HEADER DNA BINDING PROTEIN 07-AUG-25 9W7W TITLE CRYSTAL STRUCTURE OF NFIB BOUND TO A PALINDROMIC DNA COMPND MOL_ID: 1; COMPND 2 MOLECULE: NUCLEAR FACTOR 1 B-TYPE; COMPND 3 CHAIN: A, B; COMPND 4 SYNONYM: NF1-B,NUCLEAR FACTOR 1/B,CCAAT-BOX-BINDING TRANSCRIPTION COMPND 5 FACTOR,CTF,NUCLEAR FACTOR I/B,NF-I/B,NFI-B,TGGCA-BINDING PROTEIN; COMPND 6 ENGINEERED: YES; COMPND 7 MOL_ID: 2; COMPND 8 MOLECULE: DNA (5'- COMPND 9 D(*AP*GP*TP*TP*GP*GP*CP*AP*AP*GP*AP*TP*GP*CP*CP*AP*AP*CP*T)-3'); COMPND 10 CHAIN: C, E; COMPND 11 ENGINEERED: YES; COMPND 12 MOL_ID: 3; COMPND 13 MOLECULE: DNA (5'- COMPND 14 D(*G*AP*TP*TP*GP*GP*CP*AP*TP*CP*TP*TP*GP*CP*CP*AP*AP*CP*T)-3'); COMPND 15 CHAIN: D, F; COMPND 16 ENGINEERED: YES SOURCE MOL_ID: 1; SOURCE 2 ORGANISM_SCIENTIFIC: HOMO SAPIENS; SOURCE 3 ORGANISM_COMMON: HUMAN; SOURCE 4 ORGANISM_TAXID: 9606; SOURCE 5 GENE: NFIB; SOURCE 6 EXPRESSION_SYSTEM: ESCHERICHIA COLI; SOURCE 7 EXPRESSION_SYSTEM_TAXID: 562; SOURCE 8 MOL_ID: 2; SOURCE 9 SYNTHETIC: YES; SOURCE 10 ORGANISM_SCIENTIFIC: SYNTHETIC CONSTRUCT; SOURCE 11 ORGANISM_TAXID: 32630; SOURCE 12 MOL_ID: 3; SOURCE 13 SYNTHETIC: YES; SOURCE 14 ORGANISM_SCIENTIFIC: SYNTHETIC CONSTRUCT; SOURCE 15 ORGANISM_TAXID: 32630 KEYWDS NFIB, TRANSCRIPTION FACTOR, ONCOGENIC REGULATION, DNA BINDING PROTEIN EXPDTA X-RAY DIFFRACTION AUTHOR C.ZHU,Y.WANG,C.QIN,H.SONG REVDAT 1 07-JAN-26 9W7W 0 JRNL AUTH C.ZHU,D.XIAO,Y.WANG,H.HAN,C.QIN,S.LIU,X.CHEN,H.XIAO,X.CHEN, JRNL AUTH 2 J.SHI,J.TANG,J.SHEN,H.SONG JRNL TITL MOLECULAR BASIS OF NFIB-MEDIATED REGULATION OF ONCOGENIC JRNL TITL 2 TRANSCRIPTION. JRNL REF NUCLEIC ACIDS RES. V. 53 2025 JRNL REFN ESSN 1362-4962 JRNL PMID 41428734 JRNL DOI 10.1093/NAR/GKAF1369 REMARK 2 REMARK 2 RESOLUTION. 2.81 ANGSTROMS. REMARK 3 REMARK 3 REFINEMENT. REMARK 3 PROGRAM : PHENIX 1.20.1_4487 REMARK 3 AUTHORS : PAUL ADAMS,PAVEL AFONINE,VINCENT CHEN,IAN REMARK 3 : DAVIS,KRESHNA GOPAL,RALF GROSSE-KUNSTLEVE, REMARK 3 : LI-WEI HUNG,ROBERT IMMORMINO,TOM IOERGER, REMARK 3 : AIRLIE MCCOY,ERIK MCKEE,NIGEL MORIARTY, REMARK 3 : REETAL PAI,RANDY READ,JANE RICHARDSON, REMARK 3 : DAVID RICHARDSON,TOD ROMO,JIM SACCHETTINI, REMARK 3 : NICHOLAS SAUTER,JACOB SMITH,LAURENT REMARK 3 : STORONI,TOM TERWILLIGER,PETER ZWART REMARK 3 REMARK 3 REFINEMENT TARGET : GEOSTD + MONOMER LIBRARY + CDL V1.2 REMARK 3 REMARK 3 DATA USED IN REFINEMENT. REMARK 3 RESOLUTION RANGE HIGH (ANGSTROMS) : 2.81 REMARK 3 RESOLUTION RANGE LOW (ANGSTROMS) : 31.39 REMARK 3 MIN(FOBS/SIGMA_FOBS) : 1.360 REMARK 3 COMPLETENESS FOR RANGE (%) : 61.7 REMARK 3 NUMBER OF REFLECTIONS : 13433 REMARK 3 REMARK 3 FIT TO DATA USED IN REFINEMENT. REMARK 3 R VALUE (WORKING + TEST SET) : 0.250 REMARK 3 R VALUE (WORKING SET) : 0.246 REMARK 3 FREE R VALUE : 0.293 REMARK 3 FREE R VALUE TEST SET SIZE (%) : 7.410 REMARK 3 FREE R VALUE TEST SET COUNT : 995 REMARK 3 REMARK 3 FIT TO DATA USED IN REFINEMENT (IN BINS). REMARK 3 BIN RESOLUTION RANGE COMPL. NWORK NFREE RWORK RFREE REMARK 3 1 31.3900 - 5.3600 0.99 2904 235 0.2056 0.2546 REMARK 3 2 5.3600 - 4.2600 0.99 2875 228 0.2568 0.2694 REMARK 3 3 4.2600 - 3.7200 0.92 2641 215 0.2711 0.3322 REMARK 3 4 3.7200 - 3.3800 0.67 1907 147 0.3009 0.3938 REMARK 3 5 3.3800 - 3.1400 0.39 1116 92 0.3098 0.3862 REMARK 3 6 3.1400 - 2.9500 0.22 639 47 0.3255 0.3169 REMARK 3 7 2.9500 - 2.8100 0.13 356 31 0.3513 0.4117 REMARK 3 REMARK 3 BULK SOLVENT MODELLING. REMARK 3 METHOD USED : FLAT BULK SOLVENT MODEL REMARK 3 SOLVENT RADIUS : 1.10 REMARK 3 SHRINKAGE RADIUS : 0.90 REMARK 3 K_SOL : NULL REMARK 3 B_SOL : NULL REMARK 3 REMARK 3 ERROR ESTIMATES. REMARK 3 COORDINATE ERROR (MAXIMUM-LIKELIHOOD BASED) : 0.401 REMARK 3 PHASE ERROR (DEGREES, MAXIMUM-LIKELIHOOD BASED) : 44.641 REMARK 3 REMARK 3 B VALUES. REMARK 3 FROM WILSON PLOT (A**2) : 69.00 REMARK 3 MEAN B VALUE (OVERALL, A**2) : 110.8 REMARK 3 OVERALL ANISOTROPIC B VALUE. REMARK 3 B11 (A**2) : NULL REMARK 3 B22 (A**2) : NULL REMARK 3 B33 (A**2) : NULL REMARK 3 B12 (A**2) : NULL REMARK 3 B13 (A**2) : NULL REMARK 3 B23 (A**2) : NULL REMARK 3 REMARK 3 TWINNING INFORMATION. REMARK 3 FRACTION: NULL REMARK 3 OPERATOR: NULL REMARK 3 REMARK 3 DEVIATIONS FROM IDEAL VALUES. REMARK 3 RMSD COUNT REMARK 3 BOND : 0.003 4476 REMARK 3 ANGLE : 0.491 6352 REMARK 3 CHIRALITY : 0.034 702 REMARK 3 PLANARITY : 0.004 540 REMARK 3 DIHEDRAL : 24.968 1832 REMARK 3 REMARK 3 TLS DETAILS REMARK 3 NUMBER OF TLS GROUPS : 1 REMARK 3 TLS GROUP : 1 REMARK 3 SELECTION: ALL REMARK 3 ORIGIN FOR THE GROUP (A): 50.9555 10.7401 17.8060 REMARK 3 T TENSOR REMARK 3 T11: 0.6728 T22: 0.0413 REMARK 3 T33: 1.3036 T12: -0.1269 REMARK 3 T13: 0.0555 T23: 0.0114 REMARK 3 L TENSOR REMARK 3 L11: 2.9199 L22: 1.8605 REMARK 3 L33: 1.2434 L12: 1.7036 REMARK 3 L13: -0.0480 L23: -0.1213 REMARK 3 S TENSOR REMARK 3 S11: -0.2291 S12: 0.0497 S13: 0.3889 REMARK 3 S21: -0.2556 S22: 0.1975 S23: -0.1710 REMARK 3 S31: -0.1822 S32: -0.0464 S33: -0.0172 REMARK 3 REMARK 3 NCS DETAILS REMARK 3 NUMBER OF NCS GROUPS : NULL REMARK 3 REMARK 3 OTHER REFINEMENT REMARKS: NULL REMARK 4 REMARK 4 9W7W COMPLIES WITH FORMAT V. 3.30, 13-JUL-11 REMARK 100 REMARK 100 THIS ENTRY HAS BEEN PROCESSED BY PDBJ ON 07-AUG-25. REMARK 100 THE DEPOSITION ID IS D_1300062431. REMARK 200 REMARK 200 EXPERIMENTAL DETAILS REMARK 200 EXPERIMENT TYPE : X-RAY DIFFRACTION REMARK 200 DATE OF DATA COLLECTION : 17-MAR-25 REMARK 200 TEMPERATURE (KELVIN) : 100 REMARK 200 PH : NULL REMARK 200 NUMBER OF CRYSTALS USED : 1 REMARK 200 REMARK 200 SYNCHROTRON (Y/N) : Y REMARK 200 RADIATION SOURCE : SSRF REMARK 200 BEAMLINE : BL18U1 REMARK 200 X-RAY GENERATOR MODEL : NULL REMARK 200 MONOCHROMATIC OR LAUE (M/L) : M REMARK 200 WAVELENGTH OR RANGE (A) : 0.9795 REMARK 200 MONOCHROMATOR : NULL REMARK 200 OPTICS : NULL REMARK 200 REMARK 200 DETECTOR TYPE : PIXEL REMARK 200 DETECTOR MANUFACTURER : DECTRIS PILATUS3 6M REMARK 200 INTENSITY-INTEGRATION SOFTWARE : HKL-3000 REMARK 200 DATA SCALING SOFTWARE : HKL-3000 REMARK 200 REMARK 200 NUMBER OF UNIQUE REFLECTIONS : 13562 REMARK 200 RESOLUTION RANGE HIGH (A) : 2.800 REMARK 200 RESOLUTION RANGE LOW (A) : 40.000 REMARK 200 REJECTION CRITERIA (SIGMA(I)) : NULL REMARK 200 REMARK 200 OVERALL. REMARK 200 COMPLETENESS FOR RANGE (%) : 62.4 REMARK 200 DATA REDUNDANCY : 5.600 REMARK 200 R MERGE (I) : NULL REMARK 200 R SYM (I) : NULL REMARK 200 FOR THE DATA SET : 30.4000 REMARK 200 REMARK 200 IN THE HIGHEST RESOLUTION SHELL. REMARK 200 HIGHEST RESOLUTION SHELL, RANGE HIGH (A) : 2.80 REMARK 200 HIGHEST RESOLUTION SHELL, RANGE LOW (A) : 2.90 REMARK 200 COMPLETENESS FOR SHELL (%) : NULL REMARK 200 DATA REDUNDANCY IN SHELL : 3.90 REMARK 200 R MERGE FOR SHELL (I) : NULL REMARK 200 R SYM FOR SHELL (I) : NULL REMARK 200 FOR SHELL : NULL REMARK 200 REMARK 200 DIFFRACTION PROTOCOL: SINGLE WAVELENGTH REMARK 200 METHOD USED TO DETERMINE THE STRUCTURE: MOLECULAR REPLACEMENT REMARK 200 SOFTWARE USED: PHASER REMARK 200 STARTING MODEL: 9W7S REMARK 200 REMARK 200 REMARK: NULL REMARK 280 REMARK 280 CRYSTAL REMARK 280 SOLVENT CONTENT, VS (%): 66.18 REMARK 280 MATTHEWS COEFFICIENT, VM (ANGSTROMS**3/DA): 3.64 REMARK 280 REMARK 280 CRYSTALLIZATION CONDITIONS: 0.2 M POTASSIUM SODIUM TARTRATE AND REMARK 280 20% (W/V) PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, TEMPERATURE REMARK 280 293K REMARK 290 REMARK 290 CRYSTALLOGRAPHIC SYMMETRY REMARK 290 SYMMETRY OPERATORS FOR SPACE GROUP: C 1 2 1 REMARK 290 REMARK 290 SYMOP SYMMETRY REMARK 290 NNNMMM OPERATOR REMARK 290 1555 X,Y,Z REMARK 290 2555 -X,Y,-Z REMARK 290 3555 X+1/2,Y+1/2,Z REMARK 290 4555 -X+1/2,Y+1/2,-Z REMARK 290 REMARK 290 WHERE NNN -> OPERATOR NUMBER REMARK 290 MMM -> TRANSLATION VECTOR REMARK 290 REMARK 290 CRYSTALLOGRAPHIC SYMMETRY TRANSFORMATIONS REMARK 290 THE FOLLOWING TRANSFORMATIONS OPERATE ON THE ATOM/HETATM REMARK 290 RECORDS IN THIS ENTRY TO PRODUCE CRYSTALLOGRAPHICALLY REMARK 290 RELATED MOLECULES. REMARK 290 SMTRY1 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.00000 REMARK 290 SMTRY2 1 0.000000 1.000000 0.000000 0.00000 REMARK 290 SMTRY3 1 0.000000 0.000000 1.000000 0.00000 REMARK 290 SMTRY1 2 -1.000000 0.000000 0.000000 0.00000 REMARK 290 SMTRY2 2 0.000000 1.000000 0.000000 0.00000 REMARK 290 SMTRY3 2 0.000000 0.000000 -1.000000 0.00000 REMARK 290 SMTRY1 3 1.000000 0.000000 0.000000 52.97600 REMARK 290 SMTRY2 3 0.000000 1.000000 0.000000 62.77550 REMARK 290 SMTRY3 3 0.000000 0.000000 1.000000 0.00000 REMARK 290 SMTRY1 4 -1.000000 0.000000 0.000000 52.97600 REMARK 290 SMTRY2 4 0.000000 1.000000 0.000000 62.77550 REMARK 290 SMTRY3 4 0.000000 0.000000 -1.000000 0.00000 REMARK 290 REMARK 290 REMARK: NULL REMARK 300 REMARK 300 BIOMOLECULE: 1, 2 REMARK 300 SEE REMARK 350 FOR THE AUTHOR PROVIDED AND/OR PROGRAM REMARK 300 GENERATED ASSEMBLY INFORMATION FOR THE STRUCTURE IN REMARK 300 THIS ENTRY. THE REMARK MAY ALSO PROVIDE INFORMATION ON REMARK 300 BURIED SURFACE AREA. REMARK 350 REMARK 350 COORDINATES FOR A COMPLETE MULTIMER REPRESENTING THE KNOWN REMARK 350 BIOLOGICALLY SIGNIFICANT OLIGOMERIZATION STATE OF THE REMARK 350 MOLECULE CAN BE GENERATED BY APPLYING BIOMT TRANSFORMATIONS REMARK 350 GIVEN BELOW. BOTH NON-CRYSTALLOGRAPHIC AND REMARK 350 CRYSTALLOGRAPHIC OPERATIONS ARE GIVEN. REMARK 350 REMARK 350 BIOMOLECULE: 1 REMARK 350 AUTHOR DETERMINED BIOLOGICAL UNIT: TRIMERIC REMARK 350 SOFTWARE DETERMINED QUATERNARY STRUCTURE: TRIMERIC REMARK 350 SOFTWARE USED: PISA REMARK 350 TOTAL BURIED SURFACE AREA: 3310 ANGSTROM**2 REMARK 350 SURFACE AREA OF THE COMPLEX: 14750 ANGSTROM**2 REMARK 350 CHANGE IN SOLVENT FREE ENERGY: -21.0 KCAL/MOL REMARK 350 APPLY THE FOLLOWING TO CHAINS: A, C, D REMARK 350 BIOMT1 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.00000 REMARK 350 BIOMT2 1 0.000000 1.000000 0.000000 0.00000 REMARK 350 BIOMT3 1 0.000000 0.000000 1.000000 0.00000 REMARK 350 REMARK 350 BIOMOLECULE: 2 REMARK 350 AUTHOR DETERMINED BIOLOGICAL UNIT: TRIMERIC REMARK 350 SOFTWARE DETERMINED QUATERNARY STRUCTURE: TRIMERIC REMARK 350 SOFTWARE USED: PISA REMARK 350 TOTAL BURIED SURFACE AREA: 3270 ANGSTROM**2 REMARK 350 SURFACE AREA OF THE COMPLEX: 14800 ANGSTROM**2 REMARK 350 CHANGE IN SOLVENT FREE ENERGY: -26.0 KCAL/MOL REMARK 350 APPLY THE FOLLOWING TO CHAINS: B, E, F REMARK 350 BIOMT1 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.00000 REMARK 350 BIOMT2 1 0.000000 1.000000 0.000000 0.00000 REMARK 350 BIOMT3 1 0.000000 0.000000 1.000000 0.00000 REMARK 465 REMARK 465 MISSING RESIDUES REMARK 465 THE FOLLOWING RESIDUES WERE NOT LOCATED IN THE REMARK 465 EXPERIMENT. (M=MODEL NUMBER; RES=RESIDUE NAME; C=CHAIN REMARK 465 IDENTIFIER; SSSEQ=SEQUENCE NUMBER; I=INSERTION CODE.) REMARK 465 REMARK 465 M RES C SSSEQI REMARK 465 GLU A 175 REMARK 465 LEU A 176 REMARK 465 GLU B 175 REMARK 465 LEU B 176 REMARK 500 REMARK 500 GEOMETRY AND STEREOCHEMISTRY REMARK 500 SUBTOPIC: CLOSE CONTACTS REMARK 500 REMARK 500 THE FOLLOWING ATOMS THAT ARE RELATED BY CRYSTALLOGRAPHIC REMARK 500 SYMMETRY ARE IN CLOSE CONTACT. AN ATOM LOCATED WITHIN 0.15 REMARK 500 ANGSTROMS OF A SYMMETRY RELATED ATOM IS ASSUMED TO BE ON A REMARK 500 SPECIAL POSITION AND IS, THEREFORE, LISTED IN REMARK 375 REMARK 500 INSTEAD OF REMARK 500. ATOMS WITH NON-BLANK ALTERNATE REMARK 500 LOCATION INDICATORS ARE NOT INCLUDED IN THE CALCULATIONS. REMARK 500 REMARK 500 DISTANCE CUTOFF: REMARK 500 2.2 ANGSTROMS FOR CONTACTS NOT INVOLVING HYDROGEN ATOMS REMARK 500 1.6 ANGSTROMS FOR CONTACTS INVOLVING HYDROGEN ATOMS REMARK 500 REMARK 500 ATM1 RES C SSEQI ATM2 RES C SSEQI SSYMOP DISTANCE REMARK 500 SG CYS A 103 SG CYS A 103 2655 2.03 REMARK 500 REMARK 500 REMARK: NULL REMARK 500 REMARK 500 GEOMETRY AND STEREOCHEMISTRY REMARK 500 SUBTOPIC: TORSION ANGLES REMARK 500 REMARK 500 TORSION ANGLES OUTSIDE THE EXPECTED RAMACHANDRAN REGIONS: REMARK 500 (M=MODEL NUMBER; RES=RESIDUE NAME; C=CHAIN IDENTIFIER; REMARK 500 SSEQ=SEQUENCE NUMBER; I=INSERTION CODE). REMARK 500 REMARK 500 STANDARD TABLE: REMARK 500 FORMAT:(10X,I3,1X,A3,1X,A1,I4,A1,4X,F7.2,3X,F7.2) REMARK 500 REMARK 500 EXPECTED VALUES: GJ KLEYWEGT AND TA JONES (1996). PHI/PSI- REMARK 500 CHOLOGY: RAMACHANDRAN REVISITED. STRUCTURE 4, 1395 - 1400 REMARK 500 REMARK 500 M RES CSSEQI PSI PHI REMARK 500 ALA B 26 48.76 -83.05 REMARK 500 HIS B 167 47.21 -91.46 REMARK 500 HIS B 168 -13.10 -143.73 REMARK 500 REMARK 500 REMARK: NULL REMARK 620 REMARK 620 METAL COORDINATION REMARK 620 (M=MODEL NUMBER; RES=RESIDUE NAME; C=CHAIN IDENTIFIER; REMARK 620 SSEQ=SEQUENCE NUMBER; I=INSERTION CODE): REMARK 620 REMARK 620 COORDINATION ANGLES FOR: M RES CSSEQI METAL REMARK 620 ZN A 201 ZN REMARK 620 N RES CSSEQI ATOM REMARK 620 1 CYS A 104 SG REMARK 620 2 CYS A 157 SG 109.4 REMARK 620 3 CYS A 163 SG 113.5 111.9 REMARK 620 4 HIS A 168 ND1 86.3 114.0 119.0 REMARK 620 N 1 2 3 REMARK 620 REMARK 620 COORDINATION ANGLES FOR: M RES CSSEQI METAL REMARK 620 ZN B 201 ZN REMARK 620 N RES CSSEQI ATOM REMARK 620 1 CYS B 104 SG REMARK 620 2 CYS B 157 SG 112.5 REMARK 620 3 CYS B 163 SG 112.8 111.8 REMARK 620 4 HIS B 168 ND1 83.3 114.4 118.9 REMARK 620 N 1 2 3 DBREF 9W7W A 14 176 UNP O00712 NFIB_HUMAN 14 176 DBREF 9W7W C 1 19 PDB 9W7W 9W7W 1 19 DBREF 9W7W D 1 19 PDB 9W7W 9W7W 1 19 DBREF 9W7W B 14 176 UNP O00712 NFIB_HUMAN 14 176 DBREF 9W7W E 1 19 PDB 9W7W 9W7W 1 19 DBREF 9W7W F 0 18 PDB 9W7W 9W7W 0 18 SEQADV 9W7W GLY A 12 UNP O00712 EXPRESSION TAG SEQADV 9W7W SER A 13 UNP O00712 EXPRESSION TAG SEQADV 9W7W GLY B 12 UNP O00712 EXPRESSION TAG SEQADV 9W7W SER B 13 UNP O00712 EXPRESSION TAG SEQRES 1 A 165 GLY SER HIS PRO PHE ILE GLU ALA LEU LEU PRO HIS VAL SEQRES 2 A 165 ARG ALA ILE ALA TYR THR TRP PHE ASN LEU GLN ALA ARG SEQRES 3 A 165 LYS ARG LYS TYR PHE LYS LYS HIS GLU LYS ARG MET SER SEQRES 4 A 165 LYS ASP GLU GLU ARG ALA VAL LYS ASP GLU LEU LEU SER SEQRES 5 A 165 GLU LYS PRO GLU ILE LYS GLN LYS TRP ALA SER ARG LEU SEQRES 6 A 165 LEU ALA LYS LEU ARG LYS ASP ILE ARG GLN GLU TYR ARG SEQRES 7 A 165 GLU ASP PHE VAL LEU THR VAL THR GLY LYS LYS HIS PRO SEQRES 8 A 165 CYS CYS VAL LEU SER ASN PRO ASP GLN LYS GLY LYS ILE SEQRES 9 A 165 ARG ARG ILE ASP CYS LEU ARG GLN ALA ASP LYS VAL TRP SEQRES 10 A 165 ARG LEU ASP LEU VAL MET VAL ILE LEU PHE LYS GLY ILE SEQRES 11 A 165 PRO LEU GLU SER THR ASP GLY GLU ARG LEU MET LYS SER SEQRES 12 A 165 PRO HIS CYS THR ASN PRO ALA LEU CYS VAL GLN PRO HIS SEQRES 13 A 165 HIS ILE THR VAL SER VAL LYS GLU LEU SEQRES 1 C 19 DA DG DT DT DG DG DC DA DA DG DA DT DG SEQRES 2 C 19 DC DC DA DA DT DC SEQRES 1 D 19 DG DA DT DT DG DG DC DA DT DC DT DT DG SEQRES 2 D 19 DC DC DA DA DC DT SEQRES 1 B 165 GLY SER HIS PRO PHE ILE GLU ALA LEU LEU PRO HIS VAL SEQRES 2 B 165 ARG ALA ILE ALA TYR THR TRP PHE ASN LEU GLN ALA ARG SEQRES 3 B 165 LYS ARG LYS TYR PHE LYS LYS HIS GLU LYS ARG MET SER SEQRES 4 B 165 LYS ASP GLU GLU ARG ALA VAL LYS ASP GLU LEU LEU SER SEQRES 5 B 165 GLU LYS PRO GLU ILE LYS GLN LYS TRP ALA SER ARG LEU SEQRES 6 B 165 LEU ALA LYS LEU ARG LYS ASP ILE ARG GLN GLU TYR ARG SEQRES 7 B 165 GLU ASP PHE VAL LEU THR VAL THR GLY LYS LYS HIS PRO SEQRES 8 B 165 CYS CYS VAL LEU SER ASN PRO ASP GLN LYS GLY LYS ILE SEQRES 9 B 165 ARG ARG ILE ASP CYS LEU ARG GLN ALA ASP LYS VAL TRP SEQRES 10 B 165 ARG LEU ASP LEU VAL MET VAL ILE LEU PHE LYS GLY ILE SEQRES 11 B 165 PRO LEU GLU SER THR ASP GLY GLU ARG LEU MET LYS SER SEQRES 12 B 165 PRO HIS CYS THR ASN PRO ALA LEU CYS VAL GLN PRO HIS SEQRES 13 B 165 HIS ILE THR VAL SER VAL LYS GLU LEU SEQRES 1 E 19 DA DG DT DT DG DG DC DA DA DG DA DT DG SEQRES 2 E 19 DC DC DA DA DT DC SEQRES 1 F 19 DG DA DT DT DG DG DC DA DT DC DT DT DG SEQRES 2 F 19 DC DC DA DA DC DT HET ZN A 201 1 HET ZN B 201 1 HETNAM ZN ZINC ION FORMUL 7 ZN 2(ZN 2+) FORMUL 9 HOH *23(H2 O) HELIX 1 AA1 SER A 13 LEU A 21 1 9 HELIX 2 AA2 PRO A 22 VAL A 24 5 3 HELIX 3 AA3 ALA A 26 GLU A 46 1 21 HELIX 4 AA4 SER A 50 SER A 63 1 14 HELIX 5 AA5 LYS A 65 ILE A 84 1 20 HELIX 6 AA6 ARG A 85 THR A 97 1 13 HELIX 7 AA7 LEU A 130 PHE A 138 1 9 HELIX 8 AA8 THR A 146 GLU A 149 5 4 HELIX 9 AA9 GLN A 165 HIS A 167 5 3 HELIX 10 AB1 SER B 13 LEU B 21 1 9 HELIX 11 AB2 ILE B 27 GLU B 46 1 20 HELIX 12 AB3 SER B 50 SER B 63 1 14 HELIX 13 AB4 LYS B 65 ILE B 84 1 20 HELIX 14 AB5 ARG B 85 GLU B 87 5 3 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ANISOU 2627 CB LYS B 71 14675 8048 21717 -1447 280 -1958 C ANISOU 2628 CG LYS B 71 16617 9712 23886 -1455 280 -1977 C ANISOU 2629 CD LYS B 71 17844 10866 25427 -1311 319 -2033 C ANISOU 2630 CE LYS B 71 17913 11031 25618 -1299 420 -2333 C ANISOU 2631 NZ LYS B 71 15320 8416 23356 -1148 466 -2385 N ANISOU 2632 N TRP B 72 14272 8104 20829 -1392 206 -1608 N ANISOU 2633 CA TRP B 72 14195 8174 20528 -1417 166 -1428 C ANISOU 2634 C TRP B 72 14081 8104 20368 -1302 141 -1232 C ANISOU 2635 O TRP B 72 14104 8127 20260 -1326 106 -1044 O ANISOU 2636 CB TRP B 72 13826 8019 20049 -1465 182 -1532 C ANISOU 2637 CG TRP B 72 13362 7731 19408 -1452 154 -1359 C ANISOU 2638 CD1 TRP B 72 14448 8872 20391 -1540 129 -1260 C ANISOU 2639 CD2 TRP B 72 13619 8135 19595 -1347 156 -1276 C ANISOU 2640 NE1 TRP B 72 14196 8788 20020 -1491 122 -1128 N ANISOU 2641 CE2 TRP B 72 14070 8715 19897 -1376 135 -1134 C ANISOU 2642 CE3 TRP B 72 13397 7950 19436 -1235 178 -1313 C ANISOU 2643 CZ2 TRP B 72 13406 8200 19131 -1299 135 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LYS B 79 10864 4728 15965 -1945 60 140 C ANISOU 2697 NZ LYS B 79 12150 6108 17205 -2072 106 135 N ANISOU 2698 N LEU B 80 12130 5897 17496 -1497 -68 200 N ANISOU 2699 CA LEU B 80 12478 6324 17707 -1473 -75 313 C ANISOU 2700 C LEU B 80 14071 7736 19327 -1514 -139 504 C ANISOU 2701 O LEU B 80 13648 7315 18720 -1591 -141 642 O ANISOU 2702 CB LEU B 80 12102 6107 17406 -1325 -68 215 C ANISOU 2703 CG LEU B 80 13006 7220 18238 -1297 -10 69 C ANISOU 2704 CD1 LEU B 80 10642 4969 15995 -1165 -7 -44 C ANISOU 2705 CD2 LEU B 80 10295 4629 15300 -1355 25 139 C ANISOU 2706 N ARG B 81 13537 7042 19037 -1474 -191 516 N ANISOU 2707 CA ARG B 81 14020 7352 19600 -1512 -269 717 C ANISOU 2708 C ARG B 81 14569 7780 19948 -1701 -267 865 C ANISOU 2709 O ARG B 81 15405 8567 20674 -1781 -302 1051 O ANISOU 2710 CB ARG B 81 15188 8367 21117 -1433 -322 690 C ANISOU 2711 CG ARG B 81 18234 11192 24274 -1512 -409 907 C ANISOU 2712 CD ARG B 81 19722 12531 26160 -1418 -462 874 C ANISOU 2713 NE ARG B 81 20087 12898 26776 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C ANISOU 3104 CZ2 TRP B 128 11138 6985 16680 -1332 170 -564 C ANISOU 3105 CZ3 TRP B 128 10599 6448 15897 -1198 216 -439 C ANISOU 3106 CH2 TRP B 128 9720 5625 15170 -1246 183 -525 C ANISOU 3107 N ARG B 129 11120 6534 15938 -1435 352 -53 N ANISOU 3108 CA ARG B 129 11559 6842 16187 -1491 362 46 C ANISOU 3109 C ARG B 129 12174 7298 16729 -1456 293 82 C ANISOU 3110 O ARG B 129 13055 8200 17696 -1365 253 16 O ANISOU 3111 CB ARG B 129 11379 6760 15919 -1461 408 64 C ANISOU 3112 CG ARG B 129 12755 8040 17132 -1580 453 152 C ANISOU 3113 CD ARG B 129 13904 9309 18250 -1566 524 138 C ANISOU 3114 NE ARG B 129 11887 7309 16135 -1472 490 141 N ANISOU 3115 CZ ARG B 129 12279 7764 16457 -1463 538 140 C ANISOU 3116 NH1 ARG B 129 14662 10199 18872 -1536 632 127 N ANISOU 3117 NH2 ARG B 129 12295 7791 16387 -1382 498 145 N ANISOU 3118 N LEU B 130 12503 7465 16921 -1541 283 191 N ANISOU 3119 CA LEU B 130 13026 7832 17425 -1510 216 246 C ANISOU 3120 C LEU B 130 12653 7533 17042 -1389 194 228 C ANISOU 3121 O LEU B 130 11167 6026 15674 -1298 149 186 O ANISOU 3122 CB LEU B 130 13212 7838 17467 -1644 207 389 C ANISOU 3123 CG LEU B 130 13150 7641 17421 -1775 208 432 C ANISOU 3124 CD1 LEU B 130 13236 7549 17339 -1922 196 590 C ANISOU 3125 CD2 LEU B 130 12613 7027 17066 -1711 154 378 C ANISOU 3126 N ASP B 131 12522 7486 16785 -1392 230 253 N ANISOU 3127 CA ASP B 131 11512 6553 15762 -1287 212 236 C ANISOU 3128 C ASP B 131 10004 5216 14379 -1182 222 111 C ANISOU 3129 O ASP B 131 8726 3988 13141 -1090 196 78 O ANISOU 3130 CB ASP B 131 8492 3552 12560 -1339 248 298 C ANISOU 3131 CG ASP B 131 11857 6993 15885 -1417 325 274 C ANISOU 3132 OD1 ASP B 131 12317 7600 16474 -1359 355 182 O ANISOU 3133 OD2 ASP B 131 13951 9000 17837 -1547 358 348 O ANISOU 3134 N LEU B 132 10198 5502 14650 -1203 257 46 N ANISOU 3135 CA LEU B 132 8839 4291 13421 -1128 256 -60 C ANISOU 3136 C LEU B 132 10437 5829 15138 -1084 210 -128 C ANISOU 3137 O LEU B 132 7926 3393 12686 -1011 197 -198 O ANISOU 3138 CB LEU B 132 11357 6913 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ANISOU 3936 OP2 DG F 4 14933 14006 30968 -176 2728 -598 O ANISOU 3937 O5' DG F 4 13927 13326 31527 -153 3167 -812 O ANISOU 3938 C5' DG F 4 11611 11016 29602 -196 3527 -1044 C ANISOU 3939 C4' DG F 4 11943 11221 29484 -279 3853 -1324 C ANISOU 3940 O4' DG F 4 11914 10951 28589 -343 3887 -1394 O ANISOU 3941 C3' DG F 4 12319 11502 29374 -304 3741 -1298 C ANISOU 3942 O3' DG F 4 13127 12271 30278 -374 4082 -1558 O ANISOU 3943 C2' DG F 4 11694 10625 27634 -369 3569 -1237 C ANISOU 3944 C1' DG F 4 10255 9089 26041 -415 3822 -1414 C ANISOU 3945 N9 DG F 4 11293 9934 26250 -438 3644 -1326 N ANISOU 3946 C8 DG F 4 12315 10941 26984 -376 3286 -1083 C ANISOU 3947 N7 DG F 4 11512 9948 25442 -413 3215 -1071 N ANISOU 3948 C5 DG F 4 11194 9510 24900 -510 3531 -1309 C ANISOU 3949 C6 DG F 4 10625 8726 23616 -593 3602 -1398 C ANISOU 3950 O6 DG F 4 10933 8910 23350 -586 3396 -1281 O ANISOU 3951 N1 DG F 4 10448 8484 23438 -703 3959 -1655 N ANISOU 3952 C2 DG F 4 11248 9411 24852 -727 4232 -1823 C ANISOU 3953 N2 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ANISOU 4144 O4' DC F 14 9103 5638 16735 -2650 654 -289 O ANISOU 4145 C3' DC F 14 10745 7266 18518 -2883 540 -332 C ANISOU 4146 O3' DC F 14 10487 7015 18323 -3043 609 -302 O ANISOU 4147 C2' DC F 14 10668 6904 18017 -2819 513 -319 C ANISOU 4148 C1' DC F 14 9733 6002 17026 -2735 619 -268 C ANISOU 4149 N1 DC F 14 10050 6139 17015 -2618 592 -251 N ANISOU 4150 C2 DC F 14 10073 6047 16813 -2629 663 -186 C ANISOU 4151 O2 DC F 14 9861 5879 16665 -2743 756 -150 O ANISOU 4152 N3 DC F 14 9339 5163 15800 -2530 628 -163 N ANISOU 4153 C4 DC F 14 9236 5030 15650 -2418 540 -211 C ANISOU 4154 N4 DC F 14 9204 4866 15367 -2324 513 -188 N ANISOU 4155 C5 DC F 14 9181 5085 15807 -2416 474 -286 C ANISOU 4156 C6 DC F 14 9710 5755 16601 -2520 496 -299 C ANISOU 4157 P DA F 15 9780 6424 17861 -3208 557 -331 P ANISOU 4158 OP1 DA F 15 9556 6522 18073 -3159 546 -349 O ANISOU 4159 OP2 DA F 15 10400 6813 18229 -3269 444 -371 O ANISOU 4160 O5' DA F 15 9987 6628 18086 -3368 667 -282 O ANISOU 4161 C5' DA F 15 9878 6665 18125 -3343 813 -252 C ANISOU 4162 C4' DA F 15 10081 6645 17975 -3423 885 -191 C ANISOU 4163 O4' DA F 15 10037 6369 17575 -3299 827 -174 O ANISOU 4164 C3' DA F 15 11931 8323 19652 -3631 852 -152 C ANISOU 4165 O3' DA F 15 12355 8718 19972 -3765 969 -88 O ANISOU 4166 C2' DA F 15 12070 8142 19418 -3580 730 -142 C ANISOU 4167 C1' DA F 15 11884 7922 19086 -3400 757 -130 C ANISOU 4168 N9 DA F 15 11450 7317 18453 -3265 646 -159 N ANISOU 4169 C8 DA F 15 11059 6914 18128 -3239 542 -230 C ANISOU 4170 N7 DA F 15 11180 6877 18044 -3116 474 -255 N ANISOU 4171 C5 DA F 15 12026 7630 18682 -3052 526 -185 C ANISOU 4172 C6 DA F 15 12355 7801 18760 -2923 494 -166 C ANISOU 4173 N6 DA F 15 12398 7750 18731 -2825 411 -228 N ANISOU 4174 N1 DA F 15 12259 7654 18496 -2914 556 -86 N ANISOU 4175 C2 DA F 15 12540 8030 18848 -3032 652 -38 C ANISOU 4176 N3 DA F 15 11414 7064 17969 -3152 704 -57 N ANISOU 4177 C4 DA F 15 11650 7351 18374 -3151 631 -126 C ANISOU 4178 P DA F 16 14641 10909 22171 -4024 973 -31 P ANISOU 4179 OP1 DA F 16 14187 10706 21964 -4144 1132 -26 O ANISOU 4180 OP2 DA F 16 14433 10654 22028 -4066 849 -72 O ANISOU 4181 O5' DA F 16 14181 10094 21231 -4083 934 67 O ANISOU 4182 C5' DA F 16 11531 7422 18413 -4069 1022 120 C ANISOU 4183 C4' DA F 16 11439 6987 17894 -4050 928 202 C ANISOU 4184 O4' DA F 16 11267 6741 17697 -3827 829 141 O ANISOU 4185 C3' DA F 16 13520 8793 19745 -4241 849 289 C ANISOU 4186 O3' DA F 16 14180 9263 20080 -4368 864 416 O ANISOU 4187 C2' DA F 16 12739 7812 18891 -4092 715 240 C ANISOU 4188 C1' DA F 16 12884 8040 19044 -3851 718 188 C ANISOU 4189 N9 DA F 16 13906 9038 20140 -3680 624 94 N ANISOU 4190 C8 DA F 16 12828 8089 19307 -3676 587 0 C ANISOU 4191 N7 DA F 16 13474 8678 19943 -3532 504 -75 N ANISOU 4192 C5 DA F 16 14217 9253 20437 -3418 490 -28 C ANISOU 4193 C6 DA F 16 12945 7867 19050 -3248 423 -71 C ANISOU 4194 N6 DA F 16 12267 7224 18481 -3172 359 -180 N ANISOU 4195 N1 DA F 16 11995 6777 17873 -3176 425 2 N ANISOU 4196 C2 DA F 16 12269 7015 18019 -3282 485 111 C ANISOU 4197 N3 DA F 16 13226 8062 19045 -3457 556 156 N ANISOU 4198 C4 DA F 16 14295 9281 20365 -3509 557 80 C ANISOU 4199 P DC F 17 15461 10255 21104 -4612 806 541 P ANISOU 4200 OP1 DC F 17 14820 9664 20321 -4843 896 653 O ANISOU 4201 OP2 DC F 17 15634 10431 21460 -4671 761 483 O ANISOU 4202 O5' DC F 17 14657 9109 20011 -4491 697 592 O ANISOU 4203 C5' DC F 17 15469 9884 20637 -4398 710 638 C ANISOU 4204 C4' DC F 17 14809 8965 19833 -4220 604 643 C ANISOU 4205 O4' DC F 17 13967 8236 19215 -3992 563 497 O ANISOU 4206 C3' DC F 17 15781 9602 20661 -4332 530 725 C ANISOU 4207 O3' DC F 17 17773 11360 22392 -4340 503 847 O ANISOU 4208 C2' DC F 17 14539 8309 19600 -4148 451 600 C ANISOU 4209 C1' DC F 17 14071 8087 19266 -3917 466 487 C ANISOU 4210 N1 DC F 17 14212 8349 19652 -3802 431 337 N ANISOU 4211 C2 DC F 17 13813 7883 19274 -3598 364 255 C ANISOU 4212 O2 DC F 17 13838 7760 19141 -3499 335 308 O ANISOU 4213 N3 DC F 17 13202 7382 18861 -3530 334 119 N ANISOU 4214 C4 DC F 17 12374 6724 18219 -3648 361 72 C ANISOU 4215 N4 DC F 17 12209 6662 18235 -3598 322 -56 N ANISOU 4216 C5 DC F 17 13184 7616 19040 -3839 431 156 C ANISOU 4217 C6 DC F 17 13208 7530 18854 -3913 467 283 C ANISOU 4218 P DT F 18 21228 14445 25712 -4450 446 963 P ANISOU 4219 OP1 DT F 18 20162 13247 24374 -4590 480 1125 O ANISOU 4220 OP2 DT F 18 16150 9338 20742 -4614 450 942 O ANISOU 4221 O5' DT F 18 17503 10585 22097 -4173 349 889 O ANISOU 4222 C5' DT F 18 13184 6331 17743 -3965 332 868 C ANISOU 4223 C4' DT F 18 13092 6136 17796 -3733 248 779 C ANISOU 4224 O4' DT F 18 12844 6066 17753 -3645 246 607 O ANISOU 4225 C3' DT F 18 14686 7409 19423 -3772 182 848 C ANISOU 4226 O3' DT F 18 15931 8529 20694 -3588 120 876 O ANISOU 4227 C2' DT F 18 13516 6251 18450 -3756 160 699 C ANISOU 4228 C1' DT F 18 13032 6066 18062 -3592 181 546 C ANISOU 4229 N1 DT F 18 12950 6124 18153 -3627 189 404 N ANISOU 4230 C2 DT F 18 12814 6012 18166 -3477 148 251 C ANISOU 4231 O2 DT F 18 12748 5866 18108 -3310 111 218 O ANISOU 4232 N3 DT F 18 12775 6104 18273 -3545 156 135 N ANISOU 4233 C4 DT F 18 12840 6290 18380 -3731 197 158 C ANISOU 4234 O4 DT F 18 14253 7829 19949 -3784 194 52 O ANISOU 4235 C5 DT F 18 12974 6400 18365 -3875 246 316 C ANISOU 4236 C7 DT F 18 14221 7791 19662 -4092 303 349 C ANISOU 4237 C6 DT F 18 13032 6316 18249 -3825 240 429 C TER 4238 DT F 18 HETATM 4239 ZN ZN A 201 48.394 2.107 5.308 1.00124.64 ZN ANISOU 4239 ZN ZN A 201 16686 11904 18770 -2342 820 230 ZN HETATM 4240 ZN ZN B 201 51.002 22.298 7.958 1.00160.77 ZN ANISOU 4240 ZN ZN B 201 20991 15441 24652 -1678 -93 1202 ZN HETATM 4241 O HOH A 301 45.757 13.255 21.321 1.00 76.71 O ANISOU 4241 O HOH A 301 9516 5668 13961 -530 171 -74 O HETATM 4242 O HOH A 302 36.240 1.607 18.900 1.00 56.78 O ANISOU 4242 O HOH A 302 7198 3539 10837 -971 202 331 O HETATM 4243 O HOH A 303 35.976 4.164 25.879 1.00108.34 O ANISOU 4243 O HOH A 303 13217 9968 17980 -704 267 -116 O HETATM 4244 O HOH A 304 45.502 -25.334 7.884 1.00111.36 O ANISOU 4244 O HOH A 304 14644 8867 18801 -2137 2552 -1463 O HETATM 4245 O HOH A 305 46.689 -19.050 7.380 1.00117.88 O ANISOU 4245 O HOH A 305 15488 10286 19015 -2058 2266 -1200 O HETATM 4246 O HOH A 306 37.469 -3.373 8.626 1.00 91.63 O ANISOU 4246 O HOH A 306 12581 7970 14263 -2337 404 460 O HETATM 4247 O HOH A 307 36.768 1.287 26.186 1.00 69.67 O ANISOU 4247 O HOH A 307 8482 5190 12799 -851 262 13 O HETATM 4248 O HOH A 308 32.420 -9.783 16.061 1.00 62.52 O ANISOU 4248 O HOH A 308 8562 4432 10758 -1982 388 403 O HETATM 4249 O HOH A 309 29.314 -15.917 23.102 1.00 59.90 O ANISOU 4249 O HOH A 309 8062 4172 10528 -2239 338 690 O HETATM 4250 O HOH A 310 47.490 -20.740 5.630 1.00106.56 O ANISOU 4250 O HOH A 310 14034 8664 17788 -2246 2760 -1612 O HETATM 4251 O HOH A 311 64.644 -4.524 5.429 1.00103.58 O ANISOU 4251 O HOH A 311 12298 8495 18562 -1668 3308 -1524 O HETATM 4252 O HOH C 101 29.131 -20.592 18.968 1.00 59.74 O ANISOU 4252 O HOH C 101 8530 3892 10278 -2704 396 554 O HETATM 4253 O HOH D 101 29.530 3.082 26.522 1.00 74.78 O ANISOU 4253 O HOH D 101 8497 5629 14285 -869 331 -145 O HETATM 4254 O HOH B 301 67.488 14.714 25.420 1.00 89.36 O ANISOU 4254 O HOH B 301 10272 7044 16638 -1136 225 -259 O HETATM 4255 O HOH B 302 53.855 41.886 9.528 1.00123.49 O ANISOU 4255 O HOH B 302 15773 8134 23012 -1487 -959 1867 O HETATM 4256 O HOH B 303 66.700 18.480 25.479 1.00 88.45 O ANISOU 4256 O HOH B 303 10432 6816 16359 -1261 187 -422 O HETATM 4257 O HOH B 304 48.739 33.447 28.808 1.00102.45 O ANISOU 4257 O HOH B 304 12163 6905 19860 -410 438 -1777 O HETATM 4258 O HOH B 305 72.979 36.854 23.040 1.00 98.02 O ANISOU 4258 O HOH B 305 12414 6497 18332 -2554 58 -738 O HETATM 4259 O HOH B 306 71.284 32.161 20.403 1.00 80.05 O ANISOU 4259 O HOH B 306 10050 4704 15663 -2179 173 -370 O HETATM 4260 O HOH B 307 56.481 30.756 28.606 1.00 92.63 O ANISOU 4260 O HOH B 307 11405 6247 17543 -997 248 -1447 O HETATM 4261 O HOH E 101 72.387 38.957 16.246 1.00 92.27 O ANISOU 4261 O HOH E 101 12131 5409 17517 -2824 72 91 O HETATM 4262 O HOH E 102 66.552 -2.961 4.788 1.00 96.04 O ANISOU 4262 O HOH E 102 11230 7519 17744 -1780 3488 -1606 O HETATM 4263 O HOH F 101 73.233 17.014 25.317 1.00 69.07 O ANISOU 4263 O HOH F 101 7277 4279 14686 -1471 221 -272 O CONECT 789 4239 CONECT 1215 4239 CONECT 1256 4239 CONECT 1296 4239 CONECT 2908 4240 CONECT 3334 4240 CONECT 3375 4240 CONECT 3415 4240 CONECT 4239 789 1215 1256 1296 CONECT 4240 2908 3334 3375 3415 MASTER 298 0 2 18 8 0 0 6 4257 6 10 34 END