data_9YAQ # _entry.id 9YAQ # _audit_conform.dict_name mmcif_pdbx.dic _audit_conform.dict_version 5.416 _audit_conform.dict_location http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic # loop_ _database_2.database_id _database_2.database_code _database_2.pdbx_database_accession _database_2.pdbx_DOI PDB 9YAQ pdb_00009yaq 10.2210/pdb9yaq/pdb WWPDB D_1000300138 ? ? EMDB EMD-72734 ? ? # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal _pdbx_audit_revision_history.data_content_type _pdbx_audit_revision_history.major_revision _pdbx_audit_revision_history.minor_revision _pdbx_audit_revision_history.revision_date _pdbx_audit_revision_history.part_number 1 'Structure model' 1 0 2026-07-22 ? 2 'EM metadata' 1 0 2026-07-22 ? 3 FSC 1 0 2026-07-22 ? 4 'Half map' 1 0 2026-07-22 1 5 'Half map' 1 0 2026-07-22 2 6 Image 1 0 2026-07-22 ? 7 'Primary map' 1 0 2026-07-22 ? # loop_ _pdbx_audit_revision_details.ordinal _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_details.data_content_type _pdbx_audit_revision_details.provider _pdbx_audit_revision_details.type _pdbx_audit_revision_details.description _pdbx_audit_revision_details.details 1 1 'Structure model' repository 'Initial release' ? ? 2 2 'EM metadata' repository 'Initial release' ? ? 3 3 FSC repository 'Initial release' ? ? 4 4 'Half map' repository 'Initial release' ? ? 5 5 'Half map' repository 'Initial release' ? ? 6 6 Image repository 'Initial release' ? ? 7 7 'Primary map' repository 'Initial release' ? ? # _database_PDB_caveat.id 1 _database_PDB_caveat.text ;Residues TYR J 624 and ASP J 628 are linked together in the model; however, there are residues between them in the deposited polymeric sequence. ; # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 9YAQ _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2025-09-16 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site RCSB _pdbx_database_status.process_site RCSB _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y # _pdbx_database_related.db_name EMDB _pdbx_database_related.details 'The structure of the cardiac native cross bridge in the rigor state, myosin heads bound to actin molecules 5 and 6.' _pdbx_database_related.db_id EMD-72734 _pdbx_database_related.content_type 'associated EM volume' # _pdbx_contact_author.id 2 _pdbx_contact_author.email galkinve@odu.edu _pdbx_contact_author.name_first Vitold _pdbx_contact_author.name_last Galkin _pdbx_contact_author.name_mi E _pdbx_contact_author.role 'principal investigator/group leader' _pdbx_contact_author.identifier_ORCID 0000-0003-1138-7565 # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Galkin, V.E.' 1 ? 'Risi, C.M.' 2 ? # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country ? _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev 'To Be Published' _citation.journal_id_ASTM ? _citation.journal_id_CSD 0353 _citation.journal_id_ISSN ? _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume ? _citation.language ? _citation.page_first ? _citation.page_last ? _citation.title 'The structure of the native cardiac cross-bridge' _citation.year ? _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI ? _citation.pdbx_database_id_PubMed ? _citation.pdbx_database_id_patent ? _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Galkin, V.E.' 1 ? primary 'Risi, C.M.' 2 ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer man 'Actin, alpha cardiac muscle 1' 42064.891 4 ? ? ? ? 2 polymer man 'Tropomyosin alpha-1 chain' 32762.656 4 ? ? ? ? 3 polymer man 'Troponin T2, cardiac type' 33941.738 2 ? ? ? ? 4 polymer man Myosin-7 223649.094 2 ? ? ? ? 5 polymer man 'Myosin light chain 3' 21788.875 2 ? ? ? ? 6 polymer man 'Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles' 18433.508 1 ? ? ? ? 7 polymer man 'Troponin I, cardiac muscle' 24120.732 1 ? ? ? ? 8 non-polymer syn "ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE" 427.201 4 ? ? ? ? 9 non-polymer syn 'MAGNESIUM ION' 24.305 4 ? ? ? ? 10 non-polymer syn 'CALCIUM ION' 40.078 3 ? ? ? ? # loop_ _entity_name_com.entity_id _entity_name_com.name 1 'Cardiac muscle alpha actin 1' 2 Alpha-tropomyosin,Tropomyosin-1 4 'Myosin heavy chain 7,Myosin heavy chain slow isoform,MyHC-slow,Myosin 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VTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEK SYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVLSGGTTMYPGIADRMQKEIT ALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDEAGPSIVHRKCF ; A,B,C,D ? 2 'polypeptide(L)' no no ;MDAIKKKMQMLKLDKENALDRAEQAEADKKAAEDRSKRLEDELVSLQKKLKATEDELDKYSEAPKDAQEKLELAEKKATD AEADVASLNRRIQLVEEELDRAQERLATALQKLEEAEKAADESERGMKVIESRAQKDEEKMEIQEIQLKEAKHIAEDADR KYEEVARKLVIIESDLERAEERAELSEGKCAELEEELKTVTNNLKSLEAQAEKYSQKEDKYEEEIKVLSDKLKEAETRAE FAERSVTKLEKSIDDLEDELYAQKLKYKAISEELDHALNDMTSI ; ;MDAIKKKMQMLKLDKENALDRAEQAEADKKAAEDRSKRLEDELVSLQKKLKATEDELDKYSEAPKDAQEKLELAEKKATD AEADVASLNRRIQLVEEELDRAQERLATALQKLEEAEKAADESERGMKVIESRAQKDEEKMEIQEIQLKEAKHIAEDADR KYEEVARKLVIIESDLERAEERAELSEGKCAELEEELKTVTNNLKSLEAQAEKYSQKEDKYEEEIKVLSDKLKEAETRAE FAERSVTKLEKSIDDLEDELYAQKLKYKAISEELDHALNDMTSI ; E,F,G,H ? 3 'polypeptide(L)' no no ;MSDVEETVDEYEEEQEEGAAEEQEEAVEEEAGGEAEAEEANAEEAGQEEDGREAEDGPMEESKPKPRLFMPNLVPPKIPD 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LSKANSEVAQWRTKYETDAIQRTEELEEAKKKLAQRLQDAEEAVEAVNAKCSSLEKTKHRLQNEIEDLMVDVERSNAAAA ALDKKQRNFDKILAEWKQKYEESQSELESSQKEARSLSTELFKLKNAYEESLEHLETFKRENKNLQEEISDLTEQLGSSG KTIHELEKVRKQLEAEKLELQSALEEAEASLEHEEGKILRAQLEFNQIKAEMERKLAEKDEEMEQAKRNHLRVVDSLQTS LDAETRSRNEALRVKKKMEGDLNEMEIQLSHANRMAAEAQKQVKSLQSLLKDTQIQLDDAVRANDDLKENIAIVERRNNL LQAELEELRAVVEQTERSRKLAEQELIETSERVQLLHSQNTSLINQKKKMEADLSQLQTEVEEAVQECRNAEEKAKKAIT DAAMMAEELKKEQDTSAHLERMKKNMEQTIKDLQHRLDEAEQIALKGGKKQLQKLEARVRELENELEAEQKRNAESVKGM RKSERRIKELTYQTEEDRKNLLRLQDLVDKLQLKVKAYKRQAEEAEEQANTNLSKFRKVQHELDEAEERADIAESQVNKL RAKSRDIGTKGLNEE ; J,K ? 5 'polypeptide(L)' no no ;MAPKKPEPKKDDAKAAAKAAPAPAPAPAPAPEPKEPEFDASKIKIEFTPEQIEEFKEAFMLFDRTPKCEMKITYGQCGDV LRALGQNPTQAEVLRVLGKPKQEELNSKMMDFDTFLPMLQHISKNKDTGTYEDFVEGLRVFDKEGNGTVMGAELRHVLAT LGERLTEDEVEKLMAGQEDSNGCINYEAFVKHIMAS ; ;MAPKKPEPKKDDAKAAAKAAPAPAPAPAPAPEPKEPEFDASKIKIEFTPEQIEEFKEAFMLFDRTPKCEMKITYGQCGDV LRALGQNPTQAEVLRVLGKPKQEELNSKMMDFDTFLPMLQHISKNKDTGTYEDFVEGLRVFDKEGNGTVMGAELRHVLAT LGERLTEDEVEKLMAGQEDSNGCINYEAFVKHIMAS ; L,M ? 6 'polypeptide(L)' no no ;MDDIYKAAVEQLTEEQKNEFKAAFDIFVLGAEDGCISTKELGKVMRMLGQNPTPEELQEMIDEVDEDGSGTVDFDEFLVM MVRCMKDDSKGKSEEELSDLFRMFDKNADGYIDLEELKIMLQATGETITEDDIEELMKDGDKNNDGRIDYDEFLEFMKGV E ; ;MDDIYKAAVEQLTEEQKNEFKAAFDIFVLGAEDGCISTKELGKVMRMLGQNPTPEELQEMIDEVDEDGSGTVDFDEFLVM MVRCMKDDSKGKSEEELSDLFRMFDKNADGYIDLEELKIMLQATGETITEDDIEELMKDGDKNNDGRIDYDEFLEFMKGV E ; N ? 7 'polypeptide(L)' no no ;MADRSGDAAGDSRPAPAPVRRRSSANYRAYATEPHAKKKSKISASRKLQLKTLMLQIAKQELEREAEERRGEKGRALSTR CQPLELAGLSFAELQDLCRQLHARVDKVDEERYDVEVKVTKNITEIADLNQKIFDLRGKFKRPTLRRVRISADAMMQALL GARAKETLDLRAHLKQVKKEDTEKENREVGDWRKNIDALSGMEGRKKKFEG ; ;MADRSGDAAGDSRPAPAPVRRRSSANYRAYATEPHAKKKSKISASRKLQLKTLMLQIAKQELEREAEERRGEKGRALSTR CQPLELAGLSFAELQDLCRQLHARVDKVDEERYDVEVKVTKNITEIADLNQKIFDLRGKFKRPTLRRVRISADAMMQALL GARAKETLDLRAHLKQVKKEDTEKENREVGDWRKNIDALSGMEGRKKKFEG ; O ? # loop_ _pdbx_entity_nonpoly.entity_id _pdbx_entity_nonpoly.name _pdbx_entity_nonpoly.comp_id 8 "ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE" ADP 9 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