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'Kobayashi, Y.' 5 0000-0001-6590-288X 'Ogasawara, M.' 6 0000-0003-3248-2270 'Takizawa, Y.' 7 0000-0002-6265-4830 'Kurumizaka, H.' 8 0000-0001-7412-3722 # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country ? _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev 'To Be Published' _citation.journal_id_ASTM ? _citation.journal_id_CSD 0353 _citation.journal_id_ISSN ? _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume ? _citation.language ? _citation.page_first ? _citation.page_last ? _citation.title 'Structural basis for site-specific histone H3 acetylation-dependent regulation of RNAPII transcription through nucleosomes' _citation.year ? _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI ? _citation.pdbx_database_id_PubMed ? _citation.pdbx_database_id_patent ? _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Oishi, T.' 1 0009-0005-1724-0670 primary 'Hatazawa, S.' 2 0000-0002-5678-4049 primary 'Kujirai, T.' 3 0000-0001-5547-9598 primary 'Suzuki, S.' 4 ? primary 'Nakatsu, K.' 5 0009-0008-1388-282X primary 'Hayashi, G.' 6 0000-0001-6853-2706 primary 'Kato, J.' 7 ? primary 'Kobayashi, Y.' 8 0000-0001-6590-288X primary 'Ogasawara, M.' 9 0000-0003-3248-2270 primary 'Ehara, H.' 10 0000-0002-7420-145X primary 'Sekine, S.' 11 0000-0001-8174-8704 primary 'Takizawa, Y.' 12 0000-0002-6265-4830 primary 'Kurumizaka, H.' 13 0000-0001-7412-3722 # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer man 'Histone H3.2' 15298.867 2 ? 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;ARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPATGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKT DLRFQSSAVMALQEASEAYLVGLFEDTNLAAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA ; A,E ? 2 'polypeptide(L)' no no ;GSHMSGRGKGGKGLGKGGAKRHRKVLRDNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEETRGVLKVFLENVIRDAVTYTEHA KRKTVTAMDVVYALKRQGRTLYGFGG ; ;GSHMSGRGKGGKGLGKGGAKRHRKVLRDNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEETRGVLKVFLENVIRDAVTYTEHA KRKTVTAMDVVYALKRQGRTLYGFGG ; B,F ? 3 'polypeptide(L)' no no ;GSHMSGRGKQGGKARAKAKTRSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGNYSERVGAGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKT RIIPRHLQLAIRNDEELNKLLGRVTIAQGGVLPNIQAVLLPKKTESHHKAKGK ; ;GSHMSGRGKQGGKARAKAKTRSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGNYSERVGAGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKT RIIPRHLQLAIRNDEELNKLLGRVTIAQGGVLPNIQAVLLPKKTESHHKAKGK ; C,G ? 4 'polypeptide(L)' no no ;GSHMPEPAKSAPAPKKGSKKAVTKAQKKDGKKRKRSRKESYSIYVYKVLKQVHPDTGISSKAMGIMNSFVNDIFERIAGE ASRLAHYNKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSAK ; ;GSHMPEPAKSAPAPKKGSKKAVTKAQKKDGKKRKRSRKESYSIYVYKVLKQVHPDTGISSKAMGIMNSFVNDIFERIAGE ASRLAHYNKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSAK ; D,H ? 5 polydeoxyribonucleotide no no ;(DG)(DC)(DT)(DT)(DA)(DC)(DG)(DT)(DC)(DA)(DG)(DT)(DC)(DT)(DG)(DG)(DC)(DC)(DA)(DT) (DC)(DT)(DT)(DT)(DG)(DT)(DG)(DT)(DT)(DT)(DG)(DG)(DT)(DG)(DT)(DG)(DT)(DT)(DT)(DG) (DG)(DG)(DT)(DG)(DG)(DT)(DG)(DG)(DC)(DC)(DG)(DT)(DT)(DT)(DT)(DC)(DG)(DT)(DT)(DG) (DT)(DT)(DT)(DT)(DT)(DT)(DT)(DC)(DT)(DG)(DT)(DC)(DT)(DC)(DG)(DT)(DG)(DC)(DC)(DT) (DG)(DG)(DT)(DG)(DT)(DC)(DT)(DT)(DG)(DG)(DG)(DT)(DG)(DT)(DA)(DA)(DT)(DC)(DC)(DC) (DC)(DT)(DT)(DG)(DG)(DC)(DG)(DG)(DT)(DT)(DA)(DA)(DA)(DA)(DC)(DG)(DC)(DG)(DG)(DG) (DG)(DG)(DA)(DC)(DA)(DG)(DC)(DG)(DC)(DG)(DT)(DA)(DC)(DG)(DT)(DG)(DC)(DG)(DT)(DT) (DT)(DA)(DA)(DG)(DC)(DG)(DG)(DT)(DG)(DC)(DT)(DA)(DG)(DA)(DG)(DC)(DT)(DG)(DT)(DC) (DT)(DA)(DC)(DG)(DA)(DC)(DC)(DA)(DA)(DT)(DT)(DG)(DA)(DG)(DC)(DG)(DG)(DC)(DC)(DT) (DC)(DG)(DG)(DC)(DA)(DC)(DC)(DG)(DG)(DG)(DA)(DT)(DT)(DC)(DT)(DG)(DA)(DT) ; ;GCTTACGTCAGTCTGGCCATCTTTGTGTTTGGTGTGTTTGGGTGGTGGCCGTTTTCGTTGTTTTTTTCTGTCTCGTGCCT GGTGTCTTGGGTGTAATCCCCTTGGCGGTTAAAACGCGGGGGACAGCGCGTACGTGCGTTTAAGCGGTGCTAGAGCTGTC TACGACCAATTGAGCGGCCTCGGCACCGGGATTCTGAT ; I ? 6 polydeoxyribonucleotide no no ;(DA)(DT)(DC)(DA)(DG)(DA)(DA)(DT)(DC)(DC)(DC)(DG)(DG)(DT)(DG)(DC)(DC)(DG)(DA)(DG) (DG)(DC)(DC)(DG)(DC)(DT)(DC)(DA)(DA)(DT)(DT)(DG)(DG)(DT)(DC)(DG)(DT)(DA)(DG)(DA) (DC)(DA)(DG)(DC)(DT)(DC)(DT)(DA)(DG)(DC)(DA)(DC)(DC)(DG)(DC)(DT)(DT)(DA)(DA)(DA) (DC)(DG)(DC)(DA)(DC)(DG)(DT)(DA)(DC)(DG)(DC)(DG)(DC)(DT)(DG)(DT)(DC)(DC)(DC)(DC) (DC)(DG)(DC)(DG)(DT)(DT)(DT)(DT)(DA)(DA)(DC)(DC)(DG)(DC)(DC)(DA)(DA)(DG)(DG)(DG) (DG)(DA)(DT)(DT)(DA)(DC)(DA)(DC)(DC)(DC)(DA)(DA)(DG)(DA)(DC)(DA)(DC)(DC)(DA)(DG) (DG)(DC)(DA)(DC)(DG)(DA)(DG)(DA)(DC)(DA)(DG)(DA)(DA)(DA)(DA)(DA)(DA)(DA)(DC)(DA) (DA)(DC)(DG)(DA)(DA)(DA)(DA)(DC)(DG)(DG)(DC)(DC)(DA)(DC)(DC)(DA)(DC)(DC)(DC)(DA) (DA)(DA)(DC)(DA)(DC)(DA)(DC)(DC)(DA)(DA)(DA)(DC)(DA)(DC)(DA)(DA)(DG)(DA)(DG)(DC) (DT)(DA)(DA)(DT)(DT)(DG)(DA)(DC)(DT)(DG)(DA)(DC)(DG)(DT)(DA)(DA)(DG)(DC) ; ;ATCAGAATCCCGGTGCCGAGGCCGCTCAATTGGTCGTAGACAGCTCTAGCACCGCTTAAACGCACGTACGCGCTGTCCCC CGCGTTTTAACCGCCAAGGGGATTACACCCAAGACACCAGGCACGAGACAGAAAAAAACAACGAAAACGGCCACCACCCA AACACACCAAACACAAGAGCTAATTGACTGACGTAAGC ; J ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 ALA n 1 2 ARG n 1 3 THR n 1 4 LYS n 1 5 GLN n 1 6 THR n 1 7 ALA n 1 8 ARG n 1 9 LYS n 1 10 SER n 1 11 THR n 1 12 GLY n 1 13 GLY n 1 14 LYS n 1 15 ALA n 1 16 PRO n 1 17 ARG n 1 18 LYS n 1 19 GLN n 1 20 LEU n 1 21 ALA n 1 22 THR n 1 23 LYS n 1 24 ALA n 1 25 ALA n 1 26 ARG n 1 27 LYS n 1 28 SER n 1 29 ALA n 1 30 PRO n 1 31 ALA n 1 32 THR n 1 33 GLY n 1 34 GLY n 1 35 VAL n 1 36 LYS n 1 37 LYS n 1 38 PRO n 1 39 HIS n 1 40 ARG n 1 41 TYR n 1 42 ARG n 1 43 PRO n 1 44 GLY n 1 45 THR n 1 46 VAL n 1 47 ALA n 1 48 LEU n 1 49 ARG n 1 50 GLU n 1 51 ILE n 1 52 ARG n 1 53 ARG n 1 54 TYR n 1 55 GLN n 1 56 LYS n 1 57 SER n 1 58 THR n 1 59 GLU n 1 60 LEU n 1 61 LEU n 1 62 ILE n 1 63 ARG n 1 64 ALY n 1 65 LEU n 1 66 PRO n 1 67 PHE n 1 68 GLN n 1 69 ARG n 1 70 LEU n 1 71 VAL n 1 72 ARG n 1 73 GLU n 1 74 ILE n 1 75 ALA n 1 76 GLN n 1 77 ASP n 1 78 PHE n 1 79 LYS n 1 80 THR n 1 81 ASP n 1 82 LEU n 1 83 ARG n 1 84 PHE n 1 85 GLN n 1 86 SER n 1 87 SER n 1 88 ALA n 1 89 VAL n 1 90 MET n 1 91 ALA n 1 92 LEU n 1 93 GLN n 1 94 GLU n 1 95 ALA n 1 96 SER n 1 97 GLU n 1 98 ALA n 1 99 TYR n 1 100 LEU n 1 101 VAL n 1 102 GLY n 1 103 LEU n 1 104 PHE n 1 105 GLU n 1 106 ASP n 1 107 THR n 1 108 ASN n 1 109 LEU n 1 110 ALA n 1 111 ALA n 1 112 ILE n 1 113 HIS n 1 114 ALA n 1 115 LYS n 1 116 ARG n 1 117 VAL n 1 118 THR n 1 119 ILE n 1 120 MET n 1 121 PRO n 1 122 LYS n 1 123 ASP n 1 124 ILE n 1 125 GLN n 1 126 LEU n 1 127 ALA n 1 128 ARG n 1 129 ARG n 1 130 ILE n 1 131 ARG n 1 132 GLY n 1 133 GLU n 1 134 ARG n 1 135 ALA n 2 1 GLY n 2 2 SER n 2 3 HIS n 2 4 MET n 2 5 SER n 2 6 GLY n 2 7 ARG n 2 8 GLY n 2 9 LYS n 2 10 GLY n 2 11 GLY n 2 12 LYS n 2 13 GLY n 2 14 LEU n 2 15 GLY n 2 16 LYS n 2 17 GLY n 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J . n # _pdbx_entity_instance_feature.ordinal 1 _pdbx_entity_instance_feature.comp_id ALY _pdbx_entity_instance_feature.asym_id ? _pdbx_entity_instance_feature.seq_num ? _pdbx_entity_instance_feature.auth_comp_id ALY _pdbx_entity_instance_feature.auth_asym_id ? _pdbx_entity_instance_feature.auth_seq_num ? _pdbx_entity_instance_feature.feature_type 'SUBJECT OF INVESTIGATION' _pdbx_entity_instance_feature.details ? # loop_ _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.PDB_model_num _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.polymer_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.occupancy_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.PDB_ins_code _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_atom_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_alt_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_atom_id 1 1 Y 1 D ALA 124 ? 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H ALA 128 CB # _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma 90.00 _cell.angle_gamma_esd ? _cell.entry_id 9XDO _cell.details ? _cell.formula_units_Z ? _cell.length_a 1.00 _cell.length_a_esd ? _cell.length_b 1.00 _cell.length_b_esd ? _cell.length_c 1.00 _cell.length_c_esd ? _cell.volume ? _cell.volume_esd ? _cell.Z_PDB ? _cell.reciprocal_angle_alpha ? _cell.reciprocal_angle_beta ? _cell.reciprocal_angle_gamma ? _cell.reciprocal_angle_alpha_esd ? _cell.reciprocal_angle_beta_esd ? _cell.reciprocal_angle_gamma_esd ? _cell.reciprocal_length_a ? _cell.reciprocal_length_b ? _cell.reciprocal_length_c ? _cell.reciprocal_length_a_esd ? _cell.reciprocal_length_b_esd ? _cell.reciprocal_length_c_esd ? _cell.pdbx_unique_axis ? _cell.pdbx_esd_method ? # _symmetry.entry_id 9XDO _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' _symmetry.pdbx_full_space_group_name_H-M ? # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 9XDO _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 9XDO _struct.title 'Cryo-EM structure of the H3K64ac nucleosome' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 9XDO _struct_keywords.text 'nuclear protein, chromatin, GENE REGULATION' _struct_keywords.pdbx_keywords 'GENE REGULATION' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 1 ? F N N 2 ? G N N 3 ? H N N 4 ? I N N 5 ? J N N 6 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP H32_HUMAN Q71DI3 ? 1 ;ARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPATGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKT DLRFQSSAVMALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA ; 2 2 UNP H4_HUMAN P62805 ? 2 ;MSGRGKGGKGLGKGGAKRHRKVLRDNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEETRGVLKVFLENVIRDAVTYTEHAKRK TVTAMDVVYALKRQGRTLYGFGG ; 1 3 UNP H2A1B_HUMAN P04908 ? 3 ;MSGRGKQGGKARAKAKTRSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGNYSERVGAGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKTRII PRHLQLAIRNDEELNKLLGRVTIAQGGVLPNIQAVLLPKKTESHHKAKGK ; 1 4 UNP H2B1J_HUMAN P06899 ? 4 ;MPEPAKSAPAPKKGSKKAVTKAQKKDGKKRKRSRKESYSIYVYKVLKQVHPDTGISSKAMGIMNSFVNDIFERIAGEASR LAHYNKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSAK ; 1 5 PDB 9XDO 9XDO ? 5 ? 1 6 PDB 9XDO 9XDO ? 6 ? 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 9XDO A 1 ? 135 ? Q71DI3 2 ? 136 ? 1 135 2 2 9XDO B 4 ? 106 ? P62805 1 ? 103 ? 0 102 3 3 9XDO C 4 ? 133 ? P04908 1 ? 130 ? 0 129 4 4 9XDO D 4 ? 129 ? P06899 1 ? 126 ? 0 125 5 1 9XDO E 1 ? 135 ? Q71DI3 2 ? 136 ? 1 135 6 2 9XDO F 4 ? 106 ? P62805 1 ? 103 ? 0 102 7 3 9XDO G 4 ? 133 ? P04908 1 ? 130 ? 0 129 8 4 9XDO H 4 ? 129 ? P06899 1 ? 126 ? 0 125 9 5 9XDO I 1 ? 198 ? 9XDO -125 ? 72 ? -125 72 10 6 9XDO J 1 ? 198 ? 9XDO -72 ? 125 ? -72 125 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 1 9XDO ALA A 110 ? UNP Q71DI3 CYS 111 'engineered mutation' 110 1 2 9XDO GLY B 1 ? UNP P62805 ? ? 'expression tag' -3 2 2 9XDO SER B 2 ? UNP P62805 ? ? 'expression tag' -2 3 2 9XDO HIS B 3 ? UNP P62805 ? ? 'expression tag' -1 4 3 9XDO GLY C 1 ? UNP P04908 ? ? 'expression tag' -3 5 3 9XDO SER C 2 ? UNP P04908 ? ? 'expression tag' -2 6 3 9XDO HIS C 3 ? UNP P04908 ? ? 'expression tag' -1 7 4 9XDO GLY D 1 ? UNP P06899 ? ? 'expression tag' -3 8 4 9XDO SER D 2 ? UNP P06899 ? ? 'expression tag' -2 9 4 9XDO HIS D 3 ? UNP P06899 ? ? 'expression tag' -1 10 5 9XDO ALA E 110 ? UNP Q71DI3 CYS 111 'engineered mutation' 110 11 6 9XDO GLY F 1 ? UNP P62805 ? ? 'expression tag' -3 12 6 9XDO SER F 2 ? UNP P62805 ? ? 'expression tag' -2 13 6 9XDO HIS F 3 ? UNP P62805 ? ? 'expression tag' -1 14 7 9XDO GLY G 1 ? UNP P04908 ? ? 'expression tag' -3 15 7 9XDO SER G 2 ? UNP P04908 ? ? 'expression tag' -2 16 7 9XDO HIS G 3 ? UNP P04908 ? ? 'expression tag' -1 17 8 9XDO GLY H 1 ? UNP P06899 ? ? 'expression tag' -3 18 8 9XDO SER H 2 ? UNP P06899 ? ? 'expression tag' -2 19 8 9XDO HIS H 3 ? UNP P06899 ? ? 'expression tag' -1 20 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details decameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 10 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'not applicable' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 GLY A 44 ? SER A 57 ? GLY A 44 SER A 57 1 ? 14 HELX_P HELX_P2 AA2 ARG A 63 ? ASP A 77 ? ARG A 63 ASP A 77 1 ? 15 HELX_P HELX_P3 AA3 GLN A 85 ? ALA A 114 ? GLN A 85 ALA A 114 1 ? 30 HELX_P HELX_P4 AA4 MET A 120 ? GLY A 132 ? MET A 120 GLY A 132 1 ? 13 HELX_P HELX_P5 AA5 ASP B 28 ? ILE B 33 ? ASP B 24 ILE B 29 5 ? 6 HELX_P HELX_P6 AA6 THR B 34 ? GLY B 45 ? THR B 30 GLY B 41 1 ? 12 HELX_P HELX_P7 AA7 LEU B 53 ? ALA B 80 ? LEU B 49 ALA B 76 1 ? 28 HELX_P HELX_P8 AA8 THR B 86 ? GLN B 97 ? THR B 82 GLN B 93 1 ? 12 HELX_P HELX_P9 AA9 THR C 20 ? GLY C 26 ? THR C 16 GLY C 22 1 ? 7 HELX_P HELX_P10 AB1 PRO C 30 ? LYS C 40 ? PRO C 26 LYS C 36 1 ? 11 HELX_P HELX_P11 AB2 ALA C 49 ? ASN C 77 ? ALA C 45 ASN C 73 1 ? 29 HELX_P HELX_P12 AB3 ILE C 83 ? ASN C 93 ? ILE C 79 ASN C 89 1 ? 11 HELX_P HELX_P13 AB4 ASP C 94 ? LEU C 101 ? ASP C 90 LEU C 97 1 ? 8 HELX_P HELX_P14 AB5 TYR D 41 ? HIS D 53 ? TYR D 37 HIS D 49 1 ? 13 HELX_P HELX_P15 AB6 SER D 59 ? ASN D 88 ? SER D 55 ASN D 84 1 ? 30 HELX_P HELX_P16 AB7 THR D 94 ? LEU D 106 ? THR D 90 LEU D 102 1 ? 13 HELX_P HELX_P17 AB8 GLY D 108 ? SER D 127 ? GLY D 104 SER D 123 1 ? 20 HELX_P HELX_P18 AB9 ARG E 63 ? ASP E 77 ? ARG E 63 ASP E 77 1 ? 15 HELX_P HELX_P19 AC1 GLN E 85 ? ALA E 114 ? GLN E 85 ALA E 114 1 ? 30 HELX_P HELX_P20 AC2 MET E 120 ? GLY E 132 ? MET E 120 GLY E 132 1 ? 13 HELX_P HELX_P21 AC3 ASN F 29 ? ILE F 33 ? ASN F 25 ILE F 29 5 ? 5 HELX_P HELX_P22 AC4 THR F 34 ? GLY F 45 ? THR F 30 GLY F 41 1 ? 12 HELX_P HELX_P23 AC5 LEU F 53 ? ALA F 80 ? LEU F 49 ALA F 76 1 ? 28 HELX_P HELX_P24 AC6 THR F 86 ? GLN F 97 ? THR F 82 GLN F 93 1 ? 12 HELX_P HELX_P25 AC7 THR G 20 ? GLY G 26 ? THR G 16 GLY G 22 1 ? 7 HELX_P HELX_P26 AC8 PRO G 30 ? LYS G 40 ? PRO G 26 LYS G 36 1 ? 11 HELX_P HELX_P27 AC9 ALA G 49 ? ASN G 77 ? ALA G 45 ASN G 73 1 ? 29 HELX_P HELX_P28 AD1 ILE G 83 ? ASN G 93 ? ILE G 79 ASN G 89 1 ? 11 HELX_P HELX_P29 AD2 ASP G 94 ? LEU G 101 ? ASP G 90 LEU G 97 1 ? 8 HELX_P HELX_P30 AD3 GLN G 116 ? LEU G 120 ? GLN G 112 LEU G 116 5 ? 5 HELX_P HELX_P31 AD4 TYR H 41 ? HIS H 53 ? TYR H 37 HIS H 49 1 ? 13 HELX_P HELX_P32 AD5 SER H 59 ? ASN H 88 ? SER H 55 ASN H 84 1 ? 30 HELX_P HELX_P33 AD6 THR H 94 ? LEU H 106 ? THR H 90 LEU H 102 1 ? 13 HELX_P HELX_P34 AD7 GLY H 108 ? SER H 127 ? GLY H 104 SER H 123 1 ? 20 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role covale1 covale both ? 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WATSON-CRICK ? ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference covale ? ? hydrog ? ? # loop_ _pdbx_modification_feature.ordinal _pdbx_modification_feature.label_comp_id _pdbx_modification_feature.label_asym_id _pdbx_modification_feature.label_seq_id _pdbx_modification_feature.label_alt_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_alt_id _pdbx_modification_feature.auth_comp_id _pdbx_modification_feature.auth_asym_id _pdbx_modification_feature.auth_seq_id _pdbx_modification_feature.PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.symmetry _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.modified_residue_symmetry _pdbx_modification_feature.comp_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id _pdbx_modification_feature.ref_pcm_id _pdbx_modification_feature.ref_comp_id _pdbx_modification_feature.type _pdbx_modification_feature.category 1 ALY A 64 ? . . . . ALY A 64 ? 1_555 . . . . . . . LYS 1 ALY Acetylation 'Named protein modification' 2 ALY E 64 ? . . . . ALY E 64 ? 1_555 . . . . . . . LYS 1 ALY Acetylation 'Named protein modification' # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 2 ? AA2 ? 2 ? AA3 ? 2 ? AA4 ? 2 ? AA5 ? 2 ? AA6 ? 2 ? AA7 ? 2 ? AA8 ? 2 ? AA9 ? 2 ? 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J 60 ? I -59 ? J 59 ? 1 I DT 67 1_555 J DA 132 1_555 I DC 68 1_555 J DG 131 1_555 0.195 0.247 3.321 3.923 -2.945 40.894 0.675 0.154 3.300 -4.197 -5.590 41.174 2 II_DT-59DC-58:DG58DA59_JJ I -59 ? J 59 ? I -58 ? J 58 ? 1 I DC 68 1_555 J DG 131 1_555 I DT 69 1_555 J DA 130 1_555 -0.617 -0.542 3.439 0.453 -1.506 30.538 -0.714 1.265 3.452 -2.858 -0.859 30.577 3 II_DC-58DT-57:DA57DG58_JJ I -58 ? J 58 ? I -57 ? J 57 ? 1 I DT 69 1_555 J DA 130 1_555 I DG 70 1_555 J DC 129 1_555 0.855 1.485 3.713 2.850 1.793 38.037 2.010 -0.892 3.828 2.745 -4.362 38.181 4 II_DT-57DG-56:DC56DA57_JJ I -57 ? J 57 ? I -56 ? J 56 ? 1 I DG 70 1_555 J DC 129 1_555 I DT 71 1_555 J DA 128 1_555 -0.360 1.762 3.697 2.457 -9.230 42.023 3.380 0.750 3.233 -12.674 -3.373 43.047 5 II_DG-56DT-55:DA55DC56_JJ I -56 ? J 56 ? I -55 ? J 55 ? 1 I DT 71 1_555 J DA 128 1_555 I DC 72 1_555 J DG 127 1_555 -0.623 0.962 3.509 -7.566 1.062 38.234 1.302 -0.070 3.588 1.601 11.412 38.962 6 II_DT-55DC-54:DG54DA55_JJ I -55 ? J 55 ? I -54 ? J 54 ? 1 I DC 72 1_555 J DG 127 1_555 I DT 73 1_555 J DA 126 1_555 -0.118 0.761 3.405 -0.922 1.269 34.551 1.075 0.049 3.432 2.136 1.552 34.586 7 II_DC-54DT-53:DA53DG54_JJ I -54 ? J 54 ? I -53 ? J 53 ? 1 I DT 73 1_555 J DA 126 1_555 I DC 74 1_555 J DG 125 1_555 0.219 0.023 3.283 -4.126 4.215 34.838 -0.586 -0.972 3.218 6.978 6.831 35.319 8 II_DT-53DC-52:DG52DA53_JJ I -53 ? J 53 ? I -52 ? J 52 ? 1 I DC 74 1_555 J DG 125 1_555 I DG 75 1_555 J DC 124 1_555 -0.391 -0.223 3.142 -3.765 5.025 34.308 -1.107 0.103 3.103 8.430 6.317 34.861 9 II_DC-52DG-51:DC51DG52_JJ I -52 ? J 52 ? I -51 ? J 51 ? 1 I DG 75 1_555 J DC 124 1_555 I DT 76 1_555 J DA 123 1_555 0.507 -0.273 3.418 0.221 2.290 34.027 -0.844 -0.827 3.396 3.907 -0.377 34.103 10 II_DG-51DT-50:DA50DC51_JJ I -51 ? J 51 ? I -50 ? J 50 ? 1 I DT 76 1_555 J DA 123 1_555 I DG 77 1_555 J DC 122 1_555 -0.466 0.214 3.015 0.749 5.608 36.427 -0.366 0.832 3.004 8.904 -1.190 36.849 11 II_DT-50DG-49:DC49DA50_JJ I -50 ? J 50 ? I -49 ? 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J 39 ? 1 I DT 87 1_555 J DA 112 1_555 I DT 88 1_555 J DA 111 1_555 0.215 -0.406 3.452 4.860 0.714 37.937 -0.714 0.319 3.444 1.092 -7.437 38.243 22 II_DT-39DT-38:DA38DA39_JJ I -39 ? J 39 ? I -38 ? J 38 ? 1 I DT 88 1_555 J DA 111 1_555 I DG 89 1_555 J DC 110 1_555 0.617 0.389 3.527 0.984 0.079 33.062 0.668 -0.905 3.544 0.139 -1.728 33.076 23 II_DT-38DG-37:DC37DA38_JJ I -38 ? J 38 ? I -37 ? J 37 ? 1 I DG 89 1_555 J DC 110 1_555 I DG 90 1_555 J DC 109 1_555 -0.565 0.503 3.388 -1.024 0.181 35.667 0.794 0.768 3.405 0.296 1.671 35.682 24 II_DG-37DG-36:DC36DC37_JJ I -37 ? J 37 ? I -36 ? J 36 ? 1 I DG 90 1_555 J DC 109 1_555 I DG 91 1_555 J DC 108 1_555 -0.848 1.679 3.783 -0.686 -8.481 46.395 2.875 0.998 3.454 -10.660 0.862 47.126 25 II_DG-36DG-35:DC35DC36_JJ I -36 ? J 36 ? I -35 ? J 35 ? 1 I DG 91 1_555 J DC 108 1_555 I DT 92 1_555 J DA 107 1_555 -0.095 1.020 3.291 -3.233 -1.263 31.834 2.077 -0.412 3.243 -2.294 5.873 32.018 26 II_DG-35DT-34:DA34DC35_JJ I -35 ? J 35 ? I -34 ? 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J 29 ? 1 I DT 97 1_555 J DA 102 1_555 I DC 98 1_555 J DG 101 1_555 -0.498 -0.502 3.091 3.185 2.408 38.547 -1.032 1.115 3.006 3.635 -4.809 38.745 32 II_DT-29DC-28:DG28DA29_JJ I -29 ? J 29 ? I -28 ? J 28 ? 1 I DC 98 1_555 J DG 101 1_555 I DC 99 1_555 J DG 100 1_555 1.302 0.495 3.460 7.031 0.919 35.085 0.660 -1.007 3.655 1.506 -11.517 35.772 33 II_DC-28DC-27:DG27DG28_JJ I -28 ? J 28 ? I -27 ? J 27 ? 1 I DC 99 1_555 J DG 100 1_555 I DC 100 1_555 J DG 99 1_555 -1.477 0.810 3.414 -1.622 -7.584 39.462 2.067 1.959 3.265 -11.102 2.374 40.187 34 II_DC-27DC-26:DG26DG27_JJ I -27 ? J 27 ? I -26 ? J 26 ? 1 I DC 100 1_555 J DG 99 1_555 I DC 101 1_555 J DG 98 1_555 1.211 0.884 3.502 4.912 -6.424 41.057 1.961 -1.145 3.448 -9.054 -6.923 41.812 35 II_DC-26DC-25:DG25DG26_JJ I -26 ? J 26 ? I -25 ? J 25 ? 1 I DC 101 1_555 J DG 98 1_555 I DT 102 1_555 J DA 97 1_555 -0.211 0.934 3.561 0.351 -1.912 34.129 1.915 0.419 3.503 -3.254 -0.597 34.183 36 II_DC-25DT-24:DA24DG25_JJ I -25 ? J 25 ? I -24 ? J 24 ? 1 I DT 102 1_555 J DA 97 1_555 I DT 103 1_555 J DA 96 1_555 -0.119 0.104 3.522 -4.357 4.996 29.873 -0.875 -0.709 3.475 9.543 8.324 30.583 37 II_DT-24DT-23:DA23DA24_JJ I -24 ? J 24 ? I -23 ? J 23 ? 1 I DT 103 1_555 J DA 96 1_555 I DG 104 1_555 J DC 95 1_555 0.967 -0.751 3.162 2.591 7.932 31.231 -2.689 -1.300 2.956 14.414 -4.707 32.300 38 II_DT-23DG-22:DC22DA23_JJ I -23 ? J 23 ? I -22 ? J 22 ? 1 I DG 104 1_555 J DC 95 1_555 I DG 105 1_555 J DC 94 1_555 -0.582 -0.446 3.349 -3.214 6.232 30.382 -2.043 0.459 3.239 11.697 6.033 31.162 39 II_DG-22DG-21:DC21DC22_JJ I -22 ? J 22 ? I -21 ? J 21 ? 1 I DG 105 1_555 J DC 94 1_555 I DC 106 1_555 J DG 93 1_555 0.426 -0.797 3.368 -1.129 6.783 30.260 -2.799 -1.014 3.103 12.787 2.129 31.013 40 II_DG-21DC-20:DG20DC21_JJ I -21 ? J 21 ? I -20 ? J 20 ? 1 I DC 106 1_555 J DG 93 1_555 I DG 107 1_555 J DC 92 1_555 0.263 -0.307 3.074 1.606 8.954 33.705 -1.777 -0.212 2.909 15.104 -2.709 34.877 41 II_DC-20DG-19:DC19DG20_JJ I -20 ? J 20 ? I -19 ? J 19 ? 1 I DG 107 1_555 J DC 92 1_555 I DG 108 1_555 J DC 91 1_555 -0.619 -0.674 3.239 1.506 3.737 33.717 -1.738 1.295 3.119 6.414 -2.585 33.950 42 II_DG-19DG-18:DC18DC19_JJ I -19 ? J 19 ? I -18 ? J 18 ? 1 I DG 108 1_555 J DC 91 1_555 I DT 109 1_555 J DA 90 1_555 -0.181 -0.635 3.265 2.586 -0.422 32.448 -1.059 0.773 3.249 -0.754 -4.618 32.551 43 II_DG-18DT-17:DA17DC18_JJ I -18 ? J 18 ? I -17 ? J 17 ? 1 I DT 109 1_555 J DA 90 1_555 I DT 110 1_555 J DA 89 1_555 2.023 0.273 3.721 12.187 -10.756 36.718 1.911 -1.240 3.947 -16.139 -18.286 40.041 44 II_DT-17DT-16:DA16DA17_JJ I -17 ? J 17 ? I -16 ? J 16 ? 1 I DT 110 1_555 J DA 89 1_555 I DA 111 1_555 J DT 88 1_555 -1.159 1.037 3.447 -2.497 -1.576 35.100 1.962 1.523 3.471 -2.607 4.132 35.220 45 II_DT-16DA-15:DT15DA16_JJ I -16 ? J 16 ? I -15 ? J 15 ? 1 I DA 111 1_555 J DT 88 1_555 I DA 112 1_555 J DT 87 1_555 -0.072 0.108 3.475 -2.128 -1.151 38.757 0.311 -0.168 3.469 -1.733 3.203 38.830 46 II_DA-15DA-14:DT14DT15_JJ I -15 ? J 15 ? I -14 ? 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