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EMDB EMD-65578 ? ? # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal _pdbx_audit_revision_history.data_content_type _pdbx_audit_revision_history.major_revision _pdbx_audit_revision_history.minor_revision _pdbx_audit_revision_history.revision_date _pdbx_audit_revision_history.part_number 1 'Structure model' 1 0 2026-04-01 ? 2 'EM metadata' 1 0 2026-04-01 ? 3 FSC 1 0 2026-04-01 ? 4 'Half map' 1 0 2026-04-01 1 5 'Half map' 1 0 2026-04-01 2 6 Image 1 0 2026-04-01 ? 7 Mask 1 0 2026-04-01 1 8 'Primary map' 1 0 2026-04-01 ? # loop_ _pdbx_audit_revision_details.ordinal _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_details.data_content_type _pdbx_audit_revision_details.provider _pdbx_audit_revision_details.type _pdbx_audit_revision_details.description _pdbx_audit_revision_details.details 1 1 'Structure model' repository 'Initial release' ? ? 2 2 'EM metadata' repository 'Initial release' ? ? 3 3 FSC repository 'Initial release' ? ? 4 4 'Half map' repository 'Initial release' ? ? 5 5 'Half map' repository 'Initial release' ? ? 6 6 Image repository 'Initial release' ? ? 7 7 Mask repository 'Initial release' ? ? 8 8 'Primary map' repository 'Initial release' ? ? # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 9W2S _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2025-07-28 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site PDBJ _pdbx_database_status.process_site PDBJ _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y # _pdbx_database_related.db_name EMDB _pdbx_database_related.details 'Cryo-EM structure of FoF1-ATPase monomer state 3 on the bovine heart submitochondrial particles (FoF1-2)' _pdbx_database_related.db_id EMD-65578 _pdbx_database_related.content_type 'associated EM volume' # _pdbx_contact_author.id 3 _pdbx_contact_author.email yokoken@cc.kyoto-su.ac.jp _pdbx_contact_author.name_first Ken _pdbx_contact_author.name_last Yokoyama _pdbx_contact_author.name_mi ? _pdbx_contact_author.role 'principal investigator/group leader' _pdbx_contact_author.identifier_ORCID 0000-0002-6813-1096 # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Nakano, A.' 1 0000-0003-2466-5341 'Masuya, T.' 2 0000-0003-4950-0527 'Akisada, S.' 3 0009-0007-1400-4079 'Ishikawa-Fukuda, M.' 4 0000-0002-8620-1801 'Mitsuoka, K.' 5 0000-0003-1782-675X 'Miyoshi, H.' 6 0000-0002-1792-554X 'Murai, M.' 7 0000-0001-6601-2854 'Yokoyama, K.' 8 0000-0002-6813-1096 # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country UK _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev 'Nat Commun' _citation.journal_id_ASTM ? _citation.journal_id_CSD ? _citation.journal_id_ISSN 2041-1723 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume ? _citation.language ? _citation.page_first ? _citation.page_last ? _citation.title 'Structures of respiratory supercomplexes and ATP synthase oligomers in mammalian mitochondrial inner membrane.' _citation.year 2026 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1038/s41467-026-70578-x _citation.pdbx_database_id_PubMed 41844608 _citation.pdbx_database_id_patent ? _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Nakano, A.' 1 ? primary 'Masuya, T.' 2 0000-0003-4950-0527 primary 'Akisada, S.' 3 ? primary 'Ishikawa-Fukuda, M.' 4 0000-0002-8620-1801 primary 'Mitsuoka, K.' 5 ? primary 'Miyoshi, H.' 6 0000-0002-1792-554X primary 'Murai, M.' 7 0000-0001-6601-2854 primary 'Yokoyama, K.' 8 0000-0002-6813-1096 # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer nat 'ATP synthase F(0) complex subunit 8' 7944.523 1 ? ? ? ? 2 polymer nat 'ATP synthase F(1) complex subunit alpha, mitochondrial' 55331.234 3 ? ? ? ? 3 polymer nat 'ATP synthase F(1) complex catalytic subunit beta, mitochondrial' 51757.836 3 7.1.2.2 ? ? ? 4 polymer nat 'ATP synthase F(1) complex subunit gamma, mitochondrial' 30300.760 1 ? ? ? ? 5 polymer nat 'ATP synthase F(1) complex subunit delta, mitochondrial' 15074.813 1 ? ? ? ? 6 polymer nat 'ATP synthase F(1) complex subunit epsilon, mitochondrial' 5662.693 1 ? ? ? ? 7 polymer nat 'ATPase inhibitor, mitochondrial' 6633.216 1 ? ? ? ? 8 polymer nat 'ATP synthase F(0) complex subunit C1, mitochondrial' 7653.034 8 ? ? ? ? 9 polymer nat 'ATP synthase peripheral stalk subunit OSCP, mitochondrial' 20959.777 1 ? ? ? ? 10 polymer nat 'ATP synthase F(0) complex subunit a' 24801.785 1 ? ? ? ? 11 polymer nat 'ATP synthase peripheral stalk subunit b, mitochondrial' 24702.709 1 ? ? ? ? 12 polymer nat 'ATP synthase peripheral stalk subunit d, mitochondrial' 18588.256 1 ? ? ? ? 13 polymer nat 'ATP synthase F(0) complex subunit e, mitochondrial' 8205.492 1 ? ? ? ? 14 polymer nat 'ATP synthase F(0) complex subunit f, mitochondrial' 10184.011 1 ? ? ? ? 15 polymer nat 'ATP synthase F(0) complex subunit g, mitochondrial' 11298.196 1 ? ? ? ? 16 polymer nat 'ATP synthase peripheral stalk subunit F6, mitochondrial' 8971.079 1 ? ? ? ? 17 polymer nat 'ATP synthase F(0) complex subunit j, mitochondrial' 6846.093 1 ? ? ? ? 18 polymer nat 'ATP synthase F(0) complex subunit k, mitochondrial' 6312.383 1 ? ? ? ? # loop_ _entity_name_com.entity_id _entity_name_com.name 1 'A6L,F-ATPase subunit 8,ATP synthase subunit A6L' 2 'ATP synthase F1 subunit alpha' 3 'ATP synthase F1 subunit beta' 4 'ATP synthase F1 subunit gamma,F-ATPase gamma subunit' 5 'ATP synthase F1 subunit delta,F-ATPase delta subunit' 6 'ATPase subunit epsilon,ATP synthase F1 subunit epsilon' 7 'ATP synthase F1 subunit epsilon,Inhibitor of F(1)F(o)-ATPase,IF(1),IF1' 8 ;ATP synthase lipid-binding protein,ATP synthase membrane subunit c locus 1,ATP synthase proteolipid P1,ATPase protein 9,ATPase subunit c,Proton-conducting channel,ATP synthase F(0) complex subunit c ; 9 'ATP synthase subunit O,Oligomycin sensitivity conferral protein,OSCP' 10 'ATP synthase subunit a,F-ATPase protein 6,Proton-conducting channel,ATP synthase F(0) complex subunit a' 11 ;ATP synthase F(0) complex subunit B1,mitochondrial,ATP synthase peripheral stalk-membrane subunit b,ATP synthase subunit b,ATPase subunit b ; 12 'ATPase subunit d,ATP synthase peripheral stalk subunit d' 13 'ATPase subunit e,ATP synthase membrane subunit e' 14 'ATP synthase membrane subunit f' 15 'ATPase subunit g,ATP synthase membrane subunit g' 16 'ATPase subunit F6,ATP synthase peripheral stalk subunit F6' 17 'ATP synthase subunit 6.8PL (subunit j),6.8 kDa mitochondrial proteolipid,6.8 kDa mitochondrial proteolipid protein,MLQ' 18 ;ATP synthase membrane subunit DAPIT,mitochondrial,Diabetes-associated protein in insulin-sensitive tissues,Up-regulated during skeletal muscle growth protein 5 ; # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no MPQLDTSTWLTMILSMFLTLFIIFQLKVSKHNFYHNPELTPTKMLKQNTPWETKWTKIYLPLLLPL MPQLDTSTWLTMILSMFLTLFIIFQLKVSKHNFYHNPELTPTKMLKQNTPWETKWTKIYLPLLLPL 8 ? 2 'polypeptide(L)' no no ;QKTGTAEVSSILEERILGADTSVDLEETGRVLSIGDGIARVHGLRNVQAEEMVEFSSGLKGMSLNLEPDNVGVVVFGNDK LIKEGDIVKRTGAIVDVPVGEELLGRVVDALGNAIDGKGPIGSKARRRVGLKAPGIIPRISVREPMQTGIKAVDSLVPIG RGQRELIIGDRQTGKTSIAIDTIINQKRFNDGTDEKKKLYCIYVAIGQKRSTVAQLVKRLTDADAMKYTIVVSATASDAA 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IHSSVAKQMKSEAANLAAAGKEVKIIGVGDKIRSILHRTHSDQFLVTFKEVGRRPPTFGDASVIALELLNSGYEFDEGSI IFNRFRSVISYKTEEKPIFSLDTISSAESMSIYDDIDADVLRNYQEYSLANIIYYSLKESTTSEQSARMTAMDNASKNAS EMIDKLTLTFNRTRQAVITKELIEIISGAAALD ; ;ATLKDITRRLKSIKNIQKITKSMKMVAAAKYARAERELKPARVYGVGSLALYEKADIKTPEDKKKHLIIGVSSDRGLCGA IHSSVAKQMKSEAANLAAAGKEVKIIGVGDKIRSILHRTHSDQFLVTFKEVGRRPPTFGDASVIALELLNSGYEFDEGSI IFNRFRSVISYKTEEKPIFSLDTISSAESMSIYDDIDADVLRNYQEYSLANIIYYSLKESTTSEQSARMTAMDNASKNAS EMIDKLTLTFNRTRQAVITKELIEIISGAAALD ; G ? 5 'polypeptide(L)' no no ;AEAAAAQAPAAGPGQMSFTFASPTQVFFNSANVRQVDVPTQTGAFGILAAHVPTLQVLRPGLVVVHAEDGTTSKYFVSSG SVTVNADSSVQLLAEEAVTLDMLDLGAAKANLEKAQSELLGAADEATRAEIQIRIEANEALVKALE ; ;AEAAAAQAPAAGPGQMSFTFASPTQVFFNSANVRQVDVPTQTGAFGILAAHVPTLQVLRPGLVVVHAEDGTTSKYFVSSG SVTVNADSSVQLLAEEAVTLDMLDLGAAKANLEKAQSELLGAADEATRAEIQIRIEANEALVKALE ; H ? 6 'polypeptide(L)' no no VAYWRQAGLSYIRYSQICAKAVRDALKTEFKANAMKTSGSTIKIVKVKKE VAYWRQAGLSYIRYSQICAKAVRDALKTEFKANAMKTSGSTIKIVKVKKE I ? 7 'polypeptide(L)' no no GSESGDNVRSSAGAVRDAGGAFGKREQAEEERYFRARAKEQLAALKKHHENEISHHAKEI GSESGDNVRSSAGAVRDAGGAFGKREQAEEERYFRARAKEQLAALKKHHENEISHHAKEI J ? 8 'polypeptide(L)' no yes 'DIDTAAKFIGAGAATVGVAGSGAGIGTVFGSLIIGYARNPSL(M3L)QQLFSYAILGFALSEAMGLFCLMVAFLILFAM' DIDTAAKFIGAGAATVGVAGSGAGIGTVFGSLIIGYARNPSLKQQLFSYAILGFALSEAMGLFCLMVAFLILFAM K,L,M,N,O,P,Q,R ? 9 'polypeptide(L)' no no ;FAKLVRPPVQIYGIEGRYATALYSAASKQNKLEQVEKELLRVGQILKEPKMAASLLNPYVKRSVKVKSLSDMTAKEKFSP LTSNLINLLAENGRLTNTPAVISAFSTMMSVHRGEVPCTVTTASALDEATLTELKTVLKSFLSKGQVLKLEVKIDPSIMG GMIVRIGEKYVDMSAKTKIQKLSRAMREIL ; ;FAKLVRPPVQIYGIEGRYATALYSAASKQNKLEQVEKELLRVGQILKEPKMAASLLNPYVKRSVKVKSLSDMTAKEKFSP LTSNLINLLAENGRLTNTPAVISAFSTMMSVHRGEVPCTVTTASALDEATLTELKTVLKSFLSKGQVLKLEVKIDPSIMG GMIVRIGEKYVDMSAKTKIQKLSRAMREIL ; S ? 10 'polypeptide(L)' no no ;MNENLFTSFITPVILGLPLVTLIVLFPSLLFPTSNRLVSNRFVTLQQWMLQLVSKQMMSIHNSKGQTWTLMLMSLILFIG STNLLGLLPHSFTPTTQLSMNLGMAIPLWAGAVITGFRNKTKASLAHFLPQGTPTPLIPMLVIIETISLFIQPMALAVRL TANITAGHLLIHLIGGATLALMSISTTTALITFTILILLTILEFAVAMIQAYVFTLLVSLYLHDNT ; ;MNENLFTSFITPVILGLPLVTLIVLFPSLLFPTSNRLVSNRFVTLQQWMLQLVSKQMMSIHNSKGQTWTLMLMSLILFIG STNLLGLLPHSFTPTTQLSMNLGMAIPLWAGAVITGFRNKTKASLAHFLPQGTPTPLIPMLVIIETISLFIQPMALAVRL TANITAGHLLIHLIGGATLALMSISTTTALITFTILILLTILEFAVAMIQAYVFTLLVSLYLHDNT ; a ? 11 'polypeptide(L)' no no ;PVPPLPEHGGKVRFGLIPEEFFQFLYPKTGVTGPYVLGTGLILYLLSKEIYVITPETFSAISTIGFLVYIVKKYGASVGE FADKLNEQKIAQLEEVKQASIKQIQDAIDMEKSQQALVQKRHYLFDVQRNNIAMALEVTYRERLHRVYREVKNRLDYHIS VQNMMRQKEQEHMINWVEKRVVQSISAQQEKETIAKCIADLKLLSKKAQAQPVM ; ;PVPPLPEHGGKVRFGLIPEEFFQFLYPKTGVTGPYVLGTGLILYLLSKEIYVITPETFSAISTIGFLVYIVKKYGASVGE FADKLNEQKIAQLEEVKQASIKQIQDAIDMEKSQQALVQKRHYLFDVQRNNIAMALEVTYRERLHRVYREVKNRLDYHIS VQNMMRQKEQEHMINWVEKRVVQSISAQQEKETIAKCIADLKLLSKKAQAQPVM ; b ? 12 'polypeptide(L)' no no ;AGRKLALKTIDWVAFGEIIPRNQKAVANSLKSWNETLTSRLATLPEKPPAIDWAYYKANVAKAGLVDDFEKKFNALKVPI PEDKYTAQVDAEEKEDVKSCAEFLTQSKTRIQEYEKELEKMRNIIPFDQMTIEDLNEVFPETKLDKKKYPYWPHRPIETL ; ;AGRKLALKTIDWVAFGEIIPRNQKAVANSLKSWNETLTSRLATLPEKPPAIDWAYYKANVAKAGLVDDFEKKFNALKVPI PEDKYTAQVDAEEKEDVKSCAEFLTQSKTRIQEYEKELEKMRNIIPFDQMTIEDLNEVFPETKLDKKKYPYWPHRPIETL ; d ? 13 'polypeptide(L)' no no VPPVQVSPLIKLGRYSALFLGMAYGAKRYNYLKPRAEEERRLAAEEKKKRDEQKRIERELAEAQEDTILK VPPVQVSPLIKLGRYSALFLGMAYGAKRYNYLKPRAEEERRLAAEEKKKRDEQKRIERELAEAQEDTILK e ? 14 'polypeptide(L)' no no ;ASVVPLKEKKLLEVKLGELPSWILMRDFTPSGIAGAFQRGYYRYYNKYVNVKKGSIAGLSMVLAAYVFLNYCRSYKELKH ERLRKYH ; ;ASVVPLKEKKLLEVKLGELPSWILMRDFTPSGIAGAFQRGYYRYYNKYVNVKKGSIAGLSMVLAAYVFLNYCRSYKELKH ERLRKYH ; f ? 15 'polypeptide(L)' no no ;AEFVRNLAEKAPALVNAAVTYSKPRLATFWYYAKVELVPPTPAEIPTAIQSLKKIINSAKTGSFKQLTVKEALLNGLVAT EVWMWFYVGEIIGKRGIIGYDV ; ;AEFVRNLAEKAPALVNAAVTYSKPRLATFWYYAKVELVPPTPAEIPTAIQSLKKIINSAKTGSFKQLTVKEALLNGLVAT EVWMWFYVGEIIGKRGIIGYDV ; g ? 16 'polypeptide(L)' no no NKELDPVQKLFVDKIREYRTKRQTSGGPVDAGPEYQQDLDRELFKLKQMYGKADMNTFPNFTFEDPKFEVVEKPQS NKELDPVQKLFVDKIREYRTKRQTSGGPVDAGPEYQQDLDRELFKLKQMYGKADMNTFPNFTFEDPKFEVVEKPQS h ? 17 'polypeptide(L)' no no MLQSLIKKVWIPMKPYYTQAYQEIWVGTGLMAYIVYKIRSADKRSKALKASSAAPAHGHH MLQSLIKKVWIPMKPYYTQAYQEIWVGTGLMAYIVYKIRSADKRSKALKASSAAPAHGHH j ? 18 'polypeptide(L)' no no AGPEADAQFHFTGIKKYFNSYTLTGRMNCVLATYGSIALIVLYFKLRSKKTPAVKAT AGPEADAQFHFTGIKKYFNSYTLTGRMNCVLATYGSIALIVLYFKLRSKKTPAVKAT k ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET n 1 2 PRO n 1 3 GLN n 1 4 LEU n 1 5 ASP n 1 6 THR n 1 7 SER n 1 8 THR n 1 9 TRP n 1 10 LEU n 1 11 THR n 1 12 MET n 1 13 ILE n 1 14 LEU n 1 15 SER n 1 16 MET n 1 17 PHE n 1 18 LEU n 1 19 THR n 1 20 LEU n 1 21 PHE n 1 22 ILE n 1 23 ILE n 1 24 PHE n 1 25 GLN n 1 26 LEU n 1 27 LYS n 1 28 VAL n 1 29 SER n 1 30 LYS n 1 31 HIS n 1 32 ASN n 1 33 PHE n 1 34 TYR n 1 35 HIS n 1 36 ASN n 1 37 PRO n 1 38 GLU n 1 39 LEU n 1 40 THR n 1 41 PRO n 1 42 THR n 1 43 LYS n 1 44 MET n 1 45 LEU n 1 46 LYS n 1 47 GLN n 1 48 ASN n 1 49 THR n 1 50 PRO n 1 51 TRP n 1 52 GLU n 1 53 THR n 1 54 LYS n 1 55 TRP n 1 56 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_refine.ls_d_res_high 4.00 _refine.ls_d_res_low ? _refine.ls_extinction_coef ? _refine.ls_extinction_coef_esd ? _refine.ls_extinction_expression ? _refine.ls_extinction_method ? _refine.ls_goodness_of_fit_all ? _refine.ls_goodness_of_fit_all_esd ? _refine.ls_goodness_of_fit_obs ? _refine.ls_goodness_of_fit_obs_esd ? _refine.ls_hydrogen_treatment ? _refine.ls_matrix_type ? _refine.ls_number_constraints ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.ls_number_reflns_obs ? _refine.ls_number_reflns_R_free ? _refine.ls_number_reflns_R_work ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.ls_percent_reflns_obs ? _refine.ls_percent_reflns_R_free ? _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_obs ? _refine.ls_R_factor_R_free ? _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_R_factor_R_work ? _refine.ls_R_Fsqd_factor_obs ? _refine.ls_R_I_factor_obs ? _refine.ls_redundancy_reflns_all ? _refine.ls_redundancy_reflns_obs ? _refine.ls_restrained_S_all ? 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_refine.pdbx_ls_cross_valid_method ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values 'REAL-SPACE (WEIGHTED MAP SUM AT ATOM CENTERS)' _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_real_space_R ? _refine.pdbx_density_correlation ? _refine.pdbx_pd_number_of_powder_patterns ? _refine.pdbx_pd_number_of_points ? _refine.pdbx_pd_meas_number_of_points ? _refine.pdbx_pd_proc_ls_prof_R_factor ? _refine.pdbx_pd_proc_ls_prof_wR_factor ? _refine.pdbx_pd_Marquardt_correlation_coeff ? _refine.pdbx_pd_Fsqrd_R_factor ? _refine.pdbx_pd_ls_matrix_band_width ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.pdbx_diffrn_id ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.overall_SU_R_free ? _refine.overall_FOM_free_R_set ? _refine.overall_FOM_work_R_set ? _refine.pdbx_average_fsc_overall ? _refine.pdbx_average_fsc_work ? _refine.pdbx_average_fsc_free ? # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_Zscore _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.004 ? 39747 ? f_bond_d ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.871 ? 53759 ? f_angle_d ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 15.465 ? 14665 ? f_dihedral_angle_d ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.050 ? 6267 ? f_chiral_restr ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.006 ? 6916 ? f_plane_restr ? ? ? # _struct.entry_id 9W2S _struct.title 'Cryo-EM structure of FoF1-ATPase monomer state 3 on the bovine heart submitochondrial particles (FoF1-2)' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 9W2S _struct_keywords.text 'ATP synthase, FoF1-ATPase, submitochondrial particles, MOTOR PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'MOTOR PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 2 ? D N N 2 ? E N N 3 ? F N N 3 ? G N N 3 ? H N N 4 ? I N N 5 ? J N N 6 ? K N N 7 ? L N N 8 ? M N N 8 ? N N N 8 ? O N N 8 ? P N N 8 ? Q N N 8 ? R N N 8 ? S N N 8 ? T N N 9 ? U N N 10 ? V N N 11 ? W N N 12 ? X N N 13 ? Y N N 14 ? Z N N 15 ? AA N N 16 ? BA N N 17 ? CA N N 18 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP ATP8_BOVIN P03929 ? 1 MPQLDTSTWLTMILSMFLTLFIIFQLKVSKHNFYHNPELTPTKMLKQNTPWETKWTKIYLPLLLPL 1 2 UNP ATPA_BOVIN P19483 ? 2 ;QKTGTAEVSSILEERILGADTSVDLEETGRVLSIGDGIARVHGLRNVQAEEMVEFSSGLKGMSLNLEPDNVGVVVFGNDK LIKEGDIVKRTGAIVDVPVGEELLGRVVDALGNAIDGKGPIGSKARRRVGLKAPGIIPRISVREPMQTGIKAVDSLVPIG RGQRELIIGDRQTGKTSIAIDTIINQKRFNDGTDEKKKLYCIYVAIGQKRSTVAQLVKRLTDADAMKYTIVVSATASDAA PLQYLAPYSGCSMGEYFRDNGKHALIIYDDLSKQAVAYRQMSLLLRRPPGREAYPGDVFYLHSRLLERAAKMNDAFGGGS LTALPVIETQAGDVSAYIPTNVISITDGQIFLETELFYKGIRPAINVGLSVSRVGSAAQTRAMKQVAGTMKLELAQYREV AAFAQFGSDLDAATQQLLSRGVRLTELLKQGQYSPMAIEEQVAVIYAGVRGYLDKLEPSKITKFENAFLSHVISQHQALL SKIRTDGKISEESDAKLKEIVTNFLAGFEA ; 44 3 UNP ATPB_BOVIN P00829 ? 3 ;AAQASPSPKAGATTGRIVAVIGAVVDVQFDEGLPPILNALEVQGRETRLVLEVAQHLGESTVRTIAMDGTEGLVRGQKVL DSGAPIRIPVGPETLGRIMNVIGEPIDERGPIKTKQFAAIHAEAPEFVEMSVEQEILVTGIKVVDLLAPYAKGGKIGLFG GAGVGKTVLIMELINNVAKAHGGYSVFAGVGERTREGNDLYHEMIESGVINLKDATSKVALVYGQMNEPPGARARVALTG LTVAEYFRDQEGQDVLLFIDNIFRFTQAGSEVSALLGRIPSAVGYQPTLATDMGTMQERITTTKKGSITSVQAIYVPADD LTDPAPATTFAHLDATTVLSRAIAELGIYPAVDPLDSTSRIMDPNIVGSEHYDVARGVQKILQDYKSLQDIIAILGMDEL SEEDKLTVSRARKIQRFLSQPFQVAEVFTGHLGKLVPLKETIKGFQQILAGEYDHLPEQAFYMVGPIEEAVAKADKLAEE HS ; 47 4 UNP ATPG_BOVIN P05631 ? 4 ;ATLKDITRRLKSIKNIQKITKSMKMVAAAKYARAERELKPARVYGVGSLALYEKADIKTPEDKKKHLIIGVSSDRGLCGA IHSSVAKQMKSEAANLAAAGKEVKIIGVGDKIRSILHRTHSDQFLVTFKEVGRRPPTFGDASVIALELLNSGYEFDEGSI IFNRFRSVISYKTEEKPIFSLDTISSAESMSIYDDIDADVLRNYQEYSLANIIYYSLKESTTSEQSARMTAMDNASKNAS EMIDKLTLTFNRTRQAVITKELIEIISGAAALD ; 26 5 UNP ATPD_BOVIN P05630 ? 5 ;AEAAAAQAPAAGPGQMSFTFASPTQVFFNSANVRQVDVPTQTGAFGILAAHVPTLQVLRPGLVVVHAEDGTTSKYFVSSG SVTVNADSSVQLLAEEAVTLDMLDLGAAKANLEKAQSELLGAADEATRAEIQIRIEANEALVKALE ; 23 6 UNP ATP5E_BOVIN P05632 ? 6 VAYWRQAGLSYIRYSQICAKAVRDALKTEFKANAMKTSGSTIKIVKVKKE 2 7 UNP ATIF1_BOVIN P01096 ? 7 GSESGDNVRSSAGAVRDAGGAFGKREQAEEERYFRARAKEQLAALKKHHENEISHHAKEI 26 8 UNP AT5G1_BOVIN P32876 ? 8 DIDTAAKFIGAGAATVGVAGSGAGIGTVFGSLIIGYARNPSLKQQLFSYAILGFALSEAMGLFCLMVAFLILFAM 62 9 UNP ATPO_BOVIN P13621 ? 9 ;FAKLVRPPVQIYGIEGRYATALYSAASKQNKLEQVEKELLRVGQILKEPKMAASLLNPYVKRSVKVKSLSDMTAKEKFSP LTSNLINLLAENGRLTNTPAVISAFSTMMSVHRGEVPCTVTTASALDEATLTELKTVLKSFLSKGQVLKLEVKIDPSIMG GMIVRIGEKYVDMSAKTKIQKLSRAMREIL ; 24 10 UNP ATP6_BOVIN P00847 ? 10 ;MNENLFTSFITPVILGLPLVTLIVLFPSLLFPTSNRLVSNRFVTLQQWMLQLVSKQMMSIHNSKGQTWTLMLMSLILFIG STNLLGLLPHSFTPTTQLSMNLGMAIPLWAGAVITGFRNKTKASLAHFLPQGTPTPLIPMLVIIETISLFIQPMALAVRL TANITAGHLLIHLIGGATLALMSISTTTALITFTILILLTILEFAVAMIQAYVFTLLVSLYLHDNT ; 1 11 UNP AT5F1_BOVIN P13619 ? 11 ;PVPPLPEHGGKVRFGLIPEEFFQFLYPKTGVTGPYVLGTGLILYLLSKEIYVITPETFSAISTIGFLVYIVKKYGASVGE FADKLNEQKIAQLEEVKQASIKQIQDAIDMEKSQQALVQKRHYLFDVQRNNIAMALEVTYRERLHRVYREVKNRLDYHIS VQNMMRQKEQEHMINWVEKRVVQSISAQQEKETIAKCIADLKLLSKKAQAQPVM ; 43 12 UNP ATP5H_BOVIN P13620 ? 12 ;AGRKLALKTIDWVAFGEIIPRNQKAVANSLKSWNETLTSRLATLPEKPPAIDWAYYKANVAKAGLVDDFEKKFNALKVPI PEDKYTAQVDAEEKEDVKSCAEFLTQSKTRIQEYEKELEKMRNIIPFDQMTIEDLNEVFPETKLDKKKYPYWPHRPIETL ; 2 13 UNP ATP5I_BOVIN Q00361 ? 13 VPPVQVSPLIKLGRYSALFLGMAYGAKRYNYLKPRAEEERRLAAEEKKKRDEQKRIERELAEAQEDTILK 2 14 UNP ATPK_BOVIN Q28851 ? 14 ;ASVVPLKEKKLLEVKLGELPSWILMRDFTPSGIAGAFQRGYYRYYNKYVNVKKGSIAGLSMVLAAYVFLNYCRSYKELKH ERLRKYH ; 2 15 UNP ATP5L_BOVIN Q28852 ? 15 ;AEFVRNLAEKAPALVNAAVTYSKPRLATFWYYAKVELVPPTPAEIPTAIQSLKKIINSAKTGSFKQLTVKEALLNGLVAT EVWMWFYVGEIIGKRGIIGYDV ; 2 16 UNP ATP5J_BOVIN P02721 ? 16 NKELDPVQKLFVDKIREYRTKRQTSGGPVDAGPEYQQDLDRELFKLKQMYGKADMNTFPNFTFEDPKFEVVEKPQS 33 17 UNP ATP68_BOVIN P14790 ? 17 MLQSLIKKVWIPMKPYYTQAYQEIWVGTGLMAYIVYKIRSADKRSKALKASSAAPAHGHH 1 18 UNP ATPMK_BOVIN Q3ZBI7 ? 18 AGPEADAQFHFTGIKKYFNSYTLTGRMNCVLATYGSIALIVLYFKLRSKKTPAVKAT 2 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 9W2S 8 1 ? 66 ? P03929 1 ? 66 ? 1 66 2 2 9W2S C 1 ? 510 ? P19483 44 ? 553 ? 1 510 3 2 9W2S A 1 ? 510 ? P19483 44 ? 553 ? 1 510 4 2 9W2S B 1 ? 510 ? P19483 44 ? 553 ? 1 510 5 3 9W2S F 1 ? 482 ? P00829 47 ? 528 ? -3 478 6 3 9W2S D 1 ? 482 ? P00829 47 ? 528 ? -3 478 7 3 9W2S E 1 ? 482 ? P00829 47 ? 528 ? -3 478 8 4 9W2S G 1 ? 273 ? P05631 26 ? 298 ? 1 273 9 5 9W2S H 1 ? 146 ? P05630 23 ? 168 ? 1 146 10 6 9W2S I 1 ? 50 ? P05632 2 ? 51 ? 1 50 11 7 9W2S J 1 ? 60 ? P01096 26 ? 85 ? 1 60 12 8 9W2S K 1 ? 75 ? P32876 62 ? 136 ? 1 75 13 8 9W2S L 1 ? 75 ? P32876 62 ? 136 ? 1 75 14 8 9W2S M 1 ? 75 ? P32876 62 ? 136 ? 1 75 15 8 9W2S N 1 ? 75 ? P32876 62 ? 136 ? 1 75 16 8 9W2S O 1 ? 75 ? P32876 62 ? 136 ? 1 75 17 8 9W2S P 1 ? 75 ? P32876 62 ? 136 ? 1 75 18 8 9W2S Q 1 ? 75 ? P32876 62 ? 136 ? 1 75 19 8 9W2S R 1 ? 75 ? P32876 62 ? 136 ? 1 75 20 9 9W2S S 1 ? 190 ? P13621 24 ? 213 ? 1 190 21 10 9W2S a 1 ? 226 ? P00847 1 ? 226 ? 1 226 22 11 9W2S b 1 ? 214 ? P13619 43 ? 256 ? 1 214 23 12 9W2S d 1 ? 160 ? 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