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_refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.pdbx_diffrn_id ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.overall_SU_R_free ? _refine.overall_FOM_free_R_set ? _refine.overall_FOM_work_R_set ? _refine.pdbx_average_fsc_overall ? _refine.pdbx_average_fsc_work ? _refine.pdbx_average_fsc_free ? # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_Zscore _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.003 ? 40086 ? f_bond_d ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.564 ? 54555 ? f_angle_d ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 11.851 ? 14529 ? f_dihedral_angle_d ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.044 ? 5871 ? f_chiral_restr ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.005 ? 7266 ? f_plane_restr ? ? ? # _struct.entry_id 9YGB _struct.title 'CryoEM structure of F7 pyocin tail tip in the pre-ejection state' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 9YGB _struct_keywords.text 'Phage, tail, bacteriocin, Pseudomonas, cryoEM, tip, VIRUS LIKE PARTICLE' _struct_keywords.pdbx_keywords 'VIRUS LIKE PARTICLE' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 2 ? E N N 4 ? F N N 5 ? G N N 3 ? H N N 6 ? I N N 1 ? J N N 2 ? K N N 3 ? L N N 2 ? M N N 4 ? N N N 5 ? O N N 3 ? P N N 6 ? Q N N 1 ? R N N 2 ? S N N 3 ? T N N 2 ? U N N 4 ? V N N 5 ? W N N 3 ? X N N 6 ? Y N N 7 ? Z N N 7 ? AA N N 7 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP A0A643J2J4_PSEAI A0A643J2J4 ? 1 ;MATNTDGSLTLDLVLRSEGYRAGMDKVGRINDQKMRAMEARAEKAGKAIGKSLDSSALIASSVLDQALDMLGRTSRQAGQ AKKPVQSAQDKVLAEWKTRQKELGEAWKSYREPLQDLSKLNEALLKNSSDKLDKALLNLSETGKLSLANVGKAAYADAAR LASRQMTLMLLDGLFGWVASVGTEKPKVDDKAGKGQAKAGDDEKEQPSLQSQVFKQWLLQMNSVWGAYRAPLQDISGMTD ELFRNASEKLEKSLFNFATTGKLSLSNFAKTVIDDVARIAARQLSMLALDGLFGWMNGKAGITEAQLASQKPYTSLLEKA RADAGQAAAGAPAAQGAAPMPAAAMDVGAMVATASGQTRDGSKVSAGGASASAGKPVGSWVEQMDASWASLRDQAQDVSG MMDMLFTNAFTNMENALFTFATTGKLSFKDFADSVIQDMARIAARQATLQIIGGIVGAVSGFFGSGATAGSRISDYTGSD MANWVSKQRAGGMPGFARGGAFNDGIQSAPALFSMAGGRPALIGERGPEAIMPLSRGSDGVLGVRALGGGEGGNVFNFST SVSLGGGREGAATASGDDGTGQQLAGMINDAARNVVAQELRPGGLVWRMVNG ; 1 2 UNP Q9R3G3_PSEAI Q9R3G3 ? 2 ;MSILTQGTQIYALVPPVSGTGAATVLEIEGVTSFNPGGNPADQIEDPCLSDTSRKYKKGLRTPGQATLGINADPRLASHV RLFQLSEKDGETSVKWAIGWSDGIDVKPTVSTEGDDFVLPPARTWFTFEGYVSDFPFDFASNTLVATQATIQRSGAGKWT PKSA ; 1 3 UNP Q9S561_PSEAI Q9S561 ? 3 ;MADLERFTWDISIDSAGQANQLVRQVQYGGGYSQALGDGLNNLSETWQVSRTGDLALIGPIRDFLKRHGGYRSFLWTLPT GEPVRVRAQGWQLRPRGNGVFTLNTTFQQVFNP ; 1 4 UNP A0A0H2ZLF4_PSEAB A0A0H2ZLF4 ? 4 ;MNDTLSQGLTTIRLYGVLGKRFGRMHGRLLESGTVREAMSALKHTMEGFETFMREAESKGLTFAVFRGRTNLSGEQLDMR GREDIRIVPLVIGSKQSGLFQTVLGAALIAVGVFATSLTLGTSTFLISAGASMMLGGVMQMLSPQPKGLKGREAPENAPS YAFGGPVNTIAQGHPVGVLYGKRRIGGAVISAGIYAEDRL ; 1 5 UNP A0A7M2ZXW7_PSEAI A0A7M2ZXW7 ? 5 ;MNKTITGHKGGSKKPRQPVEMPDSVRSIARAKILLALGEGEFDGGVDGRSIYLDDTPLLAADGSVNFPGVTWEFRPGSVD QEHIAGVPAVENELAVGVELKSDAPWVRAVNNTQLSAVRLRLSWPAIQRQQENGDVVGYRIDYAIDIAVDGGAWQEALKA SLDDKSTSRYERSHRVDLPEARSGWQVRVRRLTPNQNNNRIADTMRVEAITEVIDAKLRYPNTALLFVEFDASQFQSIPQ ISVEARGRRVRVPSNYDPQTRSYSGTWDGSFKSAWTSNPAWHWYDIVLHKRFGLGRRIDASMVDKWSLYRIAQYCDQSVP DGKGGQEPRFSCNLYLQSRAEAWTVLRDLAAIFRGMSYWSGAEMVAVSDMPEDEAYTFSPSNTVRGDDGSHFNYSSSRQR DRHTLALVNYDNPGNGYQSQPVAVNNDRAQRRYGISQLEITAIGCTSEGEAQRRGQWALLTEELEQDAVTFRTGMDGRGL APGKIIAVADPVKSGKQIGGRLSAVDGRALTLDRDVEARPGDRLLVNLPNGKAEARSVQSVVGRVLSVTAAYSETPRPQG QWALQSNSLTTQRFRIMSITRPEDNLFEITALQHNASKFDAIDNGARIELPPVTSIPPGVQAPPQNVRIKAFTKVDQGLA VTSLSASWDAAPNAVAYEAEWRKDSGNWVRVPRTSALGFDVPGIYAGRYLVRVRALNVMEVGSVYASSEETALEGKTTPP PALAYLRCVAGPWRIGLEWGFPASGAADTAYTEIQQSATPGGSEETARALGLFAYPGNTHLVSPIPAGERLAFRGRLIDR SGNVGAWSNWVTGTSSSDASEYNQLITQEYVESALGQQFFSDIERMQVDIGGLQKQVGDLADILLYDPAKVYAKNDMVRQ GQRLYQALKAVPAKTAPPNAAYWSDIGQSLETANGLAQQVASHTAEISELDGSLTAQASRLGVLQAATRDDADDGNGAMA DALRGWKTVARAAQEETVRATENEAQATRTTLLEARTADAEGRIATVERVATSDRQATAQRLDQLSASIGGTAASLQSEQ TARANADSVLAQRIDTVQASTDTNSAAIQTTSQAVTSLDGNVKAMYSVKLQAHANGQKYAAGWQLGFDSGTSVSTMAFQA DRFIWFDSSSGTAVAPVSIVNGQMFIKSALIQDGAIDNAKIG ; 1 6 UNP A0A3E1N7Q2_PSEAI A0A3E1N7Q2 ? 6 ;MTITADDQALEPGALVRLFDLDCTGFGGEMLRFHGHLQQGPIHWQGNAYQAWPLEARGFEQRGDGRASSPTLSVGNIDGS ISALCLFFDGLVGARLTVRETYAHYLDAANFAEGNPQADPSQERLNIWFLEQKTAENSVQVTWELSAPPDFQGQQIPARQ ITSLCHWCITNEYRGQDCNYTGTAMFDADGNPVDDPALDRCGGRVSDCKLRFGADNPLSHGGFAGAGLVRM ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 9YGB F 1 ? 612 ? A0A643J2J4 1 ? 612 ? 0 611 2 2 9YGB H 1 ? 164 ? Q9R3G3 1 ? 164 ? 1 164 3 3 9YGB C 1 ? 113 ? Q9S561 1 ? 113 ? 1 113 4 2 9YGB G 1 ? 164 ? Q9R3G3 1 ? 164 ? 1 164 5 4 9YGB E 1 ? 200 ? A0A0H2ZLF4 1 ? 200 ? 1 200 6 5 9YGB A 1 ? 1162 ? A0A7M2ZXW7 1 ? 1162 ? 1 1162 7 3 9YGB D 1 ? 113 ? Q9S561 1 ? 113 ? 1 113 8 6 9YGB B 1 ? 231 ? A0A3E1N7Q2 1 ? 231 ? 1 231 9 1 9YGB S 1 ? 612 ? A0A643J2J4 1 ? 612 ? 0 611 10 2 9YGB W 1 ? 164 ? Q9R3G3 1 ? 164 ? 1 164 11 3 9YGB M 1 ? 113 ? Q9S561 1 ? 113 ? 1 113 12 2 9YGB U 1 ? 164 ? Q9R3G3 1 ? 164 ? 1 164 13 4 9YGB Q 1 ? 200 ? A0A0H2ZLF4 1 ? 200 ? 1 200 14 5 9YGB I 1 ? 1162 ? A0A7M2ZXW7 1 ? 1162 ? 1 1162 15 3 9YGB O 1 ? 113 ? Q9S561 1 ? 113 ? 1 113 16 6 9YGB K 1 ? 231 ? A0A3E1N7Q2 1 ? 231 ? 1 231 17 1 9YGB T 1 ? 612 ? A0A643J2J4 1 ? 612 ? 0 611 18 2 9YGB X 1 ? 164 ? Q9R3G3 1 ? 164 ? 1 164 19 3 9YGB N 1 ? 113 ? Q9S561 1 ? 113 ? 1 113 20 2 9YGB V 1 ? 164 ? Q9R3G3 1 ? 164 ? 1 164 21 4 9YGB R 1 ? 200 ? A0A0H2ZLF4 1 ? 200 ? 1 200 22 5 9YGB J 1 ? 1162 ? 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UNP A0A7M2ZXW7 VAL 1049 conflict 1049 8 6 9YGB THR A 1155 ? UNP A0A7M2ZXW7 ALA 1155 conflict 1155 9 9 9YGB SER S 260 ? UNP A0A643J2J4 THR 260 conflict 259 10 9 9YGB ALA S 323 ? UNP A0A643J2J4 ASP 323 conflict 322 11 9 9YGB GLY S 359 ? UNP A0A643J2J4 ARG 359 conflict 358 12 9 9YGB GLU S 403 ? UNP A0A643J2J4 ASP 403 conflict 402 13 13 9YGB SER Q 2 ? UNP A0A0H2ZLF4 ASN 2 conflict 2 14 14 9YGB VAL I 709 ? UNP A0A7M2ZXW7 GLU 709 conflict 709 15 14 9YGB VAL I 863 ? UNP A0A7M2ZXW7 ILE 863 conflict 863 16 14 9YGB ALA I 1049 ? UNP A0A7M2ZXW7 VAL 1049 conflict 1049 17 14 9YGB THR I 1155 ? UNP A0A7M2ZXW7 ALA 1155 conflict 1155 18 17 9YGB SER T 260 ? UNP A0A643J2J4 THR 260 conflict 259 19 17 9YGB ALA T 323 ? UNP A0A643J2J4 ASP 323 conflict 322 20 17 9YGB GLY T 359 ? UNP A0A643J2J4 ARG 359 conflict 358 21 17 9YGB GLU T 403 ? UNP A0A643J2J4 ASP 403 conflict 402 22 21 9YGB SER R 2 ? UNP A0A0H2ZLF4 ASN 2 conflict 2 23 22 9YGB VAL J 709 ? UNP A0A7M2ZXW7 GLU 709 conflict 709 24 22 9YGB VAL J 863 ? UNP A0A7M2ZXW7 ILE 863 conflict 863 25 22 9YGB ALA J 1049 ? UNP A0A7M2ZXW7 VAL 1049 conflict 1049 26 22 9YGB THR J 1155 ? UNP A0A7M2ZXW7 ALA 1155 conflict 1155 27 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details 24-meric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 24 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'not applicable' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 THR A 580 ? 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