 99 O VAL A 116 ? O VAL B 116 AA2 5 6 O SER A 113 ? O SER B 113 N LEU A 56 ? N LEU B 56 AA2 6 7 O SER A 53 ? O SER B 53 N ASP A 30 ? N ASP B 30 AA2 7 8 N PHE A 29 ? N PHE B 29 O TYR C 108 ? O TYR A 108 AA2 8 9 N GLU C 107 ? N GLU A 107 O HIS C 117 ? O HIS A 117 AA2 9 10 O THR C 118 ? O THR A 118 N TYR C 58 ? N TYR A 58 AA3 1 2 O LEU B 28 ? O LEU C 28 N SER B 6 ? N SER C 6 AA3 2 3 N LYS B 5 ? N LYS C 5 O CYS B 84 ? O CYS C 84 AA3 3 4 N ILE B 81 ? N ILE C 81 O ILE B 94 ? O ILE C 94 AA3 4 5 N LEU B 95 ? N LEU C 95 O LYS B 128 ? O LYS C 128 AA4 1 2 N THR B 109 ? N THR C 109 O TYR B 115 ? O TYR C 115 AA5 1 2 N PHE C 33 ? N PHE A 33 O ILE D 106 ? O ILE D 106 AA5 2 3 N ASN D 105 ? N ASN D 105 O LYS D 119 ? 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